sp|Q6AT26|CESA1_ORYSJ ----> Probable cellulose synthase A catalytic subunit 1 [UDP-forming]

Intron 1 GTACATTAGA ... GTTGTGAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	55.56	34	56	29
A2	56.96	17	24	21
A3	61.17	20	30	33
A4	42.34	32	15	32
A5	53.49	10	11	12
A6	67.31	34	55	85
A7	66.12	41	69	91
A8	64.74	55	81	121
A9	55.35	73	80	101
A10	47.96	70	45	84

>TRINITY_DN131578_c0_g1_i20 from sample A1 / Example spliced isoform

TCCTTACCATTTAGTGATTGATCTTAACCAAACTTTCCCTTTGTTTCAACCCACTGAGCAAAATATTTTGTCCAAATGTTTTGTTTTATTAAATTCTTTATCAAAAACTTGTTTCAAAGACTCTTTCTATGAAGCTTTTCTATGCCAAAGCTCAATGTTGCAGAAGTCAATAGCTACGCAAATCATGTTTCATGCAAACA
CTTATATGAGCTACGCAAATCATGTTTCATGCAAACACTTATATGAGCTACGACAAGGGGTTAGCCATTAGATATGTAGAGGGTTATAGTCTTCAAATATATGACTTAGACATGGATTGGTCACCAATCTGTGAACAACGATGATTATTCAGGAACTCACATTAAAAGAAAGCAACTGAGACACATATGAAGCAATGACG
GTTGATTCTGAAGTGGCATCCTTTTATCGAACATAACCACATCACATTAGTTTTTTTAATTATAGCTTAGCCTTTATGGTCCAATCACTTTTATGGTCAGGCTAAAATACAAATGCTTTCCATACAATCCTTTTGTAGTCTTGTTCGGGGAAAATGCATACTCTTTTTCATTATGAATCACAGAACCAAGTGCATTGATA
GTGGGCCGATCCACTTCCTGGCAACTCTGAGACTGTTAAGAGTTCTCCAAGCAAACCTTATTGCAAAAGAATTCGTATAGCAAGAAAGTAAACTCAAATTGTTCTCAAGGAAGGCTAGATTGTGCAAGATATTTAACACCCTGACTTGGAATTAATATTGGAGATATGAGACCATATTGGGATGATATAGGAAATATTCA
TGCTTAAAGGAATCATGGGACAGCCCTCGCATACTTAGCTTAATTAAGCTAACACATACACACTATCTTTTGAAATAGGTTCCTAAAGGTCACAACCAAGGACATCTCTAAGACAAAGACTAGTTGGCGAACAACAAGCTAACCCTAAATGCCCCAAGGGTTCATGTAAAGTAGTGCAGGGGTTTTATGGCCCTAGGTTA
TAATTACAAAGGTGGAAAAAGACTCCTATCCAAGTGATCCTACAGCTATAGTCCGAGGGTTATCATAACCAAATAAAATTTGTGATGATTAAAAACAGAAACGATAAACGAGGTTTCTATGACTGTAATAAAGAGGGGTAATTAAGTGGAAGGCAGCTGTCGTAATAAATTTTGGCTCTTGCTGTCCTAAGACTCTTCTC
GAGGATTTCAAGCTACTCATTCACTGAGATTGGGAAAGAGGAAGAACTCTCGGCCGTCATGGCTGAGAGGCTCTACTGCTCAGCAAAATTTCATGGACTCTAGTCTCCACCAGAACTAAGCCATCGATCTTGCTCTGAGAAGCACGATATCAATTGAAACGATTCTGCTCACAACACTAGCGCGCGAGGTTTTCTCTGGT
ACTCAGTTAAAAAGTGCAGCACTTCCATGCCCGAGATCTTAAATTTGAAGGTAAGGGCAATAACTTAAAAACTTCATC

>TRINITY_DN131578_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TCCTTACCATTTAGTGATTGATCTTAACCAAACTTTCCCTTTGTTTCAACCCACTGAGCAAAATATTTTGTCCAAATGTTTTGTTTTATTAAATTCTTTATCAAAAACTTGTTTCAAAGACTCTTTCTATGAAGCTTTTCTATGCCAAAGCTCAATGTTGCAGAAGTCAATAGCTACGCAAATCATGTTTCATGCAAACA
CTTATATGAGCTACGCAAATCATGTTTCATGCAAACACTTATATGAGCTACGACAAGGGGTTAGCCATTAGATATGTAGAGGGTTATAGTCTTCAAATATATGACTTAGACATGGATTGGTCACCAATCTGTGAACAACGATGATTATTCAGGAACTCACATTAAAAGAAAGCAACTGAGACACATATGAAGCAATGATG
GTTGATTCTGAAGTGGCATCCTTTTATCGAACATAACCACATCACATTAGTTTTTTTAATTATAGCTTAGCCTTTATGGTCCAATCACGTTTTGCAGTCTTCTTCGGGGAAAATGAATACTCTTTTTGATTATGAATCACAGAACCAAGTGCATTGATAGTGGGCCGATCCACTTCCTGGCAACTCTGAGACTGTTAAGA
GTTCTCCAAGCAAACCTTATTGCAAAAGAATTCATATAGCAAGAAAGTAAAgtacattagagagaatatatttcctattccttgctgtaattacttgtatgttggttctttgacattttggtaattatactaactgtgtctggcaatctgctatcatttctagagagaatatacagagttcaaattctgaattgattctt
gttgtgaaagCTCAAATTGTTCTCAAGGAAGGCTAGATTGTGCAAGATATTTAACACCCTGACTTGGAATTAATATTGGAGATATGAGACCATATTGGGATGATATAGGAAATATTCATGCTTAAAGGAATCATGGGACAGCCCTCGCATACTTAGCTTAATTAAGCTAACACATACACACTATCTTTTGAAATAGGTTC
CTAAAGGTCACAACCAAGGACATCTCTAAGACAAAGACTAGTTGGCGAACAACAAGCTAACCCTAAATGCCCCAAGGGTTCATGTAAAGTAGTGCAGGGGTTTTATGGCCCTAGGTTATAATTACAAAGGTGGAAAAAGACTCCTATCCAAGTGATCCTACAGCTATAGTCCGAGGGTTATCATAACCAAATAAAATTTG
TGATGATTAAAAACAGAAACGATAAACGAGGTTTCTATGACTGTAATAAAGAGGGGTAATTAAGTGGAAGGCAGCTGTCGTAATAAATTTTGGCTCTTGCTGTCCTAAGACTCTTCTCGAGGATTTCAAGCTACTCATTCACTGAGATTGGGAAAGAGGAAGAACTCTCGGCCGTCATGGCTGAGAGGCTCTACTGCTCA
GCAAAATTTCATGGACTCTAGTCTCCACCAGAACTAAGCCATCGATCTTGCTCTGAGAAGCACGATATCAATTGAAACGATTCTGCTCACAACACTAGCGCGCGAGGTTTTCTCTGGTACTCAGTTAAAAAGTGCAGCACTTCCATGCCCGAGATCTTAAATTTGAAGGTGGCGTTTGGATGGGACTCTGGAGTGAGCTT
CTCCCAAGCGAGGGTATCAATACAGACAACCAGGTATGCCATGGCTGTCCCTGGAGTCCTACGGTGTGAAGGTTCAATCCAAAGGTGCTGCAAGGAAGTCTAAGGTTTTTAAAACATTATTCGTTGTTTGTATGTTTTTTGAAAAGAACTTCTGGTTTTGAATGGGTTGTAATATAGATTTTAAAAACTGAAGAAGGTAG
GGTTTTCTCAGAATTAACAAGATATTGGTTTGGATCCGCGAAGTATCCTTCAACTTCAGGGTTGATATAAATGTATATATTTTTGTTTTGGAGCGAGCCGCGAAGCATCTTTTAGCTTCTGTGTTGTTGTTTTATGGCTTGACCTGGGTTTTTACTTCTGCAAACTTAAATTTGTTTTAAGAAACTAAAA