sp|D5A972|CSPL3_PICSI ----> CASP-like protein 2A3

Intron 1 GTTAGCATAT ... CACTCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	43.48	13	0	10
A2	45.45	12	7.3	10
A3	40.91	13	2.6	9
A4	46.15	7	2.1	6
A5	42.86	8	1.1	6
A6	35.53	98	1.4	54
A7	17.78	37	1.6	8
A8	36.36	34	0	19.4
A9	33.33	38	3	19
A10	40.28	43	2	29

>TRINITY_DN101767_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform

GAGCATATGCAATCGTGTTCCATCCGGTAAATTTTAGTCGAAAATTGTTCGAAAGAAGAAAAATTTTATTCGAAAATTGTTCCAAAGGGAGGAGGAATCAGAGGGTGGATTTCTCTGGGGTAATTACAGATGGCGAGGAATGGAGATATGAGCTCTGAGATGGGGGCAAAAAAAGAAGAAGCGATCGAATTAATTTATGG
ATTGACGACGCGAAAGAAATGGATCGAGACGGCCTTGAGGTTTCTACCTGTTGGACTTTGCATTTCAGCTCTTGTACTTGTGCTTAAGAGCAAGCAGAGAAACGATTATGGAATTCTCGAATATAGACATGTTGGCGCCTTCAGGTATTTGGCTTATACAAATGGGATTTGTGCTGCGTACTCTTGCCTCTCGGCATTTG
AATCTGTTATTCCTAGGTCCTGCAGTCTATCCAGGGCGTGGGTTGTATTTGTTTTTGATCAGGCATTTACATACTTAATGCTGGGAGCTGGAGCTGTAGCGACCGAAGTACTGTATCTGGCATATAAGGGAGATGAGCAGATCACATGGTCTGAACTATGCCCCTACTATGGAAGATTTTGCCACAAAGTAGCAGCCTCT
CTGGTTATAAGTTTTTTGGCTCTGTTATGCTTCATTTTGCTCTCGCTTATATCAGCCTACAGAGTGTTCAGTAAATATGATCCACCAAGTCTTTGCAAGAAAGACCAAATAACCAGCCAGAGTTGAGTGTTAATAAAGTAAAGGGAGTGCATGTAATTGAACACTTTGTACATGCTCGTTTGAAATCTAGTTCAATAATA
AATGTTGATAAAGTGCAAACGGTAGTTTGTACCACTTGTTGATGAAAAGTTGGTTTGCTTCCAATACATTAAATGTTCTATGAATCATAGTTCAACCAACTATTACCAAGTTGTTGGTCGGGCCGGGGGGTACTACCACCCCACAGAAGTTGGCTCTAACTTGGCTCTGATACTGTGCATAAATCACCGATTAACAAAGA
GTCGAATAATCTCCCTTGAATGTTTGAATTTAGCGTGCCATACATGTTACAACACTTTATAAAGAAGACGTTCGAGTTTATTTGAAATAGAGATATCAAATTGCAAACACTGAAGATTCTTATGTCCCTTGATTTTCCAAAAACAGTAATGTGAAGATATTCAACTTGTTCCTTTTTTGTCATTTATTTTTCAAATTTTG
TGAAACTGTGGTGTTTGTAAGGTCTTAGGCCAACTCATAATTATGTAATCAAACATCTTTTATTATGCTGCG

>TRINITY_DN101767_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GAGCATATGCAATCGTGTTCCATCCGGTAAATTTTAGTCGAAAATTGTTCGAAAGAAGAAAAATTTTATTCGAAAATTGTTCCAAAGGGAGGAGGAATCAGAGGGTGGATTTCTCTGGGGTAATTACAGATGGCGAGGAATGGAGATATGAGCTCTGAGATGGGGGCAAAAAAAGAAGAAGCGATCGAATTAATTTATGG
ATTGACGACGCGAAAGAAATGGATCGAGACGGCCTTGAGGTTTCTACCTGTTGGACTTTGCATTTCAGCTCTTGTACTTGTGCTTAAGAGCAAGCAGAGAAACGATTATGGAATTCTCGAATATAGACATGTTGGCGCCTTCAGGTATTTGGCTTATACAAATGGGATTTGTGCTGCGTACTCTTGCCTCTCGGCATTTG
AATCTGTTATTCCTAGGTCCTGCAGTCTATCCAGGGCGTGGGTTGTATTTGTTTTTGATCAGgttagcatatggccaactttgatctggcttctgctgtatttgttgtttaactcatataagtccttatctcttttataactttccattctccgtgtcatgctttgtcctggctgcatggccggttcattcacactgcta
cttatttgctttacactctgcagGCATTTACATACTTAATGCTGGGAGCTGGAGCTGTAGCGACCGAAGTACTGTATCTGGCATATAAGGGAGATGAGCAGATCACATGGTCTGAACTATGCCCCTACTATGGAAGATTTTGCCACAAAGTAGCAGCCTCTCTGGTTATAAGTTTTTTGGCTCTGTTATGCTTCATTTTG
CTCTCGCTTATATCAGCCTACAGAGTGTTCAGTAAATATGATCCACCAAGTCTTTGCAAGAAAGACCAAATAACCAGCCAGAGTTGAGTGTTAATAAAGTAAAGGGAGTGCATGTAATTGAACACTTTGTACATGCTCGTTTGAAATCTAGTTCAATAATAAATGTTGATAAAGTGCAAACGGTAGTTTGTACCACTTGT
TGATGAAAAGTTGGTTTGCTTCCAATACATTAAATGTTCTATGAATCATAGTTCAACCAACTATTACCAAGTTGTTGGTCGGGCCGGGGGGTACTACCACCCCACAGAAGTTGGCTCTAACTTGGCTCTGATACTGTGCATAAATCACCGATTAACAAAGAGTCGAATAATCTCCCTTGAATGTTTGAATTTAGCGTGCC
ATACATGTTACAACACTTTATAAAGAAGACGTTCGAGTTTATTTGAAATAGAGATATCAAATTGCAAACACTGAAGATTCTTATGTCCCTTGATTTTCCAAAAACAGTAATGTGAAGATATTCAACTTGTTCCTTTTTTGTCATTTATTTTTCAAATTTTGTGAAACTGTGGTGTTTGTAAGGTCTTAGGCCAACTCATA
ATTATGTAATCAAACATCTTTTATTATGCTGCG

Intron 2 GTATTTGGCT ... TTTTGATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	39.62	16	8	13
A2	41.67	14	8	12
A3	48	13	11	13
A4	52.38	5	4	7
A5	43.75	9	6	8
A6	49.17	77	51	98
A7	64.49	19	32	37
A8	47.27	29	18	34
A9	52.94	28	25	38
A10	47.45	36	22	43

>TRINITY_DN42304_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

AGAGCATATGCAATCGTGTTCCATCCGGTAAATTTTAGTCGAAAATTGTTCGAAAGAAGAAAAATTTTATTCGAAAATTGTTCCAAAGGGAGGAGGAATCAGAGGGTGGATTTCTCTGGGGTAATTACAGATGGCGAGGAATGGAGATATGAGCTCTGAGATAGGGGCAAAAAAAGAAGAAGCGATCGAATTAATTTATG
GATTGACGACGCGAAAGAAATGGATCGAGACGGCCTTGAGGTTTCTACCTGTTGGACTTTGCATTTCAGCTCTTGTACTTGTGCTTAAGAGCAAGCAGAGAAACGATTATGGAATTCTCGAATATAGACATGTTGGCGCCTTCAGGCATTTACATACTTAATGCTGGGAGCTGGAGCTGTAGCGACCGAAGTACTGTATC
TGGCATATAAGGGAGATGAGCAGATCACATGGTCCGAACTATGCCCCTACTATGGAAGATTTTGCCACAAAGTAGCAGCCTCTCTGGTTATAAGTTTTTTGGCTCTGTTATGCTTCATTTTGCTCTCGCTTATATCAGCCTACAGAGTGTTCAGTAAATATGATCCACCAAGTCTTTGCAAGAAAGACCAAATAACCAGC
CAGAGTTGAGTGTTAATAAAGTAAAGGGAGTGCATGTAATTGAACACTTTGTACATGCTCGTTTGAAATCTAGTTCAATAATAAATGTTGATAAAGTGCAAACGGTAGTTTGTACCACTTGTTGATGAAAAGTTGGTTTGCTTCCAATACATTAAATGTTCTATGAATCATAGTTCAACCAACTATTACCAAGTTGTTGG
TCGGGCCGGGGGGTACTACCACCCCACAGAAGTTGGCTCTAACTTGGCTCTGATACTGTGCATAAATCACCGATTAACAAAGAGTCGAATAATCTCCCTTGAATGTTTGAATTTAGCGTGCCATACATGTTACAACACTTTATAAAGAAGACGTTCGAGTTTATTTGAAATAGAGATATCAAATTGCAAACACTGAAGAT
TCTTATGTCCCG

>TRINITY_DN42304_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TCGTCATCCACGTTACAGTTGTACTACTACGGCCTTTGCATTCAATGCAAACACACCATTGTCAAAGCGCACATTGTTCGAAAGAAGAAAAATTTTATTCGAAAATTGTTCCAAAGGGAGGAGGAATCAGAGGGTGGATTTCTCTGGGGTAATTACAGATGGCGAGGAATGGAGATATGAGCTCTGAGATAGGGGCAAAA
AAAGAAGAAGCGATCGAATTAATTTATGGATTGACGACGCGAAAGAAATGGATCGAGACGGCCTTGAGGTTTCTACCTGTTGGACTTTGCATTTCAGCTCTTGTACTTGTGCTTAAGAGCAAGCAGAGAAACGATTATGGAATTCTCGAATATAGACATGTTGGCGCCTTCAGgtatttggcttatacaaatgggatttg
tgctgcgtactcttgcctctcggcatttgaatctgttattcctaggtcctgcagtctatccagggcgtgggttgtatttgtttttgatcagGCATTTACATACTTAATGCTGGGAGCTGGAGCTGTAGCGACCGAAGTACTGTATCTGGCATATAAGGGAGATGAGCAGATCACATGGTCCGAACTATGCCCCTACTATG
GAAGATTTTGCCACAAAGTAGCAGCCTCTCTGGTTATAAGTTTTTTGGCTCTGTTATGCTTCATTTTGCTCTCGCTTATATCAGCCTACAGAGTGTTCAGTAAATATGATCCACCAAGTCTTTGCAAGAAAGACCAAATAACCAGCCAGAGTTGAGTGTTAATAAAGTAAAGGGAGTGCATGTAATTGAACACTTTGTAC
ATGCTCGTTTGAAATCTAGTTCAATAATAAATGTTGATAAAGTGCAAACGGTAGTTTGTACCACTTGTTGATGAAAAGTTGGTTTGCTTCCAATACATTAAATGTTCTATGAATCATAGTTCAACCAACTATTACCAAGTTGTTGGTCGGGCCGGGGGGTACTACCACCCCACAGAAGTTGGCTCTAACTTGGCTCTGAT
ACTGTGCATAAATCACCGATTAACAAAGAGTCGAATAATCTCCCTTGAATGTTTGAATTTAGCGTGCCATACATGTTACAACACTTTATAAAGAAGACGTTCGAGTTTATTTGAAATAGAGATATCAAATTGCAAACACTGAAGATTCTTATGTCCCG