sp|Q8RW96|2A5G_ARATH ----> Serine/threonine protein phosphatase 2A 59 kDa regulatory subunit B' gamma isoform

Intron 1 GTAAGTATTG ... GGGCTAAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.32	56	31	9
A2	25.23	27	5.2	13
A3	25.45	41	16	12
A4	21.05	45	14	10
A5	20.75	21	9	2
A6	22.92	190	64	49
A7	22.9	170	53	48
A8	21.14	166	47	42
A9	21.08	131	43	27
A10	20	92	23	23

>TRINITY_DN116318_c0_g3_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCTCCCTATATAAATGATAATTTGAGCTATGTTCAAATATGCATCTGTTGTTGTCAAATCTTTAACACAAATTCTATTCTCAATCCATCCAGATTTCGATCTGAGCACAAATTGTTTGGGTGTGGTGGATTTTCTTGATTATTGACAGGGCATGCTGGCACTGTGCGAATCTAGGGCTTTCTTGGCCGAAAGGAATAGCA
GTTATGATAAAGCAAATACTGGGCAGGCTTCCTCGCAAACAGTCTAAATCTGATCACAACAATAACAGTAGTAGCGATGTAGGAGGAGGTGGGGGTTCTTCAAATGCGATCGTTTATAATCATGGGAATAAATTGGCCCCTGCTTCTGTTTTGTGTAATGGAAGCTCGACATCTTTCAATTACTCCTATGACCCTCTGCC
CTCTTTCAGGGATGTGCCCAGTTCCGACAGAGAGAATTTGCTCATAAAAAAATTGAGCCTATGTTGTACTGTTTTTGATTTCACCGAGCCCTACAAAAATGTGAGAGAGAAGGAAATCAAACGACAAAACCTGCTGGACCTCGTGGATTTCATTACCTCAGGTGGTGGCAGGCTCAATGAAGCAGCAATGGAGGAGATTG
CTAAGATGGTTTCTGCCAATTTGTTCAGGAATCTGCCATCGACATCATCATCATCGCCATCTTTACTTGAAGGCCTTGATCCAGAAGAGGAGGAGACAGCTCTGGAGCCTGCCTGGTCACATCTGCAGTTGGTCTATGATTTCTTTCTCAGGTTTGTAGCATCCACTGAGACTGATGCAAAATTGGCCAAGAAATACATT
GATCATTCATTTGTTCTGAGGTTAATGGATCTTTTTGATTCTGAGGACCCAAGAGAGAGAGAGTGCCTGAAAACAGTTTTGCACCGTATTTATGGGAAATTCATGGTGCACAGGCCCTTCATTCGTAAGGCAATCAACAACATTTTTTACAGATTTATATTTGAGACTGAGAGATATAATGGAATAGCTGAACTGCTAGA
GATTTTGGGTAGTATCATTAGTGGGTTTGCATTGCCATTGAAGGAGGAGCACAAACTTTTTCTTGTCCGAACTCTGATACCATTGCATAAGCCTAAATGTTTGTCTTCATACCATCAACAATTATCCCATTGTATCATACAGTTTGTGGAGAAGGATTTCAAGCTAGCAGACACTGTGATCAGGGGATTGTTAAAATACT
GGCCTATCACAAATAGTCAAAAGGAGGTGCTTTTTCTAGTAGAATTGGAGACAGTTTTGGAAGTCACCCAGGCAGCTGAATTTCAGAGGTGTATGGTACCCTTGTTTCGACAAATTGGGCGCTGCCTGAACAGTTCACATTTCCAGGTAGCTGAGCGTGCTTTGTTCCTGTGGAACAATGATAATATTTTAAATTTGATG
TCACAACACCGATATGCAATATTGCCATTGATTTTCCCTGCTCTGGAGAAAAATATAAGAAACCACTGGAGTCAGCTTGTACACAGTTTGACTTGGAATGTGAGAAAGATGTTGATGGATATGGACCAAGAGCTTTTCCAGGAATGCCAACGTAGGTACCTTGAAGAGGAAACAAAGGCAATACGCATACAAGAAAAACG
CGAAATGACATGGCAGCGTTTGGAAGCTGTTGCTGCTTCAAAAGCTTTGTCTTGCAGGTAAGTTTCTCCTGAGGAGGTCTTTTGGTCGATAACTGCAAACTGAAACAGAGTTTTGAGCTTTGGCTTCGAATTCCTTTTGCACAAATAAATATTAAATTCTTTGCACATATCTGTTATATCATTCTTTTCCCTTGTGAGCT
GGGTTGAAAGGAAGTTGGAAACAGAGAAATGGTTAAGGTATGGGTTCTTCATTATTGGTCAACCACATACTTGCTTTTAAGTATGATGTTACTTTGGTTGGCCTACTGCCTTTCTACCCATATGTTGTAAAGATTGTCAGGATTCTGCCTCTTATTGGCTGGCAGATGTGCGTTGAGTTGTCTCCTTACAAATGCAATGC
ACCGCTGAGAGCCTGCATTTGCCAAGTATGTTTCTGTGAATCTAGCTTGAAGAAAAATAGTATATTAGAAATTCAAAAATTTGGATTGCCAGAACCTTTGGTAACTGGCCATGGTTCTAGCTTCCTTTCCACCCAGAAGTATGATAACCTTTTCTGCCTTATTGCAGAGTGCCATTGATGGGCTTGAATTTAGTACAGGA
AGTTATTGATGTATTTGTTTATATATGGAGAAGTTTAGATGTTTATGTCAAAATTGGA

>TRINITY_DN116318_c0_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCTCCCTATATAAATGATAATTTGAGCTATGTTCAAATATGCATCTGTTGTTGTCAAATCTTTAACACAAATTCTATTCTCAATCCATCCAGATTTCGATCTGAGCACAAATTGTTTGGGTGTGGTGGATTTTCTTGATTATTGACAGGGCATGCTGGCACTGTGCGAATCTAGGGCTTTCTTGGCCGAAAGGAATAGCA
GTTATGATAAAGCAAATACTGGGCAGGCTTCCTCGCAAACAGTCTAAATCTGATCACAACAATAACAGTAGTAGCGATGTAGGAGGAGGTGGGGGTTCTTCAAATGCGATCGTTTATAATCATGGGAATAAATTGGCCCCTGCTTCTGTTTTGTGTAATGGAAGCTCGACATCTTTCAATTACTCCTATGACCCTCTGCC
CTCTTTCAGGGATGTGCCCAGTTCCGACAGAGAGAATTTGCTCATAAAAAAATTGAGCCTATGTTGTACTGTTTTTGATTTCACCGAGCCCTACAAAAATGTGAGAGAGAAGGAAATCAAACGACAAAACCTGCTGGACCTCGTGGATTTCATTACCTCAGGTGGTGGCAGGCTCAATGAAGCAGCAATGGAGGAGATTG
CTAAGATGGTTTCTGCCAATTTGTTCAGGAATCTGCCATCGACATCATCATCATCGCCATCTTTACTTGAAGGCCTTGATCCAGAAGAGGAGGAGACAGCTCTGGAGCCTGCCTGGTCACATCTGCAGTTGGTCTATGATTTCTTTCTCAGGTTTGTAGCATCCACTGAGACTGATGCAAAATTGGCCAAGAAATACATT
GATCATTCATTTGTTCTGAGGTTAATGGATCTTTTTGATTCTGAGGACCCAAGAGAGAGAGAGTGCCTGAAAACAGTTTTGCACCGTATTTATGGGAAATTCATGGTGCACAGGCCCTTCATTCGTAAGGCAATCAACAACATTTTTTACAGATTTATATTTGAGACTGAGAGATATAATGGAATAGCTGAACTGCTAGA
GATTTTGGGTAGTATCATTAGTGGGTTTGCATTGCCATTGAAGGAGGAGCACAAACTTTTTCTTGTCCGAACTCTGATACCATTGCATAAGCCTAAATGTTTGTCTTCATACCATCAACAATTATCCCATTGTATCATACAGTTTGTGGAGAAGGATTTCAAGCTAGCAGACACTGTGATCAGGGGATTGTTAAAATACT
GGCCTATCACAAATAGTCAAAAGGAGGTGCTTTTTCTAGTAGAATTGGAGACAGTTTTGGAAGTCACCCAGGCAGCTGAATTTCAGAGGTGTATGGTACCCTTGTTTCGACAAATTGGGCGCTGCCTGAACAGTTCACATTTCCAGGTAGCTGAGCGTGCTTTGTTCCTGTGGAACAATGATAATATTTTAAATTTGATG
TCACAACACCGATATGCAATATTGCCATTGATTTTCCCTGCTCTGGAGAAAAATATAAGAAACCACTGGAGTCAGCTTGTACACAGTTTGACTTGGAATGTGAGAAAGATGTTGATGGATATGGACCAAGAGCTTTTCCAGGAATGCCAACGTAGGTACCTTGAAGAGGAAACAAAGGCAATACGCATACAAGAAAAACG
CGAAATGACATGGCAGCGTTTGGAAGCTGTTGCTGCTTCAAAAGCTgtaagtattgaactagtgcctgtagcacatctaaggggtagcaattctggtctgaaagcttcatctgttagttcaccatttgtaatattattatattaatcaatccttgggcaggaaactgaagtagttggaggcatgtcacttttgtttcgac
ctcttcctttccaagtgtattgcaacattttatgactgagaatgggctaaaagTTGTCTTGCAGGTAAGTTTCTCCTGAGGAGGTCTTTTGGTCGATAACTGCAAACTGAAACAGAGTTTTGAGCTTTGGCTTCGAATTCCTTTTGCACAAATAAATATTAAATTCTTTGCACATATCTGTTATATCATTCTTTTCCCTT
GTGAGCTGGGTTGAAAGGAAGTTGGAAACAGAGAAATGGTTAAGGTATGGGTTCTTCATTATTGGTCAACCACATACTTGCTTTTAAGTATGATGTTACTTTGGTTGGCCTACTGCCTTTCTACCCATATGTTGTAAAGATTGTCAGGATTCTGCCTCTTATTGGCTGGCAGATGTGCGTTGAGTTGTCTCCTTACAAAT
GCAATGCACCGCTGAGAGCCTGCATTTGCCAAGTATGTTTCTGTGAATCTAGCTTGAAGAAAAATAGTATATTAGAAATTCAAAAATTTGGATTGCCAGAACCTTTGGTAACTGGCCATGGTTCTAGCTTCCTTTCCACCCAGAAGTATGATAACCTTTTCTGCCTTATTGCAGAGTGCCATTGATGGGCTTGAATTTAG
TACAGGAAGTTATTGATGTATTTGTTTATATATGGAGAAGTTTAGATGTTTATGTCAAAATTGGA

Intron 2 GTAAGTATTG ... TGTCTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	29.48	61	31	20
A2	25.23	30	5.3	15
A3	25.81	46	16	16
A4	22.83	49	14	15
A5	22.58	24	9	5
A6	24.56	215	64	76
A7	26.27	188	53	81
A8	23.79	181	47	66
A9	23.29	140	43	42
A10	24.32	112	23	49

>TRINITY_DN116318_c0_g3_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

CCTCCCTATATAAATGATAATTTGAGCTATGTTCAAATATGCATCTGTTGTTGTCAAATCTTTAACACAAATTCTATTCTCAATCCATCCAGATTTCGATCTGAGCACAAATTGTTTGGGTGTGGTGGATTTTCTTGATTATTGACAGGGCATGCTGGCACTGTGCGAATCTAGGGCTTTCTTGGCCGAAAGGAATAGCA
GTTATGATAAAGCAAATACTGGGCAGGCTTCCTCGCAAACAGTCTAAATCTGATCACAACAATAACAGTAGTAGCGATGTAGGAGGAGGTGGGGGTTCTTCAAATGCGATCGTTTATAATCATGGGAATAAATTGGCCCCTGCTTCTGTTTTGTGTAATGGAAGCTCGACATCTTTCAATTACTCCTATGACCCTCTGCC
CTCTTTCAGGGATGTGCCCAGTTCCGACAGAGAGAATTTGCTCATAAAAAAATTGAGCCTATGTTGTACTGTTTTTGATTTCACCGAGCCCTACAAAAATGTGAGAGAGAAGGAAATCAAACGACAAAACCTGCTGGACCTCGTGGATTTCATTACCTCAGGTGGTGGCAGGCTCAATGAAGCAGCAATGGAGGAGATTG
CTAAGATGGTTTCTGCCAATTTGTTCAGGAATCTGCCATCGACATCATCATCATCGCCATCTTTACTTGAAGGCCTTGATCCAGAAGAGGAGGAGACAGCTCTGGAGCCTGCCTGGTCACATCTGCAGTTGGTCTATGATTTCTTTCTCAGGTTTGTAGCATCCACTGAGACTGATGCAAAATTGGCCAAGAAATACATT
GATCATTCATTTGTTCTGAGGTTAATGGATCTTTTTGATTCTGAGGACCCAAGAGAGAGAGAGTGCCTGAAAACAGTTTTGCACCGTATTTATGGGAAATTCATGGTGCACAGGCCCTTCATTCGTAAGGCAATCAACAACATTTTTTACAGATTTATATTTGAGACTGAGAGATATAATGGAATAGCTGAACTGCTAGA
GATTTTGGGTAGTATCATTAGTGGGTTTGCATTGCCATTGAAGGAGGAGCACAAACTTTTTCTTGTCCGAACTCTGATACCATTGCATAAGCCTAAATGTTTGTCTTCATACCATCAACAATTATCCCATTGTATCATACAGTTTGTGGAGAAGGATTTCAAGCTAGCAGACACTGTGATCAGGGGATTGTTAAAATACT
GGCCTATCACAAATAGTCAAAAGGAGGTGCTTTTTCTAGTAGAATTGGAGACAGTTTTGGAAGTCACCCAGGCAGCTGAATTTCAGAGGTGTATGGTACCCTTGTTTCGACAAATTGGGCGCTGCCTGAACAGTTCACATTTCCAGGTAGCTGAGCGTGCTTTGTTCCTGTGGAACAATGATAATATTTTAAATTTGATG
TCACAACACCGATATGCAATATTGCCATTGATTTTCCCTGCTCTGGAGAAAAATATAAGAAACCACTGGAGTCAGCTTGTACACAGTTTGACTTGGAATGTGAGAAAGATGTTGATGGATATGGACCAAGAGCTTTTCCAGGAATGCCAACGTAGGTACCTTGAAGAGGAAACAAAGGCAATACGCATACAAGAAAAACG
CGAAATGACATGGCAGCGTTTGGAAGCTGTTGCTGCTTCAAAAGCTGTAAGTTTCTCCTGAGGAGGTCTTTTGGTCGATAACTGCAAACTGAAACAGAGTTTTGAGCTTTGGCTTCGAATTCCTTTTGCACAAATAAATATTAAATTCTTTGCACATATCTGTTATATCATTCTTTTCCCTTGTGAGCTGGGTTGAAAGG
AAGTTGGAAACAGAGAAATGGTTAAGGTATGGGTTCTTCATTATTGGTCAACCACATACTTGCTTTTAAGTATGATGTTACTTTGGTTGGCCTACTGCCTTTCTACCCATATGTTGTAAAGATTGTCAGGATTCTGCCTCTTATTGGCTGGCAGATGTGCGTTGAGTTGTCTCCTTACAAATGCAATGCACCGCTGAGAG
CCTGCATTTGCCAAGTATGTTTCTGTGAATCTAGCTTGAAGAAAAATAGTATATTAGAAATTCAAAAATTTGGATTGCCAGAACCTTTGGTAACTGGCCATGGTTCTAGCTTCCTTTCCACCCAGAAGTATGATAACCTTTTCTGCCTTATTGCAGAGTGCCATTGATGGGCTTGAATTTAGTACAGGAAGTTATTGATG
TATTTGTTTATATATGGAGAAGTTTAGATGTTTATGTCAAAATTGGA

>TRINITY_DN116318_c0_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCTCCCTATATAAATGATAATTTGAGCTATGTTCAAATATGCATCTGTTGTTGTCAAATCTTTAACACAAATTCTATTCTCAATCCATCCAGATTTCGATCTGAGCACAAATTGTTTGGGTGTGGTGGATTTTCTTGATTATTGACAGGGCATGCTGGCACTGTGCGAATCTAGGGCTTTCTTGGCCGAAAGGAATAGCA
GTTATGATAAAGCAAATACTGGGCAGGCTTCCTCGCAAACAGTCTAAATCTGATCACAACAATAACAGTAGTAGCGATGTAGGAGGAGGTGGGGGTTCTTCAAATGCGATCGTTTATAATCATGGGAATAAATTGGCCCCTGCTTCTGTTTTGTGTAATGGAAGCTCGACATCTTTCAATTACTCCTATGACCCTCTGCC
CTCTTTCAGGGATGTGCCCAGTTCCGACAGAGAGAATTTGCTCATAAAAAAATTGAGCCTATGTTGTACTGTTTTTGATTTCACCGAGCCCTACAAAAATGTGAGAGAGAAGGAAATCAAACGACAAAACCTGCTGGACCTCGTGGATTTCATTACCTCAGGTGGTGGCAGGCTCAATGAAGCAGCAATGGAGGAGATTG
CTAAGATGGTTTCTGCCAATTTGTTCAGGAATCTGCCATCGACATCATCATCATCGCCATCTTTACTTGAAGGCCTTGATCCAGAAGAGGAGGAGACAGCTCTGGAGCCTGCCTGGTCACATCTGCAGTTGGTCTATGATTTCTTTCTCAGGTTTGTAGCATCCACTGAGACTGATGCAAAATTGGCCAAGAAATACATT
GATCATTCATTTGTTCTGAGGTTAATGGATCTTTTTGATTCTGAGGACCCAAGAGAGAGAGAGTGCCTGAAAACAGTTTTGCACCGTATTTATGGGAAATTCATGGTGCACAGGCCCTTCATTCGTAAGGCAATCAACAACATTTTTTACAGATTTATATTTGAGACTGAGAGATATAATGGAATAGCTGAACTGCTAGA
GATTTTGGGTAGTATCATTAGTGGGTTTGCATTGCCATTGAAGGAGGAGCACAAACTTTTTCTTGTCCGAACTCTGATACCATTGCATAAGCCTAAATGTTTGTCTTCATACCATCAACAATTATCCCATTGTATCATACAGTTTGTGGAGAAGGATTTCAAGCTAGCAGACACTGTGATCAGGGGATTGTTAAAATACT
GGCCTATCACAAATAGTCAAAAGGAGGTGCTTTTTCTAGTAGAATTGGAGACAGTTTTGGAAGTCACCCAGGCAGCTGAATTTCAGAGGTGTATGGTACCCTTGTTTCGACAAATTGGGCGCTGCCTGAACAGTTCACATTTCCAGGTAGCTGAGCGTGCTTTGTTCCTGTGGAACAATGATAATATTTTAAATTTGATG
TCACAACACCGATATGCAATATTGCCATTGATTTTCCCTGCTCTGGAGAAAAATATAAGAAACCACTGGAGTCAGCTTGTACACAGTTTGACTTGGAATGTGAGAAAGATGTTGATGGATATGGACCAAGAGCTTTTCCAGGAATGCCAACGTAGGTACCTTGAAGAGGAAACAAAGGCAATACGCATACAAGAAAAACG
CGAAATGACATGGCAGCGTTTGGAAGCTGTTGCTGCTTCAAAAGCTgtaagtattgaactagtgcctgtagcacatctaaggggtagcaattctggtctgaaagcttcatctgttagttcaccatttgtaatattattatattaatcaatccttgggcaggaaactgaagtagttggaggcatgtcacttttgtttcgac
ctcttcctttccaagtgtattgcaacattttatgactgagaatgggctaaaagttgtcttgcagGTAAGTTTCTCCTGAGGAGGTCTTTTGGTCGATAACTGCAAACTGAAACAGAGTTTTGAGCTTTGGCTTCGAATTCCTTTTGCACAAATAAATATTAAATTCTTTGCACATATCTGTTATATCATTCTTTTCCCTT
GTGAGCTGGGTTGAAAGGAAGTTGGAAACAGAGAAATGGTTAAGGTATGGGTTCTTCATTATTGGTCAACCACATACTTGCTTTTAAGTATGATGTTACTTTGGTTGGCCTACTGCCTTTCTACCCATATGTTGTAAAGATTGTCAGGATTCTGCCTCTTATTGGCTGGCAGATGTGCGTTGAGTTGTCTCCTTACAAAT
GCAATGCACCGCTGAGAGCCTGCATTTGCCAAGTATGTTTCTGTGAATCTAGCTTGAAGAAAAATAGTATATTAGAAATTCAAAAATTTGGATTGCCAGAACCTTTGGTAACTGGCCATGGTTCTAGCTTCCTTTCCACCCAGAAGTATGATAACCTTTTCTGCCTTATTGCAGAGTGCCATTGATGGGCTTGAATTTAG
TACAGGAAGTTATTGATGTATTTGTTTATATATGGAGAAGTTTAGATGTTTATGTCAAAATTGGA