sp|Q93V58|GRIK1_ARATH ----> Serine/threonine-protein kinase GRIK1

Intron 1 GTAGAATGCC ... TTTTCAATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.07	98.4	9.6	30.1
A2	19.65	70.2	7.7	17.6
A3	22.92	101.4	4.8	30.4
A4	20.16	71.1	9	18.2
A5	23.9	25.1	1.6	7.8
A6	20.23	223.5	10.1	57.9
A7	21.77	303.2	51.2	86.1
A8	24.78	171.5	15.8	58.1
A9	19.65	282.9	13.6	70.4
A10	24.8	243	15.9	81.4

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGGCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGT
TATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATAT
TTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTAT
ATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGG
GTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTCTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGA
GGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACC
TTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTG
CTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAAT
GAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTG

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGGCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGgtagaatgcctcaaactttgctcgttaaaccaatactgtcagctcaaggtttgggcaaacggtgtttcttattg
ttttacagttaaccttgtatatgtagactagatgactaggctgagctgttgctaatttgtactgtaatcatagcttccatgatatatcgtctatcttgtttgttgtcagattacattctgatactctacatatattttcaagtcatgtttgttctcttgtaaatgaaagagcagaggaaaggaagaaagggtcacaattt
aaggcacaaattctttagttgtcaaaatggacgtgacaatttttgttgtctcttttcaatagGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGGTAAATGAATCTATGCTGCTTT
ACTTTTCAAACAAGCTGGAGGGAGGGAAATACTTATTTTCTTGTTGATGATGGCTTAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTG
CGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTT
TGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTT
GCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTCTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTAT
ATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTAT
TGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATT
AAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGC
ATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTG

Intron 2 GTAAATGAAT ... CTTCTTCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.79	134.5	17.5	35.5
A2	20.01	114	15	33.5
A3	17.54	162	17	38.5
A4	20.83	110	11.5	34
A5	16.73	30	3	7
A6	14.96	421.5	31.5	87.5
A7	15.04	425	60	85.5
A8	18.77	317	33.5	86.5
A9	14.71	428	43.5	86
A10	16.94	339	36	81

>TRINITY_DN116284_c1_g1_i5 from sample A3 / Example spliced isoform

TTTCTTTCTCCAGTTTGTCTAACCAATCCCTTTAAACAACAAAAAATATCCCATTGCAGAGTCTGACCTCTGTGTGGTCTCATCACTGAAATCTTTTGAGTATTTTCAGTCTTTACAAATTTAAGAGAGAGCCCTCTCTGGTTGTATTGGTTAGAATACAAACTAAAGTAGGTTTGTGGTTACCTTGGGATTCCTCTTTG
CAGCTGAGGGGATTTTCTGAGTGTTAACACCATGCAAACTAAAGTAAAAGTTTTAAGAAAACGGTACTCCTTCCGACCATTTCATTGCAGCAATCATGTGCTCACTTGTCAAATTTTTGGTATTTATAGCTATTTTTGGCCATAAGATATTAAGATGTGAAAACTTTATAATTCCCTTCCTATAGAATGCTTATGTTAAA
AATTAATCTAATATTTCAACAGGTAGGTTACATCTTTACATATAGAAGTAAAATTGAACATATTTTGTATTTGAATTCATATGGATATTTAAGCTACAGATCACAAAGATCCCAAAGGGATTGTGTTTTGCATTGGCCTGCTTACGTGCTAGCTTTACAAAATAAGTGAGAGTAGTGCATGTGAACATAAAGCAGCTTCT
TTATGGAGATATCTCTGTCCCGATTGGAAATGAATTGAATCCAGTGATCATGACTATCCATAACAGTTCCTATAAATGCCTTCACCCTGTGCACGAGGAAAATTTGGGTTCAAACTTCAAGTCCTTTCCTGTTGGCAATTATTACCTACTGTCTCCATTTTTCTTGTACTTTGTTTCTTTCATTTGATGGAATAAATCAT
AAAAGGTTTTCTTCAGAATCCGACTCTACAAATTTTTACTACCAAATTTCCAAATATTTATAGATTCCTTACATTGTGAAATAAATTTCAAATATTTATGGATTCCTTACATTGTTTTTACTAAAATAATTTGAAGGTTAGACTACCAATCATTCTCTCTCTACTGTTGGAAAAGGACAAAAGTTTCATCTTGAAACTTA
GCTTCTTTTTACTGTGTCAAAGTTGGACTCACTTCCATCCACCTTCTTGGTTGGGAACCTGTTATTTACTGTGCAGAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGGCAAGAATGTTGCTCTCTCAGTGTACCA
TCCTTTTTGATAGTGAACGTGTTCTAATCATGAGCACTCATACTGCACCATTTTGTAGTTGTAGACAATTACAAAATGTCTACTGTTAACAGACTTTTGTTACGTGTGTAATATTTATTAAATGCTAAAATCGAACAATATGCATTCAACAACTGGGAGGGAATGTTTTACAAAATGCCGATGTTCCTTTGGATGTATAC
AGGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATGATATGAATCCAG
AACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAA
TCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTA
ATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAA
TATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAA
CTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCAT
TGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGC
ATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTGAGTTTGATTCCTTTTATATTGGCTTCTATTATCTAATAATCATTCCA
GAAGCACTGGTAAGGAACTGATGCCTTTAGTTTATGCAGTGATGTGTCCATAGCCATTTCCCGTTTTTGGTAAAATTTGCGATATCCATCTTTGTCTGAACTTAAAATTTACGAATGCCCTGATAGGTTCAAAGTTCATGGTGAAGATGGTGGTATGTTAAGCCACCCACAGAGGTTCAATTTCCCAAGTCATGAATAAG
TAATTGGAACCAGGTGCAAGCCCTGGGTGATTTTGACGGTAGAGTAGCCCCCTATCGCAGCAGGCTGCAGCTTAGTCAAACGAAAGTGCTTATGTTCAGTTGTGGTTTGCCCCTCATGGTGCCATTTTACCAGCGCAAGCAGGCCGCTTTTGGTGTTTGACCTCCCAGGGCATTGTAACGTTTCTCTTTGAGCTTAGAAG
GAAACGATTGCAAAAGAATTTGCAATCAGAGGCAGCAAAGTGAGCTGCAGTTATTATCGTTAAAAGAGTTGAATGGGGAAATGCTGGAAATTTCTGGGTATTGCACAAACTTGTAATGATAGCTCACAAGGTAAAACAGCAATCCATATTGCAGTTTTTGTATTCATTGGGTTTTCAAAACTAACTGTTTATTGATTGTT
AATTACACAAATTTTCGCTTGTAACTAAATTGTGATGTTCTGT

>TRINITY_DN116284_c1_g1_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTTTGTTCTCTTGTAAATGAAAGAGCAGAGGAAAGGAAGAAAGGGTCACAATTTAAGGCACAAATTCTTTAGTTGTCAAAATGGACGTGACAATTTTTGTTGTCTCTTTTCAATAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCA
TTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGgtaaatgaatctatgctgctttacttttcaaacaagctggagggagggaaatacttattttcttgttgatgatggcttagattgttcacgatccactacttcttccagATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGGTAAGTGAC
TTTTCCCATTTGAACTTTTTACAGAATAGATTTTAAGAGTTGCATTGCTGCAAATTTTGAAATTCACCTTAATAGTCAAACTGCCACTATTGAATTTCATAGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAG
GGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATG
CTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCG
GTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGT
TTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGG
TGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCA
GAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATG
GAACCTTGCTTGGGGATTGAGTTTGATTCCTTTTATATTGGCTTCTATTATCTAATAATCATTCCAGAAGCACTGGTAAGGAACTGATGCCTTTAGTTTATGCAGTGATGTGTCCATAGCCATTTCCCGTTTTTGGTAAAATTTGCGATATCCATCTTTGTCTGAACTTAAAATTTACGAATGCCCTGATAGGTTCAAAG
TTCATGGTGAAGATGGTGGTATGTTAAGCCACCCACAGAGGTTCAATTTCCCAAGTCATGAATAAGTAATTGGAACCAGGTGCAAGCCCTGGGTGATTTTGACGGTAGAGTAGCCCCCTATCGCAGCAGGCTGCAGCTTAGTCAAACGAAAGTGCTTATGTTCAGTTGTGGTTTGCCCCTCATGGTGCCATTTTACCAGC
GCAAGCAGGCCGCTTTTGGTGTTTGACCTCCCAGGGCATTGTAACGTTTCTCTTTGAGCTTAGAAGGAAACGATTGCAAAAGAATTTGCAATCAGAGGCAGCAAAGTGAGCTGCAGTTATTATCGTTAAAAGAGTTGAATGGGGAAATGCTGGAAATTTCTGGGTATTGCACAAACTTGTAATGATAGCTCACAAGGTAA
AACAGCAATCCATATTGCAGTTTTTGTATTCATTGGGTTTTCAAAACTAACTGTTTATTGATTGTTAATTACACAAATTTTCGCTTGTAACTAAATTGTGATGTTCTGT

Intron 3 GTTGGTTTAG ... TTGCTGATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.37	134	8	25
A2	12.95	88	0	15
A3	13.48	110	2	19.5
A4	15.24	97	5	19.5
A5	12.9	60	0	9.5
A6	10.16	145	0	18.5
A7	9.45	236	0	27.5
A8	8.15	118	0	11.5
A9	10.95	189	1	26.5
A10	9.96	185	0	23

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGGCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGT
TATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATAT
TTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTAT
ATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGG
GTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTCTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGA
GGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACC
TTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTG
CTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAAT
GAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTG

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GCCCTTTTTGAGGTGTACTTTTATCTTCTTTAATGCTTTTATAGGCTCATCCTCATCCTTTTCTATTAAAAACATTTTCTTTATATCACGGCTTTCTTTTGCTTCACAGGGCTGTAACACTATATTTTTCCAATTTGTCAACACAACAACTTTCTAGGCCTGCACTGACAAATGTAGTATTTACCTTTTTTCTTTGAAGA
ACTTTGTGTAACAAAGCTTCTTGAGCCTGAAACCTGCATAATATTTCTTTAAATGAGGGTGTTGCATTTATCTAGTTTACAATGATGTTGATTTTTTTCATTTCTGTGTAGTCAAATACGAAAATTGTTAAATTGGAAATGGTATTTTAGTCTAAAAGTATCCCATAATCTTCTACATGAATTTGTGTAGGACATGAATG
GCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGgttggtttagattttctactctatgaaataaggtttatttcattctaagcacaagtgaagagaaccatactgatcgtacctctgtttttgggttgctgatagGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTG
TATGCCCTCAAGGTACTACATTGTAACTGTGCATTTCTGATTTCTTCATTCTTGAAGCTTATGACTGCACTTGACAGTATGCAAACCAGTGTATTTCCCTCCAATAAATTTATACAATATCCCAATTTCAGCTTCAATAACTTGGAATTTCTTCTGTCAGGCATGTAAAAGTTTTTAACTAGGATTTGTTCAAAATGGCA
TCAGATAACTTAGAGTGGATTCAGTTAAGTGCTAGTTCAAGTCTTTTTCAAGTGCTAGTTCAAGTCTTTTTCATATGACCCTTTAAAAGACTTGAAATATCCTTACACTTTGCTGAAGCTAAATCAAACAAATGGCATATTGTAGGT

Intron 4 GCAAGAATGT ... ATGTATACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.22	95.6	21.2	5.8
A2	16.63	79.7	19.1	19.3
A3	16.56	96.7	21.8	5.2
A4	15.56	99.7	23.9	8.5
A5	15.28	43.6	9.6	3.4
A6	13.23	201.5	38.2	7.3
A7	16.32	294.6	68.2	29.2
A8	15.39	149.2	34.9	15.1
A9	14.18	308.1	66	10.9
A10	14	239.4	48.2	18

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i7 from sample A1 / Example spliced isoform

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGGCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTC
ACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGA
AGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGT
TATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAA
GGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTCTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTA
GCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGAT
GGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAA
AAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAA
CTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTG

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i11 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTTGAAGGTTAGACTACCAATCATTCTCTCTCTACTGTTGGAAAAGGACAAAAGTTTCATCTTGAAACTTAGCTTCTTTTTACTGTGTCAAAGTTGGACTCACTTCCATCCACCTTCTTGGTTGGGAACCTGTTATTTACTGTGCAGAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGG
AACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGgcaagaatgttgctctctcagtgtaccatcctttttgatagtgaacgtgttctaatcatgagcactcatactgcaccattttgtagttgtagacaattacaaaatgtctactgttaacagacttttgttatgtgtgtaatatttattaaatgctaaa
atcgaacaatatgcattcaacaactgggagggaatgttttacaaaatgccgatgttcctttggatgtatacagGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGTAGAATGCCTCAAACTTTGCTCGTTAAACCAATACTGTCAGCTCAAGGTTTGGGCAAAC
GGTGTTTCTTATTGTTTTACAGTTAACCTTGTATATGTAGACTAGATGACTAGGCTGAGCTGTTGCTAATTTGTACTGTAATCATAGCTTCCATGATATATCGTCTATCTTGTTTGTTGTCAGATTACATTCTGATACTCTACATATATTTTCAAGTCATGTTTGTTCTCTTGTAAATGAAAGAGCAGAGGAAAGGAAGA
AAGGGTCACAATTTAAGGCACAAATTCTTTAGTTGTCAAAATGGACGTGACAATTTTTGTTGTCTCTTTTCAATAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAG

Intron 5 GTTGGAACTA ... GGTATTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	4.6	146	0	7
A2	8.78	84.1	2	8
A3	2.79	106.3	0	3
A4	0	96.9	0	0
A5	5.3	54.3	0	3
A6	0	195.5	0	0
A7	0.7	286.8	0	2
A8	0	128.5	0	0
A9	0	256.8	0	0
A10	0	192.4	0	0

>TRINITY_DN115679_c0_g1_i9 from sample A2 / Example spliced isoform

GGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTACTACATTGTAACTGTGCATTTCTGATTTCTTCATTCTTGAAGCTTATGACTGCACTTGACAGTATGCAAGGAACACACCATGCTTGAGATTTTGTTTTTTAGGCATGCAAACCAGTGTATTTACCTCCAATAAATTTATACAATATCCCAATTTCAGCTTCAATAACTTGGAATTT
CTTCTGTCAGGCATGAAAAGTTTTTAACTAGGATTTGTTCAAAATGGCATCAGATAACTTAGAGTGGATTCAGTTAAGTGCTAGTTCAAGTCTTTTTCAAGTGCTAGTTCAAGTCTTTTTCATATGACCCTTTAAAAGACTTGAAATATCCTTACACTTTGCTGAAGCTAAATCAAACAAATGGCATATTGTAGGTCATT
GATGCTAGTAAAAAATGTTGGTAATTTGAATTGCAAAAAAATTAGATTCCAAATTTTGGTGTTGTTTGCTGCAACCTGCTCATGTATTGGCAGCGAGATTGCTGATACTTCACAGTATTTTCCTTTCAGAAATTTTTGAGAACCACACAGTATACTTCATCTCTCTCAGGTGTGCACAACAAAAGATATCAGATACAAGG
CACACAAAAGAAGATGAAAGTGAATAATTCCTACAAAAGAGACAATTTCTAACCAAGAAAGAATCTCTGAAAATGAAATAACAGTGTCTACATGAAAGAGGTTTATAACTTTATACATTTTATCTATAGACCTTAATGTAAATCTTTCAAACTTGACCAGTGAAGACATAAAACTAATGATTGAAGTATGGACCTACATG
ATATATGATTGCTGGAATACAAGTTCATGTTGCCTTTTTGTTCAATCTTCAATCCCTACAATATAGTGTTCTATTTACTAGCAATCATGTAAAATGAATATTCTAAGAAGGCGAATGGAAACATACATCCTCAATCTACCACCAATTTTGCTTTGATATGATCGTTCTGGATTCTAAATGCAGGTTTTCCACAGGCATCG
TCTTTCCAAAGTGCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAG
GAATTGGGGAAGATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCGGGT
ACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGC
AAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTT
AACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGTGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAAT
TGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGC
TTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTT
TCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGG

>TRINITY_DN115679_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TGACAGATGTTCTAAGAGAGgttggaactattaacactttcattctaagattttagggctttagcaggatacatctagggtactgtagcattgtttcttctgacatttgtatttggtatttcagGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATC
AATTTTACTTGGGTAAGAGACTTTGTTTTCTTGTGCTATTTTGCATTAGTCGTTGAATGCTAGTCC

Intron 6 GTAAATGAAT ... GATGGCTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.08	139.8	33.2	26.6
A2	20.48	105.4	27.2	29.1
A3	14.86	157.1	27.5	21.6
A4	14.25	122.1	20.4	28.2
A5	16.5	29.4	5.8	6.8
A6	13.51	382.6	60	50.3
A7	21.68	405.3	113.3	58.8
A8	17.5	281.6	59.9	57.9
A9	17.65	381.1	82.3	43.9
A10	17.49	317.7	67.9	54.7

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGGCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGT
TATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATAT
TTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTAT
ATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGG
GTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTCTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGA
GGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACC
TTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTG
CTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAAT
GAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTG

>TRINITY_DN124394_c1_g4_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGGCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGTAGAATGCCTCAAACTTTGCTCGTTAAACCAATACTGTCAGCTCAAGGTTTGGGCAAACGGTGTTTCTTATTG
TTTTACAGTTAACCTTGTATATGTAGACTAGATGACTAGGCTGAGCTGTTGCTAATTTGTACTGTAATCATAGCTTCCATGATATATCGTCTATCTTGTTTGTTGTCAGATTACATTCTGATACTCTACATATATTTTCAAGTCATGTTTGTTCTCTTGTAAATGAAAGAGCAGAGGAAAGGAAGAAAGGGTCACAATTT
AAGGCACAAATTCTTTAGTTGTCAAAATGGACGTGACAATTTTTGTTGTCTCTTTTCAATAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGgtaaatgaatctatgctgcttt
acttttcaaacaagctggagggagggaaatacttattttcttgttgatgatggcttagATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTG
CGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTT
TGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTT
GCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTCTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTAT
ATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTAT
TGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATT
AAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGC
ATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTG

Intron 7 GTACTACATT ... CTAAATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25.59	157	0	54
A2	24.82	106	0	35
A3	24.68	119	4	39
A4	20.69	92	0	24
A5	28.26	66	0	26
A6	31.35	173	0	79
A7	27.32	258	0	97
A8	25.97	134	0	47
A9	30.21	231	0	100
A10	24.9	190	0	63

>TRINITY_DN115679_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoform

AGAAAATCAACTTAAAATGCTAGGAGCTATCTCCATTCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGCTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAAAGAAGAAGC
AGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGCCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCTTCTTGCAGA
AGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGTGCGTGTGGC
ACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAGATACTGCCA
GAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATGTAAGTTCTTCCGAGGATAAATTTAATTAAGGTAACACATATTGCACACTTATGGATCTATGATATTGGTGCTGCTGCTTTCTTTCGAAACTGTTTGCAGAATAGATGGGTGCAGATGGAACAACTTGATTATTATATATATTGAGCAGG
AAGTCTGCAATGTCTCAGGTTTATTTTAGTCATTGAAAGACACAAGGAATAATTTTAGCACAAAGAGGTTCGTAGATAGGATGAAGATTGTCTACTACCTATTATCTATGAACATATTTATATTGAGCAGGAAGTCTGCTATGTTTCATTTCTATATTAGTTATTGAAAGACACAAGGAATAATT

>TRINITY_DN115679_c0_g1_i9 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGAAAGCTGTATGCCCTCAAGgtactacattgtaactgtgcatttctgatttcttcattcttgaagcttatgactgcacttgacagtatgcaaggaacacaccatgcttgagattttgttttttaggcatgcaaaccagtgtatttacctccaataaatttatacaatatcccaatttcagcttcaataacttggaattt
cttctgtcaggcatgaaaagtttttaactaggatttgttcaaaatggcatcagataacttagagtggattcagttaagtgctagttcaagtctttttcaagtgctagttcaagtctttttcatatgaccctttaaaagacttgaaatatccttacactttgctgaagctaaatcaaacaaatggcatattgtaggtcatt
gatgctagtaaaaaatgttggtaatttgaattgcaaaaaaattagattccaaattttggtgttgtttgctgcaacctgctcatgtattggcagcgagattgctgatacttcacagtattttcctttcagaaatttttgagaaccacacagtatacttcatctctctcaggtgtgcacaacaaaagatatcagatacaagg
cacacaaaagaagatgaaagtgaataattcctacaaaagagacaatttctaaccaagaaagaatctctgaaaatgaaataacagtgtctacatgaaagaggtttataactttatacattttatctatagaccttaatgtaaatctttcaaacttgaccagtgaagacataaaactaatgattgaagtatggacctacatg
atatatgattgctggaatacaagttcatgttgcctttttgttcaatcttcaatccctacaatatagtgttctatttactagcaatcatgtaaaatgaatattctaagaaggcgaatggaaacatacatcctcaatctaccaccaattttgctttgatatgatcgttctggattctaaatgcagGTTTTCCACAGGCATCG
TCTTTCCAAAGTGCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAG
GAATTGGGGAAGATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCGGGT
ACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGC
AAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTT
AACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGTGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAAT
TGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGC
TTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTT
TCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGG

Intron 8 GTTAAGATTT ... GATGTTTGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70.69	42.3	112.8	93.8
A2	50.94	103.5	148.3	77.5
A3	56.21	91	148.3	94.5
A4	61.08	69.5	135.3	95.8
A5	56.68	37.3	60.3	42.3
A6	55.01	192.8	301	195.5
A7	57.64	256.8	441.5	286.8
A8	58.04	118.3	201.8	143.8
A9	62.97	190	382	297
A10	58.07	197.5	337.3	233.3

>TRINITY_DN106393_c1_g1_i9 from sample A5 / Example spliced isoform

TAGAAAATCAACTTAAAATGCTAGGAGCTATCTCCATTCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGCTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAAAGAAGAAG
CAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGGCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCTTCTTGCAG
AAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGTGCGTGTGG
CACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAGATACTGCC
AGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGCGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGACAGCAATGATGAGCC

>TRINITY_DN106393_c1_g1_i8 from sample A5 / Example unspliced isoform:

GTGAAGAGAACCATACTGATCGTACCTCTGTTTTTGGGTTGCTGATAGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGTGCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAA
TATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAGATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGCGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATA
TCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAgttaagatttccgacttcagtgttagcaggatgtttgagGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCGGGTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATAC
TGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTT
TGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCC
TTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACT
TTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCC
CCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGA
CGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAA

Intron 9 GTAAAACAGC ... GTTTTGCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	100	0	8	0
A2	71.43	1.1	2	2
A3	33.33	3	3	0
A4	100	0	1	1
A5	-1	0	0	0
A6	68.75	5	18	4
A7	62.75	3.1	5	5.1
A8	66.67	10	27	13
A9	60	6	12	6
A10	71.35	4.9	12	11.9

>TRINITY_DN47447_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGCCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCGGGTACCCCTATTTTC
ACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGA
AGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTCTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGT
TATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGTGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAA
GGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTA
GCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGAT
GGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAA
AAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAA
CTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAATTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTGAGTTTGATTCCTTTTATATTGGCTTCTATTATCTAATAATCATTCAAGAAGCACTGGTAAGGAACT
GATGCCTTTAGTTTATGCAGTGATGTGTCCATAGCCATTTCCCGTTTTTGGTAAAATTTGCGATATCCATCTTTGTCTGAACTTAAAATTTACGAATGCCCTGATAGGTTCAAAGTTCATGGTGAAGATGGTGGTATGTTAAGCCACCCACAGAGGTTCAATTTCCCAAGTCATGAATAAGTAATTGGAACCAGGTGCAA
GCCCTGGGTGATTTTGACGGTAGAGTAGCCCCCTATCGCAGCAGGCTGCAGCTTAGTCAAACGAAAGTGCTTATGTTCAGTTGTGGTTTGCCCCTCATGGTGCCATTTTACCAGCGCAAGCAGGCCGCTTTTGGTGTTTGACCTCCCAGGGCATTGTAACGTTTCTCTTTGAGCTTAGAAGGAAACGATTGCAAAAGAAT
TTGCAATCAGAGGCAGCAAAGTGAGCTGCAGCTATTATCGTTAAAAGAGTTGAATGGGGAAATGCTGGAAATTTCTGGGTATTGCACAAACTTGTAATGATAGCTCACAAGGAAGGGGACTTGGAATAAATGGCACTTGCTGTACTATTAGATTTGGATGTTCTAAATTGTTGACCCTGAAAATAATATTTATTGGTTTC
GTGTACAATTAGTCGTGAT

>TRINITY_DN47447_c0_g1_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGTTGTAGATGCTTCGGATTCATGAGAA
AGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGCCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAGATTTGAATGGATCT
TCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCATCGTCTTTCCAAAGT
GCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGGAGGAATTGGGGAAG
ATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCGGGTACCCCTATTTTC
ACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGA
AGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTCTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGT
TATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGTGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAA
GGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTA
GCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGAT
GGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAA
AAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAA
CTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAATTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTGAGTTTGATTCCTTTTATATTGGCTTCTATTATCTAATAATCATTCAAGAAGCACTGGTAAGGAACT
GATGCCTTTAGTTTATGCAGTGATGTGTCCATAGCCATTTCCCGTTTTTGGTAAAATTTGCGATATCCATCTTTGTCTGAACTTAAAATTTACGAATGCCCTGATAGGTTCAAAGTTCATGGTGAAGATGGTGGTATGTTAAGCCACCCACAGAGGTTCAATTTCCCAAGTCATGAATAAGTAATTGGAACCAGGTGCAA
GCCCTGGGTGATTTTGACGGTAGAGTAGCCCCCTATCGCAGCAGGCTGCAGCTTAGTCAAACGAAAGTGCTTATGTTCAGTTGTGGTTTGCCCCTCATGGTGCCATTTTACCAGCGCAAGCAGGCCGCTTTTGGTGTTTGACCTCCCAGGGCATTGTAACGTTTCTCTTTGAGCTTAGAAGGAAACGATTGCAAAAGAAT
TTGCAATCAGAGGCAGCAAAGTGAGCTGCAGCTATTATCGTTAAAAGAGTTGAATGGGGAAATGCTGGAAATTTCTGGGTATTGCACAAACTTGTAATGATAGCTCACAAGgtaaaacagcaatccatattgcagtttttgtattcattgggttttcaaaactaactgtttattgatttttaattacacaaattttcgct
tgtaactaaattgagatgttctgttgtgccagGAAGGGGACTTGGAATAAATGGCACTTGCTGTACTATTAGATTTGGATGTTCTAAATTGTTGACCCTGAAAATAATATTTATTGGTTTCGTGTACAATTAGTCGTGAT

Intron 10 GTAAGTGACT ... AATTTCATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	11.09	97.1	0.9	12
A2	14.83	97.9	1.7	17
A3	16.48	134.7	3.4	26
A4	9.55	76.1	3.4	8
A5	30	32.7	0.9	14
A6	13.66	353.3	0.9	55
A7	16.39	309.9	11.8	60
A8	15.8	274.3	4.3	51
A9	12.76	334.1	2.6	48
A10	13.71	261.5	5.7	41

>TRINITY_DN116284_c1_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoform

TATAAATTTCCATTCCACCCCTGAGAAAATCAACTTAAAATGCTACGAGCTATCTCCATCCGTGCAATTTATGTTTCCACTGATTTTTCTCCGCAATCTTTCTGTGTTGCATTCTTGTACTGAACATGGGCAGATGATTATTATAATCTGCGAATGCTTCTCTGGCTGGAAGAAACAATGGGTTGGTGCTGTAGATGCTT
CGGATTCATGAGAAAGAAGAAGCAGGAGAACCCAAAATTTGTGCCCCCTGCATTCTATGCCAAACATCGGTCCCAGGAACATTTACTCAAGTTCACACATGAAGAAGCTGAGACTACAAAGCAAGCCCAATATGAATACGGCCACAGATTCCCTGCCGCTTCGGACGAAAACAGGCAGGCTTCGAAGCCATCAGTTGCAG
ATTTGAATGGATCTTCTTGCAGAAGTATTCCTGTCAAAGAGACCCACCATATTATTAAATCAGAGGACATGAATGGCAACAAAATGATCAATGAATATGTCCGAGAGCACAAGTTAGGAGCAGGCAGCTACAGCAAAGTGGTACTTCACCGAAATATAAAAGATGGAAAGCTGTATGCCCTCAAGGTTTTCCACAGGCAT
CGTCTTTCCAAAGTGCGTGTGGCACCTTCGGAAACTGCTCTGACAGATGTTCTAAGAGAGGTTTCAATTATGAAAAAGTTGGCCCACCCCAATATTGTCAATTTGGTTGAGGTGATTGATGATCTTGATACTGATCAATTTTACTTGGTCCTAGAGTATGTTGAAGGAAGGGGTATTTTTCAAGGTTGTGGACCAGCTGG
AGGAATTGGGGAAGATACTGCCAGAAGATATTTTCGAGATGTTCTTGCAGGTCTCGTGTATCTCCATGCTCATAATATTTTTCATGGAGATATCAAACCAGAAAACCTTTTGATTGGCAGCAATGGAACAGTTAAGATTTCCGACTTCAGTGTTAGCAGGATGTTTGAGGACAGCAATGATGAGCTTCGGAGGTCTCCTG
GTACCCCTATTTTCACTGCACCAGAGTGTTGCTTAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCATTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTT
GCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAGGGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGT
TTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATGCTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCA
ATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCGGTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGT
GCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGTTTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGT
TTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGGTGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATG
GAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCAGAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTT
GGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATGGAACCTTGCTTGGGGATTGAGTTTGATTCCTTTTATATTGGCTTCTATTATCTAATAATCATTCCAGAAGC
ACTGGTAAGGAACTGATGCCTTTAGTTTATGCAGTGATGTGTCCATAGCCATTTCCCGTTTTTGGTAAAATTTGCGATATCCATCTTTGTCTGAACTTAAAATTTACGAATGCCCTGATAGGTTCAAAGTTCATGGTGAAGATGGTGGTATGTTAAGCCACCCACAGAGGTTCAATTTCCCAAGTCATGAATAAGTAATT
GGAACCAGGTGCAAGCCCTGGGTGATTTTGACGGTAGAGTAGCCCCCTATCGCAGCAGGCTGCAGCTTAGTCAAACGAAAGTGCTTATGTTCAGTTGTGGTTTGCCCCTCATGGTGCCATTTTACCAGCGCAAGCAGGCCGCTTTTGGTGTTTGACCTCCCAGGGCATTGTAACGTTTCTCTTTGAGCTTAGAAGGAAAC
GATTGCAAAAGAATTTGCAATCAGAGGCAGCAAAGTGAGCTGCAGTTATTATCGTTAAAAGAGTTGAATGGGGAAATGCTGGAAATTTCTGGGTATTGCACAAACTTGTAATGATAGCTCACAAGGTAAAACAGCAATCCATATTGCAGTTTTTGTATTCATTGGGTTTTCAAAACTAACTGTTTATTGATTGTTAATTA
CACAAATTTTCGCTTGTAACTAAATTGTGATGTTCTGT

>TRINITY_DN116284_c1_g1_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTTTGTTCTCTTGTAAATGAAAGAGCAGAGGAAAGGAAGAAAGGGTCACAATTTAAGGCACAAATTCTTTAGTTGTCAAAATGGACGTGACAATTTTTGTTGTCTCTTTTCAATAGGCTTGACATATCATGGTAAACTTGCTGATGTGTGGGCATTGGGTGTGACACTATACTGCATGGTGTTGGGTTGTTATCCCTTCA
TTGGGGAATCCTTGCAAGACACATATGACAAGGTAAATGAATCTATGCTGCTTTACTTTTCAAACAAGCTGGAGGGAGGGAAATACTTATTTTCTTGTTGATGATGGCTTAGATTGTTCACGATCCACTACTTCTTCCAGATGATATGAATCCAGAACTTGCAAACTTACTTGAAGGTCTTCTTTGTAAGGgtaagtgac
ttttcccatttgaactttttacagaatagattttaagagttgcattgctgcaaattttgaaattcaccttaatagtcaaactgccactattgaatttcatagATCCGAAGAAAAGGATGAGCTTAGATGCTGTTGCAAGGCATCCATGGGTTGTGAAGGATTTTGCGTCAACTCTGCATATTTTGGGGAAACATGAAGAG
GGTAGCTTCAGATATCATTCTGATCATCATGAGCAAACTGTAGCTTCCTTTGAAGTATAGTCAGAATCAGTTTAACAGGAATGGTTATGGTTTTTATTTACATATTTCATGGCTGCTTAATAAGTCGTGGAAGAGATGTTGTGGTTCTTCAGAAGAGGGCCCCTTTGCTCATTGTATTTATATTGAGGTGTACTATGATG
CTTGTACATTTTATCTATCTCTGACTTTCGATATTCAGCAACATGCTTAAGTTGGATTTCCTTCTAATGCAATTGGGACCTCAAAGGAATATTTTTTGACAGTTCTAAGCATGCAAATAATAATCATGAATCACATGATATGGTGGTTAATGTTCAAAGCACTTTGCGGTCAAGAGGTGGGGTCATTCTTCGAGAACTCG
GTGTTTCTGTTGCAGAATATGTGCCAGTAAGGTGTAGCAAGCAAGTTCGGTGTCTCTGTTGTAGAATATGTGCTTGTAAGATGTAGCAAGCAAGTTCGCCTTACAAGGAACTCCCCAGTGTAATTGATGCTGTTCAATTAAGAATAAAATAATATTGCAAATTATATGTCCTCGTTGTAGAGGGATGTATTGCGGAGAGT
TTTTAAGAACCTTTGTGCATGCAATAACTGTGTTTATGATAGCTTATTCTTTATGGCTTTGTGCAACTGGTTTTCAAGCTAGGATGGTTGCTAGTAGAAATATATCTGCAGAGACGTTGGCCATTTCAAATTGAACTAGAATTGGTCAAGTTAGTTTTCCTGTATTGGAATATTATAGACCTTGCCTTTTATGGTTGTGG
TGCACATTTTGACAAGTGTAACAATAGAAAAACAAGCTAATTGTGTGGCCAGCTTTTTGATGGCATTGATGGAACTTTCTCTGAAAAACTGGTCATATGGGGCTTCATATTTAGATTGTGATAATTCTTATCTATTGACAAAATAGATCTGTATATTCACAAATTAAACCCAATAGATTTGCTGCTGATTTCTGGGAGCA
GAGGGTTTCTATTACTATATATCGGTACCACCATAAAGTGACGAAAGATCAGACTTTGAATGGAGCATTTTGGGAAATCTTGAAACTGATATTGTCTACTTATGGTCGAGTTTGATCAGAACTGCAGTCAGTGCTTATGTCAATCCATTGAACTAACAATAAGGCATTAGAATGTTGGAATGAAATCTGATCAAAATATG
GAACCTTGCTTGGGGATTGAGTTTGATTCCTTTTATATTGGCTTCTATTATCTAATAATCATTCCAGAAGCACTGGTAAGGAACTGATGCCTTTAGTTTATGCAGTGATGTGTCCATAGCCATTTCCCGTTTTTGGTAAAATTTGCGATATCCATCTTTGTCTGAACTTAAAATTTACGAATGCCCTGATAGGTTCAAAG
TTCATGGTGAAGATGGTGGTATGTTAAGCCACCCACAGAGGTTCAATTTCCCAAGTCATGAATAAGTAATTGGAACCAGGTGCAAGCCCTGGGTGATTTTGACGGTAGAGTAGCCCCCTATCGCAGCAGGCTGCAGCTTAGTCAAACGAAAGTGCTTATGTTCAGTTGTGGTTTGCCCCTCATGGTGCCATTTTACCAGC
GCAAGCAGGCCGCTTTTGGTGTTTGACCTCCCAGGGCATTGTAACGTTTCTCTTTGAGCTTAGAAGGAAACGATTGCAAAAGAATTTGCAATCAGAGGCAGCAAAGTGAGCTGCAGTTATTATCGTTAAAAGAGTTGAATGGGGAAATGCTGGAAATTTCTGGGTATTGCACAAACTTGTAATGATAGCTCACAAGGTAA
AACAGCAATCCATATTGCAGTTTTTGTATTCATTGGGTTTTCAAAACTAACTGTTTATTGATTGTTAATTACACAAATTTTCGCTTGTAACTAAATTGTGATGTTCTGT