sp|Q943I6|STOP1_ORYSJ ----> Zinc finger protein STOP1 homolog
Intron 1 GTATGTTAAG ... GAATTATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 33.33 | 11 | 5 | 6 |
| A2 | 20 | 8 | 2 | 2 |
| A3 | 20 | 10 | 3 | 2 |
| A4 | 33.33 | 12 | 7 | 5 |
| A5 | 37.14 | 11 | 11 | 2 |
| A6 | 20 | 6 | 2 | 1 |
| A7 | 40 | 6 | 3 | 5 |
| A8 | 60 | 1 | 2 | 1 |
| A9 | 36.36 | 7 | 5 | 3 |
| A10 | 25.58 | 16 | 4 | 7 |
>TRINITY_DN46701_c1_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoformCCTGGAGAAGTGCAAGAACCTTCGTGGTAGATTGTAAAAATGAAAAAACACAGTCTCAAATTTCAATTTATTTAGCGATACATCATTCGGATTATCGAATTAAATATTGTTGGCTTTTGGTCAAACTCGCACTCGGCCTTTATGAGCACAGAGGACATCCCCGTTTCCAGTGCAAACTGCAAATTTAATGGGGGAGGATG
GGCATAAAATAGCAGCAGGACTCAGGAGACGAAGGCATGGCCATGGCGCCGGCGAATTTTGATTCGGACAAGTGAAGATGGAGAAGAATAATAATGGATCCGAAGAAGGCAAGGTTTTCCGTTTCTATGAAGCGTAGGGTTTTCTTGCAGGGAAAAGGGGTTTCGGGCTCTCACAGTTGAGTCTAATACAATTCTGAAGA
TTTTCATTACTTTTGGTCCTGGAGGGAAAGCCTGTTTGCTGTTTAGTCCGACTCCTTTTTCTTCTTTTAAGGAGAGGGTGTGTATTTTCTGGCGTTAGAGGGAGATGATGGCAGGTCAGGTTATGGAGCCTCCATCGGCTTCTCCCAAATCTGAGGGAGAGGATGGCGAATCCAAGTTTTCGCTTCTTGGGCAGCAGTTT
AGTCGTTATGTTTCTGCTGCCCAAAACCAGGTTCAATCTTCGCAGACGGCGTCAATAAGCTTCTCCTTGGTGCCTCCGCTGCCACATAACCAGGTTGCATTAAATTCCCAATCATTAGCCAATTCCAGCCATGGCGGAAGCGATGGAGGAAATAGTGGGTCATTCTCCGATGCTCGGCATCAGCATATGCCTTCTTTGCA
AGGATATAGTTTGGCATATGGTGCACATCACACAAATCAGAGTAATATCGGGGAAAGTAGTGGTTCAAGTGGGAATCCCTCCCAAGCTTGTAATACTCAAGTTTTACTGAGTACTTTGTCAATACTCCAGCGAAAGATCTATCAGCTGCAGTCTTTGGTACAACTGATGGCCCAGGAACAGAGGCAATCTGGTCAGTCAT
CTACGATGATGGCTCAACAACAAGCAGTGACAACGAGTGTTGCCTCAATTATATCTCAGTTAATGGTGGCTGCTGCTGGTATGCTCCCTTTGTCTCAGCAGACAGGTTTGAATCTTTCTTCGATGACAACTGCTGGAGATCTCCAGCTGGGTCATTTTTTTGGGGCTGGTCTTGGTTTGGGATTGAATGCTTTTCAGCAA
AATGGAGCTGGAAACTCAGCAACGGGCCCAGTGAATGGTCCTGTAGGTGCAAACAATATCTTCAGTCTTGAAGGTGGTTCAGGGGGGGCAAATATGGGGGGTATTGCAACATCACAGTCTGTACAACCTCAGAATCCTCTTGGAACACCTAACTCTACACATGAAATTGGAACATCTATTAATGCCGGTTCCAGTGATGG
TAAGGTGCTTGGGGGAGTTACAGAGGCAAACGATTGTGATAATGGAAATGGGATAGCAAATCAGGCTGGAGATTCATTGTTTACATCACAACGTTCAGGAGGACCTGGGTCAGGAGATGACAATGATTTTGGTGGAAACGGAAGGGATGAGGATGATGATGGAGAGGGAGAAAGCCTTCCTCCTGGATCTTATCAACTTG
TTGAGATGGATGCAGTTGAGATTCTAGCGGAACACACACACTTTTGTGAAATATGTGGGAAGGGATTCAAGCGGGATGCTAACTTGCGGATGCATATGCGAGGCCATGGTGATGAGTACAAGACTCCAGCAGCTTTGGCTAGGCCTGACAAAGCTCAAGATTCAGCTTCTGCCCAGCCAAGGAGGTATTCTTGCCCATTT
GTAGGATGCAAGCGGAATAAGAAGCACAAGAAATTTCAACCCCTAAAAACCATGCTTTGTGTAAAAAATCATTATAGAAGAAGTCATTGTCCTAAGATGTACACTTGTAACAGATGCAAGAATAAGAAATTTTCAGTCGTAGCAGATCTAAAAACCCATGAAAAACACTGTGGTCGAGATAAATGGCAGTGCTCATGTGG
AACAACGTTCTCGAGAAAGGACAAGCTCTTTGGACATATTGCCCTATTTCAGGGTCACACGCCTGTCTTTTCTCCCAATGAAATGGAAGGGGGTGCTCTGCAAGATCAAGTAGGAAATAATGGAGGAGCACCCAACATTGGCAATTCAGTATCAGGCTTTGCAATTGCCTGTGGTAATGTTCCAGGGATTCTGGCAGGTT
CAGAACATATTGGATCGATTCACAGTAACAGTAACGCCCCTTCTATTGGCCCAGGAGCAAATGGCAAGGTATTGGAATCAAGTAACGGTGCCTCTCATAGTCAAATAGGGCTTAAAAATATTGGTTTCTCAGAGGAGGGCAATCCACTCAGTATGGGAGTGGATTCTTCAAACCAAATGTCTGGGTTTTCTCAATCAGCT
TCAGCTCTCATGCCAGAGCCATTTATGTTCCAAAGCCTTCTTTCCAACAATTTCCTTCAGCAAGGTAGAGGGAATTAGAAATCCAGTCTGCTCAATTCATGCTGTGGCAATTTTGGGAGTGGAGTGGTGACCACCATAAACACTTTTGAACTTGTGCAGTTGTTAGTAATGAAGGAGCATAGATTGGAGGGATTGGGTTC
CATGCTCACAATGTCCAAGAAAGCTAATTATAGGAGAGAGCAAAGAGACTTACATCTGGTTTTCTTGAGTGCATGGAAAGGGGAAAATGGAAAAGAAGATAGAATTCTGTAACAACTAACAAATGAAGCTTTCAATTGACTTTGCTTTTCTCTTTTTTCTCTTCACATTTTGGCTGTAGGTAAGGGATACTAGTCTGAAA
TCAATATGTGCTCGAACATTTCTGAGCTTTGTTGGGTAAAAGATGGAGCATAGATTTGAGGGATTGCTCTCTATGTCTGAGAAAGTTAATTGTAAGAGAGAGCAAAGAGATTTGCATCTTGTTTTCTTGAGTGCACAAAGGGGAAATGGAAGAAGAAGACATAATTAATGTTGTAGCTGTAAATGAAGCTTTCAGCCAAC
TTTATTTTCCTTCCTTTTTTTCACATTTTGGCCTGCAGGTAAGATATACTAGTCTGAAATAAAGACCAAAATATTTTTGTGCCTGAACATTTCTCAGCTTTGTTGAGCATGCTGGGAACAGCCAGTGGATACAGCCTTATATAGCAATGTAACTGATAGTAGTCAAGATGTTTCTGATTCGGTGATATCTAGTGTAAATT
ATTATAGAAATAACTGGCTGCAATATTGGTGCTTAGAACCCTACACAGAGCTATGCTCTTTTTGTCAACTGGCTCTTGTTTGTAGGATGGCAGCTGCAAAGAGCTTGATGGATAAGATGGTCTTATGTAATAAGTAGAAACTGGTTGATCTGGCCCAGGCCTGTATTCCAACTTTTAATTTTAAATTCAACTGTGCTGTA
TCATGGCACTTCAGTTACAAATTCAACTGTGCTGTATCTTGATTCATGGCAGACTTCAGACAAGCAAATAATGAAATTCCGATCTAATTAAGTAGAATAGTT
>TRINITY_DN46701_c1_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:CCTGGAGAAGTGCAAGAACCTTCGTGGTAGATTGTAAAAATGAAAAAACACAGTCTCAAATTTCAATTTATTTAGCGATACATCATTCGGATTATCGAATTAAATATTGTTGGCTTTTGGTCAAACTCGCACTCGGCCTTTATGAGCACAGAGGACATCCCCGTTTCCAGTGCAAACTGCAAATTTAATGGGGGAGGATG
GGCATAAAATAGCAGCAGGACTCAGGAGACGAAGGCATGGCCATGGCGCCGGCGAATTTTGATTCGGACAAGTGAAGATGGAGAAGAATAATAATGGgtatgttaagcttaagtcataatctccaactaacactaacagtattttgagtttcggaatgacagattgtttatttgtttgttgacatccaacaccattatca
gtatgtaggctaaaaccccaacatgtttgattgttagggattgcatgtccattagatgcattctcgttatagtaccagagatcttctctacccccccttcccatgggttccctggtacattcactgctttagtattattgtttatcattctcagccttttttttacatgatttggggtttgaattatcagATCCGAAGAA
GGCAAGGTTTTCCGTTTCTATGAAGCGTAGGGTTTTCTTGCAGGGAAAAGGGGTTTCGGGCTCTCACAGTTGAGTCTAATACAATTCTGAAGATTTTCATTACTTTTGGTCCTGGAGGGAAAGCCTGTTTGCTGTTTAGTCCGACTCCTTTTTCTTCTTTTAAGGAGAGGGTGTGTATTTTCTGGCGTTAGAGGGAGATG
ATGGCAGGTCAGGTTATGGAGCCTCCATCGGCTTCTCCCAAATCTGAGGGAGAGGATGGCGAATCCAAGTTTTCGCTTCTTGGGCAGCAGTTTAGTCGTTATGTTTCTGCTGCCCAAAACCAGGTTCAATCTTCGCAGACGGCGTCAATAAGCTTCTCCTTGGTGCCTCCGCTGCCACATAACCAGGTTGCATTAAATTC
CCAATCATTAGCCAATTCCAGCCATGGCGGAAGCGATGGAGGAAATAGTGGGTCATTCTCCGATGCTCGGCATCAGCATATGCCTTCTTTGCAAGGATATAGTTTGGCATATGGTGCACATCACACAAATCAGAGTAATATCGGGGAAAGTAGTGGTTCAAGTGGGAATCCCTCCCAAGCTTGTAATACTCAAGTTTTAC
TGAGTACTTTGTCAATACTCCAGCGAAAGATCTATCAGCTGCAGTCTTTGGTACAACTGATGGCCCAGGAACAGAGGCAATCTGGTCAGTCATCTACGATGATGGCTCAACAACAAGCAGTGACAACGAGTGTTGCCTCAATTATATCTCAGTTAATGGTGGCTGCTGCTGGTATGCTCCCTTTGTCTCAGCAGACAGGT
TTGAATCTTTCTTCGATGACAACTGCTGGAGATCTCCAGCTGGGTCATTTTTTTGGGGCTGGTCTTGGTTTGGGATTGAATGCTTTTCAGCAAAATGGAGCTGGAAACTCAGCAACGGGCCCAGTGAATGGTCCTGTAGGTGCAAACAATATCTTCAGTCTTGAAGGTGGTTCAGGGGGGGCAAATATGGGGGGTATTGC
AACATCACAGTCTGTACAACCTCAGAATCCTCTTGGAACACCTAACTCTACACATGAAATTGGAACATCTATTAATGCCGGTTCCAGTGATGGTAAGGTGCTTGGGGGAGTTACAGAGGCAAACGATTGTGATAATGGAAATGGGATAGCAAATCAGGCTGGAGATTCATTGTTTACATCACAACGTTCAGGAGGACCTG
GGTCAGGAGATGACAATGATTTTGGTGGAAACGGAAGGGATGAGGATGATGATGGAGAGGGAGAAAGCCTTCCTCCTGGATCTTATCAACTTGTTGAGATGGATGCAGTTGAGATTCTAGCGGAACACACACACTTTTGTGAAATATGTGGGAAGGGATTCAAGCGGGATGCTAACTTGCGGATGCATATGCGAGGCCAT
GGTGATGAGTACAAGACTCCAGCAGCTTTGGCTAGGCCTGACAAAGCTCAAGATTCAGCTTCTGCCCAGCCAAGGAGGTATTCTTGCCCATTTGTAGGATGCAAGCGGAATAAGAAGCACAAGAAATTTCAACCCCTAAAAACCATGCTTTGTGTAAAAAATCATTATAGAAGAAGTCATTGTCCTAAGATGTACACTTG
TAACAGATGCAAGAATAAGAAATTTTCAGTCGTAGCAGATCTAAAAACCCATGAAAAACACTGTGGTCGAGATAAATGGCAGTGCTCATGTGGAACAACGTTCTCGAGAAAGGACAAGCTCTTTGGACATATTGCCCTATTTCAGGGTCACACGCCTGTCTTTTCTCCCAATGAAATGGAAGGGGGTGCTCTGCAAGATC
AAGTAGGAAATAATGGAGGAGCACCCAACATTGGCAATTCAGTATCAGGCTTTGCAATTGCCTGTGGTAATGTTCCAGGGATTCTGGCAGGTTCAGAACATATTGGATCGATTCACAGTAACAGTAACGCCCCTTCTATTGGCCCAGGAGCAAATGGCAAGGTATTGGAATCAAGTAACGGTGCCTCTCATAGTCAAATA
GGGCTTAAAAATATTGGTTTCTCAGAGGAGGGCAATCCACTCAGTATGGGAGTGGATTCTTCAAACCAAATGTCTGGGTTTTCTCAATCAGCTTCAGCTCTCATGCCAGAGCCATTTATGTTCCAAAGCCTTCTTTCCAACAATTTCCTTCAGCAAGGTAGAGGGAATTAGAAATCCAGTCTGCTCAATTCATGCTGTGG
CAATTTTGGGAGTGGAGTGGTGACCACCATAAACACTTTTGAACTTGTGCAGTTGTTAGTAATGAAGGAGCATAGATTGGAGGGATTGGGTTCCATGCTCACAATGTCCAAGAAAGCTAATTATAGGAGAGAGCAAAGAGACTTACATCTGGTTTTCTTGAGTGCATGGAAAGGGGAAAATGGAAAAGAAGATAGAATTC
TGTAACAACTAACAAATGAAGCTTTCAATTGACTTTGCTTTTCTCTTTTTTCTCTTCACATTTTGGCTGTAGGTAAGGGATACTAGTCTGAAATCAATATGTGCTCGAACATTTCTGAGCTTTGTTGGGTAAAAGATGGAGCATAGATTTGAGGGATTGCTCTCTATGTCTGAGAAAGTTAATTGTAAGAGAGAGCAAAG
AGATTTGCATCTTGTTTTCTTGAGTGCACAAAGGGGAAATGGAAGAAGAAGACATAATTAATGTTGTAGCTGTAAATGAAGCTTTCAGCCAACTTTATTTTCCTTCCTTTTTTTCACATTTTGGCCTGCAGGTAAGATATACTAGTCTGAAATAAAGACCAAAATATTTTTGTGCCTGAACATTTCTCAGCTTTGTTGAG
CATGCTGGGAACAGCCAGTGGATACAGCCTTATATAGCAATGTAACTGATAGTAGTCAAGATGTTTCTGATTCGGTGATATCTAGTGTAAATTATTATAGAAATAACTGGCTGCAATATTGGTGCTTAGAACCCTACACAGAGCTATGCTCTTTTTGTCAACTGGCTCTTGTTTGTAGGATGGCAGCTGCAAAGAGCTTG
ATGGATAAGATGGTCTTATGTAATAAGTAGAAACTGGTTGATCTGGCCCAGGCCTGTATTCCAACTTTTAATTTTAAATTCAACTGTGCTGTATCATGGCACTTCAGTTACAAATTCAACTGTGCTGTATCTTGATTCATGGCAGACTTCAGACAAGCAAATAATGAAATTCCGATCTAATTAAGTAGAATAGTT