sp|Q9CA75|XXT5_ARATH ----> Probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 5
Intron 1 GTTGATCTCA ... CAACTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 0 | 5 |
| A2 | 80 | 1 | 5 | 3 |
| A3 | 72.73 | 3 | 9 | 7 |
| A4 | 100 | 0 | 4 | 2 |
| A5 | 33.33 | 4 | 4 | 0 |
| A6 | 43.21 | 23 | 25 | 10 |
| A7 | 44 | 7 | 6 | 5 |
| A8 | 55.1 | 11 | 14 | 13 |
| A9 | 48.15 | 14 | 11 | 15 |
| A10 | 33.33 | 5 | 1 | 4 |
>TRINITY_DN43115_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformCCTCCCTCCATTCCCATAAATACATACCTTCAACTCCCACACGACCCTCCCTGTAGCAGACCTAAGATCTGCCTAGCCCTCATCCCTAATCGCACCGCTGGTCGGCAATATAGAATAATATAAACACAATCGAGAAGAATCAATTGTTCGTTGGCTTCAACTATTTCCCACGTACTCCGTATTCCCTAAATTAGCGCATT
CGTAGAAGGGACCGGCCGTTGAATGGTAAACAAGCAGTTAAAATCGTCCAGACCCTCTAAACAGGAGACAGACAGGCGCCGTTATACCCTAGTCGGTAGTAATAGAGGATCCAGATAAACAACAATAACAAGGGCAGCTACCTTTTCTTCATGTGCGCTTATTTATGAAAAAAATCCCAAATATCCAGCCTCTTCCCAAC
TTCACACAGTTGTGACTTACAAGTTACGAAGTGGGCAACATATGGTGATTCATGCAGAGAACTACTGATGGCGGGCAGACCAAGACAGTTATTTCAGAGGCATCTTAACCTCATTTTTACTGTTGGGTACTAGACCAGATCTGGTTCCTGGCAGCCCCCTCCGTGTGAGATTCGATGTGGGTCCCATTGCTTTTAGCTGG
AAGAGTTTCAGTTAGAGTTGTCAGTCCCCTTGAATAAACAAATCTGGATCCACCCTGCCTAATGGGCTTGACCTAGGAACTAGCATTTGGTGTTTTATATAGTATCTGAAGGCCTATCAGCCTGAACATCCAGGTATGAAGCCTGTTTAGGTTTCTGTATTTTTCTTCATAACAAGTTATATAGAATAGCAGATAAAGAG
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ATTTGGGTGGCCAAGACACGGGGGATGGTAGCCAAAAAGTGGCAGAGGAGAATGCTAGGGTGCTAGAAGAGATCAGGAGGAAGGAAGAGCCTGATGACGAGGAGAAGATGGAGATGCAGATTGGTTCTAATGTAACCTATCCTAATGTAACCTATACTTTGGGACCCCGGATCAGTGACTGGGATCAGCAGAGAATAACT
TGGCTCAAGGAAAATCCGCAATTTCCCAGTTATGTGAATGGGAAGCCTAGGATTTTGCTCGTCACTGGGTCCCAGCCCACCCCATGTGATAGCCCAGTCGGGGATCATTATTTGCTCAAGGGAGTCAAGAACAAAATTGACTACTGCAGGCTTCATGGCATTGAGATTGTCTATAATATGGCTCATTTGGATAAGGAGAT
GGCTGGTTATTGGGCCAAGTTGCCCCTGCTCCGAAGGCTTATGCTGTCACATCCGGAAGTGGAATGGATTTGGTGGATGGACAGTGATGCAATGTTCACTGATATGGTTTTTGAGCTGCCATTGGATAAATACAAGGACTATAATTTTGTTCTCCATGGTTGGGATAATTTGGTTTATGGTAAGCAGTCTTGGATCGGAT
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GGTGACAGAGTTTTTCTGGAAAGCTCCTATTTTCTTCATGGCTATTGGGTTAGTGTGGTGGACAAGTACGAGGACATGATACGGACTTACCATCCTGGATTTGGAGATGAAAGGTGGCCTTTTGTTACTCATTTTGTGGGATGCAAACCTTGTGGTAGCTATGGAGATTACCCAGTCGAACGCTGTATGAAGAGTATGGA
AAGAGCCTTCAATTTCGCAGACAACCAGATACTTCAGATTTATGGTTTTAAACACAAGACTCTGAATACTGCAAAAGTCAAGCGGACAAGGAATGACACGGCAACACCTCTTGAAGTTAAAGATGAGTTCAACCTCTTGCATCCCTCATTCACTACTTCAAAGAGCCTATGATGTATTTAAGCATGCATTCATAGATATC
TCTGCAAATAGGGAGGCATTTCTTTAGACATTTTCCAAACTTTGTAAGATGAATGCTGTGGTGTTAATCTAATTTATTCTTTGCTTTTGCTATATTATAAGCGAATATGTTTGTTCACAACATTGCAGTCTTGGATTCGAATACAGTCTTGAAGTGCTGACAGGTTTACTAGTCAGTCTGTTTCACATTCAACAGGAATC
TGCCATTTGTCTATAAACCTGAGATGATTTGGGTTAGCAGTCTTTTATTAGGCTTTGATTAATGTTGATCTAAGATTTACACTTGAATCATTGTATGGTTTTGTTTATTTTGAACTGGAAATGTTTTATAGTTATCAAGGGTAGGAATGTGCGGGATCTAATGCTACGACGGAAGGTTTAAAGAGGTAAATTTGTTGGGA
GAGGGCAAGGTTACTTGTCGACAGATCAGATTTAGTGCAGGTGGGGATGATGTATAAAGGGATACATGAATACCCGATTGATGACACAATCACTAGCATTAATGAAAATAAGTGGGCAGAATCTGTTAATAAAATATAGTTTTGACGTTGTAGTTTTAGTACTATAACTGAGTTGAGGGTCTGATGTTTTTGGTGGATTT
CAAATATATTCGAGCTTTCCC
>TRINITY_DN43115_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:CCTCCCTCCATTCCCATAAATACATACCTTCAACTCCCACACGACCCTCCCTGTAGCAGACCTAAGATCTGCCTAGCCCTCATCCCTAATCGCACCGCTGGTCGGCAATATAGAATAATATAAACACAATCGAGAAGAATCAATTGTTCGTTGGCTTCAACTATTTCCCACGTACTCCGTATTCCCTAAATTAGCGCATT
CGTAGAAGGGACCGGCCGTTGAATGGTAAACAAGCAGTTAAAATCGTCCAGACCCTCTAAACAGGAGACAGACAGGCGCCGTTATACCCTAGTCGGTAGTAATAGAGGATCCAGATAAACAACAATAACAAGGGCAGCTACCTTTTCTTCATGTGCGCTTATTTATGAAAAAAATCCCAAATATCCAGCCTCTTCCCAAC
TTCACACAGTTGTGACTTACAAGTTACGAAGTGGGCAACATATGGTGATTCATGCAGAGAACTACTGATGGCGGGCAGACCAAGACAGTTATTTCAGAGGCATCTTAACCTCATTTTTACTGTTGGGTACTAGACCAGATCTGGTTCCTGGCAGCCCCCTCCGTGTGAGATTCGATGTGGGTCCCATTGCTTTTAGCTGG
AAGAGTTTCAGTTAGAGTTGTCAGTCCCCTTGAATAAACAAATCTGGATCCACCCTGCCTAATGGGCTTGACCTAGGAACTAGCATTTGGTGTTTTATATAGTATCTGAAGGCCTATCAGCCTGAACATCCAGGTATGAAGCCTGTTTAGGTTTCTGTATTTTTCTTCATAACAAGTTATATAGAATAGCAGATAAAGAG
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ATTTGGGTGGCCAAGACACGGGGGATGGTAGCCAAAAAGTGGCAGAGGAGAATGCTAGGGTGCTAGAAGAGATCAGGAGGAAGGAAGAGCCTGATGACGAGGAGAAGATGGAGATGCAGATTGGTTCTAATGTAACCTATCCTAATGTAACCTATACTTTGGGACCCCGGATCAGTGACTGGGATCAGCAGAGAATAACT
TGGCTCAAGGAAAATCCGCAATTTCCCAGTTATGTGAATGGGAAGCCTAGGATTTTGCTCGTCACTGGGTCCCAGCCCACCCCATGTGATAGCCCAGTCGGGGATCATTATTTGCTCAAGGGAGTCAAGAACAAAATTGACTACTGCAGGCTTCATGGCATTGAGATTGTCTATAATATGGCTCATTTGGATAAGGAGAT
GGCTGGTTATTGGGCCAAGTTGCCCCTGCTCCGAAGGCTTATGCTGTCACATCCGGAAGTGGAATGGATTTGGTGGATGGACAGTGATGCAATGTTCACTGATATGGTTTTTGAGCTGCCATTGGATAAATACAAGGACTATAATTTTGTTCTCCATGGTTGGGATAATTTGGTTTATGGTAAGCAGTCTTGGATCGGAT
TGAATACTGGCAGTTTCCTTCTTCGGAATTGTCAGTGGTCTTTAGATATATTGGATGCGTGGGCGCCAATGGGTCCAAAGGGCAAGATCAGAGAAGAAGCAGGAAAGGTTTTGACTGCTCATTTGGAGGGTAGACCGGCATTCGAGGCAGATGATCAATCTGCCCTAATATATTTATTGATCTCTCAAAAAAAGCTTTGG
GGTGACAGAGTTTTTCTGGAAAGCTCCTATTTTCTTCATGGCTATTGGGTTAGTGTGGTGGACAAGTACGAGGACATGATACGGACTTACCATCCTGGATTTGGAGATGAAAGGTGGCCTTTTGTTACTCATTTTGTGGGATGCAAACCTTGTGGTAGCTATGGAGATTACCCAGTCGAACGCTGTATGAAGAGTATGGA
AAGAGCCTTCAATTTCGCAGACAACCAGATACTTCAGATTTATGGTTTTAAACACAAGACTCTGAATACTGCAAAAGTCAAGCGGACAAGGAATGACACGGCAACACCTCTTGAAGTTAAAGATGAGTTCAACCTCTTGCATCCCTCATTCACTACTTCAAAGAGCCTATGATGTATTTAAGCATGCATTCATAGATATC
TCTGCAAATAGGGAGGCATTTCTTTAGACATTTTCCAAACTTTGTAAGATGAATGCTGTGGTGTTAATCTAATTTATTCTTTGCTTTTGCTATATTATAAGCGAATATGTTTGTTCACAACATTGCAGTCTTGGATTCGAATACAGTCTTGAAGTGCTGACAGGTTTACTAGTCAGTCTGTTTCACATTCAACAGGAATC
TGCCATTTGTCTATAAACCTGAGATGATTTGGGTTAGCAGTCTTTTATTAGGCTTTGATTAATGTTGATCTAAGATTTACACTTGAATCATTGTATGGTTTTGTTTATTTTGAACTGGAAATGTTTTATAGTTATCAAGGGTAGGAATGTGCGGGATCTAATGCTACGACGGAAGGTTTAAAGgttgatctcactgcaag
gcttgtttatgaatattatgattaattttgtttaattacctacatgcctttagtcaattgttagcaattgcttttgattttcacacattttattcaactttcagAGGTAAATTTGTTGGGAGAGGGCAAGGTTACTTGTCGACAGATCAGATTTAGTGCAGGTGGGGATGATGTATAAAGGGATACATGAATACCCGATT
GATGACACAATCACTAGCATTAATGAAAATAAGTGGGCAGAATCTGTTAATAAAATATAGTTTTGACGTTGTAGTTTTAGTACTATAACTGAGTTGAGGGTCTGATGTTTTTGGTGGATTTCAAATATATTCGAGCTTTCCC
Intron 2 GTTGATCTCA ... CAACTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 1 | 7 |
| A2 | 66.67 | 1 | 3 | 1 |
| A3 | 76 | 3 | 12 | 7 |
| A4 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A5 | 33.33 | 4 | 4 | 0 |
| A6 | 45.24 | 23 | 26 | 12 |
| A7 | 50 | 7 | 5 | 9 |
| A8 | 46.34 | 11 | 11 | 8 |
| A9 | 51.72 | 14 | 11 | 19 |
| A10 | 33.33 | 5 | 1 | 4 |
>TRINITY_DN43115_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformCCTCCCTCCATTCCCATAAATACATACCTTCAACTCCCACACGACCCTCCCTGTAGCAGACCTAAGATCTGCCTAGCCCTCATCCCTAATCGCACCGCTGGTCGGCAATATAGAATAATATAAACACAATCGAGAAGAATCAATTGTTCGTTGGCTTCAACTATTTCCCACGTACTCCGTATTCCCTAAATTAGCGCATT
CGTAGAAGGGACCGGCCGTTGAATGGTAAACAAGCAGTTAAAATCGTCCAGACCCTCTAAACAGGAGACAGACAGGCGCCGTTATACCCTAGTCGGTAGTAATAGAGGATCCAGATAAACAACAATAACAAGGGCAGCTACCTTTTCTTCATGTGCGCTTATTTATGAAAAAAATCCCAAATATCCAGCCTCTTCCCAAC
TTCACACAGTTGTGACTTACAAGTTACGAAGTGGGCAACATATGGTGATTCATGCAGAGAACTACTGATGGCGGGCAGACCAAGACAGTTATTTCAGAGGCATCTTAACCTCATTTTTACTGTTGGGTACTAGACCAGATCTGGTTCCTGGCAGCCCCCTCCGTGTGAGATTCGATGTGGGTCCCATTGCTTTTAGCTGG
AAGAGTTTCAGTTAGAGTTGTCAGTCCCCTTGAATAAACAAATCTGGATCCACCCTGCCTAATGGGCTTGACCTAGGAACTAGCATTTGGTGTTTTATATAGTATCTGAAGGCCTATCAGCCTGAACATCCAGGTATGAAGCCTGTTTAGGTTTCTGTATTTTTCTTCATAACAAGTTATATAGAATAGCAGATAAAGAG
ATCTGGGATTGCTTCTTTAGGGGTTTCAATGAGGGAGAGCTTCAAGAGGGGTCTGCCCTCTGTGAGGGGGGCTGCCAATGGTAGATCTCTGGGTCTGCCCAAAGCCAGGCAGCTCCAGAAGACTTTCAACAATCTGAAAATTACGATCTTGTGTGGTTTTGTGACCATACTTGTTCTGAGGGGCACCATCGGAGTCGGCA
ATTTGGGTGGCCAAGACACGGGGGATGGTAGCCAAAAAGTGGCAGAGGAGAATGCTAGGGTGCTAGAAGAGATCAGGAGGAAGGAAGAGCCTGATGACGAGGAGAAGATGGAGATGCAGATTGGTTCTAATGTAACCTATCCTAATGTAACCTATACTTTGGGACCCCGGATCAGTGACTGGGATCAGCAGAGAATAACT
TGGCTCAAGGAAAATCCGCAATTTCCCAGTTATGTGAATGGGAAGCCTAGGATTTTGCTCGTCACTGGGTCCCAGCCCACCCCATGTGATAGCCCAGTCGGGGATCATTATTTGCTCAAGGGAGTCAAGAACAAAATTGACTACTGCAGGCTTCATGGCATTGAGATTGTCTATAATATGGCTCATTTGGATAAGGAGAT
GGCTGGTTATTGGGCCAAGTTGCCCCTGCTCCGAAGGCTTATGCTGTCACATCCGGAAGTGGAATGGATTTGGTGGATGGACAGTGATGCAATGTTCACTGATATGGTTTTTGAGCTGCCATTGGATAAATACAAGGACTATAATTTTGTTCTCCATGGTTGGGATAATTTGGTTTATGGTAAGCAGTCTTGGATCGGAT
TGAATACTGGCAGTTTCCTTCTTCGGAATTGTCAGTGGTCTTTAGATATATTGGATGCGTGGGCGCCAATGGGTCCAAAGGGCAAGATCAGAGAAGAAGCAGGAAAGGTTTTGACTGCTCATTTGGAGGGTAGACCGGCATTCGAGGCAGATGATCAATCTGCCCTAATATATTTATTGATCTCTCAAAAAAAGCTTTGG
GGTGACAGAGTTTTTCTGGAAAGCTCCTATTTTCTTCATGGCTATTGGGTTAGTGTGGTGGACAAGTACGAGGACATGATACGGACTTACCATCCTGGATTTGGAGATGAAAGGTGGCCTTTTGTTACTCATTTTGTGGGATGCAAACCTTGTGGTAGCTATGGAGATTACCCAGTCGAACGCTGTATGAAGAGTATGGA
AAGAGCCTTCAATTTCGCAGACAACCAGATACTTCAGATTTATGGTTTTAAACACAAGACTCTGAATACTGCAAAAGTCAAGCGGACAAGGAATGACACGGCAACACCTCTTGAAGTTAAAGATGAGTTCAACCTCTTGCATCCCTCATTCACTACTTCAAAGAGCCTATGATGTATTTAAGCATGCATTCATAGATATC
TCTGCAAATAGGGAGGCATTTCTTTAGACATTTTCCAAACTTTGTAAGATGAATGCTGTGGTGTTAATCTAATTTATTCTTTGCTTTTGCTATATTATAAGCGAATATGTTTGTTCACAACATTGCAGTCTTGGATTCGAATACAGTCTTGAAGTGCTGACAGGTTTACTAGTCAGTCTGTTTCACATTCAACAGGAATC
TGCCATTTGTCTATAAACCTGAGATGATTTGGGTTAGCAGTCTTTTATTAGGCTTTGATTAATGTTGATCTAAGATTTACACTTGAATCATTGTATGGTTTTGTTTATTTTGAACTGGAAATGTTTTATAGTTATCAAGGGTAGGAATGTGCGGGATCTAATGCTACGACGGAAGGTTTAAAGAGGTAAATTTGTTGGGA
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CAAATATATTCGAGCTTTCCC
>TRINITY_DN43115_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:CCTCCCTCCATTCCCATAAATACATACCTTCAACTCCCACACGACCCTCCCTGTAGCAGACCTAAGATCTGCCTAGCCCTCATCCCTAATCGCACCGCTGGTCGGCAATATAGAATAATATAAACACAATCGAGAAGAATCAATTGTTCGTTGGCTTCAACTATTTCCCACGTACTCCGTATTCCCTAAATTAGCGCATT
CGTAGAAGGGACCGGCCGTTGAATGGTAAACAAGCAGTTAAAATCGTCCAGACCCTCTAAACAGGAGACAGACAGGCGCCGTTATACCCTAGTCGGTAGTAATAGAGGATCCAGATAAACAACAATAACAAGGGCAGCTACCTTTTCTTCATGTGCGCTTATTTATGAAAAAAATCCCAAATATCCAGCCTCTTCCCAAC
TTCACACAGTTGTGACTTACAAGTTACGAAGTGGGCAACATATGGTGATTCATGCAGAGAACTACTGATGGCGGGCAGACCAAGACAGTTATTTCAGAGGCATCTTAACCTCATTTTTACTGTTGGGTACTAGACCAGATCTGGTTCCTGGCAGCCCCCTCCGTGTGAGATTCGATGTGGGTCCCATTGCTTTTAGCTGG
AAGAGTTTCAGTTAGAGTTGTCAGTCCCCTTGAATAAACAAATCTGGATCCACCCTGCCTAATGGGCTTGACCTAGGAACTAGCATTTGGTGTTTTATATAGTATCTGAAGGCCTATCAGCCTGAACATCCAGGTATGAAGCCTGTTTAGGTTTCTGTATTTTTCTTCATAACAAGTTATATAGAATAGCAGATAAAGAG
ATCTGGGATTGCTTCTTTAGGGGTTTCAATGAGGGAGAGCTTCAAGAGGGGTCTGCCCTCTGTGAGGGGGGCTGCCAATGGTAGATCTCTGGGTCTGCCCAAAGCCAGGCAGCTCCAGAAGACTTTCAACAATCTGAAAATTACGATCTTGTGTGGTTTTGTGACCATACTTGTTCTGAGGGGCACCATCGGAGTCGGCA
ATTTGGGTGGCCAAGACACGGGGGATGGTAGCCAAAAAGTGGCAGAGGAGAATGCTAGGGTGCTAGAAGAGATCAGGAGGAAGGAAGAGCCTGATGACGAGGAGAAGATGGAGATGCAGATTGGTTCTAATGTAACCTATCCTAATGTAACCTATACTTTGGGACCCCGGATCAGTGACTGGGATCAGCAGAGAATAACT
TGGCTCAAGGAAAATCCGCAATTTCCCAGTTATGTGAATGGGAAGCCTAGGATTTTGCTCGTCACTGGGTCCCAGCCCACCCCATGTGATAGCCCAGTCGGGGATCATTATTTGCTCAAGGGAGTCAAGAACAAAATTGACTACTGCAGGCTTCATGGCATTGAGATTGTCTATAATATGGCTCATTTGGATAAGGAGAT
GGCTGGTTATTGGGCCAAGTTGCCCCTGCTCCGAAGGCTTATGCTGTCACATCCGGAAGTGGAATGGATTTGGTGGATGGACAGTGATGCAATGTTCACTGATATGGTTTTTGAGCTGCCATTGGATAAATACAAGGACTATAATTTTGTTCTCCATGGTTGGGATAATTTGGTTTATGGTAAGCAGTCTTGGATCGGAT
TGAATACTGGCAGTTTCCTTCTTCGGAATTGTCAGTGGTCTTTAGATATATTGGATGCGTGGGCGCCAATGGGTCCAAAGGGCAAGATCAGAGAAGAAGCAGGAAAGGTTTTGACTGCTCATTTGGAGGGTAGACCGGCATTCGAGGCAGATGATCAATCTGCCCTAATATATTTATTGATCTCTCAAAAAAAGCTTTGG
GGTGACAGAGTTTTTCTGGAAAGCTCCTATTTTCTTCATGGCTATTGGGTTAGTGTGGTGGACAAGTACGAGGACATGATACGGACTTACCATCCTGGATTTGGAGATGAAAGGTGGCCTTTTGTTACTCATTTTGTGGGATGCAAACCTTGTGGTAGCTATGGAGATTACCCAGTCGAACGCTGTATGAAGAGTATGGA
AAGAGCCTTCAATTTCGCAGACAACCAGATACTTCAGATTTATGGTTTTAAACACAAGACTCTGAATACTGCAAAAGTCAAGCGGACAAGGAATGACACGGCAACACCTCTTGAAGTTAAAGATGAGTTCAACCTCTTGCATCCCTCATTCACTACTTCAAAGAGCCTATGATGTATTTAAGCATGCATTCATAGATATC
TCTGCAAATAGGGAGGCATTTCTTTAGACATTTTCCAAACTTTGTAAGATGAATGCTGTGGTGTTAATCTAATTTATTCTTTGCTTTTGCTATATTATAAGCGAATATGTTTGTTCACAACATTGCAGTCTTGGATTCGAATACAGTCTTGAAGTGCTGACAGGTTTACTAGTCAGTCTGTTTCACATTCAACAGGAATC
TGCCATTTGTCTATAAACCTGAGATGATTTGGGTTAGCAGTCTTTTATTAGGCTTTGATTAATGTTGATCTAAGATTTACACTTGAATCATTGTATGGTTTTGTTTATTTTGAACTGGAAATGTTTTATAGTTATCAAGGGTAGGAATGTGCGGGATCTAATGCTACGACGGAAGGTTTAAAGgttgatctcactgcaag
gcttgtttatgaatattatgattaattttgtttaattacctacatgcctttaactggaataatgtgggatttattttcggcatgcctttagtcaattgttagcaattgcttttgattttcacacattttattcaactttcagAGGTAAATTTGTTGGGAGAGGGCAAGGTTACTTGTCGACAGATCAGATTTAGTGCAGG
TGGGGATGATGTATAAAGGGATACATGAATACCCGATTGATGACACAATCACTAGCATTAATGAAAATAAGTGGGCAGAATCTGTTAATAAAATATAGTTTTGACGTTGTAGTTTTAGTACTATAACTGAGTTGAGGGTCTGATGTTTTTGGTGGATTTCAAATATATTCGAGCTTTCCC