sp|Q9LIC2|TMN7_ARATH ----> Transmembrane 9 superfamily member 7

Intron 1 GTAAGTATTA ... TCTGCGGCAG

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A6	15.22	117	25	17
A7	18.42	206	54	39
A8	22.58	60	11	24
A9	19.44	174	30	54
A10	19.9	163	27	54

>TRINITY_DN118780_c0_g7_i2 from sample A2 / Example spliced isoform

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TTCAAAGGAGTTTGTTTGGGCTTTGCTCCTTGTATTTTTAGTCTCAGGTGCAAATTGCTTCTATCTTCCCGGTGTAGCCCCTCAGGACTTCAGTAAGGGTGATGAGCTCCAGGTTAAAGTGAACAAGTTATCTTCCATAAAGACGCAGCTTCCTTATGATTTTTATTCTCTGGATTACTGTAAACCAAAAACAATTGTCA
ACAGTGCTGAAAATCTTGGAGAAGTTCTTCGTGGAGATCGCATTGAGAACTCTCCTTATGCGTTCCATATGAGAGAGGTGAAGCTCTGTAATTATGTATGCCGGATAAAGCTCGATGCAAAGTCCGCAAAGAACTTTAAGGAGAAAATAGATGATGAATACCGTGTTAACATGATTCTGGATAATCTACCTGTGGCTGTA
GCCAGACAAAGAGCTGATGGAACTTCATATGAACATGGCTTCCGTGTTGGGTTTAAAGCAAGCTATGCAGGGAGTTCAGAAGAGAGATACTTCATACACAACCATCTGTCTTTTGAGGTTAAGTTTCACAAAGATTCAGAGGCTGATTCTGCTCGGATTGTTGGATTTGAAGTCACACCATATAGCGTCAAGCATGAGCA
TGAGCAACCTTGGTCTGAGGATAATCCCCGTTTGACAACCTGCAACCCAAACACCAAGCACTACGTTTCACAAACTAATAGTCCGCAAGAAGTTGATGAGGGTAAAGATATTATATTTACCTATGATGTGGCATTCAAGGAAAGCCCTATCAAATGGGCTTCTCGATGGGATACATATCTTCTCATGACAGATGATCAGA
TCCACTGGTTCTCTATTATCAACTCATTAATGATTGTTTTGTTCCTTTCTGGGATGGTGGCAATGATTATGATGAGAACCTTGTATCGGGATATCTCAAACTACAATCAACTGGAGACACAGGATGAAGCCCAAGAAGAAACCGGATGGAAACTTGTCCATGGAGATGCATTCAGGCCCCCAAATAATGCAGGTCTGCTC
TGTGTCTATGCAGGAACTGGAGTACAGTTTTTTGGGATGACACTTGTTACAATGATATTTGCCATGCTTGGGTTTCTTTCACCATCCAACCGTGGTGGACTGATGACAGCTATGGTTCTCTTGTGGGTGTTCATGGGTTTGTTTGCTGGTTACTCTTCTGCTCGTCTGTATAAGATGTTTAAGGGCACAGAATGGAAAAC
AAACACACTGAAGACAGCTTTCACGTTCCCTGGAATTGTTTTTGGCATTTTCTTTGTTCTCAATGCACTGATTTGGGGTGAAAAGTCCTCTGGTGCATTACCATTTGGAACAATGTTTGCTTTGGTATTTTTATGGTTTGGGATATCTGTGCCTTTGGTCTTTGTTGGTAGTTACTTTGGCTACAAGAAACCTGCAATTG
AGGATCCAGTGAAAACCAATAAAATCCCCAGGCAGATTCCAGAGCAGGCATGGTACATGCAGCCAGTTTTCTCCGTACTCATTGGAGGCATATTGCCATTTGGTGCAGTTTTCATTGAATTATTCTTCATCTTAACGTCGATCTGGCTACATCAATTCTATTACATTTTTGGGTTCCTGTTCATTGTCTTTGTTATCCTT
ATTGTTACTTGTGCAGAGATCACTATTGTCCTTTGCTACTTTCAGTTGTGTAGTGAGGACTACCACTGGTGGTGGAGAGCTTATCTAACTTCAGGCTCGTCTGCACTGTACTTATTCCTGTATGCTACATTCTACTTCTTCACCAAGCTGGAGATCACAAAACTTGTGTCTGGTATTCTGTACTTTGGCTACATGACAAT
TATCTCATATGCTTTCTTTGTATTGACTGGTACAATCGGTTTCTATGCGTGCTTCTGGTTTGTACGGACCATTTATGCTTCAGTGAAGATTGACTGAAGCTACATGTAGCCAAATTTTTCTCGGGGCTCAAATTTGCATTTGTTGAGCAGAATCAAGTAGTAGAATGGAAGACGTGCATTCTTTTCTCTGGTATTTAGGA
AACTAGAACAGGAGTTTTCATGTGCTAGCAAGAGGAGATATCTTAGAGGATATCATGAACATCACGTATCAGTTGGTTACAAGGTACTATTTTTTTAAAGTTGCAGACTACCAAGTTATTCTGCATTGTACTCAAATGAGGTAGTTAGGACAGAATTTTTTCCTTGATGTACTGTTTGCAATGAATTATGGCTCATACTT
ATTATGGCTTCCATGCCTTTCAATCAGACTCTGGTGGCATACCATTTGCTATGCAAGATTTATGATATATGATATACAGATATTTTTGGTATTCAGTTGCTTCCAACATAAGCTTTCAGACTTGGACAATCATGCTATGCTTTATTCACCTATGTTATAACACTTACAGAGGTGTTGTTATGGTATAGAGATATTTAATA
CTTTG

>TRINITY_DN118780_c0_g7_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CGCTGAGACATCTCTTTCTTCGAGGGAACTTAGCTAATCTAATGCAAATCAGAGTATCTATAGAGAGTCAGATCTGTTTATATTGAGAGCAGAGTATCCGTTCATAGTCAGATCTGTTTATATAGAGAACCAACTAATCTGTTCCTGTCCGCTTGGGTTTTGTGGTTCTCGAGGGCTCCTTCAAGCTGAGCCTCAATGGC
TTCAAAGGAGTTTGTTTGGGCTTTGCTCCTTGTATTTTTAGTCTCAGGTGCAAATTGCTTCTATCTTCCCGGTGTAGCCCCTCAGGACTTCAGTAAGGGTGATGAGCTCCAGGTTAAAGTGAACAAGTTATCTTCCATAAAGACGCAGCTTCCTTATGATTTTTATTCTCTGGATTACTGTAAACCAAAAACAATTGTCA
ACAGTGCTGAAAATCTTGGAGAAGTTCTTCGTGGAGATCGCATTGAGAACTCTCCTTATGCGgtaagtattatggtttccgttcttggcttagttcttcattggattggtcctaaggactcgagttttcttttctttgcggaattttttgaaggtataaaagtgtgcacgcagaagaaagtatggctagagctttagggt
ctgtgtagcattgtgtgatggattgttgacatcttgtcagaattggcattatgcgtacttgttagcaagtcgctggaactaccagcctaaacaactttttgtgaccaattatttaaccggtttcttctgcggcagTTCCATATGAGAGAGGTGAAGCTCTGTAATTATGTATGCCGGATAAAGCTCGATGCAAAGTCCGC
AAAGAACTTTAAGGAGAAAATAGATGATGAATACCGTGTTAACATGATTCTGGATAATCTACCTGTGGCTGTAGCCAGACAAAGAGCTGATGGAACTTCATATGAACATGGCTTCCGTGTTGGGTTTAAAGCAAGCTATGCAGGGAGTTCAGAAGAGAGATACTTCATACACAACCATCTGTCTTTTGAGGTTAAGTTTC
ACAAAGATTCAGAGGCTGATTCTGCTCGGATTGTTGGATTTGAAGTCACACCATATAGCGTCAAGCATGAGCATGAGCAACCTTGGTCTGAGGATAATCCCCGTTTGACAACCTGCAACCCAAACACCAAGCACTACGTTTCACAAACTAATAGTCCGCAAGAAGTTGATGAGGGTAAAGATATTATATTTACCTATGAT
GTGGCATTCAAGGAAAGCCCTATCAAATGGGCTTCTCGATGGGATACATATCTTCTCATGACAGATGATCAGATCCACTGGTTCTCTATTATCAACTCATTAATGATTGTTTTGTTCCTTTCTGGGATGGTGGCAATGATTATGATGAGAACCTTGTATCGGGATATCTCAAACTACAATCAACTGGAGACACAGGATGA
AGCCCAAGAAGAAACCGGATGGAAACTTGTCCATGGAGATGCATTCAGGCCCCCAAATAATGCAGGTCTGCTCTGTGTCTATGCAGGAACTGGAGTACAGTTTTTTGGGATGACACTTGTTACAATGATATTTGCCATGCTTGGGTTTCTTTCACCATCCAACCGTGGTGGACTGATGACAGCTATGGTTCTCTTGTGGG
TGTTCATGGGTTTGTTTGCTGGTTACTCTTCTGCTCGTCTGTATAAGATGTTTAAGGGCACAGAATGGAAAACAAACACACTGAAGACAGCTTTCACGTTCCCTGGAATTGTTTTTGGCATTTTCTTTGTTCTCAATGCACTGATTTGGGGTGAAAAGTCCTCTGGTGCATTACCATTTGGAACAATGTTTGCTTTGGTA
TTTTTATGGTTTGGGATATCTGTGCCTTTGGTCTTTGTTGGTAGTTACTTTGGCTACAAGAAACCTGCAATTGAGGATCCAGTGAAAACCAATAAAATCCCCAGGCAGATTCCAGAGCAGGCATGGTACATGCAGCCAGTTTTCTCCGTACTCATTGGAGGCATATTGCCATTTGGTGCAGTTTTCATTGAATTATTCTT
CATCTTAACGTCGATCTGGCTACATCAATTCTATTACATTTTTGGGTTCCTGTTCATTGTCTTTGTTATCCTTATTGTTACTTGTGCAGAGATCACTATTGTCCTTTGCTACTTTCAGTTGTGTAGTGAGGACTACCACTGGTGGTGGAGAGCTTATCTAACTTCAGGCTCGTCTGCACTGTACTTATTCCTGTATGCTA
CATTCTACTTCTTCACCAAGCTGGAGATCACAAAACTTGTGTCTGGTATTCTGTACTTTGGCTACATGACAATTATCTCATATGCTTTCTTTGTATTGACTGGTACAATCGGTTTCTATGCGTGCTTCTGGTTTGTACGGACCATTTATGCTTCAGTGAAGATTGACTGAAGCTACATGTAGCCAAATTTTTCTCGGGGC
TCAAATTTGCATTTGTTGAGCAGAATCAAGTAGTAGAATGGAAGACGTGCATTCTTTTCTCTGGTATTTAGGAAACTAGAACAGGAGTTTTCATGTGCTAGCAAGAGGAGATATCTTAGAGGATATCATGAACATCACGTATCAGTTGGTTACAAG

Intron 2 GTACTATTTT ... TTTCAATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	66.67	35.5	82	60
A2	70.64	19.5	61	32.8
A3	66.52	37	104	43
A4	60.47	34	76	28
A5	70.53	14	34	33
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A8	78.58	231	857	837.7
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A10	70.63	96.5	283	181

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CGCTGAGACATCTCTTTCTTCGAGGGAACTTAGCTAATCTAATGCAAATCAGAGTATCTATAGAGAGTCAGATCTGTTTATATTGAGAGCAGAGTATCCGTTCATAGTCAGATCTGTTTATATAGAGAACCAACTAATCTGTTCCTGTCCGCTTGGGTTTTGTGGTTCTCGAGGGCTCCTTCAAGCTGAGCCTCAATGGC
TTCAAAGGAGTTTGTTTGGGCTTTGCTCCTTGTATTTTTAGTCTCAGGTGCAAATTGCTTCTATCTTCCCGGTGTAGCCCCTCAGGACTTCAGTAAGGGTGATGAGCTCCAGGTTAAAGTGAACAAGTTATCTTCCATAAAGACGCAGCTTCCTTATGATTTTTATTCTCTGGATTACTGTAAACCAAAAACAATTGTCA
ACAGTGCTGAAAATCTTGGAGAAGTTCTTCGTGGAGATCGCATTGAGAACTCTCCTTATGCGTTCCATATGAGAGAGGTGAAGCTCTGTAATTATGTATGCCGGATAAAGCTCGATGCAAAGTCCGCAAAGAACTTTAAGGAGAAAATAGATGATGAATACCGTGTTAACATGATTCTGGATAATCTACCTGTGGCTGTA
GCCAGACAAAGAGCTGATGGAACTTCATATGAACATGGCTTCCGTGTTGGGTTTAAAGCAAGCTATGCAGGGAGTTCAGAAGAGAGATACTTCATACACAACCATCTGTCTTTTGAGGTTAAGTTTCACAAAGATTCAGAGGCTGATTCTGCTCGGATTGTTGGATTTGAAGTCACACCATATAGCGTCAAGCATGAGCA
TGAGCAACCTTGGTCTGAGGATAATCCCCGTTTGACAACCTGCAACCCAAACACCAAGCACTACGTTTCACAAACTAATAGTCCGCAAGAAGTTGATGAGGGTAAAGATATTATATTTACCTATGATGTGGCATTCAAGGAAAGCCCTATCAAATGGGCTTCTCGATGGGATACATATCTTCTCATGACAGATGATCAGA
TCCACTGGTTCTCTATTATCAACTCATTAATGATTGTTTTGTTCCTTTCTGGGATGGTGGCAATGATTATGATGAGAACCTTGTATCGGGATATCTCAAACTACAATCAACTGGAGACACAGGATGAAGCCCAAGAAGAAACCGGATGGAAACTTGTCCATGGAGATGCATTCAGGCCCCCAAATAATGCAGGTCTGCTC
TGTGTCTATGCAGGAACTGGAGTACAGTTTTTTGGGATGACACTTGTTACAATGATATTTGCCATGCTTGGGTTTCTTTCACCATCCAACCGTGGTGGACTGATGACAGCTATGGTTCTCTTGTGGGTGTTCATGGGTTTGTTTGCTGGTTACTCTTCTGCTCGTCTGTATAAGATGTTTAAGGGCACAGAATGGAAAAC
AAACACACTGAAGACAGCTTTCACGTTCCCTGGAATTGTTTTTGGCATTTTCTTTGTTCTCAATGCACTGATTTGGGGTGAAAAGTCCTCTGGTGCATTACCATTTGGAACAATGTTTGCTTTGGTATTTTTATGGTTTGGGATATCTGTGCCTTTGGTCTTTGTTGGTAGTTACTTTGGCTACAAGAAACCTGCAATTG
AGGATCCAGTGAAAACCAATAAAATCCCCAGGCAGATTCCAGAGCAGGCATGGTACATGCAGCCAGTTTTCTCCGTACTCATTGGAGGCATATTGCCATTTGGTGCAGTTTTCATTGAATTATTCTTCATCTTAACGTCGATCTGGCTACATCAATTCTATTACATTTTTGGGTTCCTGTTCATTGTCTTTGTTATCCTT
ATTGTTACTTGTGCAGAGATCACTATTGTCCTTTGCTACTTTCAGTTGTGTAGTGAGGACTACCACTGGTGGTGGAGAGCTTATCTAACTTCAGGCTCGTCTGCACTGTACTTATTCCTGTATGCTACATTCTACTTCTTCACCAAGCTGGAGATCACAAAACTTGTGTCTGGTATTCTGTACTTTGGCTACATGACAAT
TATCTCATATGCTTTCTTTGTATTGACTGGTACAATCGGTTTCTATGCGTGCTTCTGGTTTGTACGGACCATTTATGCTTCAGTGAAGATTGACTGAAGCTACATGTAGCCAAATTTTTCTCGGGGCTCAAATTTGCATTTGTTGAGCAGAATCAAGTAGTAGAATGGAAGACGTGCATTCTTTTCTCTGGTATTTAGGA
AACTAGAACAGGAGTTTTCATGTGCTAGCAAGAGGAGATATCTTAGAGGATATCATGAACATCACGTATCAGTTGGTTACAAGACTCTGGTGGCATACCATTTGCTATGCAAGATTTATGATATATGATATACAGATATTTTTGGTATTCAGTTGCTTCCAACATAAGCTTTCAGACTTGGACAATCATGCTATGCTTTA
TTCACCTATGTTATAACACTTACAGAGGTGTTGTTATGGTATAGAGATATTTAATACTTTG

>TRINITY_DN118780_c0_g7_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CGCTGAGACATCTCTTTCTTCGAGGGAACTTAGCTAATCTAATGCAAATCAGAGTATCTATAGAGAGTCAGATCTGTTTATATTGAGAGCAGAGTATCCGTTCATAGTCAGATCTGTTTATATAGAGAACCAACTAATCTGTTCCTGTCCGCTTGGGTTTTGTGGTTCTCGAGGGCTCCTTCAAGCTGAGCCTCAATGGC
TTCAAAGGAGTTTGTTTGGGCTTTGCTCCTTGTATTTTTAGTCTCAGGTGCAAATTGCTTCTATCTTCCCGGTGTAGCCCCTCAGGACTTCAGTAAGGGTGATGAGCTCCAGGTTAAAGTGAACAAGTTATCTTCCATAAAGACGCAGCTTCCTTATGATTTTTATTCTCTGGATTACTGTAAACCAAAAACAATTGTCA
ACAGTGCTGAAAATCTTGGAGAAGTTCTTCGTGGAGATCGCATTGAGAACTCTCCTTATGCGTTCCATATGAGAGAGGTGAAGCTCTGTAATTATGTATGCCGGATAAAGCTCGATGCAAAGTCCGCAAAGAACTTTAAGGAGAAAATAGATGATGAATACCGTGTTAACATGATTCTGGATAATCTACCTGTGGCTGTA
GCCAGACAAAGAGCTGATGGAACTTCATATGAACATGGCTTCCGTGTTGGGTTTAAAGCAAGCTATGCAGGGAGTTCAGAAGAGAGATACTTCATACACAACCATCTGTCTTTTGAGGTTAAGTTTCACAAAGATTCAGAGGCTGATTCTGCTCGGATTGTTGGATTTGAAGTCACACCATATAGCGTCAAGCATGAGCA
TGAGCAACCTTGGTCTGAGGATAATCCCCGTTTGACAACCTGCAACCCAAACACCAAGCACTACGTTTCACAAACTAATAGTCCGCAAGAAGTTGATGAGGGTAAAGATATTATATTTACCTATGATGTGGCATTCAAGGAAAGCCCTATCAAATGGGCTTCTCGATGGGATACATATCTTCTCATGACAGATGATCAGA
TCCACTGGTTCTCTATTATCAACTCATTAATGATTGTTTTGTTCCTTTCTGGGATGGTGGCAATGATTATGATGAGAACCTTGTATCGGGATATCTCAAACTACAATCAACTGGAGACACAGGATGAAGCCCAAGAAGAAACCGGATGGAAACTTGTCCATGGAGATGCATTCAGGCCCCCAAATAATGCAGGTCTGCTC
TGTGTCTATGCAGGAACTGGAGTACAGTTTTTTGGGATGACACTTGTTACAATGATATTTGCCATGCTTGGGTTTCTTTCACCATCCAACCGTGGTGGACTGATGACAGCTATGGTTCTCTTGTGGGTGTTCATGGGTTTGTTTGCTGGTTACTCTTCTGCTCGTCTGTATAAGATGTTTAAGGGCACAGAATGGAAAAC
AAACACACTGAAGACAGCTTTCACGTTCCCTGGAATTGTTTTTGGCATTTTCTTTGTTCTCAATGCACTGATTTGGGGTGAAAAGTCCTCTGGTGCATTACCATTTGGAACAATGTTTGCTTTGGTATTTTTATGGTTTGGGATATCTGTGCCTTTGGTCTTTGTTGGTAGTTACTTTGGCTACAAGAAACCTGCAATTG
AGGATCCAGTGAAAACCAATAAAATCCCCAGGCAGATTCCAGAGCAGGCATGGTACATGCAGCCAGTTTTCTCCGTACTCATTGGAGGCATATTGCCATTTGGTGCAGTTTTCATTGAATTATTCTTCATCTTAACGTCGATCTGGCTACATCAATTCTATTACATTTTTGGGTTCCTGTTCATTGTCTTTGTTATCCTT
ATTGTTACTTGTGCAGAGATCACTATTGTCCTTTGCTACTTTCAGTTGTGTAGTGAGGACTACCACTGGTGGTGGAGAGCTTATCTAACTTCAGGCTCGTCTGCACTGTACTTATTCCTGTATGCTACATTCTACTTCTTCACCAAGCTGGAGATCACAAAACTTGTGTCTGGTATTCTGTACTTTGGCTACATGACAAT
TATCTCATATGCTTTCTTTGTATTGACTGGTACAATCGGTTTCTATGCGTGCTTCTGGTTTGTACGGACCATTTATGCTTCAGTGAAGATTGACTGAAGCTACATGTAGCCAAATTTTTCTCGGGGCTCAAATTTGCATTTGTTGAGCAGAATCAAGTAGTAGAATGGAAGACGTGCATTCTTTTCTCTGGTATTTAGGA
AACTAGAACAGGAGTTTTCATGTGCTAGCAAGAGGAGATATCTTAGAGGATATCATGAACATCACGTATCAGTTGGTTACAAGgtactatttttttaaagttgcagactaccaagttattctgcattgtactcaaatgaggtagttaggacagaattttttccttgatgtactgtttgcaatgaattatggctcatactt
attatggcttccatgcctttcaatcagACTCTGGTGGCATACCATTTGCTATGCAAGATTTATGATATATGATATACAGATATTTTTGGTATTCAGTTGCTTCCAACATAAGCTTTCAGACTTGGACAATCATGCTATGCTTTATTCACCTATGTTATAACACTTACAGAGGTGTTGTTATGGTATAGAGATATTTAATA
CTTTG

Intron 3 GTACTATTTT ... TTTCAATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	66.36	36	82	60
A2	70.15	20	61	33
A3	66.59	37	104.5	43
A4	60.47	34	76	28
A5	70.53	14	34	33
A6	77.19	267	972	835
A7	73.27	182	554	444
A8	79.18	223	858	838
A9	76.43	183	588	599
A10	70.73	96	283	181

>TRINITY_DN107386_c0_g3_i1 from sample A4 / Example spliced isoform

CTGAGACATCTCTTTCTTCGAGGGAACTCAGCTAATCTAATGTAAATCAGAGTATCTATAGAGAGTCAGATCTGTTTATATTGAGAGCAGAGTATCCGTTCAGAGTCAGATCTGTTTATATAGAGAACCAACTAATCTGTTCCTGTCCGCTTGGGTTTTGTGGTTCTCGAGGGCTCCTTCAAGCTGAGCCTCAATGGCTT
CAAAGGAGTTTGTTTGGGCTTTGCTCCTTGTATTTTTAGTCTCAGGTGCAAATTGCTTCTATCTTCCCGGTGTAGCCCCTCAGGACTTCAGTAAGGGTGATGAGCTCCAGGTTAAAGTGAACAAGTTATCTTCCATAAAGACGCAGCTTCCTTATGATTTTTATTCTCTGGATTACTGTAAACCAAAAACAATTGTCAAC
AGTGCTGAAAATCTTGGAGAAGTTCTTCGTGGAGATCGCATTGAGAACTCTCCTTATGCGTTCCATATGAGAGAGGTGAAGCTCTGTAATTATGTATGCCGGATAAAGCTCGATGCAAAGTCCGCAAAGAACTTTAAGGAGAAAATAGATGATGAATACCGTGTTAACATGATTCTGGATAATCTACCTGTGGCTGTAGC
CAGACAAAGAGCTGATGGAACCTCATATGAACATGGCTTCCGTGTTGGGTTTAAAGCAAGCTATGCAGGGAGTTCAGAAGAGAGATACTTCATACACAACCATCTGTCTTTTGAGGTTAAGTTTCACAAAGATTCAGAGGCTGATTCTGCTCGGATTGTTGGATTTGAAGTCACACCATATAGCGTCAAGCATGAGCATG
AGCAACCTTGGTCTGAGGATAATCCCCGTTTGACAACCTGCAACCCAAACACCAAGCACTACGTTTCACAAACTAATAGTCCGCAAGAAGTTGATGAGGGTAAAGATATTATATTTACCTATGATGTGGCATTCAAGGAAAGCCCTATCAAATGGGCTTCTCGATGGGATACATATCTTCTCATGACAGATGATCAGATC
CACTGGTTCTCTATTATCAACTCATTAATGATTGTTTTGTTCCTTTCTGGGATGGTGGCAATGATTATGATGAGAACCTTGTATCGGGATATCTCAAACTACAATCAACTGGAGACACAGGATGAAGCCCAAGAAGAAACCGGATGGAAACTTGTCCATGGAGATGCATTCAGGCCCCCAAATAATGCAGGTCTGCTCTG
TGTCTATGCAGGAACTGGAGTACAGTTTTTTGGGATGACACTTGTTACAATGATATTTGCCATGCTTGGGTTTCTTTCACCATCCAACCGTGGTGGACTGATGACAGCTATGGTTCTCTTGTGGGTGTTCATGGGTTTGTTTGCTGGTTACTCTTCTGCTCGTCTGTATAAGATGTTTAAGGGCACAGAATGGAAAACAA
ACACACTGAAGACAGCTTTCACGTTCCCTGGAATTGTTTTTGGCATTTTCTTTGTTCTCAATGCACTGATTTGGGGTGAAAAGTCCTCTGGTGCATTACCATTTGGAACAATGTTTGCTTTGGTATTTTTATGGTTTGGGATATCTGTGCCTTTGGTCTTTGTTGGTAGTTACTTTGGCTACAAGAAACCTGCAATTGAA
GATCCTGTTAAGACAAATAAAATCCCCAGGCAGATTCCAGAGCAGGCATGGTACATGCAGCCAGTTTTCTCCGTACTCATTGGAGGCATATTGCCATTTGGTGCAGTTTTCATTGAATTATTCTTCATCTTAACGTCGATCTGGCTACATCAATTCTATTACATTTTTGGGTTCCTGTTCATTGTCTTTGTTATCCTTAT
TGTTACTTGTGCAGAGATCACTATTGTCCTTTGCTACTTTCAGTTGTGTAGTGAGGACTACCACTGGTGGTGGAGAGCTTATCTAACTTCAGGCTCGTCTGCACTGTACTTATTCCTGTATGCTACATTCTACTTCTTCACCAAGCTGGAGATCACAAAACTTGTGTCTGGTATTCTGTACTTTGGCTACATGACAATTA
TCTCATATGCTTTCTTTGTATTGACTGGTACAATCGGTTTCTATGCGTGCTTCTGGTTTGTACGGACCATTTATGCTTCAGTGAAGATTGACTGAAGCTACATGTAGCCAAATTTTTCTCGGGGCTCAAATTTGCATTTGTTGAGCAGAATCAAGTAGTAGAATGGTAGATGTGCATTCTTTTCTCTGGTATTTAGGAAA
CTAGAACAGGAGTTTTCATGTGCTAGCAAGAGGAGATATCTTAGAGGATATCATGAACATTACGTATCAGTTGGTTACAAGACTCTGGTGGCATACCATTTGCTATGCAAGATTTATGATATATGATATACAGATATTTTTGGTATTCAGTTGCTTCCAACATAAGCTTTCAGACTTGGACAATCATGCTATGCTTTATT
CACCTATGTTATAACACTTACAGAGGTGTTGTTATGGTATAGAGATATTTAATACTTTGCCAACATAGGTAGGATTCTGACATTGAATGTTGTAATGCT

>TRINITY_DN107386_c0_g3_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:

GCATTGAGAACTCTCCTTATGTGGTAAGTATTATGGTTTCCGTTCTTGGCTCAGTTCTTCATTGGATTGGTCCTAAGGACTCGAGTTTTCTTTTCTTTGCGGAATTTTTTGAAGGTATAAAAGTGTGCACGCAGAAGAAAGTATGGCTAGAGCTTTAGGGTCTGTGTAGCATTGTGTGATGGATTGTTGACATCTTGTCA
GAATTGGCATTATGCCTACTTGTTAGCAAGTCGCTGGAACTACCAGCCTAAACAACTTTTTGTGACCAATTATTTAACCGGTTTCTTCTGCGGCAGTTCCATATGAGAGAGGTGAAGCTCTGTAATTATGTATGCCGGATAAAGCTCGATGCAAAGTCCGCAAAGAACTTTAAGGAGAAAATAGATGATGAATACCGTGT
TAACATGATTCTGGATAATCTACCTGTGGCTGTAGCCAGACAAAGAGCTGATGGAACCTCATATGAACATGGCTTCCGTGTTGGGTTTAAAGCAAGCTATGCAGGGAGTTCAGAAGAGAGATACTTCATACACAACCATCTGTCTTTTGAGGTTAAGTTTCACAAAGATTCAGAGGCTGATTCTGCTCGGATTGTTGGAT
TTGAAGTCACACCATATAGCGTCAAGCATGAGCATGAGCAACCTTGGTCTGAGGATAATCCCCGTTTGACAACCTGCAACCCAAACACCAAGCACTACGTTTCACAAACTAATAGTCCGCAAGAAGTTGATGAGGGTAAAGATATTATATTTACCTATGATGTGGCATTCAAGGAAAGCCCTATCAAATGGGCTTCTCGA
TGGGATACATATCTTCTCATGACAGATGATCAGATCCACTGGTTCTCTATTATCAACTCATTAATGATTGTTTTGTTCCTTTCTGGGATGGTGGCAATGATTATGATGAGAACCTTGTATCGGGATATCTCAAACTACAATCAACTGGAGACACAGGATGAAGCCCAAGAAGAAACCGGATGGAAACTTGTCCATGGAGA
TGCATTCAGGCCCCCAAATAATGCAGGTCTGCTCTGTGTCTATGCAGGAACTGGAGTACAGTTTTTTGGGATGACACTTGTTACAATGATATTTGCCATGCTTGGGTTTCTTTCACCATCCAACCGTGGTGGACTGATGACAGCTATGGTTCTCTTGTGGGTGTTCATGGGTTTGTTTGCTGGTTACTCTTCTGCTCGTC
TGTATAAGATGTTTAAGGGCACAGAATGGAAAACAAACACACTGAAGACAGCTTTCACGTTCCCTGGAATTGTTTTTGGCATTTTCTTTGTTCTCAATGCACTGATTTGGGGTGAAAAGTCCTCTGGTGCATTACCATTTGGAACAATGTTTGCTTTGGTATTTTTATGGTTTGGGATATCTGTGCCTTTGGTCTTTGTT
GGTAGTTACTTTGGCTACAAGAAACCTGCAATTGAAGATCCTGTTAAGACAAATAAAATCCCCAGGCAGATTCCAGAGCAGGCATGGTACATGCAGCCAGTTTTCTCCGTACTCATTGGAGGCATATTGCCATTTGGTGCAGTTTTCATTGAATTATTCTTCATCTTAACGTCGATCTGGCTACATCAATTCTATTACAT
TTTTGGGTTCCTGTTCATTGTCTTTGTTATCCTTATTGTTACTTGTGCAGAGATCACTATTGTCCTTTGCTACTTTCAGTTGTGTAGTGAGGACTACCACTGGTGGTGGAGAGCTTATCTAACTTCAGGCTCGTCTGCACTGTACTTATTCCTGTATGCTACATTCTACTTCTTCACCAAGCTGGAGATCACAAAACTTG
TGTCTGGTATTCTGTACTTTGGCTACATGACAATTATCTCATATGCTTTCTTTGTATTGACTGGTACAATCGGTTTCTATGCGTGCTTCTGGTTTGTACGGACCATTTATGCTTCAGTGAAGATTGACTGAAGCTACATGTAGCCAAATTTTTCTCGGGGCTCAAATTTGCATTTGTTGAGCAGAATCAAGTAGTAGAAT
GGTAGATGTGCATTCTTTTCTCTGGTATTTAGGAAACTAGAACAGGAGTTTTCATGTGCTAGCAAGAGGAGATATCTTAGAGGATATCATGAACATTACGTATCAGTTGGTTACAAGgtactatttttttttaaagttgcagactaccaagttattctgcattgtactcaaatgaggtagttaggacagaattttttcct
tgatgtactgtttgcaatgaattatggctcatacttattgtggcttccatgcctttcaatcagACTCTGGTGGCATACCATTTGCTATGCAAGATTTATGATATATGATATACAGATATTTTTGGTATTCAGTTGCTTCCAACATAAGCTTTCAGACTTGGACAATCATGCTATGCTTTATTCACCTATGTTATAACACT
TACAGAGGTGTTGTTATGGTATAGAGATATTTAATACTTTGCCAACATAGGTAGGATTCTGACATTGAATGTTGTAATGCT