sp|Q39030|KPK2_ARATH ----> Serine/threonine-protein kinase AtPK2/AtPK19
Intron 1 GTGTATTTCT ... GTTTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.05 | 151 | 7 | 68 |
| A2 | 31.85 | 184 | 17 | 86 |
| A3 | 35.58 | 201 | 20 | 111 |
| A4 | 28.8 | 136 | 18 | 55 |
| A5 | 31.71 | 84 | 8 | 39 |
| A6 | 36.93 | 526 | 22 | 308 |
| A7 | 35.28 | 877 | 65 | 478 |
| A8 | 32.15 | 838 | 90 | 397 |
| A9 | 36.58 | 1035 | 63 | 597 |
| A10 | 32.53 | 616 | 44 | 297 |
>TRINITY_DN110959_c1_g2_i4 from sample A3 / Example spliced isoformAGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATACCGCCAGCTTGGACAAAGTTTTAATAATTTAGTAATATAGCCAAATCCCTGGAATAAACTTTTCCGGCTCCCCTTCGGACTTCCCCTTCATCTGGACGGCTGTGAAGGCATCGGAAAACTAGGTAAGGTTGGAGGCGGCCAGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATCCTGGGGGCTACA
GTCTGCAGATAAGATTTCCCATCAAACGGTACTCCTCCCGCATGCTTTAATGTCAAAATCGTCTTCCGTGCCTCTGATTGTATGCAGCATACCTGTACATCACACTTGATCAATTCTGGTGTGCCGTTTTTGAATGTTATTCGATCGATTTTTAAACCTATCGTCCAAGTACAATGTAACCTTAGGGGGCAAACGGGCGC
CTTCCGGCGAGACTTCAATTTTTATTCTGGATTAAATTCTGCTCTGCAATCTCTGCAAAGGTTCGACTCAGCAAACTCTGGTTTGCGCATTTGATTTTTTGCGTTATTTGCCCTTTCTGAAACTCTGCAAATTCTAGATCTGGTCTCCCTCTCTGATACTTGAAAACGGCTTCGTATTTTTAAAATTTCCTTTTTCCCTT
TTCCGACTTGTTTTGTACAGGGGTTTCCCGCGCATTGTCAGGAAATTTTCTTAATGAGTTTGGGCCTATCAGACCCAGCCTTGGTTTCCTGTTATTCGGGAAACAAGGGCGAAATTTTCTTCTGGACGTTGTTCTTCTGTGTTCCTATAGTGGCCGAATTCGTTGCTGTATTCAAAATTAAAGCCGTTCCCGGTCGGTGT
CTATTTACGTAGCCATGGTTTTACGGGGGGGTTTCGGTGTTTCGTTATCCCGTAAATCAAGGTCGGTCCTCTTAGGACACCTGAAACTGCCTCTGGATTCTCTATCTACGCAACCGGTTAAGCGATCTGACAGCGAGGATGAAGAGTTTGATTTTTCTGACGTGTTTGGTCCCACTCTGTCGGACCAGCCTTCGCCTTCG
CCTTCACCTGGTCAAGGGAAGGCTATAACGAAATGGGTAGCCCCGGGGTTTCTTAGAACTGAGGATCCCGAAGTAATTTATAATCGATCTCATTCACTGGTTGGTCCCTCGCCTCGCCCCGGCATTGATAGGCAGCTCAGCAAGTTCAGCGAAGAGGAAAATTGCAACTCTGGTGAAAAATCCATAAAGACTGAAGAGAC
AGGGTCTCTTTCTGAAGCACATGATGAATTTCGGGTTTCTTTGTGTGAAGACTCTGATGGGGTTAATTCCGGTGCCGATGAAGAGAAGAGTTATGGTGGCGAGAAGCTTGGACCACAGGATTTTGAACTCCTAAGGGTGGTTGGGCAGGGTGCGTTTGGAAAGGTGTTTCAAGTGAGGAGAAAAGGAACAAATGAAATTT
TTGCCATGAAAGTCATGATAAAAGATAAAATTATCACAGGAAATCATGTAGACTATATGAAAGCAGAGAGGGATATTCTCACAAAGATAATTCACCCTTTCATTGTTCAGCTTCAATACTCTTTTCAGACAAAATCTAAATTGTATTTAATTCTGGATTTTATAAATGGAGGACATCTATTCTTTCAGCTTTATCGACAG
GGACTCTTCAGTGAAGAATTGGCTCGGGTTTATACTGCAGAAATAGTTTCTGCTGTGTCACATCTTCACAAAAATGGCATAATACACCGGGATCTTAAACCGGAGAACATTCTTCTAGATGCTGAAGGGCATGTCATGTTGACTGATTTTGGCCTGGCCAAGGAAGTTGATGAATCGATGCGATCCAATTCTATGTGTGG
GACTACAGAGTACATGGCACCTGAGATTCTACTTTCTAAAGGCCATAATAAATCTGCTGATTGGTGGAGTGTGGGAATTCTTTTATATGAAATGCTGACTGGTCAGCCTCCCTACACCAATTACAACAGGCAGAAGCTTCAAGAGAGAATCATCAAGGAGAAAATTAAACTACCATCATATCTGACATCCGAAGTTCATT
CATTGCTCAAAGGACTACTGCAGAAGGATCCTAGTAAGCGCCTTGGGAGTGGAGTGAATGGCAGTGATGAAATTAAGCGGCACAAATGGTTTAAAATAATAAATTGGAGGAAACTAGAAGCACGTGAGATACAGCCCAACTTCAGGCCTAATGTCAGTGGAAAGGACTGCATTGCAAACTTTGATGAACGCTGGACAGCT
ATGCCACCTCAGGACTCCCCAGCCTCAACTCCAAAAGACGGTGCATATTTCCAAGGTTACACATATGTAGCTCCTAACCCTTGGCTTTCAGAGGCCAACAAAGAAAGCCACTAAGGTGTTAAATATAGTTGCAAGAACAATTAGTTTTGGCCTTTTGACATCCCTGTGTTATTGTTTGATGGACAACCATGTAAAACCTG
TATTCACCTTTTTAATAGTCACAGGCTATGCACCTTTATGTTAAAAATAATTTGAGTGCCAATTTCACGTGAAATGCTGCTTGTATGAGTGCATAGAAAATTATAGAATGACTCGACTGTAGATTGGTTTATTCTCGTGTGTTCTGGTCTAGAAGCAATGGCCACAGTTTGAAGCTTGCAATTGGTTTTAATTCTATATT
TATATGAGTTTTTTGTTTACCTTGTGCATATCTAGTAACATGATAGGCA
>TRINITY_DN110959_c1_g2_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTCATGTTGACTGATTTTGGCCTGGCCAAGGAAGTTGATGAATCGATGCGATCCAATTCTATGTGTGGGACTACAGAGTACATGGCACCTGAGATTCTACTTTCTAAAGGCCATAATAAATCTGCTGATTGGTGGAGTGTGGGAATTCTTTTATATGAAATGCTGACTGGTCAGgtgtatttctattaccctttgaatcc
cccttaaatatttgtctcatattgtgtttgattattgatttgcatcctctttctagtgtcgagtgtccgatgaccgtgtccttgatcatggatattgtagtctttcctcttatcatgcttcgattatggtaaacttcttttcgttgtttttctgaggtcaatattgtttttgcagCCTCCCTACACCAATTACAACAGGC
AGAAGCTTCAAGAGAGAATCATCAAGGAGAAAATTAAACTACCATCATATCTGACATCCGAAGTTCATTCATTGCTCAAAGGACTACTGCAGAAGGATCCTAGTAAGCGCCTTGGGAGTGGAGTGAATGGCAGTGATGAAATTAAGCGGCACAAATGGTTTAAAATAATAAATTGGAGGAAACTAGAAGCACGTGAGATA
CAGCCCAACTTCAGGCCTAATGTCAGTGGAAAGGACTGCATTGCAAACTTTGATGAACGCTGGACAGCTATGCCACCTCAGGACTCCCCAGCCTCAACTCCAAAAGACGGTGCATATTTCCAAGGTTACACATATGTAGCTCCTAACCCTTGGCTTTCAGAGGCCAACAAAGAAAGCCACTAAGGTGTTAAATATAGTTG
CAAGAACAATTAGTTTTGGCCTTTTGACATCCCTGTGTTATTGTTTGATGGACAACCATGTAAAACCTGTATTCACCTTTTTAATAGTCACAGGCTATGCACCTTTATGTTAAAAATAATTTGAGTGCCAATTTCACGTGAAATGCTGCTTGTATGAGTGCATAGAAAATTATAGAATGACTCGACTGTAGATTGGTTTA
TTCTCGTGTGTTCTGGTCTAGAAGCAATGGCCACAGTTTGAAGCTTGCAATTGGTTTTAATTCTATATTTATATGAGTTTTTTGTTTACCTTGTGCATATCTAGTAACATGATAGGCA
Intron 2 GTTCGACTCA ... TTTTGTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.18 | 98.2 | 52 | 37 |
| A2 | 31.22 | 41 | 24.2 | 13 |
| A3 | 27.67 | 94.6 | 42 | 30.4 |
| A4 | 37.28 | 53 | 33 | 30 |
| A5 | 33.33 | 39 | 19 | 20 |
| A6 | 28.21 | 42 | 20 | 13 |
| A7 | 35.97 | 81 | 53 | 38 |
| A8 | 24.11 | 48.8 | 12 | 19 |
| A9 | 29.85 | 94 | 40 | 40 |
| A10 | 34.15 | 108 | 62 | 50 |
>TRINITY_DN116789_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformAGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATACCGCCAGCTTGGACAAAGTTTTAATAATTTAGTAATATAGCCAAATCCCTGGAATAAACTTTTCCGGCTCCCCTTCGGACTTCCCCTTCATCTGGACGGCTGTGAAGGCATCGGAAAACTAGGTAAGGTTGGAGGCGGCCAGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATACCGCCAGCTTGG
ACAAAGTTTTAATAATTTAGTAATATAGCCAAATCCCTGGAATAAACTTTTCCGGCTCCCCTTCGGACTTCCCCTTCATCTGGACGGCTGTGAAGGCATCGGAAAACTAGGTAAGGTTGGAGGCGGCCAGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATCCTGGGGGCTACAGTCTGCAGATAAGATTTCCCATCAAACGGTATTCCT
CCCGCATGCTTTAATGTCAAAATCGTCTTCCGTGCCTCTGATTGTATGCAGCATACCTGTACATCACACTTGATCAATTCTGGTGTGCCGTTTTTGAATGTTATTCGATCGATTTTTAAACCTATCGTCCAAGTACAATGTAACCTTAGGGGGCAAACGGGCGCCTTCCGGCGAGACTTCAATTTTTATTCTGGATTAAA
TTCTGCTCTGCAATCTCTGCAAAGGGGTTTCCCGCGCATTGTCAGGAAATTTTCTTAATGAGTTTGGGCCTATCAGACCCAGCCTTGGTTTCCTGTTATTCGGGAAACAAGGGCGAAATTTTCTTCTGGACGTTGTTCTTCTGTGTTCCTATAGTGGCCGAATTCGTTGCTGTATTCAAAATTAAAGCCGTTCCCGGTCG
GTGTCTATTTACGTAGCCATGGTTTTACGGGGGGGTTTCGGTGTTTCGTTATCCCGTAAATCAAGGTCGGTCCTCTTAGGACACCTGAAACTGCCTCTGGATTCTCTATCTACGCAACCGGTTAAGCGATCTGACAGCGAGGATGAAGAGTTTGATTTTTCTGACGTGTTTGGTCCCACTCTGTCGGACCAGCCTTCGCC
TTCGCCTTCACCTGGTCAAGGGAAGGCTATAACGAAATGGGTAGCCCCGGGGTTTCTTAGAACTGAGGATCCCGAAGTAATTTATAATCGATCTCATTCACTGGTTGGTCCCTCGCCTCGTCCCGGCATTGATAGGCAGCTCAGCAAGTTCAGCGAAGAGGAAAATTGCAACTCTGGCGAAAAATCCATAAAGACTGAAG
AGACAGGGTCTCTTTCTGAAGCACATGATGAATTTCGGGTTTCTTTGTGTGAAGACTCTGATGGGGTTAATTCCGGTGCCGATGAAGAGAAGAGTTATGGTGGCGAGAAGCTTGGACCACAGGATTTTGAACTCCTAAGGGTGGTTGGGCAGGGTGCGTTTGGAAAGGTGTTTCAAGTGAGGAGAAAAGGAACAAATGAA
ATTTTTGCCATGAAAGTCATGATAAAAGATAAAATTATCACAGGAAATCATGTAGACTATATGAAAGCAGAGAGGGATATTCTCACAAAGATAATTCACCCTTTCATTGTTCAGCTTCAATACTCTTTTCAGACAAAATCTAAATTGTATTTAATTCTGGATTTTATAAATGGAGGACATCTATTCTTTCAGCTTTATCG
ACAGGGACTCTTCAGTGAAGAATTGGCTCGGGTTTATACTGCAGAAATAGTTTCTGCTGTGTCACATCTTCACAAAAATGGCATAATACACCGGGATCTTAAACCGGAGAACATTCTTCTAGATGCTGAAGGGCATGTAAGTGAACTCTGAATTTTAAATTGTATGGGTAGTTCTTGTTGCTATGTACATGTTTCACAGT
ATGGTGGTTTTATTTTAGTATTTTAATCTATTGAAACTTGTGCATATTGATTTCTATCTTTTTGTTATTAAGAATTATATATATATTTTTTTCCAATGGAAAAATCTCTTTATTCTTGTCGAATAAACATAAACTGACCTCTACGGGGTTACATCATGTTTTCATGCTTTTATGGCTTCATTACAA
>TRINITY_DN116789_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:AGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATACCGCCAGCTTGGACAAAGTTTTAATAATTTAGTAATATAGCCAAATCCCTGGAATAAACTTTTCCGGCTCCCCTTCGGACTTCCCCTTCATCTGGACGGCTGTGAAGGCATCGGAAAACTAGGTAAGGTTGGAGGCGGCCAGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATACCGCCAGCTTGG
ACAAAGTTTTAATAATTTAGTAATATAGCCAAATCCCTGGAATAAACTTTTCCGGCTCCCCTTCGGACTTCCCCTTCATCTGGACGGCTGTGAAGGCATCGGAAAACTAGGTAAGGTTGGAGGCGGCCAGGTCGAAGTCGGGGGATCGAATCCTGGGGGCTACAGTCTGCAGATAAGATTTCCCATCAAACGGTATTCCT
CCCGCATGCTTTAATGTCAAAATCGTCTTCCGTGCCTCTGATTGTATGCAGCATACCTGTACATCACACTTGATCAATTCTGGTGTGCCGTTTTTGAATGTTATTCGATCGATTTTTAAACCTATCGTCCAAGTACAATGTAACCTTAGGGGGCAAACGGGCGCCTTCCGGCGAGACTTCAATTTTTATTCTGGATTAAA
TTCTGCTCTGCAATCTCTGCAAAGgttcgactcagcaaactctggtttgcgcatttgattttttgcgttatttgccgtttctgaaactctgcaaattctagatctggtctccctctctgatacttgaaaacggcttcgtatttttaaaatttcctttttcccttttccgacttgttttgtacagGGGTTTCCCGCGCATT
GTCAGGAAATTTTCTTAATGAGTTTGGGCCTATCAGACCCAGCCTTGGTTTCCTGTTATTCGGGAAACAAGGGCGAAATTTTCTTCTGGACGTTGTTCTTCTGTGTTCCTATAGTGGCCGAATTCGTTGCTGTATTCAAAATTAAAGCCGTTCCCGGTCGGTGTCTATTTACGTAGCCATGGTTTTACGGGGGGGTTTCG
GTGTTTCGTTATCCCGTAAATCAAGGTCGGTCCTCTTAGGACACCTGAAACTGCCTCTGGATTCTCTATCTACGCAACCGGTTAAGCGATCTGACAGCGAGGATGAAGAGTTTGATTTTTCTGACGTGTTTGGTCCCACTCTGTCGGACCAGCCTTCGCCTTCGCCTTCACCTGGTCAAGGGAAGGCTATAACGAAATGG
GTAGCCCCGGGGTTTCTTAGAACTGAGGATCCCGAAGTAATTTATAATCGATCTCATTCACTGGTTGGTCCCTCGCCTCGTCCCGGCATTGATAGGCAGCTCAGCAAGTTCAGCGAAGAGGAAAATTGCAACTCTGGCGAAAAATCCATAAAGACTGAAGAGACAGGGTCTCTTTCTGAAGCACATGATGAATTTCGGGT
TTCTTTGTGTGAAGACTCTGATGGGGTTAATTCCGGTGCCGATGAAGAGAAGAGTTATGGTGGCGAGAAGCTTGGACCACAGGATTTTGAACTCCTAAGGGTGGTTGGGCAGGGTGCGTTTGGAAAGGTGTTTCAAGTGAGGAGAAAAGGAACAAATGAAATTTTTGCCATGAAAGTCATGATAAAAGATAAAATTATCA
CAGGAAATCATGTAGACTATATGAAAGCAGAGAGGGATATTCTCACAAAGATAATTCACCCTTTCATTGTTCAGCTTCAATACTCTTTTCAGACAAAATCTAAATTGTATTTAATTCTGGATTTTATAAATGGAGGACATCTATTCTTTCAGCTTTATCGACAGGGACTCTTCAGTGAAGAATTGGCTCGGGTTTATACT
GCAGAAATAGTTTCTGCTGTGTCACATCTTCACAAAAATGGCATAATACACCGGGATCTTAAACCGGAGAACATTCTTCTAGATGCTGAAGGGCATGTCATGTTGACTGATTTTGGCCTGGCCAAGGAAGTTGATGAATCGATGCGATCCAATTCTATGTGTGGGACTACAGAGTACATGGCACCTGAGATTCTACTTTC
TAAAGGCCATAATAAATCTGCTGATTGGTGGAGTGTGGGAATTCTTTTATATGAAATGCTGACTGGTCAGCCTCCCTACACCAATTACAACAGGCAGAAGCTTCAAGAGAGAATCATCAAGGAGAAAATTAAACTACCATCATATCTGACATCCGAAGTTCATTCATTGCTCAAAGGACTACTGCAGAAGGATCCTAGTA
AGCGCCTTGGGAGTGGAGTGAATGGCAGTGATGAAATTAAGCGGCACAAATGGTTTAAAATAATAAATTGGAGGAAACTAGAAGCACGTGAGATACAGCCCAACTTCAGGCCTAATGTCAGTGGAAAGGACTGCATTGCAAACTTTGATGAACGCTGGACAGCTATGCCACCTCAGGACTCCCCAGCCTCAACTCCAAAA
GACGGTGCATATTTCCAAGGTTACACATATGTAGCTCCTAACCCTTGGCTTTCAGAGGCCAACGAAGAAAGCCACTAAGGTGTTAAATATAGTTGCAAGAACATATAGTTTTGGCCTTTTGACATCCCTGTGTTTTTGTTTGATGGACAACCATGTAAAACCTGTATTCACCTTTTTAATAGTCACAGCCTATGCACCTT
TATGTTAAAAATAATTTGAGTGCCAATTTCACGTGAAATGCTGCTTGTATAAGTGCATAGAAAATTATTGAATGGCTCGACTGTAGATTGGTTTATTCTCGTGTGTTCTGGTCTAGAAGCAATGGCCACAGTTTGAAGCTTGC