NA ----> NA

Intron 1 GTAAGTCCTC ... GAATGCTAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	5.29	36.8	1	3
A2	2.11	23.5	1	0
A3	2.92	35	0	2
A4	0	14.8	0	0
A5	0	5	0	0
A6	0	16.5	0	0
A7	0	49.5	0	0
A8	0	25	0	0
A9	0	41.5	0	0
A10	0	22.3	0	0

>TRINITY_DN127645_c5_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

TACGTGAGAACTTTTTTTGTGATCCTCTCCACGGTGGAGCCTAACAACTATCATAACTCGTCCGCTCAGCTGGCTGTCCTCACTGCAGGGTTCTTTATTGCCATCCATGATTGAATGAAATAGTTCCTCTCGCCATTGCCTAAAATTCGACGCCCGCTTGATCAGGGTTTTATAATCTTGCAAACCATGGCGAGTGGTAA
GCGGTCGGATCCCAGCGGCCGACGTAGTCAGATTACCAGCGCATGCGACGAAGCGGAGGGAGCTCTCAAGCTTTTTCTTCAAGGAAAATTTGATGAAGCTGAAGCTTTCATTGAAGAAAGAGTAGAGACTAGAGACAAGGCTTTTAATGCTGTACCCATATTCAGTCATTGCCATGCTATTATTCTATTTGCAAAGGCAG
CAATCTCTGGCACAGAGGAAGACAGGAAGCAAGCCATGGATAAGCTACGTGAAGTAGCGAATATGGCAGCAGAACATATACCTAAACAAGGATGGGCTCAAAGCATAGCATCATGGGGCATAGGCTATTTCACATCAGCGCCAGGATGTAATGATGTCTCTGAAGAAGAACTAAGCTGTCAGATTATTGAGGCAGAGGCT
ACTTATTTGTCAGCATTACTTTGCTTTTTTGAAGAGTCAATGTCCTCCTTTTTTAAGGGTGCTTTGCTGATTCGGAAGGCAATAAGTGGATACAGGCGATGCAATGGTGTTCTTCAGCAGCAGACAATTGGAAGCAAGCATGAAGTTGGTGCCATAAAACTTGGTTTTGGTGGCTTTAGCCTTGTGATCTCCATGCTACC
CCCAAAGTTACTTCGTCTACTATCTGTTTTGGGTTTTCGTTGTGACCGGAAGGCTGGACTTAGTGATATTGAAGAAAGCCTTTGCAGTGGTGGGCTTCGATCTTCTGCTTCTGGCATGCTTCTTTTGTCGTACCATGTTATTTTACCAGCTTTTTTCTCTATCCCTCAAGAACGAGAACAACATATAGAATGTGCTGAGC
GAGTTCTGGCGACTTTAAATGAAATGTACCCAGGAAGCTTTTTTCTAAGCTATTATAAAGGCCGATTGCAAAGGTTGAAAAGGGACCTACCAGGGTCGATCGATTGGTTTATAAAACTTGAAGAGGGCTTAAGATTAACTCCCAACTCAAAGTTTTTCAAGATGCGGCATGCATGGTTGTATGAGCTTGGAGTGAGCTAC
ATGCTGGAGCTTGAATGGGAAGCTGCAGAGAAATATTGGGCAGAGCTAGAGAAAGACTGTGTCTGGTCACGCGCTTTCTTTGCATACATGCATGGTATCTGTCTATCTATGAATGGCAAAACTAACCTTGCTGCTGATCAGTTTGCCAAGGTTCCAGGGCTTTTGAGAGGGAAAATTTCTGGACGTGTTTTAGCCGAGGA
GCAATATGTCTCTAGGAAGGTGAAGGATTATGCTCTTGATACGTTAGAAGGAGTTAAAAGCATTCAAGCTCACATAAGTGGAGTAGAGTTTCTATACCTTTGGAATTCATTTCCACAGATGCCACATGACAAGTTGGAAAGAGTTGTTCAAATAATTGAAGAGGCAGAGACCATGTTAGCTGGATCAACATCTCGTTACA
CGAGGGACACTACAGGGCGTTTGCAATGGATGTTTGAAGATTCAGATGAAGAGGATGAAATCGAAATGCAAGATGATTATGCAGTTTGCAGTTTGATCAAAGGCACAGCCTTTCGAGAGCTAGGAAAACTGGATGCTGCTCATGAATGCCTTAATAATCTAAGAGAGGAGAGTTGCTATGTTGGGGCTGAGCTATTTGTG
TTTCCAATGGCTGCATATGAGCGTGCACTGCTTCTAATCAATAGGCATTTGAACGAAGTCTGTGCTATCTCTGAACAGACAACAAATTTTGACTTTTTGAAGCAGGCCCAGAAAGAGCTTGCGATTGCAGAGAAATTTAAGCAAGATTACAATTTTCTATGGCGTCTTTTGGGACGAGTACATGCAGCTCATGTAGCAAT
TCGACACCTTATGAGTGACGAGGGGAGTTCAAATGGCGAAACATCTATCAAGTATGATGATGAATGTAATGAGCAATGGAAAGACATTGAAGATGGACAACTTGCGAATGAGAACTTTGGCATTGATGATTTCTCTTTACTATCAATATGAATGATAGGCTTATGTTATGTATTATATGGATGTATTGGCTAGGTAGAAT
AAAGCTTCATTATGTGCTCTACCTAGTTGTGGATGTAACTTTCTAATAGTCATAAGGTAATATTATTTAAGCATGACAATGTAAGTGCATATCATTTGTGGAATCGATTAGGAATTTGTTTCTTACAAATATTAATTCTATTATTTGGTCTACTCAAACATGACCGGAGTGTATTCATTTTCATTGGTGCATGTGGCTAT
TGTGAAATGGGAATCTACACATGCTCGAATTGTATAATTGGTTGCTCTCAATAAACCACATGACCTATCAACTTCATGAT

>TRINITY_DN127645_c5_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGAGCTACATGCTGGAGCTTGAAgtaagtcctccaatacgctgtctttggttttcattgacattttcagttcaaagactgttatcaatttaatgtctatagataaaagctcttatggaactgatactcttacgcaatggcttcttttgaattattctatttgcacatttaaagaaataatctcacagtttcataagtttt
gtttattcttctttacacctttttttcttagggagagaatattcaactaaaagttattatttcttgaatgctaagTGGGAAGCTGCAGAGAAATATTGGGCAGAGCTAGAGAAAGACTGTGTCTGGTCACGCGCTTTCTTTGCATACATGCATGTTCCAGGGCTTTTGAGAGGGAAAATTTCTGGACGTGTTTTAGCCGA
GGAGCAATATGTCTCTAGGAAGGTGAAGGATTATGCTCTTGATACGTTAGAAGGAGTTAAAAGCATTCAAGCTCACATAAGTGGAGTAGAGTTTCTATACCTTTGGAATTCATTTCCACAGATGCCACATGACAAGTTGGAAAGAGTTGTTCAAATAATTGAAGAGGCAGAGACCATGTTAGCTGGATCAACATCTCGTT
ACACGAGGGACACTACAGGGCGTTTGCAATGGATGTTTGAAGATTCAGATGAAGAGGATGAAATCGAAATGCAAGATGATTATGCAGTTTGCAGTTTGATCAAAGGCACAGCCTTTCGAGAGCTAGGAAAACTGGATGCTGCTCATGAATGCCTTAATAATCTAAGAGAGGAGAGTTGCTATGTTGGGGCTGAGCTATTT
GTGTTTCCAATGGCTGCATATGAGCGTGCACTGCTTCTAATCAATAGGCATTTGAACGAAGTCTGTGCTATCTCTGAACAGACAACAAATTTTGACTTTTTGAAGCAGGCCCAGAAAGAGCTTGCGATTGCAGAGAAATTTAAGCAAGATTACAATTTTCTATGGCGTCTTTTGGGACGAGTACATGCAGCTCATGTAGC
AATTCGACACCTTATGAGTGACGAGGGGAGTTCAAATGGCGAAACATCTATCAAGTATGATGATGAATGTAATGAGCAATGGAAAGACATTGAAGATGGACAACTTGCGAATGAGAACTTTGGCATTGATGATTTCTCTTTACTATCAATATGAATGATAGGCTTATGTTATGTATTATATGGATGTATTGGCTAGGTAG
AATAAAGCTTCATTATGTGCTCTACCTAGTTGTGGATGTAACTTTCTAATAGTCATAAGGTAATATTATTTAAGCATGACAATGTAAGTGCATATCATTTGTGGAATCGATTAGGAATTTGTTTCTTACAAATATTAATTCTATTATTTGGTCTACTCAAACATGACCGGAGTGTATTCATTTTCATTGGTGCATGTGGC
TATTGTGAAATGGGAATCTACACATGCTCGAATTGTATAATTGGTTGCTCTCAATAAACCACATGACCTATCAACTTCATGAT

Intron 2 GTTCGAGTCG ... TCGATCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	86.76	7.3	37.7	57.9
A2	72.53	8	6.8	35.5
A3	74.93	19.2	44.5	70.2
A4	72.95	9.6	18.2	33.5
A5	67.36	8.8	9.8	26.5
A6	72.92	2	4	6.8
A7	61.21	18.4	18	39.8
A8	49.4	7	2	11.7
A9	78.9	7.3	23.6	30.9
A10	69.5	10	14	31.6

>TRINITY_DN127645_c5_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

TACGTGAGAACTTTTTTTGTGATCCTCTCCACGGTGGAGCCTAACAACTATCATAACTCGTCCGCTCAGCTGGCTGTCCTCACTGCAGGGTTCTTTATTGCCATCCATGATTGAATGAAATAGTTCCTCTCGCCATTGCCTAAAATTCGACGCCCGCTTGATCAGGGTTTTATAATCTTGCAAACCATGGCGAGTGGTAA
GCGGTCGGATCCCAGCGGCCGACGTAGTCAGATTACCAGCGCATGCGACGAAGCGGAGGGAGCTCTCAAGCTTTTTCTTCAAGGAAAATTTGATGAAGCTGAAGCTTTCATTGAAGAAAGAGTAGAGACTAGAGACAAGGCTTTTAATGCTGTACCCATATTCAGTCATTGCCATGCTATTATTCTATTTGCAAAGGCAG
CAATCTCTGGCACAGAGGAAGACAGGAAGCAAGCCATGGATAAGCTACGTGAAGTAGCGAATATGGCAGCAGAACATATACCTAAACAAGGATGGGCTCAAAGCATAGCATCATGGGGCATAGGCTATTTCACATCAGCGCCAGGATGTAATGATGTCTCTGAAGAAGAACTAAGCTGTCAGATTATTGAGGCAGAGGCT
ACTTATTTGTCAGCATTACTTTGCTTTTTTGAAGAGTCAATGTCCTCCTTTTTTAAGGGTGCTTTGCTGATTCGGAAGGCAATAAGTGGATACAGGCGATGCAATGGTGTTCTTCAGCAGCAGACAATTGGAAGCAAGCATGAAGTTGGTGCCATAAAACTTGGTTTTGGTGGCTTTAGCCTTGTGATCTCCATGCTACC
CCCAAAGTTACTTCGTCTACTATCTGTTTTGGGTTTTCGTTGTGACCGGAAGGCTGGACTTAGTGATATTGAAGAAAGCCTTTGCAGTGGTGGGCTTCGATCTTCTGCTTCTGGCATGCTTCTTTTGTCGTACCATGTTATTTTACCAGCTTTTTTCTCTATCCCTCAAGAACGAGAACAACATATAGAATGTGCTGAGC
GAGTTCTGGCGACTTTAAATGAAATGTACCCAGGAAGCTTTTTTCTAAGCTATTATAAAGGCCGATTGCAAAGGTTGAAAAGGGACCTACCAGGGTCGATCGATTGGTTTATAAAACTTGAAGAGGGCTTAAGATTAACTCCCAACTCAAAGTTTTTCAAGATGCGGCATGCATGGTTGTATGAGCTTGGAGTGAGCTAC
ATGCTGGAGCTTGAATGGGAAGCTGCAGAGAAATATTGGGCAGAGCTAGAGAAAGACTGTGTCTGGTCACGCGCTTTCTTTGCATACATGCATGGTATCTGTCTATCTATGAATGGCAAAACTAACCTTGCTGCTGATCAGTTTGCCAAGGTTCCAGGGCTTTTGAGAGGGAAAATTTCTGGACGTGTTTTAGCCGAGGA
GCAATATGTCTCTAGGAAGGTGAAGGATTATGCTCTTGATACGTTAGAAGGAGTTAAAAGCATTCAAGCTCACATAAGTGGAGTAGAGTTTCTATACCTTTGGAATTCATTTCCACAGATGCCACATGACAAGTTGGAAAGAGTTGTTCAAATAATTGAAGAGGCAGAGACCATGTTAGCTGGATCAACATCTCGTTACA
CGAGGGACACTACAGGGCGTTTGCAATGGATGTTTGAAGATTCAGATGAAGAGGATGAAATCGAAATGCAAGATGATTATGCAGTTTGCAGTTTGATCAAAGGCACAGCCTTTCGAGAGCTAGGAAAACTGGATGCTGCTCATGAATGCCTTAATAATCTAAGAGAGGAGAGTTGCTATGTTGGGGCTGAGCTATTTGTG
TTTCCAATGGCTGCATATGAGCGTGCACTGCTTCTAATCAATAGGCATTTGAACGAAGTCTGTGCTATCTCTGAACAGACAACAAATTTTGACTTTTTGAAGCAGGCCCAGAAAGAGCTTGCGATTGCAGAGAAATTTAAGCAAGATTACAATTTTCTATGGCGTCTTTTGGGACGAGTACATGCAGCTCATGTAGCAAT
TCGACACCTTATGAGTGACGAGGGGAGTTCAAATGGCGAAACATCTATCAAGTATGATGATGAATGTAATGAGCAATGGAAAGACATTGAAGATGGACAACTTGCGAATGAGAACTTTGGCATTGATGATTTCTCTTTACTATCAATATGAATGATAGGCTTATGTTATGTATTATATGGATGTATTGGCTAGGTAGAAT
AAAGCTTCATTATGTGCTCTACCTAGTTGTGGATGTAACTTTCTAATAGTCATAAGGTAATATTATTTAAGCATGACAATGTAAGTGCATATCATTTGTGGAATCGATTAGGAATTTGTTTCTTACAAATATTAATTCTATTATTTGGTCTACTCAAACATGACCGGAGTGTATTCATTTTCATTGGTGCATGTGGCTAT
TGTGAAATGGGAATCTACACATGCTCGAATTGTATAATTGGTTGCTCTCAATAAACCACATGACCTATCAACTTCATGAT

>TRINITY_DN127645_c5_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TACGTGAGAACTTTTTTTGTGATCCTCTCCACGGTGGAGCCTAACAACTATCATAACTCGTCCGCTCAGCTGGCTGTCCTCACTGCAGGGTTCTTTATTGCCATCCATGATTGAATGAAATAGTTCCTCTCGCCATTGCCTAAAATTCGACGCCCGCTTGATCAGGgttcgagtcgcctaggcacttgaaattttaatga
aacgtgctttaactgccatgttttaaagatttactagctcaaaagggacctgaactcggagccattttcgatctcagGTTTTATAATCTTGCAAACCATGGCGAGTGGTAAGCGGTCGGATCCCAGCGGCCGACGTAGTCAGATTACCAGCGCATGCGACGAAGCGGAGGGAGCTCTCAAGTAAGCAGTTCTATTGAATT
ATGTGCATTTTACGAGGTAACAGGCATGGTATGTTAACTGATGGATTCTCAGATCTTAAACTAAATATTTTAAAGCAATTCGATCCAATTCGATTTCAGCTTACGTCCTCGTGGCGGGAAAGTATGATTGAATGAACCAGGAGTTAAATTTCCCATTTAAAAAAAATTAGAAACAGTTCGTGCAGAGGATTAATCTTTTG
AAAGGCTGGAAATCCCTTACTGTTCTAAATCTTAAGCTGTCAGTATCATTACGCCTTTACGTTTTCTTTCATTTTTATTTGCGTGCCATGGTTATATGATCTATAAAGACGAAAATCATTTCGTGTAGA

Intron 3 GTAAGCCAGA ... ATCTTTATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.73	34	7	13
A2	26.32	21	5	10
A3	17.53	40	6	11
A4	19.05	17	6	2
A5	33.33	4	1	3
A6	29.03	11	7	2
A7	21.28	37	8	12
A8	19.44	29	8	6
A9	20	28	9	5
A10	18.52	33	10	5

>TRINITY_DN127645_c5_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

TACGTGAGAACTTTTTTTGTGATCCTCTCCACGGTGGAGCCTAACAACTATCATAACTCGTCCGCTCAGCTGGCTGTCCTCACTGCAGGGTTCTTTATTGCCATCCATGATTGAATGAAATAGTTCCTCTCGCCATTGCCTAAAATTCGACGCCCGCTTGATCAGGGTTTTATAATCTTGCAAACCATGGCGAGTGGTAA
GCGGTCGGATCCCAGCGGCCGACGTAGTCAGATTACCAGCGCATGCGACGAAGCGGAGGGAGCTCTCAAGCTTTTTCTTCAAGGAAAATTTGATGAAGCTGAAGCTTTCATTGAAGAAAGAGTAGAGACTAGAGACAAGGCTTTTAATGCTGTACCCATATTCAGTCATTGCCATGCTATTATTCTATTTGCAAAGGCAG
CAATCTCTGGCACAGAGGAAGACAGGAAGCAAGCCATGGATAAGCTACGTGAAGTAGCGAATATGGCAGCAGAACATATACCTAAACAAGGATGGGCTCAAAGCATAGCATCATGGGGCATAGGCTATTTCACATCAGCGCCAGGATGTAATGATGTCTCTGAAGAAGAACTAAGCTGTCAGATTATTGAGGCAGAGGCT
ACTTATTTGTCAGCATTACTTTGCTTTTTTGAAGAGTCAATGTCCTCCTTTTTTAAGGGTGCTTTGCTGATTCGGAAGGCAATAAGTGGATACAGGCGATGCAATGGTGTTCTTCAGCAGCAGACAATTGGAAGCAAGCATGAAGTTGGTGCCATAAAACTTGGTTTTGGTGGCTTTAGCCTTGTGATCTCCATGCTACC
CCCAAAGTTACTTCGTCTACTATCTGTTTTGGGTTTTCGTTGTGACCGGAAGGCTGGACTTAGTGATATTGAAGAAAGCCTTTGCAGTGGTGGGCTTCGATCTTCTGCTTCTGGCATGCTTCTTTTGTCGTACCATGTTATTTTACCAGCTTTTTTCTCTATCCCTCAAGAACGAGAACAACATATAGAATGTGCTGAGC
GAGTTCTGGCGACTTTAAATGAAATGTACCCAGGAAGCTTTTTTCTAAGCTATTATAAAGGCCGATTGCAAAGGTTGAAAAGGGACCTACCAGGGTCGATCGATTGGTTTATAAAACTTGAAGAGGGCTTAAGATTAACTCCCAACTCAAAGTTTTTCAAGATGCGGCATGCATGGTTGTATGAGCTTGGAGTGAGCTAC
ATGCTGGAGCTTGAATGGGAAGCTGCAGAGAAATATTGGGCAGAGCTAGAGAAAGACTGTGTCTGGTCACGCGCTTTCTTTGCATACATGCATGGTATCTGTCTATCTATGAATGGCAAAACTAACCTTGCTGCTGATCAGTTTGCCAAGGTTCCAGGGCTTTTGAGAGGGAAAATTTCTGGACGTGTTTTAGCCGAGGA
GCAATATGTCTCTAGGAAGGTGAAGGATTATGCTCTTGATACGTTAGAAGGAGTTAAAAGCATTCAAGCTCACATAAGTGGAGTAGAGTTTCTATACCTTTGGAATTCATTTCCACAGATGCCACATGACAAGTTGGAAAGAGTTGTTCAAATAATTGAAGAGGCAGAGACCATGTTAGCTGGATCAACATCTCGTTACA
CGAGGGACACTACAGGGCGTTTGCAATGGATGTTTGAAGATTCAGATGAAGAGGATGAAATCGAAATGCAAGATGATTATGCAGTTTGCAGTTTGATCAAAGGCACAGCCTTTCGAGAGCTAGGAAAACTGGATGCTGCTCATGAATGCCTTAATAATCTAAGAGAGGAGAGTTGCTATGTTGGGGCTGAGCTATTTGTG
TTTCCAATGGCTGCATATGAGCGTGCACTGCTTCTAATCAATAGGCATTTGAACGAAGTCTGTGCTATCTCTGAACAGACAACAAATTTTGACTTTTTGAAGCAGGCCCAGAAAGAGCTTGCGATTGCAGAGAAATTTAAGCAAGATTACAATTTTCTATGGCGTCTTTTGGGACGAGTACATGCAGCTCATGTAGCAAT
TCGACACCTTATGAGTGACGAGGGGAGTTCAAATGGCGAAACATCTATCAAGTATGATGATGAATGTAATGAGCAATGGAAAGACATTGAAGATGGACAACTTGCGAATGAGAACTTTGGCATTGATGATTTCTCTTTACTATCAATATGAATGATAGGCTTATGTTATGTATTATATGGATGTATTGGCTAGGTAGAAT
AAAGCTTCATTATGTGCTCTACCTAGTTGTGGATGTAACTTTCTAATAGTCATAAGGTAATATTATTTAAGCATGACAATGTAAGTGCATATCATTTGTGGAATCGATTAGGAATTTGTTTCTTACAAATATTAATTCTATTATTTGGTCTACTCAAACATGACCGGAGTGTATTCATTTTCATTGGTGCATGTGGCTAT
TGTGAAATGGGAATCTACACATGCTCGAATTGTATAATTGGTTGCTCTCAATAAACCACATGACCTATCAACTTCATGAT

>TRINITY_DN127645_c5_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:

ACAATTGGAAGCAAGCATGAAGTTGGTGCCATAAAACTTGGTTTTGGTGGCTTTAGCCTTGTGATCTCCATGCTACCCCCAAAGTTACTTCGTCTACTATCTGTTTTGGGTTTTCGTTGTGACCGGAAGGCTGGACTTAGTGATATTGAAGAAAGCCTTTGCAGTGGTGGGCTTCGATCTTCTGCTTCTGGCATGCTTCT
TTTGTCGTACCATGTTATTTTACCAGCTTTTTTCTCTATCCCTCAAgtaagccagattatgcaccttgtcatttcatcttttttattttaatttaattatatagttataattagatgcattgtaaatttatattcaaagttctatctttctcaaaaagaggtttacagtgattagattaattgattttccatctttatag


GAACGAGAACAACATATAGAATGTGCTGAGCGAGTTCTGGCGACTTTAAATGAAATGTACCCAGGAAGCTTTTTTCTAAGCTATTATAAAGGCCGATTGCAAAGGTTGAAAAGGGACCTACCAGGGTCGATCGATTGGTTTATAAAACTTGAAGAGGGCTTAAGATTAACTCCCAACTCAAAGTTTTTCAAGATGCGGCA
TGCATGGTTGTATGAGCTTGGAGTGAGCTACATGCTGGAGCTTGAATGGGAAGCTGCAGAGAAATATTGGGCAGAGCTAGAGAAAGACTGTGTCTGGTCACGCGCTTTCTTTGCATACATGCATG

Intron 4 GCTTTTTCTT ... AGGAAGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	72.14	16.1	32.3	51
A2	77.52	9.8	37.5	30
A3	67.41	26.3	56.3	52.5
A4	78.69	9	32.5	34
A5	88.76	2.7	24.5	18
A6	80.43	5.3	16.5	27
A7	64.51	22.3	46	35
A8	64.44	8	13	16
A9	72.22	11	21.2	36
A10	73.53	9	22	28

>TRINITY_DN117279_c1_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoform

CTCGTCCGCTCAGCTGGCTGTCCTCACTGTAGGGTTCTTTATTGCCATCCATGATTGAATGAAATAGTTCCTCTCGCCATTGCCTAAAATTCGACGCCCGCTTGATCAGGGTTCGAGTCGCCTAGGCACTTGAAATTTTAATGAAACGTGCTTTAACTGCCATGTTTTAAAGATTTACTAGCTCAAAAGGGACCTGAACT
CGGAGCCATTTTCGATCTCAGGTTTTCTAATCTTGCAAACAATGGCGAGTGGTAAGCGGTCGGATCCCAGCGGCCGACGTAGTCAGATTACCAGCGCATGCGACGAAGCGGAGGGAGCTCTCAAGAAGCAAGCCATGGATAAGCTACGTGAAGTAGCGAATATGGCAGCAGAACATATACCTAAACAAGGATGGGCTCAA
AGCATAGCATCATGGGGCATAGGCTATTTCACATCAGCGCCAGGATGTAATGATGTCTCTGAAGAAGAACTAAGCTGTCAGATTATTGAGGCAGAGGCTACTTATTTGTCAGCATTACTTTGCTTTTTTGAAGAGTCAATGTCCTCCTTTTTTAAGGGTGCTTTGCTGATTCGGAAGGCAATAAGTGGATACAGGCGATG
CAATGGTGTTCTTCAGCAGCAGACAATTGGAAGCAAGCATGAAGTTGGTGCCATAAAACTTGGTTTTGGTGGCTTTAGCCTTGTGATCTCCATGCTACCCCCAAAGTTACTTCGTCTACTATCTGTTTTGGGTTTTCGTTGTGACCGGAAGGCTGGACTTAGTGATATTGAAGAAAGCCTTTGCAGTGGTGGGCTTCGAT
CTTCTGCTTCTGGCATGCTTCTTTTGTCGTACCATGTTATTTTACCAGCTTTTTTCTCTATCCCTCAAGAACGAGAACAACATATAGAATGTGCTGAGCGAGTTCTGGCGACTTTAAATGAAATGTACCCAGGAAGCTTTTTTCTAAGCTATTATAAAGGCCGATTGCAAAGGTTGAAAAGGGACCTACCAGGGTCGATC
GATTGGTTTATAAAACTTGAAGAGGGCTTAAGATTAACTCCCAACTCAAAGTTTTTCAAGATGCGGCATGCATGGTTGTATGAGCTTGGAGTGAGCTACATGCTGGAGCTTGAATGGGAAGCTGCAGAGAAATATTGGGCAGAGCTAGAGAAAGACTGTGTCTGGTCACGCGCTTTCTTTGCATACATGCATGGTATCTG
TCTATCTATGAATGGCAAAACTAACCTTGCTGCTGATCAGTTTGCCAAGGTTCCAGGGCTTTTGAGAGGGAAAATTTCTGGACGTGTTTTAGCCGAGGAGCAATATGTCTCTAGGAAGGTGAAGAATTATGCTCTTGATACGTTAGAAGGAGTTAAAAGCATTCAAGCTCACATAAGTGGAGTAGAGTTTCTATACCTTT
GGAATTCATTTCCACAGATGCCACATGACAAGTTGGAAAGAGTTGTTCAAATAATTGAAGAGGCAGAGACCATGTTAGCTGGATCAACATCTCGTTACACGAGGGACACTACAGGGCGTTTGCAATGGATGTTTGAAGATTCAGATGAAGAGGATGAAATCGAAATGCAAGATGATTATGCAGTTTGCAGTTTGATCAAA
GGCACAGCCTTTCGAGAGCTAGGAAAACTGGATGCTGCTCATGAATGCCTTAATAATCTAAGAGAGGAGAGTTGCTATGTTGGGGCTGAGCTATTTGTGTTTCCAATGGCTGCATATGAGCGTGCACTGCTTCTAATCAATAGGCATTTGAACGAAGTCTGTGCTATCTCTGAACAGACAACAAATTTTGACTTTTTGAA
GCAGGTAACGCTTCCAAAATCTTTCTAATCATAGGGCATAGTTTATTCTCCTTGTCATAATAGGCAATATGCATTTTCTGCATGTATGGAATGTTCGTCATTTTATAGCAGAGATTAATTATAAGTTAATT

>TRINITY_DN117279_c1_g1_i8 from sample A2 / Example unspliced isoform:

AGCCATTTTCGATCTCAGGTTTTATAATCTTGCAAACCATGGCGAGTGGTAAGCGGTCGGATCCCAGCGGCCGACGTAGTCAGATTACCAGCGCATGCGACGAAGCGGAGGGAGCTCTCAAgctttttcttcaaggaaaatttgatgaagctgaagctttcattgaagaaagagtagagactagagacaaggcttttaat
gctgtacccatattcagtcattgccacgctattattctatttgcaaaggcagcaatctctggcacagaggaagacagGAAGCAAGCCATGGATAAGCTACGTGAAGTAGCGAATATGGCAGCAGAACATATACCTAAACAAGGATGGGCTCAAAGCATAGCATCATGGGGCATAGGCTATTTCACATCAGCGCCAGGATG
TAATGATGTCTCTGAAGAAGAACTAAGCTGTCAGATTATTGAGGCAGAGGCTACTTATTTGTCAGCATTACTTTGCTTTTTTGAAGAGTCAATGTCCTCCTTTTTTAAGGGTGCTTTGCTGATTCGGAAGGCAATAAGTGGATACAGGCGATGCAATGGTGTTCTTCAGCAGCAGACAATTGGAAGCAAGCATGAAGTTG
GTGCCATAAAACTTGGTTTTGGTGGCTTTAGCCTTGTGATCTCCATGCTACCCCCAAAGTTACTTCGTCTACTATCTGTTTTGGGTTTTCGTTGTGACCGGAAGGCTGGACTTAGTGATATTGAAGAAAGCCTTTGCAGTGGTGGGCTTCGATCTTCTGCTTCTGGCATGCTTCTTTTGTCGTACCATGTTATTTTACCA
GCTTTTTTCTCTATCCCTCAAGAACGAGAACAACATATAGAATGTGCTGAGCGAGTTCTGGCGACTTTAAATGAAATGTACCCAGGAAGCTTTTTTCTAAGCTATTATAAAGGCCGATTGCAAAGGTTGAAAAGGGACCTACCAGGGTCGATCGATTGGTTTATAAAACTTGAAGAGGGCTTAAGATTAACTCCCAACTC
AAAGTTTTTCAAGATGCGGCATGCATGGTTGTATGAGCTTGGAGTGAGCTACATGCTGGAGCTTGAATGGGAAGCTGCAGAGAAATATTGGGCAGAGCTAGAGAAAGACTGTGTCTGGTCACGCGCTTTCTTTGCATACATGCATGGTATCTGTCTATCTATGAATGGCAAAACTAACCTTGCTGCTGATCAGTTTGCCA
AGGTTCCAGGGCTTTTGAGAGGGAAAATTTCTGGACGTGTTTTAGCCGAGGAGCAATATGTCTCTAGGAAGGTGAAGAATTATGCTCTTGATACGTTAGAAGGAGTTAAAAGCATTCAAGCTCACATAAGTGGAGTAGAGTTTCTATACCTTTGGAATTCATTTCCACAGATGCCACATGACAAGTTGGAAAGAGTTGTT
CAAATAATTGAAGAGGCAGAGACCATGTTAGCTGGATCAACATCTCGTTACACGAGGGACACTACAGGGCGTTTGCAATGGATGTTTGAAGATTCAGATGAAGAGGATGAAATCGAAATGCAAGATGATTATGCAGTTTGCAGTTTGATCAAAGGCACAGCCTTTCGAGAGCTAGGAAAACTGGATGCTGCTCATGAATG
CCTTAATAATCTAAGAGAGGAGAGTTGCTATGTTGGGGCTGAGCTATTTGTGTTTCCAATGGCTGCATATGAGCGTGCACTGCTTCTAATCAATAGGCATTTGAACGAAGTCTGTGCTATCTCTGAACAGACAACAAATTTTGACTTTTTGAAGCAGGCCCAGAAAGAGCTTGCGATTGCAGAGAAATTTAAGCAAGATT
ACAATTTTCTATGGCGTCTTTTGGGACGAGTACATGCAGCTCATGTAGCAATTCGACACCTTATGAGTGACGAGGGGAGTTCAAATGGCGAAACATCTATCAAGTATGATGATGAATGTAATGAGCAATGGAAAGACATTGAAGATGGACAACTTGCGAATGAGAACTTTGGCATTGATGATTTCTCTTTACTGTCAATA
TGAATGATAGGATTATGTTATGTATTATATGGATGTATTGGCTAGGTAGAATAAAGCTTCATTATGTGCTCTACCTAGTTGTGGATGTAACTTTCTAATAGTCATAAGGTAATATTATTTAAGCATGACAATGTAAGTGCATATCATTTGTGGAATCGATCAGGAATTTGTTTCTTACAAATATTAATTCTATTATTTGG
TCTACTCAAACATGACCGGAGTGTATTCATTTTCATTGGTGCATGTGGCTATTGTGAAATGGGAATCTACACATGCTCGAATTGTATAATTGGTTGCTCTCAATAAACC