sp|Q9FIX3|PP407_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g39710
Intron 1 GTAAGACCCC ... GTGTCAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 80.95 | 2 | 10 | 7 |
| A2 | 40.54 | 11 | 10 | 5 |
| A3 | 90 | 1 | 5 | 13 |
| A4 | 60 | 4 | 9 | 3 |
| A5 | 100 | 0 | 6 | 0 |
| A6 | 71.43 | 5 | 7 | 18 |
| A7 | 69.86 | 11 | 20 | 31 |
| A8 | 77.27 | 15 | 29 | 73 |
| A9 | 60.56 | 14 | 13 | 30 |
| A10 | 70.83 | 7 | 18 | 16 |
>TRINITY_DN114301_c5_g2_i2 from sample A2 / Example spliced isoformCGATGATCCATTGGGAATACTCACCACAGCTATTCCCAACAAATGGCCTTAAACCTCCGCTCTTAAACGTTAAGAAACCTCTATCTATGGAAGCTTAGGGTTTAGGGTATATCACCCTGCAAAACCAGAGTCAAATTTGATCGGAAACTGCAAATTCATTGCAATGCGAAAGCATGGGAAAGTTTTGAGCTCCATATCAG
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>TRINITY_DN114301_c5_g2_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGATGATCCATTGGGAATACTCACCACAGCTATTCCCAACAAATGGCCTTAAACCTCCGCTCTTAAACGTTAAGAAACCTCTATCTATGGAAGCTTAGGGTTTAGGGTATATCACCCTGCAAAACCAGAGTCAAATTTGATCGGAAACTGCAAATTCATTGCAATGCGAAAGCATGGGAAAGTTTTGAGCTCCATATCAG
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ATGTTATGCCTACGAATTGTTTGACAAAATGAGGGATTCGGGCTTTAGTGTTGGCGTTGCTGTATACAACTCATTCGTCAAGTACTATTGTAAGAACAGGCGGATAGAACGTGCATTAGTTTTTGTGGGTGAGATGAAAGAAGACGGTTGTGCGCTGAATAGAGAAACTTATCATTTACTGATCAAGAGACTGTGTTTAG
AGAATAAGTTGGAGAAGGCGTGGGTATTGTGGGAAGAGATGAGATTAGGAGGATGTAATGCCGCCCCCGATACATATGTTTTTTTGATCAAGGCCTTCTGTTGCCGGGGTGAGTTGCAAAATGCATGTGACTTGTTGGAGGAAATGGTAGGCAAAGGAGTGGCTCCTCAGAATCTTCACACGTGGAACACGTTTTATGCC
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AAGGATCCTACTCAGCTACGCAATCAGGTTCATAGAGACATTCATACAGGGAGTGATAGGGATGTGGCAACTTACTACCTAGAATTGGATCGCTTAATACCTCAATCTGGACCAGATGTCACAGTCTGTTGGGCAGCCTTAGCGTAATATGCACCATTGTTTGCTAGGGTGGCATCCAACTCTTTGTACTGGACTGATAG
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TGCTAGTATGTTCCGTTCATAGCACTTAGAAAATATCATAATATCTTCTGTCAGAAGGCCACCTTTGGCATGGGAATCTCAGGTCGAATGTCAGTGGCTTCTTCAGAAAATACATCCCAGATGGAAATGGAGCTTGCTAACATCTTCAATGGTGGCAATCTTGCTACATATCATAAGACAATTTCAGTTCTAGCTTGAGT
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CTTCAATGATTTGCAACGGAGTGTCAAATTTGCCTTGAGCTCTCCATTGCTGCATGgtaagaccccaaattcaccttttggtcttgaataatggggtttgatggtcatggtttgctgcaataactaaacatctggtttcttcagaggttctatactgtcatcaatatcaacacctaaaatggaagttgttttaagaggtc
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ATTTTCTCAAGG