NA ----> NA


Intron 1 GTAATTATTT ... TGTTTCTCAG

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>TRINITY_DN101454_c0_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoform
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TAATTTGATCTTCTTTATCAAAACCCGCACAGTGGACAAGGTGGAGGGCGAGGCCTACATTAATATCCGCAAGGGAAAGGTCATCCCGGGCTACGAGCTCACTGTCACGATCTCATGGAGCGGCGAGGCCAAGGATGAGAGCGGCAACACCCTCGCCACCGTAGACGGCAATCTCCACCTGCCTTACCTCGCCGACGAGA
ATGCTGACCAAGACCCTGAGATCAAAATCTCTGTCAATACCGACACACCCTACGCAGAGGAGCTCCGCCAGGCCTTTCTTGCCCACGGGAAGCCGCTCATATTAGAGAGAGTGAAACAATACACTCAGCATATGACCGCCGGAGGGCCGGCCAAAGACGAGCTCGAGTCCAAAGTCCTTGCATCCAAAGACAAACCCTCT
AAACCCAAGCTCCCTGAGAAAGGCGTGGAAGGAAAGCAGACTCCTCCTCCCCCTACTCCGGCTGTCAAGGAGGGTTTCAAGACCATTCGCCTGACGGAGAAGTTCCATTGCAGGCCTCGCGATATATTCGACATTCTCATGGACGAGAATAGATGGAAGGGCTTCACTCAGAGTAATGCCAAGATTAGCCGAGAGGTTGG
CGGTTCTTTCTCTTTATTTGACGGTGCCATCACGGGTGTGTTTCAGGATTTGCAGCAAGACAAGCTTCTCGTTCAAAAATGGAGATTCGGGAATTGGGACGATGGTGTTTTCTCTACTGTTACAATGACATTTGAGGAACCAGAAGTAGGGGTTACCATAGTGAAGCTTACACAGACCAACGTGCCTGAAGAAGACAGGT
TTGGCAATGCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGGAATCTGAGAATCCAACGATAGGTCTATTTATAGGATACATTTCATTTGAGCTTTTACATAGAACTTTGATTGCCATGTTAATTTTGGGAGTCAACATCATTCTGGCCAAGTTATA
CATGGCATATAACAAATACATTAGCATCCCTGCATACGTCAATGCATTTTTCTCACTGCAAGATTGGAGTTTGTAATTAACTATTTTGGTTTAGATATAGATGGGAGAGCATAAATACATTGGCAGTGCTACGGACATGTAAAGTATGTTCCTGCTGTGAGACTCTGGCATGTAATGTTTTTTTTAATGAAATGATGATG
GCTGTTTACTTGCCAGATTAATGGCTGTTTACTTGCCATATTCGCAACTACCTCCCTCGCTAGTTATGAGTACCAGTATGAGGCATTATGGATATTTAGTAATGCTTTACAACTACGTACGTCTGCTTGGAAGCATGGTTATTTAGTATTTGTTTTCAAATCAGTGCCCTGAAAGTTAAATGCATGTCAGTAGAGGGCGT
GGTGATTGCCCTTAAATGACATCTACTTTTGGGATATGATTTTGAATATGCTTTCTGCACTAATTCGTTTTGAATCTGAAAATACTCCCAGTGCAGGCACCATCGAAGCCAAGGGTTTTTTGTTCAGATTTTTGTGTTGGCCACAACCATAAAAAGTGTGTTTTTTTGCCTACAGAAGTCCCTTTATGTAGTTGCTTCCT
TAAAGTACATTGTGTTTTTTAAACAGAAACTCCCCATTTTTAGGTGGACGTGTCGCTCTGATGATTTCCTGGTAGTTGAGAGAAGGTGCAAGCACCAAAACCACTGGGAATTGAACCTGGGGCAGTTGAGGTAAACACACACTGGTTTACTGCTGAACAACAGCTGAACAGACTTGAAAGTATATTATTGATGAGTTCAT
AGATCTGGATGTTACAGTTTGTAGAGAGACCTTTCTTGATATTTGAGGTGTAAATTGCTGGGCTATTGATTAACCTTGGAATACATATTCAACAACTTTGTAATCACACAACGATGACATTCTGTAGCCTAATTGTTATTGATTGTGGATCCATGTGCTAACTGGTAGAAGGCCAATATCTTACCCATGTGAATGTATGT
TGGTTCTGCAGCTTTTGTGACATTGTGTTCCAGTTATTCTACTGTATAGCTGTACTTCTAGAAATATGCTGATGTTGTAATCTTTTATATGTTAGGAAGGTTGATAAGAATCAGATGTTGAAGTAGTTGAAAGGCCCTTTTAATTTTTAATGATGTAGTGTTGCTCAACTATTACTAAATTATG


>TRINITY_DN101454_c0_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:
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ttgaatggcttgataaagacacaccgccagtttagggatctattgaatctttgatttacagtctagggatacagtctaggacgtggggcttgttgtaccaagaaaagcaaggtatattctacagatcgatccagcaacaccgtcataggctcatctaagccccagtctgatatgcagctcaaggttgcaaattttgaggg
tgcgtctgttgaattcacacagatgaccaacgtatcgaatattgaaactggagatatgcaaccatatattgaaactggaaatatgcagcaaggtgcattctacagcccgggtgggtgtgatacattaacactgtcatagactcatctaaaccccaccctgatatgcagctcaagtttgcaaatctcgatgatgcattttt
tgaattcacaccaatgaccaaagtatcaaatattgaaactgaagatgtgcaaccatatatcggaactgtaaatatgaaacctcgaaatgcgtatcagaaataggtttaaatgggcttgtgatagtttaaagttataaacccttcaaagatttaacgtactttaagataagcatgaacaaaaattcattatccaaagaaac
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tatatagagataggataatatagagataggatttgcagatggcttttcttttcttccttgtagtgtaaaatgttgtttaatccttttgttgctgttagttcaagtaaccaaattttttgaggttcatcgtaggtgagacactatgtcgtatgaaaaattgctggattgtgaagtgttaaactataattcattacgacgca
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GTTACAATGACATTTGAGGAACCAGAAGTAGGGGTTACCATAGTGAAGCTTACACAGACCAACGTGCCTGAAGAAGACAGGTTTGGCAATGCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGG
AATCTGAGAATCCAACGATAGGTCTATTTATAGGATACATTTCATTTGAGCTTTTACATAGAACTTTGATTGCCATGTTAATTTTGGGAGTCAACATCATTCTGGCCAAGTTATACATGGCATATAACAAATACATTAGCATCCCTGCATACGTCAATGCATTTTTCTCACTGCAAGATTGGAGTTTGTAATTAACTATT
TTGGTTTAGATATAGATGGGAGAGCATAAATACATTGGCAGTGCTACGGACATGTAAAGTATGTTCCTGCTGTGAGACTCTGGCATGTAATGTTTTTTTTAATGAAATGATGATGGCTGTTTACTTGCCAGATTAATGGCTGTTTACTTGCCATATTCGCAACTACCTCCCTCGCTAGTTATGAGTACCAGTATGAGGCA
TTATGGATATTTAGTAATGCTTTACAACTACGTACGTCTGCTTGGAAGCATGGTTATTTAGTATTTGTTTTCAAATCAGTGCCCTGAAAGTTAAATGCATGTCAGTAGAGGGCGTGGTGATTGCCCTTAAATGACATCTACTTTTGGGATATGATTTTGAATATGCTTTCTGCACTAATTCGTTTTGAATCTGAAAATAC
TCCCAGTGCAGGCACCATCGAAGCCAAGGGTTTTTTGTTCAGATTTTTGTGTTGGCCACAACCATAAAAAGTGTGTTTTTTTGCCTACAGAAGTCCCTTTATGTAGTTGCTTCCTTAAAGTACATTGTGTTTTTTAAACAGAAACTCCCCATTTTTAGGTGGACGTGTCGCTCTGATGATTTCCTGGTAGTTGAGAGAAG
GTGCAAGCACCAAAACCACTGGGAATTGAACCTGGGGCAGTTGAGGTAAACACACACTGGTTTACTGCTGAACAACAGCTGAACAGACTTGAAAGTATATTATTGATGAGTTCATAGATCTGGATGTTACAGTTTGTAGAGAGACCTTTCTTGATATTTGAGGTGTAAATTGCTGGGCTATTGATTAACCTTGGAATACA
TATTCAACAACTTTGTAATCACACAACGATGACATTCTGTAGCCTAATTGTTATTGATTGTGGATCCATGTGCTAACTGGTAGAAGGCCAATATCTTACCCATGTGAATGTATGTTGGTTCTGCAGCTTTTGTGACATTGTGTTCCAGTTATTCTACTGTATAGCTGTACTTCTAGAAATATGCTGATGTTGTAATCTTT
TATATGTTAGGAAGGTTGATAAGAATCAGATGTTGAAGTAGTTGAAAGGCCCTTTTAATTTTTAATGATGTAGTGTTGCTCAACTATTACTAAATTATG




Intron 2 GTTACAATGA ... AAGAAGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A172.6670205167
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>TRINITY_DN105453_c0_g1_i2 from sample A5 / Example spliced isoform
TGAGAGGCCCAAGAAAGTGATTAGACTTTCAGGGACTTTTGTAGTTTAAATTTTGATTGTTTAATCTCTTGAGGCATTCAGGGACATTCTAGTTTTTTTTCTGGAGGTTGGAGGTTATATTCGAATAATACCTTTAGGCTTTTCCAGAGGATTCCTCCTAACTATTATTCCATCCAAAGCACAAGCCCAAGCCGACATAA
ATTGGAATTGTGATCGATCACAACGAAACAAAGCCCATTATTCTATTCCAGACAAACTCACGGACATAAATTATACAGACAAAGAAAACCAGGAGCACAGCAATGGCGAAATTCGGAGCGGGTGACAAGAGATGGATAGTGGACGACAGAGCGGACGGGAAGAACGTCCATAACTGGCATTGGGCTGAGAAGGACTGCCT
GGAATGGTCCAGGGGACGCCTTGCCGACCTCCTTCAAGACCTCACAGTTCTTGATGGCCATGCCCAGGGCGCTAATTTGATCTTCTTTATCAAAACCCGCACAGTGGACAAGGTGGAGGGCGAGGCCTACATTAATATCCGCAAGGGAAAGGTCATCCCGGGCTACGAGCTCACTGTCACGATCTCATGGAGCGGCGAGG
CCAAGGATGAGAGCGGCAACACCCTCGCCACCGTAGACGGCAATCTCCACCTGCCTTACCTCGCCGACGAGAATGCTGACCAAGACCCTGAGATCAAAATCTCTGTCAATACCGACACACCCTACGCAGAGGAGCTCCGCCAGGCCTTTCTTGCCCACGGGAAGCCGCTCATATTAGAGAGAGTGAAACAATACACTCAG
CATATGACCGCCGGAGGGCCGGCCAAAGACGAGCTCGAGTCCAAAGTCCTTGCATCCAAAGACAAACCCTCTAAACCCAAGCTCCCTGAGAAAGGCGTGGAAGGAAAGCAGACTCCTCCTCCCCCTACTCCGGCTGTCAAGGAGGGTTTCAAGACCATTCACCTGACGGAGAAGTTCCATTGCAGGCCTCGCGATATATT
CGACATTCTCATGGACGAGAATAGATGGAAGGGCTTCACTCAGAGTAATGCCAAGATTAGCCGAGAGGTTGGCGGTTCTTTCTCTTTATTTGACGGTGCCATCACGGGTGTGTTTCAGGATTTGCAGCAAGACAAGCTTCTCGTTCAAAAATGGAGATTCGGGAACTGGGACGATGGTGTTTTCTCTACTGTTTGGCAAT
GCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGGAATCTGAGAATCCAACGATAGGTCTATTTATAGGATACATTTCATTTGAGCTTTTACATAGAACTTTGATTGCCATGTTAATTTTGGGAGTCAACATCATTCTGGCCAAGTTATACATGGCAT
ATAACAAATACATTAGCATCCCTGCATACGTCAATGCATTTTTCTCACTGCAAGATTGGAGTTTGTAATTAACTATTTTGGTTTAGATATAGATGGGAGAGCATAAATACATTGGCAGTGCTACGGACATGTAAAGTATGTTCCTGCTGTGAGACTCTGGCATGTAATGTTTTTTTTAATGAAATGATGATGGCTGTTTA
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ATTGTGTTTTTTAAACAGAAACTCCCCATTTTTAGGTGGACGTGTCGCTCTGATGATTTCCTGGTAGTTGAGAGAAGGTGCAAGCACCAAAACCACTGGGAATTGAACCTGGGGCAGTTGAGGTAAACACACACTGGTTTACTGCTGAACAACAGCTGAACAGACTTGAAAGTATATTATTGATGAGTTCATAGATCTGG
ATGTTACAGTTTGTAGAGAGACCTTTCTTGATATTTGAGGTGTAAATTGCTAGGCTATTGATTAACCTTGGAATACATATTCAACAACTTTGTAATCACACAACGATGACATTCTGTAGCCTAATTGTTATTGATTGTGGATCCATGTGCTAACTGGTAGAAGGCCAATATCTTACCCATGTGAATGTATGTTGGTTCTG
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ATCACATAATGATGTGATGTTCCTTATCCAAAG


>TRINITY_DN105453_c0_g1_i1 from sample A5 / Example unspliced isoform:
TGAGAGGCCCAAGAAAGTGATTAGACTTTCAGGGACTTTTGTAGTTTAAATTTTGATTGTTTAATCTCTTGAGGCATTCAGGGACATTCTAGTTTTTTTTCTGGAGGTTGGAGGTTATATTCGAATAATACCTTTAGGCTTTTCCAGAGGATTCCTCCTAACTATTATTCCATCCAAAGCACAAGCCCAAGCCGACATAA
ATTGGAATTGTGATCGATCACAACGAAACAAAGCCCATTATTCTATTCCAGACAAACTCACGGACATAAATTATACAGACAAAGAAAACCAGGAGCACAGCAATGGCGAAATTCGGAGCGGGTGACAAGAGATGGATAGTGGACGACAGAGCGGACGGGAAGAACGTCCATAACTGGCATTGGGCTGAGAAGGACTGCCT
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CCAAGGATGAGAGCGGCAACACCCTCGCCACCGTAGACGGCAATCTCCACCTGCCTTACCTCGCCGACGAGAATGCTGACCAAGACCCTGAGATCAAAATCTCTGTCAATACCGACACACCCTACGCAGAGGAGCTCCGCCAGGCCTTTCTTGCCCACGGGAAGCCGCTCATATTAGAGAGAGTGAAACAATACACTCAG
CATATGACCGCCGGAGGGCCGGCCAAAGACGAGCTCGAGTCCAAAGTCCTTGCATCCAAAGACAAACCCTCTAAACCCAAGCTCCCTGAGAAAGGCGTGGAAGGAAAGCAGACTCCTCCTCCCCCTACTCCGGCTGTCAAGGAGGGTTTCAAGACCATTCACCTGACGGAGAAGTTCCATTGCAGGCCTCGCGATATATT
CGACATTCTCATGGACGAGAATAGATGGAAGGGCTTCACTCAGAGTAATGCCAAGATTAGCCGAGAGGTTGGCGGTTCTTTCTCTTTATTTGACGGTGCCATCACGGGTGTGTTTCAGGATTTGCAGCAAGACAAGCTTCTCGTTCAAAAATGGAGATTCGGGAACTGGGACGATGGTGTTTTCTCTACTgttacaatga
catttgaggaaccagaagtaggggttaccatagtgaagcttacacagaccaacgtgcctgaagaagacag
GTTTGGCAATGCTACAGTGGTGGAGAACACTGAGAGGGGTTGGAGGGAGCTTATTTTCCACAAGATTCGAGCAGTCTTTGGATATGGAATCTGAGAATCCAACGATAGGTCTATTTATAGGATACATTTC
ATTTGAGCTTTTACATAGAACTTTGATTGCCATGTTAATTTTGGGAGTCAACATCATTCTGGCCAAGTTATACATGGCATATAACAAATACATTAGCATCCCTGCATACGTCAATGCATTTTTCTCACTGCAAGATTGGAGTTTGTAATTAACTATTTTGGTTTAGATATAGATGGGAGAGCATAAATACATTGGCAGTG
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GGAAGCATGGTTATTTAGTATTTGTTTTGAAATCAGTGCCCTGAAAGTTAAATGCATGTCAATAGAGGGCGTGGTGATTGCCCTTAAATGACATCTACTTTTGGGATATGATTTTGAATATGCTTTCTGCACTAATTCGTTTTGAATCTGAAAATACTCCCAGTGCAGGCACCATCGAAGCCAAGGGTTTTTTGTTCAGA
TTTTTGTGTTGGCCACAACCATAAAAAGTGTGTTTTTTTGCCTACAGAAGTCCCTTTATGTAGTTGTTTCCTTAAAGTACATTGTGTTTTTTAAACAGAAACTCCCCATTTTTAGGTGGACGTGTCGCTCTGATGATTTCCTGGTAGTTGAGAGAAGGTGCAAGCACCAAAACCACTGGGAATTGAACCTGGGGCAGTTG
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CTAATTGTTATTGATTGTGGATCCATGTGCTAACTGGTAGAAGGCCAATATCTTACCCATGTGAATGTATGTTGGTTCTGCAGCTTTTGTGACATTGTGTTCCAGTTATTCTACTGTATAGCTGTACTTCTAGAAATATGCTGATGTTGTAATCTTTTATATGTTAGGAAGGTTGATAAGAATCAGATGTTGAAGTAGTT
GAAAGGCCCTTTTAATTTTTAATGATGTAGTGTTGCTCAACTATTACTAAATTATGGAGGGCACCTTCAAAAACTCTACAATCACATAATGATGTGATGTTCCTTATCCAAAG