sp|O24412|PSD7A_ARATH ----> 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 homolog A

Intron 1 GTAAATATTG ... CAAGTTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	30.77	9	2	6
A2	0	9	0	0
A3	2.56	19	1	0
A4	37.14	11	10	3
A5	0	1	0	0
A6	6.9	54	6	2
A7	4.44	43	3	1
A8	1.45	68	2	0
A9	5.17	55	6	0
A10	6.49	36	5	0

>TRINITY_DN109011_c1_g5_i9 from sample A4 / Example spliced isoform

TTTAACAGGCCTGGCAAGTTTATTGGACTCTGAAGGACAAGAAGGTCTGCAGTCAATACGAAGGAGGCAGACGTTTAGTGAAATTGATGATTAGACATCTAACATCTGACATTGAATCTTTTATGTACTTATGTAATTTTCTGAAAGGCATAGTACTTCAAATTTAGATTTCAGGTTTCTGCAATTCCATGATGCATGCT
CGCACCTTACCACTTGGAAGGAGGTGTTGTTAGGGGGCAACTGTTGTTGGGTTTCAATTTACACAGCAGCTCGTCAGAATTAAAATGCTCTACTTTATTTGGAACGGGCAAAATAATGGCATGCTTAAAAAAATTGTTGAAAAAAAATTTTATTAAATAATGTATTTATTAAGTAGAAGGCGTTCTTTCAAAAGGTTTCT
TGGCTACTTTTCCAGGATTCTCTACCCACTTAATTCATGCCACGTGTTTGATTAGTCATTGATCTCTTCTGCTATTTGTCTGTCTTGTCCGTCAAAATTTGGGAGTGCCACTCTTACAGAGCCGTCTGCTTGTCAATAGCATGTACCTGAAGAGGGAAGAGGCGGTTGGAAACATTGATTTTTTTCCGAGTACAATGTTC
TGTATTTTCCAGGTGAGGAGGGTTTGTTCTCTTCTGATTTTTTCAATCTCCGGCAAAAGAAATATGTGTGGAAGCAGGGCACGTTGGGGTTTGGTGTGGGCGGTTCAGTAACTGAGGAGGGTTTGTTCTCTTTTGATTTTTTCAATCTCCGGCAAAAGAATTATGTGTGGAAGCAGGGCACGTTGGGGTTTGGTGTGGGT
GGTTCAGTAGCTGAGGAGGGTTTGTTCTCTTCTGATTTTTTCAATCTCCTGCAAAAGAAATATGTGTGGAAGCAGGGCACGTTGGGGTTTGGCGTGGGCGGTTCAGTAGCTGTGGATACAGGAAAACTGCAAAATCACAGGTCCTGATGTGTTCTCTTGGCATCCTATTTTGTTGGGGCCTTTGCAATTACAGAGTTAAT
TTAGAAAGTTAATCAGTTGGATGCATTACGTTAAGGAACGATGGCAGATATTGCATGTTGCAGGAACTACTAGGAAAACTGCAAAATCACAGGTGCTCTAAAATTTGTGGTTTTGATTTGAAATTATGCTACAATCAGTAACTTTGGAGAGAAATAAGAAAAAAATTGGCTTTGTATGGTATTTCAAGCAGCTACAGCAT
TTGTGTCATAATTATAGCTATAAATATCCTTAAACAGAATGGGAGCTTGTTTCTCAGTTGAGGAAAGCAAGTGAAGGATTTTGCAGCGAAAACAAATGACATGATGCTGGTCATCTATCTCTCCTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCTATGCATAATCTCATAAACAAGGAGATGATAAACAAGGAGCATGAGAAAACTT
GCAGATGCTTTAGCGCCAC

>TRINITY_DN109011_c1_g5_i6 from sample A4 / Example unspliced isoform:

TTTAACAGGCCTGGCAAGTTTATTGGACTCTGAAGGACAAGAAGGTCTGCAGTCAATACGAAGGAGGCAGACGTTTAGTGAAATTGATGATTAGACATCTAACATCTGACATTGAATCTTTTATGTACTTATGTAATTTTCTGAAAGGCATAGTACTTCAAATTTAGATTTCAGGTTTCTGCAATTCCATGATGCATGCT
CGCACCTTACCACTTGGAAGGAGGTGTTGTTAGGGGGCAACTGTTGTTGGGTTTCAATTTACACAGCAGCTCGTCAGAATTAAAATGCTCTACTTTATTTGGAACGGGCAAAATAATGGCATGCTTAAAAAAATTGTTGAAAAAAAATTTTATTAAATAATGTATTTATTAAGTAGAAGGCGTTCTTTCAAAAGGTTTCT
TGGCTACTTTTCCAGGATTCTCTACCCACTTAATTCATGCCACGTGTTTGATTAGTCATTGATCTCTTCTGCTATTTGTCTGTCTTGTCCGTCAAAATTTGGGAGTGCCACTCTTACAGAGCCGTCTGCTTGTCAATAGCATGTACCTGAAGAGGGAAGAGGCGGTTGGAAACATTGATTTTTTTCCGAGTACAATGTTC
TGTATTTTCCAGGTGAGGAGGGTTTGTTCTCTTCTGATTTTTTCAATCTCCGGCAAAAGAAATATGTGTGGAAGCAGGGCACGTTGGGGTTTGGTGTGGGCGGTTCAGTAACTGAGGAGGGTTTGTTCTCTTTTGATTTTTTCAATCTCCGGCAAAAGAATTATGTGTGGAAGCAGGGCACGTTGGGGTTTGGTGTGGGT
GGTTCAGTAGCTGAGGAGGGTTTGTTCTCTTCTGATTTTTTCAATCTCCTGCAAAAGAAATATGTGTGGAAGCAGGGCACGTTGGGGTTTGGCGTGGGCGGTTCAGTAGCTGTGGATACAGGAAAACTGCAAAATCACAGGTCCTGATGTGTTCTCTTGGCATCCTATTTTGTTGGGGCCTTTGCAATTACAGAGTTAAT
TTAGAAAGTTAATCAGTTGGATGCATTACGTTAAGGAACGATGGCAGATATTGCATGTTGCAGGAACTACTAGGAAAACTGCAAAATCACAGGTGCTCTAAAATTTGTGGTTTTGATTTGAAATTATGCTACAATCAGTAACTTTGGAGAGAAATAAGAAAAAAATTGGCTTTGTATGGTATTTCAAGCAGCTACAGCAT
TTGTGTCATAATTATAGCTATAAATATCCTTAAACAGAATGGGAGCTTGTTTCTCAGTTGAGGAAAGCAAGTGAAGGATTTTGCAGCGAAAACAAATGACATGATGCTGGTCATCTATCTCTCCTCCCTTATTCGGAGTGTCATTGCTATGCATAATCTCATAAACAAGGAGgtaaatattgaaacaatatcttttttct
ttagtggtaagtaaaataactgcctgaagttttaatgtgtggtttggcttacttacaagttacagATGATAAACAAGGAGCATGAGAAAACTTGCAGATGCTTTAGCGCCAC