sp|Q6ICW6|WNK11_ARATH ----> Probable serine/threonine-protein kinase WNK11

Intron 1 GTATGCCGTT ... TCTAGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.33	12	7	6
A2	30.16	44	4	19
A3	24.24	25	0	8
A4	29.17	17	1	7
A5	15.63	27	0	5
A6	23.81	96	3	30
A7	24.17	91	1	29
A8	25.45	41	1	14
A9	26.85	109	0	40
A10	22.31	94	2	27

>TRINITY_DN121081_c0_g3_i2 from sample A2 / Example spliced isoform

TTCTCATTGCTCGCGTTTTCTACTCTTTCGCTTCTCGCTTTTTCCAGATTTCAAAAACGGCCGCTGAGCCAGCTCTGCAACAAGAGAAAGGTGCCTTACGGGAGCGAAAATGCTGTTGGTCTCTTTGGTAGCCTCAAAGGAAGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGCTCAGCCTCTGAATTCTGTACATCATCTGAAT
TCAGGGAACATCTCCATTTCTGTGTCTTCCTTTAGCCCTGCAAGGTTTTCTTCTTGTTCAATTCAAACAAGAAGAGGACAAGTGGGAATTCAAGGGTTAGGGTTTTTAATTTTTCCACCCTTAACAAACAAAATGCCTGCTGTAGAATGTGATGCCGGTGACAAGGACAGGGAACCTTTTGTGGAAGTGGATCCGACTGG
TCGATATGGACGCTATGAGGAGGTGTTGGGTCGTGGTGCCATGAAGACAGTATACCGAGCTTTTGATCAGGAAGACGGTATCGAGGTTGCTTGGAACAAGGTGTCTCTGCAAAACCTTGATGATGTTTCCGTACTAAGGATCTATGGAGAAGTCCGTCTGTTGAAATCTCTCAGGAATGAAAACATCATTATGCTTTACA
ATGCTTGGTTGGATAAAAAGACAAGGCATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGTACCTCGGGGACCCTGAGAGAGTACCGTCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCTGTGAAAAATTGGTCACGGCAGATACTGGAGGGATTGCATTATCTGCATAATCAGAACCCTTGCATAATTCATAGAGATTTGAATTGCAGC
AATATTTTGGTGAATGGCAATACTGGCGTTCTGAAGATTGGGGATCTGGGTCTTGCCGCTACCCTGGAAAATGATCATGCCGCACACACTGTTATTGGTACACCGGAATTCATGGCCCCGGAATTATATGAAGAGCATTATAATGAGCTTGTAGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGTTTGCTGGAGATGGTTACTTTGGA
GATTCCTTACAGTGAGTGCCGTAGCGTTGCTCAGATTTATAAGAAGGTGAGTTCCGGTATAAGGCCTGCAGCATTGGAAAAAGTTACCAATCAAGAGACGAGACAATTTATTGAAAAATGCCTGGCAGCAGAATCGGTGAGGCCTACTGTTGCAGAGCTTCTGATGGACCCATTTCTTATAGGAGTACAAGTGAACAGCT
AGTATATGTGCATTGCAGATTCTCATCTTCTGTTGTAAAGAGTTTGGATAACGGTATTTGGGTGTTTTAGTACTTAACAGGTTCTGTGATCGTGTGTTATTGTAAAGGATAGGACTTAATTATTTTTAAGATGTGCCCCGTTAGTTTAAGAATTGAAGTAGGCGTTTCTGTCAGCATATGCGGAAAACGTCGTTAAAAGA
TGATGACGAAAGTTAGGTGTAAGGAGATATATAAATATTTATTGATGTATATGTTGAGCTTTTGCTTGATAAAATTCGGCAGTATGATTTGAAGTTCTCTTGATACTCGCAATATGATTGATGCAAATGGATGATATTTTATTTCCAGCAGTTTATTTATTATTTTTATTCATCGCATGTCATTATAAAATGTATGATTG
TATGCAGAATTAGGGCACATTATGTTCCAGTTTATTTTGTTTTAACATGAACTGTTAAAAGTTGACATTGCATTATATTTTAAGAAAACCGTGAGCATAGTTTCCTGTCTATTATGCAATGTAATTCAATTTTATAACCATGCATTTGGTACCTTGACCTATTGGTAAGAG

>TRINITY_DN121081_c0_g3_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TTCTCATTGCTCGCGTTTTCTACTCTTTCGCTTCTCGCTTTTTCCAGATTTCAAAAACGGCCGCTGAGCCAGCTCTGCAACAAGAGAAAGgtatgccgtttccaatatctctgaacaacccgttctcaagcttttttatggatttttattttttattcttgtgtaagggcgttgttaaaaatatttgtcagagttccatt
ttcttattttccgtatccatttcaagagaaattggatcagacattcaaatgatttctggtgtatttgtcctgcaaagcgattaggtttttacatttaaatttattgcgaggattttctagtgcagGTGCCTTACGGGAGCGAAAATGCTGTTGGTCTCTTTGGTAGCCTCAAAGGAAGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCTAT
CTGCTCAGCCTCTGAATTCTGTACATCATCTGAATTCAGGGAACATCTCCATTTCTGTGTCTTCCTTTAGCCCTGCAAGGTTTTCTTCTTGTTCAATTCAAACAAGAAGAGGACAAGTGGGAATTCAAGGGTTAGGGTTTTTAATTTTTCCACCCTTAACAAACAAAATGCCTGCTGTAGAATGTGATGCCGGTGACAAG
GACAGGGAACCTTTTGTGGAAGTGGATCCGACTGGTCGATATGGACGCTATGAGGAGGTGTTGGGTCGTGGTGCCATGAAGACAGTATACCGAGCTTTTGATCAGGAAGACGGTATCGAGGTTGCTTGGAACAAGGTGTCTCTGCAAAACCTTGATGATGTTTCCGTACTAAGGATCTATGGAGAAGTCCGTCTGTTGAA
ATCTCTCAGGAATGAAAACATCATTATGCTTTACAATGCTTGGTTGGATAAAAAGACAAGGCATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGTACCTCGGGGACCCTGAGAGAGTACCGTCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCTGTGAAAAATTGGTCACGGCAGATACTGGAGGGATTGCATTATCTGCATAATCAGA
ACCCTTGCATAATTCATAGAGATTTGAATTGCAGCAATATTTTGGTGAATGGCAATACTGGCGTTCTGAAGATTGGGGATCTGGGTCTTGCCGCTACCCTGGAAAATGATCATGCCGCACACACTGTTATTGGTACACCGGAATTCATGGCCCCGGAATTATATGAAGAGCATTATAATGAGCTTGTAGATGTTTATTCC
TTTGGCATGTGTTTGCTGGAGATGGTTACTTTGGAGATTCCTTACAGTGAGTGCCGTAGCGTTGCTCAGATTTATAAGAAGGTGAGTTCCGGTATAAGGCCTGCAGCATTGGAAAAAGTTACCAATCAAGAGACGAGACAATTTATTGAAAAATGCCTGGCAGCAGAATCGGTGAGGCCTACTGTTGCAGAGCTTCTGAT
GGACCCATTTCTTATAGGAGTACAAGTGAACAGCTAGTATATGTGCATTGCAGATTCTCATCTTCTGTTGTAAAGAGTTTGGATAACGGTATTTGGGTGTTTTAGTACTTAACAGGTTCTGTGATCGTGTGTTATTGTAAAGGATAGGACTTAATTATTTTTAAGATGTGCCCCGTTAGTTTAAGAATTGAAGTAGGCGT
TTCTGTCAGCATATGCGGAAAACGTCGTTAAAAGATGATGACGAAAGTTAGGTGTAAGGAGATATATAAATATTTATTGATGTATATGTTGAGCTTTTGCTTGATAAAATTCGGCAGTATGATTTGAAGTTCTCTTGATACTCGCAATATGATTGATGCAAATGGATGATATTTTATTTCCAGCAGTTTATTTATTATTT
TTATTCATCGCATGTCATTATAAAATGTATGATTGTATGCAGAATTAGGGCACATTATGTTCCAGTTTATTTTGTTTTAACATGAACTGTTAAAAGTTGACATTGCATTATATTTTAAGAAAACCGTGAGCATAGTTTCCTGTCTATTATGCAATGTAATTCAATTTTATAACCATGCATTTGGTACCTTGACCTATTGG
TAAGAG

Intron 2 GTATGCCGTT ... TCTAGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.33	12	2	6
A2	30.16	44	2	19
A3	24.24	25	0	8
A4	29.17	17	0	7
A5	15.63	27	0	5
A6	23.26	99	0	30
A7	24.17	91	0	29
A8	25.45	41	1	14
A9	26.85	109	0	40
A10	22.31	94	1	27

>TRINITY_DN43024_c1_g4_i1 from sample A8 / Example spliced isoform

CCAAACCCAGGTTAAGAGGGAACCCTGGTTACCATACCAAACCTCAGCAGTCTCCAAGATATATTTATTGAACAGTGTTCCCTCTTCTTCTTTCCATGTTCCATTCTCATTGCTCGCGTTTTCTACTCTTTCGCTTCTCGCTTTTTCCAGATTTCAAAAACGGCCGCTGAGCCAGCTCTGCAACAAGAGAAAGGTGCCTT
ACGGGAGCGAAAATGCTGTTGGTCTCTTTGGTAGCCTCAAAGGAAGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGCTCAGCCTCTGAATTCTGTACATCATCTGAATTCAGGGAACATCTCCATTTCTGTGTCTTCCTTTAGCCCTGCAAGGTTTTCTTCTTGTTCAATTCAAACAAGAAGAGGACAAGTGGGAATTCAAGGGT
TAGGGTTTTTAATTTTTCCACCCTTAACAAACAAAATGCCTGCTGTAGAATGTGATGCCGGTGACAAGGACAGGGAACCTTTTGTGGAAGTGGATCCGACTGGTCGATATGGACGCTATGAGGAGGTGTTGGGTCGTGGTGCCATGAAGACAGTATACCGAGCTTTTGATCAGGAAGACGGTATCGAGGTTGCTTGGAAC
AAGGTGTCTCTGCAAAACCTTGATGATGTTTCCGTACTAAGGATCTATGGAGAAGTCCGTCTGTTGAAATCTCTCAGGAATGAAAACATCATTATGCTTTACAATGCTTGGTTGGATAAAAAGACAAGGCATGTGAATTTCATTACTGAGGTCTGTACCTCGGGGACCCTGAGAGAGTACCGTCAGAAGCACCGGCATGT
CTCCATGAAGGCTGTGAAAAATTGGTCACGGCAGATACTGGAGGGATTGCATTATCTGCATAATCAGAACCCTTGCATAATTCATAGAGATTTGAATTGCAGCAATATTTTGGTGAATGGCAATACTGGCGTTCTGAAGATTGGGGATCTGGGTCTTGCCGCTACCCTGGAAAATGATCATGCCGCACACACTGTTATTG
GTACACCGGAATTCATGGCCCCGGAATTATATGAAGAGCATTATAATGAGCTTGTAGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGTTTGCTGGAGATGGTTACTTTGGAGATTCCTTACAGTGAGTGCCGTAGCGTTGCTCAGATTTATAAGAAGGTGAGTTCCGGTATAAGGCCTGCAGCATTGGAAAAAGTTACCAATCAAGAG
ACGAGACAATTTATTGAAAAATGCCTGGCAGCAGAATCGGTGAGGCCTACTGTTGCAGAGCTTCTGATGGACCCATTTCTTATAGGAGTACAAGTGAACAGCTAGTATATGTGCACTGCAGATTCTCATCTTCTGTTGTAAAGAGTTTGGATAACGGTATTAGGGTGTTTTAGTACTTAACAGGTTCTGTGATCGTGTGT
TATTGTAAAGGATAGGACTTAATTATTTTGAAGATGTGCCCCGTTAGTTTAAGAATTGAAGTAGGCGTTTCTGTCAGCATATGCGGAAAACGTCGTTAAAAGATGATGACGAAAGTTAGGTGTAAGGAGATATATAAATATTTATTGATGTATATGTTGAGCTTTTGCTTGATAAAATTCGGCAGTATGATTTGAAGTTC
TCTTGATACTCGCAATATGATTGATGCAAATGGATGATATTTTATTTCCAGCAGTTTATTTATTATTTTTATTCATCGCATGTCATTATAAAATGTATGATTGTATGCAGAATTAGGG

>TRINITY_DN43024_c1_g4_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CAGCTCTGCAACAAGAGAAAGgtatgccgtttccaatatctctgaacaacccgttctcaagctttttttatggatttttattttttattcttgtgtaagggcgttgttaaaaatatttgtcagagttccattttcttattttccgtatccatttcgagagaaattggatcagacattcaaatgatttctggtgtatttgt
cctgcatagcgatttaggtttttacatttaaatttattgcgaggattttctagtgcagGTGCCTTACGGGAGCGAAAATGCTGTTGGTCTCTTTGGTAGCCTCAAAGGAAGCAAAGTCTTCCGTCTTTGCTATCTGCTCAGCCTCTGAATTCTGTACATCATCTGAATTCAGGGAACATCTCCATTTCTGTGTCTTCCTT
TAGCCCTGCAAGGTTTTCTTCTTGTTCAATTCAAACAAGAAGAGGACAAGTGGGAATTCAAGGGTTAGGGTTTTTAATTTTTCCACCCTTAACAAACAAAATGCCTGCTGTAGAATGTGATGCCGGTGACAAGGACAGGGAACCTTTTGTGGAAGTGGATCCGACTGGTCGATATGGACGCTATGAGGAGGTGTTGGGTC
GTGGTGCCATGAAGACAGTATACCGAGCTTTTGATCAGGAAGACGGTATCGAGGTTGCTTGGAACAAGGTGTCTCTGCAAAACCTTGATGATGTTTCCGTACTAAGGATCTATGGAGAAGTCCGTCTGTTGAAATCTCTCAGGAATGAAAACATCATTATGCTTTACAATGCTTGGTTGGATAAAAAGACAAGGCATGTG
AATTTCATTACTGAGGTCTGTACCTCGGGGACCCTGAGAGAGTACCGTCAGAAGCACCGGCATGTCTCCATGAAGGCTGTGAAAAATTGGTCACGGCAGATACTGGAGGGATTGCATTATCTGCATAATCAGAACCCTTGCATAATTCATAGAGATTTGAATTGCAGCAATATTTTGGTGAATGGCAATACTGGCGTTCT
GAAGATTGGGGATCTGGGTCTTGCCGCTACCCTGGAAAATGATCATGCCGCACACACTGTTATTGGTACACCGGAATTCATGGCCCCGGAATTATATGAAGAGCATTATAATGAGCTTGTAGATGTTTATTCCTTTGGCATGTGTTTGCTGGAGATGGTTACTTTGGAGATTCCTTACAGTGAGTGCCGTAGCGTTGCTC
AGATTTATAAGAAGGTGAGTTCCGGTATAAGGCCTGCAGCATTGGAAAAAGTTACCAATCAAGAGACGAGACAATTTATTGAAAAATGCCTGGCAGCAGAATCGGTGAGGCCTACTGTTGCAGAGCTTCTGATGGACCCATTTCTTATAGGAGTACAAGTGAACAGCTAGTATATGTGCACTGCAGATTCTCATCTTCTG
TTGTAAAGAGTTTGGATAACGGTATTAGGGTGTTTTAGTACTTAACAGGTTCTGTGATCGTGTGTTATTGTAAAGGATAGGACTTAATTATTTTGAAGATGTGCCCCGTTAGTTTAAGAATTGAAGTAGGCGTTTCTGTCAGCATATGCGGAAAACGTCGTTAAAAGATGATGACGAAAGTTAGGTGTAAGGAGATATAT
AAATATTTATTGATGTATATGTTGAGCTTTTGCTTGATAAAATTCGGCAGTATGATTTGAAGTTCTCTTGATACTCGCAATATGATTGATGCAAATGGATGATATTTTATTTCCAGCAGTTTATTTATTATTTTTATTCATCGCATGTCATTATAAAATGTATGATTGTATGCAGAATTAGGG