sp|F4K5K6|PMIR1_ARATH ----> Protein PLASTID MOVEMENT IMPAIRED 1-RELATED 1
Intron 1 GTATGTATAT ... TGCGTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.03 | 92 | 26 | 13.7 |
| A2 | 21.57 | 80 | 22 | 11.1 |
| A3 | 18.57 | 57 | 13 | 3.4 |
| A4 | 28 | 54 | 21 | 11.7 |
| A5 | 22.5 | 31 | 9 | 3.9 |
| A6 | 19.39 | 266 | 64 | 35.3 |
| A7 | 15.4 | 335 | 61 | 37.9 |
| A8 | 14.45 | 444 | 75 | 79.3 |
| A9 | 14.33 | 293 | 49 | 55 |
| A10 | 19.33 | 192 | 46 | 30.1 |
>TRINITY_DN109166_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCCGGTAGTCATCTCACACAGCCATTCCGCATGCGGTTGTTGGCCCTGGACTGTGATGGCAAGGTGGTGTCCATGGTTTTCGCAGATTCGAAACCGGGTCGATTGTTCGACTAACACTTCATAAATACACGCTTGATTTCGCCGCGAAAGCCGAGCCAGAACAGCCTAGAAAACGATTAGACAAGCAGGTCATGAGATCGT
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TGGAGGAAGATGGAAGGAAATTGCGTCATTAAATCCACACATCAGAAATCCTAATATAATTTTACCAAATGATACTCTTAAGTTACGGTAGACATTTTGATTTTTAACTCTTCGGTTGGAAGAGTGGCACAGCTTTTGCTTTCTAGAGACTGCATGTCTTTCGTTTACATGTTTTATTTCTGTTGGAAATTTTCACAGGG
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TGATTGGGCATAAGTGACTAATAGAAGTTTATATGCATGTCTCGTACCAAAATAGCCCGAACCAAATGAAGGTAGCAAGGGAGTAACAGAATTGGGAACTGAACATCGTACAACTAAACCAACAGCTTGGATGCAACCTCTTGGATCTCATTTTGATTTCATAGAATAGTTGCCACCTATGTCAATAGGTTCAGCAAATT
TTCCTTCAAAATTTCAAAATTTTGAAGATATCTTTGGTGGATGCCATTTTTACTGCTCATCATATATCTAATAATCAAGGACTTAAAATTTTTGGTTTTGGGTTCAACTGTTAGAACTAGCTGAAAATCCATTTTTAAAATAAAGGTTACTGAATAAAACTATGTTACCGGATTTGCCCATGGAGAATTTTCTGTATATC
TG
>TRINITY_DN109166_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCGGTAGTCATCTCACACAGCCATTCCGCATGCGGTTGTTGGCCCTGGACTGTGATGGCAAGGTGGTGTCCATGGTTTTCGCAGATTCGAAACCGGGTCGATTGTTCGACTAACACTTCATAAATACACGCTTGATTTCGCCGCGAAAGCCGAGCCAGAACAGCCTAGAAAACGATTAGACAAGCAGGTCATGAGATCGT
ATTCCTGAATTCGTTCTAGCAGTAGACGTAAGACGGGGTTTTTAACTTTTTTGTGTTAAGCTCAATGCAATCGACGAGGAAGAGCCGGACGGATTCCGGCGGCAGGCAGTTGTTACACGAGCTGGAGGCGCTGAGACATGCGCTGTATCCTGGCGGCGGGCATCAGCAGCAAAAGGATTTCATAAGGAAAGAATTTGGCT
TGGGATCGGCCTCCCTCAATGAGACCCTCTCGCGGTTCCCGGCTGCCAATTCTGGTTTTCGCCCAGAAGCCGATGCAAGAACCGCGAAGGCCGACGGGAAGACGAGGCAATCGAAAGAGAACCCCCGAGCGGAGAAGAGTCCGGCCGAGAAAAAGAAGCTATGGGATTGGAAACCCTTGCGTGCTCTGGCCAACATCGGA
CGGCATCGGCTCGGCTGCGAATTCTCGCTGCGCGTCCACAGCGTCGAAGGGCTTCCGATCCGCTTTGATGGGTTGAATTTGTGTGCCCATTGGAGGAGACGGGAGGGAGGAGTGAAGACGAAGCCTGCAAAGGCATTTAATGGGGTGGCCGAATTTGGTGAGACTTTGTATCACAAATGTACTGTTTATGGGAACAAGGC
CGGGCCTAATCAGGGTATGAGGTATGAATCAAAGTTTTTTGAGATTTCTGTTTTTGCTTTGGGTGTAGAAGAGCTTGAATTGTGTAAACATAGGGTTGATCTCAGCAGAATGCTGCCTGAAACAATTGGGGATTTGGGTTTGGATGAGAAGTCCGGGAGCTGGACTACAAGTTTTAAGCTTACTAAGAAGGAGGCCAGAG
GAGGGCTTCTGTCTGTCACTATTGGGTATAAGATACTTGATAAGGAATTTGGTGGTATGGGTGAAACTAGTTCTAATGTAAATCCGAGTATAAACAGGTCTGTAAGCTCACGACCTGGTCAACGATCAAACCCTAAAACAGGTTGGAATGCTGGCACACGGGTTGGGGATGCTTCTGGTCGGAAGCCTATGCGATCCTTC
AACAGCTTTCCCAATCCTGCAGGGAGAACTGGAGAAAAGCCGAGGGCTAGGGCTACTTTGTCGTCTTCGATGTCGGCACCCGGGGTGGATATTGATAGTATGTCTCATTTGAGCCTGGATGATCATTGGTCGATCGAGGGCCCTGATGGTCAGCAATTCGAAGGGACCGACATGACATCGTTGCTTGATTTTAAGCCAAG
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AGGCGTTGATCACAGCCCTTTTGCTTTAAGTTCAGATAGTGATCCAGACTCACCTAGAGCACGCCTTCTTAAACAGTTTGAGAGAGAGGGTGGCATTGGTCTAGGAATTGGTATTACAGAACAGTCTGACGGCGAACCGAGCCATTCTTCTGAATTACAAAGGCATGGTGTTGCTGCTCGACCCGGTTGGGATTCAGATG
AAGATTTGGAATTGGCCTCGATTGTGCAGGTTGGAGAATCTGAGCTTCAGAAAGCAGCCCAGACTATGCGCAGTAAAACCCGAGCTAAGATGCTCGAGGATGCAGAGACTGAGGCACTGATGCAAGAGTGGGGTATGGATGAGAGAGCTTTCCGGAATTCACCTCCAGGCAGTTCTCGTGGGTTTGGAAGTCCCGTCGAT
TTTCCTTTTGAGGGGCCTGTTGAGCTGCCTGCTGTAGCCGAAGGATTTGGTCCTCTTGTTAAGACAAGGGATGGAGGATTCCTGCGGTCAATGAATCCAGATCTTTTTCGGAACAGCAAAAGTAAGGGGAGCCTAGTCATGCAGATATCAAATCCCGTTGTGGTTCCTGCAGAGATGGGTTCGACTGTCATGGATATATT
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gtatttacttgcaaatttttatctgtacttacaaatatggatagacgcatgaactttgctttgtttgcgttgcagAAAAATATGGATGAGGCAAGATTCTCTCGAGGAGATAAAAATAAGGGGCTTCTTACAAGATACTGCAAACTCATAATAGTAATATCAAAATATATTTCTATTCATTCGGGGTTTATTTCTGGTCA
TACATTATCTAAAAAATGAAAATAATGTCTTCTGTGTAGTTATTAAATTGTATAATTTGTGTGTTAAACCAGTTGGTGCGAAAAGAAGTATCACACAAGGTTTAGACTGTGGACATGGCTACAATCTTGCCTAAAACATTTTGGCTGGTAAAAACTGTGTTTGGATGTTGTAGAAGTATGTAGGAATAATGCAGTATTTT
TAAAATTCAAGCTTTGTTTCAATCAGCCTCTTGATGGGAGTGGCAGTCTCTGTTGAACATAGCCTTGTTGTAAGTCGTTCATATTTGGTGGATTACTGCTTCATAGCAGGTTTTGTGCACTTTTTACTCGTGCATCGAACTTTTTGTTTTCTGCCCTTTGTGTACTAAATCAAGTGAGTAAATGCATCCTTAATTAAAGG
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TATATCTAATAATCAAGGACTTAAAATTTTTGGTTTTGGGTTCAACTGTTAGAACTAGCTGAAAATCCATTTTTAAAATAAAGGTTACTGAATAAAACTATGTTACCGGATTTGCCCATGGAGAATTTTCTGTATATCTG