NA ----> NA
Intron 1 GTTAGTCTTC ... AAGCAAAGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 11.61 | 442 | 5 | 58 |
| A2 | 12.3 | 593.7 | 2 | 83 |
| A3 | 11 | 681.7 | 3 | 84 |
| A4 | 9.3 | 440 | 6 | 45 |
| A5 | 12.27 | 365.7 | 6 | 51 |
| A6 | 11.29 | 9887.7 | 1 | 1257 |
| A7 | 12.34 | 6149.3 | 1 | 865 |
| A8 | 12.66 | 5217.7 | 0 | 755 |
| A9 | 12.1 | 6693.7 | 0 | 920 |
| A10 | 9.09 | 5150 | 4 | 514 |
>TRINITY_DN41861_c0_g3_i3 from sample A9 / Example spliced isoformTACTATGGATACATGTTAATCCACTTTTTCGTCTTTTCCTAAGGTATTCACGGACATATCTACCTCCCCATGTAATTACACTCATCTACCCCATGACTAGGACCTTGCTTAATGAAGAGACAAAAGCTTGATCTTCCTCGTAGGGGCCTTCAGTGTGATCACCGGTCGGCCTCCATCCGAGCCTCTCCCATATCTCGATT
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TACTTTTTGGTTACAGTTGAAAGGTTACGATTGATAATATTTGGATCAAGTATTGCTATTTTGTGCTACCATATTTGTATTCAGTGCTTTTCAGAGGTATTTAATGTCGAATTTCAGCAGTTTTTTTCTATTACTTGCGTCATCTTCATAAAGAAATAAGGCTTGTGCTGGTAAGTATATATAATGCCATGCCTAATTTA
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TCGGTTCTTTTAGAAAAATATCTGTGTATTTACTTTGAATTAATATCAAAGTGTGAATGCCATCTTTACATTCGTTAGGGCATATTATATATAAAAAATACCTGAATTGCTTCC
>TRINITY_DN41861_c0_g3_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:GAACTTTATGTGCAGGGATTAGATTAAGGGCTCTAGTGATTTGATTGCTATCAGAAGGTTTTACTCTTCGCATCAGCAATATTTTGATGTTGTAGCTGATTTGGTGAATGGTGTGGTTGTTGTAGCTTAGAATTATATATTAGCCACCCTTTAATTGGTCGCTCCATTGCATTTCGTTGGAAACCCTAGATGTAAAACCC
TATGGCGCCTCTTTTTAACTTATGGCTGGCAATGTGGAAGGGAACTTTATGTGCAGGGATTAGATTAAGGGCTCTAGTGATTTGATTGCTATCAGAAGGTTTTACTCTTCGCATCAGCAATATTTTGATGTTGTAGCTGGTACGGGCTCTGGTGATTTGATTTCGATCGGAAGGTTTTACTCTTCGCACCAGCAATGAGG
GCCAAGgttagtcttcgatctattctacggactgttacttatatttgctcgtctgttgcttggctttgtatttatcctctgctttattttcagatggaagagttttctttggggcagcgtagttgggcttgaatactagggttttctccggcttcttgttccttttgcaaaattatggttttgttttttgtttcgtattc
tatcatctcgttgtacagggcaagaattttgcattagggttttaataaatggactgcggagaaatgcaattgctttttcagttttttttcctgtagagaggttttcactccgattgagagtgatagaatgtaacatttgcgtttacactcttctgtaatgaatcttgaaaggcttgcattggagactgtagttatctctt
gtttgtagcattttaccctttttcgggtagttgtttccatcattcaattgggaagcgatagaagccattatatgtaattagagtgtctacgcaaccagcgtattcattctcccctcccatggcctgtagatctgcggattggcattttagggttttattataattaattccgtctgaacgtaaatgttcctacaaaagtt
gaaagaatgctcacttttcatcttgatagtggtaatgcagtatgcgtaatcctggctttttttcatgaagaaaaacattaatattcaatatttcaaagctggagtcggaatatacatagacatgtcttttcgatgccattcagaagcaaagagTGGAAGAAGAAGCGAATGAGGAGGCTCAAAAGGAAGCGCAGGAAGAT
GAGACAGAGATCCAAGTAACTTAACATGGGTGGCAGTTCTTGGAACGGTTTTGGATGCTGGAGACTTCTATTACTGCTTTTTGCAGTTATGGATGGCGTGATTGCCATTTTTTGAATTGTGAGAAGTCTGCTTTGATTTTATCATCTTCATATTTATCGGAGGGGAAGTAGATAGACACACATACCCTGCATGTATGCCA
GAGGCTGTTACTTGTTATCTGCCACTATAGGACTATACTTTTTGGTTACAGTTGAAAGGTTACGATTGATAATATTTGGATCAAGTATTGCTATTTTGTGCTACCATATTTGTATTCAGTGCTTTTCAGAGGTATTTAATGTCGAATTTCAGCAGTTTTTTTCTATTACTTGCGTCATCTTCATAAAGAAATAAGGCTTG
TGCTGGTAAGTATATATAATGCCATGCCTAATTTATATTTGTCGAGTCATTGTCTGCCTGCTTTATTGTTGTTGATTTATAATAATTGGATGGGCTAGAATGTTGTGGCCACTAAGTGTTGATTTTGAGCAAAGTCTGATTGCAAGAATTTGAGAGGTTAATGGTCTTTACATCTAAAGCACATTATAACCTGTAGAGGG
TTAAATAGGCTGGTCGTGCTTTTGGGCTTTCGTCCTCGGTTCTTTTAGAAAAATATCTGTGTATTTACTTTGAATTAATATCAAAGTGTGAATGCCATCTTTACATTCGTTAGGGCATATTATATATAAAAAATACCTGAATTGCTTCC