sp|Q56WH1|TBA3_ARATH ----> Tubulin alpha-3 chain


Intron 1 GTAAATTGCA ... TTTTTTTCAG

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A553.8820810243
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A854.816115741
A954.87143621746
A1053.77122021419



>TRINITY_DN44001_c0_g1_i13 from sample A6 / Example spliced isoform
CATTTATAGTGATTTACTCGTTTTTAAATTGTATAATCTGTTTCTCGTTTTGTTTTGTATTTTTTTTAAAGGTCCTTTATAAGAACAAAGCACATTGGTCTTGAAATAGTAGCTTCAGCTTGCTTTATGTGTGCTGCCGATGTTTTCAGGTCATTAGTAGTTGCTGGAGAGAGTTGTTTCCGGTGTTAAGTTTAGGCCAG
AGAAAGTGTCGTACACGACCTTGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATAT
CCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATG
GCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAATTACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGC
TAAGGTTCAACGTGCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTTGATGTATGCCAAACGTGCATTTGTCCATTGGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGAAGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTG
GGGCAGAGGCTTCTGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAATAAACTGTAAGGGTGGCTTGTATTGCCTTGATCTATTTTGTAATTTGCTATTCTCTGATTCCAGTGTGCAGTGCTCGCTGCACAAATTTTTATTTGTTAATATGTGTACGGCAGCA
GGATTCTGTTTTTTCTAAAGTGTAGGATCAATCCAACAAATTATGCTTCAATCTGTGTGTAATGATAGTCTTCCACTTGTAGATCATATAATTTTTCTTGTCATCTAAAATTTAAGTAGAGACAAAATGGAAACAGAGTTTTGACTATGGTTACATCCCGTTGGATATGAGTTACCTTCTCTAAGTGCCAAGTTTATGTA
CCATGTACATATATCGATGCACCAAATGGCATTGTGTGTTACTGCCAATGTGCAAACATATATAAGGTAAGCAAAGCTGGACATATCCCTTTGTCTTTAGTATGCTAGCACTTAATTGGCAATGACATTACTATCACGAGTCGTGATAGCATGCATCTTTGCAATGTGCTTTTAGAACAGGTGTATAGAAATTGGCATTA
TGCATGGTCATAGTTTGTTATGGCATTATCATGCAGCACACGATGAATTGTTCATATTTGTCAACCACAAGCACATATAAGAGATGGAATAATTGGTAACTCTGTCAAGATTTATAATACCTTTGGAGACCTATTTAAAGATTTATTTACAAATTCAGGTCTTCATTGCTTTTCTTTCTCTTCCAAGTAGCAGGGGAACT
GCTCTTGGCGGTTGGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATGCCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCTCATTTCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCATAAGAGCATTTTTATGATAATAAAAGCCCTTATCTAAAC
CTATCAATATGCCTCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGGAGAGTTTGTGAGAGCTTCAGCTGAGAGCAGTGCTTGTTTCTAGCTTATTTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTTATAAATAATAGAGCTGTGGCACATTGTTTCT
TAGTTGGGAAGCGTATGGTGCTACTGCCAGCTATGGATACTATCAGTACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTCTACTGCGTCGTTCCATATTTATTCGGTTACTCTAAGTTTGAAATCCAGATTTTAATCAAAGACAAAAGTAAAAGACACAAACCTGGCAAGGATTACTTAACTCTTTTTACCTTGAGTGGATTCT
GAAATTTTGATCATTGGTATCTACTGCCTTTAACCATTTTATCTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGTTGCTTGGAGAGCTTGTGAGTAGCGAGTCTTGGTGGTCGGAACAGTTTCAAGGGCTT
CAGCTGAGCAGTGCTGTTTGCAGTTTAATTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTCATAAATAATGTAACTGTGGCACAATGTTTCTGAAATGGGAAGCGTATGGTGCTAGTTTTCTGATAATATCAATACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTATATTTCACCGTTCAATATTTATTCTGTTATTCT
AAGTTTGAAATCAAAGACAAAAGGATTACTCTTACACATCTTGGACATCATTAGTGCTAGC


>TRINITY_DN44001_c0_g1_i10 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CATTTATAGTGATTTACTCGTTTTTAAATTGTATAATCTGTTTCTCGTTTTGTTTTGTATTTTTTTTAAAGGTCCTTTATAAGAACAAAGCACATTGGTCTTGAAATAGTAGCTTCAGCTTGCTTTATGTGTGCTGCCGATGTTTTCAGGTCATTAGTAGTTGCTGGAGAGAGTTGTTTCCGGTGTTAAGTTTAGGCCAG
AGAAAGTGTCGTACACGACCTTgtaaattgcaatttctgaataaattatgaacatggaggtttaggttttgaaatataagtattgatgggattgaaccttttttttcagGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATG
AAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCT
CCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGAC
TGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAATTACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGCTAAGGTTCAACGTGCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTTGATGTATGCCAAACGTGCATTTGTCCATT
GGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGAAGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTGGGGCAGAGGCTTCTGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAATAAACTGTAAGGGTGGCTTGTATTGCCTT
GATCTATTTTGTAATTTGCTATTCTCTGATTCCAGTGTGCAGTGCTCGCTGCACAAATTTTTATTTGTTAATATGTGTACGGCAGCAGGATTCTGTTTTTTCTAAAGTGTAGGATCAATCCAACAAATTATGCTTCAATCTGTGTGTAATGATAGTCTTCCACTTGTAGATCATATAATTTTTCTTGTCATCTAAAATTT
AAGTAGAGACAAAATGGAAACAGAGTTTTGACTATGGTTACATCCCGTTGGATATGAGTTACCTTCTCTAAGTGCCAAGTTTATGTACCATGTACATATATCGATGCACCAAATGGCATTGTGTGTTACTGCCAATGTGCAAACATATATAAGGTAAGCAAAGCTGGACATATCCCTTTGTCTTTAGTATGCTAGCACTT
AATTGGCAATGACATTACTATCACGAGTCGTGATAGCATGCATCTTTGCAATGTGCTTTTAGAACAGGTGTATAGAAATTGGCATTATGCATGGTCATAGTTTGTTATGGCATTATCATGCAGCACACGATGAATTGTTCATATTTGTCAACCACAAGCACATATAAGAGATGGAATAATTGGTAACTCTGTCAAGATTT
ATAATACCTTTGGAGACCTATTTAAAGATTTATTTACAAATTCAGGTCTTCATTGCTTTTCTTTCTCTTCCAAGTAGCAGGGGAACTGCTCTTGGCGGTTGGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATGCCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCTCATT
TCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCATAAGAGCATTTTTATGATAATAAAAGCCCTTATCTAAACCTATCAATATGCCTCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGGAGAGTTTGTGAGAGCTTCAGCTGAGAGCA
GTGCTTGTTTCTAGCTTATTTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTTATAAATAATAGAGCTGTGGCACATTGTTTCTTAGTTGGGAAGCGTATGGTGCTACTGCCAGCTATGGATACTATCAGTACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTCTACTGCGTCGTTCCATATTTATTCGGTTACTCTAAGT
TTGAAATCCAGATTTTAATCAAAGACAAAAGTAAAAGACACAAACCTGGCAAGGATTACTTAACTCTTTTTACCTTGAGTGGATTCTGAAATTTTGATCATTGGTATCTACTGCCTTTAACCATTTTATCTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATGATAGCTAGAGATCTTGCAA
TTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGTTGCTTGGAGAGCTTGTGAGTAGCGAGTCTTGGTGGTCGGAACAGTTTCAAGGGCTTCAGCTGAGCAGTGCTGTTTGCAGTTTAATTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTCATAAATAATGTAACTGTGGCACAATGTTTCTGAAATGGGAAGCGTATG
GTGCTAGTTTTCTGATAATATCAATACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTATATTTCACCGTTCAATATTTATTCTGTTATTCTAAGTTTGAAATCAAAGACAAAAGGATTACTCTTACACATCTTGGACATCATTAGTGCTAGC



Intron 2 GTAAGGGTGG ... CAAGTAGCAG

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A1077.07223975277



>TRINITY_DN44001_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform
GCAAATTATGCCCTGCCATGCCTAACTGGCAATGAGGCTGATAGCCCCCCTGCCTCCCTCAGATAAATGCAAAAACAATTGAAATTGAAAAGGATGATAATTGATAGAAGGGTCCACACCCAAAACGGAATCCAAACAACACTCAAATATAGCGGAATGCTTCTAGGGAATTTTGTCAATGCTTCATAAACTAGCGAGGC
ATCTAAGTTTGGAGAAGTGAGGCAGCGCAGCTTCTAGATAACCGTAGTTGATGATATATATGCCCGCCTGCCTGTAGGTCGACATTGGAATTGGAATCTCTGCATGATACTTCCTTCTACGATTTCAAATCCTTTTCAAATCGGCTTACTGGCTCTAACTTTGAGCGCAAATTTGAGATCTCGTATTGGTTTCATTTGAA
CTCGAAGGAAATGAGAGAAATTATCAGCATTCACATCGGCCAAGCGGGGATTCAGGTCGGGAATTCGTGCTGGGAGCTCTACTGTCTCGAACATGGAATCCAGCCCGATGGTATGATGCCCAGTGATACGTCGGTGGGCGTCGGAGACGATGCGTTCAACACTTTTTTCAGTGAGACAGGAGCTGGGAAACATGTTCCGA
GAGCTGTGTTCGTAGATCTGGAACCCACGGTCATAGACGAGGTTCGAACCGGGACATATCGGCAGCTCTTCCATCCTGAACAGCTGATCTCGGGCAAAGAAGACGCGGCCAACAACTTCGCTCGCGGGCATTACACTGTGGGGAAGGAGATTGTGGACCTCTGTCTAGATCGGGTGAGGAAGCTGGCCGATAACTGCACG
GGTTTACAGGGTTTTTTGGTTTTTAATGCTGTTGGAGGTGGAACTGGATCTGGTCTAGGTTCTTTGCTTTTGGAACGACTCTCTGTTGACTATGGAAAGAAATCAAAGCTTGGATTCACTATTTACCCTTCGCCTCAGGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACA
CACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTC
GAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCA
GCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAATTACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGCTAAGGTTCAACGTGCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTT
GATGTATGCCAAACGTGCATTTGTCCATTGGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGAAGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTGGGGCAGAGGCTTCTGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAA

TAAACTGGGAACTGCTCTTGGCGGTTGGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATGCCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCTCATTTCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCATAAGAGCATTTTTATGATAATAAAAG
CCCTTATCTAAACCTATCAATATGCCTCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGGAGAGTTTGTGAGAGCTTCAGCTGAGAGCAGTGCTTGTTTCTAGCTTATTTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTTATAAATAATAGAGCTGTG
GCACATTGTTTCTTAGTTGGGAAGCGTATGGTGCTACTGCCAGCTATGGATACTATCAGTACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTCTACTGCGTCGTTCCATATTTATTCGGTTACTCTAAGTTTGAAATCCAGATTTTAATCAAAGACAAAAGTAAAAGACACAAACCTGGCAAGGATTACTTAACTCTTTTTACC
TTGAGTGGATTCTGAAATTTTGATCATTGGTATCTACTGCCTTTAACCATTTTATCTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGTTGCTTGGAGAGCTTGTGAGTAGCGAGTCTTGGTGGTCGGAACA
GTTTCAAGGGCTTCAGCTGAGCAGTGCTGTTTGCAGTTTAATTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTCATAAATAATGTAACTGTGGCACAATGTTTCTGAAATGGGAAGCGTATGGTGCTAGTTTTCTGATAATATCAATACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTATATTTCACCGTTCAATATTT
ATTCTGTTATTCTAAGTTTGAAATCAAAGACAAAAGGATTACTCTTACACATCTTGGACATCATTAGTGCTAGC


>TRINITY_DN44001_c0_g1_i15 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CATTTATAGTGATTTACTCGTTTTTAAATTGTATAATCTGTTTCTCGTTTTGTTTTGTATTTTTTTTAAAGGTCCTTTATAAGAACAAAGCACATTGGTCTTGAAATAGTAGCTTCAGCTTGCTTTATGTGTGCTGCCGATGTTTTCAGGTCATTAGTAGTTGCTGGAGAGAGTTGTTTCCGGTGTTAAGTTTAGGCCAG
AGAAAGTGTCGTACACGACCTTGTAAATTGCAATTTCTGAATAAATTATGAACATGGAGGTTTAGGTTTTGAAATATAAGTATTGATGGGATTGAACCTTTTTTTTCAGGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATG
AAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCT
CCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGAC
TGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAATTACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGCTAAGGTTCAACGTGCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTTGATGTATGCCAAACGTGCATTTGTCCATT
GGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGAAGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTGGGGCAGAGGCTTCTGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAATAAACTgtaagggtggcttgtattgcctt
gatctattttgtaatttgctattctctgattccagtgtgcagtgctcgctgcacaaatttttatttgttaatatgtgtacggcagcaggattctgttttttctaaagtgtaggatcaatccaacaaattatgcttcaatctgtgtgtaatgatagtcttccacttgtagatcatataatttttcttgtcatctaaaattt
aagtagagacaaaatggaaacagagttttgactatggttacatcccgttggatatgagttaccttctctaagtgccaagtttatgtaccatgtacatatatcgatgcaccaaatggcattgtgtgttactgccaatgtgcaaacatatataaggtaagcaaagctggacatatccctttgtctttagtatgctagcactt
aattggcaatgacattactatcacgagtcgtgatagcatgcatctttgcaatgtgcttttagaacaggtgtatagaaattggcattatgcatggtcatagtttgttatggcattatcatgcagcacacgatgaattgttcatatttgtcaaccacaagcacatataagagatggaataattggtaactctgtcaagattt
ataatacctttggagacctatttaaagatttatttacaaattcaggtcttcattgcttttctttctcttccaagtagcagGGGAACTGCTCTTGGCGGTTGGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATGCCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCTCATT
TCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCATAAGAGCATTTTTATGATAATAAAAGCCCTTATCTAAACCTATCAATATGCCTCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGGAGAGTTTGTGACTCGCGAGTCTTTGGAGT
CTTGTTGGCCAG



Intron 3 GTACATTAAG ... TTTTTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A116.651417136.2283
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A820.932799.6260.5741
A920.966583.2601.51746
A1018.676180.86201419



>TRINITY_DN109231_c0_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoform
AGCAAATTATGCCCTGCCATGCCTAACTGGCAATGAGGCTGATAGCCCCCCTGCCTCCCTCAGATAAATGCAAAAACAATTGAAATTGAAAAGGATGATAATTGATAGAAGGGTCCACACCCAAAACGGAATCCAAACAACACTCAAATATAGCGGAATGCTTCTAGGGAATTTTGTCAATGCTTCATAAACTAGCGAGG
CATCTAAGTTTGGAGAAGTGAGGCAGCGCAGCTTCTAGATAACCGTAGTTGATGATATATATGCCCGCCTGCCTGTAGGTCGACATTGGAATTGGAATCTCTGCATGATACTTCCTTCTACGATTTCAAATCCTTTTCAAATCGGCTTACTGGCTCTAACTTTGAGCGCAAATTTGAGATCTCGTATTGGTTTCATTTGA
ACTCGAAGGAAATGAGAGAAATTATCAGCATTCACATCGGCCAAGCGGGGATTCAGGTCGGGAATTCGTGCTGGGAGCTCTACTGTCTCGAACATGGAATCCAGCCCGATGGTATGATGCCCAGTGATACGTCGGTGGGCGTCGGAGACGATGCGTTCAACACTTTTTTCAGTGAGACAGGAGCTGGGAAACATGTTCCG
AGAGCTGTGTTCGTAGATCTGGAACCCACGGTCATAGACGAGGTTCGAACCGGGACATATCGGCAGCTCTTCCATCCTGAACAGCTGATCTCGGGCAAAGAAGACGCGGCCAACAACTTCGCTCGCGGGCATTACACTGTGGGGAAGGAGATTGTGGACCTCTGTCTAGATCGGGTGAGGAAGCTGGCCGATAACTGCAC
GGGTTTACAGGGTTTTTTGGTTTTTAATGCTGTTGGAGGTGGAACTGGATCTGGTCTAGGTTCTTTGCTTTTGGAACGACTCTCTGTTGACTATGGAAAGAAATCAAAGCTTGGATTCACTATTTACCCTTCGCCTCAGGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAAC
ACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCT
CGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGC
AGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTAGGTGAATTTCTATTTGTTTTCACTTTGAAGCCTCACTACACCTCTAAAATTTATTCCTCTGTTTCTTACAATATTTATTTGGTGGTTACTAGGTGCCCCACG


>TRINITY_DN109231_c0_g1_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:
ACTATTTACCCTTCGCCTCAGgtacattaagctagcctttgaccagcggttagtttaggcatgtagttatacccattttagggttttgcattttgtgtggaacaatgctgaatgtcacatgatcacaggttcttgaagtaactgaatacggtcttgatttgaacaaagggttttgaagttattggatgtagtgttagtgt
ttcttctatagtttaccgtatagtccagacccatctgaaacgggcctgatatgcacctccatgttgctacgctgttggttgatgtctagattttgaatgtttgacggtccgtcatttgtgtggatttgagatatgagtctatggtctgttgtgctgcatctcaatgttgggaagttcgaggttccatatggagagttcca
atatttgtgaagtctaccatttgtaagaacgatgtgggtctcggctagtgtcattattcactgcaccttttagtttcaatgcacagttacagatccctaagagttactggatctgtaccctcatctcggctgtagattgcaccttgtttctcttgttataatcaagcatatttggagtgcctcacgtctattgcagcatt
ccttagatgtgctgcctccccatagtttaaagatttatggtagggctagcatcctcaagttctttaaatgaatttgcttttgtttttgttgcgcacaattttgctgatcaatataggatgagattatgcagtcttgtgctggatgcacacccaatgctttcaagcattcccaagtagttggaggaaatttgtaggcccca
aaatgtttgccatttatagtgatttactcgtttttaaattgtataatctgtttcttgttttgttttgtattttttttaaaggtcctttataagaacaaagcacattggtcttgaaatagtagcttcagcttgcttatgtgtgctgccgatgttttcaggtcattagtagttgctggagagagttgtttccggtgttaagt
ttaggccagagaaagtgtcgtacacgaccttgtaaattgcaatttctgaataaattatgaacatggaggtttaggttttgaaatataagtattgatgggattgaaccttttttttcagGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTC
TAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCT
TCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGAC
TAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTAGGTGAATTTCTATTTGTTTTCACTTTGAAGCCTCACTACACCTCTAAAATTTATTCCTCTGTTTCTTACAATATTTATTTGGTGGTTACTAGGTGCCCCACG



Intron 4 GTAGGTGAAT ... TGGTTACTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A116.38143428166.8
A218.41116126271.2
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A417.29101421271.4
A516.2475814739.7
A614.441258921251009.7
A714.5884951450636.1
A814.0594981553767.7
A916.4291831804716.6
A1014.264871074469.1



>TRINITY_DN101839_c0_g1_i9 from sample A4 / Example spliced isoform
GCAAATTATGCCCTGCCATGCCTAACTGGCAATGAGGCTGATAGCCCCCCTGCCTCCCTCAGATAAATGCAAAAACAATTGAAATTGAAAAGGATGATAATTGATAGAAGGGTCCACACCCAAAACGGAATCCAAACAACACTCAAATATAGCGGAATGCTTCTAGGGAATTTTGTCAATGCTTCATAAACTAGCGAGGC
ATCTAAGTTTGGAGAAGTGAGGCAGCGCAGCTTCTAGATAACCGTAGTTGATGATATATATGCCCGCCTGCCTGTAGGTCGACATTGGAATTGGAATCTCTGCATGATACTTCCTTCTACGATTTCAAATCCTTTTCAAATCGGCTTACTGGCTCTAACTTTGAGCGCAAATTTGAGATCTCGTATTGGTTTCATTTGAA
CTCGAAGGAAATGAGAGAAATTATCAGCATTCACATCGGCCAAGCGGGGATTCAGGTCGGGAATTCGTGCTGGGAGCTCTACTGTCTCGAACATGGAATCCAGCCCGATGGTATGATGCCCAGTGATACGTCGGTGGGCGTCGGAGACGATGCGTTCAACACTTTTTTCAGTGAGACAGGAGCTGGGAAACATGTTCCGA
GAGCTGTGTTCGTAGATCTGGAACCCACGGTCATAGACGAGGTTCGAACCGGGACATATCGGCAGCTCTTCCATCCTGAACAGCTGATCTCGGGCAAAGAAGACGCGGCCAACAACTTCGCTCGCGGGCATTACACTGTGGGGAAGGAGATTGTGGACCTCTGTCTAGATCGGGTGAGGAAGCTGGCCGATAACTGCACG
GGTTTACAGGGTTTTTTGGTTTTTAATGCTGTTGGAGGTGGAACTGGATCTGGTCTAGGTTCTTTGCTTTTGGAACGACTCTCTGTTGACTATGGAAAGAAATCAAAGCTTGGATTCACTATTTACCCTTCGCCTCAGGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACA
CACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTC
GAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCA
GCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAATTACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGCTAAGGTTCAACGTGCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTT
GATGTATGCCAAACGTGCATTTGTCCATTGGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGAAGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTGGGGCAGAGGCTTCTGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAA
TAAACTGTAAGGGTGGCTTGTATTGCCTTGATCTATTTTGTAATTTGCTATTCTCTGATTCCAGTGTGCAGTGCTCGCTGCACAAATTTTTATTTGTTAATATGTGTACGGCAGCAGGATTCTGTTTTTTCTAAAGTGTAGGATCAATCCAACAAATTATGCTTCAATCTGTGTGTAATGATAGTCTTCCACTTGTAGAT
CATATAATTTTTCTTGTCATCTAAAATTTAAGTAGAGACAAAATGGAAACAGAGTTTTGACTATGGTTACATCCCGTTGGATATGAGTTACCTTCTCTAAGTGCCAAGTTTATGTACCATGTACATATATCGATGCACCAAATGGCATTGTGTGTTACTGCCAATGTGCAAACATATATAAGGTAAGCAAAGCTGGACAT
ATCCCTTTGTCTTTAGTATGCTAGCACTTAATTGGCAATGACATTACTATCACGAGTCGTGATAGCATGCATCTTTGCAATGTGCTTTTAGAACAGGTGTATAGAAATTGGCATTATGCATGGTCATAGTTTGTTATGGCATTATCATGCAGCACACGATGAATTGTTCATATTTGTCAACCACAAGCACATATAAGAGA
TGGAATAATTGGTAACTCTGTCAAGATTTATAATACCTTTGGAGACCTATTTAAAGATTTATTTACAAATTCAGGTCTTCATTGCTTTTCTTTCTCTTCCAAGTAGCAGGGGAACTGCTCTTGGCGGTTGGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATG
CCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCTCATTTCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCATAAGAGCATTTTTATGATAATAAAAGCCCTTATCTAAACCTATCAATATGCCTCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGG
AGAGTTTGTGAGAGCTTCAGCTGAGAGCAGTGCTTGTTTCTAGCTTATTTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTTATAAATAATAGAGCTGTGGCACAATGTTTCTTAGTTGGGAAGCGTATGGTGCTACTGCTAGCTATGGATACTATCAGTAGTAGTACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTCTA
CTGCGTCGTTCCATATTTATTCGGTTACTCTAAGTTTGAAATCCAGATTTTAATCAAAGACAAAAGTAAAAGACACAAACCTGGCAAGGATTACTTAACTCTTTTTACCTTGAGTGGATTCTGAAATTTTGATCATTGGTATCTACTGCCTTTAACCATTTTATCTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGA
CTGAGAATCAGACATATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGCCTTAAACCATTTTATTTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGTTGCTTGGAGAGCTTG
TGAGTAGCGAGTCTTGGTGGTCGGAACAGTTTCAAGGGCTTCAGCTGAGCAGTGCTGTTTGCAGTTTAATTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTCATAAATAATGTAACTGTGGCACAATGTTTCTGAAATGGGAAGCGTATGGTGCTAGTTTTCTGATAATATCAATACAATACAGTATATTTGGATA
GCAGACTATATTTCACCGTTCAATATTTATTCTGTTATTCTAAGTTTGAAATCAAAGACAAAAGGATTACTCTTACACATCTTGGACATCATTAGTGCTAGCTTTCCGAAACTGATAATATCCATTTTTTTATAGTTTAGTACAGCTTGACAGCTTGAGTGGGTCCAACGGTTAAGAACATGTGTTTCCTCTAAAGAGGC
ATGTACTTCTGTAGATTTTAGAAGTTAAATTGCTGTGCAGAGAGGGTCTTTTGTCCCACAATCAAGTGAGTTTCATACACTAAATTGGTCTCTGGATTGGCTTTGCTTAAAAATGTTATATTATTATATTATATATATTACTGTTATATCTCAGAACAGTTGAGTGCCAAATGCAAATGCAAATTGGAGATTTAACTCTT
TCTACCTTGAGTGGATTCCGAAATTTCGATCATTGATATCTATTGCCTTTATCCATTTTATTCTGAATTTGCTGGAACTTCTGCTCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGCCTTAAACCATTTTATTTGAATTTGCTGGAACTTC
TGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATGATAGCTAGAGATCTTGCAAT


>TRINITY_DN101839_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGT
TTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGG
AAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGgtaggtgaatttctatttgttttcactttgaagcctcactacacctctaaaatttattcctctgtttcttacaatatttatttggtggttact
agGTGCCCCACAGGATTCAAATGT



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>TRINITY_DN42172_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoform
CACAAGAAGGTGAGTCCGGCGAGTGGTATTGATGCATAAAGTAATACCGACCAACCTTGATTTACAACTCTAAAAATTCAAAATTCAAATTTTAGGTGGTTCCACAAAATTCCAAATCAAGATTTCTTCGAAATAAGTGCTCCAACTTACCACCAACCTTGCCAGGCAAACAAAGCAAATTATGCCCTGCCATGCCTAAC
TGGCAATGAGGCTGATAGCCCCCCTGCCTCCCTCAGATAAATGCAAAAACAATTGAAATTGAAAAGGATGATAATTGATAGAAGGGTCCACACCCAAAACGGAATCCAAACAACACTCAAATATAGCGGAATGCTTCTAGGGAATTTTGTCAATGCTTCATAAACTAGCGAGGCATCTAAGTTTGGAGAAGTGAGGCAGC
GCAGCTTCTAGATAACCGTAGTTGATGATATATATGCCCGCCTGCCTGTAGGTCGACATTGGAATTGGAATCTCTGCATGATACTTCCTTCTACGATTTCAAATCCTTTTCAAATCGGCTTACTGGCTCTAACTTTGAGCGCAAATTTGAGATCTCGTATTGGTTTCATTTGAACTCGAAGGAAATGAGAGAAATTATCA
GCATTCACATCGGCCAAGCGGGGATTCAGGTCGGGAATTCGTGCTGGGAGCTCTACTGTCTCGAACATGGAATCCAGCCCGATGGTATGATGCCCAGTGATACGTCGGTGGGCGTCGGAGACGATGCGTTCAACACTTTTTTCAGTGAGACAGGAGCTGGGAAACATGTTCCGAGAGCTGTGTTCGTAGATCTGGAACCC
ACGGTCATAGACGAGGTTCGAACCGGGACATATCGGCAGCTCTTCCATCCTGAACAGCTGATCTCGGGCAAAGAAGACGCGGCCAACAACGTCGCTCGCGGGCATTACACTGTGGGGAAGGAGATTGTGGACCTCTGTCTAGATCGGGTGAGGAAGCTGGCCGATAACTGCACGGGTTTACAGGGTTTTTTGGTTTTTAA
TGCTGTTGGAGGTGGAACTGGATCTGGTCTAGGTTCTTTGCTTTTGGAACGACTCTCTGTTGACTATGGAAAGAAATCAAAGCTTGGATTCACTATTTACCCTTCGCCTCAGGTACATTAAGCTAGCCTTTGACCAGCGGTTAGTTTAGGCATGTAGTTATACCCATTTTAGGGTTTTGCATTTTGTGTGGAACAATGCT
GAATGTCACATGATCACAGGTTCTTGAAGTAACTGAATACGGTCTTGATTTGAACAAAGGGTTTTGAAGTTATTGGATGTAGTGTTAGTGTTTCTTCTATAGTTTACCGTATAGTCCAGACCCATCTGAAACGGGCCTGATATGCACCTCCATGTTGCTACGCTGTTGGTTGATGTCTAGATTTTGAATGTTTGACGGTC
CGTCATTTGTGTGGATTTGAGATATGAGTCTATGGTCTGTTGTGCTGCATCTCAATGTTGGGAAGTTCGAGGTTCCATATGGAGAGTTCCAATATTTGTGAAGTCTACCATTTGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGAC
AATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTA
TGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAAC
GGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAATTACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGCTAAGGTTCAACGTGCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTTGATGTATGCCAAACGTGCATTTGTC
CATTGGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGAAGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTGGGGCAGAGGCTTCTGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAATAAACTGTAAGGGTGGCTTGTATTG
CCTTGATCTATTTTGTAATTTGCTATTCTCTGATTCCAGTGTGCAGTGCTCGCTGCACAAATTTTTATTTGTTAATATGTGTACGGCAGCAGGATTCTGTTTTTTCTAAAGTGTAGGATCAATCCAACAAATTATGCTTCAATCTGTGTGTAATGATAGTCTTCCACTTGTAGATCATATAATTTTTCTTGTCATCTAAA
ATTTAAGTAGAGACAAAATGGAAACAGAGTTTTGACTATGGTTACATCCCGTTGGATATGAGTTACCTTCTCTAAGTGCCAAGTTTATGTACCATGTACATATATCGATGCACCAAATGGCATTGTGTGTTACTGCCAATGTGCAAACATATATAAGGTAAGCAAAGCTGGACATATCCCTTTGTCTTTAGTATGCTAGC
ACTTAATTGGCAATGACATTACTATCACGAGTCGTGATTGCATGCATCTTTGCAATGTGCTTTTAGAACAGGTGTATAGAAATTGGCATTATGCATGGTCATAGTTTGTTATGGCATTATCATGCAGCACACGATGAATTGTTCATATTTGTCAACCACAAGCACATATAAGAGATGGAATAATTGGTAACTCTGTCAAG
ATTTATAATACCTTTGGAGACCTATTTAAAGATTTATTTACAAATTCAGGTCTTCATTGCTTTTCTTTCTCTTCCAAGTAGCAGGGGAACTGCTCTTGGCGGTTGGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATGCCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCT
CATTTCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCATAAGAGCATTTTTATGATAATAAAAGCCCTTATCTAAACCTATCAATATGCCTCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGGAGAGTTTGTGAGAGCTTCAGCTGAG
AGCAGTGCTTGTTTCTAGCTTATTTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTTATAAATAATAGAGCTGTGGCACATTGTTTCTTAGTTGGGAAGCGTATGGTGCTACTGCCAGCTATGGATACTATCAGTACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTCTACTGCGTCGTTCCATATTTATTCGGTTACTCT
AAGTTTGAAATCCAGATTTTAATCAAAGACAAAAGTAAAAGACACAAACCTGGCAAGGATTACTTAACTCTTTTTACCTTGAGTGGATTCTGAAATTTTGATCATTGGTATCTACTGCCTTTAACCATTTTATCTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATATGATAGCTAGAGATC
TTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGCCTTAAACCATTTTATTTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGTTGCTTGGAGAGCTTGTGAGTAGCGAGTCTTGGTGGTCGGAACAGTT
TCAAGGGCTTCAGCTGAGCAGTGCTGTTTGCAGTTTAATTTTAGGGATTTATAATCAATGT


>TRINITY_DN42172_c0_g1_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:
CACAAGAAGGTGAGTCCGGCGAGTGGTATTGATGCATAAAGTAATACCGACCAACCTTGATTTACAACTCTAAAAATTCAAAATTCAAATTTTAGGTGGTTCCACAAAATTCCAAATCAAGATTTCTTCGAAATAAGTGCTCCAACTTACCACCAACCTTGCCAGGCAAACAAAGCAAATTATGCCCTGCCATGCCTAAC
TGGCAATGAGGCTGATAGCCCCCCTGCCTCCCTCAGATAAATGCAAAAACAATTGAAATTGAAAAGGATGATAATTGATAGAAGGGTCCACACCCAAAACGGAATCCAAACAACACTCAAATATAGCGGAATGCTTCTAGGGAATTTTGTCAATGCTTCATAAACTAGCGAGGCATCTAAGTTTGGAGAAGTGAGGCAGC
GCAGCTTCTAGATAACCGTAGTTGATGATATATATGCCCGCCTGCCTGTAGGTCGACATTGGAATTGGAATCTCTGCATGATACTTCCTTCTACGATTTCAAATCCTTTTCAAATCGGCTTACTGGCTCTAACTTTGAGCGCAAATTTGAGATCTCGTATTGGTTTCATTTGAACTCGAAGGAAATGAGAGAAATTATCA
GCATTCACATCGGCCAAGCGGGGATTCAGGTCGGGAATTCGTGCTGGGAGCTCTACTGTCTCGAACATGGAATCCAGCCCGATGGTATGATGCCCAGTGATACGTCGGTGGGCGTCGGAGACGATGCGTTCAACACTTTTTTCAGTGAGACAGGAGCTGGGAAACATGTTCCGAGAGCTGTGTTCGTAGATCTGGAACCC
ACGGTCATAGACGAGGTTCGAACCGGGACATATCGGCAGCTCTTCCATCCTGAACAGCTGATCTCGGGCAAAGAAGACGCGGCCAACAACGTCGCTCGCGGGCATTACACTGTGGGGAAGGAGATTGTGGACCTCTGTCTAGATCGGGTGAGGAAGCTGGCCGATAACTGCACGGGTTTACAGGGTTTTTTGGTTTTTAA
TGCTGTTGGAGGTGGAACTGGATCTGGTCTAGGTTCTTTGCTTTTGGAACGACTCTCTGTTGACTATGGAAAGAAATCAAAGCTTGGATTCACTATTTACCCTTCGCCTCAGGTACATTAAGCTAGCCTTTGACCAGCGGTTAGTTTAGGCATGTAGTTATACCCATTTTAGGGTTTTGCATTTTGTGTGGAACAATGCT
GAATGTCACATGATCACAGGTTCTTGAAGTAACTGAATACGGTCTTGATTTGAACAAAGGGTTTTGAAGTTATTGGATGTAGTGTTAGTGTTTCTTCTATAGTTTACCGTATAGTCCAGACCCATCTGAAACGGGCCTGATATGCACCTCCATGTTGCTACGCTGTTGGTTGATGTCTAGATTTTGAATGTTTGACGGTC
CGTCATTTGTGTGGATTTGAGATATGAGTCTATGGTCTGTTGTGCTGCATCTCAATGTTGGGAAGTTCGAGGTTCCATATGGAGAGTTCCAATATTTGTGAAGTCTACCATTTgtaagaacgatgtgggtctcggctagtgtcattattcactgcaccttttagtttcaatgcacagttacagatccctaagagttactg
gatctgtaccctcatctcggctgtagattgcaccttgtttctcttgttataatcaagcatatttggagtgcctcacgtctattgcagcattccttagatgtgctgcctccccatagtttaaagatttatggtagggctagcatcctcaagttctttaaatgaatttgcttttgtttttgttgcgcacaattttgctgatc
aatataggatgagattatgcagtcttgtgctggatgcacacccaatgctttcaagcattcccaagtagttggaggaaatttgtaggccccaaaatgtttgccatttatagtgatttactcgtttttaaattgtataatctgtttcttgttttgttttgtattttttttaaaggtcctttataagaacaaagcacattggt
cttgaaatagtagcttcagcttgcttatgtgtgctgccgatgttttcaggtcattagtagttgctggagagagttgtttccggtgttaagtttaggccagagaaagtgtcgtacacgaccttgtaaattgcaatttctgaataaattatgaacatggaggtttaggttttgaaatataagtattgatgggattgaacctt
ttttttcagGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAACTTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCAC
GTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTGAGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACC
CTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAATTACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGCTAAGGTTCAACGT
GCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTTGATGTATGCCAAACGTGCATTTGTCCATTGGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGAAGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTGGGGCAGAGGCTTC
TGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAATAAACTGTAAGGGTGGCTTGTATTGCCTTGATCTATTTTGTAATTTGCTATTCTCTGATTCCAGTGTGCAGTGCTCGCTGCACAAATTTTTATTTGTTAATATGTGTACGGCAGCAGGATTCTGTTTTT
TCTAAAGTGTAGGATCAATCCAACAAATTATGCTTCAATCTGTGTGTAATGATAGTCTTCCACTTGTAGATCATATAATTTTTCTTGTCATCTAAAATTTAAGTAGAGACAAAATGGAAACAGAGTTTTGACTATGGTTACATCCCGTTGGATATGAGTTACCTTCTCTAAGTGCCAAGTTTATGTACCATGTACATATA
TCGATGCACCAAATGGCATTGTGTGTTACTGCCAATGTGCAAACATATATAAGGTAAGCAAAGCTGGACATATCCCTTTGTCTTTAGTATGCTAGCACTTAATTGGCAATGACATTACTATCACGAGTCGTGATTGCATGCATCTTTGCAATGTGCTTTTAGAACAGGTGTATAGAAATTGGCATTATGCATGGTCATAG
TTTGTTATGGCATTATCATGCAGCACACGATGAATTGTTCATATTTGTCAACCACAAGCACATATAAGAGATGGAATAATTGGTAACTCTGTCAAGATTTATAATACCTTTGGAGACCTATTTAAAGATTTATTTACAAATTCAGGTCTTCATTGCTTTTCTTTCTCTTCCAAGTAGCAGGGGAACTGCTCTTGGCGGTT
GGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATGCCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCTCATTTCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCATAAGAGCATTTTTATGATAATAAAAGCCCTTATCTAAACCTATCAATATGCC
TCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGGAGAGTTTGTGAGAGCTTCAGCTGAGAGCAGTGCTTGTTTCTAGCTTATTTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTTGTGATTTATAAATAATAGAGCTGTGGCACATTGTTTCTTAGTTGGGAAGCG
TATGGTGCTACTGCCAGCTATGGATACTATCAGTACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTCTACTGCGTCGTTCCATATTTATTCGGTTACTCTAAGTTTGAAATCCAGATTTTAATCAAAGACAAAAGTAAAAGACACAAACCTGGCAAGGATTACTTAACTCTTTTTACCTTGAGTGGATTCTGAAATTTTGATCA
TTGGTATCTACTGCCTTTAACCATTTTATCTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGCCTTAAACCATTTTATTTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATG
ATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGTTGCTTGGAGAGCTTGTGAGTAGCGAGTCTTGGTGGTCGGAACAGTTTCAAGGGCTTCAGCTGAGCAGTGCTGTTTGCAGTTTAATTTTAGGGATTTATAATCAATGT



Intron 6 GTACATTAAG ... TTTTTTTCAG

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A517.671079220243
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A1018.25618113411419



>TRINITY_DN130612_c3_g2_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
AACCTTGATTTACAACTCTAAAAATTCAAAATTCAAATTTTAGGTGGTTCCACAAAATTCCAAATCAAGATTTCTTCGAAATAAGTGCTCCAACTTACCACCAACCTTGCCAGGCAAACAAAGCAAATTATGCCCTGCCATGCCTAACTGGCAATGAGGCTGATAGCCCCCCTGCCTCCCTCAGATAAATGCAAAAACAA
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TCGACATTGGAATTGGAATCTCTGCATGATACTTCCTTCTACGATTTCAAATCCTTTTCAAATCGGCTTACTGGCTCTAACTTTGAGCGCAAATTTGAGATCTCGTATTGGTTTCATTTGAACTCGAAGGAAATGAGAGAAATTATCAGCATTCACATCGGCCAAGCGGGGATTCAGGTCGGGAATTCGTGCTGGGAGCT
CTACTGTCTCGAACATGGAATCCAGCCCGATGGTATGATGCCCAGTGATACGTCGGTGGGCGTCGGAGACGATGCGTTCAACACTTTTTTCAGTGAGACAGGAGCTGGGAAACATGTTCCGAGAGCTGTGTTCGTAGATCTGGAACCCACGGTCATAGACGAGGTTCGAACCGGGACATATCGGCAGCTCTTCCATCCTG
AACAGCTGATCTCGGGCAAAGAAGACGCGGCCAACAACTTCGCTCGCGGGCATTACACTGTGGGGAAGGAGATTGTGGACCTCTGTCTAGATCGGGTGAGGAAGCTGGCCGATAACTGCACGGGTTTACAGGGTTTTTTGGTTTTTAATGCTGTTGGAGGTGGAACTGGATCTGGTCTAGGTTCTTTGCTTTTGGAACGA
CTCTCTGTTGACTATGGAAAGAAATCAAAGCTTGGATTCACTATTTACCCTTCGCCTCAGGTTTCTACTGCAGTTGTGGAACCATACAACAGTGTCCTTTCAACACATTCTTTGCTGGAACACACAGATGTTGCAGTGCTTCTAGACAATGAAGCCATATATGACATTTGTAGAAGATCCTTGGATATTGAGAGGCCAAC
TTATACCAACTTGAATAGGTTAATCTCTCAGATCATATCCTCTCTGACCACGTCTCTTAGGTTTGACGGGGCCATTAATGTGGATGTGACAGAGTTTCAGACTAATCTTGTACCATATCCTCGAATTCATTTCATGCTTTCTTCCTATGCTCCAGTAATCTCTGCAGAGAAAGCCTATCATGAGCAGCTATCTGTGCCTG
AGATCACCAACGCAGTGTTTGAACCCTCAAGCATGATGGCCAAGTGTGACCCTAGGCATGGGAAATACATGGCTTGCTGTCTCATGTACCGGGGGGATGTTGTGCCAAAGGATGTGAATGCAGCAGTAGCAACCATCAAGACTAAACGGACTGTTCAGTTTGTAGACTGGTGCCCCACAGGATTCAAATGTGGTATCAAT
TACCAACCACCCACAGTGGTGCCTGGAGGAGACCTTGCTAAGGTTCAACGTGCAGTGTGCATGATTAGCAACAATACTGCTGTTGCTGAAGTCTTTTCTCGGATTGACCACAAGTTTGATTTGATGTATGCCAAACGTGCATTTGTCCATTGGTATGTAGGCGAGGGTATGGAAGAGGGTGAATTCTCTGAAGCCCGTGA
AGACCTGGCTGCTTTGGAGAAGGATTATGAAGAAGTTGGGGCAGAGGCTTCTGACGAAGCTGATGATGGAGAAGAATACTGAACTTCTATTCGCCCTGGTTCTCCTATTGGTTGAATTGGAATAAACTGTAAGGGTGGCTTGTATTGCCTTGATCTATTTTGTAATTTGCTATTCTCTGATTCCAGTGTGCAGTGCTCGC
TGCACAAATTTTTATTTGTTAATATGTGTACGGCAGCAGGATTCTGTTTTTTCTAAAGTGTAGGATCAATCCAACAAATTATGCTTCAATCTGTGTGTAATGATAGTCTTCCACTTGTAGATCATATAATTTTTCTTGTCATCTAAAATTTAAGTAGAGACAAAATGGAAACAGAGTTTTGACTATGGTTACATCCCGTT
GGATATGAGTTACCTTCTCTAAGTGCCAAGTTTATGTACCATGTACATATATCGATGCACCAAATGGCATTGTGTGTTACTGCCAATGTGCAAACATATATAAGGTAAGCAAAGCTGGACATATCCCTTTGTCTTTAGTATGCTAGCACTTAATTGGCAATGACATTACTATCACGAGTCGTGATAGCATGCATCTTTGC
AATGTGCTTTTAGAACAGGTGTATAGAAATTGGCATTATGCATGGTCATAGTTTGTTATGGCATTATCATGCAGCACACGATGAATTGTTCATATTTGTCAACCACAAGCACATATAAGAGATGGAATAATTGGTAACTCTGTCAAGATTTATAATACCTTTGGAGACCTATTTAAAGATTTATTTACAAATTCAGGTCT
TCATTGCTTTTCTTTCTCTTCCAAGTAGCAGGGGAACTGCTCTTGGCGGTTGGGGAACGGTTCCAGGAGCTGCTCTCAGTGGAGTTCATGGTCTGTTCTGCGATCCTCTAGGTCCACACATGCCCAAGACAAACTGCCAGACGCTCTCATTTCATGCCAATGTTAGTGCTCTTGGGCCCACAAACACGCACTGATACCAT
AAGAGCATTTTTATGATAATAAAAGCCCTTATCTAAACCTATCAATATGCCTCGTGAAAAGAGAAAAGACTCTGTTATTCAGCTTTTGCATTCAAAATTTTTGGATTTCCCTTTGTGCTTGGAGAGTTTGTGAGAGCTTCAGCTGAGAGCAGTGCTTGTTTCTAGCTTATTTTTAGGGATTTATAATCAATGTCATGGTT
GTGATTTATAAATAATAGAGCTGTGGCACATTGTTTCTTAGTTGGGAAGCGTATGGTGCTACTGCCAGCTATGGATACTATCAGTACAATACAGTATATTTGGATAGCAGACTCTACTGCGTCGTTCCATATTTATTCGGTTACTCTAAGTTTGAAATCCAGATTTTAATCAAAGACAAAAGTAAAAGACACAAACCTGG
CAAGGATTACTTAACTCTTTTTACCTTGAGTGGATTCTGAAATTTTGATCATTGGTATCTACTGCCTTTAACCATTTTATCTGAATTTGCTGGAACTTCTGTCCAGAGTGACATGACTGAGAATCAGACATGATAGCTAGAGATCTTGCAATTCCTGTCTAGTCTTCTGGGTTTCCCTTTGTTGCTTGGAGAGCTTGTGA
GTAGCGAGTCTTGGTGGTCGGAACAGTTTCAAGGGCTTCAGCTGAGCAGTGCTGTTTCTAGTTCCATGAACCATATGTAAAGCAAATACAAATTTTCACTTGTAGTGCAAAAATTGATGCTTTCTTGTGTCCTAAAGACAAAATCATTTTTTGGGTTGATATCTTCTTAATAAGGCAAATTTGTTGTAGTCTATTTGTCT
CTGGAAAAATGTGCTTCTCTTTTTGTCAATATTTTTGCATATTATGTTTTATTTCCAAGCATTTTGTTTGAATGTGGGAACTTTGTTGTTAGATTACCTTGTAATTGTCAATGTAAAGAAAGAGTATGA


>TRINITY_DN130612_c3_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AACCTTGATTTACAACTCTAAAAATTCAAAATTCAAATTTTAGGTGGTTCCACAAAATTCCAAATCAAGATTTCTTCGAAATAAGTGCTCCAACTTACCACCAACCTTGCCAGGCAAACAAAGCAAATTATGCCCTGCCATGCCTAACTGGCAATGAGGCTGATAGCCCCCCTGCCTCCCTCAGATAAATGCAAAAACAA
TTGAAATTGAAAAGGATGATAATTGATAGAAGGGTCCACACCCAAAACGGAATCCAAACAACACTCAAATATAGCGGAATGCTTCTAGGGAATTTTGTCAATGCTTCATAAACTAGCGAGGCATCTAAGTTTGGAGAAGTGAGGCAGCGCAGCTTCTAGATAACCGTAGTTGATGATATATATGCCCGCCTGCCTGTAGG
TCGACATTGGAATTGGAATCTCTGCATGATACTTCCTTCTACGATTTCAAATCCTTTTCAAATCGGCTTACTGGCTCTAACTTTGAGCGCAAATTTGAGATCTCGTATTGGTTTCATTTGAACTCGAAGGAAATGAGAGAAATTATCAGCATTCACATCGGCCAAGCGGGGATTCAGGTCGGGAATTCGTGCTGGGAGCT
CTACTGTCTCGAACATGGAATCCAGCCCGATGGTATGATGCCCAGTGATACGTCGGTGGGCGTCGGAGACGATGCGTTCAACACTTTTTTCAGTGAGACAGGAGCTGGGAAACATGTTCCGAGAGCTGTGTTCGTAGATCTGGAACCCACGGTCATAGACGAGGTTCGAACCGGGACATATCGGCAGCTCTTCCATCCTG
AACAGCTGATCTCGGGCAAAGAAGACGCGGCCAACAACTTCGCTCGCGGGCATTACACTGTGGGGAAGGAGATTGTGGACCTCTGTCTAGATCGGGTGAGGAAGCTGGCCGATAACTGCACGGGTTTACAGGGTTTTTTGGTTTTTAATGCTGTTGGAGGTGGAACTGGATCTGGTCTAGGTTCTTTGCTTTTGGAACGA
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