sp|Q8LG98|OTU1_ARATH ----> OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 1

Intron 1 GTAATATGGG ... TACGGATTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	15.3	917.7	222.6	109
A2	15.68	928.1	244.1	101
A3	14.65	1081.5	260.4	111
A4	14.61	703.5	167.1	73.6
A5	15.28	506.6	146.8	36
A6	12.97	4594.4	955.8	413.6
A7	12.67	5427.5	1128.4	446
A8	13.49	4029.8	872	384.4
A9	13.96	5358.9	1293.7	446
A10	12.69	4977.1	1099.6	347

>TRINITY_DN117170_c10_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform

ATTTGAAGCATGGAAGGTCCATCCATTTTCAATAAAGTAAAGAATAACTTTCCTAAAAGTGGAGCTATATAAATAGCCATTCACTTTCATTTGCTAAGCAAACTCGCAGATCGAACACAGCAGTTGAAGGAGAAACAGCCGCTGAAGGAGAACAGTAGAACCCTCAAAACCCTATCCTTCTTCCATTGCATTTACTTAGA
AAACATGGACGGCAGCTGCGACGGAGGCGATGGTGTGGTCGACGCAGAGTGGACATGCTACAGGGACGACGAGATTATACAGCAGCAGAACGCCATCCAGGCCGCAGAAGCCCTCAAAATCCCCTTCGTCGGCGACAAGGAGTCTCTTTCTGCCTTGGCAGCTGAGTATGAAACAGGCAGTTCTATCTTAAAGGCAAAAA
TTGGGGTATTGGATGAGTTATATGGGGCAATTCGACGCACACGCGGTGATGGAAATTGCTTCTTTCGTTCGTTCATGTTTTCATACCTGGAGCATATATTGGAGACCCAAGATAAAGCGGAAGTGGAACATGTGTTGAAAAACATTGAGCAATGCAAGAAATCCCTCCTGGACCTGGGATATGCGGAGTTCACATTTGAA
GACTTTTTCTCAATATTTATTGACCTCGTCGAGAGTGTGATTCCAGGCAGGGATTCATCTATAAGTATTGATACACTCATTGAGAGGAGCCGAGACCCGTTAGTGTCGAATTATGTTGTGATGTTTTTTAGATTTGTGACATCGGGTGAAATTCGTCGGAGGACTGAGTTTTTTGGACCTTTCATAATGGGTGTAAGCAA
TGGAACAGTGGACCAGTTCTGCAAAACATCTGTGGAACCTATGGGAGAAGAGAGCGATCATGTCCATATTACTGCTCTATCAGATGCCTTGGGGGTACCAATTCGTGTTGTATACCTTGACCGAAGTTCATGTGATGTTGGTAAGACGGAAGTCAATCATCATGATTTCATACCTTCCAATTGCCTTTTAAAAGAAGCAG
GATCAGAAACAATTGAGCCTTCTGTAGTTTTACTGTATCGCCCAGGCCATTATGACATTCTTTATCCCAGGTTAAGGAGCGTTGTAAGCAAGTGATACCATCTTTATAATTTGACTCTAAGGAAGTTATTGGTCCTAATTTTTTGTATTTGCTTGACTATCACATTGTTGTAAAGATGCCTGGAATTAATATTTTGGGCT
TAGCTTAAGTGTAAATATGAAACTGTCAATGATTGGCAAATTATAATTCCATTCAGATCTGCCGCTGACTTTCCAACTTTAATTAAGACCGTTGAAGGGATGATTTTTTCTTTTGTACATGCCATTCCTATTGTATGGAATCTGAGTCCATTAAGCTGGGGCACGTTATATTTGAAGTAGTGATTTTATATGATACGAGT
CATTATCCATCCAATGCAATGGTTCTAAATTACAATGAGCATAGTTTGTAATAATGGGATCCTTCTGGCTTAGGAATAAGAAATGACCACAATTTGTAGTTTTATACTTCATCAGATTATTGTATGCAGG

>TRINITY_DN117170_c10_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

ATTTGAAGCATGGAAGGTCCATCCATTTTCAATAAAGTAAAGAATAACTTTCCTAAAAGTGGAGCTATATAAATAGCCATTCACTTTCATTTGCTAAGCAAACTCGCAGATCGAACACAGCAGTTGAAGGAGAAACAGCCGCTGAAGGAGAACAGTAGAACCCTCAAAACCCTATCCTTCTTCCATTGCATTTACTTAGA
AAACATGGACGGCAGCTGCGACGGAGGCGATGGTGTGGTCGACGCAGAGTGGACATGCTACAGGGACGACGAGATTATACAGCAGCAGAACGCCATCCAGGCCGCAGAAGCCCTCAAAATCCCCTTCGTCGGCGACAAGGAGTCTCTTTCTGCCTTGGCAGCTGAGTATGAAACAGGCAGTTCTATCTTAAAGGCAAAAA
TTGGGGTATTGGATGAGTTATATGGGGCAATTCGACGCACACGCGGTGATGGAAATTGCTTCTTTCGTTCGTTCATGTTTTCATACCTGgtaatatgggaacagaactttcttatccagagggttggctcctttaaaaagttctagggtctaagtttttatctattttatgggagggagaggataacagcatacaatcat
ttcatctaatagtacgaatgttgaggttacggattagGAGCATATATTGGAGACCCAAGATAAAGCGGAAGTGGAACATGTGTTGAAAAACATTGAGCAATGCAAGAAATCCCTCCTGGACCTGGGATATGCGGAGTTCACATTTGAAGACTTTTTCTCAGTAAGCCCTATTTGCAGCTTTTACCCCCTTTCAACTACAG
CTTCAGTCCTCTGTATAGAGTTAGTGGTAGTCTAAACGGACAGCTTGGAATACAGCTTTATTTATCTGTATAGAGCTAGTGGTATCTTGAAGGAAACTTCTCTATTTGAGAATGATAAATTGAATATATATTAAGTGAAAATAAATACCAGCATAGATCCATCTTAAACCTGTATCTATCA

Intron 2 GTAACATTTT ... CACTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	10.23	656.3	40.7	43.7
A2	4.62	557.5	40.7	28.1
A3	8.71	643.1	46.4	37.8
A4	4.71	509.7	33.8	29.9
A5	7.9	291.3	23.8	16.7
A6	6.43	3639.1	235.8	215.1
A7	6.93	3953.4	264	235.9
A8	4.82	3264.8	214	196.1
A9	5.15	3587.1	284.9	196.7
A10	6.68	2941.1	235.4	175.2

>TRINITY_DN117170_c10_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform

ATTTGAAGCATGGAAGGTCCATCCATTTTCAATAAAGTAAAGAATAACTTTCCTAAAAGTGGAGCTATATAAATAGCCATTCACTTTCATTTGCTAAGCAAACTCGCAGATCGAACACAGCAGTTGAAGGAGAAACAGCCGCTGAAGGAGAACAGTAGAACCCTCAAAACCCTATCCTTCTTCCATTGCATTTACTTAGA
AAACATGGACGGCAGCTGCGACGGAGGCGATGGTGTGGTCGACGCAGAGTGGACATGCTACAGGGACGACGAGATTATACAGCAGCAGAACGCCATCCAGGCCGCAGAAGCCCTCAAAATCCCCTTCGTCGGCGACAAGGAGTCTCTTTCTGCCTTGGCAGCTGAGTATGAAACAGGCAGTTCTATCTTAAAGGCAAAAA
TTGGGGTATTGGATGAGTTATATGGGGCAATTCGACGCACACGCGGTGATGGAAATTGCTTCTTTCGTTCGTTCATGTTTTCATACCTGGAGCATATATTGGAGACCCAAGATAAAGCGGAAGTGGAACATGTGTTGAAAAACATTGAGCAATGCAAGAAATCCCTCCTGGACCTGGGATATGCGGAGTTCACATTTGAA
GACTTTTTCTCAATATTTATTGACCTCGTCGAGAGTGTGATTCCAGGCAGGGATTCATCTATAAGTATTGATACACTCATTGAGAGGAGCCGAGACCCGTTAGTGTCGAATTATGTTGTGATGTTTTTTAGATTTGTGACATCGGGTGAAATTCGTCGGAGGACTGAGTTTTTTGGACCTTTCATAATGGGTGTAAGCAA
TGGAACAGTGGACCAGTTCTGCAAAACATCTGTGGAACCTATGGGAGAAGAGAGCGATCATGTCCATATTACTGCTCTATCAGATGCCTTGGGGGTACCAATTCGTGTTGTATACCTTGACCGAAGTTCATGTGATGTTGGTAAGACGGAAGTCAATCATCATGATTTCATACCTTCCAATTGCCTTTTAAAAGAAGCAG
GATCAGAAACAATTGAGCCTTCTGTAGTTTTACTGTATCGCCCAGGCCATTATGACATTCTTTATCCCAGGTTAAGGAGCGTTGTAAGCAAGTGATACCATCTTTATAATTTGACTCTAAGGAAGTTATTGGTCCTAATTTTTTGTATTTGCTTGACTATCACATTGTTGTAAAGATGCCTGGAATTAATATTTTGGGCT
TAGCTTAAGTGTAAATATGAAACTGTCAATGATTGGCAAATTATAATTCCATTCAGATCTGCCGCTGACTTTCCAACTTTAATTAAGACCGTTGAAGGGATGATTTTTTCTTTTGTACATGCCATTCCTATTGTATGGAATCTGAGTCCATTAAGCTGGGGCACGTTATATTTGAAGTAGTGATTTTATATGATACGAGT
CATTATCCATCCAATGCAATGGTTCTAAATTACAATGAGCATAGTTTGTAATAATGGGATCCTTCTGGCTTAGGAATAAGAAATGACCACAATTTGTAGTTTTATACTTCATCAGATTATTGTATGCAGG

>TRINITY_DN117170_c10_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAAGGTCCACCGATGATAGCGATTAATAGTAAACGCTATCATAGTAAAGGTTAAAAGTATGATTTAGAACAAAAAATAATTGCATAACATTTGAATAAACTAAGAGATGACAGCAGAAAATATCAAGACAAGTTGCTACACAATGATTTGACAGTGGGAAATTTTTTACAATAAGTAATTCCGTGAACATTCAGACTGT
CTACTTGAAAGGAAGAGTTTCAGCCCCAAGCTTCTTTGTCTGCTTCTACATAAAAGTGGGCTTAAATAGGGCACCCACCTTACATTAAATGCTACCTTATTAAAATAAGAATTTTTTTCAACACCTGTCTACTTCTTTCTGCAATCCCCCACTAATATTTCAACAGAAACAATATCGGTTAGGACACCATACTAAAATAT
ATTTTATGGCGGATACAAAATATGTCATGTGTTGGAGTGGCAGTTTATTGATACAATATACTTTATGACAAGTACAAAACATTTCATCACTTGTAAACGTAAATGGTTCAAAATTGGATTGATCTCCTTCAAATTTTGTTGGTTCCGTTTTTTTTTCACTAGTGTGTCTTCAATATTTTTTCCTTTCTTTCACCATTTGT
GTAAAGATGGATGGTTTGGTCTGTATGGTTAGTGTTCTGACTTCAAAATTCATGCTATTAATCTAGTCAGAAGATTACTACATTCACGCATTCCTCACATTGTGTCGAGTTAGTCTGTGTGAGCATTTATGTATATTTGAAACTTGTATATTAGTAAATATTAAAATATTTTATCAAATTCTTGATTTGTACATTTTTAA
ATGCCACTCAGATATTTATTGACCTCGTCGAGAGTGTGATTCCAGGCAGGGATTCATCTATAAGgtaacattttctgctggttttattgagattggaaattcttatagttacagttgatatgaatttctaaatttagattggatgctggcttctgcctacagaaggttgtttgtagtcaagtgtacttataattttataa
tatgcattcatgcaaaggtgtgactatttttctacctcaagtcaataaatgagaatgtgttcacatttcattcattagttttctgagctgttacacaggagataattaccttttcactgtgcagTATTGATACACTCATTGAGAGGAGCCGAGACCCGTTAGTGTCGAATTATGGTAAACCAAATTTGAAGAATTTCTCT
CATCCATAATAAGTTCGCTGATTTATCTTTGCAGTGAACTTATTTCATTCTCTGTTGTATAGTTGTGATGTTTTTTAGATTTGTGACATCGGGTGAAATTCGTCGGAGGACTGAGTTTTTTGGACCTTTCATAATGGGTGTAAGCAATGGAACAGTGGACCAGTTCTGCAAAACATCTGTGGAACCTATGGGAGAAGAGA
GCGATCATGTCCATATTACTGCTCTATCAGATGCCTTGGGGGTACCAATTCGTGTTGTATACCTTGACCGAAGTTCATGTGATGTTGGTAAGACGGAAGTCAATCATCATGATTTCATACCTTCCAATTGCCTTTTAAAAGAAGCAGGATCAGAAACAATTGAGCCTTCTGTAGTTTTACTGTATCGCCCAGGCCATTAT
GACATTCTTTATCCCAGGTTAAGGAGCGTTGTAAGCAAGTGATACCATCTTTATAATTTGACTCTAAGGAAGTTATTGGTCCTAATTTTTTGTATTTGCTTGACTATCACATTGTTGTAAAGATGCCTGGAATTAATATTTTGGGCTTAGCTTAAGTGTAAATATGAAACTGTCAATGATTGGCAAATTATAATTCCATT
CAGATCTGCCGCTGACTTTCCAACTTTAATTAAGACCGTTGAAGGGATGATTTTTTCTTTTGTACATGCCATTCCTATTGTATGGAATCTGAGTCCATTAAGCTGGGGCACGTTATATTTGAAGTAGTGATTTTATATGATACGAGTCATTATCCATCCAATGCAATGGTTCTAAATTACAATGAGCATAGTTTGTAATA
ATGGGATCCTTCTGGCTTAGGAATAAGAAATGACCACAATTTGTAGTTTTATACTTCATCAGATTATTGTATGCAGG

Intron 3 GTAAACCAAA ... TGTTGTATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.86	765.5	9.4	180.6
A2	20.27	654.6	1.6	170.8
A3	17.95	730.7	4.2	162
A4	18.44	617.9	4.6	141.4
A5	19.17	329.3	2.2	79.7
A6	19.06	4521.6	8.4	1084.4
A7	19.82	4884.6	25.4	1232.5
A8	19.18	4277.6	14.4	1039.1
A9	20.18	4284	10.4	1112.7
A10	20.58	3592.8	4.4	962.9

>TRINITY_DN117170_c10_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform

ATTTGAAGCATGGAAGGTCCATCCATTTTCAATAAAGTAAAGAATAACTTTCCTAAAAGTGGAGCTATATAAATAGCCATTCACTTTCATTTGCTAAGCAAACTCGCAGATCGAACACAGCAGTTGAAGGAGAAACAGCCGCTGAAGGAGAACAGTAGAACCCTCAAAACCCTATCCTTCTTCCATTGCATTTACTTAGA
AAACATGGACGGCAGCTGCGACGGAGGCGATGGTGTGGTCGACGCAGAGTGGACATGCTACAGGGACGACGAGATTATACAGCAGCAGAACGCCATCCAGGCCGCAGAAGCCCTCAAAATCCCCTTCGTCGGCGACAAGGAGTCTCTTTCTGCCTTGGCAGCTGAGTATGAAACAGGCAGTTCTATCTTAAAGGCAAAAA
TTGGGGTATTGGATGAGTTATATGGGGCAATTCGACGCACACGCGGTGATGGAAATTGCTTCTTTCGTTCGTTCATGTTTTCATACCTGGAGCATATATTGGAGACCCAAGATAAAGCGGAAGTGGAACATGTGTTGAAAAACATTGAGCAATGCAAGAAATCCCTCCTGGACCTGGGATATGCGGAGTTCACATTTGAA
GACTTTTTCTCAATATTTATTGACCTCGTCGAGAGTGTGATTCCAGGCAGGGATTCATCTATAAGTATTGATACACTCATTGAGAGGAGCCGAGACCCGTTAGTGTCGAATTATGTTGTGATGTTTTTTAGATTTGTGACATCGGGTGAAATTCGTCGGAGGACTGAGTTTTTTGGACCTTTCATAATGGGTGTAAGCAA
TGGAACAGTGGACCAGTTCTGCAAAACATCTGTGGAACCTATGGGAGAAGAGAGCGATCATGTCCATATTACTGCTCTATCAGATGCCTTGGGGGTACCAATTCGTGTTGTATACCTTGACCGAAGTTCATGTGATGTTGGTAAGACGGAAGTCAATCATCATGATTTCATACCTTCCAATTGCCTTTTAAAAGAAGCAG
GATCAGAAACAATTGAGCCTTCTGTAGTTTTACTGTATCGCCCAGGCCATTATGACATTCTTTATCCCAGGTTAAGGAGCGTTGTAAGCAAGTGATACCATCTTTATAATTTGACTCTAAGGAAGTTATTGGTCCTAATTTTTTGTATTTGCTTGACTATCACATTGTTGTAAAGATGCCTGGAATTAATATTTTGGGCT
TAGCTTAAGTGTAAATATGAAACTGTCAATGATTGGCAAATTATAATTCCATTCAGATCTGCCGCTGACTTTCCAACTTTAATTAAGACCGTTGAAGGGATGATTTTTTCTTTTGTACATGCCATTCCTATTGTATGGAATCTGAGTCCATTAAGCTGGGGCACGTTATATTTGAAGTAGTGATTTTATATGATACGAGT
CATTATCCATCCAATGCAATGGTTCTAAATTACAATGAGCATAGTTTGTAATAATGGGATCCTTCTGGCTTAGGAATAAGAAATGACCACAATTTGTAGTTTTATACTTCATCAGATTATTGTATGCAGG

>TRINITY_DN117170_c10_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAAGGTCCACCGATGATAGCGATTAATAGTAAACGCTATCATAGTAAAGGTTAAAAGTATGATTTAGAACAAAAAATAATTGCATAACATTTGAATAAACTAAGAGATGACAGCAGAAAATATCAAGACAAGTTGCTACACAATGATTTGACAGTGGGAAATTTTTTACAATAAGTAATTCCGTGAACATTCAGACTGT
CTACTTGAAAGGAAGAGTTTCAGCCCCAAGCTTCTTTGTCTGCTTCTACATAAAAGTGGGCTTAAATAGGGCACCCACCTTACATTAAATGCTACCTTATTAAAATAAGAATTTTTTTCAACACCTGTCTACTTCTTTCTGCAATCCCCCACTAATATTTCAACAGAAACAATATCGGTTAGGACACCATACTAAAATAT
ATTTTATGGCGGATACAAAATATGTCATGTGTTGGAGTGGCAGTTTATTGATACAATATACTTTATGACAAGTACAAAACATTTCATCACTTGTAAACGTAAATGGTTCAAAATTGGATTGATCTCCTTCAAATTTTGTTGGTTCCGTTTTTTTTTCACTAGTGTGTCTTCAATATTTTTTCCTTTCTTTCACCATTTGT
GTAAAGATGGATGGTTTGGTCTGTATGGTTAGTGTTCTGACTTCAAAATTCATGCTATTAATCTAGTCAGAAGATTACTACATTCACGCATTCCTCACATTGTGTCGAGTTAGTCTGTGTGAGCATTTATGTATATTTGAAACTTGTATATTAGTAAATATTAAAATATTTTATCAAATTCTTGATTTGTACATTTTTAA
ATGCCACTCAGATATTTATTGACCTCGTCGAGAGTGTGATTCCAGGCAGGGATTCATCTATAAGGTAACATTTTCTGCTGGTTTTATTGAGATTGGAAATTCTTATAGTTACAGTTGATATGAATTTCTAAATTTAGATTGGATGCTGGCTTCTGCCTACAGAAGGTTGTTTGTAGTCAAGTGTACTTATAATTTTATAA
TATGCATTCATGCAAAGGTGTGACTATTTTTCTACCTCAAGTCAATAAATGAGAATGTGTTCACATTTCATTCATTAGTTTTCTGAGCTGTTACACAGGAGATAATTACCTTTTCACTGTGCAGTATTGATACACTCATTGAGAGGAGCCGAGACCCGTTAGTGTCGAATTATGgtaaaccaaatttgaagaatttctct
catccataataagttcgctgatttatctttgcagtgaacttatttcattctctgttgtatagTTGTGATGTTTTTTAGATTTGTGACATCGGGTGAAATTCGTCGGAGGACTGAGTTTTTTGGACCTTTCATAATGGGTGTAAGCAATGGAACAGTGGACCAGTTCTGCAAAACATCTGTGGAACCTATGGGAGAAGAGA
GCGATCATGTCCATATTACTGCTCTATCAGATGCCTTGGGGGTACCAATTCGTGTTGTATACCTTGACCGAAGTTCATGTGATGTTGGTAAGACGGAAGTCAATCATCATGATTTCATACCTTCCAATTGCCTTTTAAAAGAAGCAGGATCAGAAACAATTGAGCCTTCTGTAGTTTTACTGTATCGCCCAGGCCATTAT
GACATTCTTTATCCCAGGTTAAGGAGCGTTGTAAGCAAGTGATACCATCTTTATAATTTGACTCTAAGGAAGTTATTGGTCCTAATTTTTTGTATTTGCTTGACTATCACATTGTTGTAAAGATGCCTGGAATTAATATTTTGGGCTTAGCTTAAGTGTAAATATGAAACTGTCAATGATTGGCAAATTATAATTCCATT
CAGATCTGCCGCTGACTTTCCAACTTTAATTAAGACCGTTGAAGGGATGATTTTTTCTTTTGTACATGCCATTCCTATTGTATGGAATCTGAGTCCATTAAGCTGGGGCACGTTATATTTGAAGTAGTGATTTTATATGATACGAGTCATTATCCATCCAATGCAATGGTTCTAAATTACAATGAGCATAGTTTGTAATA
ATGGGATCCTTCTGGCTTAGGAATAAGAAATGACCACAATTTGTAGTTTTATACTTCATCAGATTATTGTATGCAGG

Intron 4 GTGATAAGGA ... CTGCATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	18.11	953.8	7	211
A2	16.51	869.7	4	172
A3	16.73	940.8	5	189
A4	16.79	773.2	2	156
A5	17.22	384.7	2	80
A6	19.19	5773.7	19	1371
A7	18.52	6013.5	29.5	1367
A8	20.05	6206.3	17.5	1556
A9	19.77	5668.2	36.5	1396
A10	17.42	4641.7	10	979

>TRINITY_DN46638_c3_g2_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

CCTCCTCCAATTTGAAGTATGGAAGGTCCATCCATTTTCATTAAAGTAAAGAATAACTTTCCTTAAAGTGGAGCTATATAAATAGCCATTCACTTTCATTTGCAAAGCAAACTCGCAGATCGAACACAGCAGTTGAAGGAGAAACAGCCGCTGAAGGAGAACAGTAGAACCCTCAAAACCCTATCCTTCTTCCATTGCAT
TTGCTTAGAAAACATGGACGGCAGCTGCGACGGAGGCGATGGTGTGGTCGACGCGGAGTGGACATGCTACAGGGACGACGAGATTATACAGCAGCAGAACGCCATCCAGGCCGCAGAAGCCCTCAAAATCCCCTTCGTCGGCGACAAGGAGTCTCTTTCTGCCTTGGCAGCTGAGTATGAAACAGGCAGTTCTATATTAA
AGGCAAAAATTGGGGTATTGAATGAGTTATATGGGGCAATTCGACGCACACGCGGTGATGGAAATTGCTTCTTTCGTTCGTTCATGTTTTCATACCTGGTAATATGGGAACAGAACTTTCTTATCCAGAGGGTTGGCTCCTTTAAAAAGTTCTAGGGTCTAAGTTTTTATCTATTTTATGGGAGGGAGAGGATAACAGCA
TACAATCATTTCATCTAATAGTACGAATGTTGAGGTTACGGATTAGGAGCATATATTGGAGACCCAAGATAAAGCGGAAGTGGAACATGTGTTGAAAAACATTGAGCAATGCAAGAAATCCCTCCTGGACCTGGGATATGCGGAGTTCACATTTGAAGACTTTTTCTCAATATTTATTGACCTCGTCGAGAGTGTGATTC
CAGGCAGGGATTCATCTATAAGTATTGATACACTCATTGAGAGGAGCCGAGACCCGTTAGTGTCGAATTATGTTGTGATGTTTTTTAGATTTGTGACATCGGGTGAAATTCGTCGGAGGACTGAGTTTTTTGGACCTTTCATAATGGGTGTAAGCAATGGAACAGTGGACCAGTTCTGCAAAACATCTGTGGAACCTATG
GGAGAAGAGAGCGATCATGTCCATATTACTGCTCTATCAGATGCCTTGGGGGTACCAATTCGTGTTGTATACCTTGACCGAAGTTCATGTGATGTTGGTAAGACGGAAGTCAATCATCATGATTTCATACCTTCCAATTGCCTTTTAAAAGAAGCAGGATCAGAAACAATTGAGCCTTCTGTAGTTTTACTGTATCGCCC
AGGCCATTATGACATTCTTTATCCCAGGTTAAGGAGCGTTGTAAGCAAGTGATACCATCTTTATAATTTGACTCTCAGGAAGTTATTGGTCCTAATTTTTTGTATTTGCTTGACTATCACATTGTTGTAAAGATGCCTGGAATTAATATTTTGGGCTTAGCTTAAGTGTAAATATGAAACTGTCAATGATTGGCAAATTA
TAATTCCATTCAGATCTGCCGCTGACTTTCCAACTTTAATTAAGACCGTTGAAGGGATGATTTTTTCTTTTGTACATGCCATTCCTATTGTATGGAATCTGAGTCCATTAAGCTGGGGCACGTTATATTTGAAGTAGTGATTTTATATGATACGAGTCATTATCCATCCAATGCAATGGTTCTAAATTACAATGAGCATA
GTTTGTAATAATGGGATCCTTCTGGCTTAGGAATAAGAAATGACCACAATTTGTAGTTTTATACTTCATCAGATTATTGTATGCAGGATATTACCAATGCTATTTAGAGCACAATGCTGCAATTTAGAGGCATTACAATATAATAGCATCTTTTCGACG

>TRINITY_DN46638_c3_g2_i5 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CCTCCTCCAATTTGAAGTATGGAAGGTCCATCCATTTTCATTAAAGTAAAGAATAACTTTCCTTAAAGTGGAGCTATATAAATAGCCATTCACTTTCATTTGCAAAGCAAACTCGCAGATCGAACACAGCAGTTGAAGGAGAAACAGCCGCTGAAGGAGAACAGTAGAACCCTCAAAACCCTATCCTTCTTCCATTGCAT
TTACTTAGAAAACATGGACGGCAGCTGCGACGGAGGCGATGGTGTGGTCGACGCGGAGTGGACATGCTACAGGGACGACGAGATTATACAGCAGCAGAACGCCATCCAGGCCGCAGAAGCCCTCAAAATCCCCTTCGTCGGCGACAAGGAGTCTCTTTCTGCCTTGGCAGCTGAGTATGAAACAGGCAGTTCTATATTAA
AGGCAAAAATTGGGGTATTGAATGAGTTATATGGGGCAATTCGACGCACACGCGGTGATGGAAATTGCTTCTTTCGTTCGTTCATGTTTTCATACCTGGAGCATATATTGGAGACCCAAGATAAAGCGGAAGTGGAACATGTGTTGAAAAACATTGAGCAATGCAAGAAATCCCTCCTGGACCTGGGATATGCGGAGTTC
ACATTTGAAGACTTTTTCTCAATATTTATTGACCTCGTCGAGAGTGTGATTCCAGGCAGGGATTCATCTATAAGGTAACATTTTCTGCTGGTTTTATTGAGATTGGAAATTCTTATAGTTACAGTTGATATGAATTTCTAAATTTAGATTGGATGCTGGCTTCTGCCTACAGAAGGTTGTTTGTAGTCAAGTGTACTTAT
AATTTTATAATATGCATTCATGCAAAGGTGTGACTATTTTTCTACCTCAAGTCAATAAATGAGAATGTGTTCACATTTCATTCATTAGTTTTCTGAGCTGTTACACAGGAGATAATTACCTTTTCACTGTGCAGTATTGATACACTCATTGAGAGGAGCCGAGACCCGTTAGTGTCGAATTATGGTAAACCAAATTTGAA
GAATTTCTCTCATCCATAATAAGTTCGCTGATTTATCTTTGCAGTGAACTTATTTCATTCTCTGTTGTATAGTTGTGATGTTTTTTTAGATTTGTGACATCGGGTGAAATTCGTCGGAGGACTGAGTTTTTTGGACCTTTCATAATGGGTGTAAGCAATGGAACAGTGGACCAGgtgataaggaagcttctatcactaag
tgcttgcacagtgaatttcaattttctcaatgcttctaattatcaactgcttttcttattttgttaattttcttgctgcatgcagTTCTGCAAAACATCTGTGGAACCTATGGGAGAAGAGAGCGATCATGTCCATATTACTGCTCTATCAGATGCCTTGGGGGTACCAATTCGTGTTGTATACCTTGACCGAAGTTCAT
GTGATGTTGGTAAGACGGAAGTCAATCATCATGATTTCATACCTTCCAATTGCCTTTTAAAAGAAGCAGGATCAGAAACAATTGAGCCTTCTGTAGTTTTACTGTATCGCCCAGGCCATTATGACATTCTTTATCCCAGGTTAAGGAGCGTTGTAAGCAAGTGATACCATCTTTATAATTTGACTCTCAGGAAGTTATTG
GTCCTAATTTTTTGTATTTGCTTGACTATCACATTGTTGTAAAGATGCCTGGAATTAATATTTTGGGCTTAGCTTAAGTGTAAATATGAAACTGTCAATGATTGGCAAATTATAATTCCATTCAGATCTGCCGCTGACTTTCCAACTTTAATTAAGACCGTTGAAGGGATGATTTTTTCTTTTGTACATGCCATTCCTAT
TGTATGGAATCTGAGTCCATTAAGCTGGGGCACGTTATATTTGAAGTAGTGATTTTATATGATACGAGTCATTATCCATCCAATGCAATGGTTCTAAATTACAATGAGCATAGTTTGTAATAATGGGATCCTTCTGGCTTAGGAATAAGAAATGACCACAATTTGTAGTTTTATACTTCATCAGATTATTGTATGCAGGA
TATTACCAATGCTATTTAGAGCACAATGCTGCAATTTAGAGGCATTACAATATAATAGCATCTTTTCGACG