sp|F4JMI5|GUX7_ARATH ----> Putative glucuronosyltransferase PGSIP7
Intron 1 GTATCGGAAA ... TCTACTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 60.27 | 73.2 | 105 | 111 |
| A2 | 57.03 | 56.2 | 68 | 75 |
| A3 | 58.31 | 77 | 104 | 104 |
| A4 | 63.09 | 66.2 | 92 | 123 |
| A5 | 61.18 | 39.6 | 71 | 51 |
| A6 | 58.53 | 52 | 61 | 76 |
| A7 | 61.3 | 103 | 176 | 138 |
| A8 | 60.91 | 39.4 | 55 | 63 |
| A9 | 61.48 | 92.4 | 159.6 | 126 |
| A10 | 56.39 | 123.6 | 153.6 | 153 |
>TRINITY_DN47029_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformCTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGCGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCGCCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCCCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTC
TGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATTGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTC
CGAAGGTTGATTTCTTTGCTTTGAATGTTTTTTGACTAGATCAAAACCTCGCTTGCCAGGATTTGGAGAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTT
>TRINITY_DN47029_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:CTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGCGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCGCCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCCCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTC
TGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATTGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTC
CGAAGGTTGATTTCTTTGCTTTGAATGTTTTTTGACTAGATCAAAACCTCGCTTGCCAGGATTTGGAGgtatcggaaattcggcgtgatgacatgcatcaggttttgtttgttaagtttgtatatggcgtcgttagaactccgatactgagattaaccttgactctgtcaagaactgtgaggtttttgtcagattatggt
taatacagtgcacatataacgccttccctatttcggcaaagtttgagctgcgtttagtgaacactcccgttttctgacatgtcagcattctgaatttgccgaaaagactttggccaggcgtccttttgatgcatctcgtagccttttaagctttcctcggtgttataatctttcatggccaggaatgggagatttgaggt
tcaaatctcatcaagtcccttttcctggtggcttagtgcaaaattgcattaaagattgagaaaataacctacagatttactttattaaactggatacaaatcccgtatcccggagctagttggccgtgttaaatttcgtctggtctctgccttttgttctttaacgtttggatagtagcgatgcaatcttttctagtgaa
cggaagcagaaacttatatacagtttaaaccttaactgcattctgattctcttttctacttcagAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGG
CGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCTCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATA
GTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGTATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAA
TCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTATTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTGATATGATGCATGAACTGAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGCAGACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATCCTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATC
GACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTATTTGAAGTTGAAATGGCACGTGCCATGTGGACCAAATAGTGTCATCACTTTTCCTAGTGTTCCTTGGATGAAGCCATGGTACTGGTGGTCATGGCCAGTTTTGCCCTTGGGGCTCTCTTGGCATGAGCAGAGGCGCCAGACAATAGGGTATGGTGCAGAG
ATTCCCCTCGTTCTAGCTGAGTCACTGTTTTACTTGGTCACTCTGGCTCTGTCAATGATTGCTTGTAGGGGCTCCCAAACTGCTTCATCTAAGTTTTGCCTCTTGAAATCGGAGCAGGGTTTCTCGTTCTATTCTATTGTTCCCAAGCTTTTGGTTCTATTTAGTATGGTGGCAAGTTACTTGCTCCCATTTTTGCTTGT
TCCAAGAACAATTAATCCTCTGATCGGTTGGGGGATTTATTTACTGGGTTCCATGTCAACTGGGGTTCTCGTTGTAAATGCCTTCCAGCTCCCAGTTTTGCCTGTGTTTACCCCTTGGTTGGGTATATTCGGGGTTCTTCTTGTCATGGCCTTTCCTCTTTATACCAATGGCATAGTAAGAGCAATAGCAGTAGGAGCAT
ATGCCGCTCTGGCTGCTCCCTTTGCATGGTGGGCTTTTGGAAAAGCATTGTCAACATTGTCAAGATCTGAGCCACAGTTTCAACTCACCAAAATCTGTTGATGGAAATCATTCTAAAACATTGTCATGAAATGCATTCTCATCTCAGAAAACACTTCGGAGTCCTTACAGTTTTTTCAAACAACTTATTGAGCTCATTTT
GAGTTATCTTATGCACTCTTTCTGTGCCATATTACTGGACTCCTCCCAAGAAGTGAGCGGGCTGGATCAAGAGGCTTCAAATTTTGGTGGATTTGTAATACATTTAGTGATATGCATTGGCAATGTTTGGGTGAACTCTGTAATAAAAAGAGTTTAGTGTAATCTCAAACTTGTGACATTCTTAATGGGATATATATCCA
GTTCCTGTTATCTTGCAGATGGTTTCCTCGTTACCAATTAATTTATTCTTGTGTATTGTTCACAAATAGGAACTGCGATTCTTACATGTTAGACATGTTTAACTGTCTTTTACAAATTTTCCAGTGAGAGCTGGGTTGAACACTTGGTATTTTGTTATTTGCCAGACAGTGCCACAACACTGTTGTTATATGAAACGACC
ATATTTGATTCATATTACCAAATATTCAAGTTGACAAAGAAACTTGTTTAAACTGTCACTGCAGTTCAGTTTGGTGTCCTATTCTAGATTTAATGATTATGTGACAGTTACTGTAGTCACACTAATCCTACTTATATTAGAGTTAATGTAGTCACCAGGATATAAAAGCC
Intron 2 GTTGATTTCT ... GGATTTGGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 42.48 | 130 | 96 | 67.3 |
| A2 | 39.66 | 108 | 71 | 51 |
| A3 | 47.01 | 156.7 | 139 | 70.3 |
| A4 | 43.5 | 137.7 | 106 | 59 |
| A5 | 44.91 | 83 | 67.7 | 36.7 |
| A6 | 35.75 | 133 | 74 | 46 |
| A7 | 43.44 | 271.7 | 208.7 | 93.3 |
| A8 | 40.65 | 92 | 63 | 35.7 |
| A9 | 43.71 | 204.3 | 158.7 | 84.3 |
| A10 | 42.8 | 261 | 195.3 | 112.3 |
>TRINITY_DN47029_c0_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoformCTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGCGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCGCCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCCCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTC
TGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATTGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTC
CGAAGAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCA
AGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCTCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACG
GTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGTATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTG
ATATGATGCATGAACTGAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGCAGACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATCCTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATCGACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTATTTGAAGTTGAAATGGCAC
GTGCCATGTGGACCAAATAGTGTCATCACTTTTCCTAGTGTTCCTTGGATGAAGCCATGGTACTGGTGGTCATGGCCAGTTTTGCCCTTGGGGCTCTCTTGGCATGAGCAGAGGCGCCAGACAATAGGGTATGGTGCAGAGATTCCCCTCGTTCTAGCTGAGTCACTGTTTTACTTGGTCACTCTGGCTCTGTCAATGAT
TGCTTGTAGGGGCTCCCAAACTGCTTCATCTAAGTTTTGCCTCTTGAAATCGGAGCAGGGTTTCTCGTTCTATTCTATTGTTCCCAAGCTTTTGGTTCTATTTAGTATGGTGGCAAGTTACTTGCTCCCATTTTTGCTTGTTCCAAGAACAATTAATCCTCTGATCGGTTGGGGGATTTATTTACTGGGTTCCATGTCAA
CTGGGGTTCTCGTTGTAAATGCCTTCCAGCTCCCAGTTTTGCCTGTGTTTACCCCTTGGTTGGGTATATTCGGGGTTCTTCTTGTCATGGCCTTTCCTCTTTATACCAATGGCATAGTAAGAGCAATAGCAGTAGGAGCATATGCCGCTCTGGCTGCTCCCTTTGCATGGTGGGCTTTTGGAAAAGCATTGTCAACATTG
TCAAGATCTGAGCCACAGTTTCAACTCACCAAAATCTGTTGATGGAAATCATTCTAAAACATTGTCATGAAATGCATTCTCATCTCAGAAAACACTTCGGAGTCCTTACAGTTTTTTCAAACAACTTATTGAGCTCATTTTGAGTTATCTTATGCACTCTTTCTGTGCCATATTACTGGACTCCTCCCAAGAAGTGAGCG
GGCTGGATCAAGAGGCTTCAAATTTTGGTGGATTTGTAATACATTTAGTGATATGCATTGGCAATGTTTGGGTGAACTCTGTAATAAAAAGAGTTTAGTGTAATCTCAAACTTGTGACATTCTTAATGGGATATATATCCAGTTCCTGTTATCTTGCAGATGGTTTCCTCGTTACCAATTAATTTATTCTTGTGTATTGT
TCACAAATAGGAACTGCGATTCTTACATGTTAGACATGTTTAACTGTCTTTTACAAATTTTCCAGTGAGAGCTGGGTTGAACACTTGGTATTTTGTTATTTGCCAGACAGTGCCACAACACTGTTGTTATATGAAACGACCATATTTGATTCATATTACCAAATATTCAAGTTGACAAAGAAACTTGTTTAAACTGTCAC
TGCAGTTCAGTTTGGTGTCCTATTCTAGATTTAATGATTATGTGACAGTTACTGTAGTCACACTAATCCTACTTATATTAGAGTTAATGTAGTCACCAGGATATAAAAGCC
>TRINITY_DN47029_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:CTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGCGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCGCCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCCCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTC
TGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATTGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTC
CGAAGgttgatttctttgctttgaatgttttttgactagatcaaaacctcgcttgccaggatttggagAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTT
Intron 3 GTTGATTTCT ... TCTACTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 49.81 | 130 | 147 | 111 |
| A2 | 44.04 | 108 | 95 | 75 |
| A3 | 47.47 | 157.7 | 181 | 104 |
| A4 | 49.57 | 136.6 | 145 | 123.4 |
| A5 | 48.01 | 83.8 | 103.8 | 51 |
| A6 | 40.03 | 133 | 102 | 75.6 |
| A7 | 43.75 | 271.4 | 284.5 | 137.6 |
| A8 | 45.35 | 91.6 | 89 | 63 |
| A9 | 44.58 | 204.1 | 202.8 | 125.6 |
| A10 | 43.92 | 260.2 | 254.3 | 153.4 |
>TRINITY_DN127109_c0_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCTCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTCTGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATT
GCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTCCGAAGAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCT
ATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCTCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGC
AGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGTATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTT
TTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGGTATGCTATTTCGTTTCTTCTTTTCCTTTGACAGCTGGCTAAAATGGCAAGATCCTCC
>TRINITY_DN127109_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCTCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTCTGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATT
GCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTCCGAAGgttgatttctttgctttgaatgttttttgactagatcaaaacctcgcttgccaggatttggaggtatcggaaattcggcgtgatgacatgcatcaggtttt
gtttgttaagtttgtatatggcgtcgttagagctccgatactgagattaactttgactctgtcaagaactgtgaggtttttgtcagattatggttaatacagtgcacatataacgccttccctatttcggcaaagtttgagctgcgtttagtgaacactcacgttttctgacatgtcagcattctgaatttgccgaaaag
actttggccaggcgtccttttgatgcatctcgtagccttttaagctttcctcggtgttataatctttcatggccaggaatgggagatttgaggttcaaatctcatcaagtcccttttcctggtggcttagtgcaaaattgcattaaagattgagaaaataacctacagatttactttattaaactggatacaaatcccgt
atcccggagctagttggccgtgttaaatttcgtctggtctctgccttttgttctttaacgtttggatagtagcgatgcaatcttttctagtgaacggaagcagaaacttatatacagtttaaaccttaactgcattctgattctcttttctacttcagAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACAC
AGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCT
CATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGT
ATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTATTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTGATATGATGCATGAACTGAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGCA
GACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATCCTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATCGACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTGTAAGTATATACTGTTTAAACTTTAAATCAATACCTTTAATTATATTCTAATCATTAAGGTCTTCCA
TATCAGGGTTTTAGCTTTCTCCACCTATAGTAAAATCCACAGTTCTGTGTTTCACTTGTTAATTTCTCATGTCGGATCTACCTTATGTACACAAGGATCTTGATTTAGTCATCATATTACAG
Intron 4 GTATGGATGC ... CAAGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.14 | 111 | 34.1 | 28 |
| A2 | 16.5 | 86 | 30.3 | 17 |
| A3 | 18.68 | 96 | 32.9 | 22.1 |
| A4 | 22.22 | 77 | 27.6 | 22 |
| A5 | 33.33 | 46 | 13.1 | 23 |
| A6 | 21.85 | 354 | 117.5 | 99 |
| A7 | 19.27 | 465.1 | 129.8 | 111 |
| A8 | 22.64 | 393 | 108.3 | 115 |
| A9 | 20.35 | 366.1 | 136.2 | 93.5 |
| A10 | 17.82 | 355 | 125.1 | 77 |
>TRINITY_DN115469_c0_g1_i5 from sample A3 / Example spliced isoformGCCTCCTAAGGCTCCTATAAACGTTTTCTGGGCAACCATGTAGATATTTAGGTCTTGTATTATTTGAAGTTGTTGAACTATTTCTCTTCAATCCACTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGGGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCG
CCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCTCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTCTGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACAT
TGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTCCGAAGGTTGATTTCTTTGCTTTGAATGTTTTTTGACTAGATCAAAACCTCGCTTGCCAGGATTTGGAGGTATCGGAAATTCGGCGTGATGACATGCATCAGGTTT
TGTTTGTTAAGTTTGTATATGGCGTCGTTAGAGCTCCGATACTGAGATTAACTTTGACTCTGTCAAGAACTGTGAGGTTTTTGTCAGATTATGGTTAATACAGTGCACATATAACGCCTTCCCTATTTCGGCAAAGTTTGAGCTGCGTTTAGTGAACACTCCCGTTTTCTGACATGTCAGCATTCTGAATTTGCCGAAAA
GACTTTGGCCAGGCGTCCTTTTGATGCATCTCGTAGCCTTTTAAGCTTTCCTCGGTGTTATAATCTTTCATGGCCAGGAATGGGAGATTTGAGGTTCAAATCTCATCAAGTCCCTTTTCCTGGTGGCTTAGTGCAAAATTGCATTAAAGATTGAGAAAATAACCTACAGATTTACTTTATTAAACTGGATACAAATCCCG
TATCCCGGAGCTAGTTGGCCGTGTTAAATTTCGTCTGGTCTCTGCCTTTTGTTCTTTAACGTTTGGATAGTAGCGATGCAATCTTTTCTAGTGAACGGAAGCAGAAACTTATATACAGTTTAAACCTTAACTGCATTCTGATTCTCTTTTCTACTTCAGAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACA
CAGAATGGACCGAGAATCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTC
TCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAG
TATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTGATATGATGCATGAACTGAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGC
AGACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATCCTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATCGACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTATTTGAAGTTGAAATGGCACGTGCCATGTGGACCAAATAGTGTCATCACTTTTCCTAGTGTTCCTT
GGATGAAGCCATGGTACTGGTGGTCATGGCCAGTTTTGCCCTTGGGGCTCTCTTGGCATGAGCAGAGGCGCCAGACAATAGGGTATGGTGCAGAGATTCCCCTCGTTCTAGCTGAGTCACTGTTTTACTTGGTCACTCTGGCTCTGTCAATGATTGCTTGTAGGGGCTCCCAAACTGCTTCATCTAAGTTTTGCCTCTTG
AAATCGGAGCAGGGTTTCTCGTTCTATTCTATTGTTCCCAAGCTTTTGGTTCTATTTAGTATGGTGGCAAGTTACTTGCTCCCATTTTTGCTTGTTCCAAGAACAATTAATCCTCTGATCGGTTGGGGGATTTATTTACTGGGTTCCATGTCAACTGGGGTTCTCGTTGTAAATGCCTTCCAGCTCCCAGTTTTGCCTGT
GTTTACCCCTTGGTTGGGTATATTCGGGGTTCTTCTTGTCATGGCCTTTCCTCTTTATACCAATGGCATAGTAAGAGCAATAGCAGTAGGAGCATATGCCGCTCTGGCTGCTCCCTTTGCATGGTGGGCTTTTGGAAAAGCATTGTCAACATTGTCAAGATCTGAGCCACAGTTTCAACTCACCAAAATCTGTTGATGGA
AATCATTCTAAAACATTGTCATGAAATGCATTCTCATCTCAGAAAACACTTCGGAGTCCTTACAGTTTTTTCAAACAACTTATTGAGCTCATTTTGAGTTATCTTATGCACTCTTTCTGTGCCATATTACTGGACTCCTCCCAAGAAGTGAGCGGGCTGGATCAAGAGGCTTCAAATTTTGGTGGATTTGTAATACATTT
AGTGATATGCATTGGCAATGTTTGGGTGAACTCTGTAATAAAAAGAGTTTAGTGTAATCTCAAACTTGTGACATTCTTAATGGGATATATATCCAGTTCCTGTTATCTTGCAGATGGTTTCCTCGTTACCAATTAATTTATTCTTGTGTATTGTTCACAAATAGGAACTGCGATTCTTACATGTTAGACATGTTTAACTG
TCTTTTACAAATTTTCCAGTGAGAGCTGGG
>TRINITY_DN115469_c0_g1_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:GCCTCCTAAGGCTCCTATAAACGTTTTCTGGGCAACCATGTAGATATTTAGGTCTTGTATTATTTGAAGTTGTTGAACTATTTCTCTTCAATCCACTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGGGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCG
CCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCTCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTCTGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACAT
TGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTCCGAAGGTTGATTTCTTTGCTTTGAATGTTTTTTGACTAGATCAAAACCTCGCTTGCCAGGATTTGGAGGTATCGGAAATTCGGCGTGATGACATGCATCAGGTTT
TGTTTGTTAAGTTTGTATATGGCGTCGTTAGAGCTCCGATACTGAGATTAACTTTGACTCTGTCAAGAACTGTGAGGTTTTTGTCAGATTATGGTTAATACAGTGCACATATAACGCCTTCCCTATTTCGGCAAAGTTTGAGCTGCGTTTAGTGAACACTCCCGTTTTCTGACATGTCAGCATTCTGAATTTGCCGAAAA
GACTTTGGCCAGGCGTCCTTTTGATGCATCTCGTAGCCTTTTAAGCTTTCCTCGGTGTTATAATCTTTCATGGCCAGGAATGGGAGATTTGAGGTTCAAATCTCATCAAGTCCCTTTTCCTGGTGGCTTAGTGCAAAATTGCATTAAAGATTGAGAAAATAACCTACAGATTTACTTTATTAAACTGGATACAAATCCCG
TATCCCGGAGCTAGTTGGCCGTGTTAAATTTCGTCTGGTCTCTGCCTTTTGTTCTTTAACGTTTGGATAGTAGCGATGCAATCTTTTCTAGTGAACGGAAGCAGAAACTTATATACAGTTTAAACCTTAACTGCATTCTGATTCTCTTTTCTACTTCAGAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACA
CAGAATGGACCGAGAATCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTC
TCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAG
TATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTGATATGATGCATGAACTGAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGC
AGACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATCCTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATCGACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTATTTGAAGTTGAAATGGCACGTGCCATGTGGACCAAATAGTGTCATCACTTTTCCTAGTGTTCCTT
GGATGAAGCCATGGTACTGGTGGTCATGGCCAGTTTTGCCCTTGGGGCTCTCTTGGCATGAGCAGAGGCGCCAGACAATAGGgtatggatgctttcttccttgctgtattgaaccatcttgttatttgagtatggagaccttattcttctaaccaacaagatccttgcaagttgcagGTATGGTGCAGAGATTCCCCTCG
TTCTAGCTGAGTCACTGTTTTACTTGGTCACTCTGGCTCTGTCAATGATTGCTTGTAGGGGCTCCCAAACTGCTTCATCTAAGTTTTGCCTCTTGAAATCGGAGCAGGGTTTCTCGTTCTATTCTATTGTTCCCAAGCTTTTGGTTCTATTTAGTATGGTGGCAAGTTACTTGCTCCCATTTTTGCTTGTTCCAAGAACA
ATTAATCCTCTGATCGGTTGGGGGATTTATTTACTGGGTTCCATGTCAACTGGGGTTCTCGTTGTAAATGCCTTCCAGCTCCCAGTTTTGCCTGTGTTTACCCCTTGGTTGGGTATATTCGGGGTTCTTCTTGTCATGGCCTTTCCTCTTTATACCAATGGCATAGTAAGAGCAATAGCAGTAGGAGCATATGCCGCTCT
GGCTGCTCCCTTTGCATGGTGGGCTTTTGGAAAAGCATTGTCAACATTGTCAAGATCTGAGCCACAGTTTCAACTCACCAAAATCTGTTGATGGAAATCATTCTAAAACATTGTCATGAAATGCATTCTCATCTCAGAAAACACTTCGGAGTCCTTACAGTTTTTTCAAACAACTTATTGAGCTCATTTTGAGTTATCTT
ATGCACTCTTTCTGTGCCATATTACTGGACTCCTCCCAAGAAGTGAGCGGGCTGGATCAAGAGGCTTCAAATTTTGGTGGATTTGTAATACATTTAGTGATATGCATTGGCAATGTTTGGGTGAACTCTGTAATAAAAAGAGTTTAGTGTAATCTCAAACTTGTGACATTCTTAATGGGATATATATCCAGTTCCTGTTA
TCTTGCAGATGGTTTCCTCGTTACCAATTAATTTATTCTTGTGTATTGTTCACAAATAGGAACTGCGATTCTTACATGTTAGACATGTTTAACTGTCTTTTACAAATTTTCCAGTGAGAGCTGGG
Intron 5 GTTGATTTCT ... TCTACTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 49.51 | 130 | 144 | 111 |
| A2 | 43.75 | 108 | 93 | 75 |
| A3 | 47.74 | 156 | 181 | 104 |
| A4 | 49.26 | 138 | 145 | 123 |
| A5 | 48.29 | 83 | 104 | 51 |
| A6 | 40.09 | 133 | 102 | 76 |
| A7 | 43.63 | 272 | 283 | 138 |
| A8 | 45.24 | 92 | 89 | 63 |
| A9 | 44.52 | 205 | 203 | 126 |
| A10 | 43.81 | 261 | 254 | 153 |
>TRINITY_DN47029_c0_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoformCTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGCGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCGCCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCCCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTC
TGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATTGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTC
CGAAGAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCA
AGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCTCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACG
GTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGTATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTG
ATATGATGCATGAACTGAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGCAGACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATCCTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATCGACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTATTTGAAGTTGAAATGGCAC
GTGCCATGTGGACCAAATAGTGTCATCACTTTTCCTAGTGTTCCTTGGATGAAGCCATGGTACTGGTGGTCATGGCCAGTTTTGCCCTTGGGGCTCTCTTGGCATGAGCAGAGGCGCCAGACAATAGGGTATGGTGCAGAGATTCCCCTCGTTCTAGCTGAGTCACTGTTTTACTTGGTCACTCTGGCTCTGTCAATGAT
TGCTTGTAGGGGCTCCCAAACTGCTTCATCTAAGTTTTGCCTCTTGAAATCGGAGCAGGGTTTCTCGTTCTATTCTATTGTTCCCAAGCTTTTGGTTCTATTTAGTATGGTGGCAAGTTACTTGCTCCCATTTTTGCTTGTTCCAAGAACAATTAATCCTCTGATCGGTTGGGGGATTTATTTACTGGGTTCCATGTCAA
CTGGGGTTCTCGTTGTAAATGCCTTCCAGCTCCCAGTTTTGCCTGTGTTTACCCCTTGGTTGGGTATATTCGGGGTTCTTCTTGTCATGGCCTTTCCTCTTTATACCAATGGCATAGTAAGAGCAATAGCAGTAGGAGCATATGCCGCTCTGGCTGCTCCCTTTGCATGGTGGGCTTTTGGAAAAGCATTGTCAACATTG
TCAAGATCTGAGCCACAGTTTCAACTCACCAAAATCTGTTGATGGAAATCATTCTAAAACATTGTCATGAAATGCATTCTCATCTCAGAAAACACTTCGGAGTCCTTACAGTTTTTTCAAACAACTTATTGAGCTCATTTTGAGTTATCTTATGCACTCTTTCTGTGCCATATTACTGGACTCCTCCCAAGAAGTGAGCG
GGCTGGATCAAGAGGCTTCAAATTTTGGTGGATTTGTAATACATTTAGTGATATGCATTGGCAATGTTTGGGTGAACTCTGTAATAAAAAGAGTTTAGTGTAATCTCAAACTTGTGACATTCTTAATGGGATATATATCCAGTTCCTGTTATCTTGCAGATGGTTTCCTCGTTACCAATTAATTTATTCTTGTGTATTGT
TCACAAATAGGAACTGCGATTCTTACATGTTAGACATGTTTAACTGTCTTTTACAAATTTTCCAGTGAGAGCTGGGTTGAACACTTGGTATTTTGTTATTTGCCAGACAGTGCCACAACACTGTTGTTATATGAAACGACCATATTTGATTCATATTACCAAATATTCAAGTTGACAAAGAAACTTGTTTAAACTGTCAC
TGCAGTTCAGTTTGGTGTCCTATTCTAGATTTAATGATTATGTGACAGTTACTGTAGTCACACTAATCCTACTTATATTAGAGTTAATGTAGTCACCAGGATATAAAAGCC
>TRINITY_DN47029_c0_g1_i8 from sample A7 / Example unspliced isoform:CTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGGTAACATGCGATTTGCTTTCTTAAAATAGTCGTTAATGAATTATCAATTTATGAGGTTTCGCCATCGAACCACACGGCGGTTTTCTGAATATTCCCTTTATCTCTCGCAAGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTC
TGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATTGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTC
CGAAGgttgatttctttgctttgatgtttttttgactagatcaaaacctcgcttaacaggatttggaggtatcggaaattcggcgtgatgacatgcatcagattttgtatgttaagtttgtatatggcgtcgttagaactccgatactgagattaaccttgactctgtcaagaactgtgaggtttttgtcagattatggt
taatacagtgcacatataacgccttccctatttcggcaaagtttgagctgcgtttagtgaacactcccgttttctgacatgtcagcattctgaatttgccgaaaagactttggccaggtgtctttttgatgcatctcgtagccttttaagctttcctcggtgttataatctttcatggccaggaatgggagatttgaggt
tcaaatctcatcaagtcccttttcctgacggctctagtgcaaaattgcattaaagattgagaaaataacctacagatttactttattaaactggatacaaatcccgtatcccggagctagttggccgtgttaaatttcgtctggtctctaccctttgctctttaacgtttggatagtagcgatgcaatcttttctagtga
acggaagcagaaacttatatacagtttaaaccttaactgcattctgattctcttttctacttcagAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAACCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTG
GCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCTCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTAT
AGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGTATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTA
ATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGGTATGCTATTTCGTTTCTTCTTTTCCTTTGACAGCTGGCTAGAATGGCAAGATCCTCCCCTGGTTGAAAAACACTCCTGAAAGCATCGGCATCTTGGTTACTTGAAAATGAATAGCAAATTGTTTTCTGAAACCCTTGTCGGATGTGCCGTCATCTGTGTTT
AAATTGTCATAGCTGTCCCTGAATGTGGTTTTTT
Intron 6 GTAACATGGG ... CTCTCGCAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 58.33 | 20 | 0 | 28 |
| A2 | 60 | 10 | 0 | 15 |
| A3 | 64.91 | 20 | 6 | 37 |
| A4 | 70 | 12 | 0 | 28 |
| A5 | 69.7 | 10 | 0 | 23 |
| A6 | 66.67 | 12 | 0 | 24 |
| A7 | 66.29 | 30 | 1 | 59 |
| A8 | 60 | 6 | 0 | 9 |
| A9 | 64.18 | 24 | 0 | 43 |
| A10 | 67.19 | 21 | 0 | 43 |
>TRINITY_DN115469_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoformGCCTCCTAAGGCTCCTATAAACGTTTTCTGGGCAACCATGTAGATATTTAGGTCTTGTATTATTTGAAGTTGTTGAACTATTTCTCTTCAATCCACTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTCTGGGGCTCTCGGAAGT
GGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACATTGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTCCGAAGAGCTGTAGCAG
AAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAATCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGCTATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCT
ATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCTCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCGCAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTG
AATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGTATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCTTTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTGATATGATGCATGAACT
GAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGCAGACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATCCTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATCGACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTATTTGAAGTTGAAATGGCACGTGCCATGTGGACCAA
ATAGTGTCATCACTTTTCCTAGTGTTCCTTGGATGAAGCCATGGTACTGGTGGTCATGGCCAGTTTTGCCCTTGGGGCTCTCTTGGCATGAGCAGAGGCGCCAGACAATAGGGTATGG
>TRINITY_DN115469_c0_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:GCCTCCTAAGGCTCCTATAAACGTTTTCTGGGCAACCATGTAGATATTTAGGTCTTGTATTATTTGAAGTTGTTGAACTATTTCTCTTCAATCCACTTAAGAGCTACGTCTGGCGTCCGTAACGGAAGAAGCAAGCTCGgtaacatgggatttgctttcttaaaatagtcgttaatgaattatcaatttatgaggtttcg
ccatcgaaccacacggcggttttctgaatattctctttatctctcgcaagTGGTTAGGACACGAGAATTCTTATAGACAAATGACATCACGTCTCTGGGGCTCTCGGAAGTGGCCGGTCGCTGGTTCGAAACCTTGCAAAGCCATGTGGAGATAGTCTACTGACTTGACGGTACCGTCTGACTCGTCGGTCCAACCACAT
TGCTATGCATCTTCCTTCCTGGAGACGGAAAAGGCCGCCAAAGATCGCCTCAGGGATGCCGATGGCTTGCGCATTGTAGGCCGTTGGAAGGAGTCCGAAGAGCTGTAGCAGAAGGATCTCTGTTTCAGAGAAGCAAGGACACAGAATGGACCGAGAATCCCTTCAAACTCAACGGTTTTTCTTGTTCCTCTGCTTTTTGC
TATTAATTTGTCCGCTGGCTGTGCATGGGGCGTTGGCGCCTACGAAGCGGAGCTCAAAAAATGCATATGCTACAATGATGTACATGGGGACGCCAAGAGACTATGAATTCTATGTTGCTATCAGGGTTATGCTTCGATCTCTCATTCGCCTGAAAGTGGATGCAGACCTTGTTGTTATTGCTTCAAAGGATGTTCCTCCG
CAGTGGATAAGGACTCTACAGATAGATGGGGTTATAGTTAAACCTGTGGACAACATAGAGAATCCTTACAGAAACCAGCCTGGATTCAACAAACGGTTTACTCTAACACTGAATAAGCTGTATGCGTGGACACTTGTGGAGTATGATCGCATTGTCATGCTTGATGCAGACAATCTTTTCTTGCAGAATGCGGATGAGCT
TTTTCAGTGTGGGCAGTTCTGTGCTGCCTTCATTAATCCCTGTATTTTCCATACTGGGCTTTTTGTGTTACAGCCCTCAGTGGATGTGTTCCGTGATATGATGCATGAACTGAAATCATTAAGAAAAAACAGAGATGGTGCAGACCAAGGATTTCTGGTTTCATATTTTAGTGACTTGCTTGACAGTCCGATGTTTTATC
CTCCTGCCAATGGGTCTAAACTAAATGGAATCTATCGACTTCCTTTGGGATATCAGATGGATGCTTCTTATTTCTATTTGAAGTTGAAATGGCACGTGCCATGTGGACCAAATAGTGTCATCACTTTTCCTAGTGTTCCTTGGATGAAGCCATGGTACTGGTGGTCATGGCCAGTTTTGCCCTTGGGGCTCTCTTGGCAT
GAGCAGAGGCGCCAGACAATAGGGTATGG