NA ----> NA

Intron 1 GTATGCATGG ... TGGTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	76.85	25	116	50
A2	79.59	10	65	13
A3	68.42	24	56	48
A4	69.78	21	64	33
A5	74.36	5	20	9
A6	66.67	1	2	2
A7	47.73	23	21	21
A8	71.93	8	15	26
A9	80	2	6	10
A10	58.14	9	9	16

>TRINITY_DN130124_c4_g2_i8 from sample A1 / Example spliced isoform

TGTAGTGCAAGTAATGGAAAGTGGATGGTTGTTGATGAGAATGCTGAAATGTCTTTGTGTGAGAGAGATATGGGGTAGTCAGTAAACAAGGGTGATAAGGTTGTCCTTGAATAGCCATGGAATGATGGAAGCATTCAAGAGTTGTAGAGTGGAGTCTTTGTTTGTTATATCTCTTTGTTTGTTTTTTTGTTTTTATGTTT
TTCGCTATTGTTTTTGTAACTTCTGTTATTATTGTTTTTTTCTTTTTCTATTGCTATATGTGTTTTTATTTTTTCATTTTTTAGCATGGCCATGCTACTTTGTTGTTTGGTATGTGTTTTATTGGTTGTATTCTCGTGTGTTTGTCTTCTTGTTGTT

>TRINITY_DN130124_c4_g2_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGTAGTGCAAGTAATGGAAAGTGGATGGTTGTTGATGAGAATGCTGAAATGTCTTTGTGTGAGAGAGATATGGGGTAGTCAGTAAACAAGGGTGATAAGgtatgcatggtttcaattgtttttgtttaaattagagtcattgtattatttgtcattgctttatcaatttggtttgtgtttaaaatttataatacgatttt
ttggtatctatttaatgcttggcaaaaatttggtgtgcagGTTGTCCTTGAATAGCCATGGAATGATGGAAGCATTCAAGAGTTGTAGAGTGGAGTCTTTGTTTGTTATATCTCTTTGTTTGTTTTTTTGTTTTTATGTTTTTCGCTATTGTTTTTGTAACTTCTGTTATTATTGTTTTTTTCTTTTTCTATTGCTATAT
GTGTTTTTATTTTTTCATTTTTTAGCATGGCCATGCTACTTTGTTGTTTGGTATGTGTTTTATTGGTTGTATTCTCGTGTGTTTGTCTTCTTGTTGTT