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AAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGT
ATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGC
GAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGAC
GAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGC
CCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTT
CCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAA
CAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGA
AACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGA
CATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAG
AAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAA
AAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCAC
ATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTT
TATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAA
AAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTG
TTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGAT
TCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCC
TAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGG
ATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTAC
CTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAA
ACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATG
AAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCG
TCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCT
GAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTT
ATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATT
AATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCA
GTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATA
GTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCAC
GAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGA
TCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGG
TTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAA
GCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACGTAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACATTCTCTACCCTTTACG
ACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATACAATAGATGTAATCACTTATATAGCATTTCAATGCATTTGAAAATTGATTTTGTACATTAAAGAGAGAGATCATTCTAATTGTACCCTCTCTACCCTTTACGACCCTCTC


>TRINITY_DN132264_c0_g2_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AATATTGTGAAATTTTTGGACATTTCAGACAAATTACATTAGTAATTTGTTTTGGTTATTTTCCTGACAGCTGTTTGAAACTTTTTTGGAATCTATCTGTAAAGGTTGGCTACCCATTTCTGAAAATTTATGGAAATCCTTGTCTGTAACCTGACATTAATATTGCTGTCTGAAGACATGTAACTCTATGGGAGCACTGA
CTTTTCTGAGATTAAATTCTGATTTTGGAATTAATGGGAAAATGTTATGAACTTCGCATTAAAAAAGTTAAAAACTTCTAAGAAATTCTTTTAAGCTTGGATTTCTATTCTTACATTTACTTGATGTTTTTGATATCAAATGGATACAGGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCA
TGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAAT
TCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAG
AAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATT
CCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGTAAGCTTT
TTTATAAGTTATAGTTGTATATCTATGTCACTAGGTTTTTGCTATATTCGGAGATAGGTTTATTATTTATAGGATGACCATGACTTGTAGAACAAAAATTGTAACTTTGTTTAGTGGTCATAATAATAGAGCCCTCATAGGTTTTATGCATTGTCCCACTGGTGGATTCTGACTCTGGTGCTCACGTGACAAGACTTAGA
GTCCTAATCTTGCTCTGTAACGGTGTGCTAATCTTGTTCTCTAAAAGATGTCCTAATCTTGCTGACTAAATGGTTTTCCAGGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGgttattttctgtttgtgtattcatgtttattcaatc
tgtaattgcctgaagctagctgatttttatcatgttgctgttgattccattttttgaattcaaacatttagAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAG
CATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTT
GTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACAT
GGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGG
CTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTT
CTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTT
TGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATG
CAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCAT
TTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGC
TTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCA
GCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATAT
TGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATC
TGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTA
CAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGA
TCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGA
AACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCT
TTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGG
AGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCG
AAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACA
GCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCA
CATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTC
TTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCC
AAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGA
CTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAAC
ACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGAC
CCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTT
ACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATT
TGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAA
TGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACG
TAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACATTCTCTACCCTTTACGACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATACAATAGATGTAATCACTTATATAGCATTTCAATGCATTTG
AAAATTGATTTTGTACATTAAAGAGAGAGATCATTCTAATTGTACCCTCTCTACCCTTTACGACCCTCTC



Intron 2 GTAAGTTTTT ... AATTTTACAG

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A134.4416512.7
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A8-1000
A9-1000
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>TRINITY_DN132264_c0_g2_i16 from sample A1 / Example spliced isoform
GCCAATTTTCTTTTTAAACAGCAAGCAAGATATTGTTTGATCTTCTACTTCAAATTTCTTTAGGGTTTAGGGTTTAGTATACTAAGGAAGACCGGGTTATTATGTAAGTTTCAATTGTTGAGAACCTATCGTTCTCGTCTTTGCTACCGAAGTTCCAACTGAGGATTGCGCAGCGACTATACACGAGACACTCTTGAACT
ATGTTATAATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGATATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACG
AGGCCTTCAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTTATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAG
ATCTATTGCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCATAAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGC
ATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTG
GACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGT
GTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGGTCTGTCCAGTATTTCCCACACTACTAAAAATATATGATCATCCATGCAATTTTGGTGAGGTTTTATTTCAGAATGCAGGTTTTCGCTGTTAACATAT
TTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGG
AAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAG


>TRINITY_DN132264_c0_g2_i18 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CCGGGTTCGGTTTCCGGTCCGGTTCACATTTTGGGCTCTGCTGGTTTGATCACCTGTCCGGTTCTGATAACATTGCATTGATCTTTCATTCATGTATATAATAAATCATTTTATTGGCGGTGGATATTTTTTTGACAGTTGTTTTATTATACTTGTGGATCACTTTTTTTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGG
AAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGGTCTGTCCAGTATTTCCCACACTACTAAAAATATATGATCATCCATGCAATTTTGGTGAGGTTTTATTTCAGAATGCAGGTTTTCGCTGTTAACATATTgtaagtttttcttttgcaaatggataaatatgaaatttttatttacttgcttcatattatttattgatcttt
tcatttggattgcaattttacagTGATTTTCCAG



Intron 3 GCAAGAATCT ... CTGTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A121.39792815
A227.87662031
A320.27591416
A421.39682314
A524.53401412
A626.531867
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A820804
A912.21832
A1011.111212



>TRINITY_DN132264_c0_g2_i12 from sample A1 / Example spliced isoform
CCGGGTTCGGTTTCCGGTCCGGTTCACATTTTGGGCTCTGCTGGTTTGATCACCTGTCCGGTTCTGATAACATTGCATTGATCTTTCATTCATGTATATAATAAATCATTTTATTGGCGGTGGATATTTTTTTGACAGTTGTTTTATTATACTTGTGGATCACTTTTTTTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGG
AAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGT
ATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGC
GAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGAC
GAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGC
CCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTT
CCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAA
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AACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGA
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AAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAA
AAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCAC
ATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTT
TATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAA
AAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTG
TTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGAT
TCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCC
TAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGG
ATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTAC
CTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAA
ACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATG
AAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCG
TCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCT
GAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTT
ATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATT
AATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCA
GTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATA
GTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCAC
GAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGA
TCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGG
TTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAA
GCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACGTAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACATTCTCTACCCTTTACG
ACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATACAATAGATGTAATCACTTATATAGCATTTCAATGCATTTGAAAATTGATTTTGTACATTAAAGAGAGAGATCATTCTAATTGTACCCTCTCTACCCTTTACGACCCTCTC


>TRINITY_DN132264_c0_g2_i8 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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ATGTTATAATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGATATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACG
AGGCCTTCAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTTATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAG
ATCTATTGCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCATAAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGC
ATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTG
GACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGT
GTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCAC
ACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTC
TGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAAT
ACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTT
CTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTC
ACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCT
AATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGA
ATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTC
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GTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCT
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AGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAG
TCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAAC
AGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTT
TGATTTAAAGgcaagaatcttatttgatgacaatttgtttattgtttctaagttttttatttttgaactttgttgaccttagactttatttagatgtttttgtctactgaaatgttttcctgtttgcagGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTAC
CCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGT
TGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAG
TGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAA
TTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGC
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TTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCT
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Intron 4 GTAAGTGATG ... CTTTGTGCAG

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>TRINITY_DN115017_c1_g2_i14 from sample A2 / Example spliced isoform
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GTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATG
GAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAG
GTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCAC
GGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGC
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TTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATC
CAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTC
GAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATT
TGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGT
GTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGG
AAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCT
GAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTA
CTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTAC
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TCTCTACCCTTTACGACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATAC


>TRINITY_DN115017_c1_g2_i10 from sample A2 / Example unspliced isoform:
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TTTAGGGTTTAGGGTTTAGTATACTAAGGAAGACCGGGTTATTATGTAAGTTTCAATTGTTGAGAACCTATCGTTCTCGTCTTTGCTACCGAAGTTCCAACTGAGGATTGCGCAGCGACTATACACGAGACACTCTTGAACTATGTTATAATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGA
TATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACGAGGCCTTCAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTT
ATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAGATCTATTGCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCAT
AAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGA
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TTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATT
AAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCA
CATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTG
TATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTA
TGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGC
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AGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGC
CTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGA
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GAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAG
GTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCAC
GGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGC
ATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCC
TACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGAC
CCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTC
AACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAAT
GACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGA
GAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACAT
TTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATT
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TCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTT
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Intron 5 GTAAGCTTTT ... GGTTTTCCAG

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>TRINITY_DN132264_c0_g2_i12 from sample A1 / Example spliced isoform
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>TRINITY_DN132264_c0_g2_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AATATTGTGAAATTTTTGGACATTTCAGACAAATTACATTAGTAATTTGTTTTGGTTATTTTCCTGACAGCTGTTTGAAACTTTTTTGGAATCTATCTGTAAAGGTTGGCTACCCATTTCTGAAAATTTATGGAAATCCTTGTCTGTAACCTGACATTAATATTGCTGTCTGAAGACATGTAACTCTATGGGAGCACTGA
CTTTTCTGAGATTAAATTCTGATTTTGGAATTAATGGGAAAATGTTATGAACTTCGCATTAAAAAAGTTAAAAACTTCTAAGAAATTCTTTTAAGCTTGGATTTCTATTCTTACATTTACTTGATGTTTTTGATATCAAATGGATACAGGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCA
TGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAAT
TCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAG
AAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATT
CCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAgtaagcttt
tttataagttatagttgtatatctatgtcactaggtttttgctatattcggagataggtttattatttataggatgaccatgacttgtagaacaaaaattgtaactttgtttagtggtcataataatagagccctcataggttttatgcattgtcccactggtggattctgactctggtgctcacgtgacaagacttaga
gtcctaatcttgctctgtaacggtgtgctaatcttgttctctaaaagatgtcctaatcttgctgactaaatggttttccagGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGGTTATTTTCTGTTTGTGTATTCATGTTTATTCAATC
TGTAATTGCCTGAAGCTAGCTGATTTTTATCATGTTGCTGTTGATTCCATTTTTTGAATTCAAACATTTAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAG
CATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTT
GTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACAT
GGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGG
CTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTT
CTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTT
TGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATG
CAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCAT
TTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGC
TTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCA
GCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATAT
TGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATC
TGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTA
CAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGA
TCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGA
AACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCT
TTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGG
AGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCG
AAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACA
GCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCA
CATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTC
TTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCC
AAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGA
CTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAAC
ACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGAC
CCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTT
ACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATT
TGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAA
TGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACG
TAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACATTCTCTACCCTTTACGACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATACAATAGATGTAATCACTTATATAGCATTTCAATGCATTTG
AAAATTGATTTTGTACATTAAAGAGAGAGATCATTCTAATTGTACCCTCTCTACCCTTTACGACCCTCTC



Intron 6 GTTGGTGAAT ... TGCTTTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN109717_c1_g4_i7 from sample A5 / Example spliced isoform
CGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCG
AATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGG
CAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCA
CGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATC
ACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAG
TCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATA
CGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAA
TACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAG
CTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGA
GAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTA
CCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATT
TAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTA
CCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGT
TTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAG
CAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGATGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCA
GGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGC
AGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGC
TGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACA
GTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATT
TACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTG
TAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAA
GGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGC
CGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGC
TTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTT
GCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCT
TCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCAC
AATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCT
GTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGT
GGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTA
AATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGAC
CAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGA
AGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATAT
GTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAAT
TTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGG


>TRINITY_DN109717_c1_g4_i2 from sample A5 / Example unspliced isoform:
CGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCG
AATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGG
CAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCA
CGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATC
ACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAG
TCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATA
CGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAA
TACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAG
CTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGA
GAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTA
CCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATT
TAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTA
CCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGT
TTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAG
CAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGATGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCA
GGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGC
AGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGC
TGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGgttggtgaatttttatttgtttttggtacaaatgatttctaatgcagaagaatgatttttagatctagtttgagtgtggtgttccatgaaaattaacaacttatttgatgtattatgctttttagGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTG
GCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTG
GATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGC
AGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCA
CTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACC
CTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAG
AGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAA
ATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTT
GTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAG
CACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCT
CGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCA
ATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGAC
TGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGG
TGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACA
GCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGT
TGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTAT
GATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACT
TTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGG



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TCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTTATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAGATCTATTGCC
TCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCATAAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGA
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TAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTT
CAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTG
TCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCC
TTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACT
GCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATC
ACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTA
CCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCA
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TGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGT
TTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGG
GCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCT
GAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAA
ATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGATGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCT
CCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGC
AAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAA
TTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAG
GATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACA
AAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGG
CAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGC
AAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGT
TCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAA
CGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGT
ACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGT
GTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAA
TCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTG
GACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTC
CTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAG
AGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTT
TCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACT
TCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTT
CTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAA
ACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACGTAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCC
ATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACATTCTCTACCCTTTACGACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATACAATAGATGTAATCACTTATATAGCATTTCAATGCATTTGAAAATTG


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AGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGT
CCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCT
TGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATC
ATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCT
GGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGA
CTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCA
TTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACT
TCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCT
TATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGATG
CTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGT
TACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAA
AATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAA
ACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCA
TGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGG
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ATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTG
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GCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAAC
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TCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTT
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AGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGG
AGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTAT
TCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTAT
CAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTA
TCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGT
TGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTG
CAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTA
AAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGTGAATTCTCAGTT
TTATACATGCTTTTGGCATTGGTTACCTGGGAAATCTTTGGATATCTAGAACTTATGCTTGTGTGCCTTCTTTTCAGTGATGACTTTAGTTGTACAATTAGAATTGATGGTGTTTTTACATGTCAGAGCATGCTCAAGTTATATTACTCTGAACCAAATAGTTTCTTTCTATACATTTGGAGATATATTGGTAGGAAACC
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GGAAGTACATAAGAATAAATAGCTATCTCATTGATTTAATTTCATGGTATGTCCCGTGTTAAATAAAATAATATAATTTTATTGATGCGCC


>TRINITY_DN108197_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:
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AATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGATATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACGAGGCCTT
CAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTTATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAGATCTATT
GCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCATAAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTT
AGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTG
ATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCATCGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTG
CTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGgttccgggttcggtttccggtccggttcacattttgggctctgctggtttgatcacctgtccggttctgataacattgcattgatctttcattcatgtatataataaatcattttattggcggtggatatttttttgacagttgttttattatacttgtgg
atcactttttttcagGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCAT
CATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCA
ATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACA
ATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGT
TGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGG
CCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCT
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GAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAG
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TTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAG
GTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATA
AAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTAT
TGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGC
TTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTT
AATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGAT
ATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAA
TATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTA
TGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGA
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AGATCTCGGTAAGTGATGTGTTTGGAGTTAAAGTGGAAGTAATAGGTTTCAACTTTCAACTGCGTGGGAATTTTAAGCTAGGCTTCGATGCAAATTTGTTGGCATGGAGTACATTCTTGTGTTGGGGCTAAAAGCCATTCTTTGTGCAGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAG
AATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCT
AATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGT
GTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGAT
GCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAAC
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TTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTA
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Intron 9 GTCTGTCCAG ... AATTTTACAG

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ATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATT
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TTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAA
GCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACGTAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACATTCTCTACCCTTTACG
ACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATACAATAGATGTAATCACTTATATAGCATTTCAATGCATTTGAAAATTGATTTTGTACATTAAAGAGAGAGATCATTCTAATTGTACCCTCTCTACCCTTTACGACCCTCTC


>TRINITY_DN132264_c0_g2_i18 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CCGGGTTCGGTTTCCGGTCCGGTTCACATTTTGGGCTCTGCTGGTTTGATCACCTGTCCGGTTCTGATAACATTGCATTGATCTTTCATTCATGTATATAATAAATCATTTTATTGGCGGTGGATATTTTTTTGACAGTTGTTTTATTATACTTGTGGATCACTTTTTTTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGG
AAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGgtctgtccagtatttcccacactactaaaaatatatgatcatccatgcaattttggtgaggttttatttcagaatgcaggttttcgctgttaacatattgtaagtttttcttttgcaaatggataaatatgaaatttttatttacttgcttcatattatttattgatcttt
tcatttggattgcaattttacagTGATTTTCCAG



Intron 10 GTTTACTCAT ... ACCCTGGCAG

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>TRINITY_DN132264_c0_g2_i12 from sample A1 / Example spliced isoform
CCGGGTTCGGTTTCCGGTCCGGTTCACATTTTGGGCTCTGCTGGTTTGATCACCTGTCCGGTTCTGATAACATTGCATTGATCTTTCATTCATGTATATAATAAATCATTTTATTGGCGGTGGATATTTTTTTGACAGTTGTTTTATTATACTTGTGGATCACTTTTTTTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGG
AAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGT
ATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGC
GAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGAC
GAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGC
CCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTT
CCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAA
CAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGA
AACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGA
CATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAG
AAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAA
AAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCAC
ATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTT
TATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAA
AAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTG
TTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGAT
TCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCC
TAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGG
ATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTAC
CTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAA
ACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATG
AAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCG
TCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCT
GAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTT
ATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATT
AATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCA
GTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATA
GTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCAC
GAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGA
TCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGG
TTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAA
GCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACGTAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACATTCTCTACCCTTTACG
ACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATACAATAGATGTAATCACTTATATAGCATTTCAATGCATTTGAAAATTGATTTTGTACATTAAAGAGAGAGATCATTCTAATTGTACCCTCTCTACCCTTTACGACCCTCTC


>TRINITY_DN132264_c0_g2_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GCCAATTTTCTTTTTAAACAGCAAGCAAGATATTGTTTGATCTTCTACTTCAAATTTCTTTAGGGTTTAGGGTTTAGTATACTAAGGAAGACCGGGTTATTATGTAAGTTTCAATTGTTGAGAACCTATCGTTCTCGTCTTTGCTACCGAAGTTCCAACTGAGGATTGCGCAGCGACTATACACGAGACACTCTTGAACT
ATGTTATAATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGATATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACG
AGGCCTTCAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTTATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAG
ATCTATTGCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCATAAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGC
ATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTG
GACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGT
GTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGgtttactc
atctcaacctagcacacctttcctaactatgtaggtaaggcatataatgtctaatcctattaatatattacgtctctttaccctggcagTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAA
GATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTC
CAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTC
TCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGC
AACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGT
CTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAA
ACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGA
TCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAG
AGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGG
TACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGAC
CAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTAT
TAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGAT
AAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGA
GCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTG
ATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTG
ATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGC
ATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTAC
AACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTT
GAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGG
CATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTG
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GTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCT
GGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTT
CTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTA
AGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCT
AACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTC
AGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAG
GTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCT
TTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTT
TCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCA
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Intron 11 GCAAGTTCTT ... TCAATGTCAG

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>TRINITY_DN108197_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform
TTCTTTTTAAACAGCAAGCAAGATATTGTTTGATCTTCTACTTCAAATTTCTTTAGGGTTTAGGGTTTAGTATACTAAGGAAGACCGGGTTATTATGTAAGTTTCAATTGTTGAGAACCTATCGTTCTCGTCTTTGCTACCGAAGTTCCAACTGAGGATTGCGCAGCGACTATACACGAGACACTCTTGAACTATGTTAT
AATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGATATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACGAGGCCTT
CAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTTATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAGATCTATT
GCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCATAAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTT
AGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGAACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTG
ATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAGTTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCATCGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTG
CTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGTTCCGGGTTCGGTTTCCGGTCCGGTTCACATTTTGGGCTCTGCTGGTTTGATCACCTGTCCGGTTCTGATAACATTGCATTGATCTTTCATTCATGTATATAATAAATCATTTTATTGGCGGTGGATATTTTTTTGACAGTTGTTTTATTATACTTGTGG
ATCACTTTTTTTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCAT
CATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCACATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCA
ATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACA
ATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTATGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGT
TGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGCGTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGG
CCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCT
GAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGCCTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCT
GAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAG
CTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAG
GCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATAT
TTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAG
GTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATA
AAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTAT
TGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGC
TTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTT
AATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGAT
ATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAA
TATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTA
TGGACCCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGA
TGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCT
TGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGT
CCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGA
AGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTTTTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAA
AGATCTCGGTAAGTGATGTGTTTGGAGTTAAAGTGGAAGTAATAGGTTTCAACTTTCAACTGCGTGGGAATTTTAAGCTAGGCTTCGATGCAAATTTGTTGGCATGGAGTACATTCTTGTGTTGGGGCTAAAAGCCATTCTTTGTGCAGGTACGGCTTTTGCTTGATCCAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAG
AATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCT
AATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGT
GTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGTGTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGAT
GCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGGAAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAAC
ACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCTGAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTC
TTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTACTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTA
AAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGG


>TRINITY_DN108197_c0_g1_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TCCTCACAGAAAAATGgcaagttcttattttcatttgctttcaagaatgttatgcaactagtgtattctgcctaggctattttctaaatatatagggctacttatattgttcattgatttcaatgtcagGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAG
CTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAGGTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGC
GCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGG
AATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCG
ATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTT
TGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGG
TTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTT
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>TRINITY_DN115017_c1_g2_i14 from sample A2 / Example spliced isoform
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TATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACGAGGCCTTCAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTT
ATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAGATCTATTGCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCAT
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ACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAG
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AAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCA
CATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTG
TATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTA
TGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGC
GTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGG
AGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGC
CTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGA
GGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGA
GTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATG
GAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAG
GTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCAC
GGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGC
ATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCC
TACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGAC
CCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTC
AACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAAT
GACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGA
GAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACAT
TTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATT
GAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCAAATGCCCAGTGGCATTCTTTAG
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GATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTT
TTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATC
CAATTGTTAGAGTTTATGGAAAGGCAGTAGAGAATGGAGAAGCTTCTGTCTCAGCCATTTTTGAAATGCTAGCAGTTGTTTCTGCCAAATTGGACAGAACATCTGTTGTAACTTATCATGCAAAAATATTCGAGACATGTTTGATAGCTTTGGACCTTCCTCGGCAACATCCAGAATCAATCAAGGACATGGGTAAAGTC
GAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATT
TGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGT
GTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGG
AAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCT
GAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTA
CTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTAC
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TCTCTACCCTTTACGACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATAC


>TRINITY_DN115017_c1_g2_i17 from sample A2 / Example unspliced isoform:
ATTTTATGTATTTTTTAGTCGTCCGGTTTTTTTCCCAGTTTTTTTCCTGTTCTGGTCAGGTTCCGGGTTCGGTTTCCGGTCCGGTTCACATTTTGGGCTCTGCTGGTTTGATCACCTGTCCGGTTCTGATAACATTGCATTGATCTTTCATTCATGTATATAATAAATCATTTTATTGGCGGTGGATATTTTTTTGACAG
TTGTTTTATTATACTTGTGGATCACTTTTTTTCAGGCACAGCTGATTAAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGGTCTGTCCAGTATTTCCCACACTACTAAAAATATATGATCATCCATGCAATTTTGGTGAGGTTTTATTTCAGAATGCAGGTTTTCGCTGTTAACATATTGTAAGTTTTT
CTTTTGCAAATGGATAAATATGAAATTTTTATTTACTTGCTTCATATTATTTATTGATCTTTTCATTTGGATTGCAATTTTACAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAAT
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TATTTTCTGTTTGTGTATTCATGTTTATTCAATCTGTAATTGCCTGAAGCTAGCTGATTTTTATCATGTTGCTGTTGATTCCATTTTTTGAATTCAAACATTTAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTGTATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGA
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catagacactactatttttcttttgtggaacaagttttgatcttataatttgccagGCTGAAATACGAGCAACTGCA



Intron 13 GTTTTCTTTA ... CTTTGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN115017_c1_g2_i14 from sample A2 / Example spliced isoform
TTGCTCTCTTTGATTAAAATCTTAGAATATGAAGAATCATGTTCTTTTCCTTATTGAAAAAACACTTAGAAAATTGTTTTATATTTTCTATTTAACAAATTTGGATTAAAAGTTCTTTTCCGGCATAGCCTTAGCCAACATTGCCAATTTTCTTTTTAAACAGCAAGCAAGATATTGTTTGATCTTCTACTTCAAATTTC
TTTAGGGTTTAGGGTTTAGTATACTAAGGAAGACCGGGTTATTATGTAAGTTTCAATTGTTGAGAACCTATCGTTCTCGTCTTTGCTACCGAAGTTCCAACTGAGGATTGCGCAGCGACTATACACGAGACACTCTTGAACTATGTTATAATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGA
TATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACGAGGCCTTCAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTT
ATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAGATCTATTGCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCAT
AAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGA
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AAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCA
CATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTG
TATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTA
TGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGC
GTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAATACTCAAAATGAGAAACCTGCGG
AGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTTCTGGCGCTTGCTTAAGGGGTGC
CTCTCATTTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGA
GGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTTCCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGA
GTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACTTTATGACCTTTCCCGGGGCATG
GAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAGTTCCAGATAATCTACACAAAAG
GTTTGATGAAAGAAAAAAAGAAGTAATTCTCTTATTTATCTTGACCAATGCACTTGAGTTTCCAACCTATGCCAAGTATACACTGCTTTCTGCGCTCCAAGAAGCAGGGCATGTATCTAAGCAAGTAGCAGAGACGAAGGCTTTGCTATCAAATCTTTTGTTGCGGCGAAAAGGTTTCCATCTCAAATATGATTTATCAC
GGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACCGTGCATAATAGTTTTGGAAAGC
ATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCACATTTTCCTAGAATTGAAAATCC
TACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTTGGCAAGACCATAGAAGATGGAC
CCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGTGGATCTAGTTGTGCAATGTGTC
AACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAGCAGTGGTTCCATGCTGGTTAAT
GACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCCACTCAGAAAGCACAAAATCTGA
GAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGACCCTACAAATTGAAGCCACACAT
TTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAAGAGAAGCTGCATATTGTTTATT
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GTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGTTGTTGCAAATCTCACAGCAGAT
GATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGAGCACAGCTGCTAGGGGAGCCTT
TTTGATCTCTGTTCTGAGTGTTTTAGAAGCAGTTGTGCAGAAGCTGGGCGGGTTTTTGAATCCATACTTGGAAGAAATTGTTGGTCTTTTAGTGTTGCATTCACAATTTACTACTGACTCAGGTTCCACTGTGTGCACAAAAGCTGCTTCAATCCGCATTCTCATTTCGGAAAAGATCTCGGTACGGCTTTTGCTTGATC
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GAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGACTGGGAAGCTCAGGTCTGTATT
TGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTGGTGATTTCATCCTTGCACAAGT
GTTTTCTGTATGATAGTGTTGGATTCCTTGATGCCTCTAAGTTTCAGATCCTCCTCAAGCCAATTGTTTCACAGCTCGTTGTAGACCCACCTAAGACAGTGGACCAATTGGAAGATGTCCCAAGCATCCAGCAAGTTGATGATATTTTAGTTTCGTGCCTTGGTCAAATGGCCTTGACAGCAGGAACTGACCTTCTCTGG
AAGCCACTTAATCACGAGGTCCTTATGCAAACACGTAGTGAAAAGGTTCGTGCACGGATTCTTGGTTTGAGGGTTGTGAAATACTTACTGGAGCACCTCAAGGAAGAATATCTTGTACTCCTTCCTGAGACCATTCCTTTCCTTGGGGAACTTCTTGAAGATTCAGAACTGGATGTAGTTGCTCAGGCCCAGGAAATTCT
GAAATCCATGGAAGATCTAAGTGGTGAAAGTCTTTCACAATATCTTTGATCCCCATTTTTCAAAAGAAACCCAAACCTAAATGATTTGATCTAGTTCAGGATATGTTCTACACGGCTGGCTCTCTCGATTATGTTCTATGTTATTCAGTGTTCTCTGAAATATTGTGTCCATTTATTATGATATTTAGAGAGCATTTTTA
CTGAAGGAGGCCCGGTTATTATTTTATTTGTAAAATGATTTCGTTTCCAATTTTAGATGGTATATTCCAGTCAATATGATTGCAAATGATATGCACGTCAAAATTTAATTGTTAAGACAAGTGAAAAATGCAAAAGTGGTGATTCGAACCAAACCAGTGCCAAATAAGTTTTAGTCACTTTTGGTAATCACAACATCTAC
TACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACGTAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTCAAAAATAAATCAAAATACACAT
TCTCTACCCTTTACGACCCTCTCTTAGCCTGAAAGGTGTATCTATAC


>TRINITY_DN115017_c1_g2_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TTGCTCTCTTTGATTAAAATCTTAGAATATGAAGAATCATGTTCTTTTCCTTATTGAAAAAACACTTAGAAAATTGTTTTATATTTTCTATTTAACAAATTTGGATTAAAAGTTCTTTTCCGGCATAGCCTTAGCCAACATTGCCAATTTTCTTTTTAAACAGCAAGCAAGATATTGTTTGATCTTCTACTTCAAATTTC
TTTAGGGTTTAGGGTTTAGTATACTAAGGAAGACCGGGTTATTATGTAAGTTTCAATTGTTGAGAACCTATCGTTCTCGTCTTTGCTACCGAAGTTCCAACTGAGGATTGCGCAGCGACTATACACGAGACACTCTTGAACTATGTTATAATTCAAACTTCAAATATCTTCAGGGTTTACTGCACTTAGGAAGACCCGGA
TATTCTCTCATCCACTGCCAAAGTTCCAAGTCAGGGAGACTTTTCTGGAACCACAGCCATGGCGACTTCTCTGGAATCCCAACTTAAAGCTATTGCTTCCACCCATGTGCAAACCGGGGAGTTGAAAAAGCGCCCCTTCACGAGGCCTTCAATCCTGTTCGATCCCACTGAAGCAGCAGATGTTAGTTTAGAAAGCGTTT
ATGACATTGCTCTCAGAGGGCTTGATGAACTCTCCGCAATTGAAAATCTCTTTGCTACATTTAAGAAGACTTTATTCAATTCAGAAAGCCTACAGATAGACCGGGAGCTTCAGAACAGAGAATACAATGCAAAACTAGATAGATCTATTGCCTCATTCTTGCGTTTACTATCTGGATATCTACTTCTTGCACATTCTCAT
AAGACACTGGAGTACTTGATTCGGCGATACAAGATATATGCATACAACGTAGACGATGTGATACTCTGTGCTCTTCCGTACCATGAAACAAGCTTATTTGTGCGAATTGTACAATTGCTAAACTTGGAAAAAACCAAGTGGCATTTTTTAGAAGGAGTGAAGAGGTCAGGTGCACCTCCACCAAGAGCAGTCCTGGTTGA
ACAATGTACCCGTGTAACAGCAGTTTTGGAGACGATATGTGAATATAATATGCCAGGGAACAAAAACCGAACCTGCTCCAAATTCTCAATTTCCTTCTGTGTGGCAGTAATAATTGAGACCTTGGGTGCTGTGACAACAGTGGACACTGATTTAATTAACAAAGTTCTCCCATTCATCCTTTGTTGCTTTGATCCTTCAG
TTGGTCAAGACTACAAGGTAGGTGGACTGATGATTGTGGGTACCTTAGTGGGTAGAGCAACGTTGTCAGAAAAGCTTATCCAGAAATTGATTTGCTCAGTTGCACGATCTCTTCAGAAGGATGCCGACAGATTAGATTATGTGTCTTTGCTTCAAATGACACTTATGGCCTTGATTAAGTTGACTCAGGCACAGCTGATT
AAGCTTTTTCCTTGGAAAGCCCTAGAAGTTCTTTCAAATATCAGTGATTTTCCAGCTAGTCTTTTGGAACTTTCAAAAACATTCCGTATGGAGAAGTTCCTATCACTCATTTTAGATGGATTAATTTATCACAGTTTCTCACACAAGTCCTGTCAAAATGCTTTGATTACCATCATTGACACTGTCCCTATGAAAAGCCA
CATTGTACAAGTTGTATCCAAAGTCCTAGGCCTTTGGACGGGGAAGATGGCACAGCTTGACATTCCTGATGCAAGGACTTGGACCCGACAGGTTTTATTAGAAGTCGAAAAACATTATCCAGCTGAGCTGGATAATGCAGTCTGCAACTTCCTTGAGAATTCCCAGGGAACCAATAAGCAATCATTAAGTGGTGCTCCTG
TATTTGAGATTCTGCGAACTGTCTTCAGTGGAAGTCTACATGTTCCAATGGAAGAGTCTAATGCAAGTATCCTTGTGTCGTTGGAGCATCCAAAGGCTGAAATACGAGCAACTGCAGTGTCAAGCTTGACTACTTTTGGAATACTTGAAACTGCCACTTGTGACATGAAGACAATGATAAATATACAAGAGGCACTGCTA
TGCCGTCTACATGACGAAGATCTCAGTGTCGTCCTTGCAGTTCTCTCACTGGACAGTTTGGCAAGGGTTGTTGATACTGTTCCTTTGTTGAAGGCATTGTCTAATACCTTGTCAAGATGCTATTCGATTATAAGAACAGGTTCTAAGGGATCACGAAGACAAGCTAATGTTGTTGCAAACTTATGTCTTGAATTTATAGC
GTCAAATTTCTTGGCCCAAAATCCCGATTGCTTGAAGGAAGTTGCAACAATGATTTTGCCTAATATACTGATTCTTCCAAAGgttttctttacgcttttgacctgaatacatatttattatcacaaaaactgtgatctttctgttagatattatgattaaagagtaacaactatgtgattttcttgacatattctgtggt
agcatggcatgatttcttttgatttttcattttctatcgtcaatgaagttattgataaaaaaattagctgagggaaatgacaccaatttgtgccctttgtgcagACATGGAAATTGAACCAAAAAGCTTTGGAACTTGCTGGGACAATATCGTGCCCTCTTTTCACTTGTCTTACCCCTATGCTTGAGCTAATGGCCAAT
ACTCAAAATGAGAAACCTGCGGAGAATTGGCACATTTCCATAAACATAAAGATCATTGGAGCTTTGTCTGATGCCTTGCTTGAAAATTTGGAGACATCCTTGCCTTGGCTTATTGAGTGCTGTAGAGAACTTGGGAGAGCCAAATCACTGCTTTACCTCGTTCTAATACATTCATTCATGCAGCAAAGAGAAGCTGAGTT
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ACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGATCAGCTGTT
CCTGTTAAAGTGCAGGTGGAGAGTTTGAATGCTTTGACATCACTTTGTTTGGCATTACCAAGAGCAGAGTCATATGAAAGAAATGGAATGCAGGGCATCAATGCCATGCAGTTGCAGCTAGCTTTACCATGTATTCTAGTGGCATTATGTAGTGCAGTTCAGGCTGTTCGGAGGGCAGCAACAGAAAGCATCCAGGCACT
TTATGACCTTTCCCGGGGCATGGAGACATCCTCACAGAAAAATGGTACTGAACTTCTGGATGAACGGTACATCCCAATGGATGTCTTTGAAGAATTCATGGAATGCATTTTACAGCTCAAAGAAGTTTTTGATTCCGATGGAAACTTCCTCAGCCCATTTTTGAGTTCTATTCTGAATTCGTCAAGCAGGCATATTTCAG
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CATCTCAAATATGATTTATCACGGGAAAAATTCTCACATGATGAAGTTCAGCTGCTGTGTGTACTATTAAAGACCTATATGCTGCACATCGACTCTTCACAAAACTCAGCAAAGGAATCCAACGCAGGTGGTCTAGAGCCAATATTTGAAGCGCTTTTTGTAGAAGGTGTATCTCCAGACGATCCTGCAGGCATAAAACC
GTGCATAATAGTTTTGGAAAGCATAAGTTCATCGTTTTATGATTCACAGACTGTTACATTGCAGGATAAATTATTCTCGTGTTTAATAATATTGTTTAATAGTGATATTGGAGCGATTCGTAATGCAGCCATCGATGCTTTGCGGAGAATTGATGTAAATGGAGTCACAGTTGCAAAGCAAATCGATTTGGTTATTGCAC
ATTTTCCTAGAATTGAAAATCCTACAAAAAGGCTGAAAAAGAGGAAACTGGAAAAATCTTGTCATGAGCGCCCAAGCAGTGTAGGGCTGCTTGCAGAGGGACAGCATCTGAGTTTTGCTGGTGCGCTGTTGGATTTTTTGGTTTGGAAGAAAGATATTAACAACAGGCTTGCAATTATAGAACCTTTATTTAGGCTTCTT
GGCAAGACCATAGAAGATGGACCCTTAAGACCTGGTGTTCGTGGGCAACACGAAACAGGACTCCTTGATAATGCTCATGAATCAAGAAGCAATGCTATAAGTTACCTACAGCAGGTTCTACTGACAGTTTTGGAAAACATAAGCAATTCACTATTGACAGATTTTGATTTAAAGGATATAATATGTAAGAACTTTAATGT
GGATCTAGTTGTGCAATGTGTCAACATTGCAAAGGATTCAACTACCCGTAATCATGCTTTGTCATTGATGACTGCTCTTGGAAGGCTACTTCCTGATCAAGTGTTGGATCACGTTATAGATATATTTACTATTATGGGTGAATCAACTATAATACAGGATGACAGCCATTCACAAAAGGTCTCAGAAGAGTTGATATCAG
CAGTGGTTCCATGCTGGTTAATGACTACTAAAGATCCTAAAAAGTTGCTGAAGGTTTTCGTTAATGCATTACCGCGAATGTCTCAGCATCGCAGATTGGCTATCATGAAACATCTGCTAGGGGTTGTAGGTGAAGAAACAAGTTTGCCCGCCCTTCTGTCTTTACTACTTCAGGCAGTGGTTTCAAGAACTTTAATATCC
ACTCAGAAAGCACAAAATCTGAGAGATAAGCCAGTGGATTCAGAGTGGGAAATTGAGTTTTGTGTACAACTGAGTGGGCAATACCCATCAAGAATATGGCTTCCATCTTTAGTTAAGCTTTTGCAAGGAGCGAGGACAGATGCATATGCTCTGGATCGACTTCAACCAGAGTGCAAAGGGGATGATTCATTTTTATGGAC
CCTACAAATTGAAGCCACACATTTTATTACAAATTACCTGAAAAATTCTGAATTGGCTTTTCAGCTTGAGGTTGCACATGACCAGGCAGCTTTGCAGGAAGCACTAGGAGCTCTTATGGAACAAGCCGTCTTACAATTGCAGATTATTGATAAAAAGTCTAAAAAGCCAATTGTTCCTTCTGGTTTCAAGAATGATGCAA
GAGAAGCTGCATATTGTTTATTGAATGCTGTCACAAAACTGATGCCTCCATCAGCCTACTCTAAAGGCATCACATCCCTGTTAAAGCACTCAGATGCAAATGTCTGCGAAAAGGCACTTCAATTGCTTTGTGAAAACTTGAAAGATAAGGCTGGTCTTGTACAACAATCGAGAACGAAGAGGAAAATGGTTACCTTGCCA
AATGCCCAGTGGCATTCTTTAGGTGAAGAAAGTGATGAAGCATTCAAAGAAATGATTGTGGAGATTGTTGAGTTGCTTAAGAGATCCCCAGAAGATTCATCTCTGACAGCAAAAATTGCAGCAGTTGCTACATTAGATGTCCTGGCAAAGAAATTTGTTGGCAACTTTCCAAGTACCTTTAGTGCCTGTCTTAGTCCTGT
TGTTGCAAATCTCACAGCAGATGATGTGGCTCTTTCGTCAGGTTGCTTGCATTGCATAGCTTCTCTTGTTTCTGAACTTGGGCCACAAGCGTTGGCTCAGCTTCCTCACATTATTAAATATATCCTTCAGAAGGCATGGCAAGTATGCTCATCTTCTTATAGAGAAGCAACAGTGTCCAAGATGACAGACATTGAAGGGA
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AATCAAGGACATGGGTAAAGTCGAGACAAGTGTAATTAATGCGCTTGTGGCCCTAATAATGAAATTAAGTGAGGCTACATTTAAGCCTCTCTTTGTTCGGAGTTTAGACTGGGCAGAGTCTGAAGTGGAGAGTGATGGATCATCATCGGGCCGTAATATTCAACGCAACATTTCCTTCTATAATTTCATTGACAATTTGA
CTGGGAAGCTCAGGTCTGTATTTGTTCCTTACTTTCAGTACTTGATGGACGGGTGTGTACACCACCTAACTGGTGGTCAAGATCAAGAAGACAATGTGCGTGCAAAACACAAAAAAAAGAAGAGTAAATTAACAGAAAAGGTTGTGGGCATTGAAACAAAACAAGCACTGACAGAGTCTGAGTGGAATCTTCGGATGTTG
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TTTTGGTAATCACAACATCTACTACATAAATCAGAAAGCAAGAATTTGGGTTCCTGATGCTCAATCAGCAATTGTCATGAAGGAAGCATGCACGCCAGCATGAAAACGTAGTTAAGTACATACATGTGTAACATTATCTTACTGGAAAGTGCTAATCTCTCTCTATTTGTTTCCATAAAAATACTTTGTATTTGGTATTC
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>TRINITY_DN132264_c0_g2_i19 from sample A1 / Example spliced isoform
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CCATTTCCTTCTGCAGTAAATTGTTTGAAGGGTATTGCCAACAATCTAGAGTTGTCAC


>TRINITY_DN132264_c0_g2_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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caaactgtattttgctgttttgtaacagACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCCAATGTACGTACAGTTACAACTA
ATCTCATAGTTGGAGATCTGGGAAATTTTATGCATCTTTATCAAATCAATAAAACTGCTCAACCAAGACTTCCATTGCTAGTTTAATGATTAGCCAAGCTTTTGATTGCATTCTTTGTTGTGCATGAAGGCTCAGGAAAAAATAGCAATGCTTGCTTTTGTTATCAAAAGAATTCTAATTTATAACATTTTATCTTGATT
GGCAGAAGGAAACCAGGGACAAGATGACTGTATTTGAGGATCTATTTGTGCTTTTTGCCATGTCATCATCTAAGAAACTTTTGAAAGAACATATTCATTTAATAGTGACCCACAGCACACTCCCGGCAGTACCTTTCTTGTCAAAGTTTTTTATGGAAGAAGGTTTGTTCTTTTCCCTCGTGGTTTGTTGTGTTATCTCT
TCCCATTTCCTTCTGCAGTAAATTGTTTGAAGGGTATTGCCAACAATCTAGAGTTGTCAC



Intron 15 GTACGTACAG ... TGATTGGCAG

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>TRINITY_DN132264_c0_g2_i19 from sample A1 / Example spliced isoform
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TTCTAAAACAAGAATGGTCTGATCTGGATAGCGAGGAAACAATTATTCAGACAAAGCCTGAGAAGATAGACATTTTTTTCTTTCAGCCTAATCTCTACCAGCAGATTGAGTCTGAAAGTCAAGCTGTTTGTGGGAATCTTTTGATTGCAATATTTTGGAGTGTGCTGAAGAACATTCCAAGGAAATCTATTGAGGATTCC
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CCATTTCCTTCTGCAGTAAATTGTTTGAAGGGTATTGCCAACAATCTAGAGTTGTCAC


>TRINITY_DN132264_c0_g2_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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