sp|Q9SJ04|SKIP6_ARATH ----> F-box/kelch-repeat protein SKIP6

Intron 1 GTAATTTTCT ... TATTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	24.97	73.3	17	31.8
A2	21.9	67.8	17	21
A3	17.91	76.8	10	23.5
A4	17.39	42.8	7	11
A5	15.27	27.8	4	6
A6	20.95	577	98	207.8
A7	19.23	784.8	125	248.8
A8	20.09	916	124	336.8
A9	21.89	883	169	325.8
A10	20.31	670.3	131	210.8

>TRINITY_DN115869_c1_g4_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

ACAGAAACAAGAAAGCGTGACCTGGTTTTGAATAATGGGATCCTCCGTTTCCTGCTTTCCCAAACGGAGAGCTCCTCTTCAGTCTCACAGAGATGTTCAGACAAGTGTTCATGACAAGACAGGCGGTGAGGCCGAAAGAGTTGATAATCAAGAAGAGGAATCCAGTGCGGATGAAAGATCTGTTCAAGTTAATGTTTCTA
GCTCTAGTACTTCTAGCATAATTATTTCTCGTTCTCCATCGAGTGTTTGTTTACGCTCTCCAGACGGGTCATGCGCCTCTTCTTCAGATTCGACATCATTTCTGTTAATGACGGAATTAGAGCGCAAATGCTTGTATGAATCTTCCTCTTATTGGATTTATGCAAGAACCCTAGACGACAATCACCTGCAGTCGTTCCAC
GCTCTCGACATAAAACAGCAAAAACATGAGCACAGCTATGTGCCTCTCCCTCCTTATCCTTTGGAAGAACTTGCAGACTCTGCCACAGCAGTTTTGGATAAAAAGTTGTATGTTATCGGTGGTCGAAAGGGCGAATTTGAGTGCAGCGATGTCTACGAGTACGATCCAGCAATGTATAAATGGTGCGGTTTAGCTCCCAC
CATAATACCCAGGCAAGGGGCTGTTGCGGCCACTGTTGATGGAAGAATTTATGTGTTCGGAGGGTGCAGTAATGAGTGTCCAGGCCTACGATCCAGAAATGGATGCTTGGTTTAAGTTACATGTACTTGACAGCTCTGTTCACGCAAATGCATACAGATCGGATTTTATGGCCGTAAATGATATGTTGGTCATATATCAT
GTGGGATCTCGATCATCTGAGATTCTTAGTAACAGAGACCAGCGAAAAATTTGAGACATGCATGGTGTTGGCGGTCGATTGTTTATGGAGATGCTGGCTTCCTCGTTTCAAGAATGATCTGATTTTAGCGAATCCAGCACATTCATTCTCAGCGTGATGATCAAGCCCGTGAAAACAACTTACAAGTCCACGAAAGTTGA
AATTCAGATATCAAGGACAGCTACCCGATTTATTTGCATACCATATCGATGTGATGAATATCATTCCCATATTTACAACTGAGTATTTGAGAAAAAGGTAGATGAATATGTTCATTTGTAAACCACTGTTCCAAGCACCAAAGCAGTTGGATTGATGCTGCACACTTTTGGCTATTGTGAAAAGATTATGCTGTAACAAA
ATCTTTTTCATCTTTTTCACATAGTAGTAGCTATTATCAAAGATTTTATCGTAAAGAGATGTTGCTTAATATGTTAATATAATATAATACTTTTTATTTAGAGACTTTACAA

>TRINITY_DN115869_c1_g4_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

ACAGAAACAAGAAAGCGTGACCTGGTTTTGAATAATGGGATCCTCCGTTTCCTGCTTTCCCAAACGGAGAGCTCCTCTTCAGTCTCACAGAGATGTTCAGACAAGTGTTCATGACAAGACAGGCGGTGAGGCCGAAAGAGTTGATGTTAAGAACGAGGCAGGGGTTGAGGATCAAACAGTTGATAATCAAGAAGAGGAAT
CCAGTGCGGATGAAAGATCTGTTCAAGTTAATGTTTCTAGCTCTAGTACTTCTAGCATAATTATTTCTCGTTCTCCATCGAGTGTTTGTTTACGCTCTCCAGACGGGTCATGCGCCTCTTCTTCAGATTCGACATCATTTCTGTTAATGACGGAATTAGAGCGCAAATGCTTGTATGAATCTTCCTCTTATTGGATTTAT
GCAAGAACCCTAGACGACAATCACCTGCAGTCGTTCCACGCTCTCGACATAAAACAGCAAAAACATGAGCACAGCTATGTGCCTCTCCCTCCTTATCCTTTGGAAGAACTTGCAGACTCTGCCACAGCAGTTTTGGATAAAAAGTTGTATGTTATCGGTGGTCGAAAGGGCGAATTTGAGTGCAGCGATGTCTACGAGTA
CGATCCAGCAATGTATAAATGGTGCGGTTTAGCTCCCACCATAATACCCAGGCAAGGGGCTGTTGCGGCCACTGTTGATGGAAGAATTTATGTGTTCGGAGGGTGCAGTAATGAGTGTCCAGGCCTACGATCCAGAAATGGATGCTTGGTTTAAGTTACATGTACTTGACAGCTCTGTTCACGCAAATGCATACAGATCG
GATTTTATGGCCGTAAATGATATGTTGGTCATATATCATGTGGGATCTCGATCATCTGAGATTCTTAGTAACAGAGACCAGCGAAAAATTTGAGACATGCATGGTGTTGGCGGTCGATTGTTTATGGAGATGCTGGCTTCCTCGTTTCAAGAATGATCTGATTTTAGCGAAgtaattttcttgatctttgacatgctctg
ccgcaattcttcaacatatttttacatttttgcgattattttattggatcttgacagacgttttcttctatttttcagTCCAGCACATTCATTCTCAGCGTGATGATCAAGCCCGTGAAAACAACTTACAAGTCCACGAAAGTTGAAATTCAGATATCAAGGACAGCTACCCGATTTATTTGCATACCATATCGATGTGA
TGAATATCATTCCCATATTTACAACTGAGTATTTGAGAAAAAGGTAGATGAATATGTTCATTTGTAAACCACTGTTCCAAGCACCAAAGCAGTTGGATTGATGCTGCACACTTTTGGCTATTGTGAAAAGATTATGCTGTAACAAAATCTTTTTCATCTTTTTCACATAGTAGTAGCTATTATCAAAGATTTTATCGTAA
AGAGATGTTGCTTAATATGTTAATATAATATAATACTTTTTATTTAGAGACTTTACAA