sp|Q9M4U5|HDT2_MAIZE ----> Histone deacetylase HDT2
Intron 1 GTATGTTACT ... TGATTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 4.09 | 712.9 | 35.7 | 183.6 |
| A2 | 4.06 | 552.8 | 27.6 | 126.2 |
| A3 | 4.12 | 591.9 | 31.5 | 129.2 |
| A4 | 5.44 | 356.8 | 24 | 90.7 |
| A5 | 5.28 | 270.9 | 17.8 | 48.3 |
| A6 | 2.67 | 2794.7 | 96.9 | 583.8 |
| A7 | 2.77 | 3539.7 | 131.3 | 736.9 |
| A8 | 2.83 | 4310.3 | 160.4 | 911.8 |
| A9 | 2.79 | 3583.9 | 133.4 | 732.4 |
| A10 | 3.24 | 2754.8 | 121.4 | 534.9 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformTACTTAAAATTTTAACTGAAATTCCTGTAAATCAATGATGATTTTCATTTGCAGATGAGATTTGTTATTCAATTTAAACATTTGCAATTCATCAATTGGCATTCATTCAACATTTTTTTTTATACTTTTCTCTGTAGTGTCACTACATAGGGGCTCAACAAGAGCATCATGTCACTTGCAAGAATTAGAAAAACAATAAA
TTTGGTCAGTCTCACTAATAGCTCTCTTACTTGAACCAAGTTGCAATTGCCTAATTGCAGTTTTACAAATGAAATGATGATGGTTCTTGGGTTCAGACTAAGTTGAAAATTGCCTAGGTAATTTTTTCTATGTTGCTGTATCTTCATCATTATTGCTAAGATCTTCAGTCAACGGGCTTTCAAGATAATCATTGTTCTCA
AGCATAGGCTTGGTATCTTGGCCCACTTCGAACTCTTCAATCTCTATCTCTGTACACAAGTTTTATGCAAGTTAAATTGCACTGAAAGCCCTAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAAATGTGAACATCAAGTGTTTTAGTGTTAGTGTTTATGC
ATACATCAATTGGGGTTTGACTGACTGTACTGTGCCATATCCAGCTGGGGATATGCTGCCTATGTACTTACTTCCAATGGGTATGTGTGCCAGGTACTTGGTTTGCATACCTAGTAGGTATTTGCAGTTTGGATCCTGAAAGCCATTTGACTTATTTTGGGCTGTGCATGCATAAATTGTGGTATGTCTCCAGTTTTGAT
GTGTTTATGCCGTGTATGTATCTTGCACCTAGCTGGGTACTGGGTACAGGGTACATTTGCCGGTACTTGGTTTGTGTACCTACCATATGGTCACATATACCTCATCTAGTTAGTTTAGATCCTGAGAAAGAACCATTCCACACTGAATATATTAATATGGCAAGATAAAGTAGCAATTACAGTATTTTCTGTTAAAGGCC
TGTGGGTACTTCAGATGCAGTTTGTATTCAAACTTGGCTGCCTTTATTGATAACCAAACGGTCGAGCAGAAACAATTTTTTTTTGCAAAATGAGAAAATGCCTGATCAAATCTTATCTTAAGACATCGTACATATCATAATGTTCTTTTTGCTGTGGGAGGCTGCTTTTAAATTTAAACCCCAGATTCATATTCTTTCTT
TTACAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGGTATGCTAGTGCTTTTTAAATGTCTGCTAGACTCTTTATCCTTCTGTTTTCTTTTTGGCTAATCTTTCATTACATAATAGCCGGCTGCTGGAAAG
AAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGA
GGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCATCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATG
TAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAGCAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAA
AGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTTGGCTGTTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTC
CTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTC
AGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTAT
TAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAA
TGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACA
TCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAG
GCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATG
AAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGGTATGCTAGTGCTTTTTAAATGTCTGCTAGACTCTTTATCCTTCTGTTTTCTTTTTGGCTAATCTTTCATTACATAATAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCT
CTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCATCCAT
GTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAGCAGAA
AATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAAAGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTTGGCTG
TTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGGTAAATCTTTTATCTTTCTAGAAACAAAT
TGATGGAATCTGAGTACATTAAATTACCTGTATTGTCTAATATCTTTGTCAATAAAACTGCAGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGgtatgttactttcaagttgatgccttgtggcctctggataatggactgcatgtgttgtttcaatatggctat
tgctaatttagcattgccttggtttgtaattgttgaatatgaatggaattgggttatgttttggcaaaatgaatggaatttgatcgtctacaggtgatcataggagcatcatataattagttctatatattgaatatgaactaaagtattgtcatattaggtggtgcttaatgtaagtaattgaatgcatttttggtttg
cgtatcttgtttttccctttgacttatcaaatcattgattttcagGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATC
TCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGT
TGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATC
ATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATG
TGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
Intron 2 GTTACTTCTT ... GCCTAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45.13 | 169 | 22 | 139 |
| A2 | 44.48 | 161 | 13 | 129 |
| A3 | 44.31 | 186 | 24 | 148 |
| A4 | 42.2 | 126 | 20 | 92 |
| A5 | 43.18 | 100 | 23 | 76 |
| A6 | 45.58 | 443 | 3 | 371 |
| A7 | 46.47 | 773 | 7 | 671 |
| A8 | 46.82 | 510 | 3 | 449 |
| A9 | 45.84 | 683 | 2 | 578 |
| A10 | 45.73 | 692 | 4 | 583 |
>TRINITY_DN106510_c1_g1_i4 from sample A4 / Example spliced isoformCAGTGTTCTGTTTTCTGGCTCAACGGTTTAGGGTTCAGGGTTTCAGAATTTTGTTAGTGTGATGTGGATCAGTGTTCTGTTTTCTGGCCCAACGGTTTAGGGTTCAGGGTTTCAGAATTTTGTTAGTGTGATGTGGATCAGTGTTCTGTTTTCTGGTTTCAGAATTTTTTAGTGTGATGCGGATGAGATACTGTAGACTT
GTTTCACCAGTCAGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAAAGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGG
TTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGA
>TRINITY_DN106510_c1_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:CAGTGTTCTGTTTTCTGGCTCAACGGTTTAGGGTTCAGGGTTTCAGAATTTTGTTAGTGTGATGTGGATCAGTGTTCTGTTTTCTGGCCCAACGGTTTAGGGTTCAGGGTTTCAGAATTTTGTTAGTGTGATGTGGATCAGTGTTCTGTTTTCTGGTTTCAGAATTTTTTAGTGTGATGCGGATGAGATACTGTAGACTT
GTTTCACCAGTCAGgttacttctttttttctctaataatagtagtgttcataatgtttgcttggccataaatgatgaaatcttcttgttcaatcgcaagtatttgagcccagtagccctcgtcaaagcccaaaccttaggcagtatgcggattttcattcataactgtgaatggtctgcggttatatcaagagagcaaaa
gtaaacgtagccagttgttctgaactgcttatttttaaccttgcaagccatgttaacctctaaattagggcttccgaatccacagatgtatatggtatggtatatcttctgcctttttatgaaatattggccatcgacggccgggatgttgctttgaccttaacatgaactcttgacagacagtagtttgatacgaagcg
tgttggcagatcatcagccctaaacccttgttttgcggttttaatgacatttagatgttgtttagatttctatgttttgtgtttgatactcaccgtgctttcagatttagtagacattaccctgttctcgttgcatttgattctccaaaggaagctggcgtttgtgttgttttgttttttcttttagttgaagctgttca
cttttgttggctgtattcactatttttcatgtatggcgttttatactaggcaggtttgattttagtcttgctttaaagaacgttcgaagacaacctgttctctaggggtccctaattgttagagtaaattttgaaattgaagaactgatttaattcgaattaaacatagattcggattgatgatgttggtatttcaagat
tgagatctataatttaaattatctatatatttgtttttgtaggctcggcagtctatgagagtttggtcctctatagctcgtttaaataattgtacaatttatctttctcgagtgttgtgtgtcgtgtgtacactgtccagttttagcatgtcggttgtggggttgtcctagtctttgtaacgttgttattctttttgcta
cctagttttagagaactaggttatgttgattgtttcacggcactcgtaatcttgtctttgtacatatttgtgttgtttttaagcctttgttaatgacgtgcttgttttggtatataattttgattcttgttgcctaatcagGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTT
CATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAAAGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTC
TGGCTACACTACTATCGA
Intron 3 GTAATAATTA ... TATTTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.87 | 495.2 | 45 | 387 |
| A2 | 44.2 | 419.2 | 48 | 332 |
| A3 | 42.65 | 443.8 | 20 | 330 |
| A4 | 42 | 216.8 | 33 | 157 |
| A5 | 41.94 | 180 | 17 | 130 |
| A6 | 43.2 | 1731.7 | 40 | 1317 |
| A7 | 41.66 | 2537.1 | 75 | 1812 |
| A8 | 42.02 | 2681 | 96 | 1942.8 |
| A9 | 41.97 | 2353.1 | 60 | 1702 |
| A10 | 41.82 | 2079.7 | 21 | 1495 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAA
AACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTG
CCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGT
TTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGT
AATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGG
TCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCA
TCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAG
CAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGgtaataattagatcagtgggttgacagttctcagtggtgttttgaactttgtaaaacaatcactggctttgaactgggtaaaggaattgccaattctctgaaaagtgaggcacatactatgattggaacattttttt
ggctgtttttagttaatagagactggtttgcaattatttattttccagGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCT
GGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTA
GTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAA
TTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCA
TATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCC
CATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
Intron 4 ATATCCTTAT ... CGAGAAGCAC
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.23 | 778.1 | 321.3 | 60.1 |
| A2 | 30.52 | 596.2 | 261.9 | 40.8 |
| A3 | 31.71 | 777.2 | 360.9 | 48.6 |
| A4 | 26.27 | 520.1 | 185.3 | 51.4 |
| A5 | 30.94 | 337.3 | 151.1 | 35.4 |
| A6 | 28.67 | 1788.6 | 718.7 | 101.6 |
| A7 | 29.97 | 3373.7 | 1443.9 | 188.4 |
| A8 | 26.24 | 2619.4 | 932 | 155.9 |
| A9 | 29.65 | 3068.1 | 1293.1 | 174.7 |
| A10 | 28.39 | 2571.9 | 1019.9 | 147.6 |
>TRINITY_DN118460_c5_g4_i6 from sample A2 / Example spliced isoformGGCTTTAATAGATTATAACCGTAGAAAATGGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCG
TTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTACAATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCA
GGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAAAGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTA
CTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCCCGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAG
CCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGTCTCACCTTGCTCTATTTACTGTGTTTTGGTTGTTGTTGGAATCTTGGTGGAGTTTCTTTCAATCGCTATAGAAGACAGTTATTTATTATTTAACCATATGTTTGGAACTAAACCATCTGTTTGGAACTATGTTGTCAA
GGTTTGTGGGTATTGGTATGGGTATGGATACTGGTATGACTCTTCTGAAAATTTTGCAGTATCCTCCACCTCTTCCCATGAATATCCAGATGGAGGTTGCTTCATTTGTTAGCCTCTCAATTGCCACTCACAACAGTGGCTGGTTCACCAATTGGGACTTATTAGCTGGGTTACCTGGGGAACCTCACTGTGAACTCTGC
CATTAAACCATCCTGTTTAAATCGTTGAGCTAATTAATTCACTGGGCTACTTAAAATTTTAACTGAAATTCCTGTAAATCAATGATGATTTTCATTTGCAGATGAGATTTGTTATTCAATTTAAACATTTGCAATTCATCAATTGGCATTCATTCAACATTTTTTTTTATACTTTTCTCTGTAGTGTCACTACATAGGGG
CTCAACAAGAGCATCATGTCACTTGCAAGAATTAGAAAAACAATAAATTTGGTCAGTCTCACTAATAGCTCTCTTACTTGAACCAAGTTGCAATTGCCTAATTGCAGTTTTACAAATGAAATGATGATGGTTCTTGGGTTCAGACTAAGTTGAAAATTGCCTAGGTAATTTTTTCTATGTTGCTGTATCTTCATCATTAT
TGCTAAGATCTTCAGTCAACGGGCTTTCAAGATAATCATTGTTCTCAAGCATAGGCTTGGTATCTTGGACCACTTCGAACTCTTCAATCTCTATCTCTGTACACAAGTTTTATGCAAGTTAAATTGCACTGAAAGCCCTAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCT
GATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGA
>TRINITY_DN118460_c5_g4_i7 from sample A2 / Example unspliced isoform:GGCTTTAATAGATTATAACCGTAGAAAATGGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCG
TTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTACAATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCA
GGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAAAGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTA
CTATCGAatatccttataagaactttggcaaataatcttgcattttttttttaatactatactcttattttgtaatcctctcttccttaacgagaagcacTCATGAAGCCCTAGATGGATTCCCGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAG
AATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGA
TTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATC
CAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCT
GGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATT
TTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATATTTTTAAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTT
CACCTGTGCATTATTTTACG
Intron 5 GTTAGCATAT ... TGGGAAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28.61 | 424 | 190.5 | 34.1 |
| A2 | 26.3 | 380 | 163 | 36.5 |
| A3 | 27.19 | 409 | 177.5 | 14.9 |
| A4 | 32.76 | 200 | 107.5 | 23.8 |
| A5 | 25.86 | 186 | 76 | 16.5 |
| A6 | 23.13 | 1596 | 603.5 | 40.6 |
| A7 | 23.15 | 2511.3 | 955.9 | 58.5 |
| A8 | 22.73 | 2296.1 | 836.1 | 66 |
| A9 | 22.88 | 2242.1 | 831.5 | 66.9 |
| A10 | 23.1 | 1755 | 674 | 36.4 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAA
AACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTG
CCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGT
TTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGT
AATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGG
TCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATG
AAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGGTATGCTAGTGCTTTTTAAATGTCTGCTAGACTCTTTATCCTTCTGTTTTCTTTTTGGCTAATCTTTCATTACATAATAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCT
CTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGgttagcatattatcctttgaccaccaacttggtatgttaattgtgtctttcagatatgtgttttctgtaatggtgatgagtcatgtcaattagaacagaaatgttgtggtgagggtcaattgaagggttttattgggtgagcccactttgctgctcttatcattatcatccat
gttgactttttgatacttttttgtcagctgatgttttaatagacaaaatattttaattatttttctgttaatcaaattcgtaaaactgttggaacctctcttagacaatgactattttttagtaagtacattctttatgtaaacaccaatagcctagcctttctgcttttggaaatgattcttctatatgggaagcagAA
AATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAAAGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTTGGCTG
TTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGGTAAATCTTTTATCTTTCTAGAAACAAAT
TGATGGAATCTGAGTACATTAAATTACCTGTATTGTCTAATATCTTTGTCAATAAAACTGCAGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGTATGTTACTTTCAAGTTGATGCCTTGTGGCCTCTGGATAATGGACTGCATGTGTTGTTTCAATATGGCTAT
TGCTAATTTAGCATTGCCTTGGTTTGTAATTGTTGAATATGAATGGAATTGGGTTATGTTTTGGCAAAATGAATGGAATTTGATCGTCTACAGGTGATCATAGGAGCATCATATAATTAGTTCTATATATTGAATATGAACTAAAGTATTGTCATATTAGGTGGTGCTTAATGTAAGTAATTGAATGCATTTTTGGTTTG
CGTATCTTGTTTTTCCCTTTGACTTATCAAATCATTGATTTTCAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATC
TCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGT
TGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATC
ATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATG
TGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
Intron 6 GTAAATCTTT ... AAAACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.82 | 766.5 | 245.4 | 27.2 |
| A2 | 25.12 | 630.6 | 216.6 | 23.4 |
| A3 | 25.53 | 712.5 | 250.9 | 13.8 |
| A4 | 22.63 | 367.8 | 110.2 | 17.5 |
| A5 | 24.17 | 301.1 | 98 | 17.2 |
| A6 | 22.85 | 3124.4 | 946.7 | 49.9 |
| A7 | 23.02 | 4159.8 | 1274.2 | 61.1 |
| A8 | 22.19 | 4874.7 | 1421.1 | 78.8 |
| A9 | 22.31 | 4077.9 | 1197.2 | 64 |
| A10 | 23.67 | 3428.6 | 1090.6 | 46.7 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformTACTTAAAATTTTAACTGAAATTCCTGTAAATCAATGATGATTTTCATTTGCAGATGAGATTTGTTATTCAATTTAAACATTTGCAATTCATCAATTGGCATTCATTCAACATTTTTTTTTATACTTTTCTCTGTAGTGTCACTACATAGGGGCTCAACAAGAGCATCATGTCACTTGCAAGAATTAGAAAAACAATAAA
TTTGGTCAGTCTCACTAATAGCTCTCTTACTTGAACCAAGTTGCAATTGCCTAATTGCAGTTTTACAAATGAAATGATGATGGTTCTTGGGTTCAGACTAAGTTGAAAATTGCCTAGGTAATTTTTTCTATGTTGCTGTATCTTCATCATTATTGCTAAGATCTTCAGTCAACGGGCTTTCAAGATAATCATTGTTCTCA
AGCATAGGCTTGGTATCTTGGCCCACTTCGAACTCTTCAATCTCTATCTCTGTACACAAGTTTTATGCAAGTTAAATTGCACTGAAAGCCCTAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAAATGTGAACATCAAGTGTTTTAGTGTTAGTGTTTATGC
ATACATCAATTGGGGTTTGACTGACTGTACTGTGCCATATCCAGCTGGGGATATGCTGCCTATGTACTTACTTCCAATGGGTATGTGTGCCAGGTACTTGGTTTGCATACCTAGTAGGTATTTGCAGTTTGGATCCTGAAAGCCATTTGACTTATTTTGGGCTGTGCATGCATAAATTGTGGTATGTCTCCAGTTTTGAT
GTGTTTATGCCGTGTATGTATCTTGCACCTAGCTGGGTACTGGGTACAGGGTACATTTGCCGGTACTTGGTTTGTGTACCTACCATATGGTCACATATACCTCATCTAGTTAGTTTAGATCCTGAGAAAGAACCATTCCACACTGAATATATTAATATGGCAAGATAAAGTAGCAATTACAGTATTTTCTGTTAAAGGCC
TGTGGGTACTTCAGATGCAGTTTGTATTCAAACTTGGCTGCCTTTATTGATAACCAAACGGTCGAGCAGAAACAATTTTTTTTTGCAAAATGAGAAAATGCCTGATCAAATCTTATCTTAAGACATCGTACATATCATAATGTTCTTTTTGCTGTGGGAGGCTGCTTTTAAATTTAAACCCCAGATTCATATTCTTTCTT
TTACAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGGTATGCTAGTGCTTTTTAAATGTCTGCTAGACTCTTTATCCTTCTGTTTTCTTTTTGGCTAATCTTTCATTACATAATAGCCGGCTGCTGGAAAG
AAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGA
GGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCATCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATG
TAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAGCAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAA
AGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTTGGCTGTTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTC
CTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTC
AGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTAT
TAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAA
TGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACA
TCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAG
GCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATG
AAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGGTATGCTAGTGCTTTTTAAATGTCTGCTAGACTCTTTATCCTTCTGTTTTCTTTTTGGCTAATCTTTCATTACATAATAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCT
CTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCATCCAT
GTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAGCAGAA
AATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAAAGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTTGGCTG
TTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGgtaaatcttttatctttctagaaacaaat
tgatggaatctgagtacattaaattacctgtattgtctaatatctttgtcaataaaactgcagAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGTATGTTACTTTCAAGTTGATGCCTTGTGGCCTCTGGATAATGGACTGCATGTGTTGTTTCAATATGGCTAT
TGCTAATTTAGCATTGCCTTGGTTTGTAATTGTTGAATATGAATGGAATTGGGTTATGTTTTGGCAAAATGAATGGAATTTGATCGTCTACAGGTGATCATAGGAGCATCATATAATTAGTTCTATATATTGAATATGAACTAAAGTATTGTCATATTAGGTGGTGCTTAATGTAAGTAATTGAATGCATTTTTGGTTTG
CGTATCTTGTTTTTCCCTTTGACTTATCAAATCATTGATTTTCAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATC
TCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGT
TGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATC
ATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATG
TGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
Intron 7 ATATCCTTAT ... CGAGAAGCAC
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.21 | 778 | 321 | 14 |
| A2 | 30.46 | 596 | 261 | 14 |
| A3 | 31.66 | 777 | 360 | 14 |
| A4 | 26.24 | 520 | 185 | 21 |
| A5 | 30.8 | 337 | 150 | 14 |
| A6 | 28.57 | 1788 | 715 | 22 |
| A7 | 29.93 | 3373 | 1441 | 32 |
| A8 | 26.2 | 2619 | 930 | 38 |
| A9 | 29.63 | 3068 | 1292 | 59 |
| A10 | 28.3 | 2571 | 1015 | 28 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCA
TCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAG
CAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAAAGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTT
GGCTGTTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCT
GGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTA
GTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAA
TTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCA
TATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCC
CATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGAatatccttataagaactttggca
aataatcttgcatttttttttaatactatactcttattttgtaatcctctcttccttaacgagaagcacTCATGAAGCCCTAGATGGATTCCCGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGTGAGTTAGTTGTTCATCTCTGTC
TTGCTTACATCTTGCAAATGGAGTGCTGTATGCAGAAGTGTTCTTTTCTTGATTTGTATATGGGAATGAGATTTTTTTTTCAAATAGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGAT
TCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGTCTCACCTTGCTCTATTTACTGTGTTTTGGTTGTTGTTGGAATCTTGGTGGAGTTTCTTTCAATCGCTATAGAAGACAGTTATTTATTATTTAACCATATGTTTGGAACTAAACCATCTGTTTGGAACTATGTTGTCAAGGTTTGTGGGTATTGGTATGGGTATGG
ATACTGGTATGACTCTTCTGAAAATTTTGCAGTATCCTCCACCTCTTCCCATGAATATCCAGATGGAGGTTGCTTCATTTGTTAGCCTCTCAATTGCCACTCACAACAGTGGCTGGTTCACCAATTGGGACTTATTAGCTGGGTTACCTGGGGAACCTCACTGTGAACTCTGCCATTAAACCATCCTGTTTAAATCGTTG
AGCTAATTAATTCACTGGGCTACTTAAAATTTTAACTGAAAT
Intron 8 GTAATGAAAT ... GTTAACGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.6 | 469.8 | 3 | 80 |
| A2 | 13.63 | 334.5 | 0 | 46.7 |
| A3 | 18.75 | 447.2 | 2 | 87.7 |
| A4 | 15.77 | 343.8 | 1 | 56.7 |
| A5 | 12.77 | 190.7 | 0 | 24.7 |
| A6 | 11.78 | 1008.7 | 0 | 128 |
| A7 | 12.7 | 1876.3 | 0 | 261.7 |
| A8 | 11.94 | 1597.9 | 0 | 205.3 |
| A9 | 13.09 | 1728.7 | 0.7 | 252 |
| A10 | 11.91 | 1490.2 | 0 | 194 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGAATATCCTTATAAGAACTTTGGCA
AATAATCTTGCATTTTTTTTTAATACTATACTCTTATTTTGTAATCCTCTCTTCCTTAACGAGAAGCACTCATGAAGCCCTAGATGGATTCCCGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGTGAGTTAGTTGTTCATCTCTGTC
TTGCTTACATCTTGCAAATGGAGTGCTGTATGCAGAAGTGTTCTTTTCTTGATTTGTATATGGGAATGAGATTTTTTTTTCAAATAGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGAT
TCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGTCTCACCTTGCTCTATTTACTGTGTTTTGGTTGTTGTTGGAATCTTGGTGGAGTTTCTTTCAATCGCTATAGAAGACAGTTATTTATTATTTAACCATATGTTTGGAACTAAACCATCTGTTTGGAACTATGTTGTCAAGGTTTGTGGGTATTGGTATGGGTATGG
ATACTGGTATGACTCTTCTGAAAATTTTGCAGTATCCTCCACCTCTTCCCATGAATATCCAGATGGAGGTTGCTTCATTTGTTAGCCTCTCAATTGCCACTCACAACAGTGGCTGGTTCACCAATTGGGACTTATTAGCTGGGTTACCTGGGGAACCTCACTGTGAACTCTGCCATTAAACCATCCTGTTTAAATCGTTG
AGCTAATTAATTCACTGGGCTACTTAAAATTTTAACTGAAAT
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATGGATTCCCGGATGATGAAGgtaatgaaatgatttttaactatgtacctaacatcgattgatcttcaatatttgtgtttgtggcaattatctgtgtcttcaacttaaaaccttttgttaacgcagACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGT
GAGTTAGTTGTTCATCTCTGTCTTGCTTACATCTTGCAAATGGAGTGCTGTATGCAGAAGTGTTCTTTTCTTGATTTGTATATGGGAATGAGATTTTTTTTTCAAATAGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACC
AGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGTCTCACCTTGCTCTATTTACTGTGTTTTGGTTGTTGTTGGAATCTTGGTGGAGTTTCTTTCAATCGCTATAGAAGACAGTTATTTATTATTTAACCATATGTTTGGAACTAAACCATCTGTTTGGAACTATGTTGTCAAGGTTT
GTGGGTATTGGTATGGGTATGGATACTGGTATGACTCTTCTGAAAATTTTGCAGTATCCTCCACCTCTTCCCATGAATATCCAGATGGAGGTTGCTTCATTTGTTAGCCTCTCAATTGCCACTCACAACAGTGGCTGGTTCACCAATTGGGACTTATTAGCTGGGTTACCTGGGGAACCTCACTGTGAACTCTGCCATTA
AACCATCCTGTTTAAATCGTTGAGCTAATTAATTCACTGGGCTACTTAAAATTTTAACTGAAAT
Intron 9 GTATGCTAGT ... TACATAATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 13.29 | 1184 | 186.9 | 97 |
| A2 | 12.92 | 1131.6 | 172.4 | 59 |
| A3 | 11.7 | 1290.6 | 175.4 | 93 |
| A4 | 17.37 | 575.1 | 123.9 | 74 |
| A5 | 11.63 | 633.7 | 86.3 | 45 |
| A6 | 9.77 | 4930.2 | 551.7 | 146 |
| A7 | 9.39 | 7548.8 | 810.1 | 210 |
| A8 | 8.76 | 6956.5 | 694 | 179 |
| A9 | 9.64 | 6643.1 | 732 | 226 |
| A10 | 9.71 | 6314.9 | 705 | 164 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCA
TCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAG
CAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAAAGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTT
GGCTGTTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCT
GGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTA
GTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAA
TTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCA
TATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCC
CATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:TACTTAAAATTTTAACTGAAATTCCTGTAAATCAATGATGATTTTCATTTGCAGATGAGATTTGTTATTCAATTTAAACATTTGCAATTCATCAATTGGCATTCATTCAACATTTTTTTTTATACTTTTCTCTGTAGTGTCACTACATAGGGGCTCAACAAGAGCATCATGTCACTTGCAAGAATTAGAAAAACAATAAA
TTTGGTCAGTCTCACTAATAGCTCTCTTACTTGAACCAAGTTGCAATTGCCTAATTGCAGTTTTACAAATGAAATGATGATGGTTCTTGGGTTCAGACTAAGTTGAAAATTGCCTAGGTAATTTTTTCTATGTTGCTGTATCTTCATCATTATTGCTAAGATCTTCAGTCAACGGGCTTTCAAGATAATCATTGTTCTCA
AGCATAGGCTTGGTATCTTGGCCCACTTCGAACTCTTCAATCTCTATCTCTGTACACAAGTTTTATGCAAGTTAAATTGCACTGAAAGCCCTAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAAATGTGAACATCAAGTGTTTTAGTGTTAGTGTTTATGC
ATACATCAATTGGGGTTTGACTGACTGTACTGTGCCATATCCAGCTGGGGATATGCTGCCTATGTACTTACTTCCAATGGGTATGTGTGCCAGGTACTTGGTTTGCATACCTAGTAGGTATTTGCAGTTTGGATCCTGAAAGCCATTTGACTTATTTTGGGCTGTGCATGCATAAATTGTGGTATGTCTCCAGTTTTGAT
GTGTTTATGCCGTGTATGTATCTTGCACCTAGCTGGGTACTGGGTACAGGGTACATTTGCCGGTACTTGGTTTGTGTACCTACCATATGGTCACATATACCTCATCTAGTTAGTTTAGATCCTGAGAAAGAACCATTCCACACTGAATATATTAATATGGCAAGATAAAGTAGCAATTACAGTATTTTCTGTTAAAGGCC
TGTGGGTACTTCAGATGCAGTTTGTATTCAAACTTGGCTGCCTTTATTGATAACCAAACGGTCGAGCAGAAACAATTTTTTTTTGCAAAATGAGAAAATGCCTGATCAAATCTTATCTTAAGACATCGTACATATCATAATGTTCTTTTTGCTGTGGGAGGCTGCTTTTAAATTTAAACCCCAGATTCATATTCTTTCTT
TTACAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGgtatgctagtgctttttaaatgtctgctagactctttatccttctgttttctttttggctaatctttcattacataatagCCGGCTGCTGGAAAG
AAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGA
GGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCATCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATG
TAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAGCAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAA
AGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTTGGCTGTTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTC
CTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTC
AGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTAT
TAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAA
TGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACA
TCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAG
GCACAAAA
Intron 10 GTAATGTGAA ... ATTGATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 11.68 | 711.8 | 7 | 91 |
| A2 | 11.61 | 575.8 | 8 | 74 |
| A3 | 12.95 | 689.3 | 5 | 100 |
| A4 | 13.42 | 484.5 | 5 | 73 |
| A5 | 11.46 | 350.8 | 3 | 44 |
| A6 | 12.34 | 1505 | 3 | 209 |
| A7 | 12.43 | 2483.3 | 3 | 347 |
| A8 | 13.68 | 1654 | 2 | 258 |
| A9 | 10.93 | 2318.5 | 4 | 278 |
| A10 | 11.02 | 2384.8 | 2 | 289 |
>TRINITY_DN110689_c0_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCA
TCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAG
CAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAAAGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTT
GGCTGTTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCT
GGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTA
GTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAA
TTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCAATCTAATCATC
ATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTAC
>TRINITY_DN110689_c0_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:CAACGGTTTAGGGTTCAGGGTTTCAGAATTTTGTTAGTGTGATGTGGATCAGTGTTCTGTTTTCTGGCCCAACGGTTTAGGGTTCAGGGTTTCAGAATTTTGTTAGTGTGATGTGGATCAGTGTTCTGTTTTCTGGTTTCAGAATTTTTTAGTGTGATGCGGATGAGATACTGTAGACTTGTTTCACCAGTCAGGCGTTG
AAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGgtaatgtgaagtctgtgtaatcatcaattatgtttcttggttgctgagaccaatgccatagaaatgatttgtggcaataacttgtcaaggcgatgatagttggcaaaatttgtagagataaaaactgccaaacaa
attgttgtgggtctggtctgaaaaataaaatttatagttttttttaaaatattggcaatattgtccaaccatatgaaaatgagcaaaaaatctcttgagtgggaaaaaatatattttgattggttcaataattggagattctggttacagtagtttagatttcggttttttagtggtattggattttaattttgtaaaat
gatataattgatgcagGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAAAGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCT
TCTCTGGCTACACTACTATCGAATATCCTTATAAGAACTTTGGCAAATAATCTTGCATTTTTTTTTTAATACTATACTCTTATTTTGTAATCCTCTCTTCCTTAACGAGAAGCACTCATGAAGCCCTAGATGGATTCCCGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCA
TTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGTGAGTTAGTTGTTCATCTCTGTCTTGCTTACATCTTGCAAATGGAGTGCTGTATGCAGAAGTGTTCTTTTCTTGATTTGTATATGGGAATGAGATTTTTTTTTCAAATAGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAA
AGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGAC
CTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAA
TTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCATCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACAC
CAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAGCAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGC
AAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAAT
TTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCAC
AATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGT
CGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCAATCTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTAC
Intron 11 GTTAGCATAT ... TATTTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 28 | 995 | 197.5 | 387 |
| A2 | 25.4 | 975 | 170.6 | 332 |
| A3 | 23.42 | 1079 | 185 | 330 |
| A4 | 25.74 | 453 | 111 | 157 |
| A5 | 24.39 | 403 | 79.4 | 130 |
| A6 | 24.24 | 4117 | 636 | 1317 |
| A7 | 22.82 | 6130.3 | 1008.5 | 1812 |
| A8 | 24.23 | 6075.1 | 880.7 | 1943 |
| A9 | 23.17 | 5645 | 876.2 | 1702 |
| A10 | 24 | 4735 | 711.3 | 1495 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCC
AGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTCAGTGCATCGTTGCCAGAAAATACCCTAACAGAGATCAATTGTGTAGCAGATCTCTAGTCAGTGTCTGGAGAG
TTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAATTGAATGATTTTATAT
TTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTT
CTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCCCATGTCTGACTTGCGT
AGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:TACTTAAAATTTTAACTGAAATTCCTGTAAATCAATGATGATTTTCATTTGCAGATGAGATTTGTTATTCAATTTAAACATTTGCAATTCATCAATTGGCATTCATTCAACATTTTTTTTTATACTTTTCTCTGTAGTGTCACTACATAGGGGCTCAACAAGAGCATCATGTCACTTGCAAGAATTAGAAAAACAATAAA
TTTGGTCAGTCTCACTAATAGCTCTCTTACTTGAACCAAGTTGCAATTGCCTAATTGCAGTTTTACAAATGAAATGATGATGGTTCTTGGGTTCAGACTAAGTTGAAAATTGCCTAGGTAATTTTTTCTATGTTGCTGTATCTTCATCATTATTGCTAAGATCTTCAGTCAACGGGCTTTCAAGATAATCATTGTTCTCA
AGCATAGGCTTGGTATCTTGGCCCACTTCGAACTCTTCAATCTCTATCTCTGTACACAAGTTTTATGCAAGTTAAATTGCACTGAAAGCCCTAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAACCTTCCCCTTGCTGATAATGAAAATGTGAACATCAAGTGTTTTAGTGTTAGTGTTTATGC
ATACATCAATTGGGGTTTGACTGACTGTACTGTGCCATATCCAGCTGGGGATATGCTGCCTATGTACTTACTTCCAATGGGTATGTGTGCCAGGTACTTGGTTTGCATACCTAGTAGGTATTTGCAGTTTGGATCCTGAAAGCCATTTGACTTATTTTGGGCTGTGCATGCATAAATTGTGGTATGTCTCCAGTTTTGAT
GTGTTTATGCCGTGTATGTATCTTGCACCTAGCTGGGTACTGGGTACAGGGTACATTTGCCGGTACTTGGTTTGTGTACCTACCATATGGTCACATATACCTCATCTAGTTAGTTTAGATCCTGAGAAAGAACCATTCCACACTGAATATATTAATATGGCAAGATAAAGTAGCAATTACAGTATTTTCTGTTAAAGGCC
TGTGGGTACTTCAGATGCAGTTTGTATTCAAACTTGGCTGCCTTTATTGATAACCAAACGGTCGAGCAGAAACAATTTTTTTTTGCAAAATGAGAAAATGCCTGATCAAATCTTATCTTAAGACATCGTACATATCATAATGTTCTTTTTGCTGTGGGAGGCTGCTTTTAAATTTAAACCCCAGATTCATATTCTTTCTT
TTACAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGGTATGCTAGTGCTTTTTAAATGTCTGCTAGACTCTTTATCCTTCTGTTTTCTTTTTGGCTAATCTTTCATTACATAATAGCCGGCTGCTGGAAAG
AAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAAGATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGgttagcatattatcctttgaccaccaacttggtatgttaattgtgtctttcagatatgtgttttctgtaatggtgatgagtcatgtcaattagaacagaaatgttgtggtga
gggtcaattgaagggttttattgggtgagcccactttgctgctcttatcattatcatccatgttgactttttgatacttttttgtcagctgatgttttaatagacaaaatattttaattatttttctgttaatcaaattcgtaaaactgttggaacctctcttagacaatgactattttttagtaagtacattctttatg
taaacaccaatagcctagcctttctgcttttggaaatgattcttctatatgggaagcagaaaatgttgcagctcgagaatattgggaaagtttgatccttgcaggaaccgataagaaaggtaataattagatcagtgggttgacagttctcagtggtgttttgaactttgtaaaacaatcactggctttgaactgggtaa
aggaattgccaattctctgaaaagtgaggcacatactatgattggaacatttttttggctgtttttagttaatagagactggtttgcaattatttattttccagGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTC
CTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCTGGCAAGAAATCTGGCCAGTTTAATTGCCATAGTTGTTCAAGGGACTTCACAACGGAAGGAGCATTGAGCAGCCACAAGGCTGCTAAGCATGCTGGAAAGTGAAGCATGTGCATTTTACATGCCAAAAACCGAATTTTTGCACTC
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TGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCATATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACA
TCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCCCATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAG
GCACAAAA
Intron 12 GTGAGTTAGT ... TTTCAAATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.73 | 551 | 10.4 | 201 |
| A2 | 28.03 | 439 | 4 | 171 |
| A3 | 25.03 | 563 | 13.4 | 188 |
| A4 | 22.75 | 360 | 10 | 106 |
| A5 | 27.84 | 228.1 | 18.4 | 88 |
| A6 | 27.74 | 1305 | 4.6 | 501 |
| A7 | 27.19 | 2383 | 16.4 | 890 |
| A8 | 27.23 | 2066 | 17.6 | 773 |
| A9 | 27.53 | 2203 | 23.2 | 837 |
| A10 | 27.83 | 1966 | 18.6 | 758 |
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformGTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
AATCTTCGGGTGCCGTTCGTGTGATCTACAATCTTCGGACGCCGTTCGTGTTCTCTACGAGAGGAGGAAGATCTTTTATCCACCGCCATGGAGTTTTGGGGCGTTGAAGTGAAGCCTGGTGAGGTTTTGGCATGCGATCCTGGTGATGAAAGATACCTTCATATGTCCCAGGCTGCCATTGGAGATAAAGAAGGTGCTAA
AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGATCATGAAGCCCTAGATGGATTCC
CGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGATTCT
GATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGATATGGAAGATGCAAGTGAAAGTGATGATGGGGATGAGGAAGATGATTCTGATGAAGAAAGTGATGATGAGGATGAGGAAGATGAGGAAACTCCCAAGCCGGCTGCTGGAAAGAAGCGACCTATGCCAAACTCAGTTACCAAGTCACCAGCAACAGATAAAAAGGCAAA
GATCTCTACACCGGCTGGAGGTCAAAAGCCAGGTTAGCATATTATCCTTTGACCACCAACTTGGTATGTTAATTGTGTCTTTCAGATATGTGTTTTCTGTAATGGTGATGAGTCATGTCAATTAGAACAGAAATGTTGTGGTGAGGGTCAATTGAAGGGTTTTATTGGGTGAGCCCACTTTGCTGCTCTTATCATTATCA
TCCATGTTGACTTTTTGATACTTTTTTGTCAGCTGATGTTTTAATAGACAAAATATTTTAATTATTTTTCTGTTAATCAAATTCGTAAAACTGTTGGAACCTCTCTTAGACAATGACTATTTTTTAGTAAGTACATTCTTTATGTAAACACCAATAGCCTAGCCTTTCTGCTTTTGGAAATGATTCTTCTATATGGGAAG
CAGAAAATGTTGCAGCTCGAGAATATTGGGAAAGTTTGATCCTTGCAGGAACCGATAAGAAAGGTAATAATTAGATCAGTGGGTTGACAGTTCTCAGTGGTGTTTTGAACTTTGTAAAACAATCACTGGCTTTGAACTGGGTAAAGGAATTGCCAATTCTCTGAAAAGTGAGGCACATACTATGATTGGAACATTTTTTT
GGCTGTTTTTAGTTAATAGAGACTGGTTTGCAATTATTTATTTTCCAGGTGGTGACAAAGGCAAGAAAACAGAACATGTTGCAACTCCTTATCCAAAACAGGGTGGAAAGGGGCCTGCCTCAGGTGTCAAGGGCAAAGAAACTCCTCCTGGATCAAAACACCAAACACCAAAAGGGAAAAATGTGTCTACACCCGAGTCT
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GTCAGTGTCTGGAGAGTTACATAAAGTTGTGTTCTAAGTCAAATTTTGTATTGTAACGTCCATTCCTCCAGCGACTCCTTCATTCATGCTATTTTCTTGAGTTGTTTCTAAGGGCGTATTTTTCGAGGTAGCACAATTTTGTATTAGCAATCAAGTTTGAGTAAATCTAGTAGATGTCTATTATGTGCGGCATGGTTGAA
TTGAATGATTTTATATTTTTTAAAAAATTGTCTGAGGCTACTGGTACGATAAAAATGTCTATCTGGTGCTTATTTTGTGTTTTATGCTTTTTTCACCTGTGCATTATTTTACGACAGCAGTGTTCATTTTTAGTCGCGATGGAATGCTTGTTTGGTAATACTGATTGTTTGTATCACAATAACCAATCTACTAATCATCA
TATGCCCAGGCTGTTTCTCTCTTTAATCAATGATTATCTTAGATTAAGTGTTCCATTGCCCTCTATTCTACTGTCTATATGCTTATGCTTTGGATTATTGAAATTTGCTTTATTTAAGTTATTATTTCGTTTCTGTAATACACATCTCTAGCATGGTCTTCTTGGTTTGTTGCAAGTGCAATCTGTACTATCAATGTGCC
CATGTCTGACTTGCGTAGTCTACAGTATTTAGATGTTTTTTGACAGAGCACTATATATTTTTAAAGGCCTACTATTGGCAGGGTTTCTTTTACTAGATTGATGTTGCAATTGTTTTATTTGTCTTTCCCTGATACTAGTTGTAGGCACAAAA
>TRINITY_DN129974_c5_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTGGAAACTAAGGCAGCATAAACCCTAAACCCTAAATACTCTCTAGTCTCTGAACCCTAAAACCCTAAATACCTTCTGGCCTCTCAACCCTAAAGAGTTCGGAAGCTCGCTCAATCTATCTATTTAGTTTATATTTCTCGTGTATTGCTTTCCACTTTCTTTGAACTTCGTTACTCTTTCGTGGAGCTCAATCGATCTAC
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AGAAAATGAAAGGGTTTCCTTCTATGTTCATGTGGATGGGAAAAAGTTTGTGCTTGGGACCCTGTCACGTGGAAAATGTGATCAGGTTGGACTGGATTTGGTGTTTGAGAAAGATTTCAAGCTCTCTCACACATCTCAATCTGGGAGCGTATTCTTCTCTGGCTACACTACTATCGAATATCCTTATAAGAACTTTGGCA
AATAATCTTGCATTTTTTTTTAATACTATACTCTTATTTTGTAATCCTCTCTTCCTTAACGAGAAGCACTCATGAAGCCCTAGATGGATTCCCGGATGATGAAGACCTAGAGTCATCAGAAGAGGAAGAAGAAGAATTACCCCAGACAATGGCATTGACGGTAAAGGAGAATGGTGgtgagttagttgttcatctctgtc
ttgcttacatcttgcaaatggagtgctgtatgcagaagtgttcttttcttgatttgtatatgggaatgagatttttttttcaaatagGCAAACCTGGAGCTAAGCCTGTGAAGCCAGAATCCAAGTCATCTGTAACTAATAAAGCAGCAGCTAAAGGAAAGCCAGAGGTGAAGCCACCAGCCAAAAAGGAAGAAGATGAT
TCTGATGAAGAAGACGACGATGATGATGATGAGGTCTCACCTTGCTCTATTTACTGTGTTTTGGTTGTTGTTGGAATCTTGGTGGAGTTTCTTTCAATCGCTATAGAAGACAGTTATTTATTATTTAACCATATGTTTGGAACTAAACCATCTGTTTGGAACTATGTTGTCAAGGTTTGTGGGTATTGGTATGGGTATGG
ATACTGGTATGACTCTTCTGAAAATTTTGCAGTATCCTCCACCTCTTCCCATGAATATCCAGATGGAGGTTGCTTCATTTGTTAGCCTCTCAATTGCCACTCACAACAGTGGCTGGTTCACCAATTGGGACTTATTAGCTGGGTTACCTGGGGAACCTCACTGTGAACTCTGCCATTAAACCATCCTGTTTAAATCGTTG
AGCTAATTAATTCACTGGGCTACTTAAAATTTTAACTGAAAT