sp|Q2PCF1|PDR2_NICPL ----> Pleiotropic drug resistance protein 2


Intron 1 GTTTGTTTTC ... CGTATTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A80100
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A1063.64477



>TRINITY_DN48405_c0_g1_i15 from sample A7 / Example spliced isoform
GGGGATTTGAATCTTGACGGGTCTGTGAAACACCCCTCAGTGCACTCCAAACCAAGACTCTGTTGAGAACTGTGCCATTTTATGTTTGTTATTGGTTTTTAAGGCTTTAAAGGTCCTCTCATATGCAACTGTAGAGGATTTCATCCATGACCCAAATCTTGTTTCAGTCAGTCCCGGGGCAAAGAATCATAAACATCTTC
TGAGATTTGTTTTTTGGTTTTTTGGTTGGATTACAGGGTGGGTGTAGAGCTCCCCAAAGTCGAAGTGCGGTTCGAGCAGTTGACAATTGATGCAGATGTTTATGTTGGAAATAGAGCTTTGCCAACGCTGTTCAACGTCACGGTCAATACCTTAGAGAGTATCCTCGGCTCCATTGGTCTTGCTCCAACAAAGAAAAGTG
TTCTGAAGATACTCCACGATGTCAGTGGTGTAATAAAACCTTCTAGAATGACTATGCTTCTTGGACCTCCAAGCTCTGGAAAGACAACTTTGCTGTTGGCTCTTGCTGGGAAGCTCGACTCTGATCTCAAAGTATCCGGTAAAGTGACCTATAATGGACATGAAATGAACGAATTCGTACCTCAAAGGACATCAGCATAC
ATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGGTACCGACAAAGTTTCTACCGAAGTTTGTCATTTCTCCGAGGACGTTTCTGAAATTTGAACTTCATTTCCTTCCATAGAATTGACAGACTGTTTTAAGTGTCTTGAACA
GACTGAAAATTGTCGTCTGTCATGCTTGTACATCGTCATGGTATTTATCTTTGTGTTAGTTTCATATGAAAGTATGTTTAGAAGCCAGGTTTGAAAAACAATTGCTCAAGTTTTCACAATGAAATTTGCTGGCATAAACTGGGACAAATTATTGAAAATTACTACTTCTCCATCAATTTCAGAGATGCTTTTCGAGCTCT
CAAGGAGGGAAAAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTTCATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATATAGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTCGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACA
ACTGGAGAGATGATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATATCCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCATTAAGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGA
AGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCAGATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTT
CATTTCATGTAGGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAAAATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTATGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATG
GCAACTATCACCATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGCTTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTCTCCTTTTTTTCAGTCTTGTTATTGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATT
TTCCTTGCCCATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGGAATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCACCATCAGCAAGCAGGTTTTTCCGGCAGTTCCTGCTACTTTTCTGGGCACACCAGATGTCCTCGTCACTTTTCCGTTTCATTGCATCAGTGGGCCGAACGCTGGTCGTTG
CAGGCACATTAGGATACTTAGTACTGGTGCTAATTTTTGTCTTGGGAGGATTTGTCATTTCTAAAGATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTGGGGATACTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCG
ACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGGTGCTTTTCAACATTCTATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCAC
AGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCCGACTTGGCAATGAAGCAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCAT
TCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATTGTTAAGGGATGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGA
AAAACTGCAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGCAGAATGATATCCATTCTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGATGTTTGTGGA
AGAAGTGATGGAACTTGTTGAACTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAAAGACTTACAATAGCTGTTGACTTGGTTGCAAACCCGTCCATTATCTTCATGGATGAACCCACATCAGGGCTCGATGCCCGAGCTGCAGCTATTGTCATGAGAACTGTAC
GCAATACTGTTGATACTGGGCGCACAGTTGTCTGCACAATTCACCAACCTAGCATTGATATATTTGAGGCATTTGATGAGCTCTTACTGATGAAAATGGGAGGACAAGTCATATATGCAGGACCTCTTGGGCATCATTCTTACAAGCTGATCGAGTACTTTGAGGCTATCCCGGGAGTGCCCAGGATCAAAGAAGATTAC
AATCCATCAACCTGGATGCTAGAAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTCTTTTCCAGCAGAACCAGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGTGTCCAATGCAT
AGCTTGCTTTTCGAAGCAGCACTGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTGTTTGGTAGTATATTCTGTGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGGGATCGGCAATT
CTTCAACTGTGCAACCTGTTGTTGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGTTGCTCAGGCTGCCATTGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATGGACTTCCAATGGACAGCAGTCAAATTTTTCTGG
TTTATATTCTACATGTTCATGTGCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCATTGTTTCCTCGTTTTTCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAATCCTGTTGC
ATGGACAGTGTATGGCCTCATTACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTATAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGCTATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCA
AATATCTCAATTTCCAGAGGCGATAAGATGGTTGTAAATTTGTCATCATTTATCTTCAGAGGAATTTGGAGGAAATTGATGAAGTTGAACACGAATTGCTATTTGATCTTAGCGTTCTCTGCTTCTATAATAAACATCTGCCGTTTTCGCCAATTTTTCAACCTTACTATAGCAGACTGGATTGAGTCTTGCAGTTTTAA
CTGTAAGCTGGGTTTGCCATTTCCAATGGGGTTCTGGCCTAGATGGGATCAAGAATTCATAATTGCTTAGGGTTTCCGATATGGTCTTCTTTTGTATCGGTTTGTGAAAATCAGTTGCAGCTGTGAATAACCCCGTTGTGGTTACTGACCTCCAAGTTCCAATCCTTGGCTATACTTATAATCTCTGTTCCCCAGGTTCT
CGTTATTGAGAGGAACGACATCAAGGACATCTGTTTTTAAGGTTCCCGTTATTGAGATGGATGACATCAAGGACGACCCTAAGCCTGACAGAACTGGAGGGTGGGCAAGGAAAAGGCTTGAGAAATCCCTGGTGAAAGAAACAAAGCTAATTGTGTAGCTAACATCGCTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTT
AAATTGAATAGAAATTTCCAAATTTCAGGTTTATTGCAAATGAAGTTGCTCCAATGAAATGGGGTCAAGATATCTTCTTTCACATTCAAAATTTGTGAAACTTTATAATTTGTGAAACTTTATTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTTTAAATTGAATAGAAATTTC


>TRINITY_DN48405_c0_g1_i13 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GGGGATTTGAATCTTGACGGGTCTGTGAAACACCCCTCAGTGCACTCCAAACCAAGACTCTGTTGAGAACTGTGCCATTTTATGTTTGTTATTGGTTTTTAAGGCTTTAAAGGTCCTCTCATATGCAACTGTAGAGGATTTCATCCATGACCCAAATCTTGTTTCAGTCAGTCCCGGGGCAAAGAATCATAAACATCTTC
TGAGATTTGTTTTTTGGTTTTTTGGTTGGATTACAGGGTGGGTGTAGAGCTCCCCAAAGTCGAAGTGCGGTTCGAGCAGTTGACAATTGATGCAGATGTTTATGTTGGAAATAGAGCTTTGCCAACGCTGTTCAACGTCACGGTCAATACCTTAGAGAGTATCCTCGGCTCCATTGGTCTTGCTCCAACAAAGAAAAGTG
TTCTGAAGATACTCCACGATGTCAGTGGTGTAATAAAACCTTCTAGAATGACTATGCTTCTTGGACCTCCAAGCTCTGGAAAGACAACTTTGCTGTTGGCTCTTGCTGGGAAGCTCGACTCTGATCTCAAAGTATCCGGTAAAGTGACCTATAATGGACATGAAATGAACGAATTCGTACCTCAAAGGACATCAGCATAC
ATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGAGATGCTTTTCGAGCTCTCAAGGAGGGAAAAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTTCATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATAT
AGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTCGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACAACTGGAGAGATGATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATATCCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCATTA
AGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGAAGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCA
GATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTTCATTTCATGTAGGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAAAATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTA
TGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATGGCAACTATCACCATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGCTTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTCTCCTTTTTTTCA
GTCTTGTTATTGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATTTTCCTTGCCCATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGGAATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCA
CCATCAGCAAGCAGGTTTTTCCGGCAGTTCCTGCTACTTTTCTGGGCACACCAGATGTCCTCGTCACTTTTCCGTTTCATTGCATCAGTGGGCCGAACGCTGGTCGTTGCAGGCACATTAGGATACTTAGTACTGGTGCTAATTTTTGTCTTGGGAGGATTTGTCATTTCTAAAGgtttgttttccatatctcttcaaat
ttgcatttttcagcatagaataacatcaatattggcgtggtttgcgtattgcag
ATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTGGGGATACTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGGTAAACTAAAACATGAACTAAATGAGCTAACATCCTCAATAA
CTCCTCGTCAGTTTCTGGGTTTCAACGTTTCCATGTTATTGCATGACTGATGTCTTTTGTGCAGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCGACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGGTGCTTTTCAACATTC
TATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCCGACTTGGCAATGAAG
CAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATTGTTAAGGGA
TGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGCAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGCAGAATGATATCCATT
CTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGATGTTTGTGGAAGAAGTGATGGAACTTGTTGAACTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAAAGACTTACAATAGCT
GTTGACTTGGTTGCAAACCCGTCCATTATCTTCATGGATGAACCCACATCAGGGCTCGATGCCCGAGCTGCAGCTATTGTCATGAGAACTGTACGCAATACTGTTGATACTGGGCGCACAGTTGTCTGCACAATTCACCAACCTAGCATTGATATATTTGAGGCATTTGATGAGCTCTTACTGATGAAAATGGGAGGACA
AGTCATATATGCAGGACCTCTTGGGCATCATTCTTACAAGCTGATCGAGTACTTTGAGGCTATCCCGGGAGTGCCCAGGATCAAAGAAGATTACAATCCATCAACCTGGATGCTAGAAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTCTTTTCCAGCAGAACC
AGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGTGTCCAATGCATAGCTTGCTTTTCGAAGCAGCACTGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTGTTTGGTAGTATATTC
TGTGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGGGATCGGCAATTCTTCAACTGTGCAACCTGTTGTTGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGTTGCTCAGGCTGCCAT
TGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATGGACTTCCAATGGACAGCAGTCAAATTTTTCTGGTTTATATTCTACATGTTCATGTGCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCATTGTTTCCTCGTTTT
TCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAATCCTGTTGCATGGACAGTGTATGGCCTCATTACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTATAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGC
TATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCAAATATCTCAATTTCCAGAGGCGATAAGATGGTTGTAAATTTGTCATCATTTATCTTCAGAGGAATTTGGAGGAAATTGATGAAGTTGAACACGAATTGCTATTTGA
TCTTAGCGTTCTCTGCTTCTATAATAAACATCTGCCGTTTTCGCCAATTTTTCAACCTTACTATAGCAGACTGGATTGAGTCTTGCAGTTTTAACTGTAAGCTGGGTTTGCCATTTCCAATGGGGTTCTGGCCTAGATGGGATCAAGAATTCATAATTGCTTAGGGTTTCCGATATGGTCTTCTTTTGTATCGGTTTGTG
AAAATCAGTTGCAGCTGTGAATAACCCCGTTGTGGTTACTGACCTCCAAGTTCCAATCCTTGGCTATACTTATAATCTCTGTTCCCCAGGTTCTCGTTATTGAGAGGAACGACATCAAGGACATCTGTTTTTAAGGTTCCCGTTATTGAGATGGATGACATCAAGGACGACCCTAAGCCTGACAGAACTGGAGGGTGGGC
AAGGAAAAGGCTTGAGAAATCCCTGGTGAAAGAAACAAAGCTAATTGTGTAGCTAACATCGCTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTCCAAATTTCAGGTTTATTGCAAATGAAGTTGCTCCAATGAAATGGGGTCAAGATATCTTCTTTCACATTCAAAATTTGTGAAACTTTAT
AATTTGTGAAACTTTATTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTTTAAATTGAATAGAAATTTC




Intron 2 GTAAGTCTAT ... TTGGTAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A126.32732
A240635
A325604
A429.41632
A533.33312
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A8-1000
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A1044.44553



>TRINITY_DN122073_c0_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoform
GAAACCTGTCTATTGGGGATTTGAATCTTGACGGGGCTGTGAAACACCCCTCAGTGCACTCCAAACCAAGACCCTGGTGGGTGTAGAGCTCCCCATAGTCGAAGTGCGGTTCGAGCAGTTGACAATTGATGCAGATGTTTATGTTGGAAATAGAGCTTTGCCAACGCTGTTCAACGTCACGGTCAATACCTTAGAGAGTA
TCCTCGGCTCCATTGGTCTTGCTCCAACAAAGAAAAGTGTTCTGAAGATACTCCACGATGTCAGTGGTGTAATAAAACCTTCTAGAATGACTATGCTTCTTGGACCTCCAAGCTCTGGAAAGACAACTTTGCTGTTGGCTCTTGCTGGGAAGCTCGACTCTGATCTCAAAGTATCCGGTAAAGTGACCTATAATGGACAT
GAAATGAACGAATTCGTACCTCAAAGGACATCAGCATACATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGAGATGCTTTCCGAGCTCTCAAGGAGGGAAAAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTT
CATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATATAGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTTGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACAACTGGAGAGATGATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATAT
CCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCGTTAAGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGAAGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAG
TTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCAGATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTTCATTTCATGTAGGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAA
AATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTATGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATGGCAACTATCACCATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGA
TTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTGTCCTTTTTTTTCAGTCTTGTTAATGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATTTTCCTTGCCCATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGG
AATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCACCATCAGCAAGCAGGTTTTTCCGGCAGTTCCTGCTACTTTTCTGGGCACACCAGATGTCCTCGTCACTTTTCCGTTTCATTGCATCAGTGGGCCGAACGCTGGTCGTTGCAGGCACATTAGGATACTTAATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTGGGGATA
CTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCGACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGGTGCTTT
TCAACATTCTATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCCGACTTG
GCAATGAAGCAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATT
GTTAAGGGATGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGGAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGCATATCTGGTTTTCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCGGGCTATTGTGAGCAGGA


>TRINITY_DN122073_c0_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:
ATATGCAACTGTAGAGGATTTCATCCATGACCCAAATCTTGTTTCAGTCAGTCCCGGGGCAAAGAATCATAAACATCTTCTGAGATTTGTTTTTTGGTTTTTTGGTTGGATTACAGGGTGGGTGTAGAGCTCCCCAAAGTCGAAGTGCGGTTCGAGCAGTTGACAATTGATGCAGATGTTTATGTTGGAAATAGAGCTTT
GCCAACGCTGTTCAACGTCACGGTCAATACCTTAGAGAGTATCCTCGGCTCCATTGGTCTTGCTCCAACAAAGAAAAGTGTTCTGAAGATACTCCACGATGTCAGTGGTGTAATAAAACCTTCTAGAATGACTATGCTTCTTGGACCTCCAAGCTCTGGAAAGACAACTTTGCTGTTGGCTCTTGCTGGGAAGCTCGACT
CTGATCTCAAAGTATCCGGTAAAGTGACCTATAATGGACATGAAATGAACGAATTCGTACCTCAAAGGACATCAGCATACATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGAGATGCTTTCCGAGCTCTCAAGGAGGGAA
AAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTTCATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATATAGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTTGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACAACTGGAGAGAT
GATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATATCCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCGTTAAGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGAAGGGCAGATTG
TTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCAGATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTTCATTTCATGTA
GGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAAAATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTATGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATGGCAACTATCAC
CATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGATTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTGTCCTTTTTTTTCAGTCTTGTTAATGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATTTTCCTTGCCC
ATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGGAATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCACCATCAGCAAGCAGGTTTTTCCGGCAGTTCCTGCTACTTTTCTGGGCACACCAGATGTCCTCGTCACTTTTCCGTTTCATTGCATCAGTGGGCCGAACGCTGGTCGTTGCAGGCACATT
AGGATACTTAATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTGGGGATACTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCGACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTA
CTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGGTGCTTTTCAACATTCTATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGT
CATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCCGACTTGGCAATGAAGCAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTG


gtaagtctatattttttaaaacgaagctgctcaagtctatcaatgtcttcgagacataggaaaatggcgctgaaggaatgttggttggtaacag
GAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATTGTTAAGGGATGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTG
CTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGGAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGCATATCTGGTTTTCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCGGGCTATTGTGAGCAGGA




Intron 3 GTAAGATTAT ... CATGTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A137.51006
A233.33402
A343.75907
A40600
A528.57502
A652.94809
A731.032029
A828.572018
A926.091706
A1041.67745



>TRINITY_DN43270_c0_g1_i9 from sample A8 / Example spliced isoform
GCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGGTAAACTAAAACATGAACTAAATGAGCTAACATCCTCAATAACTCCTCGTCAGTTTCTGGGTTTCAACGTTTCCATGTTATTGCATGACTGATGTCTTTTGTGCAGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCGACCATTGGGAAAGCAATTTTGA
AAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGGTGCTTTTCAACATTCTATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAG
GGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCCGACTTGGCAATGAAGCAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATT
CAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATTGTTAAGGGATGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGCAGGTTGCATCGAAG
GAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGCAGAATGATATCCATTCTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGATGTTTGTGGAAGAAGTGATGGAACTTGTTGAA
CTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAAAGACTTACAATAGCTGTTGACTTGGTTGCAAACCCGTCCATTATCTTCATGGATGAACCCACATCAGGGCTCGATGCCCGAGCTGCAGCTATTGTCATGAGAACTGTACGCAATACTGTTGATACTGGGCG
CACAGTTGTCTGCACAATTCACCAACCTAGCATTGATATATTTGAGGCATTTGATGAGCTCTTACTGATGAAAATGGGAGGACAAGTCATATATGCAGGACCTCTTGGGCATCATTCTTACAAGCTGATCGAGTACTTTGAGGCTATCCCGGGAGTGCCCAGGATCAAAGAAGATTACAATCCATCAACCTGGATGCTAG
AAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTCTTTTCCAGCAGAACCAGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGTGTCCAATGCATAGCTTGCTTTTCGAAGCAGCAC
TGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTGTTTGGAAGTATATTCTGGGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGGGATCGGCAATTCTTCAACTGTGCAACCTGTTGT
TGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGTTGCTCAGGCTGCCATTGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATCGACTTCCAATGGACAGCAGCCAAATTTTTCTGGTTTATATTCTACATGTTCATGT
GCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCATTGTTTCCTCGTTTTTCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAATCCTGTTGCATGGACAGTGTATGGCCTCATT
ACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTGTAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGCTATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCAAATACCTCAATTTCCAGAGGCG
ATAAGATGGTTATAATCATTTATCTTCAGAGGAATTTGGAGGAAATTGATGAAGTTGAACACGAATTGCTATTTGATCTTAGCGTTCTCTGCTTCTATAATAAACATCTGCCGTTTTCGCCAATTTTTCAACCTTACTATAGCAGACTGGATTGAGTCTTGCAGTTTTAACTGTAAGCTGGGTTTGCCATTTCCAATGGG
GTTCTGGCCTAGATGGGATCAAGAATTCATAATTGCTTAGGGTTTCCGATATGGTCTTCTTTTGTATCGGTTTGTGAAAATCAGTTGCAGCTGTGAATAACCCCGTTGTGGTTACTGACCTCCAAGTTCCAATCCTTGGCTATACTTATAATCTCTGTTCCCCAGGTTCTCGTTATTGAGAGGAACGACATCAAGGACAT
CTGTTTTTAAGGTTCCCGTTATTGAGATGGATGACATCAAGGACGACCCTAAGCCTGACAGAACTGGAGGGTGGGCAAGGAAAAGGCTTGAGAAATCCCTGGTGAAAGAAACAAAGCTAATTGTGTAGCTAACATCGCTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTCCAAATTTCAGGT
TTATTGCAAATGAAGTTGCTCCAATGAAATGGGGTCAAGATATCTTCTTTCACATTCAAAATTTGTGAAACTTTATAATTTGTGAAACTTTATTAACATCTCATTTGGTGGTGTTT


>TRINITY_DN43270_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:
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TCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTGTAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGCTATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCAAATACCTCAATTTCCAGAGGCGATAAG
ATGGTTATAATCATTTATCTTCAGAGGAATTTGGAGGAAATTGATGAAGTTGAACACGAATTGCTA




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>TRINITY_DN48405_c0_g1_i13 from sample A7 / Example spliced isoform
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TTCTGAAGATACTCCACGATGTCAGTGGTGTAATAAAACCTTCTAGAATGACTATGCTTCTTGGACCTCCAAGCTCTGGAAAGACAACTTTGCTGTTGGCTCTTGCTGGGAAGCTCGACTCTGATCTCAAAGTATCCGGTAAAGTGACCTATAATGGACATGAAATGAACGAATTCGTACCTCAAAGGACATCAGCATAC
ATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGAGATGCTTTTCGAGCTCTCAAGGAGGGAAAAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTTCATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATAT
AGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTCGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACAACTGGAGAGATGATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATATCCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCATTA
AGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGAAGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCA
GATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTTCATTTCATGTAGGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAAAATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTA
TGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATGGCAACTATCACCATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGCTTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTCTCCTTTTTTTCA
GTCTTGTTATTGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATTTTCCTTGCCCATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGGAATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCA
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TTGCATTTTTCAGCATAGAATAACATCAATATTGGCGTGGTTTGCGTATTGCAGATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTGGGGATACTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGGTAAACTAAAACATGAACTAAATGAGCTAACATCCTCAATAA
CTCCTCGTCAGTTTCTGGGTTTCAACGTTTCCATGTTATTGCATGACTGATGTCTTTTGTGCAGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCGACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGGTGCTTTTCAACATTC
TATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCCGACTTGGCAATGAAG
CAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATTGTTAAGGGA
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CTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGATGTTTGTGGAAGAAGTGATGGAACTTGTTGAACTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAAAGACTTACAATAGCT
GTTGACTTGGTTGCAAACCCGTCCATTATCTTCATGGATGAACCCACATCAGGGCTCGATGCCCGAGCTGCAGCTATTGTCATGAGAACTGTACGCAATACTGTTGATACTGGGCGCACAGTTGTCTGCACAATTCACCAACCTAGCATTGATATATTTGAGGCATTTGATGAGCTCTTACTGATGAAAATGGGAGGACA
AGTCATATATGCAGGACCTCTTGGGCATCATTCTTACAAGCTGATCGAGTACTTTGAGGCTATCCCGGGAGTGCCCAGGATCAAAGAAGATTACAATCCATCAACCTGGATGCTAGAAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTCTTTTCCAGCAGAACC
AGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGTGTCCAATGCATAGCTTGCTTTTCGAAGCAGCACTGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTGTTTGGTAGTATATTC
TGTGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGGGATCGGCAATTCTTCAACTGTGCAACCTGTTGTTGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGTTGCTCAGGCTGCCAT
TGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATGGACTTCCAATGGACAGCAGTCAAATTTTTCTGGTTTATATTCTACATGTTCATGTGCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCATTGTTTCCTCGTTTT
TCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAATCCTGTTGCATGGACAGTGTATGGCCTCATTACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTATAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGC
TATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCAAATATCTCAATTTCCAGAGGCGATAAGATGGTTGTAAATTTGTCATCATTTATCTTCAGAGGAATTTGGAGGAAATTGATGAAGTTGAACACGAATTGCTATTTGA
TCTTAGCGTTCTCTGCTTCTATAATAAACATCTGCCGTTTTCGCCAATTTTTCAACCTTACTATAGCAGACTGGATTGAGTCTTGCAGTTTTAACTGTAAGCTGGGTTTGCCATTTCCAATGGGGTTCTGGCCTAGATGGGATCAAGAATTCATAATTGCTTAGGGTTTCCGATATGGTCTTCTTTTGTATCGGTTTGTG
AAAATCAGTTGCAGCTGTGAATAACCCCGTTGTGGTTACTGACCTCCAAGTTCCAATCCTTGGCTATACTTATAATCTCTGTTCCCCAGGTTCTCGTTATTGAGAGGAACGACATCAAGGACATCTGTTTTTAAGGTTCCCGTTATTGAGATGGATGACATCAAGGACGACCCTAAGCCTGACAGAACTGGAGGGTGGGC
AAGGAAAAGGCTTGAGAAATCCCTGGTGAAAGAAACAAAGCTAATTGTGTAGCTAACATCGCTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTCCAAATTTCAGGTTTATTGCAAATGAAGTTGCTCCAATGAAATGGGGTCAAGATATCTTCTTTCACATTCAAAATTTGTGAAACTTTAT
AATTTGTGAAACTTTATTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTTTAAATTGAATAGAAATTTC


>TRINITY_DN48405_c0_g1_i11 from sample A7 / Example unspliced isoform:
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TTCTGAAGATACTCCACGATGTCAGTGGTGTAATAAAACCTTCTAGAATGACTATGCTTCTTGGACCTCCAAGCTCTGGAAAGACAACTTTGCTGTTGGCTCTTGCTGGGAAGCTCGACTCTGATCTCAAAGTATCCGGTAAAGTGACCTATAATGGACATGAAATGAACGAATTCGTACCTCAAAGGACATCAGCATAC
ATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGAGATGCTTTTCGAGCTCTCAAGGAGGGAAAAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTTCATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATAT
AGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTCGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACAACTGGAGAGATGATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATATCCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCATTA
AGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGAAGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCA
GATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTTCATTTCATGTAGGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAAAATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTA
TGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATGGCAACTATCACCATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGCTTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTCTCCTTTTTTTCA
GTCTTGTTATTGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATTTTCCTTGCCCATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGGAATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCA
CCATCAGCAAGCAGGTTTTTCCGGCAGTTCCTGCTACTTTTCTGGGCACACCAGATGTCCTCGTCACTTTTCCGTTTCATTGCATCAGTGGGCCGAACGCTGGTCGTTGCAGGCACATTAGGATACTTAGTACTGGTGCTAATTTTTGTCTTGGGAGGATTTGTCATTTCTAAAGATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTG
GGGATACTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCGACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGG
TGCTTTTCAACATTCTATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCC
GACTTGGCAATGAAGCAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCT
TCAATTGTTAAGGGATGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGCAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGC
AGAATGATATCCATTCTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGgtatgctgttcagtcctccttctaaggggaaggatacttgattggaattcgaaaggtgaaccaatgctgacatgaaagcctttacaataattgtctatgtag


ATGTTT
GTGGAAGAAGTGATGGAACTTGTTGAACTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAAAGACTTACAATAGCTGTTGACTTGGTTGCAAACCCGTCCATTATCTTCATGGATGAACCCACATCAGGGCTCGATGCCCGAGCTGCAGCTATTGTCAT
GAGAACTGTACGCAATACTGTTGATACTGGGCGCACAGTTGTCTGCACAATTCACCAACCTAGCATTGATATATTTGAGGCATTTGATGAGCTCTTACTGATGAAAATGGGAGGACAAGTCATATATGCAGGACCTCTTGGGCATCATTCTTACAAGCTGATCGAGTACTTTGAGGCTATCCCGGGAGTGCCCAGGATCA
AAGAAGATTACAATCCATCAACCTGGATGCTAGAAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTCTTTTCCAGCAGAACCAGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGT
GTCCAATGCATAGCTTGCTTTTCGAAGCAGCACTGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTGTTTGGTAGTATATTCTGTGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGG
GATCGGCAATTCTTCAACTGTGCAACCTGTTGTTGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGTTGCTCAGGCTGCCATTGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATGGACTTCCAATGGACAGCAGTCA
AATTTTTCTGGTTTATATTCTACATGTTCATGTGCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCATTGTTTCCTCGTTTTTCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCC
AATCCTGTTGCATGGACAGTGTATGGCCTCATTACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTATAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGCTATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGC
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TTC




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>TRINITY_DN99166_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:
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ttgcatgactgatgtcttttgtgcag
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GCATGGCTT




Intron 6 GTATGTATCT ... TTTATTTCAG

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>TRINITY_DN48405_c0_g1_i13 from sample A7 / Example spliced isoform
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AGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGAAGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCA
GATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTTCATTTCATGTAGGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAAAATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTA
TGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATGGCAACTATCACCATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGCTTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTCTCCTTTTTTTCA
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TATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCCGACTTGGCAATGAAG
CAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATTGTTAAGGGA
TGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGCAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGCAGAATGATATCCATT
CTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGATGTTTGTGGAAGAAGTGATGGAACTTGTTGAACTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAAAGACTTACAATAGCT
GTTGACTTGGTTGCAAACCCGTCCATTATCTTCATGGATGAACCCACATCAGGGCTCGATGCCCGAGCTGCAGCTATTGTCATGAGAACTGTACGCAATACTGTTGATACTGGGCGCACAGTTGTCTGCACAATTCACCAACCTAGCATTGATATATTTGAGGCATTTGATGAGCTCTTACTGATGAAAATGGGAGGACA
AGTCATATATGCAGGACCTCTTGGGCATCATTCTTACAAGCTGATCGAGTACTTTGAGGCTATCCCGGGAGTGCCCAGGATCAAAGAAGATTACAATCCATCAACCTGGATGCTAGAAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTCTTTTCCAGCAGAACC
AGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGTGTCCAATGCATAGCTTGCTTTTCGAAGCAGCACTGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTGTTTGGTAGTATATTC
TGTGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGGGATCGGCAATTCTTCAACTGTGCAACCTGTTGTTGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGTTGCTCAGGCTGCCAT
TGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATGGACTTCCAATGGACAGCAGTCAAATTTTTCTGGTTTATATTCTACATGTTCATGTGCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCATTGTTTCCTCGTTTT
TCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAATCCTGTTGCATGGACAGTGTATGGCCTCATTACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTATAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGC
TATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCAAATATCTCAATTTCCAGAGGCGATAAGATGGTTGTAAATTTGTCATCATTTATCTTCAGAGGAATTTGGAGGAAATTGATGAAGTTGAACACGAATTGCTATTTGA
TCTTAGCGTTCTCTGCTTCTATAATAAACATCTGCCGTTTTCGCCAATTTTTCAACCTTACTATAGCAGACTGGATTGAGTCTTGCAGTTTTAACTGTAAGCTGGGTTTGCCATTTCCAATGGGGTTCTGGCCTAGATGGGATCAAGAATTCATAATTGCTTAGGGTTTCCGATATGGTCTTCTTTTGTATCGGTTTGTG
AAAATCAGTTGCAGCTGTGAATAACCCCGTTGTGGTTACTGACCTCCAAGTTCCAATCCTTGGCTATACTTATAATCTCTGTTCCCCAGGTTCTCGTTATTGAGAGGAACGACATCAAGGACATCTGTTTTTAAGGTTCCCGTTATTGAGATGGATGACATCAAGGACGACCCTAAGCCTGACAGAACTGGAGGGTGGGC
AAGGAAAAGGCTTGAGAAATCCCTGGTGAAAGAAACAAAGCTAATTGTGTAGCTAACATCGCTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTCCAAATTTCAGGTTTATTGCAAATGAAGTTGCTCCAATGAAATGGGGTCAAGATATCTTCTTTCACATTCAAAATTTGTGAAACTTTAT
AATTTGTGAAACTTTATTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTTTAAATTGAATAGAAATTTC


>TRINITY_DN48405_c0_g1_i12 from sample A7 / Example unspliced isoform:
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AACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTgtatgtatctcaaaacatgctcattacgctgccctcattagttagctcatttggatcgacttaccaagttaccacactttatttcagTCGCCGACTTGGCAATGAAGCAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTA
ACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCTTCAATTGTTAAGGGATGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGT
GTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGCAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGCAGAATGATATCCATTCTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCT
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Intron 7 GTACCGACAA ... TCAATTTCAG

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>TRINITY_DN48405_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform
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ATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGAGATGCTTTTCGAGCTCTCAAGGAGGGAAAAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTTCATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATAT
AGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTCGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACAACTGGAGAGATGATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATATCCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCATTA
AGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGAAGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCA
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GTCTTGTTATTGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATTTTCCTTGCCCATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGGAATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCA
CCATCAGCAAGCAGGTTTTTCCGGCAGTTCCTGCTACTTTTCTGGGCACACCAGATGTCCTCGTCACTTTTCCGTTTCATTGCATCAGTGGGCCGAACGCTGGTCGTTGCAGGCACATTAGGATACTTAGTACTGGTGCTAATTTTTGTCTTGGGAGGATTTGTCATTTCTAAAGATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTG
GGGATACTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCGACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGG
TGCTTTTCAACATTCTATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCACAGGAGAAGAGTTATCTTCCAAGGGAAAGAAGAAAACCAAAACTCCAGGCTTCTCGTCATCTCATCCCAGGGAGGCCTCAATTGACTTCGCC
GACTTGGCAATGAAGCAATCCAATATCTTCTCAATTGGACACTCTGACCGAATGGAGGCTAACATTGCTGTCAGTGTTATGGCTGCCAAGAGAGGGATGGTATTGCCATTCCAGCCCCTATCCCTTGTATTCAACCATATAAATTATTATGTGGACATGCCAGTGGAAATGAAGAGGCAAGGCATTATGGAAGATAGGCT
TCAATTGTTAAGGGATGTCAGTGGTGCCTTCAGACCTGGCGTCCTCACAGCTCTAGTTGGTGTGACTGGTGCTGGAAAAACCACTTTAATGGATGTTCTTGCAGGAAGAAAAACTGCAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGC
AGAATGATATCCATTCTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGATGTTTGTGGAAGAAGTGATGGAACTTGTTGAACTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAA
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GAAAATGGGAGGACAAGTCATATATGCAGGACCTCTTGGGCATCATTCTTACAAGCTGATCGAGTACTTTGAGGCTATCCCGGGAGTGCCCAGGATCAAAGAAGATTACAATCCATCAACCTGGATGCTAGAAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTC
TTTTCCAGCAGAACCAGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGTGTCCAATGCATAGCTTGCTTTTCGAAGCAGCACTGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTG
TTTGGTAGTATATTCTGTGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGGGATCGGCAATTCTTCAACTGTGCAACCTGTTGTTGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGT
TGCTCAGGCTGCCATTGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATGGACTTCCAATGGACAGCAGTCAAATTTTTCTGGTTTATATTCTACATGTTCATGTGCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCA
TTGTTTCCTCGTTTTTCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAATCCTGTTGCATGGACAGTGTATGGCCTCATTACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTATAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAA
CAATTTTTGGAAAGCTATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCAAATATCTCAATTTCCAGAGGCGATAAGATGGTTGTAAATTTGTCATCATTTATCTTCAGAGGAATTTGGAGGAAATTGATGAAGTTGAACA
CGAATTGCTATTTGATCTTAGCGTTCTCTGCTTCTATAATAAACATCTGCCGTTTTCGCCAATTTTTCAACCTTACTATAGCAGACTGGATTGAGTCTTGCAGTTTTAACTGTAAGCTGGGTTTGCCATTTCCAATGGGGTTCTGGCCTAGATGGGATCAAGAATTCATAATTGCTTAGGGTTTCCGATATGGTCTTCTT
TTGTATCGGTTTGTGAAAATCAGTTGCAGCTGTGAATAACCCCGTTGTGGTTACTGACCTCCAAGTTCCAATCCTTGGCTATACTTATAATCTCTGTTCCCCAGGTTCTCGTTATTGAGAGGAACGACATCAAGGACATCTGTTTTTAAGGTTCCCGTTATTGAGATGGATGACATCAAGGACGACCCTAAGCCTGACAG
AACTGGAGGGTGGGCAAGGAAAAGGCTTGAGAAATCCCTGGTGAAAGAAACAAAGCTAATTGTGTAGCTAACATCGCTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTCCAAATTTCAGGTTTATTGCAAATGAAGTTGCTCCAATGAAATGGGGTCAAGATATCTTCTTTCACATTCAAAA
TTTGTGAAACTTTATAATTTGTGAAACTTTATTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTTTAAATTGAATAGAAATTTC


>TRINITY_DN48405_c0_g1_i15 from sample A7 / Example unspliced isoform:
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TTCTGAAGATACTCCACGATGTCAGTGGTGTAATAAAACCTTCTAGAATGACTATGCTTCTTGGACCTCCAAGCTCTGGAAAGACAACTTTGCTGTTGGCTCTTGCTGGGAAGCTCGACTCTGATCTCAAAGTATCCGGTAAAGTGACCTATAATGGACATGAAATGAACGAATTCGTACCTCAAAGGACATCAGCATAC
ATTAGTCAAAATGATCTGCATCACGGTGAGATGACTGTCAGAGAGACTCTAGATTTCTCTGGCCGCTGTCAAGGAGTTAGAACCAGATACGgtaccgacaaagtttctaccgaagtttgtcatttctccgaggacgtttctgaaatttgaacttcatttccttccatagaattgacagactgttttaagtgtcttgaaca
gactgaaaattgtcgtctgtcatgcttgtacatcgtcatggtatttatctttgtgttagtttcatatgaaagtatgtttagaagccaggtttgaaaaacaattgctcaagttttcacaatgaaatttgctggcataaactgggacaaattattgaaaattactacttctccatcaatttcag
AGATGCTTTTCGAGCTCT
CAAGGAGGGAAAAGGAAGCAGGAATTAAACCAGACCACGACATTGATGTGTTCATGAAGGCTGCAGCCATGGAAGGTCAAGAAACAAATATAGTCACAGATTATGTCCTCAAGATTCTCGGCTTGGACATCTGTGCAGATACCTTAGTGGGCGATGAAATGCGAAGAGGAATTTCAGGAGGTCAAAAGAAACGAGCGACA
ACTGGAGAGATGATTGTTGGTCCTGCCAAACCTCTGTTCATGGATGAGATATCCACGGGGCTAGATAGCTCAACAACTTTCCAAATCATTAAGTGTTTACGCCAAACAGTTCATGTCATGGATGGAACAATGCTTATTTCTCTTCTTCAACCTACCCCAGAGACATTTGAACTGTTTGATGATATAATCTTACTGTCGGA
AGGGCAGATTGTTTATCAAGGACCACGGGAAAACATTGTTGAGTTCTTTGAGTTCATGGGATTCAAGTGTCCTGAGAGAAAGGGTATCGCAGATTTTTTGCAAGAGGTGACATCCAGAAAGGACCAGGAACAATATTGGGCCAATAAAAAACAGCCATATCGCTATGTTCCAGTCAAAGAATTTGCAGAATCTTTCAGTT
CATTTCATGTAGGTCGGCAACTTGTTGAGGAGTTAGCAGTTCCATTTGGTAAAATGAGAAGTCATCCTGCCGCTTTGGCCACTGAAAAGTATGGTATCAGCAAGAGGGAACTATTCAAAACTTGCTTTTCTAGAGAATGGTTGCTCTTGAAACGAAATTTGTTAGTATTTATATTCAAGACTACCCAGATATCAATCATG
GCAACTATCACCATGACAGTATTCTTGCGGACAGAGATGAAACACAAAACGCTTGCAGATGGAAACAAGTACTTTGGTCTCCTTTTTTTCAGTCTTGTTATTGTGATGTTCAATGGAATGGCAGAGTTGGCTATGACGGTTGCCAGGCTACCAGTATACTACAAGCAAAGAGACTTGCTATTCTACCCTGCCTGGGCATT
TTCCTTGCCCATTTGGGTGTTGACAATCCCTTTATCTTTCCTTGAATCGGGAATATGGATTATATTAACTTACTTTGTGGTAGATTTTGCACCATCAGCAAGCAGGTTTTTCCGGCAGTTCCTGCTACTTTTCTGGGCACACCAGATGTCCTCGTCACTTTTCCGTTTCATTGCATCAGTGGGCCGAACGCTGGTCGTTG
CAGGCACATTAGGATACTTAGTACTGGTGCTAATTTTTGTCTTGGGAGGATTTGTCATTTCTAAAGATGCTCTTGGACCATGGTGGATTTGGGGATACTGGGCTTCTCCTATAATGTATGCCTTGAATGCTATAGCCATCAATGAATATCTAGACAAGCGTTGGAGCATGCCCAACGATGATCCTAGCATAGATGAACCG
ACCATTGGGAAAGCAATTTTGAAAAGCAGAGGCATGTTCACCTGTGGGTATTGGTACTGGATCAGCATTGGAGCTCTGGCTGTTTTTTCGGTGCTTTTCAACATTCTATTCACACTGGCTCTAAAGTATCTAAATCCTCTTGGGAAACCTCAGGCTATCATTTCTGAAGAGGTTCTTGAAGAAAAGCATGTTAACCGCAC
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AAAACTGCAGGTTGCATCGAAGGAAGCATCAGTGTATCCGGTTATCCCAAGAAACAGGAAACCTTTGCTCGTGTATCAGGCTACTGTGAGCAGAATGATATCCATTCTCCTTTTGTGACAGTCTATGAATCTCTTCTCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTCCTTCAGAAGTTGATTCTAAAACACGAAAGATGTTTGTGGA
AGAAGTGATGGAACTTGTTGAACTGGCACCTCTAAGACAAGCTCTTGTGGGTCTTCCTGGAGTAGACGGCCTTTCAACTGAACAGCGTAAAAGACTTACAATAGCTGTTGACTTGGTTGCAAACCCGTCCATTATCTTCATGGATGAACCCACATCAGGGCTCGATGCCCGAGCTGCAGCTATTGTCATGAGAACTGTAC
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AATCCATCAACCTGGATGCTAGAAGTTAGTTCTCCTGCTGCTGAAACTCATCTTGGTGTAGACTTTGCAGAAGTGTACTCAAATTCCCCTCTTTTCCAGCAGAACCAGGCACTTATCAAAGAGCTGAGCACACCGGTACCTAGCTCCAGGGACCTCGACTTCCGTTCCAAATATTCTCAGAGTTTCAGTGTCCAATGCAT
AGCTTGCTTTTCGAAGCAGCACTGGTCTTACTGGAAGAATCCAAACTACAATGTTGTTCGTTTTCTTTCCACAACTGTGACGGCCCTTCTGTTTGGTAGTATATTCTGTGGACTAGGCAGCAAAACGAACAAACAACAGGATTTGATCAATATTATGGGTGCTATGTTTGCCTCAACATTGTTCCTTGGGATCGGCAATT
CTTCAACTGTGCAACCTGTTGTTGGAGTTGAGAGAACTGTGTTCTATCGTGAAAAGGCAGCTGGGATGTACTCAGCTGTTCCTTATGCAGTTGCTCAGGCTGCCATTGAGATTCCATATATACTAATCCAAACCATTATTTTCTCTCTCATTGTCTATTCAATGATGGACTTCCAATGGACAGCAGTCAAATTTTTCTGG
TTTATATTCTACATGTTCATGTGCTTTGTGTATTTTACAATGTATGGGATGATGGCTGTTGCTCTGACTCCTGGTAACGAGATTGCTGCCATTGTTTCCTCGTTTTTCTATGGATTCTGGAATCTCTTCTCTGGATTTATCATCATTCGGCCCCAAATTCCCGTGTGGTGGAGGTGGTATTACTGGGCCAATCCTGTTGC
ATGGACAGTGTATGGCCTCATTACTTCTCAACTTGGAGATTTGACTAGTTTTATAGAGGTTGCTGGTGAAAAGGATGCCATGACTGTGAAACAATTTTTGGAAAGCTATTTTGGATATAGGTATGATTTCCTGGGTGTGGTAGCTGCGGTGCATGTCGGGATAATAATCCTCTTTTTCTCGGTGTTTGCCTTTGGCATCA
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AAATTGAATAGAAATTTCCAAATTTCAGGTTTATTGCAAATGAAGTTGCTCCAATGAAATGGGGTCAAGATATCTTCTTTCACATTCAAAATTTGTGAAACTTTATAATTTGTGAAACTTTATTAACATCTCATTTGGTGGTGTTTTTCCATCTTAAATTGAATAGAAATTTTTAAATTGAATAGAAATTTC