sp|Q9M2T1|AP3BA_ARATH ----> AP3-complex subunit beta-A
Intron 1 GTAAGATTAA ... TTAATTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.08 | 10 | 1 | 5 |
| A2 | 34.69 | 16 | 12 | 5 |
| A3 | 26.67 | 22 | 4 | 12 |
| A4 | 30.86 | 28 | 19 | 6 |
| A5 | 30.43 | 8 | 7 | 0 |
| A6 | 25.81 | 46 | 22 | 10 |
| A7 | 21.37 | 46 | 11 | 14 |
| A8 | 24.64 | 52 | 29 | 5 |
| A9 | 25.68 | 55 | 25 | 13 |
| A10 | 26.47 | 25 | 10 | 8 |
>TRINITY_DN39243_c0_g2_i1 from sample A9 / Example spliced isoformGTAAAGCTGCTAGCGTAGGCGGCAGGGACTAGCTACTAGCGTAGCCATTGTTCTATAAGAATAAAAAAAATGGAAAAAGACGCAGCCAAAAACGAGATCACCATGAGAATTGGTCCCTTTCATTAGGCAGAAAGTATTTGAATAGGCATCGTAAAGTAATTGAATGTATATGCACATCTGAAATCTATTCGTCTTCCTGA
AATTTCAGCTGACACTGACACTCACGACTAGGGGAAAATTTCATGGAATAAATGGCAATTGATCTTACACTGTGACATTGGCTACGAGTGATAGCAGATGCAGTAGAGGAAAGCAAGCATCCGAGCATGTGGGTGATTAAAATTGATCGATTTTATCATTGAGTGGGCATTGGAGGTTCATCCAATCGATTCCAATCTAT
TAGGTGTAGGCGGGCATGTTCCCTCAGTTTGCAACAACATCAGACACCTTCACCAGGGCTTCAAGCATGGTATTCAGAATGGGCAGCGATGGTCATCTCTATGACGACCCCCAGGATGCGAACATTGAATCTCTCCTCGACAGCAAGTTCGACACGGAGAAGGCCGAGGCATTGAAGCGCCTTCTCGCTCTCATGTCCCA
GGGCTGTGATGTCTCCAATTTCTTCCCCCAGGTTGTAAAAAATGTGGCATCTCCATCCTTGGAGGTCAAAAAACTGGTTTATATCTATCTTGTACATTATGCTGAAAGGCGACCAGATGAGGCTTTACTGCCAATCAATAGCTTTCAGAAGGATCTGTCAGATTTGAATCCATTGGTGCGTGCATGGGCTCTTCGTGCGA
TGTCTGGAATCCGTGTTCATGTTGTGGCACCTCTGGTTTTAATGGCTGTTAATAAAGGTGCTAGAGATCCTTCTCCTTACGTGAGAAGGTGTGCTGCAAATGCTATTCCAAAGCTTTATGATTTGGAAAGGGAGGAACACGATACTGCCCTGCAAGAGCTCATTGGACTCTTGCTGACTGATAAGTGCGCAGGAGTGATT
GGAGCTGCAGCAGCTGCATATAATGTTGTCTGTCCTGATAATCTGACATTGATTGGCTCAAATTTTAAAAAGTTATGTCAGACACTTCCAGATGTTGAAGAGTGGGGCCAGATCATCTTGATTGAGATTTTATTGCATTATGCTGTTGCAAAACATGGAATCACAAAAATGTCTGCTGCATTAAATTCAGGTTATACGAA
GAGACTAAACATTGAAACAGAAAATTCTGATAGTTCATCAGAAGGCATTATGAACCACGGAGTTGGCAAAAGCAGTGCCTCCAAGGGAGACGAAGGTCACAAAATGGAAGGAAAGGGCCTGGTTTCTAGCTTCTTAAGAAATGATCAACAAAATAAGTTATCAAGGACAACCTCTTTGAGCAGTGGTTCATCTGAGTCAA
ATGATACTATTTCTACTATTGAGCTTCATAGTGATTTGAAACTTCTATTGCAATGCACATCCCCTTTGTTATGGAGTCAAAACAGTGGGGTTGTTGTTGCTGCTGCTGGAGTCCATTGGCTTATGGCTCCAGTTAAGGATGTGAGAAGAATTGTGAAGCCACTTTTGTTCCTTCTCAGGTCTTCTTATGACTCACAGTAT
GTGGTACTATCAAATCTGGCAACATTTGTTGGGGCAATGCCCTCCTTATTTGAGCCATACTTTGAAGATTTCTTTGTGCGGTCCTCTGACACATACCAAATGCGAGCAATCAAGCTGGATATCTTGTCTCTAATTGCAACGGAATCATCTATTGATACAATATTGTTAGAGTTTCAGGACTATATTAGAGATCCAGATAG
AAAGTTTGCTGCGGATGCAGTTTCTGCAATTGGGCGATGTGCTAAAAGACTTCCATCTGTGGCTTTGACCTGTTTGAAAGGTCTTCTGGCATTGGTTAGACAAAGCTCTATAGCATTGCGGGGAAGCAACTGTCCTGGTAATGAAGAAACTGCTGATGCTGAAGAAACTGCTGACTCCAGAAAAAAAAAATTTCCTGGAG
CTAAGGCAGATCTGGTTTTCCGAGCTGACTGGATGCTTCCTGTGGGTGATAAAATTAATAGAGAGGCATCTGTTCTGACACAAGCGATATTGGCTATTAAAACAATCCTACGAGAGCATCCAGTTGAATTGGAAAAGGTTTTTGTTCAGCTCATTCAGAGTTTGGATCTCATCAAGGTTCCCACAGCACGTGCAGTGGTA
ATTTGGATGGTTGGAGAGTATAGCTCTACTGGTGATTTGATCCCCAAGATAGTACCTACTATTCTGAAGTACTTGGGTGCCTGCTTTCCAACAGAAGGATTGGAGGCTAAGTTACAGATACTCAACTGTGTTGCTAAGGTAGTTTTGCATTCTCAGGCAATTGATCAAAACATGATATTGTTGGTGTCAAACTATGTACT
TGACATGGGAGAATGTGACTTGAACTATGATGTTCGAGACCGAGCACATATGCTCAAGAAGCTTTTAGCATCTTACTTATCTGGTGTTGGTTTGGATGAAAGAAATCATGCTCCACAAACTTCCGAAGGAGGAGAACATGTTGTATTAGTTGATTTACCTGGGCCTACTGCTGTTGAATCAGAAAAATCTCAAGACAATT
CTATAAAGCATGCTGTTGGTGAAACATCTCTTTCACAGCAGGAGCTTCATGCAAACTTGCTCCCTGCACTTGCAAAAAATGTTCTTCTTTCACCCAAGCTGGCTACATTGTTGCATTCAGCAAACAATGTTAGGCTTTTCTTGCCTGGTTCCCTTTCTCACATTGTCCAACACAGAGCTCCAGGTTATAGACCTTTACCA
AAACCAGGTAGTCTGTGTCAGATTCACATCCATCATACCAATGAAGTTAGGCAACCTACTGCATTAAAAGGCAAGGCTAGGGCCAATGGTCAGGATAGTTCTGCTGATATAGATGATAACACCTCTTTGTCTTCTGATGGATCCTTTAGTGATGGAAGTTTGCATGGCCGTGAAAGTGGATCAGATGAAGAACTTGATCA
ATCAAATGCTAGTGAAGGTTCAGACCTTGAAATTATTTGCAAGAATAGGTCGAGATATTCATCAACCAGCTCAACTAGAAACTCTTGTGTGAAGCCCAGAGCTTCTGAATCAAACAATAAAACAAGTAAAGATGTAGAAGGAAAAGGAAAAGGGGGGGATCAAAGACGTGTTGAACCACTAATCTATTTATCGGATGGTG
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TATACACTTTTAGATTTCACAAATGGAGATGGTATGAATGTCATGTATGCATTCTCTAATGAGCAGTCAAGCTATTCACCAATGATGGTCTGTATTCGCCTTTTTTTCTATAATCGTTCATCAGATGCAATCTTTAACATTGTTGTCAAAGCTGATGAGTCAACAGAGTCTCCTGTGGAACCTGGAGCACCAGCAACAGA
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TGAGACCACTTTCTATGAATTTAGCTGCATTTACATCTAAAGAATCTCAGATGTCAGGCATGCTTGAAAATTCACGCAGGTGTACGTTTAGAGAACATCTTCAAACGCCTTCCGATGTAAATGATACCCAGCTTCAGTATGATGATAAACTTGTTTGTGTTGCTCAGACTATTGTATCTAGAATTCTCGGCAGATTTCAT
GTTTCAGTGGTATCTGTAACAATTCCAATTTTTACATCATTCATGGATCAATCTGGTGGGCATGGAGATGTTCAAGGCCTATGCCTAAGGTTCAGCAGCGAGACATTGTCAGGGTGTACACCTTGTTTGATAACAGTGACTGCAGAAGAGTGTTACACTGGTGCAGAATTGCCTGTATTAGTCAAAATAAACTGTGAAGA
TGCAGTGTTCGGGTTGAATCTTTTGAAGAGATTAGTTGAAGTTTTGACTGAAAGTCAAAGTTAATAATCAAGAATTGTATATAAGCACATGAACGGTGCTGAATTTCATTGTGAGCAGTCATTCTTAGTGGGAAATGATAAATAGGATGATGATGTGGCTGCACTCTTGTGATTTTTTCATTTGGTATATTTGAAAATCT
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TAACTTAATGCAGATAAATGTCTATGGAACACTCTACCTGAAGAGAAGCAGTGTTCAAGTATTCAGGACATTTGAGGGGGAGTGGGAATCATTTACAAAGGTGTAACTGCTTTTGTGTGATAATATAATCTTAATTTACACAATACTTGGCATTTCTTGCACCATATCTTGCTCTCATATTAAGATGCTACACCCACTTC
AGTAGATTGAGTCCTCTTTCATAGCAACATTCCACGTCATTCTTCATAATAATGGACGTGACTATGATATGGGCTCCGAAAAATAGGTTGGGTATAGTAAACCGACAGGTGTTGTCAGAGATAATTTGGGTTTCTGCCAGCTTTCTAGAGAGGGCTTAACATCCTTTTGGGCAAATTTGTCATTCCCTGCATGGATTTGT
GTTTTGAGTTGGTGAAGCTCAAGGCTTAAATGTTATCATATGGGCATTCATCCCACTAGAGAATGATGAATTTGATTGAAATGTATAGACATCTGAGTTTTCTTCTCTATTTCATTTGATAGAAAATCCTCAC
>TRINITY_DN39243_c0_g2_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:GTAAAGCTGCTAGCGTAGGCGGCAGGGACTAGCTACTAGCGTAGCCATTGTTCTATAAGAATAAAAAAAATGGAAAAAGACGCAGCCAAAAACGAGATCACCATGAGAATTGGTCCCTTTCATTAGGCAGAAAGTATTTGAATAGGCATCGTAAAGTAATTGAATGTATATGCACATCTGAAATCTATTCGTCTTCCTGA
AATTTCAGCTGACACTGACACTCACGACTAGGGGAAAATTTCATGGAATAAATGGCAATTGATCTTACACTGTGACATTGGCTACGAGTGATAGCAGATGCAGTAGAGGAAAGCAAGCATCCGAGCATGTGGGTGATTAAAATTGATCGATTTTATCATTGAGTGGGCATTGGAGGTTCATCCAATCGATTCCAATCTAT
TAGGTGTAGGCGGGCATGTTCCCTCAGTTTGCAACAACATCAGACACCTTCACCAGGGCTTCAAGCATGGTATTCAGAATGGGCAGCGATGGTCATCTCTATGACGACCCCCAGGATGCGAACATTGAATCTCTCCTCGACAGCAAGTTCGACACGGAGAAGGCCGAGGCATTGAAGCGCCTTCTCGCTCTCATGTCCCA
GGGCTGTGATGTCTCCAATTTCTTCCCCCAGGTTGTAAAAAATGTGGCATCTCCATCCTTGGAGGTCAAAAAACTGGTTTATATCTATCTTGTACATTATGCTGAAAGGCGACCAGATGAGGCTTTACTGCCAATCAATAGCTTTCAGAAGGATCTGTCAGATTTGAATCCATTGGTGCGTGCATGGGCTCTTCGTGCGA
TGTCTGGAATCCGTGTTCATGTTGTGGCACCTCTGGTTTTAATGGCTGTTAATAAAGGTGCTAGAGATCCTTCTCCTTACGTGAGAAGGTGTGCTGCAAATGCTATTCCAAAGCTTTATGATTTGGAAAGGGAGGAACACGATACTGCCCTGCAAGAGCTCATTGGACTCTTGCTGACTGATAAGTGCGCAGGAGTGATT
GGAGCTGCAGCAGCTGCATATAATGTTGTCTGTCCTGATAATCTGACATTGATTGGCTCAAATTTTAAAAAGTTATGTCAGACACTTCCAGATGTTGAAGAGTGGGGCCAGATCATCTTGATTGAGATTTTATTGCATTATGCTGTTGCAAAACATGGAATCACAAAAATGTCTGCTGCATTAAATTCAGGTTATACGAA
GAGACTAAACATTGAAACAGAAAATTCTGATAGTTCATCAGAAGGCATTATGAACCACGGAGTTGGCAAAAGCAGTGCCTCCAAGGGAGACGAAGGTCACAAAATGGAAGGAAAGGGCCTGGTTTCTAGCTTCTTAAGAAATGATCAACAAAATAAGTTATCAAGGACAACCTCTTTGAGCAGTGGTTCATCTGAGTCAA
ATGATACTATTTCTACTATTGAGCTTCATAGTGATTTGAAACTTCTATTGCAATGCACATCCCCTTTGTTATGGAGTCAAAACAGTGGGGTTGTTGTTGCTGCTGCTGGAGTCCATTGGCTTATGGCTCCAGTTAAGGATGTGAGAAGAATTGTGAAGCCACTTTTGTTCCTTCTCAGGTCTTCTTATGACTCACAGTAT
GTGGTACTATCAAATCTGGCAACATTTGTTGGGGCAATGCCCTCCTTATTTGAGCCATACTTTGAAGATTTCTTTGTGCGGTCCTCTGACACATACCAAATGCGAGCAATCAAGCTGGATATCTTGTCTCTAATTGCAACGGAATCATCTATTGATACAATATTGTTAGAGTTTCAGGACTATATTAGAGATCCAGATAG
AAAGTTTGCTGCGGATGCAGTTTCTGCAATTGGGCGATGTGCTAAAAGACTTCCATCTGTGGCTTTGACCTGTTTGAAAGGTCTTCTGGCATTGGTTAGACAAAGCTCTATAGCATTGCGGGGAAGCAACTGTCCTGGTAATGAAGAAACTGCTGATGCTGAAGAAACTGCTGACTCCAGAAAAAAAAAATTTCCTGGAG
CTAAGGCAGATCTGGTTTTCCGAGCTGACTGGATGCTTCCTGTGGGTGATAAAATTAATAGAGAGGCATCTGTTCTGACACAAGCGATATTGGCTATTAAAACAATCCTACGAGAGCATCCAGTTGAATTGGAAAAGGTTTTTGTTCAGCTCATTCAGAGTTTGGATCTCATCAAGGTTCCCACAGCACGTGCAGTGGTA
ATTTGGATGGTTGGAGAGTATAGCTCTACTGGTGATTTGATCCCCAAGATAGTACCTACTATTCTGAAGTACTTGGGTGCCTGCTTTCCAACAGAAGGATTGGAGGCTAAGTTACAGATACTCAACTGTGTTGCTAAGGTAGTTTTGCATTCTCAGGCAATTGATCAAAACATGATATTGTTGGTGTCAAACTATGTACT
TGACATGGGAGAATGTGACTTGAACTATGATGTTCGAGACCGAGCACATATGCTCAAGAAGCTTTTAGCATCTTACTTATCTGGTGTTGGTTTGGATGAAAGAAATCATGCTCCACAAACTTCCGAAGGAGGAGAACATGTTGTATTAGTTGATTTACCTGGGCCTACTGCTGTTGAATCAGAAAAATCTCAAGACAATT
CTATAAAGCATGCTGTTGGTGAAACATCTCTTTCACAGCAGGAGCTTCATGCAAACTTGCTCCCTGCACTTGCAAAAAATGTTCTTCTTTCACCCAAGCTGGCTACATTGTTGCATTCAGCAAACAATGTTAGGCTTTTCTTGCCTGGTTCCCTTTCTCACATTGTCCAACACAGAGCTCCAGGTTATAGACCTTTACCA
AAACCAGGTAGTCTGTGTCAGATTCACATCCATCATACCAATGAAGTTAGGCAACCTACTGCATTAAAAGGCAAGGCTAGGGCCAATGGTCAGGATAGTTCTGCTGATATAGATGATAACACCTCTTTGTCTTCTGATGGATCCTTTAGTGATGGAAGTTTGCATGGCCGTGAAAGTGGATCAGATGAAGAACTTGATCA
ATCAAATGCTAGTGAAGGTTCAGACCTTGAAATTATTTGCAAGAATAGGTCGAGATATTCATCAACCAGCTCAACTAGAAACTCTTGTGTGAAGCCCAGAGCTTCTGAATCAAACAATAAAACAAGTAAAGATGTAGAAGGAAAAGGAAAAGGGGGGGATCAAAGACGTGTTGAACCACTAATCTATTTATCGGATGGTG
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TATACACTTTTAGATTTCACAAATGGAGATGGTATGAATGTCATGTATGCATTCTCTAATGAGCAGTCAAGCTATTCACCAATGATGGTCTGTATTCGCCTTTTTTTCTATAATCGTTCATCAGATGCAATCTTTAACATTGTTGTCAAAGCTGATGAGTCAACAGAGTCTCCTGTGGAACCTGGAGCACCAGCAACAGA
AGTACATGACCAACTTGTGGTTTCATCAGAACCACCAAGAGTTATTCCTATGCAAGAGATTCCCTGTCTTGGTCCAGGTCAAACAATAGAGGCAGAGCTTTATGTTTCTTTTCATCATCAGTTAGTACCTATCAAGTTGGGTGTCTATTGCAATAAGAGATGTTATTCTGTTAGATTGAGGCCTGAAATAGGGGCCTTGT
TGAGACCACTTTCTATGAATTTAGCTGCATTTACATCTAAAGAATCTCAGATGTCAGGCATGCTTGAAAATTCACGCAGgtaagattaaagctgccatgtaaagataatatatctatggattcttatactactactacacaatttacttatgccttcatatactactaatggtagagtggaacattatgtgcctcaacta
tatctagtgatagtagcctttttatattatggtaattgaagtttgagaatattttgacttgtgacaaaaaggatccaaatctagttggtttctaataacatgcccttaattccagGTGTACGTTTAGAGAACATCTTCAAACGCCTTCCGATGTAAATGATACCCAGCTTCAGTATGATGATAAACTTGTTTGTGTTGCT
CAGACTATTGTATCTAGAATTCTCGGCAGATTTCATGTTTCAGTGGTATCTGTAACAATTCCAATTTTTACATCATTCATGGATCAATCTGGTGGGCATGGAGATGTTCAAGGCCTATGCCTAAGGTTCAGCAGCGAGACATTGTCAGGGTGTACACCTTGTTTGATAACAGTGACTGCAGAAGAGTGTTACACTGGTGC
AGAATTGCCTGTATTAGTCAAAATAAACTGTGAAGATGCAGTGTTCGGGTTGAATCTTTTGAAGAGATTAGTTGAAGTTTTGACTGAAAGTCAAAGTTAATAATCAAGAATTGTATATAAGCACATGAACGGTGCTGAATTTCATTGTGAGCAGTCATTCTTAGTGGGAAATGATAAATAGGATGATGATGTGGCTGCAC
TCTTGTGATTTTTTCATTTGGTATATTTGAAAATCTCCACCCCCTTGATTGGAGAGAGCCCGAAAAGCAGAAAAGGTCTGTTTTTTATTCATTCACTTGTTGACCATTGAAAGTGAGAGATGTTAACTAGACTCCCTACACTGGAGTGATTCGATTGTATTGATAGTGATTTTCTTTTCAGTTTTAGGTTTAAACTTCCG
ATTTATGAGATGATTTCCTATCACGAGAAAGGCTTGTAACTTAATGCAGATAAATGTCTATGGAACACTCTACCTGAAGAGAAGCAGTGTTCAAGTATTCAGGACATTTGAGGGGGAGTGGGAATCATTTACAAAGGTGTAACTGCTTTTGTGTGATAATATAATCTTAATTTACACAATACTTGGCATTTCTTGCACCA
TATCTTGCTCTCATATTAAGATGCTACACCCACTTCAGTAGATTGAGTCCTCTTTCATAGCAACATTCCACGTCATTCTTCATAATAATGGACGTGACTATGATATGGGCTCCGAAAAATAGGTTGGGTATAGTAAACCGACAGGTGTTGTCAGAGATAATTTGGGTTTCTGCCAGCTTTCTAGAGAGGGCTTAACATCC
TTTTGGGCAAATTTGTCATTCCCTGCATGGATTTGTGTTTTGAGTTGGTGAAGCTCAAGGCTTAAATGTTATCATATGGGCATTCATCCCACTAGAGAATGATGAATTTGATTGAAATGTATAGACATCTGAGTTTTCTTCTCTATTTCATTTGATAGAAAATCCTCAC