NA ----> NA
Intron 1 GTAATTATTT ... TGTTTCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.64 | 205 | 0 | 60 |
| A2 | 27.76 | 190 | 1 | 73 |
| A3 | 27.36 | 215 | 1 | 81 |
| A4 | 27.11 | 199 | 3 | 74 |
| A5 | 29.77 | 92 | 0 | 39 |
| A6 | 25.15 | 1530 | 0 | 514 |
| A7 | 24.24 | 1341 | 4 | 429 |
| A8 | 26.05 | 1181 | 0 | 416 |
| A9 | 27.34 | 1071 | 0 | 403 |
| A10 | 27.37 | 1048 | 0 | 395 |
>TRINITY_DN101454_c0_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoformGTTGACCATGGGGATAACCCTAGGCCATCCACTTACACCGCTTACACCTAAATGCCATCATCCCCCCAAAAAATTACTTACCATGAAAAAGGCTGCTACTTAACTTCCATAACTATACCACCGGTTGGTGAGAGGCCCAAGAAAGTGATTAGACTTTCAGGGACTTTTGTAGTTTAAATTTTGATTGTTTAATCTCTTGA
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TTGGCAATGCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGGAATCTGAGAATCCAACGATAGGTCTATTTATAGGATACATTTCATTTGAGCTTTTACATAGAACTTTGATTGCCATGTTAATTTTGGGAGTCAACATCATTCTGGCCAAGTTATA
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GGTGATTGCCCTTAAATGACATCTACTTTTGGGATATGATTTTGAATATGCTTTCTGCACTAATTCGTTTTGAATCTGAAAATACTCCCAGTGCAGGCACCATCGAAGCCAAGGGTTTTTTGTTCAGATTTTTGTGTTGGCCACAACCATAAAAAGTGTGTTTTTTTGCCTACAGAAGTCCCTTTATGTAGTTGCTTCCT
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TGGTTCTGCAGCTTTTGTGACATTGTGTTCCAGTTATTCTACTGTATAGCTGTACTTCTAGAAATATGCTGATGTTGTAATCTTTTATATGTTAGGAAGGTTGATAAGAATCAGATGTTGAAGTAGTTGAAAGGCCCTTTTAATTTTTAATGATGTAGTGTTGCTCAACTATTACTAAATTATG
>TRINITY_DN101454_c0_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:GACGATGGTGTTTTCTCTACTgtaattatttatcctttcttttgcccctccaattcttaattttggtataaatctccgatacatttttttgggttttttatatgatctcagttttttggggttttatatgatctcagtgtgtgggtatgaatattttgcgatgtcttgacgatagtggtttttatgtatagaatatattt
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tatatagagataggataatatagagataggatttgcagatggcttttcttttcttccttgtagtgtaaaatgttgtttaatccttttgttgctgttagttcaagtaaccaaattttttgaggttcatcgtaggtgagacactatgtcgtatgaaaaattgctggattgtgaagtgttaaactataattcattacgacgca
ttgtttttcttagtttttgctgttgtttctcagGTTACAATGACATTTGAGGAACCAGAAGTAGGGGTTACCATAGTGAAGCTTACACAGACCAACGTGCCTGAAGAAGACAGGTTTGGCAATGCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGG
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GTGCAAGCACCAAAACCACTGGGAATTGAACCTGGGGCAGTTGAGGTAAACACACACTGGTTTACTGCTGAACAACAGCTGAACAGACTTGAAAGTATATTATTGATGAGTTCATAGATCTGGATGTTACAGTTTGTAGAGAGACCTTTCTTGATATTTGAGGTGTAAATTGCTGGGCTATTGATTAACCTTGGAATACA
TATTCAACAACTTTGTAATCACACAACGATGACATTCTGTAGCCTAATTGTTATTGATTGTGGATCCATGTGCTAACTGGTAGAAGGCCAATATCTTACCCATGTGAATGTATGTTGGTTCTGCAGCTTTTGTGACATTGTGTTCCAGTTATTCTACTGTATAGCTGTACTTCTAGAAATATGCTGATGTTGTAATCTTT
TATATGTTAGGAAGGTTGATAAGAATCAGATGTTGAAGTAGTTGAAAGGCCCTTTTAATTTTTAATGATGTAGTGTTGCTCAACTATTACTAAATTATG
Intron 2 GTTACAATGA ... AAGAAGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 72.66 | 70 | 205 | 167 |
| A2 | 78.12 | 50 | 190 | 167 |
| A3 | 77.96 | 53 | 215 | 160 |
| A4 | 71.54 | 71 | 199 | 158 |
| A5 | 76.15 | 26 | 92 | 74 |
| A6 | 78.96 | 360 | 1530 | 1172 |
| A7 | 79.65 | 302 | 1340 | 1024 |
| A8 | 77.71 | 312 | 1181 | 995 |
| A9 | 76.42 | 299 | 1071 | 867 |
| A10 | 79.02 | 248 | 1048 | 820 |
>TRINITY_DN105453_c0_g1_i2 from sample A5 / Example spliced isoformTGAGAGGCCCAAGAAAGTGATTAGACTTTCAGGGACTTTTGTAGTTTAAATTTTGATTGTTTAATCTCTTGAGGCATTCAGGGACATTCTAGTTTTTTTTCTGGAGGTTGGAGGTTATATTCGAATAATACCTTTAGGCTTTTCCAGAGGATTCCTCCTAACTATTATTCCATCCAAAGCACAAGCCCAAGCCGACATAA
ATTGGAATTGTGATCGATCACAACGAAACAAAGCCCATTATTCTATTCCAGACAAACTCACGGACATAAATTATACAGACAAAGAAAACCAGGAGCACAGCAATGGCGAAATTCGGAGCGGGTGACAAGAGATGGATAGTGGACGACAGAGCGGACGGGAAGAACGTCCATAACTGGCATTGGGCTGAGAAGGACTGCCT
GGAATGGTCCAGGGGACGCCTTGCCGACCTCCTTCAAGACCTCACAGTTCTTGATGGCCATGCCCAGGGCGCTAATTTGATCTTCTTTATCAAAACCCGCACAGTGGACAAGGTGGAGGGCGAGGCCTACATTAATATCCGCAAGGGAAAGGTCATCCCGGGCTACGAGCTCACTGTCACGATCTCATGGAGCGGCGAGG
CCAAGGATGAGAGCGGCAACACCCTCGCCACCGTAGACGGCAATCTCCACCTGCCTTACCTCGCCGACGAGAATGCTGACCAAGACCCTGAGATCAAAATCTCTGTCAATACCGACACACCCTACGCAGAGGAGCTCCGCCAGGCCTTTCTTGCCCACGGGAAGCCGCTCATATTAGAGAGAGTGAAACAATACACTCAG
CATATGACCGCCGGAGGGCCGGCCAAAGACGAGCTCGAGTCCAAAGTCCTTGCATCCAAAGACAAACCCTCTAAACCCAAGCTCCCTGAGAAAGGCGTGGAAGGAAAGCAGACTCCTCCTCCCCCTACTCCGGCTGTCAAGGAGGGTTTCAAGACCATTCACCTGACGGAGAAGTTCCATTGCAGGCCTCGCGATATATT
CGACATTCTCATGGACGAGAATAGATGGAAGGGCTTCACTCAGAGTAATGCCAAGATTAGCCGAGAGGTTGGCGGTTCTTTCTCTTTATTTGACGGTGCCATCACGGGTGTGTTTCAGGATTTGCAGCAAGACAAGCTTCTCGTTCAAAAATGGAGATTCGGGAACTGGGACGATGGTGTTTTCTCTACTGTTTGGCAAT
GCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGGAATCTGAGAATCCAACGATAGGTCTATTTATAGGATACATTTCATTTGAGCTTTTACATAGAACTTTGATTGCCATGTTAATTTTGGGAGTCAACATCATTCTGGCCAAGTTATACATGGCAT
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ATCACATAATGATGTGATGTTCCTTATCCAAAG
>TRINITY_DN105453_c0_g1_i1 from sample A5 / Example unspliced isoform:TGAGAGGCCCAAGAAAGTGATTAGACTTTCAGGGACTTTTGTAGTTTAAATTTTGATTGTTTAATCTCTTGAGGCATTCAGGGACATTCTAGTTTTTTTTCTGGAGGTTGGAGGTTATATTCGAATAATACCTTTAGGCTTTTCCAGAGGATTCCTCCTAACTATTATTCCATCCAAAGCACAAGCCCAAGCCGACATAA
ATTGGAATTGTGATCGATCACAACGAAACAAAGCCCATTATTCTATTCCAGACAAACTCACGGACATAAATTATACAGACAAAGAAAACCAGGAGCACAGCAATGGCGAAATTCGGAGCGGGTGACAAGAGATGGATAGTGGACGACAGAGCGGACGGGAAGAACGTCCATAACTGGCATTGGGCTGAGAAGGACTGCCT
GGAATGGTCCAGGGGACGCCTTGCCGACCTCCTTCAAGACCTCACAGTTCTTGATGGCCATGCCCAGGGCGCTAATTTGATCTTCTTTATCAAAACCCGCACAGTGGACAAGGTGGAGGGCGAGGCCTACATTAATATCCGCAAGGGAAAGGTCATCCCGGGCTACGAGCTCACTGTCACGATCTCATGGAGCGGCGAGG
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CATATGACCGCCGGAGGGCCGGCCAAAGACGAGCTCGAGTCCAAAGTCCTTGCATCCAAAGACAAACCCTCTAAACCCAAGCTCCCTGAGAAAGGCGTGGAAGGAAAGCAGACTCCTCCTCCCCCTACTCCGGCTGTCAAGGAGGGTTTCAAGACCATTCACCTGACGGAGAAGTTCCATTGCAGGCCTCGCGATATATT
CGACATTCTCATGGACGAGAATAGATGGAAGGGCTTCACTCAGAGTAATGCCAAGATTAGCCGAGAGGTTGGCGGTTCTTTCTCTTTATTTGACGGTGCCATCACGGGTGTGTTTCAGGATTTGCAGCAAGACAAGCTTCTCGTTCAAAAATGGAGATTCGGGAACTGGGACGATGGTGTTTTCTCTACTgttacaatga
catttgaggaaccagaagtaggggttaccatagtgaagcttacacagaccaacgtgcctgaagaagacagGTTTGGCAATGCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGGAATCTGAGAATCCAACGATAGGTCTATTTATAGGATACATTTC
ATTTGAGCTTTTACATAGAACTTTGATTGCCATGTTAATTTTGGGAGTCAACATCATTCTGGCCAAGTTATACATGGCATATAACAAATACATTAGCATCCCTGCATACGTCAATGCATTTTTCTCACTGCAAGATTGGAGTTTGTAATTAACTATTTTGGTTTAGATATAGATGGGAGAGCATAAATACATTGGCAGTG
CTACGGACATGTAAAGTATGTTCCTGCTGTGAGACTCTGGCATGTAATGTTTTTTTTAATGAAATGATGATGGCTGTTTACTTGCCAGATTAATGGCTGTTTACTTGCCATATTCGCAACTACCTCCCTCGCTAGTTATGAGTACCGGTATGAGGCATTATGGATATTTAGTAATGCTTTACAACTACGTACGTCTGCTT
GGAAGCATGGTTATTTAGTATTTGTTTTGAAATCAGTGCCCTGAAAGTTAAATGCATGTCAATAGAGGGCGTGGTGATTGCCCTTAAATGACATCTACTTTTGGGATATGATTTTGAATATGCTTTCTGCACTAATTCGTTTTGAATCTGAAAATACTCCCAGTGCAGGCACCATCGAAGCCAAGGGTTTTTTGTTCAGA
TTTTTGTGTTGGCCACAACCATAAAAAGTGTGTTTTTTTGCCTACAGAAGTCCCTTTATGTAGTTGTTTCCTTAAAGTACATTGTGTTTTTTAAACAGAAACTCCCCATTTTTAGGTGGACGTGTCGCTCTGATGATTTCCTGGTAGTTGAGAGAAGGTGCAAGCACCAAAACCACTGGGAATTGAACCTGGGGCAGTTG
AGGTAAACACACACTGGTTTACTGCTGAACAACAGCTGAACAGACTTGAAAGTATATTATTGATGAGTTCATAGATCTGGATGTTACAGTTTGTAGAGAGACCTTTCTTGATATTTGAGGTGTAAATTGCTAGGCTATTGATTAACCTTGGAATACATATTCAACAACTTTGTAATCACACAACGATGACATTCTGTAGC
CTAATTGTTATTGATTGTGGATCCATGTGCTAACTGGTAGAAGGCCAATATCTTACCCATGTGAATGTATGTTGGTTCTGCAGCTTTTGTGACATTGTGTTCCAGTTATTCTACTGTATAGCTGTACTTCTAGAAATATGCTGATGTTGTAATCTTTTATATGTTAGGAAGGTTGATAAGAATCAGATGTTGAAGTAGTT
GAAAGGCCCTTTTAATTTTTAATGATGTAGTGTTGCTCAACTATTACTAAATTATGGAGGGCACCTTCAAAAACTCTACAATCACATAATGATGTGATGTTCCTTATCCAAAG