sp|Q9SMQ4|SRK2F_ARATH ----> Serine/threonine-protein kinase SRK2F


Intron 1 GTTAGAAATT ... TGTTATGCAG

Found issues: Low number of reads   


SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A10200
A250202
A3-1000
A444.44504
A5-1000
A6100002
A760203
A833.33201
A9-1000
A1010901



>TRINITY_DN42688_c0_g4_i1 from sample A8 / Example spliced isoform
AGAGGTTCGTATATTTTATTACTGTTATTGGGGACGAACTGTATCTGATTCGCTTGAACACGGTGGCCCCGTTCTATCAGAGCGTGGATCAGAATTCATACCAAGTAATTACTAACCAGCCTCGCTCAGTCTTAGTAGACCATCCACAAGAGCCCCAAAAGGAGAGTTTAAAGAAATATCTCTAGCCCTAAAAAATACCC
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GCATATTACTCAGGTTTAAGATCACAGGTTCGCATATTACTAAATAAATTAGAGGCTGCAGAGTGATATACAGAGGATATACATGATGCCATTTCATGCATGGTTGGCTCGACAGATTGCAACCATCCGGTGCAATTTCAATACGGATGTAAAAGAAGAGTTCAAAGAAATATCTCTAGCCCTTAAAAAATACCTAAACT
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>TRINITY_DN42688_c0_g4_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:
AGAAGAGTTTAAAGgttagaaattatagatctgatttgttcatccgaacgacttacattatcaggaaattggttaagatgtttttattatttttatttttatgttatgcagAGGAGCGATCATACCAAGATCGGGGTATAGATCCCAGGGTTTAAGTCATCATCCCCCTGTTGCTCAAAACCATATAGATACACTATAGA
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TACCCCGACGGAATTGATGGGTGAACCCCAGCTGGGAATCCATTTAAAAGCTGAAGGATCTGGATTCGTATGGATTGCTTAATTCCGATCTACATAATTCTTTATCAAACTAGATTGTCAGGCTTTACACGCGGCGATCTCTCTGGAGGGGCGTAGTTGTTTAAGCAGGCAGAGATTGATCACAGGTTTGCATATTACTC
AGGTTTAAGATCACAGGTTCGCATATTACTAAATAAATTAGAGGCTGCAGAGTGATATACAGAGGATATACATGATGCCATTTCATGCATGGTTGGCTCGACAGATTGCAACCATCCGGTGCAATTTCAATACGGATGTAAAAGAAGAGTTCAAAGAAATATCTCTAGCCCTTAAAAAATACCTAAACTATGCTCTTGAA
GAAAAAATCATTAACTTATGTAATCCACATGTAGGAAGAATCTCAAGTTTGAAGAATCTCAGGTTTGAGATGATCACAGGTTCGCAT