sp|Q08697|PR1A_SOLLC ----> Pathogenesis-related protein 1A1


Intron 1 GTAAATATAA ... GAAATTCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A141.7323.5229
A240.6618158
A341.2816.5129
A435.4925.51412
A558.18453
A626.5417120
A730.5423144
A835.6321148
A922.4117.590
A1026.42367



>TRINITY_DN120080_c0_g1_i13 from sample A2 / Example spliced isoform
ATACTTTCATCACATGCAATTGGGACAGAGAAGGGGCGACTGTCTCCTCCAGCACTCAGACAGCCCCTTCGGAGAGAGAAATGGTTCGACTATGCCAAGAACATCTGCACTCACTACACTCAGATTAAATGCAACTCAGGCGATACTTTCATCACCTGCAATTATTATCCACCAGGGAACTACAGAGCAGCCACGCCTTA
CTGATATTTACACACAAAGCAGTCGTGTAAATAATATTTTGCAGAGGATATTTCTTAAAGCAGAGGATATTTCTTCGGCCATTGGAGCAAAGGAAGTTTTCCAACAGAAATAAATCATTGATATGTCCAACTCTTGATATTCAATTTTCATAAGATTCTAAGACATGTCGAGTATCGCCCAATGTCTGCAATCCGAGAAT
TATTATTTACCCAAAGCAGGCCGTCAAGAATTGGCAATTAACATTGAGTTATGGAAGACTGAGCATTGGCAGTCAAGCTGTGGCATTGGAGGACGAAATCTTTACAACTGCGATATCTCGTGTCGTTTACGGTTAGTAATCGCTACCCATAAACCCGGTTTATTTCTAGCATTCTTTCTTGCTCTTGAAGGTATAGTTTG
AATTGTTTAAAGCATATTCGAAAGATTTTATTATTTATGTTAGTTTTGTGTTTGACACCCACGTCATGCAGGGTTTTATGAGATGAAAATTTGATGTTTATTTTTCATTGTTTTATGGATTGAAATCGCTTCAGTTGCATTAATTTTAGGTTCCCATTAAGGTTTTGATCTTATCTTTCCTTGTTGTGTCTAGAAATGTA
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TGAATGTTTTATTACTTTCATCTTTTAATAATTGTGGTCGATATTTAACCAGTAAGTTTGTACTAAGAGGGGT


>TRINITY_DN120080_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:
ATACTTTCATCACATGCAATTGGCACAGAGAAGGGGCGACTGTCTCCCCTACACTCACTACACTCAGATTAAATGCAACTCAGGCGATACTTTCATCACCTGCAATTATTATCCACCAGGGAACTACAGAGCAGCCACGCCTTACTGATATTTACACACAAAGCAGTCGTGTAAATgtaaatataaacatgaatgtgagc
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AATATTTTGCAGAGGATATTTCTTAAAGCAGAGGATATTTCTTCGGCCATTGGAGCAAAGGAAGTTTTCCAACAG
AAATAAATCATTGATATGTCCAACTCTTGATATTCAATTTTCATAAGATTCTAAGACATGTCGAGTATCGCCCAATGTCTGCAATCCGAGAATTATTATTTACCCAAAGCAGGCCGTCAAGAATTGGCAATTAACATTGAGTTATGGAAGACTGAGCATTGGCAGTCAAGCTGTGGCATTGGAGGACGAAATCTTTACAA
CTGCGATATCTCGTGTCGTTTACGGTTAGTAATCGCTACCCATAAACCCGGTTTATTTCTAGCATTCTTTCTTGCTCTTGAAGGTATAGTTTGAATTGTTTAAAGCATATTCGAAAGATTTTATTATTTATGTTAGTTTTGTGTTTGACACCCACGTCATGCAGGGTTTTATGAGATGAAAATTTGATGTTTATTTTTCA
TTGTTTTATGGATTGAAATCGCTTCAGTTGCATTAATTTTAGGTTCCCATTAAGGTTTTGATCTTATCTTTCCTTGTTGTGTCTAGAAATGTATGGTTGTTTATGGCTTGAAAGGATATTAAGTGATGCATATATACTTTTTCTGAGGCACGCCTTTGCTAGTTGTTTGGCAAATGATAGGGTTGCTTAAAAGTTTTGGT
ATCCGCATCGCTCGTATAATTTTAATTTTTAGGTTTTGTAAGGGGATGATTGATATTTCATGCATGTATGCAACTTAGTAGCGGAAGATTATTTGAATGTTTTATTACTTTCATCTTTTAATAATTGTGGTCGATATTTAACCAGTAAGTTTGTACTAAGAGGGGT