sp|Q8GUP3|PDS5C_ARATH ----> Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog C
Intron 1 GTTGAAGACA ... GCATGTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 55.47 | 28.8 | 36.8 | 32.8 |
| A2 | 68.04 | 13 | 32.8 | 25.2 |
| A3 | 58.29 | 15.8 | 15.8 | 27.4 |
| A4 | 63.23 | 17.4 | 33 | 23 |
| A5 | 44.23 | 13.6 | 6.4 | 15.2 |
| A6 | 56.28 | 32.4 | 49 | 31.2 |
| A7 | 42.52 | 36.8 | 23.6 | 28.8 |
| A8 | 41.33 | 31.2 | 20.6 | 18.6 |
| A9 | 48.04 | 31.6 | 28 | 27.4 |
| A10 | 53.62 | 16 | 23.8 | 7.8 |
>TRINITY_DN42534_c0_g2_i4 from sample A8 / Example spliced isoformAATCATGTCAGACATAGTAGAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTT
ATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGC
TTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAA
AGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTG
ATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACA
>TRINITY_DN42534_c0_g2_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGATGTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTA
GGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTTGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGGAACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGCCTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGT
GGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGGGGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTCTCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATAT
GCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCAGGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGAGAACACTAGAAGTTCTCCTCCAGAAAAGTTCTCTGCGAAGTCCAAATAACACAAATCAATGTCTATTTGGAAGCTGTA
GTGGTCAAATGTCTGGGCATATGGCTTTCAAGGATTCAGTTATGTTTGTGGAGAATTCTGGCACTGTGTCAGTCTCTGATATGACTGTTCCTATGTGTCAGCCAACACGAAATACTTTAAATGCTTTGCGAGAGAGGAGTCTTCATGATATGGATTATAGGTTTTCTTCTACCACACAGTCTATAAAGGTGAATCTTTGC
AGAAGTACATCTACTAATCGCAGAAGGAATGGTTGTGGTGTTAATTCAGAGAGTGGTCCAGCCATTCCATCATTTTTCTTGACATTTGCAGCTGCACCTAGCTTTTTCCTTGGCTTGCATCTAAAGATGTTGTTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAA
GGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAATGGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTGCTCCTAAGTGCCCAACTGCTAAGCATTCAAAGGTAGATGTTGATGCTTCCCCTATAAGCACTGCCGATGGCTGGGTAA
TGTCATCTCCACGATCCTCATATTCTGAGCTTAATGTGACTGGCAATGCTGCAGGTCTCCCAGCAAAGAAAGATAGCTGTGATCATTTTATGCATGGAAATGCCCTTAAACTTCGGAGATGCTTGATGGATAGAGGCTCATGGAAGTTTGCCAGGAGTTCAAGGCCTCATTCTGTTCAGGAATTAAATTCTTCAGTATTT
GACTCTGAAGCAGAGGGTTGTTCTCACATAGCTATGGATGGTAGAGAGGAAGCCCCTGCAGGGCAATTCATCACCGGTTGTGTTAATTCTACACAAGTTGAGCCATATACAAAACAAGACAGGCCAGCTGTTTATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTC
ACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACATATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGAGAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTT
CACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTGCTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACA
AATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAAGATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCAGTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCG
CCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGG
CTGCCTTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAGCCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGGAAAGGCATGGCTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCA
CAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTAC
CAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGA
TGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACAT
GCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGT
AAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTCAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAA
ATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAAT
ACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGG
AGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGT
TTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGgttgaagacaaggttcatgcaacttaagatttaaaggatttgatccaaagtatttgatgtttcttaagaatacaagggattgctgtggtgactccctctaccatgtcatcatgagatgctaaaagctgtttcatttgcatgtgtagGCAAAATGTAATGATCT
GGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCT
ATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAAT
ATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGC
TTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAA
TTATTGCACA
Intron 2 GTTAAAGACA ... GCATGTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 80.65 | 8 | 29.3 | 38 |
| A2 | 84.44 | 5 | 25 | 30 |
| A3 | 86.84 | 3 | 9.3 | 31 |
| A4 | 90.48 | 3 | 30 | 27 |
| A5 | 60.65 | 8 | 6.7 | 18 |
| A6 | 78.26 | 10 | 38 | 35 |
| A7 | 59.83 | 16 | 16.3 | 32 |
| A8 | 69.57 | 8 | 16.7 | 21 |
| A9 | 71.04 | 10 | 20.3 | 29.7 |
| A10 | 100 | 0 | 19.7 | 9 |
>TRINITY_DN42534_c0_g2_i4 from sample A8 / Example spliced isoformAATCATGTCAGACATAGTAGAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTT
ATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGC
TTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAA
AGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTG
ATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACA
>TRINITY_DN42534_c0_g2_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGATGTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTA
GGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTTGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGGAACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGCCTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGT
GGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGGGGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTCTCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATAT
GCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCAGGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGAGAACACTAGAAGTTCTCCTCCAGAAAAGTTCTCTGCGAAGTCCAAATAACACAAATCAATGTCTATTTGGAAGCTGTA
GTGGTCAAATGTCTGGGCATATGGCTTTCAAGGATTCAGTTATGTTTGTGGAGAATTCTGGCACTGTGTCAGTCTCTGATATGACTGTTCCTATGTGTCAGCCAACACGAAATACTTTAAATGCTTTGCGAGAGAGGAGTCTTCATGATATGGATTATAGGTTTTCTTCTACCACACAGTCTATAAAGGTGAATCTTTGC
AGAAGTACATCTACTAATCGCAGAAGGAATGGTTGTGGTGTTAATTCAGAGAGTGGTCCAGCCATTCCATCATTTTTCTTGACATTTGCAGCTGCACCTAGCTTTTTCCTTGGCTTGCATCTAAAGATGTTGTTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAA
GGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAATGGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTGCTCCTAAGTGCCCAACTGCTAAGCATTCAAAGGTAGATGTTGATGCTTCCCCTATAAGCACTGCCGATGGCTGGGTAA
TGTCATCTCCACGATCCTCATATTCTGAGCTTAATGTGACTGGCAATGCTGCAGGTCTCCCAGCAAAGAAAGATAGCTGTGATCATTTTATGCATGGAAATGCCCTTAAACTTCGGAGATGCTTGATGGATAGAGGCTCATGGAAGTTTGCCAGGAGTTCAAGGCCTCATTCTGTTCAGGAATTAAATTCTTCAGTATTT
GACTCTGAAGCAGAGGGTTGTTCTCACATAGCTATGGATGGTAGAGAGGAAGCCCCTGCAGGGCAATTCATCACCGGTTGTGTTAATTCTACACAAGTTGAGCCATATACAAAACAAGACAGGCCAGCTGTTTATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTC
ACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACATATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGAGAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTT
CACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTGCTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACA
AATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAAGATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCAGTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCG
CCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGG
CTGCCTTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAGCCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGGAAAGGCATGGCTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCA
CAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTAC
CAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGA
TGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACAT
GCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGT
AAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTCAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAA
ATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAAT
ACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGG
AGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGTTGCATTCTTTTGTCCTGTGTTTTC
CATTCTTGTTTAAATAGTAGTGCTGCCTACGTTTATTTCTTATGATGCGTGTTTATGGTCGAGGAGGATGATCACCTGATGTGGAACCCAGCACTTATTTTGCATAGTTGATGTGTAACAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGgttaaagacagaagac
aaggttcatgcaacttaagatttaaaggatttgatccaaagtatttgatgtttcttaagaatacaagggattgctgtggtgactccctctaccatgtcatcatgagatgctaaaagctgtttcatttgcatgtgtagGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGT
GGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGC
AGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATT
AATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTC
ACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACA
Intron 3 GTACACTTCA ... CCAATGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 34.02 | 50 | 33 | 18.6 |
| A2 | 49.39 | 30 | 40 | 18.6 |
| A3 | 57.81 | 24 | 33 | 32.8 |
| A4 | 46.84 | 30 | 37 | 15.9 |
| A5 | 39.29 | 17 | 12 | 10 |
| A6 | 59.33 | 120 | 185 | 165.1 |
| A7 | 50.45 | 86.7 | 92 | 84.4 |
| A8 | 58.72 | 127 | 175 | 186.3 |
| A9 | 52.4 | 109 | 135 | 105 |
| A10 | 56.57 | 27 | 35 | 35.3 |
>TRINITY_DN116928_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGG
GAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTA
TGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGAT
TTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGT
AGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGG
TTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTG
CCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGA
GCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATC
AAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTAAAGACAAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGC
TAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCT
CTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTT
TGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAG
AAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACATACTAATCTTTGGAAAAGGGATTTGCATTCAGACATGTCCTTTTATACAGTTTAATAGGCGTTTTAGTTATTTAAT
AGGTTATACAATTTAATAAAGGTTTTAGTTATTTAATAGGTTGCTGTGCACATCTCGTTTGAAGTTTATTTTGATTTTTTTGCATGATATAAGAAAGTCATCATTTGCTTTTGCAAATATTCTTTCTATATATATTACTCTTTGAAGAGAGATCTATACAGTCCAGCAGACATATCTTAGACATATCTTATTGCAATTGT
TTGGTAGAACAAACACTAAAACTTCGCAAAATTTGTCATCCTATCAACCATAGAGTCGTTCATACTTCTAAGCGCTGTAGCTTTGGAACAGAGAGAAGTGGATATCATTGTGGTTTTCTGATCATTACAGAACACACAAGCTGAAACGAAATAGATCAATAGAGGGTTGAAGGACC
>TRINITY_DN116928_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTATAACGAAAAAAGAAAAAAAAAAACCGTGAATGCGTAAGTTATGGAACCCCGCTATTCACATAAATATTTTTGCCAAAAATATATTATCATAATTTCTCGTCCACAAACCCTAGCAGCAGTGGTTAACTTGGTCTACAAGACAAGACCAGCTTTAGAGAGAATTTATTGGATTAGGGTTTCTATTATAAATGGAGGAC
GTTAAGCCGTCGATCTGGGATCGGACGGTCTAGGTAGAGCGGCGAAGTCTTTGATCATTTTGGCTTTAATTTGGGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGTAAGCCATTAAACCCTAGCCTGGTTGTTGAATCATGAAACTCTTGTAAATCTAT
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GATCCTCGAGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAATTCTCTTCGAAAATTTTTAAGGTATGCAGAAATTTTCAGTTCTAGTGTTCCAACCCTGGCAGGATGAATAATGGATGCTTTTAATAGTCTCGTCTCCCTGAGGCTTTTTGTAAATTTGCGTGTAATTT
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AATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGA
CGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCGGTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTTTGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGAC
TTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTCGCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACATAGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAACACCCTTGTTG
TCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAATGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGTTGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATTGTCTGAGTGA
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GTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAACGAGAAATTCAAGCTTCAGCTTCTTCCAGGTGAAACCTCTGGCCATATCAAAATATTGAAAAATTCGGGCCGTCGAAAAGTTGGAGGAAGGTTTTCAAATGGTATTCAATCAGTGCCTGAAACTCCC
TACCCCGAAGAATTCAATAATGAAATTCACTTGTCTACTGTTGATAATGATGCATTTACACATACAACTGAAAATGGATCCTTTGAGAAGTATACTTCTACAGTATTGGATGTGCCTTGTAGGCCTTCCGGGAATGGAAGGGAATGCAGTGGCCATAAAGATGATGATAGCTTGGTACCCCTCAAGGATATTGATTCCAG
TGTTAAAAAAGTAACTTTTCACCCAAGTTCACATAAGATAAAATCTGGAAATGTCTATGTTAGGAGACGGTACCGCAAAACAGGTTCTGGCTTAAAGGCCACAGATGAGAGTGTTGTTAAGATAGGTGAGGGGAAGGTGAATGTGTTTCAGAAGTTGATGGAAGCTGGAACATCTTGTTCATCCAAGAAAAAGCTTGAAC
AGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAGTCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTATTCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATCTCTTGAATGT
AAAAAAGAGTTAGATAGAGCTATTGTTCCTCTGCCCTTTACCTGCAACACAATCTCTATCAATAAGGACTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGAT
GTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTTGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGGAACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGC
CTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGTGGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGGGGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTC
TCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCAGGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGAGAACACTAGA
AGTTCTCCTCCAGAAAAGTTCTCTGCGAAGTCCAAATAACACAAATCAATGTCTATTTGGAAGCTGTAGTGGTCAAATGTCTGGGCATATGGCTTTCAAGGATTCAGTTATGTTTGTGGAGAATTCTGGCACTGTGTCAGTCTCTGATATGACTGTTCCTATGTGTCAGCCAACACGAAATACTTTAAATGCTTTGCGAG
AGAGGAGTCTTCATGATATGGATTATAGGTTTTCTTCTACCACACAGTCTATAAAGGTGAATCTTTGCAGAAGTACATCTACTAATCGCAGAAGGAATGGTTGTGGTGTTAATTCTGAGAGTGGTCCAGCCATTCCATCATTTTTCTTGACATTTGCAGCTGCACCTAGCTTTTTCCTTGGCTTGCATCTAAAGATGTTG
TTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAAGGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAATGGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTGCTCCTAAGTG
CCCAACTGTTAAGCATTCAAAGGTAGATGTTGATGCTTCCCCTATAAGCACTGCCGATGGCTGGGTAATGTCATCTCCACGATCCTCATATTCTGAGCTTAATGTGACTGGCAATGCTGCAGGTCTCCCAGCAAAGAAAGATAGCTGTGATCATTTTATGCATGGAAATGCCCTTAAACTTCGGAGATGCTTGATGGATA
GAGGCTCATGGAAGTTTGCCAGGAGTTCAAGGCCTCATTCTGTTCAGGAATTAAATTCTTCAGTATTTGACTCTGAAGCAGAGGGTTGTTCTCACATAGCTATGGATGGTAGAGAGGAAGCCCCTGCAGGGCAATTCATCACCGGTTGTGTTAATTCTACACAAGTTGAGCCATATACAAAACAAGACAGGCCAGCTGTT
TATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTCACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACA
TATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTG
CTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAAGATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCA
GTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCGCCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGA
TGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGGCTGCCTTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAGCCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGGAAAGGCATGG
CTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCT
CACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGC
AGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTT
CTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATC
CATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGG
GCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTA
AAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTG
AAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGgtacacttcacaaatagttgagcaggaattaactctccattgaaataagtttttttttgctcaagtcaatattcttt
tttaatctactaatgcctttttggcaaccaatgacagATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGTTGCATTCTTTTGTCCTGTGTTTTCCATTCTTGTTTAAATAGT
AGTGCTGCCTACGTTTATTTCTTATGATGCGTGTTTATGGTCGAGGAGGATGATCACCTGATGTGGAACCCAGCACTTATTTTGCATAGTTGATGTGTAACAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTGAAGACAAGGTTCATGCAACTTAAGATTTAA
AGGATTTGATCCAAAGTATTTGATGTTTCTTAAGAATACAAGGGATTGCTGTGGTGACTCCCTCTACCATGTCATCATGAGATGCTAAAAGCTGTTTCATTTGCATGTGTAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAAT
TGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTT
TACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTA
CCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAAC
AAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACATACTAATCTTTGGAAAAGGGATTTGCATTCAGACATGTCCTTTTATACAGTTTAATAGGCG
TTTTAGTTATTTAATAGGTTATACAATTTAATAAAGGTTTTAGTTATTTAATAGGTTGCTGTGCACATCTCGTTTGAAGTTTATTTTGATTTTTTTGCATGATATAAGAAAGTCATCATTTGCTTTTGCAAATATTCTTTCTATATATATTACTCTTTGAAGAGAGATCTATACAGTCCAGCAGACATATCTTAGACATA
TCTTATTGCAATTGTTTGGTAGAACAAACACTAAAACTTCGCAAAATTTGTCATCCTATCAACCATAGAGTCGTTCATACTTCTAAGCGCTGTAGCTTTGGAACAGAGAGAAGTGGATATCATTGTGGTTTTCTGATCATTACAGAACACACAAGCTGAAACGAAATAGATCAATAGAGGGTTGAAGGACC
Intron 4 GTTGCATTCT ... TGTGTAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 27.25 | 49.8 | 23 | 14.3 |
| A2 | 24.53 | 32.4 | 12.6 | 8.4 |
| A3 | 24.8 | 36 | 19 | 4.8 |
| A4 | 38.79 | 28.8 | 17 | 19.5 |
| A5 | 34.87 | 13 | 5 | 8.9 |
| A6 | 24.71 | 57.1 | 21 | 16.5 |
| A7 | 22.76 | 47.6 | 16 | 12 |
| A8 | 25.81 | 59.6 | 29 | 12.5 |
| A9 | 21.1 | 44.2 | 16 | 7.7 |
| A10 | 23.36 | 34.4 | 9 | 12 |
>TRINITY_DN116928_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoformCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGG
GAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTA
TGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGAT
TTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGT
AGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGG
TTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTG
CCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGA
GCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATC
AAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTAAAGACAAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGC
TAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCT
CTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTT
TGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAG
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AGGTTATACAATTTAATAAAGGTTTTAGTTATTTAATAGGTTGCTGTGCACATCTCGTTTGAAGTTTATTTTGATTTTTTTGCATGATATAAGAAAGTCATCATTTGCTTTTGCAAATATTCTTTCTATATATATTACTCTTTGAAGAGAGATCTATACAGTCCAGCAGACATATCTTAGACATATCTTATTGCAATTGT
TTGGTAGAACAAACACTAAAACTTCGCAAAATTTGTCATCCTATCAACCATAGAGTCGTTCATACTTCTAAGCGCTGTAGCTTTGGAACAGAGAGAAGTGGATATCATTGTGGTTTTCTGATCATTACAGAACACACAAGCTGAAACGAAATAGATCAATAGAGGGTTGAAGGACC
>TRINITY_DN116928_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTATAACGAAAAAAGAAAAAAAAAAACCGTGAATGCGTAAGTTATGGAACCCCGCTATTCACATAAATATTTTTGCCAAAAATATATTATCATAATTTCTCGTCCACAAACCCTAGCAGCAGTGGTTAACTTGGTCTACAAGACAAGACCAGCTTTAGAGAGAATTTATTGGATTAGGGTTTCTATTATAAATGGAGGAC
GTTAAGCCGTCGATCTGGGATCGGACGGTCTAGGTAGAGCGGCGAAGTCTTTGATCATTTTGGCTTTAATTTGGGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGTAAGCCATTAAACCCTAGCCTGGTTGTTGAATCATGAAACTCTTGTAAATCTAT
TGATGAAAACCTAATTACCTTGTATGGATCGGTACATGAGAATACGGATTTGAAGGTTCTTGAGTCAAAATTTTGTCCAGGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTCTGCGCGGCTT
GATCCTCGAGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAATTCTCTTCGAAAATTTTTAAGGTATGCAGAAATTTTCAGTTCTAGTGTTCCAACCCTGGCAGGATGAATAATGGATGCTTTTAATAGTCTCGTCTCCCTGAGGCTTTTTGTAAATTTGCGTGTAATTT
TATTTGGCTTTCTTAAATGGATCGGGAGGCGGAATTTCAGCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACACGGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGGAAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAGACGTCCAAGA
ATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAAATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAAACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTCATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTGCTTTGCTAAT
AATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGA
CGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCGGTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTTTGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGAC
TTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTCGCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACATAGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAACACCCTTGTTG
TCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAATGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGTTGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATTGTCTGAGTGA
TTCTGAGAAGACTGGAATAACCACTCCAAAACAGAGTACTGTAAGAGCACTTCGGCCACGGAAGCGGAGACAAAAAGCCAGTGGCACAAAGCGTTATAAGGAAATTGGTTTCAGTGAGGTAGATGCCTTCAACATTTTGGACAGGAGAATCAAGGTTTTCTGGCCACTTGATGATAAGTGGTATTATGGTTCAGTCAAGA
GTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAACGAGAAATTCAAGCTTCAGCTTCTTCCAGGTGAAACCTCTGGCCATATCAAAATATTGAAAAATTCGGGCCGTCGAAAAGTTGGAGGAAGGTTTTCAAATGGTATTCAATCAGTGCCTGAAACTCCC
TACCCCGAAGAATTCAATAATGAAATTCACTTGTCTACTGTTGATAATGATGCATTTACACATACAACTGAAAATGGATCCTTTGAGAAGTATACTTCTACAGTATTGGATGTGCCTTGTAGGCCTTCCGGGAATGGAAGGGAATGCAGTGGCCATAAAGATGATGATAGCTTGGTACCCCTCAAGGATATTGATTCCAG
TGTTAAAAAAGTAACTTTTCACCCAAGTTCACATAAGATAAAATCTGGAAATGTCTATGTTAGGAGACGGTACCGCAAAACAGGTTCTGGCTTAAAGGCCACAGATGAGAGTGTTGTTAAGATAGGTGAGGGGAAGGTGAATGTGTTTCAGAAGTTGATGGAAGCTGGAACATCTTGTTCATCCAAGAAAAAGCTTGAAC
AGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAGTCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTATTCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATCTCTTGAATGT
AAAAAAGAGTTAGATAGAGCTATTGTTCCTCTGCCCTTTACCTGCAACACAATCTCTATCAATAAGGACTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGAT
GTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTTGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGGAACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGC
CTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGTGGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGGGGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTC
TCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCAGGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGAGAACACTAGA
AGTTCTCCTCCAGAAAAGTTCTCTGCGAAGTCCAAATAACACAAATCAATGTCTATTTGGAAGCTGTAGTGGTCAAATGTCTGGGCATATGGCTTTCAAGGATTCAGTTATGTTTGTGGAGAATTCTGGCACTGTGTCAGTCTCTGATATGACTGTTCCTATGTGTCAGCCAACACGAAATACTTTAAATGCTTTGCGAG
AGAGGAGTCTTCATGATATGGATTATAGGTTTTCTTCTACCACACAGTCTATAAAGGTGAATCTTTGCAGAAGTACATCTACTAATCGCAGAAGGAATGGTTGTGGTGTTAATTCTGAGAGTGGTCCAGCCATTCCATCATTTTTCTTGACATTTGCAGCTGCACCTAGCTTTTTCCTTGGCTTGCATCTAAAGATGTTG
TTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAAGGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAATGGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTGCTCCTAAGTG
CCCAACTGTTAAGCATTCAAAGGTAGATGTTGATGCTTCCCCTATAAGCACTGCCGATGGCTGGGTAATGTCATCTCCACGATCCTCATATTCTGAGCTTAATGTGACTGGCAATGCTGCAGGTCTCCCAGCAAAGAAAGATAGCTGTGATCATTTTATGCATGGAAATGCCCTTAAACTTCGGAGATGCTTGATGGATA
GAGGCTCATGGAAGTTTGCCAGGAGTTCAAGGCCTCATTCTGTTCAGGAATTAAATTCTTCAGTATTTGACTCTGAAGCAGAGGGTTGTTCTCACATAGCTATGGATGGTAGAGAGGAAGCCCCTGCAGGGCAATTCATCACCGGTTGTGTTAATTCTACACAAGTTGAGCCATATACAAAACAAGACAGGCCAGCTGTT
TATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTCACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACA
TATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTG
CTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAAGATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCA
GTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCGCCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGA
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CTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCT
CACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGC
AGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTT
CTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATC
CATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGG
GCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTA
AAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTG
AAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGGTACACTTCACAAATAGTTGAGCAGGAATTAACTCTCCATTGAAATAAGTTTTTTTTTGCTCAAGTCAATATTCTTT
TTTAATCTACTAATGCCTTTTTGGCAACCAATGACAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGgttgcattcttttgtcctgtgttttccattcttgtttaaatagt
agtgctgcctacgtttatttcttatgatgcgtgtttatggtcgaggaggatgatcacctgatgtggaacccagcacttattttgcatagttgatgtgtaacagGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTGAAGACAAGGTTCATGCAACTTAAGATTTAA
AGGATTTGATCCAAAGTATTTGATGTTTCTTAAGAATACAAGGGATTGCTGTGGTGACTCCCTCTACCATGTCATCATGAGATGCTAAAAGCTGTTTCATTTGCATGTGTAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAAT
TGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTT
TACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTA
CCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAAC
AAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACATACTAATCTTTGGAAAAGGGATTTGCATTCAGACATGTCCTTTTATACAGTTTAATAGGCG
TTTTAGTTATTTAATAGGTTATACAATTTAATAAAGGTTTTAGTTATTTAATAGGTTGCTGTGCACATCTCGTTTGAAGTTTATTTTGATTTTTTTGCATGATATAAGAAAGTCATCATTTGCTTTTGCAAATATTCTTTCTATATATATTACTCTTTGAAGAGAGATCTATACAGTCCAGCAGACATATCTTAGACATA
TCTTATTGCAATTGTTTGGTAGAACAAACACTAAAACTTCGCAAAATTTGTCATCCTATCAACCATAGAGTCGTTCATACTTCTAAGCGCTGTAGCTTTGGAACAGAGAGAAGTGGATATCATTGTGGTTTTCTGATCATTACAGAACACACAAGCTGAAACGAAATAGATCAATAGAGGGTTGAAGGACC
Intron 5 GTTCATGCAA ... GCATGTGTAG
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>TRINITY_DN108259_c0_g2_i7 from sample A2 / Example spliced isoformCCCGTCCGCTACTATAACGAAAAAAGAAAAAAAAAACCGTGAATGCGTAAGTTATGGAACCCCGCTATTCACATAAATATTTTTGCCAAAAATATATTATCATAATTTCTCGTCCACAAACCCTAGCAGCAGTGGTTAACTTGGTCTACAAGACAAGACCAGCTTTAGAGAGAATTTATTGGATTAGGGTTTCTATTATA
AATGGAGGACGTTAAGCCGTCGATCTGGGATCGGACGGTCTAGGTAGAGCGGCGAAGTCTTTGATCATTTTGGCTTTAATTTGGGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGTAAGCCATTAAACCCTAGCCTGGTTGTTGAATCATGAAACTCTT
GTAAATCTATTGATGAAAACCTAATTACCTTGTATGGATCGGTACATGAGAATACGGATTTGAAGGTTCTTGAGTCAAAATTTTGTCCAGGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTC
TGCGCGGCTTGATCCTCGAGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAATTCTCTTCGAAAATTTTTAAGGTATGCAGAAATTTTCAGTTCTAGTGTTCCAACCCTGGCAGGATGAATAATGGATGCTTTTAATAGTCTCGTCTCCCTGAGGCTTTTTGTAAATTTG
CGTGTAATTTTATTTGGCTTTCTTAAATGGATCGGGAGGCGGAATTTCAGCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACACGGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGGAAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAG
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CTTTGCTAATAATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTAC
GGTTTTCAGACGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCGGTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTTTGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTT
GATGATCGACTTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTCGCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACATAGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAAC
ACCCTTGTTGTCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAATGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGTTGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATT
GTCTGAGTGATTCTGAGAAGACTGGAATAACCACTCCAAAACAGAGTACTGTAAGAGCACTTCGGCCACGGAAGCGGAGACAAAAAGCCAGTGGCACAAAGCGTTATAAGGAAATTGGTTTCAGTGAGGTAGATGCCTTCAACATTTTGGACAGGAGAATCAAGGTTTTCTGGCCACTTGATGATAAGTGGTATTATGGT
TCAGTCAAGAGTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAACGAGAAATTCAAGCTTCAGCTTCTTCCAGGTGAAACCTCTGGCCATATCAAAATATTGAAAAATTCGGGCCGTCGAAAAGTTGGAGGAAGGTTTTCAAATGGTATTCAATCAGTGCC
TGAAACTCCCTACCCCGAAGAATTCAATAATGAAATTCACTTGTCTACTGTTGATAATGATGCATTTACACATACAACTGAAAATGGATCCTTTGAGAAGTATACTTCTACAGTATTGGATGTGCCTTGTAGGCCTTCCGGGAATGGAAGGGAATGCAGTGGCCATAAAGATGATGATAGCTTGGTACCCCTCAAGGATA
TTGATTCCAGTGTTAAAAAAGTAACTTTTCACCCAAGTTCACATAAGATAAAATCTGGAAATGTCTATGTTAGGAGACGGTACCGCAAAACAGGTTCTGGCTTAAAGGCCACAGATGAGAGTGTTGTTAAGATAGGTGAGGGGAAGGTGAATGTGTTTCAGAAGTTGATGGAAGCTGGAACATCTTGTTCATCCAAGAAA
AAGCTTGAACAGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAGTCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTATTCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATC
TCTTGAATGTAAAAAAGAGTTAGATAGAGCTATTGTTCCTCTGCCCTTTACCTGCAACACAATCTCTATCAATAAGGACTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATG
ACCAGGTGATGTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTCGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGGAACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGG
AACTTCTTGCCTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGTGGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGGGGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAA
GTTTATGTTCTCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCAGGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGA
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AAAGATGTTGTTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAAGGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAATGGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTG
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ACAGAGGACATATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAA
TGGATGCTTGCTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAAGATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCG
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GGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGGCTGCCTTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAGCCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGG
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ACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTT
CGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCG
GAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGA
TCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTCAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAG
TGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCC
CCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCC
ACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTG
TAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTGAAGACAAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGA
AATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGT
GAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTT
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AATGGAGGACGTTAAGCCGTCGATCTGGGATCGGACGGTCTAGGTAGAGCGGCGAAGTCTTTGATCATTTTGGCTTTAATTTGGGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGTAAGCCATTAAACCCTAGCCTGGTTGTTGAATCATGAAACTCTT
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CGTGTAATTTTATTTGGCTTTCTTAAATGGATCGGGAGGCGGAATTTCAGCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACACGGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGGAAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAG
ACGTCCAAGAATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAAATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAGACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTCATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTG
CTTTGCTAATAATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTAC
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GTTTATGTTCTCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCAGGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGA
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GCCAGCTGTTTATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTCACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGG
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AGCTGCCTCAGTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCGCCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGA
GGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGGCTGCCTTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAGCCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGG
AAAGGCATGGCTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAA
ACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTT
CGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCG
GAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGA
TCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTCAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAG
TGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCC
CCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCC
ACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGGTACACTTCACAAATAGTTGAGCAGGAATTAACTCTCCATTGAAATAAGTTTTTTTTTGCTCAAGTC
AATATTCTTTTTTAATCTACTAATGCCTTTTTGGCAACCAATGACAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCC
ATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTGAAGACAAGgttcatgcaacttaagatttaaaggatttgatccaaagtatttgatgtttcttaagaatacaagggattgctgtggtgactccctctaccatgtcatcatgagatgctaaaagctgtttcatttgcatgtgtagGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGA
AGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGT
TTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGT
AGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATC
CATCTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTATATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGA
Intron 6 GTATGCAGAA ... GGAATTTCAG
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| A5 | 65 | 35 | 72 | 58 |
| A6 | 45.45 | 3 | 3 | 2 |
| A7 | 75 | 1 | 4 | 2 |
| A8 | 80 | 1 | 5 | 3 |
| A9 | 66.67 | 1 | 2 | 2 |
| A10 | 73.33 | 2 | 10 | 1 |
>TRINITY_DN43937_c0_g1_i7 from sample A9 / Example spliced isoformGGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTCTGCGCGGCTTGATCCTCG
AGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAATTCTCTTCGAAAATTTTTAAGCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACACGGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGG
AAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAGACGTCCAAGAATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAAATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAAACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTC
ATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTGCTTTGCTAATAATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATT
CCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGACGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCGGTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTT
TGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGACTTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTCGCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACAT
AGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAACACCCTTGTTGTCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAATGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGT
TGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATTGTCTGAGTGATTCTGAGAAGACTGGAATAACCACTCCAAAACAGAGTACTGTAAGAGCACTTCGGCCACGGAAGCGGAGACAAAAAGCCAGTGGCACAAAGCGTTATAAGGAAATTGGTTTCAGTGAGGTAGATGCCTTCAACATTTTGGACAGGAGAATCAAGG
TTTTCTGGCCACTTGATGATAAGTGGTATTATGGTTCAGTCAAGAGTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAACGAGAAATTCAAGCTTCAGCTTCTTCCAGGTGAAACCTCTGGCCATATCAAAATATTGAAAAATTCGGGCCGTCGAAAAGTT
GGAGGAAGGTTTTCAAATGGTATTCAATCAGTGCCTGAAACTCCCTACCCCGAAGAATTCAATAATGAAATTCACTTGTCTACTGTTGATAATGATGCATTTACACATACAACTGAAAATGGATCCTTTGAGAAGTATACTTCTACAGTATTGGATGTGCCTTGTAGGCCTTCCGGGAATGGAAGGGAATGCAGTGGCCA
TAAAGATGATGATAGCTTGGTACCCCTCAAGGATATTGATTCCAGTGTTAAAAAAGTAACTTTTCACCCAAGTTCACATAAGATAAAATCTGGAAATGTCTATGTTAGGAGACGGTACCGCAAAACAGGTTCTGGCTTAAAGGCCACAGATGAGAGTGTTGTTAAGATAGGTGAGGGGAAGGTGAATGTGTTTCAGAAGT
TGATGGAAGCTGGAACATCTTGTTCATCCAAGAAAAAGCTTGAACAGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAGTCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTAT
TCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATCTCTTGAATGTAAAAAAGAGTTAGATAGAGCTATTGTTCCTCTGCCCTTTACCTGCAACACAATCTCTATCAATAAGGACTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAA
TGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGATGTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTCGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGG
AACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGCCTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGTGGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGG
GGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTCTCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCA
GGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGAGAACACTAGAAGTTCTCCTCCAGAAAAGTTCTCTGCGAAGTCCAAATAACACAAATCAATGTCTATTTGGAAGCTGTAGTGGTCAAATGTCTGGGCATATGGCTTTCAAGGATTCAGTTATGTTTGTGGAGAATTCTGGCACTGTGTCAGTCTCTGATATGACTG
TTCCTATGTGTCAGCCAACACGAAATACTTTAAATGCTTTGCGAGAGAGGAGTCTTCATGATATGGATTATAGGTTTTCTTCTACCACACAGTCTATAAAGGTGAATCTTTGCAGAAGTACATCTACTAATCGCAGAAGGAATGGTTGTGGTGTTAATTCTGAGAGTGGTCCAGCCATTCCATCATTTTTCTTGACATTT
GCAGCTGCACCTAGCTTTTTCCTTGGCTTGCATCTAAAGATGTTGTTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAAGGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAAT
GGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTGCTCCTAAGTGCCCAACTGTTAAGCATTCAAAGGTAGATGTTGATGCTTCCCCTATAAGCACTGCCGATGGCTGGGTAATGTCATCTCCACGATCCTCATATTCTGAGCTTAATGTGACTGGCAATGCTGCAGGTCTCCCAGCAAAGAAAGATAGCTGTGATCATT
TTATGCATGGAAATGCCCTTAAACTTCGGAGATGCTTGATGGATAGAGGCTCATGGAAGTTTGCCAGGAGTTCAAGGCCTCATTCTGTTCAGGAATTAAATTCTTCAGTATTTGACTCTGAAGCAGAGGGTTGTTCTCACATAGCTATGGATGGTAGAGAGGAAGCCCCTGCAGGGCAATTCATCACCGGTTGTGTTAAT
TCTACACAAGTTGAGCCATATACAAAACAAGACAGGCCAGCTGTTTATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTCACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGAT
CTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACATATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTG
CTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTGCTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAA
GATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCAGTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCGCCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGA
GGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGGCTGCCTTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAG
CCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGGAAAGGCATGGCTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAA
CCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGA
TATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACT
CGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAA
CGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAA
TGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTT
CCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTAT
AGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGGTACACTTCACAAATAGTTGAGCAGGAATTAA
CTCTCCATTGAAATAAGTTTTTTTTTGCTCAAGTCAATATTCTTTTTTAATCTACTAATGCCTTTTTGGCAACCAATGACAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAA
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GCATGTGTAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGC
TGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCA
TCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTG
ATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTA
TATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACATACTAATCTTTGGA
>TRINITY_DN43937_c0_g1_i8 from sample A9 / Example unspliced isoform:GGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGTAAGCCATTAAACCCTAGCCTGGTTGTTGAATCATGAAACTCTTGTAAATCTATTGATGAAAACCTAATTACCTTGTATGGATCGGTACATGAGAATACGGATTTGAAGGTTCTTGAGTCAAAATTT
TGTCCAGGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTCTGCGCGGCTTGATCCTCGAGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAAT
TCTCTTCGAAAATTTTTAAGgtatgcagaaattttcagttctagtgttccaaccctggcaggatgaataatggatgcttttaatagtctcgtctccctgaggctttttgtaaatttgcgtgtaattttatttggctttcttaaatggatcgggaggcggaatttcagCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACAC
GGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGGAAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAGACGTCCAAGAATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAA
ATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAAACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTCATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTGCTTTGCTAATAATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACA
TTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGACGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCG
GTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTTTGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGACTTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTC
GCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACATAGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAACACCCTTGTTGTCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAA
TGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGTTGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATTGTCTGAGTGATTCTGAGAAGACTGGAATAACCACTCCAAAACAGAGTACTGTAAGAGCACTTCGGCCACGGAAGCGGAGACAA
AAAGCCAGTGGCACAAAGCGTTATAAGGAAATTGGTTTCAGTGAGGTAGATGCCTTCAACATTTTGGACAGGAGAATCAAGGTTTTCTGGCCACTTGATGATAAGTGGTATTATGGTTCAGTCAAGAGTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAA
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CGCAAAACAGGTTCTGGCTTAAAGGCCACAGATGAGAGTGTTGTTAAGATAGGTGAGGGGAAGGTGAATGTGTTTCAGAAGTTGATGGAAGCTGGAACATCTTGTTCATCCAAGAAAAAGCTTGAACAGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAG
TCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTATTCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATCTCTTGAATGTAAAAAAGAGTTAGATAGAGCTATTGTTCCTCTGCCCTTTACCTGCAACACAATCTCTATCAATAAGGACTTGA
ACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGATGTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTA
ACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTCGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGGAACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGCCTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGTGGAAT
GGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGGGGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTCTCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAG
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TGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACATATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACAT
CTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTGCTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCG
TTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAAGATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCAGTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCGCCCTA
CTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGGCTGCC
TTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAGCCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGGAAAGGCATGGCTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGAT
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ATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGA
TCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTG
ACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAG
GCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGGTACACTTCACAAATAGTTGAGCAGGAATTAACTCTCCATTGAAATAAGTTTTTTTTTGCTCAAGTCAATATTCTTTTTTAATCTACTAATGCCTTTTTGGCAACCAATGACAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGAC
CATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGTTGCATTCTTTTGTCCTGTGTTTTCCATTCTTGTTTAAATAGTAGTGCTGCCTACGTTTATTTCTTATGATGCGTGTTTATGGTCGAGGAGGATGATCACCTGATGTGGAACCCAG
CACTTATTTTGCATAGTTGATGTGTAACAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTAAAGACAAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAG
GTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCT
CATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAA
AATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTC
TTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACATACTAATCTTTGGA
Intron 7 GTGATGGTTA ... ATTCATGCAG
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>TRINITY_DN116928_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformCTATAACGAAAAAAGAAAAAAAAAAACCGTGAATGCGTAAGTTATGGAACCCCGCTATTCACATAAATATTTTTGCCAAAAATATATTATCATAATTTCTCGTCCACAAACCCTAGCAGCAGTGGTTAACTTGGTCTACAAGACAAGACCAGCTTTAGAGAGAATTTATTGGATTAGGGTTTCTATTATAAATGGAGGAC
GTTAAGCCGTCGATCTGGGATCGGACGGTCTAGGTAGAGCGGCGAAGTCTTTGATCATTTTGGCTTTAATTTGGGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGTAAGCCATTAAACCCTAGCCTGGTTGTTGAATCATGAAACTCTTGTAAATCTAT
TGATGAAAACCTAATTACCTTGTATGGATCGGTACATGAGAATACGGATTTGAAGGTTCTTGAGTCAAAATTTTGTCCAGGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTCTGCGCGGCTT
GATCCTCGAGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAATTCTCTTCGAAAATTTTTAAGGTATGCAGAAATTTTCAGTTCTAGTGTTCCAACCCTGGCAGGATGAATAATGGATGCTTTTAATAGTCTCGTCTCCCTGAGGCTTTTTGTAAATTTGCGTGTAATTT
TATTTGGCTTTCTTAAATGGATCGGGAGGCGGAATTTCAGCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACACGGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGGAAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAGACGTCCAAGA
ATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAAATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAAACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTCATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTGCTTTGCTAAT
AATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGA
CGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCGGTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTTTGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGAC
TTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTCGCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACATAGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAACACCCTTGTTG
TCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAATGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGTTGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATTGTCTGAGTGA
TTCTGAGAAGACTGGAATAACCACTCCAAAACAGAGTACTGTAAGAGCACTTCGGCCACGGAAGCGGAGACAAAAAGCCAGTGGCACAAAGCGTTATAAGGAAATTGGTTTCAGTGAGGTAGATGCCTTCAACATTTTGGACAGGAGAATCAAGGTTTTCTGGCCACTTGATGATAAGTGGTATTATGGTTCAGTCAAGA
GTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAACGAGAAATTCAAGCTTCAGCTTCTTCCAGGTGAAACCTCTGGCCATATCAAAATATTGAAAAATTCGGGCCGTCGAAAAGTTGGAGGAAGGTTTTCAAATGGTATTCAATCAGTGCCTGAAACTCCC
TACCCCGAAGAATTCAATAATGAAATTCACTTGTCTACTGTTGATAATGATGCATTTACACATACAACTGAAAATGGATCCTTTGAGAAGTATACTTCTACAGTATTGGATGTGCCTTGTAGGCCTTCCGGGAATGGAAGGGAATGCAGTGGCCATAAAGATGATGATAGCTTGGTACCCCTCAAGGATATTGATTCCAG
TGTTAAAAAAGTAACTTTTCACCCAAGTTCACATAAGATAAAATCTGGAAATGTCTATGTTAGGAGACGGTACCGCAAAACAGGTTCTGGCTTAAAGGCCACAGATGAGAGTGTTGTTAAGATAGGTGAGGGGAAGGTGAATGTGTTTCAGAAGTTGATGGAAGCTGGAACATCTTGTTCATCCAAGAAAAAGCTTGAAC
AGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAGTCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTATTCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATCTCTTGAATGT
AAAAAAGAGTTAGATAGAGCTATTGTTCCTCTGCCCTTTACCTGCAACACAATCTCTATCAATAAGGACTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGAT
GTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTTGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGGAACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGC
CTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGTGGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGGGGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTC
TCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCAGGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGAGAACACTAGA
AGTTCTCCTCCAGAAAAGTTCTCTGCGAAGTCCAAATAACACAAATCAATGTCTATTTGGAAGCTGTAGTGGTCAAATGTCTGGGCATATGGCTTTCAAGGATTCAGTTATGTTTGTGGAGAATTCTGGCACTGTGTCAGTCTCTGATATGACTGTTCCTATGTGTCAGCCAACACGAAATACTTTAAATGCTTTGCGAG
AGAGGAGTCTTCATGATATGGATTATAGGTTTTCTTCTACCACACAGTCTATAAAGGTGAATCTTTGCAGAAGTACATCTACTAATCGCAGAAGGAATGGTTGTGGTGTTAATTCTGAGAGTGGTCCAGCCATTCCATCATTTTTCTTGACATTTGCAGCTGCACCTAGCTTTTTCCTTGGCTTGCATCTAAAGATGTTG
TTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAAGGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAATGGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTGCTCCTAAGTG
CCCAACTGTTAAGCATTCAAAGGTAGATGTTGATGCTTCCCCTATAAGCACTGCCGATGGCTGGGTAATGTCATCTCCACGATCCTCATATTCTGAGCTTAATGTGACTGGCAATGCTGCAGGTCTCCCAGCAAAGAAAGATAGCTGTGATCATTTTATGCATGGAAATGCCCTTAAACTTCGGAGATGCTTGATGGATA
GAGGCTCATGGAAGTTTGCCAGGAGTTCAAGGCCTCATTCTGTTCAGGAATTAAATTCTTCAGTATTTGACTCTGAAGCAGAGGGTTGTTCTCACATAGCTATGGATGGTAGAGAGGAAGCCCCTGCAGGGCAATTCATCACCGGTTGTGTTAATTCTACACAAGTTGAGCCATATACAAAACAAGACAGGCCAGCTGTT
TATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTCACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACA
TATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTG
CTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAAGATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCA
GTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCGCCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGA
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CTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCT
CACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGATATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGC
AGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTT
CTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATC
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AAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTG
AAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGT
TGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGTTGCATTCTTTTGTCCTGTGTTTTCCATTCTTGTTTAAATAGTAGTGCTGCCTACGTTTATTTCTTATGATGCGTGTTTATGGTCGAGGAGGATGATCACCTGATGTGGAACCCAGCACTTATTTTGCATAGTTGATGTGTAACAGGAATCTACATG
GACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTGAAGACAAGGTTCATGCAACTTAAGATTTAAAGGATTTGATCCAAAGTATTTGATGTTTCTTAAGAATACAAGGGATTGCTGTGGTGACTCCCTCTACCATGTCATCATGAGATGCTAAAAGCTGTTTCATTTGCATGTGTAGGC
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AAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTG
TGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGT
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ATCATTTGCTTTTGCAAATATTCTTTCTATATATATTACTCTTTGAAGAGAGATCTATACAGTCCAGCAGACATATCTTAGACATATCTTATTGCAATTGTTTGGTAGAACAAACACTAAAACTTCGCAAAATTTGTCATCCTATCAACCATAGAGTCGTTCATACTTCTAAGCGCTGTAGCTTTGGAACAGAGAGAAGT
GGATATCATTGTGGTTTTCTGATCATTACAGAACACACAAGCTGAAACGAAATAGATCAATAGAGGGTTGAAGGACC
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TGATGAAAACCTAATTACCTTGTATGGATCGGTACATGAGAATACGGATTTGAAGGTTCTTGAGTCAAAATTTTGTCCAGGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTCTGCGCGGCTT
GATCCTCGAGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAATTCTCTTCGAAAATTTTTAAGGTATGCAGAAATTTTCAGTTCTAGTGTTCCAACCCTGGCAGGATGAATAATGGATGCTTTTAATAGTCTCGTCTCCCTGAGGCTTTTTGTAAATTTGCGTGTAATTT
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ATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAAATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAAACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTCATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTGCTTTGCTAAT
AATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGA
CGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCGGTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTTTGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGAC
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AGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAGTCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTATTCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATCTCTTGAATGT
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CTTTGGTTCGGCATTTCCAGgtgatggttagatatattttcaagtaggaagaatctagtcttccaagaaattttttaatattttctgactcatttcttttatgcaaatatattgttcttattcatgcagCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTC
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AAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACTCGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGC
AGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGA
CACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTG
TCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTG
TGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTC
ATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAAGGTTGCATTCTTTTGTCCTGTGTTTTCCATTCTTGTTTAAATAGTAGTGC
TGCCTACGTTTATTTCTTATGATGCGTGTTTATGGTCGAGGAGGATGATCACCTGATGTGGAACCCAGCACTTATTTTGCATAGTTGATGTGTAACAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAGACATAGTAGAGGTTGAAGACAAGGTTCATGCAACTTAAGATTTAAAGGAT
TTGATCCAAAGTATTTGATGTTTCTTAAGAATACAAGGGATTGCTGTGGTGACTCCCTCTACCATGTCATCATGAGATGCTAAAAGCTGTTTCATTTGCATGTGTAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGATGACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTT
AGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACCCAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGG
CTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCAAGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAG
AAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCATTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTC
TCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACATACTAATCTTTGGAAAAGGGATTTGCATTCAGACATGTCCTTTTATACAGTTTAATAGGCGTTTTA
GTTATTTAATAGGTTATACAATTTAATAAAGGTTTTAGTTATTTAATAGGTTGCTGTGCACATCTCGTTTGAAGTTTATTTTGATTTTTTTGCATGATATAAGAAAGTCATCATTTGCTTTTGCAAATATTCTTTCTATATATATTACTCTTTGAAGAGAGATCTATACAGTCCAGCAGACATATCTTAGACATATCTTA
TTGCAATTGTTTGGTAGAACAAACACTAAAACTTCGCAAAATTTGTCATCCTATCAACCATAGAGTCGTTCATACTTCTAAGCGCTGTAGCTTTGGAACAGAGAGAAGTGGATATCATTGTGGTTTTCTGATCATTACAGAACACACAAGCTGAAACGAAATAGATCAATAGAGGGTTGAAGGACC
Intron 8 GTAAGCCATT ... TTTTGTCCAG
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| A6 | 100 | 0 | 3 | 1 |
| A7 | 100 | 0 | 10 | 11 |
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| A10 | 85.71 | 1 | 5 | 7 |
>TRINITY_DN43937_c0_g1_i16 from sample A9 / Example spliced isoformGGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTCTGCGCGGCTTGATCCTCG
AGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAATTCTCTTCGAAAATTTTTAAGCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACACGGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGG
AAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAGACGTCCAAGAATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAAATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAAACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTC
ATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTGCTTTGCTAATAATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACATTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATT
CCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGACGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCGGTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTT
TGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGACTTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTCGCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACAT
AGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAACACCCTTGTTGTCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAATGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGT
TGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATTGTCTGAGTGATTCTGAGAAGACTGGAATAACCACTCCAAAACAGAGTACTGTAAGAGCACTTCGGCCACGGAAGCGGAGACAAAAAGCCAGTGGCACAAAGCGTTATAAGGAAATTGGTTTCAGTGAGGTAGATGCCTTCAACATTTTGGACAGGAGAATCAAGG
TTTTCTGGCCACTTGATGATAAGTGGTATTATGGTTCAGTCAAGAGTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAACGAGAAATTCAAGCTTCAGCTTCTTCCAGGTGAAACCTCTGGCCATATCAAAATATTGAAAAATTCGGGCCGTCGAAAAGTT
GGAGGAAGGTTTTCAAATGGTATTCAATCAGTGCCTGAAACTCCCTACCCCGAAGAATTCAATAATGAAATTCACTTGTCTACTGTTGATAATGATGCATTTACACATACAACTGAAAATGGATCCTTTGAGAAGTATACTTCTACAGTATTGGATGTGCCTTGTAGGCCTTCCGGGAATGGAAGGGAATGCAGTGGCCA
TAAAGATGATGATAGCTTGGTACCCCTCAAGGATATTGATTCCAGTGTTAAAAAAGTAACTTTTCACCCAAGTTCACATAAGATAAAATCTGGAAATGTCTATGTTAGGAGACGGTACCGCAAAACAGGTTCTGGCTTAAAGGCCACAGATGAGAGTGTTGTTAAGATAGGTGAGGGGAAGGTGAATGTGTTTCAGAAGT
TGATGGAAGCTGGAACATCTTGTTCATCCAAGAAAAAGCTTGAACAGGATTTCTGTAATGGAAAGAATGTGGGCCAGTCTCTGTTTAGTAATGATAGCAAGCATAGAAACATTTCAAGTCCTAAAAATAACGTGCAACCTGAAGGATACCCCACGTCTAGCAAAGGTAATGCATGCCATTCTCTATTAGGCTTGGAGTAT
TCTGGAATTGGTGACAAAAGTGAGCCTACAAAATCTCTTGAATGTAAAAAAGAGTTAGATAGAGCTATTGTTCCTCTGCCCTTTACCTGCAACACAATCTCTATCAATAAGGACTTGAACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAA
TGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGATGTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTAACTCATTCAATGGAAGAATGTCAACCTCTGGGTGGTGTGATAATTTCTGAGGTGTCTATTCGTTGTTTTCTTTCTTCCAAGG
AACTTCGTAGAGAACACCCTATCTTATCTCTCCGGAACTTCTTGCCTCAACTTTATCCTGGATATGGACTGCAACATGTTTGCTGTCATAATAATTTGATTCCCAAGCAGTGTGGAATGGTCTTGCCTGTGTGGCCAGATGGCTGTTTGGAAATTTTGGTGGTGGATAATTTCTCGGGTTTAAGCTTTTTTTCGTTTGGG
GGTTCTTTATGGGAAGTTGTCAATGGATTCAGCAAGTTTATGTTCTCAGTTTTGAATCCATTAGAAAATAAATGTTCTTGCATGTTCTTAGGAGCTATGAAGCTTGTTGATATGCAAGTACCAGTTCCATCTGTCATTGTTCAGATTTCATTGTCTCAAGGTTTCAGAAAGCCCCTTGGCTTTATTTTTTACAAATTTCA
GGCAATTACAAGAGCAAAGTTAAAGGATCTCAAGAGAACACTAGAAGTTCTCCTCCAGAAAAGTTCTCTGCGAAGTCCAAATAACACAAATCAATGTCTATTTGGAAGCTGTAGTGGTCAAATGTCTGGGCATATGGCTTTCAAGGATTCAGTTATGTTTGTGGAGAATTCTGGCACTGTGTCAGTCTCTGATATGACTG
TTCCTATGTGTCAGCCAACACGAAATACTTTAAATGCTTTGCGAGAGAGGAGTCTTCATGATATGGATTATAGGTTTTCTTCTACCACACAGTCTATAAAGGTGAATCTTTGCAGAAGTACATCTACTAATCGCAGAAGGAATGGTTGTGGTGTTAATTCTGAGAGTGGTCCAGCCATTCCATCATTTTTCTTGACATTT
GCAGCTGCACCTAGCTTTTTCCTTGGCTTGCATCTAAAGATGTTGTTTGGGAAGCCCATTGACTCCATTGGTTTCCAAAATCTTGGATCAGATTTGTCAGACTTGGAAAATAAGGGGATGATTGATCCTTCAGACGTGGGTAATTGTGATGCATCCACTGTGGAAGTATCATCAATGAAAACTGTTCAAACCGTTGAAAT
GGTGTTCAGTGGAGGCCATACTTCAGATTCCAGTGCTCCTAAGTGCCCAACTGTTAAGCATTCAAAGGTAGATGTTGATGCTTCCCCTATAAGCACTGCCGATGGCTGGGTAATGTCATCTCCACGATCCTCATATTCTGAGCTTAATGTGACTGGCAATGCTGCAGGTCTCCCAGCAAAGAAAGATAGCTGTGATCATT
TTATGCATGGAAATGCCCTTAAACTTCGGAGATGCTTGATGGATAGAGGCTCATGGAAGTTTGCCAGGAGTTCAAGGCCTCATTCTGTTCAGGAATTAAATTCTTCAGTATTTGACTCTGAAGCAGAGGGTTGTTCTCACATAGCTATGGATGGTAGAGAGGAAGCCCCTGCAGGGCAATTCATCACCGGTTGTGTTAAT
TCTACACAAGTTGAGCCATATACAAAACAAGACAGGCCAGCTGTTTATGCTGAGTTATTCACAGGTCAGGGCAACTTTTGGGATCGGAATAGGAATGGCACAGCATCTCAGTCACAATTGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGAT
CTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACATATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACATCTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTG
CTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTGCTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCGTTACACCCATGCTATGATATGGAGAGGTGGGAAGGATTGGAGCTTGGAGTTTCCTGATAGGAAGCAATGGACTCTGTTCAAA
GATTTGCATGAAGAATGCTACAATCGGAATTTGCGAGCTGCCTCAGTGAGGCACATACCAATACCTGGAGTGCGTAAGATAGAGGATAATGATTGTAGTTCTAATTTTGTTCGCCCTACTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGA
GGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGGCTGCCTTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAG
CCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGGAAAGGCATGGCTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGATCAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAA
CCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGAAGCAGGGTGGGATGAGCATTGGAGAGGACAATTCTTCAGATGCCTTGGGTTATGTGTATAGCTCTAGTCCTCCACACATTGA
TATTCATTCTCAACCTGGAAGCACTGGTGCAGTTTCGTTAGAGGCAGCCACACAGTTGGATTCTATGGATTTCAGATTTGAAATGAATAATACCTGCCAGCAAAAGCAGAAGATGAAGCTAAGTCAAAAGAAATCAAAGAGAATGAAAATGTCTGAGGCCTCTAAAGACGTACAAAGGGGTAGAATATCCCATTTTGACT
CGCACCATAGAAAGCAATATGTTTCTCATTCTTCGGAAACAGCTTCTGGTGATCAATGGAATGATTTTGGTACTTTGCCCAAGTATAACTTGCCAAGCGTGAATTCAAGACATGCTCCAGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAA
CGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACTATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAA
TGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGATCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTT
CCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTGACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTAT
AGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAGGCTTGTAGATTTATTGTCATGACGAATTCTGTACAGAAAATTGTTTTCAGGTACACTTCACAAATAGTTGAGCAGGAATTAA
CTCTCCATTGAAATAAGTTTTTTTTTGCTCAAGTCAATATTCTTTTTTAATCTACTAATGCCTTTTTGGCAACCAATGACAGATCACTATAGGAGCAATTGTCGGGAGTGTATGAGACCATCTGAATCTGTAATTAATTATATGGCTTGTAGTGATGGTTGGGAGTTCAGTTTTTGATCAAAGTGTTTTTATTAGCCTAA
GGTTGCATTCTTTTGTCCTGTGTTTTCCATTCTTGTTTAAATAGTAGTGCTGCCTACGTTTATTTCTTATGATGCGTGTTTATGGTCGAGGAGGATGATCACCTGATGTGGAACCCAGCACTTATTTTGCATAGTTGATGTGTAACAGGAATCTACATGGACAACATTATTCGTTTATACCCATGTGTCAATCATGTCAG
ACATAGTAGAGGTTGAAGACAAGGTTCATGCAACTTAAGATTTAAAGGATTTGATCCAAAGTATTTGATGTTTCTTAAGAATACAAGGGATTGCTGTGGTGACTCCCTCTACCATGTCATCATGAGATGCTAAAAGCTGTTTCATTTGCATGTGTAGGCAAAATGTAATGATCTGGAAGAGAAGTGTGTACGTTGAAGAT
GACAATAGTCTTTTTGGCGTGGAGAGTTGAAATAGGCTGTTTAATTGGTTAGGTTACTGCTAGGGAGGGGTGTTGCATGCTTTGTGCATAGCATGTCACGAGTCTCTTTGTTGAGGCACTTCCTCTATCTAGGTTATCCTTTGGGGCTGGTTGGATGGTTGATCTAAGAGGCCTATGATTGTTTGGGCATAAATAGAACC
CAAACCCCATGAGCGAGGGCAGGTAAAGGTGAATTTTTGAGCTTTTACGGCTCATTTGCTCTTAAGAAAAGATGGCTTGGATGTATGGGTAGGGCCTACTCTTTTCTGAGGGCATGTAGAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGCCCATCTGCTCTAAGAAAAGTTAGTTTGAATATATGTGTAGAGCCTATCTTTTTTCA
AGTGCATGTATAGGCAAATTAATGAGCTTTTACTGTTCATCTGTACCAAGAAAATGAGTTTGGATCTTGCCACAGGTAATTAGGATCAAATCGAATCACACATCATATGGCCTGTGCATACAGTCAAATTTAAAAAGAGAATGTGTGATGTAACTAGTGTGGAGTCTCACCAGCTTGAAATCCAACTAAATGCAGGGGCA
TTTTAAGTTGCAAAATATTCACTTTAAATATGATAGTTGAGAAACAAGTCTCTTGTATAGAAAGATGTATAGAAAGGTGATTCGAGATCTAATATTTTATGTCAATCTCTGGACACATTTTTTTTTTAAGTTTTGATTTTGGCGTTATATTGGTAAGGTGAATAAGAAACACAATTATTGCACATACTAATCTTTGGA
>TRINITY_DN43937_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:GGGGGGACTAAATATTATTGATTTTTAATTTTTGTGTGGAGGAGGCGAATAATGAAAGGCTTTACAGTTTCTgtaagccattaaaccctagcctggttgttgaatcatgaaactcttgtaaatctattgatgaaaacctaattaccttgtatggatcggtacatgagaatacggatttgaaggttcttgagtcaaaattt
tgtccagGAATAGCCACGGCTGGATGGGTTTTCTTCAGATCTATCGAAGGAGGTCTGTTTTGGTCCAGATATTACAAGGTATGTGAATTTTTTTGCCTGAAATATGATGGGTTTGTCTGCGCGGCTTGATCCTCGAGAGGACGCCGCAGCCGTGGCCCCAGCAGCCATGGAAGATGGGTAACTGCAAGAATTTTATGAAT
TCTCTTCGAAAATTTTTAAGGTATGCAGAAATTTTCAGTTCTAGTGTTCCAACCCTGGCAGGATGAATAATGGATGCTTTTAATAGTCTCGTCTCCCTGAGGCTTTTTGTAAATTTGCGTGTAATTTTATTTGGCTTTCTTAAATGGATCGGGAGGCGGAATTTCAGCGTTTGCTGGCACCGGTATCAAGATCTTCACAC
GGAGAAGGTTTAAAGATTGAATCTAAGATCGGCGAGAATGTGGCGGATGAGACCGTCCGTTCAGCGCAGGATTTTAAGAGGGAAAATGTGCAGAGCCGTTCGAAAAATCATTCTCAGACGTCCAAGAATCGGGAACCCAGGAACAGCAGGGTTCTAGCGGGATCAAATAAGAGGAAACGTGCAGAGGACGGTTCTGTGAA
ATCCTCTCGTTCGGAGGCTAAGAAGAACAAACGAAGTGCCGCCTCTAACGCGCCTTCATCTCCAGGTACTTCATTTAATTTCATAGAACTCGAGCTATCTGAAAAACCGGATGTCTGCTTTGCTAATAATCAGGAGAGTTCTGATGATTCGGAACCCCTCATCAATAAAATTAATAAAAGTGCTGCAAAATTAGCTCACA
TTCGCGCTAAACATGCCATTGATGTTAATGATTCCCGGCTATCTACTAAGAACTCCAAACATGCTTCAAATACATCACAATTCCCTGTCAAAACTGCACCTCTTCCAAGCCTTTTACGGTTTTCAGACGGGCCCACAGAACATGCTGTCAAGCCATTGCAAATTGTTGGAGAGATTGTACGAACAGAACATAGTTTTCCG
GTTTTGAAAGATTTTGCCACCAAGTCTTTGCGAACATCAAAAAAGAAGAGCAAGGCCAGTGCTCTGCAGCCCGAACATTCTTTGAAGAAAGCTGAAGTGGAAGCTGCAATTACCTTTGATGATCGACTTGTTTCTACTAAGGTGGCAAAAACTGCTAAAGACAAAGGAAATTCTGAAACTGCTTCATCAATAACTGATTC
GCCCCATCATGTGGATCGACAGATATTTTCAAGTGAAATAAATAATGCCCCTCTCAAGTGGAGTAACCACAAGGCTCGACATAGAAAGAGAACTGTTTCTAACCAGAGGCTTCAAACACCCTTGTTGTCTCAGGCCTCCAATGTTAGGCTAACCAATGTTGCCAATGAAGAGCAAAGTTTAGAACAGAATGCAGCTAGAA
TGTTGTCATCTCGGTTTAGTTCGCATTGTGGCACCTTTGGTCTGAATGGTTTGAGTGTGTCTCAACAGACCGCAGAACCAGTTGATTCCTCACCTCCCCTCAATTTGCAACGACATTGTCTGAGTGATTCTGAGAAGACTGGAATAACCACTCCAAAACAGAGTACTGTAAGAGCACTTCGGCCACGGAAGCGGAGACAA
AAAGCCAGTGGCACAAAGCGTTATAAGGAAATTGGTTTCAGTGAGGTAGATGCCTTCAACATTTTGGACAGGAGAATCAAGGTTTTCTGGCCACTTGATGATAAGTGGTATTATGGTTCAGTCAAGAGTTATGATCCAACAAACAAGTTGCATTATGTTCGTTATGATGACCGTGATGAAGAGTGGCTTTCACTTCAAAA
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ACCTTTTGCAGTCTGGTCATGATGGTGAAATTTCAAAACTTAGATGGTCTGAAGATAATATGGCACCAGAAATCATCACGAATGAAAACAAGCACAAGCATTTGCAGGTTGATAATGACCAGGTGATGTTTTCTAAGCTGTCAGCAAGCTCTGGAAAAGATTTGCTAAGCTATCAAGGGTCTGACCTTGCCCCTAGGTTA
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TGTGGCAAGACCATAGGGCTCAAAATGTTTATAATGGTTTCACAGAACCTAGAAAGCGTCGCAGTGGTTTTTCAAATCTGATCTTTGGTGATAATTCTGATGATATTCCTTTCAAGGACAGAGGACATATGAGACGGGGCCGGCCTTCAAGGCAAAACAAGGAAGATAAGAAGAAGAGAAACTCTGATAATTCTTCACAT
CTAAGAATGTACTTAGATTCTGTATTCTGTAGTGCAAATATCCTGGTTGTTGAAGTTGAAAGAGGGTGGAGAGAATGTGGTGCTCGAGTTGTGCTTGAAGCTTCAGATCATAATGAATGGATGCTTGCTGTGAAGCTATCTGGATTTACCAAATATACCCATAAGGCGCAGCAGGTTCTTCAATCTGGCACAACAAATCG
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CTTCAAGGTACATTCGACAATTGGAGAGTGAAGTTGAAATGGCCTTGGCAACTTCCCGTGTCATGTATGACATGGACAGTGAGGATGAGGAGTGGCTTGTTGACTTAAACAGTATGAGGATTGGTGATGAAGGCTGCCAACCAAGTCAGGTATCAGAAGAAACATTTGAGAGAATTATGGACTTACTTGAGAAGGCTGCC
TTCACACAGCAACGTGAGCTATTGAATAGTGATGAAGTAGCTGATTTCTGTTGGGATATTGCACCTGTGGAAGTAGTGAAAGCCATTCATGCTCATTGGCAAGAGAAGAGGTGGAGGAAAGGCATGGCTTTGGTTCGGCATTTCCAGCCAGCTTCTTGGGAGCGGTACCAGCAACAAATAAAGGAATGGGAATCACAGAT
CAGTGAATTACAAAATTCACCAGCATCAAACAAGCAGCCTTTCATGCTGGAAAGGCCATCATTGTTTGCATTTTGTCTTAAACCTAGAGGATTGGAAATTCCAAACAAGACACAAAAACAGAGACCTCACAGGAAATTCAATGCTGGGAAGCAAATTACTTTAAGAGATCACGAGAGTGGCATCTGCCCAGCTACCAGGA
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AGCTTATGATTTTGATGCAGAACTAAGGGTTCAGGAGGCCACAAATGCCACACGAGATGCAGCTGAACTTGCTGCAGTGAAACGTGCTAAAGCTCAAAGGCTACTTCAGAAGGCAGATCTGGCTATCCATAGAGCTGCAGTAGCTGTAGTGACTGCAGAGGCTATACGAGCTGCTGAAAGAAATGCACAAGGAGTAAACT
ATAGGAATGTTGAAAAGACACAGAGTGAGCATCTTGACACATACAGGTGTAAAGTCAGCAGTGAGGCAATACCATTTCCCAATGAAACCGGTGGTGTGGCAAATGAGTCTGTGATAGTGAGTGTAGGGCATTGGCAGCCTGCTATGGTTGACCCTTCTCCTATAAAAGATGATGCAACAATCAGACAGAGCCCAAATAGA
TCTCCATCAGCTTCTTTGTCTACTGCAAGCTGTGTCATTTCGAAGAGGCAGGAAGAATTGATCCCAATCACAACAATAGGTTCCCCAGCAGTCCAGGATTTAGGTTCCAACCAGGCCCCAAAATCTAAAATTGAGGATTCACTGTTGCCAAATGATGCATTCATGCCACGTGCTAGTTGGGGTCGTGAAATCAATACCTG
ACTTCAAACTACAATGTGTGGAGTGGAGATTTTCTTTTGCAATTCTTCCTTTGCGAGGGGTAGGGAATTGGGCTAACTGTATAGCCTCCATTTAGACACTGCTAATGTACAGTTGCCACTTTCTGTGAAATTGTTGGCTTTAAAGGAGCAAGTTTACAGTGAAATTTCCGGCTGTCTTTTGTAGCTTCTAGAGGGAGAAG
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