sp|Q50EK3|C04C1_PINTA ----> Cytochrome P450 704C1
Intron 1 GTCTGCTTTT ... AAATTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68 | 16 | 34 | 11 |
| A2 | 67.74 | 10 | 21 | 9 |
| A3 | 65.63 | 11 | 21 | 8 |
| A4 | 65.38 | 9 | 17 | 1 |
| A5 | 100 | 0 | 12 | 3 |
| A6 | 58.04 | 60 | 83 | 14 |
| A7 | 67.91 | 43 | 91 | 8 |
| A8 | 76.89 | 49 | 163 | 13 |
| A9 | 71.53 | 41 | 103 | 5 |
| A10 | 55.56 | 40 | 50 | 15 |
>TRINITY_DN129662_c2_g1_i18 from sample A1 / Example spliced isoformGGCCGCTCGTGTACTGCGTTAAAGAAGAGTCCGTCCAACACAGATCAGATCCCTATCCTCTATTGCTTCGTAAAACCCTATAAACTTTAACCACATAGTTCCTTTGTATGAGAGATCGCCTGTTCTTTTAAAGCCAATTTGCCGTTGATATGGGTGAAGGCCAGACCACGATGAATTGGCCGTTAAGTCCTATCTCTGCA
AGAGCGAGAGCCATGTGATGGGAAGAAATTGTTGGTATTGAAACCTTCCGAATTCCATCCAGCTTTTTCACGAACCAGGAGGTCTGGGGATGCTTTACTATAATCTTCCCTAAGACGACGACCAGGGATCTGAAAGCCGCCATGGCATCGGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCTCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGA
CTGGAGGCACAACCAGATCGGGCGAAGACTAAGGAGAGGCGCGCAGATTTCCTACAAATGTTTTTTGCCAAAAACCCTTGAAATCTGGCTGGAAAAATCCACCCTAAAAGGTTGAAATCGTCGGGCGTTTAGGCTACTACGCATATTTTTATGAATAGATATCCTTTACTGCACGGAGGGCTACGCATATTTTTATAAAT
AGATATTCTTTACTGCACGGAGGGATTGGGGTCTGTATCATTTATTTGGCTATGTTGCCATATTCTGTTTTGATTTAACTGGAGTTGTTTGTCATACTGTTGTTGAGATAGTTTTCCCTAGTCACATCCCAACCCTCAGCTCCGGGGTGAAGTCTTTTAAATTCCTATAGCTGAATGAGAAATTGTCGGTATGCAATTGG
TCCCTTCTACCAAGATTTGTATGTGATTTACTGCAAGAAATGACAGTATTGGTATAGTTTCTCAGATTTCCATTTAAGGATTATATGTAAATATTTTCTGCCAGTTTCTAACCATGTATATCTGTTTACTATTGTATTTTAAGGCTCTCTTTTAGTTGTCAGAAAATATTGCTGTTACTATTCATCTGAATTAAAAAAAT
ACAACAGGCTGGAATAAAGATCTGTTAAGGGAAATATTGGTGTTTCATTCTTAATGATAGGGATTGAGCACTTTTCAAAGTCAACAACTCAAAGTCCAATAAGAAAAATACAAGAATATAAAATTTAAAACCAAGAGTAATTCGTTGGACGGAAAAAGAACACCCCCTAATATGAAAAGAATAAAGACTAAAATTCTATT
TGGAGCAGTCTGCTCAAACTGTGTTCATGTTCACTAGTTGAAGTTTTTGAAAGGACTTAGCTATAATAGAGATAATTGATAGAGTCTAGAGTCTGATAGAAAAATGCCATTAGTCATTCACGTGTCTTTTAATTTATTTATTTTCCAATCGAGTGCTTCTTTTGACTATTTATATAAACAATTAGCTTTAACACAGATAA
TTAATATAGTCGGATTGAAAAATGTCATTAGTCAGGCGTGTCTTTTATTTTTTAATAGAGTGCTTCTTTTGATTATGTATATAAATAAACAAATAGAATACATAATGGGCATTTTATAAAAAAGATGGAACATTTTGCAGCCACCACTAGGTAGTGAAAAAGAAAGCCCATTACCAAAATAACCCGAGCACTTTCAATAA
AATTGCCACTTAGACATATAGACATACAGTATGACTGAAAAATTCATCTGACATTAAATAAAAGTACAGCCTTTCAGTTCACACAACAAGAATCACAAACATCAAGATCCATAAGTCATGCTTTCCTGAAATTCTTTTTTTCGACACAGCATTTCTTTCAAAATAGTAACATAAAGTTATTAGACAAACGGGAAATTTGG
TGTCACAGATCAGCACCTAAGACTACATGAGCTGATATAACTTATATGGTGAAGCACTGTTCTGTGCTTAGTGTGTGTGTTCTACTTGTCTGGTTCATTCAACATGTTCTATTCAAAAGATGTTTTTATCACCCAAGCGGTTTTTGACGTTGTGGTCTGATTCTGTATAACAGATAGATGCCTTCAACAAGGCAAAATCA
GAATATCTTATAACAATTACAGACACTTAAGTACAACATATGAAATCTTTCAGTGTAAGCTGTGCCTTATTGTGAAGTAAAACTGTCCTCAGCAATTGAATCTAGGCTTGAGACGAAGATTTAATCCATCTTCAGTCATATGGAGTGTTAGTGAGAGACGATATCTCACTTCCTTACCTTCAAGAGCTTCAAATTTGAAG
AAACGTACAAGCACAGCAGCAAAAATCTTCATTTGCATGTATGCAAAATCCTTGCCAAGACAAATGCGAGGTCCAGCCTGTAAGTCAAGCACACACCTTATCAATTTCAAAGCATTATCGTAGGTGCTTTTTCCAAATATTAACTATCATGGATATGGCACTTACCTGAAATGCAGTGA
>TRINITY_DN129662_c2_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGCCGCTCGTGTACTGCGTTAAAGAAGAGTCCGTCCAACACAGATCAGATCCCTATCCTCTATTGCTTCGTAAAACCCTATAAACTTTAACCACATAGTTCCTTTGTATGAGAGATCGCCTGTTCTTTTAAAGCCAATTTGCCGTTGATATGGGTGAAGGCCAGACCACGATGAATTGGCCGTTAAGTCCTATCTCTGCA
AGAGCGAGAGCCATGTGATGGGAAGAAATTGTTGGTATTGAAACCTTCCGAATTCCATCCAGCTTTTTCACGAACCAGGAGGTCTGGGGATGCTTTACTATAATCTTCCCTAAGACGACGACCAGGGATCTGAAAGCCGCCATGGCATCGGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCTCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGA
CTGGAGGCACAACCAGATCGGGCGAAGACTAAGGAGAGGCGCGCAGgtctgcttttttttattgtcttgcatcctattttattcatgacgagaacaacaagtttaatgagtctaaagggtcataagaaatgttttctttttcaataattagttatatttcaagaagaaatttcttacaaagagagttaaaaaaaacaaaa
acagaattatatatacaatcgtgtctgatatcctcttccccaagagctaaagggcagctattaaactgagaacaagcataagaaatgttagaaaatgatcccctgtaaatatgaaaatgcagataaaaattcaccactattcacaggattttatttaatggcaatgaaaacgattgtgtggaacttttaagatcattgat
aaacgaagataaaatcctttgttctcaatgcccaaacttgcccatgtgcatatagcagcaaggcacacccattatcgtaagtgtaggtgggagggttttctgttatcgtcgaggtcaaacttcagtccgtccttgttgatggttgtgccctgcaaagtgttgttggaatatttttatttgaagtctaaaattgtgatcat
ttcgacttccaggtgggtttttggaatttgataattttttcaagaaatctgaattctgtgttgttcaaatagtaattttaaatatagaaatagattaactccctcaaatacccaaggtaacgatattttgctattttaaatatagaaatagattagctccctcagaaacccagggtaaccatattttgctaatttaaata
ctgttatttaaaattttcagATTTCCTACAAATGTTTTTTGCCAAAAACCCTTGAAATCTGGCTGGAAAAATCCACCCTAAAAGGTTGAAATCGTCGGGCGTTTAGGCTACTACGCATATTTTTATGAATAGATATCCTTTACTGCACGGAGGGCTACGCATATTTTTATAAATAGATATTCTTTACTGCACGGAGGGAT
TGGGGTCTGTATCATTTATTTGGCTATGTTGCCATATTCTGTTTTGATTTAACTGGAGTTGTTTGTCATACTGTTGTTGAGATAGTTTTCCCTAGTCACATCCCAACCCTCAGCTCCGGGGTGAAGTCTTTTAAATTCCTATAGCTGAATGAGAAATTGTCGGTATGCAATTGGTCCCTTCTACCAAGATTTGTATGTGA
TTTACTGCAAGAAATGACAGTATTGGTATAGTTTCTCAGATTTCCATTTAAGGATTATATGTAAATATTTTCTGCCAGTTTCTAACCATGTATATCTGTTTACTATTGTATTTTAAGGCTCTCTTTTAGTTGTCAGAAAATATTGCTGTTACTATTCATCTGAATTAAAAAAATACAACAGGCTGGAATAAAGATCTGTT
AAGGGAAATATTGGTGTTTCATTCTTAATGATAGGGATTGAGCACTTTTCAAAGTCAACAACTCAAAGTCCAATAAGAAAAATACAAGAATATAAAATTTAAAACCAAGAGTAATTCGTTGGACGGAAAAAGAACACCCCCTAATATGAAAAGAATAAAGACTAAAATTCTATTTGGAGCAGTCTGCTCAAACTGTGTTC
ATGTTCACTAGTTGAAGTTTTTGAAAGGACTTAGCTATAATAGAGATAATTGATAGAGTCTAGAGTCTGATAGAAAAATGCCATTAGTCATTCACGTGTCTTTTAATTTATTTATTTTCCAATCGAGTGCTTCTTTTGACTATTTATATAAACAATTAGCTTTAACACAGATAATTAATATAGTCGGATTGAAAAATGTC
ATTAGTCAGGCGTGTCTTTTATTTTTTAATAGAGTGCTTCTTTTGATTATGTATATAAATAAACAAATAGAATACATAATGGGCATTTTATAAAAAAGATGGAACATTTTGCAGCCACCACTAGGTAGTGAAAAAGAAAGCCCATTACCAAAATAACCCGAGCACTTTCAATAAAATTGCCACTTAGACATATAGACATA
CAGTATGACTGAAAAATTCATCTGACATTAAATAAAAGTACAGCCTTTCAGTTCACACAACAAGAATCACAAACATCAAGATCCATAAGTCATGCTTTCCTGAAATTCTTTTTTTCGACACAGCATTTCTTTCAAAATAGTAACATAAAGTTATTAGACAAACGGGAAATTTGGTGTCACAGATCAGCACCTAAGACTAC
ATGAGCTGATATAACTTATATGGTGAAGCACTGTTCTGTGCTTAGTGTGTGTGTTCTACTTGTCTGGTTCATTCAACATGTTCTATTCAAAAGATGTTTTTATCACCCAAGCGGTTTTTGACGTTGTGGTCTGATTCTGTATAACAGATAGATGCCTTCAACAAGGCAAAATCAGAATATCTTATAACAATTACAGACAC
TTAAGTACAACATATGAAATCTTTCAGTGTAAGCTGTGCCTTATTGTGAAGTAAAACTGTCCTCAGCAATTGAATCTAGGCTTGAGACGAAGATTTAATCCATCTTCAGTCATATGGAGTGTTAGTGAGAGACGATATCTCACTTCCTTACCTTCAAGAGCTTCAAATTTGAAGAAACGTACAAGCACAGCAGCAAAAAT
CTTCATTTGCATGTATGCAAAATCCTTGCCAAGACAAATGCGAGGTCCAGCCTGTAAGTCAAGCACACACCTTATCAATTTCAAAGCATTATCGTAGGTGCTTTTTCCAAATATTAACTATCATGGATATGGCACTTACCTGAAATGCAGTGA
Intron 2 GTTTAGGTGG ... ATCATCGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.22 | 20 | 15 | 27 |
| A2 | 39.39 | 10 | 6 | 7 |
| A3 | 42.86 | 14 | 12 | 9 |
| A4 | 58.33 | 5 | 6 | 8 |
| A5 | 28.57 | 10 | 3 | 5 |
| A6 | 44.71 | 47 | 38 | 38 |
| A7 | 43.51 | 37 | 30 | 27 |
| A8 | 43.86 | 48 | 32 | 43 |
| A9 | 44.36 | 37 | 33 | 26 |
| A10 | 38.6 | 35 | 22 | 22 |
>TRINITY_DN129662_c2_g1_i12 from sample A1 / Example spliced isoformTTGATCCCCTGTAATTATGAAAATGCAGATAAAAATCCAATCCCTATTCACGGTTGTTTGGAACTTTTAAGATCATTGGTAGACGATGATAAACTCCTTTGTTCTCAATCCCCAAAATTGCCAGTATGCATATGGCAGCAAGGCACACCCATCATCGTAGGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTCGAGGTCAAAC
TTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCCTGCATAGTGTTGTTGGAATATTTTTATGAATATATATCCTTTACTGCACGGAGGATTGGGGTCTGTATCATTTATTTGGCTATGTTGCCATATTCTGTTTTGATTTAACTGGAGTTGTTTGTCATGCTGTTATTGCTGTTGTTGAGGTAGTTTTCCCTCGTCACATCCCA
ACCCTCATGTCCGGGGTGAAATCTCCTATAGCTGGATGAGAAATTGTCGCTATGCAATTGGTCCCTTCTACGAAGATTTGTATTTGTGATTTACTGCAAGAAATGACAGTATTGGTATAGTTTCTCAGATTCCCAATTAAGGATTATATGTAAATATTTTTCTGCCAGTTTCTAACCATGTATATCTGTTTACTATTGTA
TTTTAAGGCTCTCTTTTAGTTGTCAGAAAATATTGCTGTTACTATTCATCTGAATTAAAAAAATACAACAGGCTGGAATAAAGATCTGTTAAGGGAAATATTGGTGTTTCATTCTTAATGATAGGGATTGAGCACTTTTCAAAGTCAACAACTCAAAGTCCAATAAGAAAAATACAAGAATATAAAATTTAAAACCAAGA
GTAATTCGTTGGACGGAAAAAGAACACCCCCTAATATGAAAAGAATAAAGACTAAAATTCTATTTGGAGCAGTCTGCTCAAACTGTGTTCATGTTCACTAGTTGAAGTTTTTGAAAGGACTTAGCTATAATAGAGATAATTGATAGAGTCTAGAGTCTGATAGAAAAATGCCATTAGTCATTCACGTGTCTTTTAATTTA
TTTATTTTCCAATCGAGTGCTTCTTTTGACTATTTATATAAACAATTAGCTTTAACACAGATAATTAATATAGTCGGATTGAAAAATGTCATTAGTCAGGCGTGTCTTTTATTTTTTAATAGAGTGCTTCTTTTGATTATGTATATAAATAAACAAATAGAATACATAATGGGCATTTTATAAAAAAGATGGAACATTTT
GCAGCCACCACTAGGTAGTGAAAAAGAAAGCCCATTACCAAAATAACCCGAGCACTTTCAATAAAATTGCCACTTAGACATATAGACATACAGTATGACTGAAAAATTCATCTGACATTAAATAAAAGTACAGCCTTTCAGTTCACACAACAAGAATCACAAACATCAAGATCCATAAGTCATGCTTTCCTGAAATTCTT
TTTTTCGACACAGCATTTCTTTCAAAATAGTAACATAAAGTTATTAGACAAACGGGAAATTTGGTGTCACAGATCAGCACCTAAGACTACATGAGCTGATATAACTTATATGGTGAAGCACTGTTCTGTGCTTAGTGTGTGTGTTCTACTTGTCTGGTTCATTCAACATGTTCTATTCAAAAGATGTTTTTATCACCCAA
GCGGTTTTTGACGTTGTGGTCTGATTCTGTATAACAGATAGATGCCTTCAACAAGGCAAAATCAGAATATCTTATAACAATTACAGACACTTAAGTACAACATATGAAATCTTTCAGTGTAAGCTGTGCCTTATTGTGAAGTAAAACTGTCCTCAGCAATTGAATCTAGGCTTGAGACGAAGATTTAATCCATCTTCAGT
CATATGGAGTGTTAGTGAGAGACGATATCTCACTTCCTTACCTTCAAGAGCTTCAAATTTGAAGAAACGTACAAGCACAGCAGCAAAAATCTTCATTTGCATGTATGCAAAATCCTTGCCAAGACAAATGCGAGGTCCAGCCTGTAAGTCAAGCACACACCTTATCAATTTCAAAGCATTATCGTAGGTGCTTTTTCCAA
ATATTAACTATCATGGATATGGCACTTACCTGAAATGCAGTGA
>TRINITY_DN129662_c2_g1_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGTTGATCCATGCACCGAGGATCCCGGATTGGATCAGGGGGGCTAGGTTGAGAGAACGACGGGGCCGAGGAAGAGTCCGATGGTGGAGGTTGCTTGGGGCCGCCTTTTTCTTAACCACCCGCCGTTTGGTCATCTTTCCGAGGAGAATCTTCAGCCATTGGTTGAATTTTTTTAATCTTTGGCAAAATGAACATGAATTG
GCCATATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTTGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTTGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTGCTTCTGTTAGCCTTTTGTTCAGTTCGG
AGCGCATCCTTCTCCAGCAGTGTAGAGGAAGGTACATCAACAGGAACAGTGGAGGCTACATCAAGATTGGGGTTGAAATCCGGTGTCCATTTATTCAGATACATTCCTTTCAGATCACTTTCTCTCGATTTGAAGAAGCAAGTAAGGCCCATTTCAAAAGACCAGATCATTATCTTGTTTTGCTTCGTAAAACCCTAGAA
CCTTCGACCACATAAATAATGAGATAACTTTCCTTTGTATGAGATATTGCCGTTTCTTTTAAAGTTAATTTGCCATTGATATGGGTGAAGGCCAGATCACGGTGAATAAGTCCTATCTCTGCAAGAGCGAGAGCCATGTAATGGGAAGAAATTGTTGGTTGAAGCCTTCGGAATCCCATCCAGCTTTTTCACGAACGGGG
AGGTCTGCAGATGCTTTGCTATAATCTTCCCTAAAACGACCACCATGGATCTGAAAGCCATGGCATCAGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCCCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGACTGGAGGCACAACCAGATCGGTCGAGGGCTAAGGAGAGGCGCGCAGGTCTGATTTTTTTTATTATCTTGCATCCAATTTTAT
TCATGAAGAGAACAACAAGTTTAATTAGTCTTAAGGGTCATAAAAAATGTTTCTGTTTTTTCAATAATAAGCTATATATTAAGAATATTTTTGTACAAAGAGATTTAAAAAAAAGCAAAAAACAGAATTATACATACAATGGTATCTGATATCCTCTTCCTAAGAGTTAAAGGGCAGCATTAAATTCAGAACAAGCATAA
GAAATGTTAGAAATTGATCCCCTGTAATTATGAAAATGCAGATAAAAATCCAATCCCTATTCACGGTTGTTTGGAACTTTTAAGATCATTGGTAGACGATGATAAACTCCTTTGTTCTCAATCCCCAAAATTGCCAGTATGCATATGGCAGCAAGGCACACCCATCATCGTAGgtttaggtgggagggttttctgttact
gtcgaggtcaaacttcagtccgtccttgttgacggttgtgccctgcaaggcacacccatcatcgtagGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTGGAGGTCAAACTTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCCTGCATAGTGTTGTTGGAATATTTTTATGAATATATATCCTTTACTGCACGGAGGATTGGGGTC
TGTATCATTTATTTGGCTATGTTGCCATATTCTGTTTTGATTTAACTGGAGTTGTTTGTCATGCTGTTATTGCTGTTGTTGAGGTAGTTTTCCCTCGTCACATCCCAACCCTCATGTCCGGGGTGAAATCTCCTATAGCTGGATGAGAAATTGTCGCTATGCAATTGGTCCCTTCTACGAAGATTTGTATTTGTGATTTA
CTGCAAGAAATGACAGTATTGGTATAGTTTCTCAGATTCCCAATTAAGGATTATATGTAAATATTTTTCTGCCAGTTTCTAACCATGTATATCTGTTTACTATTGTATTTTAAGGCTCTCTTTTAGTTGTCAGAAAATATTGCTGTTACTATTCATCTGAATTAAAAAAATACAACAGGCTGGAATAAAGATCTGTTAAG
GGAAATATTGGTGTTTCATTCTTAATGATAGGGATTGAGCACTTTTCAAAGTCAACAACTCAAAGTCCAATAAGAAAAATACAAGAATATAAAATTTAAAACCAAGAGTAATTCGTTGGACGGAAAAAGAACACCCCCTAATATGAAAAGAATAAAGACTAAAATTCTATTTGGAGCAGTCTGCTCAAACTGTGTTCATG
TTCACTAGTTGAAGTTTTTGAAAGGACTTAGCTATAATAGAGATAATTGATAGAGTCTAGAGTCTGATAGAAAAATGCCATTAGTCATTCACGTGTCTTTTAATTTATTTATTTTCCAATCGAGTGCTTCTTTTGACTATTTATATAAACAATTAGCTTTAACACAGATAATTAATATAGTCGGATTGAAAAATGTCATT
AGTCAGGCGTGTCTTTTATTTTTTAATAGAGTGCTTCTTTTGATTATGTATATAAATAAACAAATAGAATACATAATGGGCATTTTATAAAAAAGATGGAACATTTTGCAGCCACCACTAGGTAGTGAAAAAGAAAGCCCATTACCAAAATAACCCGAGCACTTTCAATAAAATTGCCACTTAGACATATAGACATACAG
TATGACTGAAAAATTCATCTGACATTAAATAAAAGTACAGCCTTTCAGTTCACACAACAAGAATCACAAACATCAAGATCCATAAGTCATGCTTTCCTGAAATTCTTTTTTTCGACACAGCATTTCTTTCAAAATAGTAACATAAAGTTATTAGACAAACGGGAAATTTGGTGTCACAGATCAGCACCTAAGACTACATG
AGCTGATATAACTTATATGGTGAAGCACTGTTCTGTGCTTAGTGTGTGTGTTCTACTTGTCTGGTTCATTCAACATGTTCTATTCAAAAGATGTTTTTATCACCCAAGCGGTTTTTGACGTTGTGGTCTGATTCTGTATAACAGATAGATGCCTTCAACAAGGCAAAATCAGAATATCTTATAACAATTACAGACACTTA
AGTACAACATATGAAATCTTTCAGTGTAAGCTGTGCCTTATTGTGAAGTAAAACTGTCCTCAGCAATTGAATCTAGGCTTGAGACGAAGATTTAATCCATCTTCAGTCATATGGAGTGTTAGTGAGAGACGATATCTCACTTCCTTACCTTCAAGAGCTTCAAATTTGAAGAAACGTACAAGCACAGCAGCAAAAATCTT
CATTTGCATGTATGCAAAATCCTTGCCAAGACAAATGCGAGGTCCAGCCTGTAAGTCAAGCACACACCTTATCAATTTCAAAGCATTATCGTAGGTGCTTTTTCCAAATATTAACTATCATGGATATGGCACTTACCTGAAATGCAGTGAATTTAAATGGTGACTGTGGTTGGAAGGGCACTTACCTGAAATGCAGTGAA
TTTGAATGGTGACTGTGGCTGGAAAATTCCATCATGAAGCCATCTCTCAGGCCTAAACTCCTCCGCATCACTGCCCCAAAGGTATGTCATTCTTCCCATAGAGTAAGGGACATAGTTGATCATATCACCTTTTTTTATTTTGAATCCATCAGGAAGGATGTCATCAGAAACTACATTTTTTACATCCTGCAAATTGCAAA
TTATTTTCCGATGAGCCATATTCTTTAAACTTTGAATC
Intron 3 GTAAGGCCCA ... ATGGGTGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.7 | 32 | 77 | 26 |
| A2 | 55.42 | 37 | 57 | 35.1 |
| A3 | 50.02 | 41 | 54 | 28.1 |
| A4 | 54.43 | 36 | 67 | 19 |
| A5 | 60.02 | 6 | 14 | 4 |
| A6 | 52.01 | 83.1 | 105 | 75.2 |
| A7 | 52.05 | 147 | 176 | 143 |
| A8 | 52.02 | 119 | 141 | 117.1 |
| A9 | 49.12 | 144 | 170 | 108.1 |
| A10 | 51.35 | 107.1 | 140 | 86.1 |
>TRINITY_DN129662_c2_g1_i14 from sample A1 / Example spliced isoformCGTTGATCCATGCACCGAGGATCCCGGATTGGATCAGGGGGGCTAGGTTGAGAGAACGACGGGGCCGAGGAAGAGTCCGATGGTGGAGGTTGCTTGGGGCCGCCTTTTTCTTAACCACCCGCCGTTTGGTCATCTTTCCGAGGAGAATCTTCAGCCATTGGTTGAATTTTTTTAATCTTTGGCAAAATGAACATGAATTG
GCCATATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTTGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTTGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTGCTTCTGTTAGCCTTTTGTTCAGTTCGG
AGCGCATCCTTCTCCAGCAGTGTAGAGGAAGGTACATCAACAGGAACAGTGGAGGCTACATCAAGATTGGGGTTGAAATCCGGTGTCCATTTATTCAGATACATTCCTTTCAGATCACTTTCTCTCGATTTGAAGAAGCAAGCCAGATCACGGTGAATAAGTCCTATCTCTGCAAGAGCGAGAGCCATGTAATGGGAAGA
AATTGTTGGTTGAAGCCTTCGGAATCCCATCCAGCTTTTTCACGAACGGGGAGGTCTGCAGATGCTTTGCTATAATCTTCCCTAAAACGACCACCATGGATCTGAAAGCCATGGCATCAGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCCCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGACTGGAGGCACAACCAGATCGGTCGAGGGCTA
AGGAGAGGCGCGCAGGCAAAACTAAAGACGTTGGTTCCATTTAATCACCCTCTGCATGTCACACTTACTTGGAGCTTCAACGCGAGGGTAAAGGTGCCTGCGCTCAGCCCAAAATAATAGATCAGTGCCAAATCACTGTTACAGATTCATTCGTTGGTATGTGAAAAGATGAGTGGTCGAGGAGGAAGTCAGCGTACCTA
GTTATTATGTAATGTGTCTATGGGGAAGGCTTCAAGTCTCTTGTTTTTTTTTGAAAAGTTCAAAGAGAGACTTAGTAAATATCTGTCGACACCAACACCAAACAAAATATTTTATCATGAAGGGATTAGACCATTTCAATATATATTTCATTATGAACCGGTAACATGGAAGTTTAAATAAAATAATTCATTATGTTGGG
TCATATTTGAATTTTATTGGTTTTCTTATAAGTGAGGATAAATATCTTTGAACAAGAAGAGATATTGTGTGTACAGTGTCCAGGATAGAGATATTTCGTGTACATTGTGTAGGATATAGGATATATGTGGAGAG
>TRINITY_DN129662_c2_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGTTGATCCATGCACCGAGGATCCCGGATTGGATCAGGGGGGCTAGGTTGAGAGAACGACGGGGCCGAGGAAGAGTCCGATGGTGGAGGTTGCTTGGGGCCGCCTTTTTCTTAACCACCCGCCGTTTGGTCATCTTTCCGAGGAGAATCTTCAGCCATTGGTTGAATTTTTTTAATCTTTGGCAAAATGAACATGAATTG
GCCATATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTTGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTTGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTGCTTCTGTTAGCCTTTTGTTCAGTTCGG
AGCGCATCCTTCTCCAGCAGTGTAGAGGAAGGTACATCAACAGGAACAGTGGAGGCTACATCAAGATTGGGGTTGAAATCCGGTGTCCATTTATTCAGATACATTCCTTTCAGATCACTTTCTCTCGATTTGAAGAAGCAAgtaaggcccatttcaaaagaccagatcattatcttgttttgcttcgtaaaaccctagaa
ccttcgaccacataaataatgagataactttcctttgtatgagatattgccgtttcttttaaagttaatttgccattgatatgggtgaagGCCAGATCACGGTGAATAAGTCCTATCTCTGCAAGAGCGAGAGCCATGTAATGGGAAGAAATTGTTGGTTGAAGCCTTCGGAATCCCATCCAGCTTTTTCACGAACGGGG
AGGTCTGCAGATGCTTTGCTATAATCTTCCCTAAAACGACCACCATGGATCTGAAAGCCATGGCATCAGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCCCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGACTGGAGGCACAACCAGATCGGTCGAGGGCTAAGGAGAGGCGCGCAGGCAAAACTAAAGACGTTGGTTCCATTTAATCACCCT
CTGCATGTCACACTTACTTGGAGCTTCAACGCGAGGGTAAAGGTGCCTGCGCTCAGCCCAAAATAATAGATCAGTGCCAAATCACTGTTACAGATTCATTCGTTGGTATGTGAAAAGATGAGTGGTCGAGGAGGAAGTCAGCGTACCTAGTTATTATGTAATGTGTCTATGGGGAAGGCTTCAAGTCTCTTGTTTTTTTT
TGAAAAGTTCAAAGAGAGACTTAGTAAATATCTGTCGACACCAACACCAAACAAAATATTTTATCATGAAGGGATTAGACCATTTCAATATATATTTCATTATGAACCGGTAACATGGAAGTTTAAATAAAATAATTCATTATGTTGGGTCATATTTGAATTTTATTGGTTTTCTTATAAGTGAGGATAAATATCTTTGA
ACAAGAAGAGATATTGTGTGTACAGTGTCCAGGATAGAGATATTTCGTGTACATTGTGTAGGATATAGGATATATGTGGAGAG
Intron 4 GTCTGATTTT ... GAAAATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 64.25 | 18.5 | 33 | 16.7 |
| A2 | 66.67 | 14 | 28 | 16.9 |
| A3 | 65.31 | 17 | 32 | 5 |
| A4 | 63.55 | 15.5 | 27 | 17.9 |
| A5 | 66.67 | 7 | 14 | 11 |
| A6 | 65.12 | 48.8 | 91 | 19.8 |
| A7 | 68.04 | 54.5 | 116 | 20.3 |
| A8 | 71.22 | 76 | 188 | 28.5 |
| A9 | 70.94 | 50 | 122 | 36.3 |
| A10 | 75.47 | 22.8 | 70 | 19.2 |
>TRINITY_DN99328_c0_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoformCTCGTTGATTGCTTTTGTAGGATTGCGGTATTTCGTTGATCCATGCACCGAGGATCCCGGATTGGATAGGGGGGCTAGGTTGAGAGAACGACGGGGCCGAGGAAGAGTCCGATGGTGGAGGTTGCTTGGGGCCGCCTTTTTCTTAACCACCTGCCGTTTGGTCATCTTTACGAGGAGAATCTTCAGCCATTGGTTGAATT
TTTTTAATCTTTGGCAAAATGAACATGAATTGGCCATATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTAT
TATTGCTTCTGGTAGCCTTTTGTTCAGTTCGGAGCGCATCCTTCTCCAGCAGTGTAGAGGAAGGTACATCAACAGGAACAGTGGAGGCTACATCAAGATTGGGGTTGAAATCCGGTGTCCATTTATTCAGATACATTCCTTTCAGATCACTTTCTCTCGATTTGAAGAAGCAAGTAAGGCCCATTTCAAAAGACCAGATC
ATTATCTTGTTTTGCTTCGTAAAACCCTAGAACCTTCGACCACATAAATAATGAGATAACTTTCCTTTGTATGAGATATTGCCGTTTCTTTTAAAGTTAATTTGCCATTGATATGGGTGAAGGCCAGATCACGGTGAATAAGTCCTATCTCTGCAAGAGCGAGAGCCATGTAATGGGAAGAAATTGTTGGTTGAAGCCTT
CGGAATCCCATCCAGCTTTTTCACGAACGGGGAGGTCTGCAGATGCTTTGCTATAATCTTCCCTAAAACGACCACCATGGATCTGAAAGCCATGGCATCAGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCCCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGACTGGAGGCACAACCAGATCGGTCGAGGGCTAAGGAGAGGCGCGCAGATAA
AAATCCAATCCCTATTCACGGTTGTTTGGAACTTTTAAGATCATTGGTAGACGATGATAAACTCCTTTGTTCTCAATCCCCAAAATTGCCAGTATACATATGGCAGCAAGGCACACCCATCATCGTAGGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTGGAGGTCAAACTTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCTTG
CTGCCATATGCTGCAAGGCACACCCATCATCGTAGGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTCGAGGTCAAACTTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCCTGCATAGTGTTGTTGGAATATTTTTATGAATATATATCCTTTACTGCACGGAGGAGTGGGGTCTGTATCATTTATTTGGCTATGTTGCCATATTC
TGTTTTGATTTAACTGGAGTTGTTTGTCATGCTGTTATTGCTGTTGTTGAGGTAGTTTTCCCTCGTCACATCCCAACCCTCATGTCCGGGGTGAAATCTCCTATAGCTGGATAAGAAATTGTCGCTATGCAATTGGTCCCTTCTACGAAGATTTGTATTTGTGATTTACTGCAAGAAATGACAGTATTGGTATAGTTTCT
CAGATTCCCAATTAAGGATTATATGTAAATATTTTTCTGCCAGTTTCTAACCATGTATATCTGT
>TRINITY_DN99328_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:CTCGTTGATTGCTTTTGTAGGATTGCGGTATTTCGTTGATCCATGCACCGAGGATCCCGGATTGGATAGGGGGGCTAGGTTGAGAGAACGACGGGGCCGAGGAAGAGTCCGATGGTGGAGGTTGCTTGGGGCCGCCTTTTTCTTAACCACCTGCCGTTTGGTCATCTTTACGAGGAGAATCTTCAGCCATTGGTTGAATT
TTTTTAATCTTTGGCAAAATGAACATGAATTGGCCATATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTAT
TATTGCTTCTGGTAGCCTTTTGTTCAGTTCGGAGCGCATCCTTCTCCAGCAGTGTAGAGGAAGGTACATCAACAGGAACAGTGGAGGCTACATCAAGATTGGGGTTGAAATCCGGTGTCCATTTATTCAGATACATTCCTTTCAGATCACTTTCTCTCGATTTGAAGAAGCAAGTAAGGCCCATTTCAAAAGACCAGATC
ATTATCTTGTTTTGCTTCGTAAAACCCTAGAACCTTCGACCACATAAATAATGAGATAACTTTCCTTTGTATGAGATATTGCCGTTTCTTTTAAAGTTAATTTGCCATTGATATGGGTGAAGGCCAGATCACGGTGAATAAGTCCTATCTCTGCAAGAGCGAGAGCCATGTAATGGGAAGAAATTGTTGGTTGAAGCCTT
CGGAATCCCATCCAGCTTTTTCACGAACGGGGAGGTCTGCAGATGCTTTGCTATAATCTTCCCTAAAACGACCACCATGGATCTGAAAGCCATGGCATCAGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCCCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGACTGGAGGCACAACCAGATCGGTCGAGGGCTAAGGAGAGGCGCGCAGgtct
gattttttttattatcttgcatccaattttattcatgaagagaacaacaagtttaattagtcttgagggtcataaaaaatgtttctgttttttcaataataagctatatattaagaatatttttgtacaaagagatttaaaaaaaagcaaaaaacagaattatacatacaatggtatctgatatcctcttcctaagagtt
aaagggcagcattaaattcagaacaagcataagaaatgttagaaattgatcccctgtaattatgaaaatgcagATAAAAATCCAATCCCTATTCACGGTTGTTTGGAACTTTTAAGATCATTGGTAGACGATGATAAACTCCTTTGTTCTCAATCCCCAAAATTGCCAGTATACATATGGCAGCAAGGCACACCCATCAT
CGTAGGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTGGAGGTCAAACTTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCTTGCTGCCATATGCTGCAAGGCACACCCATCATCGTAGGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTCGAGGTCAAACTTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCCTGCATAGTGTTGTTGGAA
TATTTTTATGAATATATATCCTTTACTGCACGGAGGAGTGGGGTCTGTATCATTTATTTGGCTATGTTGCCATATTCTGTTTTGATTTAACTGGAGTTGTTTGTCATGCTGTTATTGCTGTTGTTGAGGTAGTTTTCCCTCGTCACATCCCAACCCTCATGTCCGGGGTGAAATCTCCTATAGCTGGATAAGAAATTGTC
GCTATGCAATTGGTCCCTTCTACGAAGATTTGTATTTGTGATTTACTGCAAGAAATGACAGTATTGGTATAGTTTCTCAGATTCCCAATTAAGGATTATATGTAAATATTTTTCTGCCAGTTTCTAACCATGTATATCTGTCTACTATGGTATTTTAAGGCTTTCTTTTAGTTAAGGCTTTCGTTTAGTTGTCAGAAAAT
ATTGCTGTTACTATTCATCTGAATTAAAAAAATACAACAGGCTGGAATAAAGATCTGTTAAGGGA
Intron 5 GTTTAGGTGG ... ATCATCGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 62.71 | 11 | 13 | 24 |
| A2 | 50 | 8 | 9 | 7 |
| A3 | 51.35 | 9 | 12 | 7 |
| A4 | 71.43 | 3 | 8 | 7 |
| A5 | 57.14 | 3 | 3 | 5 |
| A6 | 67.92 | 17 | 36 | 36 |
| A7 | 59.18 | 20 | 31 | 27 |
| A8 | 62.16 | 21 | 33 | 36 |
| A9 | 60.82 | 19 | 33 | 26 |
| A10 | 57.5 | 17 | 24 | 22 |
>TRINITY_DN46071_c1_g1_i24 from sample A7 / Example spliced isoformCGTTGATTGCTTTTGTAGGATTACCGTATTTCGTTGATCCATGCACCGAGGATCCCGGATTGGATCAGGGGGGCTAGGTTGAGAGAACGACGGGGCCGAGGAAGAGTCCGATGGTGGAGGTTGCTTGGGGCCGCCTTTTTCTTAACCACCTGCCGTTTGGTCATCTTTACGAGGAGAATCTTCAGCCATTGGTTGAATTT
TTTTAATCTTTGGAAAAATGACCATGAATTGGCCATATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATT
ATTGCTTCTGGTAGCCTTTTGTTCAGTTCGGAGCGCATCCTTCTCCAGCAGTGTAGAGGAAGGTACATCAACAGGAACAGTGGAGGCTACATCAAGATTGGGGTTGAAATCCGGTGTCCATTTATTCAGATACATTCCTTTCAGATCACTTTCTCTCGATTTGAAGAAGCAAGCCAGATCACGGTGAATAAGTCCTATCT
CTGCAAGAGCGAGAGCCATGTAATGGGAAGAAATTGTTGGTTGAAGCCTTCGGAATCCCATCCAGCTTTTTCACGAACGGGGAGGTCTGCAGATGCTTTGCTATAATCTTCCCTAAAACGACCACCATGGATCTGAAAGCCATGGCATCAGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCCCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGA
CTGGAGGCACAACCAGATCGGTCGAGGGCTAAGGAGAGGCGCGCAGATAAAAATCCAATCCCTATTCACGGTTGTTTGGAACTTTTAAGATCATTGGTAGACGATGATAAACTCCTTTGTTCTCAATCCCCAAAATTGCCATATGCTGCAAGGCACACCCATCATCGTAGGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTC
GAGGTCAAACTTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCC
>TRINITY_DN46071_c1_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:CGTTGATTGCTTTTGTAGGATTACCGTATTTCGTTGATCCATGCACCGAGGATCCCGGATTGGATCAGGGGGGCTAGGTTGAGAGAACGACGGGGCCGAGGAAGAGTCCGATGGTGGAGGTTGCTTGGGGCCGCCTTTTTCTTAACCACCTGCCGTTTGGTCATCTTTACGAGGAGAATCTTCAGCCATTGGTTGAATTT
TTTTAATCTTTGGAAAAATGACCATGAATTGGCCATATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATTATTCATGGCATGCTTTAATATTAAATTGCAACTGTTTGTAGTCCAACTTTGGAAAGTGTTTCCATTGTTCAAGGACAGTATT
ATTGCTTCTGGTAGCCTTTTGTTCAGTTCGGAGCGCATCCTTCTCCAGCAGTGTAGAGGAAGGTACATCAACAGGAACAGTGGAGGCTACATCAAGATTGGGGTTGAAATCCGGTGTCCATTTATTCAGATACATTCCTTTCAGATCACTTTCTCTCGATTTGAAGAAGCAAGTAAGGCCCATTTCAAAAGACCAGATCA
TTATCTTGTTTTGCTTCGTAAAACCCTAGAACCTTCGACCACATAAATAATGAGATAACTTTCCTTTGTATGAGATATTGCCGTTTCTTTTAAAGTTAATTTGCCATTGATATGGGTGAAGGCCAGATCACGGTGAATAAGTCCTATCTCTGCAAGAGCGAGAGCCATGTAATGGGAAGAAATTGTTGGTTGAAGCCTTC
GGAATCCCATCCAGCTTTTTCACGAACGGGGAGGTCTGCAGATGCTTTGCTATAATCTTCCCTAAAACGACCACCATGGATCTGAAAGCCATGGCATCAGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCCCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGACTGGAGGCACAACCAGATCGGTCGAGGGCTAAGGAGAGGCGCGCAGGTCTG
ATTTTTTTTATTATCTTGCATCCAATTTTATTCATGAAGAGAACAACAAGTTTAATTAGTCTTAAGGGTCATAAAAAATGTTTCTGTTTTTTCAATAATAAGCTATATATTAAGAATATTTTTGTACAAAGAGATTTAAAAAAAAGCAAAAAACAGAATTATACATACAATGGTATCTGATATCCTCTTCCTAAGAGTTA
AAGGGCAGCATTAAATTCAGAACAAGCATAAGAAATGTTAGAAAATGATCCCCTGTAAATATGAAAATGCAGATAAAAATCCAATCCCTATTCACGGTTGTTTGGAACTTTTAAGATCATTGGTAGACGATGATAAACTCCTTTGTTCTCAATCCCCAAAATTGCCAGTATGCATATGGCAGCAAGGCACACCCATCATC
GTAGgtttaggtgggagggttttctgttactgtggaggtcaaacttcagtccgtccttgttgacggttgtgcctggttgtgccttgctgccatatgctgcaaggcacacccatcatcgtagGTTTAGGTGGGAGGGTTTTCTGTTACTGTCGAGGTCAAACTTCAGTCCGTCCTTGTTGATGGTTGTGCCCTGCATAGTG
TTGTTGGAATATTTTTATGAATATATATCCTTTACTGCACGGAGGATTGGGGTCTGTATCATTTATTTGGCTATGTTGCCATATTCTGTTTTGATTTAACTGGAGTTGTTTGTCATGCTGTTATTGCTGTTGTTGAGGTAGTTTTCCCTCGTCACATCCCAACCCTCATGTCCGGGGTGAAATCTCCTATAGCTGGATAA
GAAATTGTCGCTATGCAATTGGTCCCTTCTACGAAGATTTGTATTTGTGATTTACTGCAAGAAATGACAGTATTGGTATAGTTTCTCAGATTCCCAATTAAGGATTATATGTAAATATTTTTCTGCCAGTTTCTAACCATGTATATCTGTCTACTATGGTATTTTAAGGCTTTCTTTTAGTTAAGGCTTTCGTTTAGTTG
TCAGAAAATATTGCTGTTACTATTCATCTGAATTAAAAAAATACAACAGGCTGGAATAAAGATCTGTTAAGGGAAATATTGGTGTTTCATTCTTAATGATAGGGATTGAGCAG
Intron 6 GTCTGTACTA ... GTGAAGTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A2 | 100 | 0 | 0 | 1 |
| A3 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A4 | 50 | 2 | 2 | 2 |
| A5 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
| A6 | 75.61 | 5 | 19 | 12 |
| A7 | 53.85 | 3 | 4 | 3 |
| A8 | 65 | 14 | 31 | 21 |
| A9 | 62.5 | 6 | 11 | 9 |
| A10 | 63.64 | 2 | 3 | 4 |
>TRINITY_DN46071_c1_g1_i14 from sample A7 / Example spliced isoformATGGAATGGCGGTTTTGTCTTTAGTGAAACCAATGGAGCCATTCCTTCGGCTTCATTCCAAAATGAAGGGGAGAGGATGAGCGAAATGACGCCAAATTTATCTATGCCCAAAGCTCTTCCATGGCTGCTTCCCATCCCAATTTGGCAGGACAATGTGGCAAGCAATTTGAGCATAAAGGCCTTTCCTCGGCCTAATTATC
TGATTACAGTGCCTGTTCATGGCTTGTGTAGAGTTAGATTGAAAAGAGGCCAAAGGCTTCAAACACCCAAAGCTCATAGAAATTCATTTACGGACACAGAAACGGATACTAAAACATTAAAACATAAACCAGACAACCAGAAGGTGGGCAACCCATTCGATGGCTTTCTGGATAATATCAGAGATACATTCAAGGCAGAT
GAGCTTGGCTGGGAGATTTCGGTTATTGTATTTCCAGCAATTGTTTCTTTGGCAGCTGAACCCATTGCATCTTTGGTGGATACTGCATTCATTGGCCAGATAGGTCCAGTGGAGTTGGCAGCTGTTGGAGTGTCGATTTCAATCTTCAATATTGTATCAAAATTGTTTAACATCCCTCTACTCAATGTGACTACTTCATT
TGTGGCGGAAGATGAGGCTACACGAGGTGACAGAGTGAAAGCACTAGGAAATCAGGCTTATAGTGTACAAAGAGATTGTTATGCTAGAGCTAAAACAAGTGACAGTAGCCAGGAAGACAGGGACGAGCTCCAGGGATCATCAGATGATGGAAATAACAAGTTGCAGTTACCTGCAGTTTCAACTGCGTTAGTTATAGCAG
CTGGTCTTGGGGTTGTAGAAGCTGGTGCCTTAGTTCTTGGAGCAGAGTACTTTCTGAATATCATGGGTGTGCCTGCAGAGTTGGAAGCATAATGAATGCTGCAATGGATCCCATTTTTATGTTCACTCTTGGCTTTGGTGTAAGCGGTGCAGCTATTACTACTGTTGTATCTGAATATTTCATTGCCGTTGTGCTTCTTT
GGAACTTGAACAAGCAAGTGATTCTCCTACCACCAAAGATGGAAGAACTACGGTTTGATCGGTACTTGAAATCTGGTGGTCTTTTACTTGGAAGGACTGTAGCTGTGCTTGTTACCTTGACTCTGGGCACATCAATGGCTGCTCGACAGGGTTCCATTCCTATGGCTGCTCATCAGATTTGCCTTCAAGTTTGGCTGGCT
GTTTCTCTCCTTACAGATTCTTTAGCGCTTGCAGGCCAGGCTCTAATAGCAGATGCGGTTGCCAAAAGAGACTACAAAAAGGCAAAAAAGGTTGCATTTCGTGTCCTACAGATAGGACTTGGCTGTGGACTTGCTTTAGCCGTGATTCTGTTTGCAGGGTTTGTACCGTTTTCAAAATTGTTCATAAATGATACAACTGT
CTTGGAAATTATGGCTTCTGGAGTCCTGTTTGTTGCTGGCACTCAGCCAATCAATGCTCTTGCATTTGTTTTTGATGGGCTTCACTATGGAGTATCAGACTTTGCATATGCAGCATACTCAATGATAGTCATTGGAACAATATCCTCCGTGTGCTTGGTACTTGCACCAGCTATTTTGGGTCTTTCTGGAGTCTGGGCAG
GTTTGGCACTTTTCATGGGTTTGCGGATGGCAGCCGGGTTTTGGAGGCTAGGTGGTAAAGAAGGCCCTTGGCAGTTCTTGACGCAAGACATGGATGGCAAGGAGTTAGAAGTTGACTAAGTGATTTTTCTGTGTCTTAACAAATGATTCATCTTCGATACTAGGATACTTTGCTATGGTCTTCTCAAAATAAAAAATGAA
TCTGGACAAAGATAACACAGCATTCCTGGTACATTGATACTTTGCAGAACTACATTGATACTTTTCAGAACTTTCATACAAGCAAATTCTATTCATTATGTATTCTAAGATGCCATTCACATTTGATCAAAATCGTAGGATGAATAAAATTAAATGCACCATGTAATAATAATCAACCAAGCTTCATTCAAACATATTTT
TTTGATAGAAAAGGTCTTTGGTTAGTTTTTGGGCATTCATATTCGTTCAAAAGTCACGAGAAGAATATGTATCATGCAATAGTAGTCAAAAAGGGTGCACTCAAAACATAATTTTTGACAGAAGAGGTCCTTGTTTAGTTTGGGAAGACACATTGTTCGATCATAGCAATGTTTATCCGACATGAACATATTTTTGGCTA
AGCTAATTGATAGAGAACTATTACAGGGTGATTGATATGTCTGGTCAGCATCATGCCATTTCTGATGTCCAAGAGTGGAATTCTAATGGCCTTCTTGTACAGGTATAATTCTCATATAAATACGATGAAATAGATTCCCCTTCTCCATGGCTACTAAAATCAAACAAGAGCCACAGCAGTGTCTATGTCCCTGCTGTTTG
TTAATGAATTTGAAAGTGTTATGGAAGGCAATGTATATTTGTCATTTAGCGGATTTGCTGTTTGTTAATGAATTTGAAAGTGTTATGGAAGCCATTGTATATTTTTCATTTAGCGGATTTGACCTAACATTCCATTATAAACGTTTAGTAAGACGATTTCAGAATAGTACAGTTTGCAGATGTTAAAAGCAAGATTGATA
>TRINITY_DN46071_c1_g1_i23 from sample A7 / Example unspliced isoform:GCAAATTATTTTGAAATTGGTAAATCCGCCAACATATAACATAGGTAAATCCGCCATCATTCAATGTTAAGGAACTGGGCCGCTCGTGTACTGCGTTAAAGAAGAGTCCGTCCAACACAGATCAGATCCCTATCCTCTATTGCTTCGTAAAACCCTATAAACTTTAACCACATAGTTCCTTTGTATGAGAGATCGCCTGT
TCTTTTAAAGCCAATTTGCCGTTGATATGGGTGAAGGCCAGACCACGATGAATTGGCCGTTAAGTCCTATCTCTGCAAGAGCGAGAGCCATGTGATGGGAAGAAATTGTTGGTATTGAAACCTTCCGAATTCCATCCAGCTTTTTCACGAACCAGGAGGTCTGGGGATGCTTTACTATAATCTTCCCTAAGACGACGACC
AGGGATCTGAAAGCCGCCATGGCATCGGGGTCTGGAGGGGGGCGAGTTCTCTCCAGCAGGTGGATCCATCGTCAAGACTGGAGGCACAACCAGATCGGGCGAAGACTAAGGAGAGGCGCGCAGAGATACATTCAAGGCAGATGAGCTTGGCTGGGAGATTTCGGTTATTGTATTTCCAGCAATTGTTTCTTTGGCAGCTG
AACCCATTGCATCTTTGGTGGATACTGCATTCATTGGCCAGATAGGTCCAGTGGAGTTGGCAGCTGTTGGAGTGTCGATTTCAATCTTCAATATTGTATCAAAATTGTTTAACATCCCTCTACTCAATGTGACTACTTCATTTGTGGCGGAAGATGAGGCTACACGAGGTGACAGAGTGAAAGCACTAGGAAATCAGGCT
TATAGTGTACAAAGAGATTGTTATGCTAGAGCTAAAACAAGTGACAGTAGCCAGGAAGACAGGGACGAGCTCCAGGGATCATCAGATGATGGAAATAACAAGTTGCAGTTACCTGCAGTTTCAACTGCGTTAGTTATAGCAGCTGGTCTTGGGGTTGTAGAAGCTGGTGCCTTAGTTCTTGGAGCAGAGTACTTTCTGAA
TATCATGGGTGTGCCTGCAGATTCACCAATGCATCTTCCAGCAGAGCAATACCTTTCTTTAAGAGCCTTTGGTGCTCCAGCTGCTGTGGTTTCTCTTGCAGTGCAAGGTGTTTTCCGTGGGTTCAAGGACACTAAGACACCGTTGTATGCAACAGGAGTTGGAAGCATAATGAATGCTGCAATGGATCCCATTTTTATGT
TCACTCTTGGCTTTGGTGTAAGCGGTGCAGCTATTACTACTGTTGTATCTGAATATTTCATTGCCGTTGTGCTTCTTTGGAACTTGAACAAGCAAGTGATTCTCCTACCACCAAAGATGGAAGAACTACGGTTTGATCGGTACTTGAAATCTGGTGGTCTTTTACTTGGAAGGACTGTAGCTGTGCTTGTTACCTTGACT
CTGGGCACATCAATGGCTGCTCGACAGGGTTCCATTCCTATGGCTGCTCATCAGATTTGCCTTCAAGTTTGGCTGGCTGTTTCTCTCCTTACAGATTCTTTAGCGCTTGCAGGCCAGGCTCTAATAGCAGATGCGGTTGCCAAAAGAGACTACAAAAAGGCAAAAAAGGTTGCATTTCGTGTCCTACAGATAGGACTTGG
CTGTGGACTTGCTTTAGCCGTGATTCTGTTTGCAGGGTTTGTACCGTTTTCAAAATTGTTCATAAATGATACAACTGTCTTGGAAATTATGGCTTCTGGAGTCCTGTTTGTTGCTGGCACTCAGCCAATCAATGCTCTTGCATTTGTTTTTGATGGGCTTCACTATGGAGTATCAGACTTTGCATATGCAGCATACTCAA
TGATAGTCATTGGAACAATATCCTCCGTGTGCTTGGTACTTGCACCAGCTATTTTGGGTCTTTCTGGAGTCTGGGCAGGTTTGGCACTTTTCATGGGTTTGCGGATGGCAGCCGGGTTTTGGAGGCTAGGTGGTAAAGAAGGCCCTTGGCAGTTCTTGACGCAAGACATGGATGGCAAGGAGTTAGAAGTTGACTAAGTG
ATTTTTCTGTGTCTTAACAAATGATTCATCTTCGATACTAGGATACTTTGCTATGGTCTTCTCAAAATAAAAAATGAATCTGGACAAAGATAACACAGCATTCCTGGTACATTGATACTTTGCAGAACTACATTGATACTTTTCAGAACTTTCATACAAGCAAATTCTATTCATTATGTATTCTAAGATGCCATTCACAT
TTGATCAAAATCGTAGGATGAATAAAATTAAATGCACCATGTAATAATAATCAACCAAGCTTCATTCAAACATATTTTTTTGATAGAAAAGGTCTTTGGTTAGTTTTTGGGCATTCATATTCGTTCAAAAGTCACGAGAAGAATATGTATCATGCAATAGTAGTCAAAAAGGGTGCACTCAAAACATAATTTTTGACAGA
AGAGGTCCTTGTTTAGTTTGGGAAGACACATTGTTCGATCATAGCAATGTTTATCCGACATGAACATATTTTTGGCTAAGCTAATTGATAGAGAACTATTACAGGGTGATTGATATGTCTGGTCAGCATCATGCCATTTCTGATGTCCAAGAGTGGAATTCTAATGGCCTTCTTGTACAGgtctgtactagatttcaagc
tatcaatacttcaataataggtgaggtgaatgtatcataagctactaatttgcaaatgataaaacttttcactgaaactttggtgaagtcagGTATAATTCTCATATAAATACGATGAAATAGATTCCCCTTCTCCATGGCTACTAAAATCAAACAAGAGCCACAGCAGTGTCTATGTCCCTGCTGTTTGTTAATGAATT
TGAAAGTGTTATGGAAGGCAATGTATATTTGTCATTTAGCGGATTTGCTGTTTGTTAATGAATTTGAAAGTGTTATGGAAGCCATTGTATATTTTTCATTTAGCGGATTTGACCTAACATTCCATTATAAACGTTTAGTAAGACGATTTCAGAATAGTACAGTTTGCAGATGTTAAAAGCAAGATTGATA