sp|Q940Q8|IX10L_ARATH ----> Probable beta-1,4-xylosyltransferase IRX10L

Intron 1 GTAAGAGACA ... TCTGAACTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	24.05	150	39	56
A2	23.03	127	32	44
A3	27.13	141	44	61
A4	28	90	22	48
A5	20	64	13	19
A6	22.74	661	137	252
A7	24.62	545	99	257
A8	24.94	492	87	240
A9	24.24	500	103	217
A10	22.41	471	65	207

>TRINITY_DN104324_c0_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoform

AAGATGTCCCTTCAACCAAACTTCACCATCCTTTGACCAAACTGAGAAAAGGAAACAAGAGCTTTCCCTTAACCAAACGAGAAGAACAGTCAACCTCATCCAAACAGAAATCAAAACCCTTTGTAAATTGCATTGCCAATTCTTTAGTCCTAGTCCCCTGGTTTCTTTGAAGCAAAGCAAGTAACACGAGAACAAAGGAA
ACCGAGGCTCATAAAATAAGCATTCCAACAACACACAGTGACAGCACAACACACCCCCACCTTCCCATCTTCATTCCTTGCGCTACAAATCCCATTCAGCTTTTCATTTCCAAAAGCTCAGAAGGAATCTCGGCAACAAACGGCGAGGAGATCGAAAATAGCAGCAAACAAACGGCTAGGAGATCGAAAATACCAGCAAA
AAGAAGAAGAATAGAGAATGAGGAGGGAATTGCCCCAGAGAAGCTTTTTTGTGCTTTTCCTATTTCTATTCATTGTTTCTACTTTTGGACAGAAACAGCAAGAGCACCAGCAGTCCGAGCGTATTGCTGGCAGTGCTGGTGATGTTTTGGAGGATGACCCAGTTGGGAGATTGAAAGTGTTCATTTACGAGTTACCCAGT
AAATACAACAGGAAGATTTTGGCAAAAGATCCCAGATGCCTTACCCATATGTTTGCCACTGAGATCTTTATGAATCGATTTTTGCTTGCTAGCCCTGTCCGTACTTTGAATCCGGAGGAGGCTGACTGGTTTTATACTCCTGTCTATACTACATGTGATCTCACTCCAAATGGGTTGCCATTGCCCTTTAAATCTCCCAG
AATGATGAGAAGTGCTATTCAGTACATTTCCACTAATTGGCCATATTGGAATCGCACTGAAGGGGCAGATCATTTCTTTGTGGTGCCACATGATTTTGGTGCATGCTTCCACTACCAAGAAGAGAAAGCTATTGAGAGAGGTATTTTACCATTGCTGCAGCGGGCCACACTGGTTCAGACATTTGGACAGCGATACCATG
TCTGTTTGAAGGAAGGCTCAATCACAGTTCCACCTTATGCTCCTCCACAAAAGATGCAGGCACACTTGATACCTCCCAGCACTCCTCGGTCAATCTTTGTTTACTTTCGTGGTCTGTTTTATGATGTGGGCAATGATCCAGAAGGGGGTTACTATGCAAGGGGTGCACGAGCATCGGTATGGGAGAATTTTAAAGACAAC
CCTCTTTTTGACATCTCTACTGAGCACCCTGCCACCTATTACGAGGACATGCAACGGGCCATTTTTTGTCTGTGCCCGTTGGGCTGGGCACCTTGGAGTCCAAGACTTGTAGAAGGAGTGATATTTGGTTGTATTCCAGTCATTATAGCTGATGATATTGTGCTACCTTTCGCTGATGCCATACCTTGGGAAGAAATTGG
AGTGTTTGTAGCTGAAAAAGATGTACCTAACCTGGACACTATTCTTACGTCAATTCCACCAGAGGTCATATTGAGGAAGCAACGATTGCTTGCTAATCCTGCCATGAAGCAGGCTATGCTGTTTCCACAACCTGCTCAACCAGGAGATGCCTTCCATCAGATTTTGAATGGCCTAGCCCGCAAATTGCCTCATGATAGCA
GTATTTACTTGAAACCTAATCAAAAGGTTTTGAACTGGACAGCAGGCCCTCCTGGTGATCTAAAGCCCTGGTAGCATGTAGACACTGTGTAATCAAATTGCCAATGTACCTTCACTTTACAACTCAAGATGAGTTTTAAGGCTAGCCATTCTATTCTTTTGTAGTTTATCATTTATAAGTTATGTTCAGACAAGATATAA
GTTTTCATTGTACACTATTTTTTAAGAATTACTGATATTGTATGATAGCAGTGCTTAAGAGTTTTACAAGTCACATCCTAGTTTTTAGATCCTTGTTGCTGTACAGTGAAGATCTCAGGACAATAAGTAAGATTTTTATGTTTGAATTCTTGGTTTTGAATTTTTAATTTTTTATGTTTCAACTCTTGGTTTTGTATGCA
ATCTGCTAATGTGCTTTTGCATTCCCGTCACTTAACTAATATTTATATTCCGTGCACAAATGATATACATGCTCATCTGAGACATGGTAGATGGGGAGGGACTCGGGAGTGCTTAACGCTTCTTCTATTTGAAGTACCTAAAGAAGAGCTATCGCTGTGCCAAAATCATGTAGTGAAACACTTATCTATTCCTGCTGCCA
TC

>TRINITY_DN104324_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:

AAGATGTCCCTTCAACCAAACTTCACCATCCTTTGACCAAACTGAGAAAAGGAAACAAGAGCTTTCCCTTAACCAAACGAGAAGAACAGTCAACCTCATCCAAACAGAAATCAAAACCCTTTGTAAATTGCATTGCCAATTCTTTAGTCCTAGTCCCCTGGTTTCTTTGAAGCAAAGCAAGTAACACGAGAACAAAGGAA
ACCGAGGCTCATAAAATAAGCATTCCAACAACACACAGTGACAGCACAACACACCCCCACCTTCCCATCTTCATTCCTTGCGCTACAAATCCCATTCAGCTTTTCATTTCCAAAAGCTCAGAAGGAATCTCGGCAACAAACGGCGAGGAGATCGAAAATAGCAGCAAACAAACGGCTAGGAGATCGAAAATACCAGCAAA
AAGAAGAAGAATAGAGAATGAGGAGGGAATTGCCCCAGAGAAGCTTTTTTGTGCTTTTCCTATTTCTATTCATTGTTTCTACTTTTGGACAGAAACAGCAAGAGCACCAGCAGTCCGAGCGTATTGCTGGCAGTGCTGGTGATGTTTTGGAGGATGACCCAGTTGGGAGATTGAAAGTGTTCATTTACGAGTTACCCAGT
AAATACAACAGGAAGATTTTGGCAAAAGATCCCAGATGCCTTACCCATATGTTTGCCACTGAGATCTTTATGAATCGATTTTTGCTTGCTAGCCCTGTCCGTACTTTGAATCCGGAGGAGGCTGACTGGTTTTATACTCCTGTCTATACTACATGTGATCTCACTCCAAATGGGTTGCCATTGCCCTTTAAATCTCCCAG
AATGATGAGAAGTGCTATTCAGTACATTTCCACTAATTGGCCATATTGGAATCGCACTGAAGGGGCAGATCATTTCTTTGTGGTGCCACATGATTTTGGTGCATGCTTCCACTACCAAGAAGAGAAAGCTATTGAGAGAGGTATTTTACCATTGCTGCAGCGGGCCACACTGGTTCAGACATTTGGACAGCGATACCATG
TCTGTTTGAAGGAAGGCTCAATCACAGTTCCACCTTATGCTCCTCCACAAAAGATGCAGGCACACTTGATACCTCCCAGCACTCCTCGGTCAATCTTTGTTTACTTTCGTGGTCTGTTTTATGATGTGGGCAATGATCCAGAAGGGGGTTACTATGCAAGgtaagagacagaatacatcaagttgacaagggtgtgacta
aagcaaagtgggatttttaatatcctctctttgattctatggttattctcaaatgcataagatcttagtggattggccagatatttttttaaaactaattgagcttcctgattgcttatttttctttctgaactagGGGTGCACGAGCATCGGTATGGGAGAATTTTAAAGACAACCCTCTTTTTGACATCTCTACTGAG
CACCCTGCCACCTATTACGAGGACATGCAACGGGCCATTTTTTGTCTGTGCCCGTTGGGCTGGGCACCTTGGAGTCCAAGACTTGTAGAAGGAGTGATATTTGGTTGTATTCCAGTCATTATAGCTGATGATATTGTGCTACCTTTCGCTGATGCCATACCTTGGGAAGAAATTGGAGTGTTTGTAGCTGAAAAAGATGT
ACCTAACCTGGACACTATTCTTACGTCAATTCCACCAGAGGTCATATTGAGGAAGCAACGATTGCTTGCTAATCCTGCCATGAAGCAGGCTATGCTGTTTCCACAACCTGCTCAACCAGGAGATGCCTTCCATCAGATTTTGAATGGCCTAGCCCGCAAATTGCCTCATGATAGCAGTATTTACTTGAAACCTAATCAAA
AGGTTTTGAACTGGACAGCAGGCCCTCCTGGTGATCTAAAGCCCTGGTAGCATGTAGACACTGTGTAATCAAATTGCCAATGTACCTTCACTTTACAACTCAAGATGAGTTTTAAGGCTAGCCATTCTATTCTTTTGTAGTTTATCATTTATAAGTTATGTTCAGACAAGATATAAGTTTTCATTGTACACTATTTTTTA
AGAATTACTGATATTGTATGATAGCAGTGCTTAAGAGTTTTACAAGTCACATCCTAGTTTTTAGATCCTTGTTGCTGTACAGTGAAGATCTCAGGACAATAAGTAAGATTTTTATGTTTGAATTCTTGGTTTTGAATTTTTAATTTTTTATGTTTCAACTCTTGGTTTTGTATGCAATCTGCTAATGTGCTTTTGCATTC
CCGTCACTTAACTAATATTTATATTCCGTGCACAAATGATATACATGCTCATCTGAGACATGGTAGATGGGGAGGGACTCGGGAGTGCTTAACGCTTCTTCTATTTGAAGTACCTAAAGAAGAGCTATCGCTGTGCCAAAATCATGTAGTGAAACACTTATCTATTCCTGCTGCCATC

Intron 2 GTAAGAGACA ... TCTGAACTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.18	150	33.2	56
A2	25.73	127	26.7	44
A3	30.2	141	37.8	61
A4	34.78	90	19.3	48
A5	22.89	64	10.8	19
A6	27.6	661	115.5	252
A7	32.04	545	83.3	257
A8	32.79	492	73.5	240
A9	30.26	500	87.7	217
A10	30.53	471	54.8	207

>TRINITY_DN114141_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

GTCCCTTCAACCAAACTTCACCATCCTTTGACCAAACTGAGAAAAGGAAACAAGAGCTTTCCCTTAACCAAACGAGAAGAACAGTCAACCTCATCCAAACAGAAATCAAAACCCTTTGTAAATTGCATTGCCAATTCTTTAGTCCTAGTCCCCTGGTTTCTTTGAAGCAAAGCAAGTAACACGAGAACAAAGGAAACCGA
GGCTCATAAAATAAGCATTCCAACAACACACAGTGACAGCACAACACACCCCCACCTTCCCATCTTCATTCCTTGCGCTACAAATCCCATTCAGCTTTTCATTTCCAAAAGCTCAGAAGGAATCTCGGCAACAAACGGCGAGGAGATCGAAAATAGCAGCAAACAAACGGCTAGGAGATCGAAAATACCAGCAAAAAGAA
GAAGAATAGAGAATGAGGAGGGAATTGCCCCAGAGAAGCTTTTTTGTGCTTTTCCTATTTCTATTCATTGTTTCTACTTTTGGACAGAAACAGCAAGAGCACCAGCAGTCCGAGCGTATTGCTGGCAGTGCTGGTGATGTTTTGGAGGATGACCCAGTTGGGAGATTGAAAGTGTTCATTTACGAGTTACCCAGTAAATA
CAACAGGAAGATTTTGGCAAAAGATCCCAGATGCCTTACCCATATGTTTGCCACTGAGATCTTTATGAATCGATTTTTGCTTGCTAGCCCTGTCCGTACTTTGAATCCGGAGGAGGCTGACTGGTTTTATACTCCTGTCTATACTACATGTGATCTCACTCCAAATGGGTTGCCATTGCCCTTTAAATCTCCCAGAATGA
TGAGAAGTGCTATTCAGTACATTTCCACTAATTGGCCATATTGGAATCGCACTGAAGGGGCAGATCATTTCTTTGTGGTGCCACATGATTTTGGTGCATGCTTCCACTACCAAGAAGAGAAAGCTATTGAGAGAGGTATTTTACCATTGCTGCAGCGGGCCACACTGGTTCAGACATTTGGACAGCGATACCATGTCTGT
TTGAAGGAAGGCTCAATCACAGTTCCACCTTATGCTCCTCCACAAAAGATGCAGGCACACTTGATACCTCCCAGCACTCCTCGGTCAATCTTTGTTTACTTTCGTGGTCTGTTTTATGATGTGGGCAATGATCCAGAAGGGGGTTACTATGCAAGGGGTGCACGAGCATCGGTATGGGAGAATTTTAAAGACAACCCTCT
TTTTGACATCTCTACTGAGCACCCTGCCACCTATTACGAGGACATGCAACGGGCCATTTTTTGTCTGTGCCCGTTGGGCTGGGCACCTTGGAGTCCAAGACTTGTAGAAGGAGTGATATTTGGTTGTATTCCAGTCATTATAGCTGATGATATTGTGCTACCTTTCGCTGATGCCATACCTTGGGAAGAAATTGGAGTGT
TTGTAGCTGAAAAAGATGTACCTAACCTGGACACTATTCTTACGTCAATTCCACCAGAGGTCATATTGAGGAAGCAACGATTGCTTGCTAATCCTGCCATGAAGCAGGCTATGCTGTTTCCACAACCTGCTCAACCAGGAGATGCCTTCCATCAGATTTTGAATGGCCTAGCCCGCAAATTGCCTCATGATAGCAGTATT
TACTTGAAACCTAATCAAAAGGTTTTGAACTGGACAGCAGGCCCTCCTGGTGATCTAAAGCCCTGGTAGCATGTAGACACTGTGTAATCAAATTGCCAATGTACCTTCACTTTACAACTCAAGATGAGTTTTAAGGCTAGCCATTCTATTCTTTTGTAGTTTATCATTTATAAGTTATGTTCAGACAAGATATAAGTTTT
CATTGTACACTATTTTTTAAGAATTACTGATATTGTATGATAGCAGTGCTTAAGAGTTTTACAAGTCACATCCTAGTTTTTAGATCCTTGTTGCTGTACAGTGAAGATCTCAGGACAATAAGTAAGATTTTTATGTTTGAATTCTTGGTTTTGAATTTTTATGTTTCAACTCTTGGTTTTGTATGCAATCTGCTAATGTG
CTTTTGCATTCCCCTGTCACTTAACTAATATTTATATTCAGTGCAC

>TRINITY_DN114141_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CATTAATGAATTGAATTGTTTATAACAAATGCTTCAAGTTTATCATTCACCCACAATACAAAGGTACATTATCCAGAAAGGCAACTCATTAAGAATACTATGCTAGCTCTAGCCCATTTTCTTTTTCTAAATGTTACGCATGGATTGTTGTTGAATACATAGCTTATTTGATTGTTTTTGTTGGTTGGTGATTTTGATTT
CAGGAAGAGAAAGCTATTGAGAGAGGTATTTTACCATTGCTGCAGCGGGCCACACTGGTTCAGACATTTGGACAGCGATACCATGTCTGTTTGAAGGAAGGCTCAATCACAGTTCCACCTTATGCTCCTCCACAAAAGATGCAGGCACACTTGATACCTCCCAGCACTCCTCGGTCAATCTTTGTTTACTTTCGTGGTCT
GTTTTATGATGTGGGCAATGATCCAGAAGGGGGTTACTATGCAAGgtaagagacagaatacatcaagttgacaagggtgtgactgaagcaaagtgcgatttttgatatcctctctttgattctatggttattctcaaatgcataagatcttagtgaggattggccagatatttttttaaaactaattgagcttcctgatt
gcttatttttctttctgaactagGGGTGCACGAGCATCGGTATGGGAGAATTTTAAAGACAACCCTCTTTTTGACATCTCTACTGAGCACCCTGCCACCTATTACGAGGACATGCAACGGGCCATTTTTTGTCTGTGCCCGTTGGGCTGGGCACCTTGGAGTCCAAGACTTGTAGAAGGAGTGATATTTGGTTGTATTCC
AGTCATTATAGCTGATGATATTGTGCTACCTTTCGCTGATGCCATACCTTGGGAAGAAATTGGAGTGTTTGTAGCTGAAAAAGATGTACCTAACCTGGACACTATTCTTACGTCAATTCCACCAGAGGTCATATTGAGGAAGCAACGATTGCTTGCTAATCCTGCCATGAAGCAGGCTATGCTGTTTCCACAACCTGCTC
AACCAGGAGATGCCTTCCATCAGATTTTGAATGGCCTAGCCCGCAAATTGCCTCATGATAGCAGTATTTACTTGAAACCTAATCAAAAGGTTTTGAACTGGACAGCAGGCCCTCCTGGTGATCTAAAGCCCTGGTAGCATGTAGACACTGTGTAATCAAATTGCCAATGTACCTTCACTTTACAACTCAAGATGAGTTTT
AAGGCTAGCCATTCTATTCTTTTGTAGTTTATCATTTATAAGTTATGTTCAGACAAGATATAAGTTTTCATTGTACACTATTTTTTAAGAATTACTGATATTGTATGATAGCAGTGCTTAAGAGTTTTACAAGTCACATCCTAGTTTTTAGATCCTTGTTGCTGTACAGTGAAGATCTCAGGACAATAAGTAAGATTTTT
ATGTTTGAATTCTTGGTTTTGAATTTTTATGTTTCAACTCTTGGTTTTGTATGCAATCTGCTAATGTGCTTTTGCATTCCCCTGTCACTTAACTAATATTTATATTCAGTGCAC