sp|Q8VYW1|PAPS4_ARATH ----> Nuclear poly(A) polymerase 4
Intron 1 GTAAGCTGCT ... TTTCTCCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 79.66 | 6 | 26 | 21 |
| A2 | 75 | 8 | 20 | 28 |
| A3 | 64.58 | 17 | 49 | 13 |
| A4 | 69.86 | 11 | 37 | 14 |
| A5 | 73.91 | 3 | 12 | 5 |
| A6 | 84 | 2 | 17 | 4 |
| A7 | 77.14 | 4 | 13 | 14 |
| A8 | 68.97 | 9 | 16 | 24 |
| A9 | 68 | 4 | 11 | 6 |
| A10 | 49.09 | 14 | 21 | 6 |
>TRINITY_DN48699_c1_g1_i7 from sample A7 / Example spliced isoformTGGGCTTTATGAGAGTTTAGAGGACGGTGCCCTAAGGAAAGAGGTTTTGGCCCAAATTGATCTGGTTAGGGAACCTTATATATTTTTCTATAAAATTCGTGTATGGATTATGAAGAGATCTTAATCATTCAGAAAATTGTTTATGTGGGCAAGTCTGATTGTTTCGTGATTTTCCAGATTGCAAAAGCATGGGTCAAGAG
GATAACTCATGAAAGAGGGTATGGTGAACAGTTGGTGGAAGAAGAAAATGCTAAAATCTATACATTTGGGTCTTTATCATTTGTCGGCAGATCCCTTTTACCCGCTCTTGCATTTTATGGAGGATTCATCGTTGCAGGCATGGTCATAATCTTATATGTACAAATCTTCAATCATAATATTAGATGTTTAATTATTTGGA
TACGAGCATAAGGGAGCTCTCAAGATCCCCTGTGATGTCTTCTTGTTTGAAGGGATTCTCAAACTCATTAACAACAGATGTCCATTAGCAACATCAGTCTGTCATGAATGATTTTGAGAAGCGGTTATTTATTTTATTTTGGAGTTAGTAATTCCCAATGATGGATAGTTTATGATATCTCTTCAGGTTGTGTCTAGTAT
CCCAACACTGGAACAATATTTTTAAGTCCTTGGAATTCAAAGAGTTACCCTCCAGCTTAATGGTTCCCGGTACTCTGACCTTTCTCATTTCACGCAAGGAGCGCTCATATGGCATCATTACAGATTTACAGATTAGTGTGGAAAGCAGATATAAGTTCCATATATTATGAATCGATTTCGTTCCAAGCGTAAGGGTCTTG
TTGGCCAGTTGCAAAGGCATACTTTGTTGTTCTAGTACCGGTAAATCCAAATACATATGCAATCATGTCACTAGATCACAGATTGAATTTCCAGCTTGCATTAAACTTACACGGTGGGAATTCCATAGTCTTTATTTTGACCCTTGCAAAAGGTGAAACCCTAGCCTAAAGTTATTGTGAGACCTGTACTCAACATTGGG
CTTTTAAACGTGCACATGACATGTATATTACTATATACAGATCAGATAATATCTCATTTAAACGATTACCCACAATTGCATCTCTCAGATGATGAATACCAATTGATCAACCGATTTAAGGACATTGTCTACCTCGTCCTGGCTGCAAAACAAGATCTCCTGCTGGATATTCATAATAAAACTTCCCTGCCTATGTTTGG
ATGGAATTTTAGCGGATTCAATGCGGCGATTTTGAATTTCATGATCTTCTCTTCACATGAGTTGTTCTTGTTTGGGGAGTCTTGGTTCAGATAGACTTTCAAGGCGCCCACAGGGCAACTTATTGCCATTGGCCTCTCTAATTCCCCTAGAATTTGAGTGTGATTGTGATTGTAAGTTCCCTCTGAAATGGCAGCCATTA
TTGTGTTTGTGTTGTCCATTAAGCCAGAGTTAGCAAACTGTTTCCACTTGAAGATGTCATAAGATGTCATAAGTTTTTATAGTTTCTCTTTGGACTGTGGTTGCGGTACGAATACAAGAGCAGAACTTCTAGCTCTTTGGGCTGTTCTTAGAGTGAGTTGTTTGATGGGTCTGCCCATTCATTTGATTTTTGGTGATTCG
ATGGTGATTATTTATTGGATAAACAGAGTTACAGCCCTTGAAATTCCTACTCTGATGCACTGGTGTGATGAAATAAACTATATGCTGTAGCTTGTCCCACCGGTAATCTTCAAACATATCTTCCGAGAGCACAACATGCTAGCTGATGGTCTTCAAAAGCAGGCTCTGAAAATGGAATTGGGATCTGGATATTTCACTGA
AACATTGGATGGGAAGGTCATTGAACATGGCCAATTCATACTTTTTTAGCTGCTGTTTATCATCTTTTTTCAGCGTTTGAATGACATGCAGATGTACTTCTTTCTTTGTCTG
>TRINITY_DN48699_c1_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:CTAATGAGACCGATCTTCACAGGACTCGGCAGCTGGAAGAGATTGCAAAAGCATGGGTCAAGAGGATAACTCATGAAAGAGGGTATGGTGAACAGTTGGTGGAAGAAGAAAATGCTAAAATCTATACATTTGGGTCTTTATCATTTGTCGTGGGCTTTATGAGAGTTTAGAGGACGGTGCCCTAAGGAAAGAGGTTTTGG
CCCAAATTGATCTGGTTAGGGAACCTTATATATTTTTCTATAAAATTCGTGTATGGATTATGAAGAGATCTTAATCATTCAGAAAATTGTTTATGTGGGCAAGTCTGATTGTTTCGTGATTTTCCAGATTGCAAAAGCATGGGTCAAGAGGATAACTCATGAAAGAGGGTATGGTGAACAGTTGGTGGAAGAAGAAAATG
CTAAAATCTATACATTTGGGTCTTTATCATTTGTCGgtaagctgctgaaattgtcaagaccttggttgcattgcgttgtttttattgcatgttctatctattttcagtaaatagttggacaagcaccgagtgcttgcatgctttagcggagtcccagagatggaagttcgctcccgaagaagtgatcaacgaagtctgtt
tgcaagcaacaagagcactaattcatgccaaagtatcatctaaggctatcggtcacatgcagttaatgtgccataaatctgtgtgtttagtttcagtttctgtgcttaagtttctatctcgttttaagttttggtttaaaaattggcattaacatacccataaaaagcctcagacaaatccctgacacgtattttctccc
agGCAGATCCCTTTTACCCGCTCTTGCATTTTATGGAGGATTCATCGTTGCAGGCATGGTCATAATCTTATATGTACAAATCTTCAATCATAATATTAGATGTTTAATTATTTGGATACGAGCATAAGGGAGCTCTCAAGATCCCCTGTGATGTCTTCTTGTTTGAAGGGATTCTCAAACTCATTAACAACAGATGTCCA
TTAGCAACATCAGTCTGTCATGAATGATTTTGAGAAGCGGTTATTTATTTTATTTTGGAGTTAGTAATTCCCAATGATGGATAGTTTATGATATCTCTTCAGGTTGTGTCTAGTATCCCAACACTGGAACAATATTTTTAAGTCCTTGGAATTCAAAGAGTTACCCTCCAGCTTAATGGTTCCCGGTACTCTGACCTTTC
TCATTTCACGCAAGGAGCGCTCATATGGCATCATTACAGATTTACAGATTAGTGTGGAAAGCAGATATAAGTTCCATATATTATGAATCGATTTCGTTCCAAGCGTAAGGGTCTTGTTGGCCAGTTGCAAAGGCATACTTTGTTGTTCTAGTACCGGTAAATCCAAATACATATGCAATCATGTCACTAGATCACAGATT
GAATTTCCAGCTTGCATTAAACTTACACGGTGGGAATTCCATAGTCTTTATTTTGACCCTTGCAAAAGGTGAAACCCTAGCCTAAAGTTATTGTGAGACCTGTACTCAACATTGGGCTTTTAAACGTGCACATGACATGTATATTACTATATACAGATCAGATAATATCTCATTTAAACGATTACCCACAATTGCATCTC
TCAGATGATGAATACCAATTGATCAACCGATTTAAGGACATTGTCTACCTCGTCCTGGCTGCAAAACAAGATCTCCTGCTGGATATTCATAATAAAACTTCCCTGCCTATGTTTGGATGGAATTTTAGCGGATTCAATGCGGCGATTTTGAATTTCATGATCTTCTCTTCACATGAGTTGTTCTTGTTTGGGGAGTCTTG
GTTCAGATAGACTTTCAAGGCGCCCACAGGGCAACTTATTGCCATTGGCCTCTCTAATTCCCCTAGAATTTGAGTGTGATTGTGATTGTAAGTTCCCTCTGAAATGGCAGCCATTATTGTGTTTGTGTTGTCCATTAAGCCAGAGTTAGCAAACTGTTTCCACTTGAAGATGTCATAAGATGTCATAAGTTTTTATAGTT
TCTCTTTGGACTGTGGTTGCGGTACGAATACAAGAGCAGAACTTCTAGCTCTTTGGGCTGTTCTTAGAGTGAGTTGTTTGATGGGTCTGCCCATTCATTTGATTTTTGGTGATTCGATGGTGATTATTTATTGGATAAACAGAGTTACAGCCCTTGAAATTCCTACTCTGATGCACTGGTGTGATGAAATAAACTATATG
CTGTAGCTTGTCCCACCGGTAATCTTCAAACATATCTTCCGAGAGCACAACATGCTAGCTGATGGTCTTCAAAAGCAGGCTCTGAAAATGGAATTGGGATCTGGATATTTCACTGAAACATTGGATGGGAAGGTCATTGAACATGGCCAATTCATACTTTTTTAGCTGCTGTTTATCATCTTTTTTCAGCGTTTGAATGA
CATGCAGATGTACTTCTTTCTTTGTCTG