sp|Q9SS43|MUC21_ARATH ----> Xylan glycosyltransferase MUCI21
Intron 1 GTAAGTGTCT ... TGGATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 81.82 | 1 | 6 | 3 |
| A2 | 42.86 | 4 | 3 | 3 |
| A3 | 50 | 2 | 4 | 0 |
| A4 | 33.33 | 3 | 0 | 3 |
| A5 | 100 | 0 | 1 | 0 |
| A6 | 33.33 | 6 | 0 | 6 |
| A7 | 25 | 12 | 1 | 7 |
| A8 | 27.27 | 16 | 2 | 10 |
| A9 | 30 | 7 | 2 | 4 |
| A10 | 23.08 | 10 | 3 | 3 |
>TRINITY_DN39453_c0_g1_i6 from sample A7 / Example spliced isoformGGAAAGGGTTGGCGGCGATTGCAATTCAACAACTAATTTAGTTCATATTCTTTCCACGTGGCCCAATAATGCGCCGCCATGTCATAAACGTGAGAAACGTCCAACTGGTCACCAATGAGTTCCGAAGTAAACCAAAAGGAAAGAAACTAAAAGCAAAAACAGATTTTGAAAAGACAGTTCGGTAATGACGCAAAGATTTT
GGTCAATCGAAGCCAGCCTCACACTGAATCAGAGCAGGGCATACGTTCCAAGTTCGATCCACACAAGATGAAAAAACCTGTGTCATCCAAGCGATTTCTACTGGCGGCGACTATCGTGGCTATCGGTTTTGTCATTTTCTTTGGACAGCAATCTGCTCTGCCTTCACATCTAGAATACATAAATGCAAAGTCAACGAAGC
CGGGTGCCCAGTCTCTTGCAATATTGGGCACCGAGGAAGACCCTCCAGACAACCGAAATTTGTCCATGAAGCATAAGCATTCCACCGAAAATTCCATTGATTCTTTTTCCCTTGGTAATAAAAATGTTGTGTATACGGCAACATCAGAAATAATTAAGATTCCAGGGGCATATAAAGATGGTGAAGGAATTGTATGTGAT
CGCTCCCATTCTCGAACTGACATTTGCTTGGCATTTGGACATGTTCAGATGGATGTGAGATCAAGTTTTTTCATGCTGAATGCTTTTAATGAGAGTAACAGTGGAATAGAAGAGAAAATAAAGCCTTATACACGCAAATGGGAAAATGATGCGATGAAATTGGTAAATGAGGTAACCTTGAAGAGTAAACTTATGCAAAA
TAATTCCATGTTGAACTGTGATGTTAAGCATGAAATCCCAGCTATTGTTTTTAGTACTGGAGGATACACAGGAAATGTGTACCATGAATTCAATGATGGCATTATTCCCCTCTACATCACATCGCAGCATCTGAAAAGAGAAGTTGTGCTTGTTAATGTTGATTGTCACAATTGGTGGCTAACCAAGTATGATGAAGTTC
TGAATCAACTGACCAAATACAGGGTTATCAACTTCAATAATGAAACGATGACCCACTGCTTTCCTGAAGTCACAGTGGGTTTATTTATACATGATGAAATGACAATTGATTCCTCTCTAATGCCAAACAATGAAACTATACTCGACTTTAGAGCATTACTTGACAAGGCTTACAGACCAGGCTATCTACTCCCTGAGACA
AATTCAAGCAGGACTAATAAGCCCATTCTTGTTATACTCATTCGTGATGGAAATAGAGTGATACTGAACCTTAAACAAGTTGTGAAATTAGCTAAGCAATCAGGATTCAATGTTACATTATGGAAGCCACTTCCAACTACTGACCTGAAGGCAACATACAGACTCCTGAATTCAAGCCATGTTTTAATGGGGGTACATGG
AGCAGCATTGACGCATTTCCTTTTTATGCGTCCAAGCTCCGTGTTCATTCAGATCATTCCTCTGGGGACTGATTGGGCTTCTTCCAACTACTATGGTGATCCTGCACAGAAGATGGGGCTTCAGTACATTGGATATAAGATAGGAATAAATGAAAGTACTCTAAGTGATAAATACATAGAGAATGACACAGTATTGACGA
ATCCAACAGCAATAGTCAGGCAAGGGTGGTCAGCAACAAAAGAGATATACTTGGAATCACAAGATGTCCGTATTGATTTGCCTCGCTTCAAGAACACTCTTATGGATGCTAAGAGAAGGGCAGTTAGGTTCATTCGGCAAGAGTACAGGAAAGGGCATAAAGGATGACAGAGCTTTCAAAAGCAGTAAATCTGAATGCAG
TCAGGGGGAAATCATTTTTGAGGTTTTATGGGTAACATCAATCATTTTCAGGGCAGAGGCTCATGAATATAACCTTTGGTCTCTGGCTGTTTGGAAAGTTTTATACTACCAAGGTTGCCATGGGACATTTCCTGACATTAGCTGTAGAATTCACAGAGATCTGAATGAATGATTAACCTGTCCATAAGATGATTGCTAGC
AGCTGCTGAACAGGCAACGTTAATTGCTATTCGTTTCTTGGCAGGTTGAATCATAATGTGAAATGGGAAGTATAGAGAATTGGTGGCTTCGTAAGGGCTCAGTATGAATCCAATCCTAGATTATTCAATATTTAGTGGCATTAAACTTTATTGTGCAAAGTTATGCCAGTGTACAGACAAAAGTCATAATTCCATTTTTT
CAACATGACAGCTGTGCAGGTGCCATAAAGAGAGCTTGCAGATTGTGGCTGACCCACAAGAAAAAGCTTGTAGAAGGTGTTGGTTCACATGCAGTTGAAGAAGTTTGCGGATGAAAATGTCGAGGAATTAGCCATTGCAGAAGCTTGCAGATGTGGAATGAGGAAGGTCAAGTAACTTCAAGAAGTAAGAGTTGATTCTA
TTGCCCGTCAGATTTCAAGAACAGCCAACAGCCCTGCATCGGTTCAACCATTGTATGATCTATGCAAGTCTGGTAATTCATACGATGAGATCGGTCCCGATCATGAGAAAGAGAAAAAGAGCAAGCGCCTCAGTGTCGAGCAGGTGAAGTCATTGGAGACCAGCTTCCAGATGGAGAGCAAGCTGGGCCCTGAAAGGAAG
ATGAAGCTGGCTGATGAGATTGGCCTCGAGCCCAGACAAGTCGCTGTGTGGTATCAGAACCGTCGGGCACGGTGGAAAGCCAAGCAGCTGGAGAAGGACTACCATAATCTCAAACAACTATACCATACAGCGGTGTTGGAGAAACGCAAGTTGGAATTGGAGGTGTTAAGGTTGACAGAGGAACTTCATGTCATGAAGCA
GTCTCGGTCTGGGCCGAAGGAAATCGAACAGATATATACCTCATATGATAACTTAAATGATGCATTAATGACACCGATAGGAACGACTGATGGCCCTAAAAGCAATAATTCATGTTGCAGCGATGCTGCTTCCAAATCCAAGGTTCATGCAACTGAATTCGGTCTGGTAATTAAGAGTGAGAGAGAATCGCCTCCCCAAG
AGACTGAGATATTGCAGGATAAGCTGTCAAGTGCAAACGACCATAAACAGACTGGCCAGGAAGCAATGGACGATATGACTATCATGTCAGATGAATTCTACAACTATTTTATGGTTCTGGATCACGACCACGAAGGATATTCAACTGTCTACAACTTCGACTGGCCCAATTAATTAATCCAGTGCGATTACTTCGTGCTG
AACTAAGGAAGCTCTTCAACTCCGATGGCTTCGCTATCTGAAATTGATAATCATTCATCTCCAAAGTCACGGGCCTACAATAATTAGCCATGTAACAGTATTATTTGAATTTCCAATAAGTCTATCTATTATGTGCGTTGGATGAAAATTTTGGTTGAAAATAGCTGTTGCAATTATGGTGGCTGAAAGACTGCTTTTTA
CAGATCACATTGAAACCTTTTTTTCAAAGGTTTACTAACTTCGCCCAGGGGATGTACTCAGTTGACAAATGGTCCTCTACTCAGTAACTAATTGGTATTCAGATATTATGAATTAAACATTTTGTTTAATATTTTGATTAAATTCCAATAAACACTCC
>TRINITY_DN39453_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:GAAAGCCTAAATTAAGATAATTTACCCGGAATTAAAATTGTGATGTCATAACCATTGATCAAATTGACTCGAAAATCAAAGCAAATATGAATACACGTCAAGGAAGCGTTGAATTCAATGTGATGGGATAATGTTTTGCTGAGCTGGTTCCCCTCCTAACGGACATCTTGCCTGCCTTTGACGTAAGGATCCTCATGCAT
TAGGTGCACTGCACAACCTCATTAGTACCCAGGGATATGTCCAAACCTCAATCCACAAAAATCAAAGTAACCGGGTCTAAAACTGTCACCAATATAGTGTCAACCTACGACAAAGAAAAAGGCACACGCATGATGCTAACAACGAATTCGTTGGGCCATCCTTATTTGGAATACAGCCCCTTAGCGTTACTCCTTACAGA
GTCCCCAAGTCAAAGGAAAAGACTGCTCTCGTAAACGTAAACCTAGATTTTAAGATTAAGACTATGTATCATCCAAAGGTGTCATCACTGTCACATGCACGTGGAGGCCAGATGAACTTCTTCACGTGTTGGGACCCGCCAATATCCTGGACATGACAGCAGCTTCGTTCTGGTTGCTGCCATCTTTTCCTGGTACAAAG
GAGTAGCTAATCTTACAGTGTACTTTTTTATTTGTTGGAGTTTAGTGATATAGAAAGTCAAAATTTTGAAAAAAAATGGATCAGAATAAAACTCCACTCTAATCTAAAATAAAATTATCACTTTGAAATATGTATCTATCCTCAATTTAACCTGCTCCTTTAAGAAAAGATCTTATTTTTAGTTTTACCTTGACTAATAC
TCAATCCCGGTGAATTTGGATCGGAACTCTGATTGTCATTGCTTTTAACCCACACCTTTGCGGTGGCACTAATCCCGATCAACCATTGAATAATGGGGACTCATCTTTCTGCTTTTAGGAATAAGATATATATAATAAACCCCATGATGCCTAGGATCGTATATGCCGTGATCATACAGGGGAGTAATGGCATATGAGAT
TGAGCGAGCAATGAGGATTGAATGCTTTGAGATTGAGCGAGCAATGAGGATTGAATGTGGTTATAAAGATTGAATATAGTTTTCAGTAGATTGTTAATTTGGTAGTATATCGATAGGCTTAAACTGATCATGTCCTTCACATTTGGAAACTTGGATATTGCATTAATGGGCAAAAATCCAGCCAACAGCCCTGCATCGGT
TCAACCATTGTATGATCTATGCAAGTCTGGTAATTCATACGATGAGATCGGTCCCGATCATGAGAAAGAGAAAAAGAGCAAGCGCCTCAGTGTCGAGCAGGTGAAGTCATTGGAGACCAGCTTCCAGATGGAGAGCAAGCTGGGCCCTGAAAGGAAGATGAAGCTGGCTGATGAGATTGGCCTCGAGCCCAGACAAGTCG
CTGTGTGGTATCAGAACCGTCGGGCACGGTGGAAAGCCAAGCAGCTGGAGAAGGACTACCATAATCTCAAACAACTATACCATACAGCGGTGTTGGAGAAACGCAAGTTGGAATTGGAGgtaagtgtctaaagttgtaagccatataatttatttcttagcggaaaattttgttaggtaagtgtctatagtgtatatacc
ctttgaactttgtgtatatacttgcactatgatgacttctcgtataatttatacattcattttcccttctggcttaacttcattacttcattaatttgtaggactgtccgtctaattagaaacaccaatgtctgtggaatggattgcagGTGTTAAGGTTGACAGAGGAACTTCATGTCATGAAGCAGTCTCGGTCTGGG
CCGAAGGAAATCGAACAGATATATACCTCATATGATAACTTAAATGATGCATTAATGACACCGATAGGAACGACTGATGGCCCTAAAAGCAATAATTCATGTTGCAGCGATGCTGCTTCCAAATCCAAGGTTCATGCAACTGAATTCGGTCTGGTAATTAAGAGTGAGAGAGAATCGCCTCCCCAAGAGACTGAGATATT
GCAGGATAAGCTGTCAAGTGCAAACGACCATAAACAGACTGGCCAGGAAGCAATGGACGATATGACTATCATGTCAGATGAATTCTACAACTATTTTATGGTTCTGGATCACGACCACGAAGGATATTCAACTGTCTACAACTTCGACTGGCCCAATTAATTAATCCAGTGCGATTACTTCGTGCTGAACTAAGGAAGCT
CTTCAACTCCGATGGCTTCGCTATCTGAAATTGATAATCATTCATCTCCAAAGTCACGGGCCTACAATAATTAGCCATGTAACAGTATTATTTGAATTTCCAATAAGTCTATCTATTATGTGCGTTGGATGAAAATTTTGGTTGAAAATAGCTGTTGCAATTATGGTGGCTGAAAGACTGCTTTTTACAGATCACATTGA
AACCTTTTTTTCAAAGGTTTACTAACTTCGCCCAGGGGATGTACTCAGTTGACAAATGGTCCTCTACTCAGTAACTAATTGGTATTCAGATATTATGAATTAAACATTTTGTTTAATATTTTGATTAAATTCCAATAAACACTCC
Intron 2 GTGAGTTTTG ... CTTTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.91 | 88.5 | 3 | 22 |
| A2 | 14.81 | 69 | 0 | 12 |
| A3 | 16.82 | 89 | 0 | 18 |
| A4 | 17.7 | 93 | 1 | 20 |
| A5 | 20.69 | 23 | 0 | 6 |
| A6 | 10.34 | 26 | 0 | 3 |
| A7 | 12.5 | 56 | 0 | 8 |
| A8 | 21.05 | 45 | 0 | 12 |
| A9 | 17.02 | 78 | 0 | 16 |
| A10 | 18.26 | 94 | 0 | 21 |
>TRINITY_DN118636_c7_g3_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCAGATTTTGAAAAGACAGTTCGGTAATGACGCAAAGATTTTGGTCAATCGAAGCCAGCCTCACACTGAATCAGAGCAGGGCATACGTTCCAAGTTCGATCCACACAAGATGAAAAAACCTGTGTCATCCAAGCGATTTCTACTGGCGGCGACTATCGTGGCTATCGGTTTTGTCATTTTCTTTGGACAGCAATCTGCTCT
GCCTTCACATCTAGAATACATAAATGCAAAGTCAACGAAGCCGGGTGCCCAGTCTCTTGCAATATTGGGCACCGAGGAAGACCCTCCAGACAACCGAAATTTGTCCATGAAGCATAAGCATTCCACCGAAAATTCCATTGATTCTTTTTCCCTTGGTAATAAAAATGTTGTGTATACGGCAACATCAGAAATAATTAAGA
TTCCAGGGGCATATAAAGATGGTGAAGGAATTGTATGTGATCGCTCCCATTCTCGAACTGACATTTGCTTGGCATTTGGACATGTTCAGATGGATGTGAGATCAAGTTTTTTCATGCTGAATGCTTTTAATGAGAGTAACAGTGGAATAGAAGAGAAAATAAAGCCTTATACACGCAAATGGGAAAATGATGCGATGAAA
TTGGTAAATGAGGTAACCTTGAAGAGTAAACTTATGCAAAATAATTCCATGTTGAACTGTGATGTTAAGCATGAAATCCCAGCTATTGTTTTTAGTACTGGAGGATACACAGGAAATGTGTACCATGAATTCAATGATGGCATTATTCCCCTCTACATCACATCGCAGCATCTGAAAAGAGAAGTTGTGCTTGTTAATGT
TGATTGTCACAATTGGTGGCTAACCAAGTATGATGAAGTTCTGAATCAACTGACCAAATACAGGGTTATCAACTTCAATAATGAAACGATGACCCACTGCTTTCCTGAAGTCACAGTGGGTTTATTTATACATGATGAAATGACAATTGATTCCTCTCTAATGCCAAACAATGAAACTATACTCGACTTTAGAGCATTAC
TTGACAAGGCTTACAGACCAGGCTATCTACTCCCTGAGACAAATTCAAGCAGGACTAATAAGCCCATTCTTGTTATACTCATTCGTGATGGAAATAGAGTGATACTGAACCTTAAACAAGTTGTGAAATTAGCTAAGCAATCAGGATTCAATGTTACATTATGGAAGCCACTTCCAACTACTGACCTGAAGGCAACATAC
AGACTCCTGAATTCAAGCCATGTTTTAATGGGGGTACATGGAGCAGCATTGACGCATTTCCTTTTTATGCGTCCAAGCTCCGTGTTCATTCAGATCATTCCTCTGGGGACTGATTGGGCTTCTTCCAACTACTATGGTGATCCTGCACAGAAGATGGGGCTTCAGTACATTGGATATAAGATAGGAATAAATGAAAGTAC
TCTAAGTGATAAATACATAGAGAATGACACAGTATTGACGAATCCAACAGCAATAGTCAGGCAAGGGTGGTCAGCAACAAAAGAGATATACTTGGAATCACAAGATGTCCGTATTGATTTGCCTCGCTTCAAGAACACTCTTATGGATGCTAAGAGAAGGGCAGTTAGGTTCATTCGGCAAGAGTACAGGAAAGGGCATA
AAGGATGACAGAGCTTTCAAAAGCAGTAAATCTGAATGCAGTCAGGGGGAAATCATTTTTGAGGTTTTATGGGTAACATCAATCATTTTCAGGGCAGAGGCTCATGAATATAACCTTTGGTCTCTGGCTGTTTGGAAAGTTTTATACTACCAAGGTTGCCATGGGACATTTCCTGACATTAGCTGTAGAATTCACAGAGA
TCTGAATGAATGATTAACCTGTCCATAAGATGATTGCTAGCAGCTGCTGAACAGGCAACGTTAATTGCTATTCGTTTCTTGGCAGGTTGAATCATAATGTGAAATGGGAAGTATAGAGAATTGGTGGCTTCGTAAGGGCTCAGTATGAATCCAATCCTAGATTATTCAATATTTAGTGGCATTAAACTTTATTGTGCAAA
GTTATGCCAGTGTACAGACAAAAGTCATAATTCCATTTTTTCAACATGACAGCTGTGCAGGTAGCTTTCTTAAACAACAGATTTGCATGTTGGATTACACTTGAATTTTATTTTAGGCTCCCATTTAAAGGTAGCTGATATGCAGATTAAACGAATGTTGAATATGCTGAGATCCAGTTTGAACAATTGAAAGAGGGTCT
CTTTGAAAAGGCATAGGAAAAGTATTTACCAAGGTGAATAAGAGACAAATTTTCTCAGATTTTCCTACTTGTCAGTATTTATTTCGAAAACCTGTGTAGTCTGCTTCCAATCAATACTTTAAAGACCTAGAAATTATTCATCAGAACTTCCAATCACGCCATATTTGTGTTCTCTTATCATTCTTAGCACAGAACTGAAA
TTCAGTTGTTGTAATGGCTTCTACTTCTGTTTCTGTTCTCCATTTTGATTTCACCGTATTTGGAATCTAGTTAACAAGGTTTTTACATGATAACTAGGTCAAATCTCTAGG
>TRINITY_DN118636_c7_g3_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCTTCACATCTAGAATgtgagttttgttgcctttcaattgtctgaattctttctaagtcatggcattgtcataatttgtgccttttttcagACATAAATGCAAAGTCAACGAAGCCGGGTGCCCAGTCTCTTGCAATATTGGGCACCGAGGAAGACCCTCCAGACAACCGAAATTTGTCCATGAAGCATAAGCATTCCAC
CGAAAATTCCATTGATTCTTTTTCCCTTGGTAATAAAAATGTTGTGTATACGGCAACATCAGAAATAATTAAGATTCCAGGGGCATATAAAGATGGTGAAGGAATTGTATGTGATCGCTCCCATTCTCGAACTGACATTTGCTTGGCATTTGGACATGTTCAGATGGATGTGAGATCAAGTTTTTTCATGCTGAATGCTT
TTAATGAGAGTAACAGTGGAATAGAAGAGAAAATAAAGCCTTATACACGCAAATGGGAAAATGATGCGATGAAATTGGTAAATGAGGTAACCTTGAAGAGTAAACTTATGCAAAATAATTCCATGTTGAACTGTGATGTTAAGCATGAAATCCCAGCTATTGTTTTTAGTACTGGAGGATACACAGGAAATGTGTACCAT
GAATTCAATGATGGCATTATTCCCCTCTACATCACATCGCAGCATCTGAAAAGAGAAGTTGTGCTTGTTAATGTTGATTGTCACAATTGGTGGCTAACCAAGTATGATGAAGTTCTGAATCAACTGACCAAATACAGGGTTATCAACTTCAATAATGAAACGATGACCCACTGCTTTCCTGAAGTCACAGTGGGTTTATT
TATACATGATGAAATGACAATTGATTCCTCTCTAATGCCAAACAATGAAACTATACTCGACTTTAGAGCATTACTTGACAAGGCTTACAGACCAGGCTATCTACTCCCTGAGACAAATTCAAGCAGGACTAATAAGCCCATTCTTGTTATACTCATTCGTGATGGAAATAGAGTGATACTGAACCTTAAACAAGTTGTGA
AATTAGCTAAGCAATCAGGATTCAATGTTACATTATGGAAGCCACTTCCAACTACTGACCTGAAGGCAACATACAGACTCCTGAATTCAAGCCATGTTTTAATGGGGGTACATGGAGCAGCATTGACGCATTTCCTTTTTATGCGTCCAAGCTCCGTGTTCATTCAGATCATTCCTCTGGGGACTGATTGGGCTTCTTCC
AACTACTATGGTGATCCTGCACAGAAGATGGGGCTTCAGTACATTGGATATAAGATAGGAATAAATGAAAGTACTCTAAGTGATAAATACATAGAGAATGACACAGTATTGACGAATCCAACAGCAATAGTCAGGCAAGGGTGGTCAGCAACAAAAGAGATATACTTGGAATCACAAGATGTCCGTATTGATTTGCCTCG
CTTCAAGAACACTCTTATGGATGCTAAGAGAAGGGCAGTTAGGTTCATTCGGCAAGAGTACAGGAAAGGGCATAAAGGATGACAGAGCTTTCAAAAGCAGTAAATCTGAATGCAGTCAGGGGGAAATCATTTTTGAGGTTTTATGGGTAACATCAATCATTTTCAGGGCAGAGGCTCATGAATATAACCTTTGGTCTCTG
GCTGTTTGGAAAGTTTTATACTACCAAGGTTGCCATGGGACATTTCCTGACATTAGCTGTAGAATTCACAGAGATCTGAATGAATGATTAACCTGTCCATAAGATGATTGCTAGCAGCTGCTGAACAGGCAACGTTAATTGCTATTCGTTTCTTGGCAGGTTGAATCATAATGTGAAATGGGAAGTATAGAGAATTGGTG
GCTTCGTAAGGGCTCAGTATGAATCCAATCCTAGATTATTCAATATTTAGTGGCATTAAACTTTATTGTGCAAAGTTATGCCAGTGTACAGACAAAAGTCATAATTCCATTTTTTCAACATGACAGCTGTGCAGGTAGCTTTCTTAAACAACAGATTTGCATGTTGGATTACACTTGAATTTTATTTTAGGCTCCCATTT
AAAGGTAGCTGATATGCAGATTAAACGAATGTTGAATATGCTGAGATCCAGTTTGAACAATTGAAAGAGGGTCTCTTTGAAAAGGCATAGGAAAAGTATTTACCAAGGTGAATAAGAGACAAATTTTCTCAGATTTTCCTACTTGTCAGTATTTATTTCGAAAACCTGTGTAGTCTGCTTCCAATCAATACTTTAAAGAC
CTAGAAATTATTCATCAGAACTTCCAATCACGCCATATTTGTGTTCTCTTATCATTCTTAGCACAGAACTGAAATTCAGTTGTTGTAATGGCTTCTACTTCTGTTTCTGTTCTCCATTTTGATTTCACCGTATTTGGAATCTAGTTAACAAGGTTTTTACATGATAACTAGGTCAAATCTCTAGG