sp|Q9ASP6|HNRPQ_ARATH ----> Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q


Intron 1 GTAGGTAGAC ... CTTGTTCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A1017.7741291330455



>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTATACAATGTTGTTTCCACTTTCTCTTGGGGGCTGTCATGTTTAGTTTTCAGATAAGTTCATATTATTTCACTCTTTCCTTGTATCCAGAGGT
GCACTACGAACCAGTATGATGCAGATTTGTCTCGATTCTACAGTAGCTAGGATCGTACCTACTGAATATCTTGATTTCTATTGTGGGAAATTGCAAATTTGGAGGAACTTGCTTCCGTTTTAATTTTGCATTCAAGATTTAACTGTCAAATCAATTTTGCAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
GGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTATGTAAGGACGCAT
TTGGGGTTCTTGATCGTGTAATATTTTTTTAATATTGAAATGTCCTTTATTCATGACCTCTTCTTACATGGTCATGTATTTTCATTGTTTTATAAACGAAGGTAAAAGCTAATTATGCGAAGCATCTTATTTTATTTATATTATTAAAACATCTTTTATTCATGGCCTTTGTTTTCCTTGTTTTAAACACAGGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
GTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGA
AGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGAT
CAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTT
TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
TTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATC
TGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTA
TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
CGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTT
GAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGAT
GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
AATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAA
CTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAAC
GAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTC
ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
GTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTT
TATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTT
AAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGAT
TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
CCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTT
TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
GGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACC
CAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGTCAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTG
TTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i11 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTGGGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTC
AATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGA
ATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGgtaggtagacaaccaattgatattacatttgtatgaa
atgattttactttatgatttttgtttgatattctgcattaaatcacttgttccagCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGA
TGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTG
CATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGAAGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCA
TATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAG
CTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAA
ACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTT
TTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAAT
TTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAA
GCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAG
GTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTA
TATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGT
TCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGATGTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTT
TGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTA
TTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAACTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTT
CTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAACGAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGT
AGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTCATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAG
ATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCTGTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTG
AATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTTTATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGT
CAACATACCATATAAGCATGAAAATGTTAAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAAC
TAATTAGAATATTTTACAACCTACTGATTAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTT
CATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGCCCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTT
GTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTTTCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAA
GGAATGATAATAAGCACATATGAATGGCACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGT
CTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATATAGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATAC
TGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGGTATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCA
AATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGAGGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCT
ACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACCCAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGT
CAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTGTTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA



Intron 2 GTAAGTATAC ... ACATGAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTATACAATGTTGTTTCCACTTTCTCTTGGGGGCTGTCATGTTTAGTTTTCAGATAAGTTCATATTATTTCACTCTTTCCTTGTATCCAGAGGT
GCACTACGAACCAGTATGATGCAGATTTGTCTCGATTCTACAGTAGCTAGGATCGTACCTACTGAATATCTTGATTTCTATTGTGGGAAATTGCAAATTTGGAGGAACTTGCTTCCGTTTTAATTTTGCATTCAAGATTTAACTGTCAAATCAATTTTGCAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
GGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTATGTAAGGACGCAT
TTGGGGTTCTTGATCGTGTAATATTTTTTTAATATTGAAATGTCCTTTATTCATGACCTCTTCTTACATGGTCATGTATTTTCATTGTTTTATAAACGAAGGTAAAAGCTAATTATGCGAAGCATCTTATTTTATTTATATTATTAAAACATCTTTTATTCATGGCCTTTGTTTTCCTTGTTTTAAACACAGGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
GTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGA
AGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGAT
CAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTT
TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
TTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATC
TGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTA
TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
CGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTT
GAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGAT
GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
AATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAA
CTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAAC
GAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTC
ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
GTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTT
TATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTT
AAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGAT
TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
CCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTT
TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
GGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACC
CAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGTCAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTG
TTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CGGCCAACAATCTTATGGCTTATGTGACGGTCATCAAGCTGGTAATGGATACAGGAGTATTTAATGTTTTTGTTATATTTTATAGATTCAGCAAGCATAAGTAATTTTCAAGTATTAAATTAGTGATATTGAAGGTATGCCTGTATTTTGTATTTTTTCTCAAAAGAAAAGAATTTACGTTGATTTTATCATCCAGGCTC
ACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATgtaagtatacttacaatcacattactattactagttatgacttaggtttttttcgttagcaatgttaatgataactatgaacatgttctatttctgattgcacatgaacagGTGGGTGGTAGTT
CATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACGTAAGTTTAGCAATGGACACGTTTTGGTATTTTTGTTCCCTAGTACTAGAACCCAGTCAAGTGGTATTTTCTTATCATGGATCAACAAATTTTATTGTGGATTTCGTTTACGTAGTTAGT
GTACGTGAGACCTTGTCTAGTTGTCTTATGCATGTTTATGCCATACAGATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTT
GCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAA
AGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTT
TTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTG
TACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATT
GTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCG
TGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTG



Intron 3 GTATACAATG ... AATTTTGCAG

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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i11 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTGGGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTC
AATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGA
ATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGGTAGGTAGACAACCAATTGATATTACATTTGTATGAA
ATGATTTTACTTTATGATTTTTGTTTGATATTCTGCATTAAATCACTTGTTCCAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGA
TGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTG
CATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGAAGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCA
TATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAG
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ACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTT
TTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAAT
TTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAA
GCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAG
GTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTA
TATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGT
TCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGATGTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTT
TGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTA
TTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAACTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTT
CTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAACGAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGT
AGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTCATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAG
ATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCTGTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTG
AATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTTTATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGT
CAACATACCATATAAGCATGAAAATGTTAAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAAC
TAATTAGAATATTTTACAACCTACTGATTAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTT
CATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGCCCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTT
GTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTTTCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAA
GGAATGATAATAAGCACATATGAATGGCACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGT
CTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATATAGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATAC
TGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGGTATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCA
AATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGAGGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCT
ACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACCCAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGT
CAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTGTTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGgtatacaatgttgtttccactttctcttgggggctgtcatgtttagttttcagataagttcatattatttcactctttccttgtatccagaggt
gcactacgaaccagtatgatgcagatttgtctcgattctacagtagctaggatcgtacctactgaatatcttgatttctattgtgggaaattgcaaatttggaggaacttgcttccgttttaattttgcattcaagatttaactgtcaaatcaattttgcagGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
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CAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCA
CTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAG
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ACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGT
GATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTTGCCACA
TGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAAAGCTTT
TATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTTTTGATG
CTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTGTACAAC
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AGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCGTGAGGA
GAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTTGAATTAGA
CAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGATGTTTTAAC
TTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAA
GTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAACTTTTTAT
CGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAACGAAGAAGC
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GATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCTGTAATGCG
GATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTTTATGTGAA
TGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTTAAAAGTCT
TTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGATTAAACTAT
AAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGCCCTTTCGT
TGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTTTCTTCCAA
TTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGCACATTGAT
ATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATATAGACATGT
AGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGGTATGGGTA
AGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGAGGAAACTT
CTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACCCAAGGGGC
TTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGTCAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTGTTGCATTG
TTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA



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>TRINITY_DN116247_c1_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTGGGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTC
AATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGA
ATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCA
AAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCAT
ATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGAAGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGAC
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GGACACGTTTTGGTATTTTTGTTCCCTAGTACTAGAACCCAGTCAAGTGGTATTTTCTTATCATGGATCAACAAATTTTATTGTGGATTTCGTTTACGTAGTTAGTGTACGTGAGACCTTGTCTAGTTGTCTTATGCATGTTTATGCCATACAGATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTAT
ATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTT
CTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATG
CCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTG
ATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGT
TTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATTGATTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACC
TGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAG
ATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTC
CTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGATGTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGT
GAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAA
CGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAACTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGT
TTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAACGAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCAT
TCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTCATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATT
TAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCTGTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGTTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGT
TATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTTTATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTT
TTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTTAAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTAC
GAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGATTAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTG
TTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGCCCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCAT
ATGTTTTTTGCGTTGTT


>TRINITY_DN116247_c1_g1_i15 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CATGGACAAAGGATGCTgtaagacatttcactgttttttttctgtgcgtcactcttatattctgatatgttatgttgtacttcggaattgattatatttattgatccgtttattccagGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAA
ATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGCATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTGGGAT
GACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAA
ACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCACTTC
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CTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGAAGCAGGTTACAG
CAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGTGATT
ATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACGTAAGTTTAGCAATGGACACGTTTTGGTATTTTTGTTCCCTAGTACTAGAACCCAGTCAAGTGGTATTTTCTTATCATGGATCAACAAATTTTATTGTGGATTTCGTTTACGTAGTTAGTGTACGTGAGACCTTGTCTAGTTGTCTTATGCATGTTTATGCC
ATACAGATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAAT
AGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTA
AAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATT
AGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTAC
CATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATTGATTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGG
ATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGA
GATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTA
AATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGATGTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTA
GTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGT
AACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAACTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAG
ATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAACGAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTT
GCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTCATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGA
AAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCTGTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGT
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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
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TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
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GCACTACGAACCAGTATGATGCAGATTTGTCTCGATTCTACAGTAGCTAGGATCGTACCTACTGAATATCTTGATTTCTATTGTGGGAAATTGCAAATTTGGAGGAACTTGCTTCCGTTTTAATTTTGCATTCAAGATTTAACTGTCAAATCAATTTTGCAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
GGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTATGTAAGGACGCAT
TTGGGGTTCTTGATCGTGTAATATTTTTTTAATATTGAAATGTCCTTTATTCATGACCTCTTCTTACATGGTCATGTATTTTCATTGTTTTATAAACGAAGGTAAAAGCTAATTATGCGAAGCATCTTATTTTATTTATATTATTAAAACATCTTTTATTCATGGCCTTTGTTTTCCTTGTTTTAAACACAGGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
GTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGA
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CAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTT
TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
TTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATC
TGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTA
TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
CGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTT
GAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGAT
GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
AATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAA
CTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAAC
GAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTC
ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
GTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTT
TATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTT
AAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGAT
TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
CCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTT
TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
GGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACC
CAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGTCAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTG
TTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTGGGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTC
AATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGA
ATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCA
AAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCAT
ATGCTGCTCTGgttagtatttgctgcattatacagtaatgattttattgaatatgcttgtgattagctgttataattgttcacggtgtatttctgaagcgttaactgcttgtggatattttgtcagGATGATGTTCCCAGGTACGCAG



Intron 6 GTGGGTGCTT ... TGTTCTCCAG

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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTATACAATGTTGTTTCCACTTTCTCTTGGGGGCTGTCATGTTTAGTTTTCAGATAAGTTCATATTATTTCACTCTTTCCTTGTATCCAGAGGT
GCACTACGAACCAGTATGATGCAGATTTGTCTCGATTCTACAGTAGCTAGGATCGTACCTACTGAATATCTTGATTTCTATTGTGGGAAATTGCAAATTTGGAGGAACTTGCTTCCGTTTTAATTTTGCATTCAAGATTTAACTGTCAAATCAATTTTGCAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
GGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTATGTAAGGACGCAT
TTGGGGTTCTTGATCGTGTAATATTTTTTTAATATTGAAATGTCCTTTATTCATGACCTCTTCTTACATGGTCATGTATTTTCATTGTTTTATAAACGAAGGTAAAAGCTAATTATGCGAAGCATCTTATTTTATTTATATTATTAAAACATCTTTTATTCATGGCCTTTGTTTTCCTTGTTTTAAACACAGGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
GTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGA
AGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGAT
CAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTT
TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
TTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATC
TGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTA
TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
CGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTT
GAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGAT
GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
AATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAA
CTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAAC
GAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTC
ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
GTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTT
TATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTT
AAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGAT
TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
CCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTT
TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
GGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACC
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TTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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GGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGT



Intron 7 GTAATGGATA ... TATCATCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A18.12895.894.459.5
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A107.881789.2177.566.7



>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
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TTGGGGTTCTTGATCGTGTAATATTTTTTTAATATTGAAATGTCCTTTATTCATGACCTCTTCTTACATGGTCATGTATTTTCATTGTTTTATAAACGAAGGTAAAAGCTAATTATGCGAAGCATCTTATTTTATTTATATTATTAAAACATCTTTTATTCATGGCCTTTGTTTTCCTTGTTTTAAACACAGGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
GTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGA
AGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGAT
CAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTT
TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
TTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATC
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TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
CGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTT
GAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGAT
GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
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CTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAAC
GAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTC
ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
GTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTT
TATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTT
AAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGAT
TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
CCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTT
TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
GGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACC
CAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGTCAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTG
TTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CGGCCAACAATCTTATGGCTTATGTGACGGTCATCAAGCTGgtaatggatacaggagtatttaatgtttttgttatattttatagattcagcaagcataagtaattttcaagtattaaattagtgatattgaaggtatgcctgtattttgtattttttctcaaaagaaaagaatttacgttgattttatcatccagGCTC
ACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTAAGTATACTTACAATCACATTACTATTACTAGTTATGACTTAGGTTTTTTTCGTTAGCAATGTTAATGATAACTATGAACATGTTCTATTTCTGATTGCACATGAACAGGTGGGTGGTAGTT
CATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACGTAAGTTTAGCAATGGACACGTTTTGGTATTTTTGTTCCCTAGTACTAGAACCCAGTCAAGTGGTATTTTCTTATCATGGATCAACAAATTTTATTGTGGATTTCGTTTACGTAGTTAGT
GTACGTGAGACCTTGTCTAGTTGTCTTATGCATGTTTATGCCATACAGATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTT
GCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAA
AGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTT
TTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTG
TACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATT
GTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCG
TGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTG



Intron 8 GTATGTAAGG ... TTAAACACAG

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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i11 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
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TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTGGGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTC
AATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGA
ATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGGTAGGTAGACAACCAATTGATATTACATTTGTATGAA
ATGATTTTACTTTATGATTTTTGTTTGATATTCTGCATTAAATCACTTGTTCCAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGA
TGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTG
CATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGAAGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCA
TATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAG
CTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAA
ACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTT
TTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAAT
TTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAA
GCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAG
GTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTA
TATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGT
TCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGATGTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTT
TGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTA
TTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAACTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTT
CTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAACGAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGT
AGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTCATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAG
ATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCTGTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTG
AATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTTTATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGT
CAACATACCATATAAGCATGAAAATGTTAAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAAC
TAATTAGAATATTTTACAACCTACTGATTAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTT
CATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGCCCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTT
GTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTTTCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAA
GGAATGATAATAAGCACATATGAATGGCACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGT
CTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATATAGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATAC
TGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGGTATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCA
AATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGAGGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCT
ACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACCCAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGT
CAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTGTTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTATACAATGTTGTTTCCACTTTCTCTTGGGGGCTGTCATGTTTAGTTTTCAGATAAGTTCATATTATTTCACTCTTTCCTTGTATCCAGAGGT
GCACTACGAACCAGTATGATGCAGATTTGTCTCGATTCTACAGTAGCTAGGATCGTACCTACTGAATATCTTGATTTCTATTGTGGGAAATTGCAAATTTGGAGGAACTTGCTTCCGTTTTAATTTTGCATTCAAGATTTAACTGTCAAATCAATTTTGCAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
GGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGgtatgtaaggacgcat
ttggggttcttgatcgtgtaatatttttttaatattgaaatgtcctttattcatgacctcttcttacatggtcatgtattttcattgttttataaacgaaggtaaaagctaattatgcgaagcatcttattttatttatattattaaaacatcttttattcatggcctttgttttccttgttttaaacacagGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
GTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGA
AGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGAT
CAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTT
TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
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TGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTA
TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
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GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
AATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAA
CTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAAC
GAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTC
ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
GTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTT
TATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTT
AAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGAT
TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
CCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTT
TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
GGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACC
CAAGGGGCTTGATAGCACATAAAACCTTTACTTTAGGAAAAGGATCCTGATGATAATTGCCAGAACATAACCCACAAAATATGTATGGCACCTGATTATCCTTCCAAAGATCATAATTTGTACTAGTAACCAATGAAGACATAAAACCAAAGAAAAGGATCATGATGTTTGTCAAGAACAAAAGCCACAAATGGAGATTG
TTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA



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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTATACAATGTTGTTTCCACTTTCTCTTGGGGGCTGTCATGTTTAGTTTTCAGATAAGTTCATATTATTTCACTCTTTCCTTGTATCCAGAGGT
GCACTACGAACCAGTATGATGCAGATTTGTCTCGATTCTACAGTAGCTAGGATCGTACCTACTGAATATCTTGATTTCTATTGTGGGAAATTGCAAATTTGGAGGAACTTGCTTCCGTTTTAATTTTGCATTCAAGATTTAACTGTCAAATCAATTTTGCAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
GGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTATGTAAGGACGCAT
TTGGGGTTCTTGATCGTGTAATATTTTTTTAATATTGAAATGTCCTTTATTCATGACCTCTTCTTACATGGTCATGTATTTTCATTGTTTTATAAACGAAGGTAAAAGCTAATTATGCGAAGCATCTTATTTTATTTATATTATTAAAACATCTTTTATTCATGGCCTTTGTTTTCCTTGTTTTAAACACAGGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
GTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCATATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGA
AGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGACGGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGAT
CAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTATATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTT
TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
TTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTGATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATC
TGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTA
TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
CGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTT
GAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGAT
GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
AATCGAAAGTTCCTTTATTTTCAGTGTAGTTTTTGTTTTCAAGTAACAGTATCCCTTGTTCTATTCGTTATATTTTTTCCGAAACCGTTGGACTAACGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAA
CTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGTTTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAAC
GAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCATTCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTC
ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
GTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGTTATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTT
TATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTTTTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTT
AAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTACGAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGAT
TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
CCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCATATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTT
TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
GGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAGATTGAAGTTTGTAAATCGTGTTGTTTGTTGACGCTCTACGTTGTAGTAAATATGTATGGCACTTTTGATTATCCCTACAAAGATCATAATTTGTTCCAACAACC
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TTGCATTGTTTGGTGCTTCACAACTCAGTATGGGGGAGATGTTGTAATATGTAATGTTTGTCTTTGTAACGTTACATGCAGTTTGTCTTTGTAACATTACATGCAA


>TRINITY_DN117732_c1_g2_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
TGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAAAGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCC
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atatcatttaaggactcagtttaatattgattacttaatgattcttaattgttacacttgtgtttcagGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTGTCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAA
GAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGCATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGT
A



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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
AAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGATAGCAAGGATGAAAAAGCTGAAGAAGACAGCAAGGATGAAAAGTTAGATCTGGATGACAATGAACCTGAGCATGATGTAGAAGTGCATGAGGAACAGGAGGATGAGATCGAGGAAAAGCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGA
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TTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAAGATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTG
TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
ATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTATACAATGTTGTTTCCACTTTCTCTTGGGGGCTGTCATGTTTAGTTTTCAGATAAGTTCATATTATTTCACTCTTTCCTTGTATCCAGAGGT
GCACTACGAACCAGTATGATGCAGATTTGTCTCGATTCTACAGTAGCTAGGATCGTACCTACTGAATATCTTGATTTCTATTGTGGGAAATTGCAAATTTGGAGGAACTTGCTTCCGTTTTAATTTTGCATTCAAGATTTAACTGTCAAATCAATTTTGCAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTG
GGATGACGAGCGAGTTAAAGAGGAACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTATGTAAGGACGCAT
TTGGGGTTCTTGATCGTGTAATATTTTTTTAATATTGAAATGTCCTTTATTCATGACCTCTTCTTACATGGTCATGTATTTTCATTGTTTTATAAACGAAGGTAAAAGCTAATTATGCGAAGCATCTTATTTTATTTATATTATTAAAACATCTTTTATTCATGGCCTTTGTTTTCCTTGTTTTAAACACAGGTTAAAGC
CAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAAT
CCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGATCCCAAACGGGCCACAAAGAATGATAACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGT
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TTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTTCTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGT
AAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATGCCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGT
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TGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGTTTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTA
TTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACCTGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTG
CGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTT
GAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTCCTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGAT
GTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAGGTTGATTATCCGAGTTAGGTTTTCAAGTAGATGATCTTGCCTAGAATAGTGTTGGTTTTTGGTGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGG
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ATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATTTAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCT
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TAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTGTTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGC
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TCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTAATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGC
ACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAATGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATAT
AGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGTTAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGG
TATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATAAACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGA
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>TRINITY_DN117732_c1_g2_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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TCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTTGGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGC
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AATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGATTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGA
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AAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAAACGCCCAT
ATGCTGCTCTGGATGATGTTCCCAGGTACGCAGAACCAGCTTTAAGGCACCCGAGGGCTCGTCTGGATTACGATGTTAGTGCTGGTGCTCCTCTTTATGGAGGAGCTGCATATGGCCGGCTTGGTCGAGCCCCAGAAGCAGGTTACAGCAGCCACAGCAGAACTGATTTGATCGGCCAACAATCTTATGGCTTATACGAC
GGTCATCAAGCTGGCTCACTTGGAGGTGCCGCAGTAGGTGGAATTTATTCTCCGCCAGGTTATGGTACCGGCTCCTTGCCAACCAGGACTGATGTGGGTGGTAGTTCATATTCTTCTCTGTATGCTAGCCGGAGATCAAGTGGTGATTATTTGTTGGGCCGTGGCTCAAGACCATATTACTAGAACgtaagtttagcaat
ggacacgttttggtatttttgttccctagtactagaacccagtcaagtggtattttcttatcatggatcaacaaattttattgtggatttcgtttacgtagttagtgtacgtgagaccttgtctagttgtcttatgcatgtttatgccatacagATGAGTTTTTATAACAAGAGGCAGTAGTCCGCCTAGGCTGGAGTAT
ATCTATATGCCTCTAGATCTATATTTGGGTATCTTGTGCCCAGGCATAAGGAGAGATTATGCCTTATCACATGGAGCTTCATTTATCTGCATTGGATGGCATTTTTGCCACATGATCATGGCTATAACAGATATCGTAAGTTTGCAATAGCAATGCAGTATTTGATTGAACATGTCTGATTTGTGATATTAAGGACAGTT
CTTTTGGAAGTGAGGGCGAATCTAGACAAAAGATTCAACAAGTGATTTTTGTTATAAGCTGGGATTTCTGTGTTAAACCTTCTTGAAAGTACTTTGTTGGATGTAAAGCTTTTATTCTTCTAGATGAATTGAAAACCAGCTAGACTTAAAATTTAGCTCTCTGGGCATCCTGTTTTAATTTTAATGATGTTCGCTTGATG
CCCTAAATGGAGCTTTAAGATGCTCAATTAGTTTTCCTCTACTTATACATTGCTGCCACATCTAAGTAGAAATTTTTTTTGGGCATATAAAAGTTTGAACTGGTTTTTGATGCTGGCAAGTTGACTTATTAGTTACATGATGGTTATTAGATTTGAATGACTTTCCATTGAATCAAAATGGAGGCAGTGTTCCCAATGTG
ATTCTTTGCTCTTCCTAGACACATCTGTCAAGCTGCCAATAATTTCTTGAATTGAATTATTCTATTAAGAAGAAATTTGGACTGGCCATAGAGACAGTGGTATCTGTACAACATTTGATGTCGTAGATGATCACGACAGTTTTGTTACCATGGGAGACAATTTGTTTTTTCTAAATACAGTGAACAAAGAATTTGCCAGT
TTGACATTTGATGTCTCGAACAGTCTTAGGAATCTATGATTTAATTTTTATTCAATAGGGCTGTTTGACAAGAAAAGCTTGCATTGGGATCCCAGCTTGCTCTATTGTTTGAAGAGCAGTTATTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGGATTTGCCAAAGGTAAATTAAATGCTCCCTGTGGTGGAAGAGACTTAGAGACC
TGAGTTTGAAACGATTTTTTACTTGGCAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGGTAAGATACATAGGTTTGGTAGATGTTTTGACTTTTTATTGCGTGAGGAGAATTATGATCTTATCCTAGTTTCGAGTTTGGATGAGATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGTGAGGAAGTATTTTGAAG
ATTGATCATCCGAATTAGATTTTCAGGTAGATGATCTCGCCTAGGATAGTGTTGGTTTTGGGGGCGAGGTTATGTATATTGGCTGGAATCGAAAGAGTTCCTTTGAATTAGACAAGAAATTTAGGAAGGATTTGCTAAAGGTAAATTAAATGCTCCATGTCGTGGAAGAGAGTTACAGACCTGAGTTAAATTAAATGCTC
CTTTGGCAGAACAATTTTGAAGGTAAATTAAATGCTCCCTTGGGAGAACAATTTTGATCCGATCCTAGTTTCGAGTTCGGATAAGATATATGTGTGTGGTAGATGTTTTAACTTTTTATTGCGTGACGAGAATTATGATCCTATCCTAGTTTCGAGTTCGGATGACATATAGGTCTGATAGATTTTTGACTTTATTGCGT
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CGTTTTCTTCTTTATGTGGCCTTGCCAGACATGCTGTCTAGTTTTGTGCTTGAAATAAAATCTAGTCGAATTTCTATTCATTTAGTAGCTGAAGCTACATGTAACTTTTTATCGGTAACTTTCTGTAAATTTAGGGGTTTGATAAGAGATCTTATTTTGGTACATCGTTTGATGCTGAATATACTAAATATTGAAAATGT
TTTTGATTTAGCTAATTTTTACTATAAGCTTTGTTTCTATCTTGTATTATTCGATGAAATTCTATTTGAGTGCTTTCTCCTCGAGATCTAATTATCGCAACAACGAAGAAGCTTGATCTGAAAGATACTTTATTATCCCAACGGTCTTGCATGTACAATATAGGTTTAGAGGTTCTAACCGTAAATGATTGGGGAACCAT
TCATTCGTCTTTTTCACAAGCTTATTATTGAGCCCACTTGTATATAGTTGGACATCTTTAATGGATATTTGTTTGTAGATTTTATGAAAATGTATTGTGATGTCATTTCCCTGATTAGATGTCTTAAATTGATTTAATAACGAACAGAAAGAAACCAATATGATAAACTAACGTTAAAATAATACGTAAGTTTGTAGATT
TAGCTCTTTTTAGTTGAGTAGATTTCATTGATAGTCATATAAAATCTTGGATCAAAACTATCAGCAGCGAGGATAGATACCATTTGTTGGTATATGTGAATGCTGTAATGCGGATGGATAGATATTGAGATGTGAATGTGAATGTGGCTTGATTGTATATTTTTAAAGAAAAATATCGCATGGAAAGAGCTATTGATAGT
TATAGGTTATATGTGAATGTTTCTATATGTAATTTTTATAAAATTCTCTCACAAAGAGAATACTGGTTATTATGTGAATATTGTTAAATGTGTTTAGGTTGTTTTATGTGAATGTGGGTCAACATACCATAGAACACATGCAAAGGAAAATAGTCTCAAGTCTTTTGATGGTTATATGTGAATATTTCTATATGTGATTT
TTAAAAAATGTCTGAAAATATTGGTTATATCTGAATATTGGTAAATGTGTATAGGTTGTATTATGTGAATGAGGGTCAACATACCATATAAGCATGAAAATGTTAAAAGTCTTTTGATTGTAATGTTCAATTTTTGTATTCCTTCTTTGAATGAATGATAGGGCAGGGTATGAGGAATCGATTGATACTATAACTACTAC
GAAAATTTACCTGCTTCAAAAGGGTATTATTCGATGTGTACTTACATTCTATATAATTATTGGCAACGAGTTCAACTAATTAGAATATTTTACAACCTACTGATTAAACTATAAATTTTTGAAGTTTTACGAACTAATTAAAATATATAGTTTAGTATGTTCATGTCTATTTGGAACCACTTAAATTAGCCTTTTGGTTG
TTCTAGTGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATCTTTAAAGGCAAGAGGAAGTAGATTTTCATGTAAGCATATGTTCATGTCTATTTCGAACCTACCAAATAGCCCTTTCGTTGTTCAAGTGGAAAGTAATTTTCATGTAAGCATGTCTTTAAACGCAAGAGGAAAGTAGATTTTCATTTTAACGTATCTTCACAAGCAT
ATGTTTTTTGCGTTGTTAATTTGTTTAAAATGATAATTTTATAACTCTTATGGTATGGTCTAGATATTCAGTTCTTGTAATAATTCTGATATTTAGTATTTTTTTCTTCCAATTCGTATGTAAGCTTCTAAGATTAAACCTAATTTGAATCGTATTTGAATGTATTGATCAGCTAACAAATTTGATACGTAAGTTGGGTA
ATTTTATGTAGATAGGTAGACTCAAGGTCGATTCAGTAATGAGAGGTTGAAGTAAGCATATGCCATCTCAAAATAAGGAATGATAATAAGCACATATGAATGGCACATTGATATAATTTACGTGGAGAATACATGTGGCCTTTAATTACTTAAAAATGAAGCTGAATCCAATTTCTAGTATCTTCCAATTTTTTTAAAAA
TGAATCTCAAGGAGTTACCAATCATTAATGTTTACAACATATAGGCTATGTTGCCTATTAACTTCTTTGACCACGTCTCCGTTGGTAAGCAAGGCAATTTATATAGACATGTAGTTCGTAAATGTCTGAGGTCAGAATACGAATGAACACCAAAAAAATACTTACCTTTATAAATTATGAATTGAAGAAGTTGGTCTTGT
TAATGGTGTACTTAACAATGAACATGGAATAAGACATTATGTCGCAAGCTTGGAAGCAGCCCTAACAAGATGATACTGAGCTCATGATGCATATTCTTAGTGGGTATGGGTAAGGTTTTCGATGTAGTGCAGGTTTGTAAACAACTTTACAAGAGTAGGAAATCTTTATAACACGAGGAAACTTTTTATGAGAAAGTATA
AACAATTTCATTGATGACGAAATATTGATACACAGGAAAAGGGAATTGTGTGAGAAAAAACACCTCTAATCTCCCAAATAGAATCAACACATAAAAATTTAAGAGGAAACTTCTTTACCTAGGCAGGAGTTACATCCAGAGAAAATCAGGTGATGGAAATGTTTCGAGCTTACTCTACAGAAGGGACATAATTCAATTAG
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>TRINITY_DN41866_c0_g1_i7 from sample A6 / Example unspliced isoform:
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GCAAGGAGATGTCGAGGAAGGTGACGAGGAAGATGCACAAGGTGAAGACGAGGAGGCAGAAGGTCAAGATGGCGAAGGAGATGAAGAAGAGTCAGAAGCAGAGGAGGCAGAAGATGTAGAGAATGAAGGGCAAGTTGGTGATGGGGAAGATGAGGAACATCAAATTAATGACATTCCTGCTCCCTTAAAAGATAGGCGAA
AGCAGAAAGAATTTGAAATATTTGTAGGTGGCCTTGATAAAGAAGCTGATGAAGAGGATCTGAAGAAAGTTTTTGGCGTAGTTGGTGAAATCAAAGAAGTGCGTATGTCTAAGAATCCTGCAACTCAGAAGAACAGGGGATTTGCTTTCATACGTTATGAGACTATTGAAGCGGCAAAGCGGGCCTTAACCGAACTGAAA
GATGCTCATGTGAGGGATAAGCGCTGCGGTGTGTCACCAAGCCAGGATAATGACACCCTTTACTTGGGCAATATTTGCAAGACATGGACAAAGGATGCTGTAAGAGAAAAGTTGAACGAGTATGGAATTGAGAACCTTGAAGAGATGGCTTTAATGGATGATCCAAAAAATGAGGGTCAAAATCGTGGTTATGCATTTTT
GGAGTTTAGTACTCATCAATGCGCTATGCAAGCATACAAGCGTCTGCAAAAACGAGATGTTGTCTTAGGTTGTGAAAGAACTGCAAAGGTTGCATTTGCAGAATCTTCCATTCAGCCTGATGAGGAACTCATGGCACAGGTAAAATCTGTATTTCTTGATGGGTTGCCTGCATCTTGGGATGACGAGCGAGTTAAAGAGG
AACTCAAGAAATATGGTGAAATTGAGAAAGTTCAATTATCTAAAAACATGTCTTCTGCCAAGCGAAAAGATTATGGTTTTGTTCATTTCTCTACTCGAGAGGAAGCTCAAGCATGTGTTGATGCTTTGAAAAGCAGCGAGATTGGTGATGGAGATAGTAAGGTTAAAGCCAATATTGCAAAACCTCAAAATAAGAGTAGA
TTGGTAAAGCAAGGTGTTCGTGGAGGATATCGAATTGGAGAGGTAAAATCTGAAGGTGGTAAAGGACGAAAGCGGAATCGTGGTCGTAATGATCGTGGTCGTAATGATCGAGGTCGTAATGATCGAAATCGTGGACGTGGACTGAAGAATGACAAGAAAAAGGAAAAATCCACCGCACTTCCAGAGAAGCAACAAGCTGA
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AAGACCATATTACTAGAACgtaagtttagcaatggacacgttttggtatttttgttccctagtactagaacccagtcaagtggtattttcttatcatggatcaacaaattttattgtggatttcgtttacgtagttagtgtacgtgagaccttgtctagttgtcttatgcatgtttatgccatacagatgagtttttata
acaagaggcagtagtccgcctaggctggagtatatctatatgcctctagatctatatttgggtatcttgtgcccaggcataaggagagattatgccttatcacatggagcttcatttatctgcattggatggcatttttgccacatgatcatggctataacagatatcgtaagtttgcaatagcaatgcagtatttgatt
gaacatgtctgatttgtgatattaaggacagttcttttggaagtgagggcgaatctagacaaaagattcaacaagtgatttttgttataagctgggatttctgtgttaaaccttcttgaaagtactttgttggatgtaaagcttttattcttctagatgaattgaaaaccagctagacttaaaatttagctctctgggca
tcctgttttaattttaatgatgttcgcttgatgccctaaatggagctttaagatgctcaattagttttcctctacttatacattgctgccacatctaagtagaaattttttttgggcatataaaagtttgaactggtttttgatgctggcaagttgacttattagttacatgatggttattagatttgaatgactttcca
ttgaatcaaaatggaggcagtgttcccaatgtgattctttgctcttcctagacacatctgtcaagctgccaataatttcttgaattgaattattctattaagaagaaatttggactggccatagagacagtggtatctgtacaacatttgatgtcgtagatgatcacgacagttttgttaccatgggagacaatttgttt
tttctaaatacagtgaacaaagaatttgccagtttgacatttgatgtctcgaacagtcttaggaatctatgatttaatttttattcaatagggctgtttgacaagaaaagcttgcattgggatcccagcttgctctattgattgaagagcagttattttgaattagacaagaaatttagggatttgccaaaggtaaatta
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AACGGGCAAAAGAAAAAGCGTGATCGTGATACAGGTTTTAAGAAATCTAACTTCAGGGACCAAAATAGATCTCGCGGATCGTCAAGAAATGATACACGGAGGTTCTCTTATCCTGATGATAGATATAGTCGCCATTTGGAACGTGTCCATAGTTATCTCGATGCTCCTAGCCGTCCTTATACTGGAGTTTCTGGATCAAA
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>TRINITY_DN116247_c1_g1_i12 from sample A2 / Example unspliced isoform:
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