sp|Q8VYD6|PP374_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g10690


Intron 1 GTATACATTG ... GTGAGTGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A15518122
A261.916326
A351.8513514
A490.911110
A544.441028
A6-1020
A736.841237
A866.67112
A930.77924
A1052.94819



>TRINITY_DN115744_c0_g1_i18 from sample A3 / Example spliced isoform
CACTCTGTACAAAGGGATGCGTAGCAGTGTATGTCCTCGCTGCATCCATTAGCTTTCCATCTCTTCCCAGAGATGCAGCTTGTGGCAGCACTACGCATCCCCAGGGCTGTCCAGTGCTCTTCCATTTCCTCTATAAACTTCGGCCACGAGTTTGAGTTTCTCCAAATTCCTCCACTTCAACCACAAAAGTTAAAGCGTTC
CGAGCAATGGGGAATTCGGTGTTCATACCAAAAAGATTTAGAGCAGGTGAAATCAGTAACAACTAATCCCCGTAAAAGATATCCACGGGGAAAAAGGAATCATACAGAAAGAGAGCTACGGAAGCTGACTCGAAGGGTAATGGAGCTGGCCAAGAGGAAGCAGCTAGACCAGGTAAGTTTTGACTTCTTTAATAATCCTC
CACGTTCTTGCCTTTGGCAGGATGAACCTGAAAATTCAGGTAAAATTCAGTTGCATGCTCTCTCAACGTCATCCACACAAGTTTTAATGGTTTGGTATGGAAGCCTTCATAATTTCAACTCATTCGACTGGGAATTTGGAGCCATCTAGGGTGGGGTATTTAAGGAGGTAAAGGAAGCAAAGCAGCGGTTCGGGAAGGTG
AACAAGATTGTTATGAATGCAGTGTTGTCCGGGTGCGTGCACTGCAAAGATGTGGATCGTGCTCTTCTTGCTTTTCAAGACATGTCAAAGCCAGGGGGTAGTGGTGTTGATAACATCACTTTCGGAATACTACTTAAG


>TRINITY_DN115744_c0_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CACTCTGTACAAAGGGATGCGTAGCAGTGTATGTCCTCGCTGCATCCATTAGCTTTCCATCTCTTCCCAGAGATGCAGCTTGTGGCAGCACTACGCATCCCCAGGGCTGTCCAGTGCTCTTCCATTTCCTCTATAAACTTCGGCCACGAGTTTGAGTTTCTCCAAATTCCTCCACTTCAACCACAAAAGTTAAAGCGTTC
CGAGCAATGGGGAATTCGGTGTTCATACCAAAAAGATTTAGAGCAGGTGAAATCAGTAACAACTAATCCCCGTAAAAGATATCCACGGGGAAAAAGGAATCATACAGAAAGAGAGCTACGGAAGCTGACTCGAAGGGTAATGGAGCTGGCCAAGAGGAAGCAGCTAGACCAGGTAAGTTTTGACTTCTTTAATAATCCTC
CACGTTCTTGCCTTTGGCAGGATGAACCTGAAAATTCAGGTAAAATTCAGTTGCATGCTCTCTCAACGTCATCCACACAAGTTTTAATGGTTTGGTATGGAAGCCTTCATAATTTCAACTCATTCGACTGGGAATTTGGAGCCATCTAGGGTGGGgtatacattgttgtaagaattttttatttaaagatctgtgactca
gaatttggatttaaagggtaattcagtacgtagggattgattagtctattggaatatgttggatgtgagtgaag
GTATTTAAGGAGGTAAAGGAAGCAAAGCAGCGGTTCGGGAAGGTGAACAAGATTGTTATGAATGCAGTGTTGTCCGGGTGCGTGCACTGCAAAGATGTGGATCGTGCTCTTCTTGCTTTTCAAGAC
ATGTCAAAGCCAGGGGGTAGTGGTGTTGATAACATCACTTTCGGAATACTACTTAAGGTACCTTTTTTTCACTTGTTACTTATCAAAATTTTCTATTTGCTGGTAGAGGCTACCCATTTTATACTGCAACATTATGTGAGCTACTACTTATCAAGTTATTTTCTCAAATGGCC




Intron 2 GTAAATACCA ... GCTCTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A136.36735
A252.6391010
A335.481065
A433.33853
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A60500
A75.26910
A842.86230
A99.091020
A100700



>TRINITY_DN114130_c3_g1_i14 from sample A2 / Example spliced isoform
TGAAGGTTTGCCGGAAGAAGAAGGGCAGAAGCATAATTCTCCTGAACTTCTACCAAATGTCATTACTTATACAACACTACTCAAGGGTTTTGGGAATGATGGCAACCTACATGGTATTTCCAATATTGTGGCAGAAATGAAAGCAGCAAGTACTTGCTTTATGGATCGAGTTGCTTATACTGCAATCAGTGATGCATACT
TAGCAGCTGGATCAACTTCAGGAAAATGATATTCTGGGATTCTCGAA


>TRINITY_DN114130_c3_g1_i10 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CTCTGTACAAAGGGATGCGTAGCAGTGTATGTCCTCGCTGCATCCATTAGCTTTCCATCTCTTCCCAGAGATGCAGCTTGTGGCAGCACTACGCATCCCCAGGGCTGTCCAGTGCTCTTCCATTTCCTCTATAAACTTCGGCCACGAGTTTGAGATTCTCCAAATTCCTCCACTTCAACCACAAAAGTTAAAGCGTTCCG
AGCAATGGGGAATTCGGTGTTCATACCAAAAAGATTTAGAGCAGGTGAAATCAGTAACAACTAATCCCCGTAAAAGATATCCACGGGGAAAAAGGAATCATACAGAAAGAGAGCTACGGAAGCTGACTCGAAGGGTAATGGAGCTGGCCAAGAGGAAGCAGCTAGACCAGGTAAGTTTTGACTTCTTTAATAATCCTCCA
CGTTCTTGCCTTTGGCAGGATGAACCTGAAAATTCAGGTAAAATTCAGTTGCATGCTCTCTCAACGTCATCCACACAAGTTTTAATGGTTTGGTATGGAAGCCTTCATAATTTCAACTCATTCGACTGGGAATTTGGAGCCATCTAGGGTGGGGTATACATTGTTGTAAGAATTTTTTATTTAAAGATCTGTGACTCAGA
ATTTGGATTTAAAGGGTAATTCAGTACGTAGGGATTGATTAGTCTATTGGAATATGTTGGATGTGAGTGAAGGTATTTAAGGAGGTAAAGGAAGCAAAGCAGCGGTTCGGGAAGGTGAACAAGATTGTTATGAATGCAGTGTTGTCCGGGTGCGTGCACTGCAAAGATGTGGATCGTGCTCTTCTTGCTTTTCAAGACAT
GTCAAAGCCAGGGGGTAGTGGTGTTGATAACATCACTTTCGGAATACTACTTAAGGGCCTTTGTGAAGCACAAAGACTTGATGAGGCATATGAACTGCTAGAATCCATAGAGAGAGGCATAGCTCCAGGACATCCAAAATTGTTGGAATGGCTCGTTCAGACTCTACTGAATGCTTTTGTAGAAACAGTGCAGGGGATGT
GCAGCGTGCTAGGGGAGTTCTTATGCACTATCGCTCTCTACGGAGTCAAATGCATCCATCAATTTTCATTTATAATCTTTTTATCAAGGGATATGCAAGGTCTGAAAATCCCTTGGAAGCTTTGGAACTATGGAAGGAAATGTCCAGTCAAGGGCTAAAACCAGACAGATTTACATATAATACCCTAATCAAGGCATGTG
TGAGGGCCAGGGAGATGGGAATTGCCATGGAGCTCTTGAAGGAGATGAAGGTTTGCCGGAAgtaaataccatgccagagttttgaagtctacctggaatgcagaggcacatcttttcaaggcattcctgcatttaatacaattttttatactgctcttgcagGAAGAAGGGCAGAAGCATAATTCTCCTGAACTTCTACC
AAATGTCATTACTTATACAACACTACTCAAGGTAATATGCCTTAATATCTTCTGGTTCATGCTGCTGTTTTTTTGTATGTCAGTTGATTCTACTTTTACAGATGTGCATACTAGCAAGAGTAATTTAAATACACGTTAATTTTGGGATCTGTCTATAAAACTGTCAGCTTCGAGTCAATGCTGTCCTCCATAATCATACA
CTAGTTTGCGAATAAGATCATTTGGAAGTAGATGTTTCTGTTGATGGAATTGGAGTTTATATGACTGATGAGTGATGACAACTTGATTTAAATGAATTTTCATCATTATTCATATTAGAATTTAGGGTACAAGAAGCTACGAAGATTCTAATGGCAATC




Intron 3 GTTTGCCGGA ... GCTCTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A115.223995
A225.3311110
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A413.953793
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A88.571630
A97.463150
A1002800



>TRINITY_DN114130_c3_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform
CTCTGTACAAAGGGATGCGTAGCAGTGTATGTCCTCGCTGCATCCATTAGCTTTCCATCTCTTCCCAGAGATGCAGCTTGTGGCAGCACTACGCATCCCCAGGGCTGTCCAGTGCTCTTCCATTTCCTCTATAAACTTCGGCCACGAGTTTGAGATTCTCCAAATTCCTCCACTTCAACCACAAAAGTTAAAGCGTTCCG
AGCAATGGGGAATTCGGTGTTCATACCAAAAAGATTTAGAGCAGGTGAAATCAGTAACAACTAATCCCCGTAAAAGATATCCACGGGGAAAAAGGAATCATACAGAAAGAGAGCTACGGAAGCTGACTCGAAGGGTAATGGAGCTGGCCAAGAGGAAGCAGCTAGACCAGGTATTTAAGGAGGTAAAGGAAGCAAAGCAG
CGGTTCGGGAAGGTGAACAAGATTGTTATGAATGCAGTGTTGTCCGGGTGCGTGCACTGCAAAGATGTGGATCGTGCTCTTCTTGCTTTTCAAGACATGTCAAAGCCAGGGGGTAGTGGTGTTGATAACATCACTTTCGGAATACTACTTAAGGGCCTTTGTGAAGCACAAAGACTTGATGAGGCATATGAACTGCTAGA
ATCCATAGAGAGAGGCATAGCTCCAGGACATCCAAAATTGTTGGAATGGCTCGTTCAGACTCTACTGAATGCTTTTGTAGAAACAGTGCAGGGGATGTGCAGCGTGCTAGGGGAGTTCTTATGCACTATCGCTCTCTACGGAGTCAAATGCATCCATCAATTTTCATTTATAATCTTTTTATCAAGTTCCACTGCAGGGA
TATGCAAGGTCTGAAAATCCCTTGGAAGCTTTGGAACTATGGAAGGAAATGTCCAGTCAAGGGCTAAAACCAGACAGATTTACATATAATACCCTAATCAAGGCATGTGTGAGGGCCAGGGAGATGGGAATTGCCATGGAGCTCTTGAAGGAGATGAAGGAAGAAGGGCAGAAGCATAATTCTCCTGAACTTCTACCAAA
TGTCATTACTTATACAACACTACTCAAGGGTTTTGGGAATGATGGCAACCTACATGGTATTTCCAATATTGTGGCAGAAATGAAAGCAGCAAGTACTTGCTTTATGGATCGAGTTGCTTATACTGCAATCAGTGATGCATACTTAGCAGCTGGATCAACTTCAGAAGCACTTAAAGTATTCGAGGATTTGTTGAAAATGT
CAAAGGATAACTCCTCTCTACGACCAAAGGCTCATGCATATCTTTCTCTTATGCGAGCATTGGCTGATAAGGGTGATGTCAATATGGTGAAGAATCTTCATTCTCGGATGGTGCCTGAATGTGCTGGCAATCCTTCTGTTGCAATCCGAGCAGAGGCAGATGAGCTCCTCCTTGAGGCAGCTGTAAATGATGGCCAAGTT
TCTCTAGCAAAGCAAGTTCTTGAAAAATTGATTGGGCTGAAAAAAAACATACCCTTGAGTGATCGTGCATTTCTGGCTGTTGTGCGCCTTCAGGCCATCTCTGGATTCACTGATAACCACCTTAGTCCATATATTCTAGAAAGGGTTTCACTTGAGGATCCTGTAGAGAAAATAATGCTACCATACCTGGAAGCAAATCC
ATTACCTGCGAGCCTGCAGCTGTGCAAAGTTGTAATGCGTTTTTTCAGAGAGAATGTTGTACCTGTGACAGATCAGTGGGGACACTGTATTGGTGTTGTATATCGTGAAGATTGTAATGAGTTAAATGCACAACTCTCAAGCATGATGAGGAGCTCTCCCCCGTTTGTGACATCTTGTACATCTATTGGTCGGGCAATTG
CTTTCCTTCTTGACCAAAAATATAGAATGATTGTGGTTGTCAAGTCAGAGTCTAATTACGATGATGCGTTTGGTTACCCAGCGGGAAGAGCAGTTGGCTTCTTGACCTCTCAGCATTTATTTAGCTTGGTGAGTCCGGCTTCACATATCAACAGATAGCAGGCAGAACATGGGAAAGAAGAACAGAATCAAAGAGAGACA
ATCCGAGTAAATTTCATGGGTTTTTCTCATATGGCAATAACTCTTGCGCAGTTCAGGACTTATTGCTAATGCAGCTCCTCAGATATTTTTGTTCTCTATGTGGTGTATGATTTACTAAATTAAAGGGACTGTACTCTTTTTATTTCCCAGTGATTGTGCTCTTGTATTATAACCATGGAAAGCTGTAAAGATATCTCACG
AGTGGAAAGTTTTTTACCACTCTTGACTGGTTGGGGAATCTCGTGGTATCTTCTCTCATTACATGAATCCCAAATATATTCGAAAATATTTGACGATGAACAAGCAAATGGTATGCCACTGTGGCCACTCGAGTAGATCGTTGTCACATAGAGAAAAG


>TRINITY_DN114130_c3_g1_i8 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CTCTGTACAAAGGGATGCGTAGCAGTGTATGTCCTCGCTGCATCCATTAGCTTTCCATCTCTTCCCAGAGATGCAGCTTGTGGCAGCACTACGCATCCCCAGGGCTGTCCAGTGCTCTTCCATTTCCTCTATAAACTTCGGCCACGAGTTTGAGATTCTCCAAATTCCTCCACTTCAACCACAAAAGTTAAAGCGTTCCG
AGCAATGGGGAATTCGGTGTTCATACCAAAAAGATTTAGAGCAGGTGAAATCAGTAACAACTAATCCCCGTAAAAGATATCCACGGGGAAAAAGGAATCATACAGAAAGAGAGCTACGGAAGCTGACTCGAAGGGTAATGGAGCTGGCCAAGAGGAAGCAGCTAGACCAGGTATTTAAGGAGGTAAAGGAAGCAAAGCAG
CGGTTCGGGAAGGTGAACAAGATTGTTATGAATGCAGTGTTGTCCGGGTGCGTGCACTGCAAAGATGTGGATCGTGCTCTTCTTGCTTTTCAAGACATGTCAAAGCCAGGGGGTAGTGGTGTTGATAACATCACTTTCGGAATACTACTTAAGGGCCTTTGTGAAGCACAAAGACTTGATGAGGCATATGAACTGCTAGA
ATCCATAGAGAGAGGCATAGCTCCAGGACATCCAAAATTGTTGGAATGGCTCGTTCAGACTCTACTGAATGCTTTTGTAGAAACAGTGCAGGGGATGTGCAGCGTGCTAGGGGAGTTCTTATGCACTATCGCTCTCTACGGAGTCAAATGCATCCATCAATTTTCATTTATAATCTTTTTATCAAGGGATATGCAAGGTC
TGAAAATCCCTTGGAAGCTTTGGAACTATGGAAGGAAATGTCCAGTCAAGGGCTAAAACCAGACAGATTTACATATAATACCCTAATCAAGGCATGTGTGAGGGCCAGGGAGATGGGAATTGCCATGGAGCTCTTGAAGGAGATGAAGgtttgccggaagtaaataccatgccagagttttgaagtctacctggaatgca
gaggcacatcttttcaaggcattcctgcatttaatacaattttttatactgctcttgcag
GAAGAAGGGCAGAAGCATAATTCTCCTGAACTTCTACCAAATGTCATTACTTATACAACACTACTCAAGGTAATATGCCTTAATATCTTCTGGTTCATGCTGCTGTTTTTTTGTATGTCAGTTGATTCTACTTTTACAGA
TGTGCATACTAGCAAGAGTAATTTAAATACACGTTAATTTTGGGATCTGTCTATAAAACTGTCAGCTTCGAGTCAATGCTGTCCTCCATAATCATACACTAGTTTGCGAATAAGATCATTTGGAAGTAGATGTTTCTGTTGATGGAATTGGAGTTTATATGACTGATGAGTGATGACAACTTGATTTAAATGAATTTTCA
TCATTATTCATATTAGAATTTAGGGTACAAGAAGCTACGAAGATTCTAATGGCAATC




Intron 4 GTAAGTTTTG ... GTGAGTGAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A134.8828822
A232.86472026
A341.67211614
A445.459510
A522.582468
A645.45350
A727.0327137
A826.32732
A933.331064
A1018.523369



>TRINITY_DN114130_c3_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoform
CTCTGTACAAAGGGATGCGTAGCAGTGTATGTCCTCGCTGCATCCATTAGCTTTCCATCTCTTCCCAGAGATGCAGCTTGTGGCAGCACTACGCATCCCCAGGGCTGTCCAGTGCTCTTCCATTTCCTCTATAAACTTCGGCCACGAGTTTGAGATTCTCCAAATTCCTCCACTTCAACCACAAAAGTTAAAGCGTTCCG
AGCAATGGGGAATTCGGTGTTCATACCAAAAAGATTTAGAGCAGGTGAAATCAGTAACAACTAATCCCCGTAAAAGATATCCACGGGGAAAAAGGAATCATACAGAAAGAGAGCTACGGAAGCTGACTCGAAGGGTAATGGAGCTGGCCAAGAGGAAGCAGCTAGACCAGGTATTTAAGGAGGTAAAGGAAGCAAAGCAG
CGGTTCGGGAAGGTGAACAAGATTGTTATGAATGCAGTGTTGTCCGGGTGCGTGCACTGCAAAGATGTGGATCGTGCTCTTCTTGCTTTTCAAGACATGTCAAAGCCAGGGGGTAGTGGTGTTGATAACATCACTTTCGGAATACTACTTAAGGGCCTTTGTGAAGCACAAAGACTTGATGAGGCATATGAACTGCTAGA
ATCCATAGAGAGAGGCATAGCTCCAGGACATCCAAAATTGTTGGAATGGCTCGTTCAGACTCTACTGAATGCTTTTGTAGAAACAGTGCAGGGGATGTGCAGCGTGCTAGGGGAGTTCTTATGCACTATCGCTCTCTACGGAGTCAAATGCATCCATCAATTTTCATTTATAATCTTTTTATCAAGGGATATGCAAGGTC
TGAAAATCCCTTGGAAGCTTTGGAACTATGGAAGGAAATGTCCAGTCAAGGGCTAAAACCAGACAGATTTACATATAATACCCTAATCAAGGCATGTGTGAGGGCCAGGGAGATGGGAATTGCCATGGAGCTCTTGAAGGAGATGAAGGTTTGCCGGAAGTAAATACCATGCCAGAGTTTTGAAGTCTACCTGGAATGCA
GAGGCACATCTTTTCAAGGCATTCCTGCATTTAATACAATTTTTTATACTGCTCTTGCAGGAAGAAGGGCAGAAGCATAATTCTCCTGAACTTCTACCAAATGTCATTACTTATACAACACTACTCAAGGTAATATGCCTTAATATCTTCTGGTTCATGCTGCTGTTTTTTTGTATGTCAGTTGATTCTACTTTTACAGA
TGTGCATACTAGCAAGAGTAATTTAAATACACGTTAATTTTGGGATCTGTCTATAAAACTGTCAGCTTCGAGTCAATGCTGTCCTCCATAATCATACACTAGTTTGCGAATAAGATCATTTGGAAGTAGATGTTTCTGTTGATGGAATTGGAGTTTATATGACTGATGAGTGATGACAACTTGATTTAAATGAATTTTCA
TCATTATTCATATTAGAATTTAGGGTACAAGAAGCTACGAAGATTCTAATGGCAATC


>TRINITY_DN114130_c3_g1_i10 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CTCTGTACAAAGGGATGCGTAGCAGTGTATGTCCTCGCTGCATCCATTAGCTTTCCATCTCTTCCCAGAGATGCAGCTTGTGGCAGCACTACGCATCCCCAGGGCTGTCCAGTGCTCTTCCATTTCCTCTATAAACTTCGGCCACGAGTTTGAGATTCTCCAAATTCCTCCACTTCAACCACAAAAGTTAAAGCGTTCCG
AGCAATGGGGAATTCGGTGTTCATACCAAAAAGATTTAGAGCAGGTGAAATCAGTAACAACTAATCCCCGTAAAAGATATCCACGGGGAAAAAGGAATCATACAGAAAGAGAGCTACGGAAGCTGACTCGAAGGGTAATGGAGCTGGCCAAGAGGAAGCAGCTAGACCAGgtaagttttgacttctttaataatcctcca
cgttcttgcctttggcaggatgaacctgaaaattcaggtaaaattcagttgcatgctctctcaacgtcatccacacaagttttaatggtttggtatggaagccttcataatttcaactcattcgactgggaatttggagccatctagggtggggtatacattgttgtaagaattttttatttaaagatctgtgactcaga
atttggatttaaagggtaattcagtacgtagggattgattagtctattggaatatgttggatgtgagtgaag
GTATTTAAGGAGGTAAAGGAAGCAAAGCAGCGGTTCGGGAAGGTGAACAAGATTGTTATGAATGCAGTGTTGTCCGGGTGCGTGCACTGCAAAGATGTGGATCGTGCTCTTCTTGCTTTTCAAGACAT
GTCAAAGCCAGGGGGTAGTGGTGTTGATAACATCACTTTCGGAATACTACTTAAGGGCCTTTGTGAAGCACAAAGACTTGATGAGGCATATGAACTGCTAGAATCCATAGAGAGAGGCATAGCTCCAGGACATCCAAAATTGTTGGAATGGCTCGTTCAGACTCTACTGAATGCTTTTGTAGAAACAGTGCAGGGGATGT
GCAGCGTGCTAGGGGAGTTCTTATGCACTATCGCTCTCTACGGAGTCAAATGCATCCATCAATTTTCATTTATAATCTTTTTATCAAGGGATATGCAAGGTCTGAAAATCCCTTGGAAGCTTTGGAACTATGGAAGGAAATGTCCAGTCAAGGGCTAAAACCAGACAGATTTACATATAATACCCTAATCAAGGCATGTG
TGAGGGCCAGGGAGATGGGAATTGCCATGGAGCTCTTGAAGGAGATGAAGGTTTGCCGGAAGTAAATACCATGCCAGAGTTTTGAAGTCTACCTGGAATGCAGAGGCACATCTTTTCAAGGCATTCCTGCATTTAATACAATTTTTTATACTGCTCTTGCAGGAAGAAGGGCAGAAGCATAATTCTCCTGAACTTCTACC
AAATGTCATTACTTATACAACACTACTCAAGGTAATATGCCTTAATATCTTCTGGTTCATGCTGCTGTTTTTTTGTATGTCAGTTGATTCTACTTTTACAGATGTGCATACTAGCAAGAGTAATTTAAATACACGTTAATTTTGGGATCTGTCTATAAAACTGTCAGCTTCGAGTCAATGCTGTCCTCCATAATCATACA
CTAGTTTGCGAATAAGATCATTTGGAAGTAGATGTTTCTGTTGATGGAATTGGAGTTTATATGACTGATGAGTGATGACAACTTGATTTAAATGAATTTTCATCATTATTCATATTAGAATTTAGGGTACAAGAAGCTACGAAGATTCTAATGGCAATC