sp|Q8H1U4|APC5_ARATH ----> Anaphase-promoting complex subunit 5
Intron 1 GTCAGTGTCT ... GTCATGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 18.33 | 27 | 6.2 | 9.1 |
| A2 | 19.06 | 15 | 3.5 | 7.4 |
| A3 | 26.07 | 10 | 3.5 | 8.4 |
| A4 | 10.71 | 17 | 2.1 | 2.7 |
| A5 | 18.18 | 2 | 0.5 | 0 |
| A6 | 10.82 | 46 | 5.8 | 16.4 |
| A7 | 23.45 | 28 | 8.6 | 4.5 |
| A8 | 22.26 | 44 | 12.6 | 10.3 |
| A9 | 20.91 | 34 | 9.4 | 6.4 |
| A10 | 11.98 | 33 | 4.8 | 5.5 |
>TRINITY_DN110389_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoformCTTTTACTCTGCATATTTCGGACTCTAACCGAAAACACCAATTTTTTTTGGGAGTTGCCGGTGCTGGAAACAGAGAAGCGATGGAGGCGAATAAGCAGCACCATTGAATTTTTACGCCCTATGTAGTTGGTACGGAGGAGAATAAGCATCAGCAGCGAGGGAGTTTTGTGAAGCAGAAGCAGCAGCAGGAGCAATGGCAG
CAGGAGGAGGCAAGGTTTTTGGTATAACAGCACACAAGATTTCCATTTGCGTTCTTCTTCGAGTGTGCGTGGCTCCTTTTTCGACTGAAAATGACGATGATGAGGAGTATCCCTATCCAACGCCCTTCCTTGGCGTCTCTCAACGGCAGCTTCTGTCGTCTTTTTTGATGAAGCTTTCCACGTCTTGCGACAACTTTCTT
GAGCCATCACTTGAAGACCTTATATTGCAATTGAAGGCAGCTCAAGAAGAGATTGGGGAAGATTTGATAGGACATCTATTGCATCATCTTAAGCAGTTGGCTTCTCCTGATGATTTGATCAATCTTTTTACTGGTTTACGAGATGTCTTGCCTAGTTCTGTGAATGAAGAGAATGAGATGCCCAACGCAGATGGGGTTGA
TAAGAAGTTTAACCCAAACAGTGTCTTGGGGCAGTTTGTTCGTCGTTGTATGCTTTCATTCAATCTCTTGTCCTTTGAGGAAACATGTCGTCTTCTGACAAATCTAAAGGCATATTGTAGACGATTTATAAATTTTGATTCCATTGACCCTCTCTATTTTGAGAGCTCATTGACAAAAAGGATGCCAAAGGATGAGGCGT
TTGAATCCGACGATGAAAAATTTGAATATGAAGAGACAATTTCCAGTGGGCAGCACAATGGAGCTAGACACAAAATGAAGATAAGAAAAAGAGGCAGCCATCATTCACGTGTTTCTGAACCATTTACTGAACCAGAGCCGGTGAAATGTAATGATTTCCTTGACCCTAATGGGTTTCAATTGGGTCAATCCGAGAATGGT
GCACAGGATTTGGGATTTGTGTTCACTGCAAGAGATGATAAAGATGATAACTTGGTATCTCTTCAGACATATGGGCAAGTAGAAGGTTATTTGCGAGAGCAGGCTGATTTTATTGAGAAGCAAGTGGAAATTCTTCCCAAGAATGAGTTTGAGTTGAAGCTGAATCAGCTTGAGAAACTTGCACCAGACTTACAGCGGGT
ATGCATAATCAGGCATGGTTTTGAAGAGTGTTGAAGGTGAACTATCTACGGTACCTGAATAGCCTTTATCATGGAGACTATCCTGCTGCCTTACACAGTCTTCATCGATACTTTGACTACAGGAAACATGTCGTCTTCTGACAAATCTAAAGGCATATTGTAGACGATTTATAAATTTTGATTCCATTGACCCTCTCTAT
TTTGAGAGCTCATTGACAAAAAGGATGCCAAAGGATGAGGCGTTTGAATCCGACGATGAAAAATTTGAATATGAAGAGACAATTTCCAGTGGGCAGCACAATGGAGCTAGACACAAAATGAAGATAAGAAAAAGAGGCAGCCATCATTCACGTGTTTCTGAACCATTTACTGAACCAGAGCCGGTGAAATGTAATGATTT
CCTTGACCCTAATGGGTTTCAATTGGGTCAATCCGAGAATGGTGCACAGGATTTGGGATTTGTGTTCACTGCAAGAGATGATAAAGATGATAACTTGGTATCTCTTCAGACATATGGGCAAGTAGAAGGTTATTTGCGAGAGCAGGCTGATTTTATTGAGAAGCAAGTGGAAATTCTTCCCAAGAATGAGTTTGAGTTGA
AGCTGAATCAGCTTGAGAAACTTGCACCAGACTTACAGCGGGTGAACTATCTACGGTACCTGAATAGCCTTTATCATGGAGACTATCCTGCTGCCTTACACAGTCTTCATCGATACTTTGACTACAGTGCAGGGAAGGAAGGACTCGACAACAGTGGAGCTTTTTCAGCTGGAAGGTTCCAGGCTGTGCTCCTTAGCATG
GGAACCATGCATTCTCGGTTTGGCCATCCTGCACATGCTTTAGTGGCTCTTACTGAGGCCATTCAAGAAGCTCAACAGGCTAGTGATAATTCCTGCCTTGCCCATATCTTGGCAGCTTTATGCTATCTTTTTGCTGAGGTTGGTGTTGCTAGCAACTCAGGATGCTTTGATTCAACTATACCTCCTGGGGTTGACATTGG
AGCAAGGTCTTCATTGGCAGTTCAGCAGCAGTTACCGATACTTCTTAGAAGATGTCTCAACAGGGCAGTTGACTTGAAATTGACACATCTTGTTATATTCAGCCGTCTTGCATTGGCAAAATTTGACTTGAAGCATGTACAAAGATCACCACTTTCATTTGGGTTAAAGGTTTCGACAAAGCTAAGAACATTTCCTGTTG
ATGTTTGCAAGGATCTGAGATTAAGCTGCTATGCACTTAGTGAATCTGGAATAGATCCTTCTTCTGCAGTAACTGGTGGCACTTTAACAGATCTTTCTGTCAGTTCCCTGGAAAGACCTGGACGATCATTTCTACTGCCTGGTGATACATACAGAAGTCATGGTCCCATTCCTAGATCTATAGTGCAGTTGGCTGGCAAT
TCTTACCTGCTTAGGTCTACATCATGGGAGATGTATGGGAGTGGTCCATTGGTTCGCTTGAATGCTTTGGTTCATGCTATTTGTTATGCAGATGCTGCGAGTGTAGATGATTTGTGTTTGGCTTATGTTAAACTTATACAACATCTTGCAATGTTCAAGGGGTATAAAGAGGCCTTTGCAGCATTAGATTTGGTAGAGAA
AAAATTCTCATCTGTTTCCAAATCTCGTATCCGACTAGTAAAGCAGCAGTTAATCCATGATCGTGCTCTGCATCGTGGAGAGTTAAAATTGGCCCAACTTGTCTGTAACCAGTTGGGATCACTGGCCTCTCCTGTATCCGGTGTAGATATGGACCTGAAAGTTGAGGCTAGTCTTAGGCATGCTCGCACTCTTCTTGCTG
CAGAACAATTCAGTGAGGCAGTGTCAGTTGCTCAATCTCTCTTCTGTATGTGTTACAAATTCAACATGCAAGTTGAAAGTACGAGTGTTCTACTTTTGCTTGCAGAGATCCATAAGAAATCAGGAAATGCAATCTCGGGCTTACCCTATGTGTTGGCAAGTTTGTCTTTATGTCAGTCTTTCAACCTGGACCTCCTTCAA
GCTGCAGCCATGCTAACTCTAGCAGAACTGTGGATGAATCTTGGAGCTGGCCATGCAAAACATGCGTTGGCACTTTTGTATCAAAGTTTGCCTATCATTCTTGGTCATGGTGGCCTTGAATTGCGTGCACGAGCAAATATTGGCCTTGCCAAATGCCATCTTGCAATCCCAGAGTTTTCAGTTTCTTCAGAACCAGACAC
TGTTCTAGATCCTCTACGGCAAGCTGCCGAGGAATTTGAAATATTAGAGTATCATGAATTAGCAGGAGAAGCTTTTTATTTGATGGCTATCATTTTCAATTCTCTTGGAAATGTTCAAGAGAGGGACAATTCAGCAGCTTCATTTCAGAAACATGTTCATGCCCAAAACTCTGCACAAAATTTAGAGCCAGAAGCTTTCT
TTTATCTGTAGCACGTACAAATAAGAGGCTGTGATATACAGTGTGTGTGCTTATTATAGAAAGGAACGACACCAATATCAGTTCCATTGTGATTTTTCTTCTCTCAAGTTTCCTGGTTTCTTCACATTGGATGAAGGTATAGAATTGTCTGTTAATTATGAAAGTGTTCGCTTCCCTTTATATGGAAATGTACAGTGCAT
TCCTTGTGTAAATATTTGTTTCCTAA
>TRINITY_DN110389_c0_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATAGCCTTTATCATGGAGACTATCCTGCTGCCTTACACAGTCTTCATCGATACTTTGACTACAGTGCAGGGAAGGAAGGACTCGACAACAGTGGAGCTTTTTCAGCTGGAAGGTTCCAGGCTGTGCTCCTTAGCATGGGAACCATGCATTCTCGGTTTGGCCATCCTGCACATGCTTTAGTGGCTCTTACTGAGGCCATT
CAAGAAGCTCAACAGGCTAGTGATAATTCCTGCCTTGCCCATATCTTGGCAGCTTTATGCTATCTTTTTGCTGAGGTTGGTGTTGCTAGCAACTCAGGATGCTTTGATTCAACTATACCTCCTGGGGTTGACATTGGAGCAAGGTCTTCATTGGCAGTTCAGCAGCAGTTACCGATACTTCTTAGAAGATGTCTCAACAG
GGCAGTTGACTTGAAATTGACACATCTTGTTATATTCAGCCGTCTTGCATTGGCAAAATTTGACTTGAAGCATGTACAAAGATCACCACTTTCATTTGGGTTAAAGGTTTCGACAAAGCTAAGAACATTTCCTGTTGATGTTTGCAAGGATCTGAGATTAAGCTGCTATGCACTTAGTGAATCTGGAATAGATCCTTCTT
CTGCAGTAACTGGTGGCACTTTAACAGATCTTTCTGTCAGTTCCCTGGAAAGACCTGGACGATCATTTCTACTGCCTGGTGATACATACAGAAGTCATGGTCCCATTCCTAGATCTATAGTGCAGTTGGCTGGCAATTCTTACCTGCTTAGGTCTACATCATGGGAGATGTATGGGAGTGGTCCATTGGTTCGCTTGAAT
GCTTTGGTTCATGCTATTTGTTATGCAGATGCTGCGAGTGTAGATGATTTGTGTTTGGCTTATGTTAAACTTATACAACATCTTGCAATGTTCAAGGGGTATAAAGAGGCCTTTGCAGCATTAGATTTGGTAGAGAAAAAATTCTCATCTGTTTCCAAATCTCGTATCCGACTAGTAAAGCAGCAGTTAATCCATGATCG
TGCTCTGCATCGgtcagtgtctcctggccttattctgttatctatacttgttaatttattgtttgtccatgttttctaattcttatggctaaatgatttctcttttacttggtagtgtgattaaaagggttgtttatattttaatggtactgttcaggtaactttgttgtgtggaaaaatttaaaccattgactaataca
taagtgtcatgacagTGGAGAGTTAAAATTGGC
Intron 2 GTATGCATAA ... AGTGTTGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45 | 22 | 18 | 5.6 |
| A2 | 27.27 | 32 | 12 | 7.4 |
| A3 | 26.32 | 28 | 10 | 6.6 |
| A4 | 45.67 | 18 | 15.1 | 8.4 |
| A5 | 23.83 | 13 | 4.1 | 3.4 |
| A6 | 28.57 | 15 | 6 | 1.3 |
| A7 | 26 | 37 | 13 | 3.3 |
| A8 | 36.36 | 7 | 4 | 1 |
| A9 | 33.33 | 14 | 7 | 1.9 |
| A10 | 26.67 | 22 | 8 | 1.6 |
>TRINITY_DN123663_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformTTTTAAAACTTTTACTCTGCATATTTCGGACTCTAACCGAAAACACCAATTTTTTTTTGGGAGTTGCCGGTGCTGGAAACAGAGAAGCGATGGAGGCGAATAAGCAGCACCATTGAATTTTTATGCCCTATGTAGTTTGTACGGAGGAGAATAAGCAACAGCAGCGAGGGAGTTTTGTGAAGCAGAAGCAGCAGCAGGAG
CAATGGCAGCAGGAGGAGGCAAGGTTTTTGGTATAACAGCACACAAGATTTCCATTTGCGTTCTTCTTCGAGTGTGCGTGGCTCCTTTTTCGACTGAAAATGACGATGATGAGGAGTATCCCTATCCAACGCCCTTCCTTGGCGTCTCTCAACGGCAGCTTCTGTCGTCTTTTTTGATGAAGCTTTCCACGTCTTGCGAC
AACTTTCTTGAGCCATCACTTGAAGACCTTATATTGCAATTGAAGGCAGCTCAAGAAGAGATTGGGGAAGATTTGATAGGACATCTATTGCATCATCTTAAGCAGTTGGCTTCTCCTGATGATTTGATCAATCTTTTTACTGGTTTACGAGATGTCTTGCCTAGTTCTGTGAATGAAGAGAATGAGATGCCCAACGCAGA
TGGGGTTGATAAGAAGTTTAACCCAAACAGTGTCTTGGGGCAGTTTGTTCGTCGTTGTATGCTTTCATTCAATCTCTTGTCCTTTGAGGAAACATGTCGTCTTCTGACAAATCTAAAGGCATATTGTAGACGATTTATAAATTTTGATTCCATTGACCCTCTCTATTTTGAGAGCTCATTGACAAAAAGGATGCCAAAGG
ATGAGGCGTTTGAATCCGACGATGAAAAATTTGAATATGAAGAGACAATTTCCAGTGGGCAGCACAATGGAGCTAGACACAAAATGAAGATAAGAAAAAGAGGCAGCCATCATTCACGTGTTTCTGAACCATTTACTGAACCAGGGCTGGTGAAATGTAATGATTTCCTTGACCCTAATGGGTTTCAATTGGGTCAATCC
GAGAATGGTGCACAGGATTTGGGATTTGTGTTCACTGCAAGAGATGATAAAGATGATAACTTGGTATCTCTTCAGACATATGGGCAAGTAGAAGGTTATTTGCGAGAGCAGGCTGATTTTATTGAGAAGCAAGTGGAAATTCTTCCCAAGAATGAGTTTGAGTTGAAGCTGAATCAGCTTGAGAAACTTGCACCAGACTT
ACAGCGGGTGAACTATCTACGGTACCTGAATAGCCTTTATCATGGAGACTATCCTGCTGCCTTACACAGTCTTCATCGATACTTTGACTACAGTGCAGGGAAGGAAGGACTCGACAACAGTGGAGCTTTTTCAGCTGGAAGGTTCCAGGCTGTGCTCCTTAGCATGGGAACCATGCATTCTCGGTTTGGCCATCCTGCAC
ATGCTTTAGTGGCTCTTACTGAGGCCATTCAAGAAGCTCAACAGGCTAGTGATAATTCCTGCCTTGCCCATATCTTGGCAGCTTTATGCTATCTTTTTGCTGAGGTTGGTGTTGCTAGCAACTCAGGATGCTTTGATTCAACTATACCTCCTGGGGTTGACATTGGAGCAAGGTCTTCATTGGCAGTTCAGCAGCAGTTA
CCGATACTTCTTAGAAGATGTCTCAACAGGGCAGTTGACTTGAAATTGACACATCTTGTTATATTCAGCCGTCTTGCATTGGCAAAATTTGACTTGAAGCATGTACAAAGATCACCACTTTCATTTGGGTTAAAGGTTTCGACAAAGCTAAGAACATTTCCTGTTGATGTTTGCAAGGATCTGAGATTAAGCTGCTATGC
ACTTAGTGAATCTGGAATAGATCCTTCTTCTGCAGTAACTGGTGGCACTTTAACAGATCTTTCTGTCAGTTCCCTAGAAAGACCTGGACGATCATTTCTACCGCCTGGTGATACATACAGAAGTCATGGTCCCATTCCTAGATCTATAGTGCAGTTGGCTGGCAATTCTTACTTGCTTAGGTCTACGTCATGGGAGATGT
ATGGGAGTGGTCCATTGGTTCGCTTGAATGCTTTGGTTCATGCTATTTGTTATGCAGATGCTGCGAGTGTAGATGATTTGTGTTTGGCTTATGTTAAACTTATACAACATCTTGCAATGTTCAAGGGGTATAAAGGTAAGTAATCCAACTAATATTATTTGTATTAAACTTTTGGCGGAAGATTTTGATTTTACATTCAC
TAGTATTTATTTAATAATTCGC
>TRINITY_DN123663_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTTGTAGATCTTATCTTCACCTTATGTTCTCATGGTGATTGACTAGTTTCTAGTGCTACTTATGCATGCTGGTTTAACATATCCAGCTCACACCAACACCTTGAAAGTGTATCACATCTAGGTCAGACGAATCCTAGGGCACAAGTTCTTTTGTTTTGTTTTCTTTCCATCTCAATCGATGCTACAGATGTATTCATGTT
AATATGGTCATGCTATCCAAATAGTATTGTCTTGATAACAGCCTTTGAGAATTTGTAGTTGATTTTATGTAGTACATTTTAGTACCGAGAAGTTTAATGCATAATATTTTGGTGGATGTTCAGGAAACATGTCGTCTTCTGACAAATCTAAAGGCATATTGTAGACGATTTATAAATTTTGATTCCATTGACCCTCTCTA
TTTTGAGAGCTCATTGACAAAAAGGATGCCAAAGGATGAGGCGTTTGAATCCGACGATGAAAAATTTGAATATGAAGAGACAATTTCCAGTGGGCAGCACAATGGAGCTAGACACAAAATGAAGATAAGAAAAAGAGGCAGCCATCATTCACGTGTTTCTGAACCATTTACTGAACCAGGGCTGGGTGAGTGTTGTGTTT
TACCTTGTTGCACTGAATAGAACTTGGATTTGGTGGTAACAAAATTCAATGAGAGTAGGAGGAAAGTATATTACTTTTGTTGCTCTTGCCATGTAGTTTGATTCTATTGATATAATGAAACAGGAAAACTGGATTTTATCTTAGCTTATCATTATTTATTTTCCTTTTATAATCCCACCGTCAAAATGTCTGATCAATTG
CTGCTTACTAGTATATGTAGAATTTATTTGCTTCTTTAGGATCTGAAATAGTATACTTTGTTTGTGAGAATTTGTTCCTACTGGTAATAGAGTGAAATTTAATATTTCCATATTGCCTTTCTCTATGCTTTTGTAAACCCTTTTTTTGGAGGATTTTTCTAAGTGGTACTATAGTGAATTTGAATTTGCTCTGTTTTTTT
CACATGATATGACTATATTCAATGATCTATTTGCACTTTAATGGGTGACAATTTTTCACCAAATTTTAGAATAAAATGCCATAAGTCTCGTTACTAATTGAAGTGGTATCACCTGCAGTGAAATGTAATGATTTCCTTGACCCTAATGGGTTTCAATTGGGTCAATCCGAGAATGGTGCACAGGATTTGGGATTTGTGTT
CACTGCAAGAGATGATAAAGATGATAACTTGGTATCTCTTCAGACATATGGGCAAGTAGAAGGTTATTTGCGAGAGCAGGCTGATTTTATTGAGAAGCAAGTGGAAATTCTTCCCAAGAATGAGTTTGAGTTGAAGCTGAATCAGCTTGAGAAACTTGCACCAGACTTACAGCGGgtatgcataatcaggcatggttttg
aagagtgttgaagGTGAACTATCTACGGTACCTGAATAGCCTTTATCATGGAGACTATCCTGCTGCCTTACACAGTCTTCATCGATACTTTGACTACAGTGCAGGGAAGGAAGGACTCGACAACAGTGGAGCTTTTTCAGCTGGAAGGTTCCAGGCTGTGCTCCTTAGCATGGGAACCATGCATTCTCGGTTTGGCCATC
CTGCACATGCTTTAGTGGCTCTTACTGAGGCCATTCAAGAAGCTCAACAGGCTAGTGATAATTCCTGCCTTGCCCATATCTTGGCAGCTTTATGCTATCTTTTTGCTGAGGTTGGTGTTGCTAGCAACTCAGGATGCTTTGATTCAACTATACCTCCTGGGGTTGACATTGGAGCAAGGTCTTCATTGGCAGTTCAGCAG
CAGTTACCGATACTTCTTAGAAGATGTCTCAACAGGGCAGTTGACTTGAAATTGACACATCTTGTTATATTCAGCCGTCTTGCATTGGCAAAATTTGACTTGAAGCATGTACAAAGATCACCACTTTCATTTGGGTTAAAGGTTTCGACAAAGCTAAGAACATTTCCTGTTGATGTTTGCAAGGATCTGAGATTAAGCTG
CTATGCACTTAGTGAATCTGGAATAGATCCTTCTTCTGCAGTAACTGGTGGCACTTTAACAGATCTTTCTGTCAGTTCCCTAGAAAGACCTGGACGATCATTTCTACCGCCTGGTGATACATACAGAAGTCATGGTCCCATTCCTAGATCTATAGTGCAGTTGGCTGGCAATTCTTAC
Intron 3 GTGAGTGTTG ... TCACCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.32 | 21 | 9 | 6 |
| A2 | 12.5 | 7 | 2 | 0 |
| A3 | 23.94 | 27 | 6 | 11 |
| A4 | 37.5 | 10 | 8 | 4 |
| A5 | 35.71 | 9 | 5 | 5 |
| A6 | 15.79 | 8 | 2 | 1 |
| A7 | 18.18 | 9 | 4 | 0 |
| A8 | 17.65 | 7 | 1 | 2 |
| A9 | 19.05 | 17 | 5 | 3 |
| A10 | 12 | 11 | 1 | 2 |
>TRINITY_DN123663_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformTTTTAAAACTTTTACTCTGCATATTTCGGACTCTAACCGAAAACACCAATTTTTTTTTGGGAGTTGCCGGTGCTGGAAACAGAGAAGCGATGGAGGCGAATAAGCAGCACCATTGAATTTTTATGCCCTATGTAGTTTGTACGGAGGAGAATAAGCAACAGCAGCGAGGGAGTTTTGTGAAGCAGAAGCAGCAGCAGGAG
CAATGGCAGCAGGAGGAGGCAAGGTTTTTGGTATAACAGCACACAAGATTTCCATTTGCGTTCTTCTTCGAGTGTGCGTGGCTCCTTTTTCGACTGAAAATGACGATGATGAGGAGTATCCCTATCCAACGCCCTTCCTTGGCGTCTCTCAACGGCAGCTTCTGTCGTCTTTTTTGATGAAGCTTTCCACGTCTTGCGAC
AACTTTCTTGAGCCATCACTTGAAGACCTTATATTGCAATTGAAGGCAGCTCAAGAAGAGATTGGGGAAGATTTGATAGGACATCTATTGCATCATCTTAAGCAGTTGGCTTCTCCTGATGATTTGATCAATCTTTTTACTGGTTTACGAGATGTCTTGCCTAGTTCTGTGAATGAAGAGAATGAGATGCCCAACGCAGA
TGGGGTTGATAAGAAGTTTAACCCAAACAGTGTCTTGGGGCAGTTTGTTCGTCGTTGTATGCTTTCATTCAATCTCTTGTCCTTTGAGGAAACATGTCGTCTTCTGACAAATCTAAAGGCATATTGTAGACGATTTATAAATTTTGATTCCATTGACCCTCTCTATTTTGAGAGCTCATTGACAAAAAGGATGCCAAAGG
ATGAGGCGTTTGAATCCGACGATGAAAAATTTGAATATGAAGAGACAATTTCCAGTGGGCAGCACAATGGAGCTAGACACAAAATGAAGATAAGAAAAAGAGGCAGCCATCATTCACGTGTTTCTGAACCATTTACTGAACCAGGGCTGGTGAAATGTAATGATTTCCTTGACCCTAATGGGTTTCAATTGGGTCAATCC
GAGAATGGTGCACAGGATTTGGGATTTGTGTTCACTGCAAGAGATGATAAAGATGATAACTTGGTATCTCTTCAGACATATGGGCAAGTAGAAGGTTATTTGCGAGAGCAGGCTGATTTTATTGAGAAGCAAGTGGAAATTCTTCCCAAGAATGAGTTTGAGTTGAAGCTGAATCAGCTTGAGAAACTTGCACCAGACTT
ACAGCGGGTGAACTATCTACGGTACCTGAATAGCCTTTATCATGGAGACTATCCTGCTGCCTTACACAGTCTTCATCGATACTTTGACTACAGTGCAGGGAAGGAAGGACTCGACAACAGTGGAGCTTTTTCAGCTGGAAGGTTCCAGGCTGTGCTCCTTAGCATGGGAACCATGCATTCTCGGTTTGGCCATCCTGCAC
ATGCTTTAGTGGCTCTTACTGAGGCCATTCAAGAAGCTCAACAGGCTAGTGATAATTCCTGCCTTGCCCATATCTTGGCAGCTTTATGCTATCTTTTTGCTGAGGTTGGTGTTGCTAGCAACTCAGGATGCTTTGATTCAACTATACCTCCTGGGGTTGACATTGGAGCAAGGTCTTCATTGGCAGTTCAGCAGCAGTTA
CCGATACTTCTTAGAAGATGTCTCAACAGGGCAGTTGACTTGAAATTGACACATCTTGTTATATTCAGCCGTCTTGCATTGGCAAAATTTGACTTGAAGCATGTACAAAGATCACCACTTTCATTTGGGTTAAAGGTTTCGACAAAGCTAAGAACATTTCCTGTTGATGTTTGCAAGGATCTGAGATTAAGCTGCTATGC
ACTTAGTGAATCTGGAATAGATCCTTCTTCTGCAGTAACTGGTGGCACTTTAACAGATCTTTCTGTCAGTTCCCTAGAAAGACCTGGACGATCATTTCTACCGCCTGGTGATACATACAGAAGTCATGGTCCCATTCCTAGATCTATAGTGCAGTTGGCTGGCAATTCTTACTTGCTTAGGTCTACGTCATGGGAGATGT
ATGGGAGTGGTCCATTGGTTCGCTTGAATGCTTTGGTTCATGCTATTTGTTATGCAGATGCTGCGAGTGTAGATGATTTGTGTTTGGCTTATGTTAAACTTATACAACATCTTGCAATGTTCAAGGGGTATAAAGGTAAGTAATCCAACTAATATTATTTGTATTAAACTTTTGGCGGAAGATTTTGATTTTACATTCAC
TAGTATTTATTTAATAATTCGC
>TRINITY_DN123663_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTTGTAGATCTTATCTTCACCTTATGTTCTCATGGTGATTGACTAGTTTCTAGTGCTACTTATGCATGCTGGTTTAACATATCCAGCTCACACCAACACCTTGAAAGTGTATCACATCTAGGTCAGACGAATCCTAGGGCACAAGTTCTTTTGTTTTGTTTTCTTTCCATCTCAATCGATGCTACAGATGTATTCATGTT
AATATGGTCATGCTATCCAAATAGTATTGTCTTGATAACAGCCTTTGAGAATTTGTAGTTGATTTTATGTAGTACATTTTAGTACCGAGAAGTTTAATGCATAATATTTTGGTGGATGTTCAGGAAACATGTCGTCTTCTGACAAATCTAAAGGCATATTGTAGACGATTTATAAATTTTGATTCCATTGACCCTCTCTA
TTTTGAGAGCTCATTGACAAAAAGGATGCCAAAGGATGAGGCGTTTGAATCCGACGATGAAAAATTTGAATATGAAGAGACAATTTCCAGTGGGCAGCACAATGGAGCTAGACACAAAATGAAGATAAGAAAAAGAGGCAGCCATCATTCACGTGTTTCTGAACCATTTACTGAACCAGGGCTGGgtgagtgttgtgttt
taccttgttgcactgaatagaacttggatttggtggtaacaaaattcaatgagagtaggaggaaagtatattacttttgttgctcttgccatgtagtttgattctattgatataatgaaacaggaaaactggattttatcttagcttatcattatttattttccttttataatcccaccgtcaaaatgtctgatcaattg
ctgcttactagtatatgtagaatttatttgcttctttaggatctgaaatagtatactttgtttgtgagaatttgttcctactggtaatagagtgaaatttaatatttccatattgcctttctctatgcttttgtaaaccctttttttggaggatttttctaagtggtactatagtgaatttgaatttgctctgttttttt
cacatgatatgactatattcaatgatctatttgcactttaatgggtgacaatttttcaccaaattttagaataaaatgccataagtctcgttactaattgaagtggtatcacctgcagTGAAATGTAATGATTTCCTTGACCCTAATGGGTTTCAATTGGGTCAATCCGAGAATGGTGCACAGGATTTGGGATTTGTGTT
CACTGCAAGAGATGATAAAGATGATAACTTGGTATCTCTTCAGACATATGGGCAAGTAGAAGGTTATTTGCGAGAGCAGGCTGATTTTATTGAGAAGCAAGTGGAAATTCTTCCCAAGAATGAGTTTGAGTTGAAGCTGAATCAGCTTGAGAAACTTGCACCAGACTTACAGCGGGTATGCATAATCAGGCATGGTTTTG
AAGAGTGTTGAAGGTGAACTATCTACGGTACCTGAATAGCCTTTATCATGGAGACTATCCTGCTGCCTTACACAGTCTTCATCGATACTTTGACTACAGTGCAGGGAAGGAAGGACTCGACAACAGTGGAGCTTTTTCAGCTGGAAGGTTCCAGGCTGTGCTCCTTAGCATGGGAACCATGCATTCTCGGTTTGGCCATC
CTGCACATGCTTTAGTGGCTCTTACTGAGGCCATTCAAGAAGCTCAACAGGCTAGTGATAATTCCTGCCTTGCCCATATCTTGGCAGCTTTATGCTATCTTTTTGCTGAGGTTGGTGTTGCTAGCAACTCAGGATGCTTTGATTCAACTATACCTCCTGGGGTTGACATTGGAGCAAGGTCTTCATTGGCAGTTCAGCAG
CAGTTACCGATACTTCTTAGAAGATGTCTCAACAGGGCAGTTGACTTGAAATTGACACATCTTGTTATATTCAGCCGTCTTGCATTGGCAAAATTTGACTTGAAGCATGTACAAAGATCACCACTTTCATTTGGGTTAAAGGTTTCGACAAAGCTAAGAACATTTCCTGTTGATGTTTGCAAGGATCTGAGATTAAGCTG
CTATGCACTTAGTGAATCTGGAATAGATCCTTCTTCTGCAGTAACTGGTGGCACTTTAACAGATCTTTCTGTCAGTTCCCTAGAAAGACCTGGACGATCATTTCTACCGCCTGGTGATACATACAGAAGTCATGGTCCCATTCCTAGATCTATAGTGCAGTTGGCTGGCAATTCTTAC