NA ----> NA

Intron 1 GTAATGATTT ... ATTTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50	6	6	1
A2	47.06	9	8	2
A3	22.22	7	2	0
A4	60	6	9	3
A5	47.62	11	10	1
A6	42.67	129	96	0
A7	45.19	114	94	1
A8	43.17	154	117	0
A9	42.65	117	87	1
A10	44.17	91	72	0

>TRINITY_DN103890_c1_g3_i3 from sample A4 / Example spliced isoform

CCTCTGTGGTGGTTTGTTTGTCTGTGTGCGGTTAGATGGTCCGTTTGTTTCTGTGTGGTTTGTTTGTCTATGGTCTGTGTGTTTGTTTGTGTCTTTGTCATTTTCCCGTTAAAGTTTTAAGAGTCTTTGTATTTTATGGAAGCGCTTCCTCTGTGGTGGTTTGTTTGTCTGTGTGCGGTTAGATGGTCCGTTTGTTTCTG
TGTGGTTTGTTTGTCTATGGTCTGTGTGTTTGTTTGTGTCTTTGTTGTGTGTGTGACAAAGGAGGTTATCTTTTTCAAATTTGAATTTGATATTCGAAGCAGGAATTAAAGATGCTGTGGAAGAAGCAGCAGGAATTTGAATTGAATTTCGAAGCAGGAATTAAAGATGTTGTGGAAGAAGCAGGAATTTGAATTTTGAA
GCAGGAGGAAGCGATTAGATTCTGATCATCCCCCAATTCAAAGAAAGGGCAGCTGAGCAACTCAATCGTCACTGCTCTCTCAATAATGGCTGCTATAAATTCCAGAGATCAAACATCTTTTAAACTTTGATTTAACAGATGGTTTGAATTGGGATTCTATTGGTGTGTAACTTCTAAGAATGCTAATGAATAAAGAGAGA
GGTATCAAGCATTCTTTAAACATTGATTCAATACTAGTTACA

>TRINITY_DN103890_c1_g3_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:

CCTCTGTGGTGGTTTGTTTGTCTGTGTGCGGTTAGATGGTCCGTTTGTTTCTGTGTGGTTTGTTTGTCTATGGTCTGTGTGTTTGTTTGTGTCTTTGTCATTTTCCCGTTAAAGTTTTAAGAGTCTTTGTATTTTATGGAAGCGCTTCCTCTGTGGTGGTTTGTTTGTCTGTGTGCGGTTAGATGGTCCGTTTGTTTCTG
TGTGGTTTGTTTGTCTATGGTCTGTGTGTTTGTTTGTGTCTTTGTTGTGTGTGTGACAAAGGAGGTTATCTTTTTCAAATTTGAATTTGATATTCGAAGCAGGAATTAAAGATGCTGTGGAAGAAGCAGCAGGAATTTGAATTGAATTTCGAAGCAGGAATTAAAGATGTTGTGGAAGAAGCAGGAATTTGAATTTTGAA
GCAGGAGGAAGCGATTAGATTCTGATCATCCCCCAATTCAAAGAAAGGGCAGCTGAGCAACTCAATCGTCACTGCTCTCTCAATAATGGCTGCTATAAATTCCAGAGATCAAACATCTTTTAAACTTTGATTTAACAGATGGTTTGAATTGGGATTCTATTGGTGTGTAACTTCTAAGAATGCTAATGAATAAAGAGAGA
GgtaatgatttttatctttttcatatttttatttaaagtaacatttaaataaggatgtatctcatatttgttttggtttgttattttttcagGTATCAAGCATTCTTTAAACATTGATTCAATACTAGTTACA