sp|Q56W64|ASPG3_ARATH ----> Probable isoaspartyl peptidase/L-asparaginase 3

Intron 1 GTAAGAACTT ... TTATCCCAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.95	198.5	43.5	22
A2	20.4	171	43.8	13
A3	17.68	225	48.3	14
A4	24.49	149	48.3	17
A5	25.86	107	37.3	5
A6	21.28	524	141.7	24
A7	16.27	777	151	42
A8	19.4	516	124.2	38
A9	15.26	605	109	44
A10	21.41	663	180.7	38

>TRINITY_DN106424_c0_g1_i4 from sample A3 / Example spliced isoform

AAATAATTGAAGAAAATATATTGGTAGATAATAAGGGACTTAACTACTAACCCGTGCATCGGAAAGTTTGCACTCGCAGCACAGATTACCAATGGTCTACGCTTATGTGCATTATCCCAGCAGTGTCAAAACAGAACTTGTCACAGTGCATTCTTGATCTGAGAGAGCCTTCACAGCGTCGAAACAGAATTTGCCACAAT
GCATAATTGATACGAGAGAGCTTTAACAATGTCAACCCTTTGTGGTACAAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTATTA
GCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGGAGAGTGGATTATCTGCTGTTGATGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACTGCCCTTGATGCCATGGTCATGGACGGGGGCTGTCTCAGA
TGACTATGGAGGTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATACCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCAGCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCCCCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAA
AATGGCTGCCAACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCTGAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAGAGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTCAAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTC
TATGGCAGTAATTGATAAACTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAAGATCCCTGGCAGGGTAGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATGCTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGA
GCATGAGGCAAGGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAATATCCCAATTTTATTGGAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCATGCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCA
GAGAGTGTCTAATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGGCTTGCTAGTTTACTGTTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTACTATGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACC
TAAGTATCTATAACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCACTTAATTTTGTGACTTAATTTTGTGGAGATGGCA

>TRINITY_DN106424_c0_g1_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:

AAATAATTGAAGAAAATATATTGGTAGATAATAAGGGACTTAACTACTAACCCGTGCATCGGAAAGTTTGCACTCGCAGCACAGATTACCAATGGTCTACGCTTATGTGCATTATCCCAGCAGTGTCAAAACAGAACTTGTCACAGTGCATTCTTGATCTGAGAGAGCCTTCACAGCGTCGAAACAGAATTTGCCACAAT
GCATAATTGATACGAGAGAGCTTTAACAATGTCAACCCTTTGTGGTACAAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTATTA
GCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGGAGAGTGGATTATCTGCTGTTGATGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACCGCCCTTGATACCATGGTCATGGACGGGgtaagaactttt
gataaaatccatctatgcttttaaagttgttcttatgcccaaattgacaaaattggattttattatcccaagGGCTGTCTCAGATGACTATGGAGGTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATACCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCA
GCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCCCCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAAAATGGCTGCCAACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCTGAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAG
AGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTCAAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTCTATGGCAGTAATTGATAAACTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAAGATCCCTGGCAGGGTAGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATG
CTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGAGCATGAGGCAAGGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAATATCCCAATTTTATTGGAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCAT
GCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCAGAGAGTGTCTAATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGGCTTGCTAGTTTACTGTTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTAC
TATGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACCTAAGTATCTATAACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCACTTAATTTTGTGACTTAATTTTGTGGAGATGGCA

Intron 2 GTAAGCCTCT ... TGATTGGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.54	156	33	38
A2	21.64	134	32	42
A3	20.73	151	47	32
A4	20.37	129	36	30
A5	22.47	88	31	20
A6	23.75	321	88	112
A7	19.8	407	105	96
A8	18.67	305	69	71
A9	20.66	480	117	133
A10	20.82	369	88	106

>TRINITY_DN106424_c0_g1_i3 from sample A3 / Example spliced isoform

AAATAATTGAAGAAAATATATTGGTAGATAATAAGGGACTTAACTACTAACCCGTGCATCGGAAAGTTTGCACTCGCAGCACAGATTACCAATGGTCTACGCTTATGTGCATTATCCCAGCAGTGTCAAAACAGAACTTGTCACAGTGCATTCTTGATCTGAGAGAGCCTTCACAGCGTCGAAACAGAATTTGCCACAAT
GCATAATTGATACGAGAGAGCTTTAACAATGTCAACCCTTTGTGGTACAAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTATTA
GCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGGAGAGTGGATTATCTGCTGTTGATGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACTGCCCTTGATGCCATGGTCATGGACGGGATGACTATGGAG
GTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATACCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCAGCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCCCCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAAAATGGCTGCCA
ACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCTGAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAGAGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTCAAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTCTATGGCAGTAA
TTGATAAACTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAAGATCCCTGGCAGGGTAGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATGCTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGAGCATGAGGCAA
GGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAATATCCCAATTTTATTGGAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCATGCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCAGAGAGTGTCTA
ATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGGCTTGCTAGTTTACTGTTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTACTATGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACCTAAGTATCTAT
AACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCACTTAATTTTGTGACTTAATTTTGTGGAGATGGCA

>TRINITY_DN106424_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

AAATAATTGAAGAAAATATATTGGTAGATAATAAGGGACTTAACTACTAACCCGTGCATCGGAAAGTTTGCACTCGCAGCACAGATTACCAATGGTCTACGCTTATGTGCATTATCCCAGCAGTGTCAAAACAGAACTTGTCACAGTGCATTCTTGATCTGAGAGAGCCTTCACAGCGTCGAAACAGAATTTGCCACAAT
GCATAATTGATACGAGAGAGCTTTAACAATGTCAACCCTTTGTGGTACAAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGgtaagcctctacaggaaatgataaaatatat
tatgatgtgtttgccacacggtggatttcctgagatgggtttgttacatataattcgtagttttgatctttgatcggcacgtggttggttgattggcagGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTATTAGCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGGAGAGTGGATTATCTGCTGTTGA
TGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACTGCCCTTGATGCCATGGTCATGGACGGGATGACTATGGAGGTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATA
CCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCAGCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCCCCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAAAATGGCTGCCAACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCT
GAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAGAGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTCAAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTCTATGGCAGTAATTGATAAACTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAAGATCCCTGGCAGGGT
AGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATGCTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGAGCATGAGGCAAGGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAATATCCCAATTTTATTG
GAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCATGCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCAGAGAGTGTCTAATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGGCTTGCTAGTTTACTG
TTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTACTATGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACCTAAGTATCTATAACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCACTTAATTTTGTGAC
TTAATTTTGTGGAGATGGCA

Intron 3 GTAAGAACTT ... GCTGTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.72	213.2	44.6	41
A2	15.26	173.9	43.6	19
A3	14.92	249	49.4	38
A4	19.39	160	49	28
A5	18.28	114	38	13
A6	15.65	571.2	140.9	71
A7	13.76	847	150.4	120
A8	16.56	569.6	126.1	100
A9	14.47	660.8	112.5	111
A10	15.83	707	179.9	86

>TRINITY_DN125296_c4_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GTAAATAATTGAAGAAAATATATTGGTAGATAATAAGGGACTTAACTACTAACCCGTGCATCGGAAAGTTTGCACTCGCAGCACAGATTACCAATGGTCTACGCTTATGTGCATTATCCCAGCAGTGTCAAAACAGAACTTGTCACAGTGCATTCTTGATGTGAGAGAGCCTTCACACCGTCGAAACAGAATTTGCCACA
ATGCATAATTGATACGAGAGAGCTTTAACAATGTCAACCCTTTGTGGTACAAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTAT
TAGCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGGAGAGTGGATTATCTGCTGTTGATGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACTGCCCTTGATGCCATGGTCATGGACGGGATGACTATGG
AGGTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATACCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCAGCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCCCCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAAAATGGCTGC
CAACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCTGAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAGAGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTCAAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTCTATGGCAGT
AATTGATAAACTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAAGATCCCTGGCAGGGTAGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATGCTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGAGCATGAGGC
AAGGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAATATCCCAATTTTATTGGAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCATGCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCAGAGAGTGTC
TAATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGGCTTGCTAGTTTACTGTTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTACTATGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACCTAAGTATCT
ATAACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCACTTAATTTTGTGACTTAATTTTGTGGAGATGGCTAGTTGTTAAACAAAGGCTAAACATTAAACTAACATAAACATC

>TRINITY_DN125296_c4_g2_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTATTAGCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGG
AGAGTGGATTATCTGCTGTTGATGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACTGCCCTTGATGCCATGGTCATGGACGGGgtaagaacttttgataaaatccatctatgcttttaaagttgttcttatgcccaaattgac
aaaattggattttattatcccaagggctgtctcagATGACTATGGAGGTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATACCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCAGCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCC
CCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAAAATGGCTGCCAACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCTGAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAGAGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTC
AAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTCTATGGCAGTAATTGATAAAGTAACTTGAGAGCCTACAGAGCATCTGATTATCTGAAATTACATCATGCATTCTTAATTTTAAGCAAGAGTTTTATGAATTGGATGTTATTTCTACAGCTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAA
GATCCCTGGCAGGGTAGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATGCTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGAGCATGAGGCAAGGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAAT
ATCCCAATTTTATTGGAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCATGCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCAGAGAGTGTCTAATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGG
CTTGCTAGTTTACTGTTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTACTGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACCTAAGTATCTATAACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCAC
TTAATTTTGTGACTTAATTTTGTGGAGATGGCTAGTTGTTAAACAAAGGCTAAACATTAAACTAACATAAACATC

Intron 4 GTAACTTGAG ... ATTTCTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.44	192	69	33
A2	32.61	93	45	20
A3	28.67	102	41	29
A4	33.94	72	37	15.3
A5	28.04	77	30	10.3
A6	25.04	446	149	144.6
A7	25.39	567	193	171.1
A8	28.23	534	210	133.7
A9	27.38	594	224	168.3
A10	27.58	457	174	111.7

>TRINITY_DN125296_c4_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GTAAATAATTGAAGAAAATATATTGGTAGATAATAAGGGACTTAACTACTAACCCGTGCATCGGAAAGTTTGCACTCGCAGCACAGATTACCAATGGTCTACGCTTATGTGCATTATCCCAGCAGTGTCAAAACAGAACTTGTCACAGTGCATTCTTGATGTGAGAGAGCCTTCACACCGTCGAAACAGAATTTGCCACA
ATGCATAATTGATACGAGAGAGCTTTAACAATGTCAACCCTTTGTGGTACAAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTAT
TAGCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGGAGAGTGGATTATCTGCTGTTGATGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACTGCCCTTGATGCCATGGTCATGGACGGGATGACTATGG
AGGTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATACCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCAGCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCCCCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAAAATGGCTGC
CAACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCTGAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAGAGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTCAAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTCTATGGCAGT
AATTGATAAACTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAAGATCCCTGGCAGGGTAGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATGCTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGAGCATGAGGC
AAGGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAATATCCCAATTTTATTGGAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCATGCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCAGAGAGTGTC
TAATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGGCTTGCTAGTTTACTGTTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTACTATGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACCTAAGTATCT
ATAACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCACTTAATTTTGTGACTTAATTTTGTGGAGATGGCTAGTTGTTAAACAAAGGCTAAACATTAAACTAACATAAACATC

>TRINITY_DN125296_c4_g2_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAAAACAAATCCACCAATCTTGTCAATGGCTTCTACTTCGCTTAACCTTCTTTGCCGATTGCTGCTCCTCTCATTTTTGCTTTCCTCGACAGCGTCTCAGATCTCTTGTAATTCGCCACAGGAGGTTGAGAGAAAGTTCCCACTAGTTATTAGCACTTGGCCTTTCAGGGAAGCAGTCCGGGCAGCCTGGAATGCAGTGG
AGAGTGGATTATCTGCTGTTGATGCAGTGGTAGAGGGCTGCTCAACTTGTGAAGATCTCGGCTGTGATGGCACCGTGGGGCCTGGTGGTAGCCCAGATGAAAATGGAGAAACTGCCCTTGATGCCATGGTCATGGACGGGGTAAGAACTTTTGATAAAATCCATCTATGCTTTTAAAGTTGTTCTTATGCCCAAATTGAC
AAAATTGGATTTTATTATCCCAAGGGCTGTCTCAGATGACTATGGAGGTTGGGGCTGTAGCTGGCATGCGATTTGTCAAAGGGGCAATTAAAGCAGCAAAACTTGTTCTTCAACATACCGAACACACTCTACTTGTTGGTGATCAAGCTTCAGCTTTTGCTCTCTCTATGGGGCTACCTGGACCAACAAATTTAAGTTCC
CCAGAATCACTGGCAAAGTGGAAAAGTTGGAAGGAAAATGGCTGCCAACCAAATTTTTGGAAGAATGTAGTTCCTAATGATGGATGTGGACCATACCATCCTATCACGAGGACATCTGAATTGGAAACTGGTCATTCTGGATTGGATTTTAGAGGGGCTGTTGATACAAGCAACATCTTGGCCAATCTCAACACAGGGTC
AAAGCACATTAGCCGTCTAAACCATGATACAATTTCTATGGCAGTAATTGATAAAgtaacttgagagcctacagagcatctgattatctgaaattacatcatgcattcttaattttaagcaagagttttatgaattggatgttatttctacagCTGGGACATATTGCTGCTGGAACATCTACAAATGGTGCCACTTTCAA
GATCCCTGGCAGGGTAGGTGATGGACCAATTGCAGGATCTTCGGCATATGCTGACCAGGAAGTTGGTGCTTGTGGTGCAACAGGAGACGGTGATGTGATGATGCGGTTTCTACCATGCTATCAAGTCGTGGAGAGCATGAGGCAAGGCATGACCCCTGAGCATGCTGCTGTTGATGCCCTTTCACGGATCAAGCGAAAAT
ATCCCAATTTTATTGGAGCTGTGTTTGCTGTTAATGCTGAAGGGATCCATGCTGGTGCTTGTCATGGTTGGACTTTCCAGTATTCCGTAAGAAGTTCGGACATGGAAGATGTTGAAGTGTATACCGTTTTCCCAGAGAGTGTCTAATATTGAATCACATATTATTTGAATCTTGCCATGCTGTACTAGAAGAAACAATGG
CTTGCTAGTTTACTGTTGACAATTTATGATGTGCATCAGCAGATTTTTACTGTGTGAAGCTGGTTCTATGTTCAACTTGCAACTAATAAATTTATATCAGGCCACTTTAAAATGGCTGTGGAAAGTCCGACCTAAGTATCTATAACTAGCACAGCCACAAGTAAAGTGGCAGGTGAACATGGATAGGTGTAGCGAACCAC
TTAATTTTGTGACTTAATTTTGTGGAGATGGCTAGTTGTTAAACAAAGGCTAAACATTAAACTAACATAAACATC