sp|Q9ZVH8|RDO2_ARATH ----> Transcription elongation factor TFIIS
Intron 1 GTAATTTGGA ... TGGAAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 76 | 36 | 108 | 120 |
| A2 | 78.85 | 24 | 97 | 82 |
| A3 | 84.92 | 19 | 128 | 86 |
| A4 | 79.17 | 20 | 81 | 71 |
| A5 | 82.35 | 6 | 29 | 27 |
| A6 | 77.44 | 22 | 66 | 85 |
| A7 | 77.43 | 36 | 112 | 135 |
| A8 | 76.39 | 36 | 105 | 128 |
| A9 | 75.18 | 35 | 112 | 100 |
| A10 | 75.3 | 31 | 94 | 95 |
>TRINITY_DN38148_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoformGAATGGGCAAACACCCTTCAAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTT
TCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATGTAGTTGTGATGCTTTATTGCGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTGAATTCTTTTTTCAG
CGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATA
TGAACAAAGAGGTATGTTAATGAATTTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAA
AGCTGTCTCTTATTTTTATCGTTTTGGTTCTATAAGACTTAGTAAAAGAAACTTCGTTGCTATTCAGGGTAGTTTGTGATGGTGAGTATCCATGCATTGCGAACATGCCCAGGTGAAATAAATTAAGGCAATATTTGAAGTCTCTTAGGTAACTGAGTTTGTTAACTTGGCGCTTTTCTTTGAACAATTATTATATGAAC
CTTCTTCCTTGGCAATATATAGGGAAGTGGAGAATTGATGGTCGTCCATGAGAGAAATACAGTTTTAATGGGCCAGTTTCATTCTTTCCGTAGATTGGTACTTTCATTTGAGAATTAAAAAAAAATGTGGGACAAGTGTTTGTTATCATGATGCAAAATGCACACTTGGATTAGTCATTATCCTTTGTTGTGATTTTAAT
GAGCCGTAAGAGATTCTCGATGCCCTCAGCATTCGGGAACAAAATCCCAAGGGAGCATCATGAATTTCTGAGTTGTTTTGAAACGGTACATCATTTGAAGTACCTGACATTCCAAGGATAATACGGAACGCTTGGATTTCTTTTTCAAATGCTTCAGCCGTGTCGGGGCAGCATAGGATCTATCCTATTACTATATTTTT
CGAGTCATCTTGGAGTAGTACTTGTGGAACTGTTTTCTTTTCAACTAGTCAATTTCACTTCAAGTTTGACGTCCTTGTTTTTCAACCCTTTTGTTATTTTGTCATGCAACTGTTAATGGAGAGAATTGGATGTTTTAGATGAGTTCATGCCTACTCTTGATTTGGCTGTTCTATTGTTAGTTCAACTCTTGGATGCCCCG
AAGTTATCTCAAAATAATGCATGCATAGTTGTCCATTAGTTTCTGTATTGCCTAGATTCAAAGCCAAGCAATTTTCTGTATTGGTCCTTTTGCATGTGCATAGAAAAATATTCCACTTAGTACTATATTAATCAAATCAGACTAAGTTATCTCCCAATTAATTTAATATTCTTTAATTATTCTGGCTTGTTTCTCTAGTT
ATTTATGCCAATGCTGAGCAGAGCTGCATTATGTCATGGTTTTAATTTTCTGGTTTATATTTTTTGAAAGAAGGTTTGTAATTGCACAACGATATTATAAAGTGGGACGCTGATACAACCTGTTGCATTTGGTCTTATAATGAAAATTTAATGTATCCAACGTGTATTAAGTGGCCTTTAAAAGAACAGTAGTCGATCTA
TTTGATAACCATTCCAAATTCAAGAAGGGTATATCCGCAGGAAGTTTTTAATCACTTGATCTTGAATTCCGTCAAACTTTTTCTTGCAGTTTACCACTTGTAAAATAAAGCATACTCTTTTTGTGATATAGCTTGTCCAACAAATGAATGCCTTCTAAATTTGTTTGAAACTTGTTATATTGCTCCTGTAAACTGCTTCA
AGAAGAAAATGATTACTAAGTTCCACACGAAGTAAGAAAGTCTACTGTAATGAAGGGCGTGATATTATTATGTATTCATATTTGTAGTCCTAATGAGGAGCTAGTTTCTGTCACTAGTCTGATGGCATTTCATCTACTGTTTATGGTATTATTTTGTCACGCAAATTAGAGGTTGACTTCATTTTTGTATGGTTGAAGTT
TGAGTAAAGCCGATTTGAATGGTTATCATCTTGAATGAACACAGTAACTTAAGGTTCAAGTTTCAACCGAAGGAAATCTCCAAATGCGAATGATGAAGACTTCTGAAGCAAAACATTGCGGAGATGTTTTACCAAGTTTTTCATTATTGATTTGTTCTAAATCAGAGAATTTTTTACCAAGTTTTTAGTTTTTAGTTTCT
AGTTGTAGCAGGAATGCTAAAATTCAGAAATTTCATGATTTGTCTGGATCGTATAATGAAAATAGTCATTTAAGTGGCTGTAGAAGTCTGGATAGTTACAAACTATTACACTGAAGATTATCTCCAAGGTATGTCCAGTTTCTTTAGCTCGGGAGTCCTGGATCACATGATGAAAAGTCATTTAACTGGTTGTAGAAGTC
TGGATAATTACAAGCTATGACACTCAAGATTATCCAGTTTCTTTATCCCTGGAGTCTGGCTAAATTTGTTTCCAATATGGCTAGATGAATGAACTTCAGGTGGAAATTTGGATTGAATGGAATTTGGAGTAAATATATAGTGCTGGGTTGATACATTTGTCCAGGACTGAAACATTATTGGCTGCTGGTGTAGAACTCCC
ACGCCATGGTGAGAACGTGGTTGCCCAGTAAGCATGGAGCTATGTTCGGGGCTCCAGTATCTCGAAATAAAAAAAGCAAATTGGTTGCTTGCTTAATGATTCTAATTTTAAGATGTTCAAATCCTATTGCAGTTACAACAGCAGCTGCCATTCTCTATTTAGCAGGTTGCTAATCTAGTAGATTCATTTTTAACTAGTAA
TTGTACATTCTGCACACAGAGCAGCTGTCTCAGAAATGGTGTATACAATATTTAAAGATTATGTTAATGGGAACCATTTTCAAGATTATATTATTGGGAACTCACTATTTGATGATATTTCTAATGTTGATATTAACATAATAAAGCATCATTTATTGAATCTATTGGTTTGGATCCTAGATGGGTTTTACTTGAGACTA
TTTGGCAGCTTGTCTGGTGACGTGGCTTTACTGCTATTGAAATTTAGTGATTTTTCTATTGGGCCATTTATCAATTTCAATATCCCCAAAGACAACTCTATATGTATAATTATCAATAAATATCATACCGTTCTGGAGCAACCTGTTTTCGAACGTCATATTTTTGTTCT
>TRINITY_DN38148_c0_g1_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:GGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCAT
TGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAGA
TGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAGC
ATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAACT
TAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGAA
ACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGAA
TTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACATC
ATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACA
CCCTTCAAGgtaatttggaggaaggcaaagctggtttattagatgatctttccgtctcccggaagagaatgttcaatggagaagggaaaagtgaaagccttagaaggaaaatgaaatattctgatggcctgaatgattggaaatcagGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAA
TTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTGGTTTCAATCTTTTGCAAGGAAGGTTCTTCAGG
GAATGGTCTGACGAGCATTCAGGAGGTTGCTGATTCTTACAAGCAAGGAGAGAGGGTAGGATATGCAGAACCTGCTCCTGGAGTTGAGCTATATCTATGCCCCACTGATGTTATCACAATGAAAGTTCTCAATAAATATGTTACACCTGAAGATTTTGAGAATATAAATGACCAGAATGGTTTGATTGGATGTGTTGTGT
GGCGAAGAAATAATGTAACCACTAATGTTATGCATAAGATGCCAGAACAACAATATATAAATGCAAAAAAGCTTGCACTATCTGGTCATTTGCTAGATTCTCCAACGCGCCCTGGTGTCTTAGATTCGGTGCCATATAGAACGGACAGCCCAAAATATGTGATTAATAACCTTGAAAACCATTCTGTCCAAAGTAGATCA
CCGACTATGAAATCTGCACTAACTACTACATTGGTTGAAAATATTACAGCTGAAGATAAAGATTCTTCAGAAACAGATATTCCACCTGGATTTGGTTCTTGGCCATCTTGTGATCAACAAATAAATGTAGTACCCAAGCTCATTGAATCGTCTAATTTGAATGATGATTTGATTGATGATGTGCCTCCAGGATTTGGGCC
TAGAGCAGCAGTTAGTAGAAATGGTGGCTATACAGAAAATTTGGATGATGATGATCTTCCGGAATTTGATTATGGAGCGTCTATACCTTATCAACGCCAAATACCCCCACAAGGTTGCAGTCTGCAGTCCTTGGATGATACCCAGTCTCCAAGCCAATCATCCCAGCCTAAAATATCAATTTCCAATCAATGCTACTTCC
AGTCAAATGCCAATTTGCACCTACCTCAAGTCCAATCAGTCAGTCACCAAGTTGTGCAACAGGTTCCACACCAAGTTGTGCAACAGGTTCCAAGACCACCAGCCACTCCTCACCCATCAATGAAAACCCGCGAGTTGATACAAAAGTTTGGACAGAGTGATGCCGTCTTGCCATTCACTTCTGGACCTAATACTGCCCTT
GATGTCCCCGGGGTTCACACTGCTGCCCAAATAGGTCTGCAGGCAGCTCCTCAAGGTCCCATCAATGCTCATAATCTAATGCCTGGAAAAAATTCATGGAATGAGGAGGATGATATTCCTGAATGGCGTCCTCCATATTTTTCACAAGGAAATAGTTCTTTGGTGGTTCCACCCATGGAGTCTATGCCACCATCTCAGTT
AGGGGTGCCAAATGTGATGGGAAATTTACAGCCAGTACATCATTTGCCTCCAAGAGTAACTACACCCCAAATATGTCCTCAACAAATGCCTCCACTTCAAATAGGGCCTCCCCATATGTTGCCACCTCAGGCTCTTATGCCACAGTGTATGCCACCTCCTTTACCACAGGGCCCTCGACCTTTAACTGGTATGGTTCGGC
CAATTCCCTTGTTGACACAGAGGGGTAATGGATTTATATATGCAAATAATTCTCCGTCATTTCAGAGTAGCCACAATTTCAGGCCTGCCTTAAGCGGGCCAGACATTAGACCTCTTGATGGAAGGAATAGAAGGATATGAATCTGTCCAATGACCGAAATGCACTATGTGGTTGGAAAGTTTCGTTGTATAATTAGTACT
TGCATCCCTCCATTTCATGGGGATGCATTAGAGTGAAAATAGTTAGTGTTAGTTTAGCCTATGCCATGTACAATATAAATTATTGGCCCAGCAAATGCAGCCTTCATGTAACATTATTGTCACATAACTTTTATTGTATTTTGTTTTTATTGATTATTGCAACGGGAGTTCAAATATAACGAAGAATATAACGAAGAAAC
AGTGTTTGATGGTTGTAATAGGTAATATAGCAAAGAAAACAACACCTAATAGGAAGGCCTCTTTTGAGGATTGAGGATTGTGAATGCGTTTAAGGCCATAAAAAATAAAAAAATCGATACGATCAACTTAATTAATTTTGACCTTTGTAATTTGATTTATGTTGTAAGTTTGGAC
Intron 2 GTTTTGGACT ... CTCATCATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 38.2 | 55 | 35 | 33 |
| A2 | 36.71 | 25 | 17 | 12 |
| A3 | 38.98 | 18 | 13 | 10 |
| A4 | 43.48 | 26 | 26 | 14 |
| A5 | 29.73 | 13 | 11 | 0 |
| A6 | 25.86 | 40.1 | 18 | 10 |
| A7 | 26.26 | 66 | 31 | 16 |
| A8 | 28.26 | 99 | 54 | 24 |
| A9 | 26.64 | 84 | 46 | 15 |
| A10 | 30.2 | 52 | 22 | 23 |
>TRINITY_DN41833_c0_g1_i13 from sample A6 / Example spliced isoformCGCAGGCCTTCCCTCTTTTTTAGCGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTG
AGATTAATTAGGAGGCATTTGCATTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTC
TTTTTGGAGTACCCAATGTAAAGATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTC
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TTCTATTTAATCTTAAAGATAGAAACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTA
GTTAAGAAAACACACAAAGGAGAATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCC
TGGTGCTTTTCCACCATGTACATCATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTTCTGTAATATGATGGCAAGAAATTTTGACGGTTATCATTTTGGAGAAGTATATTTTGAATTAATTCTGATGCTTTCAAAGTTCTAATTTCCACCTAGTAGCTATGAATCATGCCACAAATCCTGGGATTTCAGATATAGCTTATTTTAATAAGCC
CCAATGTATTTCTTCTTTTATTTCCTTTTGTGTATTATTGTGATTGTTGTTAGTTGAGTTTTCTGATTTGTTTCTTGAACTGATTTCTTGCGTTGCTAAATAATTTTTCTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGA
ATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAA
TGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGAT
GCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATGTAGTTGTGATGCTTTATTGCGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTG
AATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATT
TGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGCATGTTAATGAATTTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACG
>TRINITY_DN41833_c0_g1_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:CGCAGGCCTTCCCTCTTTTTTAGCGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTG
AGATTAATTAGGAGGCATTTGCATTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTC
TTTTTGGAGTACCCAATGTAAAGATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTC
CAGATTGAGTCAACAGTCTTGAGCATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGG
TTCACACCAGGCACAAAATGAACTTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTC
TTCTATTTAATCTTAAAGATAGAAACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTA
GTTAAGAAAACACACAAAGGAGAATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCC
TGGTGCTTTTCCACCATGTACATCATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTTCTGTAATATGATGGCAAGAAATTTTGACGGTTATCATTTTGGAGAAGTATATTTTGAATTAATTCTGATGCTTTCAAAGTTCTAATTTCCACCTAGTAGCTATGAATCATGCCACAAATCCTGGGATTTCAGATATAGCTTATTTTAATAAGCC
CCAATGTATTTCTTCTTTTATTTCCTTTTGTGTATTATTGTGATTGTTGTTAGTTGAGTTTTCTGATTTGTTTCTTGAACTGATTTCTTGCGTTGCTAAATAATTTTTCTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGA
ATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAA
TGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGAT
GCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGgttttggactgaatctaaatgacccacttttaggaaataatttagtatttcatagttctttgaggaatagttcaaagcttgcatcaagtgtatagagctggcttcatctaaagtgcttgtgccatgtcacactgcgatataaagtg
cttgtgccatgtataatttgccaacatatgctgcgatataaaatttcagttgggagatccactagcgagacatgtttgcttgtttcacatgcctaatctctcttctcatatatgaaacgcatgtcctaattgatcctgactggcgatgaagtgtgattgtgagttattctgtgtttaaattttagacccctcaataattt
ttttaacatagtgaggatctcttatactcatcatagGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATGTAGTTGTGATGCTTTATTGCGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTGAATTCTTTTTTCAGCGTT
GGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAA
CAAAGAGGCATGTTAATGAATTTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACG
Intron 3 GTATTTCACT ... CTGTCTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 49.28 | 35 | 40 | 28 |
| A2 | 46.88 | 17 | 25 | 5 |
| A3 | 55.93 | 13 | 22 | 11 |
| A4 | 45.83 | 26 | 27 | 17 |
| A5 | 46.34 | 11 | 13 | 6 |
| A6 | 38.98 | 18 | 19 | 4 |
| A7 | 42.59 | 31 | 36 | 10 |
| A8 | 40.98 | 54 | 50 | 25 |
| A9 | 37.84 | 46 | 48 | 8 |
| A10 | 41.33 | 22 | 24 | 7 |
>TRINITY_DN38148_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoformGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCAT
TGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAGA
TGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAGC
ATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAACT
TAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGAA
ACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGAA
TTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACATC
ATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACA
CCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAA
TTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTTTTGGACTGAATCTAAATGACCCACTTTTAGGA
AATAATTTAGTATTTCATAGTTCTTTGAGGAATAGTTCAAAGCTTGCATCAAGTGTATAGAGCTGGCTTCATCTAAAGTGCTTGTGCCATGTCACACTGCGATATAAAGTGCTTGTGCCATGTATAATTTGCCAACATATGCTGCGATATAAAATTTCAGTTGGGAGATCCACTAGCGAGACATGTTTGCTTGTTTCACA
TGCCTAATCTCTCTTCTCATATATGAAACGCATGTCCTAATTGATCCTGACTGGCGATGAAGTGTGATTGTGAGTTATTCTGTGTTTAAATTTTAGACCCCTCAATAATTTTTTTAACATAGTGAGGATCTCTTATACTCATCATAGGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATGTAGTTGTGATGCTTTATTG
CGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAA
TATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGTATGTTAATGAATTTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTG
TTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTATTTTTATCGTTTTGGTTCTATAAGACTTAGTAAAAGAAACTTCGTTGCTATTCAGGGTAGTTTGTGATGGTGAGTATCCAT
GCATTGCGAACATGCCCAGGTGAAATAAATTAAGGCAATATTTGAAGTCTCTTAGGTAACTGAGTTTGTTAACTTGGCGCTTTTCTTTGAACAATTATTATATGAACCTTCTTCCTTGGCAATATATAGGGAAGTGGAGAATTGATGGTCGTCCATGAGAGAAATACAGTTTTAATGGGCCAGTTTCATTCTTTCCGTAG
ATTGGTACTTTCATTTGAGAATTAAAAAAAAATGTGGGACAAGTGTTTGTTATCATGATGCAAAATGCACACTTGGATTAGTCATTATCCTTTGTTGTGATTTTAATGAGCCGTAAGAGATTCTCGATGCCCTCAGCATTCGGGAACAAAATCCCAAGGGAGCATCATGAATTTCTGAGTTGTTTTGAAACGGTACATCA
TTTGAAGTACCTGACATTCCAAGGATAATACGGAACGCTTGGATTTCTTTTTCAAATGCTTCAGCCGTGTCGGGGCAGCATAGGATCTATCCTATTACTATATTTTTCGAGTCATCTTGGAGTAGTACTTGTGGAACTGTTTTCTTTTCAACTAGTCAATTTCACTTCAAGTTTGACGTCCTTGTTTTTCAACCCTTTTG
TTATTTTGTCATGCAACTGTTAATGGAGAGAATTGGATGTTTTAGATGAGTTCATGCCTACTCTTGATTTGGCTGTTCTATTGTTAGTTCAACTCTTGGATGCCCCGAAGTTATCTCAAAATAATGCATGCATAGTTGTCCATTAGTTTCTGTATTGCCTAGATTCAAAGCCAAGCAATTTTCTGTATTGGTCCTTTTGC
ATGTGCATAGAAAAATATTCCACTTAGTACTATATTAATCAAATCAGACTAAGTTATCTCCCAATTAATTTAATATTCTTTAATTATTCTGGCTTGTTTCTCTAGTTATTTATGCCAATGCTGAGCAGAGCTGCATTATGTCATGGTTTTAATTTTCTGGTTTATATTTTTTGAAAGAAGGTTTGTAATTGCACAACGAT
ATTATAAAGTGGGACGCTGATACAACCTGTTGCATTTGGTCTTATAATGAAAATTTAATGTATCCAACGTGTATTAAGTGGCCTTTAAAAGAACAGTAGTCGATCTATTTGATAACCATTCCAAATTCAAGAAGGGTATATCCGCAGGAAGTTTTTAATCACTTGATCTTGAATTCCGTCAAACTTTTTCTTGCAGTTTA
CCACTTGTAAAATAAAGCATACTCTTTTTGTGATATAGCTTGTCCAACAAATGAATGCCTTCTAAATTTGTTTGAAACTTGTTATATTGCTCCTGTAAACTGCTTCAAGAAGAAAATGATTACTAAGTTCCACACGAAGTAAGAAAGTCTACTGTAATGAAGGGCGTGATATTATTATGTATTCATATTTGTAGTCCTAA
TGAGGAGCTAGTTTCTGTCACTAGTCTGATGGCATTTCATCTACTGTTTATGGTATTATTTTGTCACGCAAATTAGAGGTTGACTTCATTTTTGTATGGTTGAAGTTTGAGTAAAGCCGATTTGAATGGTTATCATCTTGAATGAACACAGTAACTTAAGGTTCAAGTTTCAACCGAAGGAAATCTCCAAATGCGAATGA
TGAAGACTTCTGAAGCAAAACATTGCGGAGATGTTTTACCAAGTTTTTCATTATTGATTTGTTCTAAATCAGAGAATTTTTTACCAAGTTTTTAGTTTTTAGTTTCTAGTTGTAGCAGGAATGCTAAAATTCAGAAATTTCATGATTTGTCTGGATCGTATAATGAAAATAGTCATTTAAGTGGCTGTAGAAGTCTGGAT
AGTTACAAACTATTACACTGAAGATTATCTCCAAGGTATGTCCAGTTTCTTTAGCTCGGGAGTCCTGGATCACATGATGAAAAGTCATTTAACTGGTTGTAGAAGTCTGGATAATTACAAGCTATGACACTCAAGATTATCCAGTTTCTTTATCCCTGGAGTCTGGCTAAATTTGTTTCCAATATGGCTAGATGAATGAA
CTTCAGGTGGAAATTTGGATTGAATGGAATTTGGAGTAAATATATAGTGCTGGGTTGATACATTTGTCCAGGACTGAAACATTATTGGCTGCTGGTGTAGAACTCCCACGCCATGGTGAGAACGTGGTTGCCCAGTAAGCATGGAGCTATGTTCGGGGCTCCAGTATCTCGAAATAAAAAAAGCAAATTGGTTGCTTGCT
TAATGATTCTAATTTTAAGATGTTCAAATCCTATTGCAGTTACAACAGCAGCTGCCATTCTCTATTTAGCAGGTTGCTAATCTAGTAGATTCATTTTTAACTAGTAATTGTACATTCTGCACACAGAGCAGCTGTCTCAGAAATGGTGTATACAATATTTAAAGATTATGTTAATGGGAACCATTTTCAAGATTATATTA
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AACTCTATATGTATAATTATCAATAAATATCATACCGTTCTGGAGCAACCTGTTTTCGAACGTCATATTTTTGTTCT
>TRINITY_DN38148_c0_g1_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:GGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCAT
TGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAGA
TGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAGC
ATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAACT
TAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGAA
ACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGAA
TTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACATC
ATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACA
CCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAA
TTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGgtatttcactttctcaatatgttgtgtattttagt
gcttgtttttaatttaatttagttgcaataaaaataactaataccatgtcaacctacgaaattttcaatagcaaaatcagttaatattctttatttttagtgggtcaggggatgggggagttgtaggaaggtagacaatcgtgataagttgcccatatgactaggctctgtgaaatgggcttttgaagctgaacatcagt
ggataatttcaagttatcaagaaaacattagggaaggaagaaaagttagtattacttaccacagtctaacttgataacaaacaacagagtatataaggcttggttaaggagcagcaaagccagtgggaaatgaatcaattaactggtaaatatcttaggaagaaacttacttcatgatggtatcgtcccaaggagtttgt
gcacagggatatggtatatgtagtatagtatacaaggtttggttaaggagcagcaaagccagtgggaaatgaatcaattaactggcaaatatcttaggaagaaacttagtatagtagtatagtgttatgggatatggtatatgtagtagtatagtgttatgggatatggtatatgtagtagtatagtatacaaggcttgg
ttaaggagcagcaaagccagtgggaaatgaatcaattaactggcaaatatcttaggaagaaacttacttcatgatggtatcgtcccaaggagtttgtgcacagggatatggtatatgtagtatagtagccaaacttggcttgataaatatgactcggacagataaatttcaccagaagcttggtcgatttaaatgagctt
tttgatgttcaatttcttttaccgagattatatataaacattggataataaagaaaatagaaataaaaaacggtatgtgttcttttgctgagtcggaatgattgtggttatcaaccctaaactggctttaaacatagggccaaggaggatctcagtaaaagaacattatttttaacatttgctggtgtggttgaatatat
aaggaggtgtgaaggtgcttgagtcacccaaggacaatttttagtggtttaccgttaagataatccattctacagaagtacattgataatgctgtaggaattggaaataaaaacgctggatgcattactgtgtttgcaggcaatcacactaaatttgtggttctagctttcaatttttgtactcgtgcattatacattta
atttttaataatttgttattattatttaggattcttgggtatgacaatttgtaagaagagactcgtttgattttggttttcatgaagtggctcattgaagaaaaagttaggatatggattctttaatacaactccattgctgaaaatggatgttaaatcgtaaagggtgtattttcttggttgtccgatccaaagagttt
ggtgtgattttgtatatttttacactgtttttctcaaaatgctgtcattctgaggatgcatagtaattttctatatagtatatggttctatattcaccgattaacaatattccttgtagtgtttctctgtcaaaagttgaaacgttagcctcggttaaccatcgttcctgaaaagagattatattggtactggttgcagc
atcgttgtgtattatgcatattcaaagctcacagagatggaagccattaggattcattttcttttgtagtcaagctaattctagtgattcgggggtattatcaggatgataggatagtaaatcattctatgatgtctttggattcatcgtatttttggtagagtagagttcatatagtagttttttatatatacaaagat
gacatttgttcacatattgaccagaatttctgtcttcagGTTTTGGACTGAATCTAAATGACCCACTTTTAGGAAATAATTTAGTATTTCATAGTTCTTTGAGGAATAGTTCAAAGCTTGCATCAAGTGTATAGAGCTGGCTTCATCTAAAGTGCTTGTGCCATGTCACACTGCGATATAAAGTGCTTGTGCCATGTATA
ATTTGCCAACATATGCTGCGATATAAAATTTCAGTTGGGAGATCCACTAGCGAGACATGTTTGCTTGTTTCACATGCCTAATCTCTCTTCTCATATATGAAACGCATGTCCTAATTGATCCTGACTGGCGATGAAGTGTGATTGTGAGTTATTCTGTGTTTAAATTTTAGACCCCTCAATAATTTTTTTAACATAGTGAG
GATCTCTTATACTCATCATAGGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATGTAGTTGTGATGCTTTATTGCGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAG
AAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGTATGTTA
ATGAATTTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTATTTTTAT
CGTTTTGGTTCTATAAGACTTAGTAAAAGAAACTTCGTTGCTATTCAGGGTAGTTTGTGATGGTGAGTATCCATGCATTGCGAACATGCCCAGGTGAAATAAATTAAGGCAATATTTGAAGTCTCTTAGGTAACTGAGTTTGTTAACTTGGCGCTTTTCTTTGAACAATTATTATATGAACCTTCTTCCTTGGCAATATA
TAGGGAAGTGGAGAATTGATGGTCGTCCATGAGAGAAATACAGTTTTAATGGGCCAGTTTCATTCTTTCCGTAGATTGGTACTTTCATTTGAGAATTAAAAAAAAATGTGGGACAAGTGTTTGTTATCATGATGCAAAATGCACACTTGGATTAGTCATTATCCTTTGTTGTGATTTTAATGAGCCGTAAGAGATTCTCG
ATGCCCTCAGCATTCGGGAACAAAATCCCAAGGGAGCATCATGAATTTCTGAGTTGTTTTGAAACGGTACATCATTTGAAGTACCTGACATTCCAAGGATAATACGGAACGCTTGGATTTCTTTTTCAAATGCTTCAGCCGTGTCGGGGCAGCATAGGATCTATCCTATTACTATATTTTTCGAGTCATCTTGGAGTAGT
ACTTGTGGAACTGTTTTCTTTTCAACTAGTCAATTTCACTTCAAGTTTGACGTCCTTGTTTTTCAACCCTTTTGTTATTTTGTCATGCAACTGTTAATGGAGAGAATTGGATGTTTTAGATGAGTTCATGCCTACTCTTGATTTGGCTGTTCTATTGTTAGTTCAACTCTTGGATGCCCCGAAGTTATCTCAAAATAATG
CATGCATAGTTGTCCATTAGTTTCTGTATTGCCTAGATTCAAAGCCAAGCAATTTTCTGTATTGGTCCTTTTGCATGTGCATAGAAAAATATTCCACTTAGTACTATATTAATCAAATCAGACTAAGTTATCTCCCAATTAATTTAATATTCTTTAATTATTCTGGCTTGTTTCTCTAGTTATTTATGCCAATGCTGAGC
AGAGCTGCATTATGTCATGGTTTTAATTTTCTGGTTTATATTTTTTGAAAGAAGGTTTGTAATTGCACAACGATATTATAAAGTGGGACGCTGATACAACCTGTTGCATTTGGTCTTATAATGAAAATTTAATGTATCCAACGTGTATTAAGTGGCCTTTAAAAGAACAGTAGTCGATCTATTTGATAACCATTCCAAAT
TCAAGAAGGGTATATCCGCAGGAAGTTTTTAATCACTTGATCTTGAATTCCGTCAAACTTTTTCTTGCAGTTTACCACTTGTAAAATAAAGCATACTCTTTTTGTGATATAGCTTGTCCAACAAATGAATGCCTTCTAAATTTGTTTGAAACTTGTTATATTGCTCCTGTAAACTGCTTCAAGAAGAAAATGATTACTAA
GTTCCACACGAAGTAAGAAAGTCTACTGTAATGAAGGGCGTGATATTATTATGTATTCATATTTGTAGTCCTAATGAGGAGCTAGTTTCTGTCACTAGTCTGATGGCATTTCATCTACTGTTTATGGTATTATTTTGTCACGCAAATTAGAGGTTGACTTCATTTTTGTATGGTTGAAGTTTGAGTAAAGCCGATTTGAA
TGGTTATCATCTTGAATGAACACAGTAACTTAAGGTTCAAGTTTCAACCGAAGGAAATCTCCAAATGCGAATGATGAAGACTTCTGAAGCAAAACATTGCGGAGATGTTTTACCAAGTTTTTCATTATTGATTTGTTCTAAATCAGAGAATTTTTTACCAAGTTTTTAGTTTTTAGTTTCTAGTTGTAGCAGGAATGCTA
AAATTCAGAAATTTCATGATTTGTCTGGATCGTATAATGAAAATAGTCATTTAAGTGGCTGTAGAAGTCTGGATAGTTACAAACTATTACACTGAAGATTATCTCCAAGGTATGTCCAGTTTCTTTAGCTCGGGAGTCCTGGATCACATGATGAAAAGTCATTTAACTGGTTGTAGAAGTCTGGATAATTACAAGCTATG
ACACTCAAGATTATCCAGTTTCTTTATCCCTGGAGTCTGGCTAAATTTGTTTCCAATATGGCTAGATGAATGAACTTCAGGTGGAAATTTGGATTGAATGGAATTTGGAGTAAATATATAGTGCTGGGTTGATACATTTGTCCAGGACTGAAACATTATTGGCTGCTGGTGTAGAACTCCCACGCCATGGTGAGAACGTG
GTTGCCCAGTAAGCATGGAGCTATGTTCGGGGCTCCAGTATCTCGAAATAAAAAAAGCAAATTGGTTGCTTGCTTAATGATTCTAATTTTAAGATGTTCAAATCCTATTGCAGTTACAACAGCAGCTGCCATTCTCTATTTAGCAGGTTGCTAATCTAGTAGATTCATTTTTAACTAGTAATTGTACATTCTGCACACAG
AGCAGCTGTCTCAGAAATGGTGTATACAATATTTAAAGATTATGTTAATGGGAACCATTTTCAAGATTATATTATTGGGAACTCACTATTTGATGATATTTCTAATGTTGATATTAACATAATAAAGCATCATTTATTGAATCTATTGGTTTGGATCCTAGATGGGTTTTACTTGAGACTATTTGGCAGCTTGTCTGGTG
ACGTGGCTTTACTGCTATTGAAATTTAGTGATTTTTCTATTGGGCCATTTATCAATTTCAATATCCCCAAAGACAACTCTATATGTATAATTATCAATAAATATCATACCGTTCTGGAGCAACCTGTTTTCGAACGTCATATTTTTGTTCT
Intron 4 GTATTTCACT ... CTCATCATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 39.89 | 55 | 40 | 33 |
| A2 | 42.53 | 25 | 25 | 12 |
| A3 | 47.06 | 18 | 22 | 10 |
| A4 | 44.09 | 26 | 27 | 14 |
| A5 | 33.33 | 13 | 13 | 0 |
| A6 | 26.37 | 40.5 | 19 | 10 |
| A7 | 28.26 | 66 | 36 | 16 |
| A8 | 27.21 | 99 | 50 | 24 |
| A9 | 27.27 | 84 | 48 | 15 |
| A10 | 31.13 | 52 | 24 | 23 |
>TRINITY_DN38148_c0_g1_i7 from sample A9 / Example spliced isoformGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCAT
TGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAGA
TGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAGC
ATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAACT
TAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGAA
ACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGAA
TTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACATC
ATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACA
CCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAA
TTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATGT
AGTTGTGATGCTTTATTGCGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTG
TCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGTATGTTAATGAATTTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAA
CGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTATTTTTATCGTTTTGGTTCTATAAGACTTAGTAAAAGAAACTTCGTTGCTATTCAGGGTAGTTT
GTGATGGTGAGTATCCATGCATTGCGAACATGCCCAGGTGAAATAAATTAAGGCAATATTTGAAGTCTCTTAGGTAACTGAGTTTGTTAACTTGGCGCTTTTCTTTGAACAATTATTATATGAACCTTCTTCCTTGGCAATATATAGGGAAGTGGAGAATTGATGGTCGTCCATGAGAGAAATACAGTTTTAATGGGCCA
GTTTCATTCTTTCCGTAGATTGGTACTTTCATTTGAGAATTAAAAAAAAATGTGGGACAAGTGTTTGTTATCATGATGCAAAATGCACACTTGGATTAGTCATTATCCTTTGTTGTGATTTTAATGAGCCGTAAGAGATTCTCGATGCCCTCAGCATTCGGGAACAAAATCCCAAGGGAGCATCATGAATTTCTGAGTTG
TTTTGAAACGGTACATCATTTGAAGTACCTGACATTCCAAGGATAATACGGAACGCTTGGATTTCTTTTTCAAATGCTTCAGCCGTGTCGGGGCAGCATAGGATCTATCCTATTACTATATTTTTCGAGTCATCTTGGAGTAGTACTTGTGGAACTGTTTTCTTTTCAACTAGTCAATTTCACTTCAAGTTTGACGTCCT
TGTTTTTCAACCCTTTTGTTATTTTGTCATGCAACTGTTAATGGAGAGAATTGGATGTTTTAGATGAGTTCATGCCTACTCTTGATTTGGCTGTTCTATTGTTAGTTCAACTCTTGGATGCCCCGAAGTTATCTCAAAATAATGCATGCATAGTTGTCCATTAGTTTCTGTATTGCCTAGATTCAAAGCCAAGCAATTTT
CTGTATTGGTCCTTTTGCATGTGCATAGAAAAATATTCCACTTAGTACTATATTAATCAAATCAGACTAAGTTATCTCCCAATTAATTTAATATTCTTTAATTATTCTGGCTTGTTTCTCTAGTTATTTATGCCAATGCTGAGCAGAGCTGCATTATGTCATGGTTTTAATTTTCTGGTTTATATTTTTTGAAAGAAGGT
TTGTAATTGCACAACGATATTATAAAGTGGGACGCTGATACAACCTGTTGCATTTGGTCTTATAATGAAAATTTAATGTATCCAACGTGTATTAAGTGGCCTTTAAAAGAACAGTAGTCGATCTATTTGATAACCATTCCAAATTCAAGAAGGGTATATCCGCAGGAAGTTTTTAATCACTTGATCTTGAATTCCGTCAA
ACTTTTTCTTGCAGTTTACCACTTGTAAAATAAAGCATACTCTTTTTGTGATATAGCTTGTCCAACAAATGAATGCCTTCTAAATTTGTTTGAAACTTGTTATATTGCTCCTGTAAACTGCTTCAAGAAGAAAATGATTACTAAGTTCCACACGAAGTAAGAAAGTCTACTGTAATGAAGGGCGTGATATTATTATGTAT
TCATATTTGTAGTCCTAATGAGGAGCTAGTTTCTGTCACTAGTCTGATGGCATTTCATCTACTGTTTATGGTATTATTTTGTCACGCAAATTAGAGGTTGACTTCATTTTTGTATGGTTGAAGTTTGAGTAAAGCCGATTTGAATGGTTATCATCTTGAATGAACACAGTAACTTAAGGTTCAAGTTTCAACCGAAGGAA
ATCTCCAAATGCGAATGATGAAGACTTCTGAAGCAAAACATTGCGGAGATGTTTTACCAAGTTTTTCATTATTGATTTGTTCTAAATCAGAGAATTTTTTACCAAGTTTTTAGTTTTTAGTTTCTAGTTGTAGCAGGAATGCTAAAATTCAGAAATTTCATGATTTGTCTGGATCGTATAATGAAAATAGTCATTTAAGT
GGCTGTAGAAGTCTGGATAGTTACAAACTATTACACTGAAGATTATCTCCAAGGTATGTCCAGTTTCTTTAGCTCGGGAGTCCTGGATCACATGATGAAAAGTCATTTAACTGGTTGTAGAAGTCTGGATAATTACAAGCTATGACACTCAAGATTATCCAGTTTCTTTATCCCTGGAGTCTGGCTAAATTTGTTTCCAA
TATGGCTAGATGAATGAACTTCAGGTGGAAATTTGGATTGAATGGAATTTGGAGTAAATATATAGTGCTGGGTTGATACATTTGTCCAGGACTGAAACATTATTGGCTGCTGGTGTAGAACTCCCACGCCATGGTGAGAACGTGGTTGCCCAGTAAGCATGGAGCTATGTTCGGGGCTCCAGTATCTCGAAATAAAAAAA
GCAAATTGGTTGCTTGCTTAATGATTCTAATTTTAAGATGTTCAAATCCTATTGCAGTTACAACAGCAGCTGCCATTCTCTATTTAGCAGGTTGCTAATCTAGTAGATTCATTTTTAACTAGTAATTGTACATTCTGCACACAGAGCAGCTGTCTCAGAAATGGTGTATACAATATTTAAAGATTATGTTAATGGGAACC
ATTTTCAAGATTATATTATTGGGAACTCACTATTTGATGATATTTCTAATGTTGATATTAACATAATAAAGCATCATTTATTGAATCTATTGGTTTGGATCCTAGATGGGTTTTACTTGAGACTATTTGGCAGCTTGTCTGGTGACGTGGCTTTACTGCTATTGAAATTTAGTGATTTTTCTATTGGGCCATTTATCAAT
TTCAATATCCCCAAAGACAACTCTATATGTATAATTATCAATAAATATCATACCGTTCTGGAGCAACCTGTTTTCGAACGTCATATTTTTGTTCT
>TRINITY_DN38148_c0_g1_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:GGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCAT
TGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAGA
TGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAGC
ATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAACT
TAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGAA
ACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGAA
TTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACATC
ATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACA
CCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAA
TTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGgtatttcactttctcaatatgttgtgtattttagt
gcttgtttttaatttaatttagttgcaataaaaataactaataccatgtcaacctacgaaattttcaatagcaaaatcagttaatattctttatttttagtgggtcaggggatgggggagttgtaggaaggtagacaatcgtgataagttgcccatatgactaggctctgtgaaatgggcttttgaagctgaacatcagt
ggataatttcaagttatcaagaaaacattagggaaggaagaaaagttagtattacttaccacagtctaacttgataacaaacaacagagtatataaggcttggttaaggagcagcaaagccagtgggaaatgaatcaattaactggtaaatatcttaggaagaaacttacttcatgatggtatcgtcccaaggagtttgt
gcacagggatatggtatatgtagtatagtatacaaggtttggttaaggagcagcaaagccagtgggaaatgaatcaattaactggcaaatatcttaggaagaaacttagtatagtagtatagtgttatgggatatggtatatgtagtagtatagtgttatgggatatggtatatgtagtagtatagtatacaaggcttgg
ttaaggagcagcaaagccagtgggaaatgaatcaattaactggcaaatatcttaggaagaaacttacttcatgatggtatcgtcccaaggagtttgtgcacagggatatggtatatgtagtatagtagccaaacttggcttgataaatatgactcggacagataaatttcaccagaagcttggtcgatttaaatgagctt
tttgatgttcaatttcttttaccgagattatatataaacattggataataaagaaaatagaaataaaaaacggtatgtgttcttttgctgagtcggaatgattgtggttatcaaccctaaactggctttaaacatagggccaaggaggatctcagtaaaagaacattatttttaacatttgctggtgtggttgaatatat
aaggaggtgtgaaggtgcttgagtcacccaaggacaatttttagtggtttaccgttaagataatccattctacagaagtacattgataatgctgtaggaattggaaataaaaacgctggatgcattactgtgtttgcaggcaatcacactaaatttgtggttctagctttcaatttttgtactcgtgcattatacattta
atttttaataatttgttattattatttaggattcttgggtatgacaatttgtaagaagagactcgtttgattttggttttcatgaagtggctcattgaagaaaaagttaggatatggattctttaatacaactccattgctgaaaatggatgttaaatcgtaaagggtgtattttcttggttgtccgatccaaagagttt
ggtgtgattttgtatatttttacactgtttttctcaaaatgctgtcattctgaggatgcatagtaattttctatatagtatatggttctatattcaccgattaacaatattccttgtagtgtttctctgtcaaaagttgaaacgttagcctcggttaaccatcgttcctgaaaagagattatattggtactggttgcagc
atcgttgtgtattatgcatattcaaagctcacagagatggaagccattaggattcattttcttttgtagtcaagctaattctagtgattcgggggtattatcaggatgataggatagtaaatcattctatgatgtctttggattcatcgtatttttggtagagtagagttcatatagtagttttttatatatacaaagat
gacatttgttcacatattgaccagaatttctgtcttcaggttttggactgaatctaaatgacccacttttaggaaataatttagtatttcatagttctttgaggaatagttcaaagcttgcatcaagtgtatagagctggcttcatctaaagtgcttgtgccatgtcacactgcgatataaagtgcttgtgccatgtata
atttgccaacatatgctgcgatataaaatttcagttgggagatccactagcgagacatgtttgcttgtttcacatgcctaatctctcttctcatatatgaaacgcatgtcctaattgatcctgactggcgatgaagtgtgattgtgagttattctgtgtttaaattttagacccctcaataatttttttaacatagtgag
gatctcttatactcatcatagGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATGTAGTTGTGATGCTTTATTGCGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAG
AAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGTATGTTA
ATGAATTTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTATTTTTAT
CGTTTTGGTTCTATAAGACTTAGTAAAAGAAACTTCGTTGCTATTCAGGGTAGTTTGTGATGGTGAGTATCCATGCATTGCGAACATGCCCAGGTGAAATAAATTAAGGCAATATTTGAAGTCTCTTAGGTAACTGAGTTTGTTAACTTGGCGCTTTTCTTTGAACAATTATTATATGAACCTTCTTCCTTGGCAATATA
TAGGGAAGTGGAGAATTGATGGTCGTCCATGAGAGAAATACAGTTTTAATGGGCCAGTTTCATTCTTTCCGTAGATTGGTACTTTCATTTGAGAATTAAAAAAAAATGTGGGACAAGTGTTTGTTATCATGATGCAAAATGCACACTTGGATTAGTCATTATCCTTTGTTGTGATTTTAATGAGCCGTAAGAGATTCTCG
ATGCCCTCAGCATTCGGGAACAAAATCCCAAGGGAGCATCATGAATTTCTGAGTTGTTTTGAAACGGTACATCATTTGAAGTACCTGACATTCCAAGGATAATACGGAACGCTTGGATTTCTTTTTCAAATGCTTCAGCCGTGTCGGGGCAGCATAGGATCTATCCTATTACTATATTTTTCGAGTCATCTTGGAGTAGT
ACTTGTGGAACTGTTTTCTTTTCAACTAGTCAATTTCACTTCAAGTTTGACGTCCTTGTTTTTCAACCCTTTTGTTATTTTGTCATGCAACTGTTAATGGAGAGAATTGGATGTTTTAGATGAGTTCATGCCTACTCTTGATTTGGCTGTTCTATTGTTAGTTCAACTCTTGGATGCCCCGAAGTTATCTCAAAATAATG
CATGCATAGTTGTCCATTAGTTTCTGTATTGCCTAGATTCAAAGCCAAGCAATTTTCTGTATTGGTCCTTTTGCATGTGCATAGAAAAATATTCCACTTAGTACTATATTAATCAAATCAGACTAAGTTATCTCCCAATTAATTTAATATTCTTTAATTATTCTGGCTTGTTTCTCTAGTTATTTATGCCAATGCTGAGC
AGAGCTGCATTATGTCATGGTTTTAATTTTCTGGTTTATATTTTTTGAAAGAAGGTTTGTAATTGCACAACGATATTATAAAGTGGGACGCTGATACAACCTGTTGCATTTGGTCTTATAATGAAAATTTAATGTATCCAACGTGTATTAAGTGGCCTTTAAAAGAACAGTAGTCGATCTATTTGATAACCATTCCAAAT
TCAAGAAGGGTATATCCGCAGGAAGTTTTTAATCACTTGATCTTGAATTCCGTCAAACTTTTTCTTGCAGTTTACCACTTGTAAAATAAAGCATACTCTTTTTGTGATATAGCTTGTCCAACAAATGAATGCCTTCTAAATTTGTTTGAAACTTGTTATATTGCTCCTGTAAACTGCTTCAAGAAGAAAATGATTACTAA
GTTCCACACGAAGTAAGAAAGTCTACTGTAATGAAGGGCGTGATATTATTATGTATTCATATTTGTAGTCCTAATGAGGAGCTAGTTTCTGTCACTAGTCTGATGGCATTTCATCTACTGTTTATGGTATTATTTTGTCACGCAAATTAGAGGTTGACTTCATTTTTGTATGGTTGAAGTTTGAGTAAAGCCGATTTGAA
TGGTTATCATCTTGAATGAACACAGTAACTTAAGGTTCAAGTTTCAACCGAAGGAAATCTCCAAATGCGAATGATGAAGACTTCTGAAGCAAAACATTGCGGAGATGTTTTACCAAGTTTTTCATTATTGATTTGTTCTAAATCAGAGAATTTTTTACCAAGTTTTTAGTTTTTAGTTTCTAGTTGTAGCAGGAATGCTA
AAATTCAGAAATTTCATGATTTGTCTGGATCGTATAATGAAAATAGTCATTTAAGTGGCTGTAGAAGTCTGGATAGTTACAAACTATTACACTGAAGATTATCTCCAAGGTATGTCCAGTTTCTTTAGCTCGGGAGTCCTGGATCACATGATGAAAAGTCATTTAACTGGTTGTAGAAGTCTGGATAATTACAAGCTATG
ACACTCAAGATTATCCAGTTTCTTTATCCCTGGAGTCTGGCTAAATTTGTTTCCAATATGGCTAGATGAATGAACTTCAGGTGGAAATTTGGATTGAATGGAATTTGGAGTAAATATATAGTGCTGGGTTGATACATTTGTCCAGGACTGAAACATTATTGGCTGCTGGTGTAGAACTCCCACGCCATGGTGAGAACGTG
GTTGCCCAGTAAGCATGGAGCTATGTTCGGGGCTCCAGTATCTCGAAATAAAAAAAGCAAATTGGTTGCTTGCTTAATGATTCTAATTTTAAGATGTTCAAATCCTATTGCAGTTACAACAGCAGCTGCCATTCTCTATTTAGCAGGTTGCTAATCTAGTAGATTCATTTTTAACTAGTAATTGTACATTCTGCACACAG
AGCAGCTGTCTCAGAAATGGTGTATACAATATTTAAAGATTATGTTAATGGGAACCATTTTCAAGATTATATTATTGGGAACTCACTATTTGATGATATTTCTAATGTTGATATTAACATAATAAAGCATCATTTATTGAATCTATTGGTTTGGATCCTAGATGGGTTTTACTTGAGACTATTTGGCAGCTTGTCTGGTG
ACGTGGCTTTACTGCTATTGAAATTTAGTGATTTTTCTATTGGGCCATTTATCAATTTCAATATCCCCAAAGACAACTCTATATGTATAATTATCAATAAATATCATACCGTTCTGGAGCAACCTGTTTTCGAACGTCATATTTTTGTTCT
Intron 5 GTTTTGGACT ... GTCAATGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 45.86 | 36 | 35 | 26 |
| A2 | 41.03 | 23 | 17 | 15 |
| A3 | 42.86 | 16 | 13 | 11 |
| A4 | 49.33 | 19 | 26 | 11 |
| A5 | 40 | 12 | 11 | 5 |
| A6 | 51.46 | 25 | 18 | 35 |
| A7 | 45.56 | 49 | 31 | 51 |
| A8 | 51.47 | 66 | 54 | 86 |
| A9 | 47.64 | 61 | 46 | 65 |
| A10 | 45.86 | 36 | 22 | 39 |
>TRINITY_DN42937_c0_g1_i15 from sample A10 / Example spliced isoformAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACACCCTTCAAGGTAATTTGGAGG
AAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAATTAAATCCCTTTGTCGTTGAA
ACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTA
TAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGCATGTTAATGAAATTACGGCATTTTCTG
TGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGT
>TRINITY_DN42937_c0_g1_i8 from sample A10 / Example unspliced isoform:AAGCGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTT
GCATTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTA
AAGATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTT
GAGCATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATG
AACTTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGAT
AGAAACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGG
AGAATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTA
CATCATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCA
AACACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGT
ACAATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGgttttggactgaatctaaatgacccactttt
aggaaataatttagtatttcatagttctttgaggaatagttcaaagcttgcatcaagtgtatagagctggcttcatctaaagtgcttgtgccatgtcacactgcgatataaagtgcttgtgccatgtataatttgccaacatatgctgcgatataaaatttcagttgggagatccactagcgagacatgtttgcttgttt
cacatgcctaatctctcttctcatatatgaaacgcatgtcctaattgatcctgactggcgatgaagtgtgattgtgagttattctgtgtttaaattttagacccctcaataatttttttaacatagtgaggatctcttatactcatcataggtttgcatcacggagagattgctatcgaacaatgtagttgtgatgcttt
attgcgaaccaactgcatatacaaatgcaactgcagcattactaccaattttcggattgttctgataaaagccgtgtttcttgatgtcaatgtagTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAAT
GCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGCATGTTAATGAAATTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCT
CTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGT
Intron 6 GTTTGCATCA ... GTCAATGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.94 | 36 | 55 | 26 |
| A2 | 46.51 | 23 | 25 | 15 |
| A3 | 47.54 | 16 | 18 | 11 |
| A4 | 49.33 | 19 | 26 | 11 |
| A5 | 42.86 | 12 | 13 | 5 |
| A6 | 60 | 25 | 40 | 35 |
| A7 | 54.42 | 49 | 66 | 51 |
| A8 | 58.36 | 66 | 99 | 86 |
| A9 | 54.98 | 61 | 84 | 65 |
| A10 | 55.83 | 36 | 52 | 39 |
>TRINITY_DN44386_c1_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformGCGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGC
ATTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAA
GATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGA
GCATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAA
CTTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAG
AAACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAG
AATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACA
TCATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAA
CACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTAC
AATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAAT
AGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTTGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGCATGT
TAATGAAATTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATT
TTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTG
>TRINITY_DN44386_c1_g1_i14 from sample A7 / Example unspliced isoform:GCGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGC
ATTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAA
GATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGA
GCATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAA
CTTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAG
AAACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAG
AATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACA
TCATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAA
CACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTAC
AATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGgtttgcatcacggagagattgctatcgaacaat
gtagttgtgatgctttattgcgaaccaactgcatatacaaatgcaactgcagcattactaccaattttcggattgttctgataaaagccgtgtttcttgatgtcaatgtagTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATT
TGTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGCATGTTAATGAAATTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAA
AACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGGCATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTGTCTCTTGTTATTTTTATCACAAGTGACCATTTTAGGATATGAACAAAGAGACATTAATAAATTGACGG
CATTCTCTGTCATTATATTCGTTGCTTTAGATTTTCAAAACGGGAAAGCTG
Intron 7 GTATGGATAT ... TTGGCTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 14.36 | 176 | 33 | 26 |
| A2 | 16.83 | 106.3 | 14 | 29 |
| A3 | 15.08 | 76 | 13 | 14 |
| A4 | 18.18 | 81 | 18 | 18 |
| A5 | 19.46 | 60 | 10 | 19 |
| A6 | 12.45 | 116 | 19 | 14 |
| A7 | 15.68 | 156 | 27 | 31 |
| A8 | 14.29 | 168 | 26 | 30 |
| A9 | 16.07 | 175 | 26 | 41 |
| A10 | 13.1 | 136 | 17 | 24 |
>TRINITY_DN112650_c0_g1_i6 from sample A2 / Example spliced isoformCGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCA
TTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAG
ATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAG
CATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAAC
TTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGA
AACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGA
ATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACAT
CATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAAC
ACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACA
ATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTGGTTTCAATCTTTTGCAAGGAAGGTTCTTCAG
GGAATGGTCTGAACTTCTTTATAACTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
>TRINITY_DN112650_c0_g1_i7 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCA
TTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAG
ATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAG
CATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAAC
TTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGA
AACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGA
ATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACAT
CATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTAAATGCATCAGACATGAGTGCAGCTGAAATTGTTATTGAAGAGGTAATGAGGGAACAAAAGGAACTTCCTGAAATAATGTCTCTTGATGAATATATAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAAC
ACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACA
ATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGgtatggatatctttgttgaataaaaacactagaaacttcattcgtgaaatgctgttaatttcatcatgttgagattcaagtgttttgggtaattgtttttcaaggtcagcagtacctgtgaaattcttagacatctttttactacattagatttt
cttttttgtattatagttatctctatatttctatgatttcatttttatatgaattggttgtaacttgtaagatgaactggatttgattgattctgacttgaggttggttggcttcagTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTC
TTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTGGTTTCAATCTTTTGCAAGGAAGGTTCTTCAGGGAATGGTCTGAACTTCTTTATAACTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Intron 8 GTAAATGCAT ... GAATATATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 66.46 | 53 | 93 | 117 |
| A2 | 71.17 | 32 | 58 | 100 |
| A3 | 66.82 | 36 | 56 | 89 |
| A4 | 65.25 | 41 | 76 | 78 |
| A5 | 77.42 | 7 | 16 | 32 |
| A6 | 64.71 | 15 | 26 | 29 |
| A7 | 69.51 | 34 | 52 | 103 |
| A8 | 62.62 | 40 | 45 | 89 |
| A9 | 66.14 | 32 | 53 | 72 |
| A10 | 64.21 | 34 | 52 | 70 |
>TRINITY_DN112650_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoformCGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCA
TTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAG
ATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAG
CATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAAC
TTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGA
AACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGA
ATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACAT
CATCTGGTCAAGTAGTTGAGGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAACACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCC
TTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACAATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGA
GTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTGGTTTCAATCTTTTGCAAGGAAGGTTCTTCAGGGAATGGTCTGACGAGCATTCAGGAGGTTGCTGATTCTTACAAGCAAGGAGAGAGGGTAGGATATGCAGAACCTGCTCCTGGAGTTGAGCTATATCTATG
CCCCACTGATGTTATCACAATGAAAGTTCTCAATAAATATGTTACACCTGAAGATTTTGAGAATATAAATGACCAGAATGGTTTGATTGGATGTGTTGTGTGGCGAAGAAATAATGTAACCACTAATGTTATGCATAAGATGCCAGAACAACAATATATAAATGCAAAAAAGCTTGCACTATCTGGTCATTTGCTAGATT
CTCCAACGCGCCCTGGTGTCTTAGATTCGGTGCCATATAGAACGGACAGCCCAAAATATGTGATTAATAACCTTGAAAACCATTCTGTCCAAAGTAGATCACCGACTATGAAATCTGCACTAACTACTACATTGGTTGAAAATATTACAGCTGAAGATAAAGATTCTTCAGAAACAGATATTCCACCTGGATTTGGTTCT
TGGCCATCTTGTGATCAACAAATAAATGTAGTACCCAAGCTCATTGAATCGTCTAATTTGAATGATGATTTGATTGATGATGTGCCTCCAGGATTTGGGCCTAGAGCAGCAGTTAGTAGAAATGGTGGCTATACAGAAAATTTGGATGATGATGATCTTCCGGAATTTGATTATGGAGCGTCTATACCTTATCAACGCCA
AATACCCCCACAAGGTTGCAGTCTGCAGTCCTTGGATGATACCCAGTCTCCAAGCCAATCATCCCAGCCTAAAATATCAATTTCCAATCAATGCTACTTCCAGTCAAATGCCAATTTGCACCTACCTCAAGTCCAATCAGTCAGTCACCAAGTTGTGCAACAGGTTCCACACCAAGTTGTGCAACAGGTTCCAAGACCAC
CAGCCACTCCTCACCCATCAATGAAAACCCGCGAGTTGATACAAAAGTTTGGACAGAGTGATGCCGTCTTGCCATTCACTTCTGGACCTAATACTGCCCTTGATGTCCCCGGGGTTCACACTGCTGCCCAAATAGGTCTGCAGGCAGCTCCTCAAGGTCCCATCAATGCTCATAATCTAATGCCTGGAAAAAATTCATGG
AATGAGGAGGATGATATTCCTGAATGGCGTCCTCCATATTTTTCACAAGGAAATAGTTCTTTGGTGGTTCCACCCATGGAGTCTATGCCACCATCTCAGTTAGGGGTGCCAAATGTGATGGGAAATTTACAGCCAGTACATCATTTGCCTCCAAGAGTAACTACACCCCAAATATGTCCTCAACAAATGCCTCCACTTCA
AATAGGGCCTCCCCATATGTTGCCACCTCAGGCTCTTATGCCACAGTGTATGCCACCTCCTTTACCACAGGGCCCTCGACCTTTAACTGGTATGGTTCGGCCAATTCCCTTGTTGACACAGAGGGGTAATGGATTTATATATGCAAATAATTCTCCGTCATTTCAGAGTAGCCACAATTTCAGGCCTGCCTTAAGCGGGC
CAGACATTAGACCTCTTGATGGAAGGAATAGAAGGATATGAATCTGTCCAATGACCGAAATGCACTATGTGGTTGGAAAGTTTCGTTGTATAATTAGTACTTGCATCCCTCCATTTCATGGGGATGCATTAGAGTGAAAATAGTTAGTGTTAGTTTAGCCTATGCCATGTACAATATAAATTATTGGCCCAGCAAATGCA
GCCTTCATGTAACATTATTGTCACATAACTTTTATTGTATTTTGTTTTTATTGATTATTGCAACGGGAGTTCAAATATAACGAAGAATATAACGAAGAAACAGTGTTTGATGGTTGTAATAGGTAATATAGCAAAGAAAACAACACCTAATAGGAAGGCCTCTTTTGAGGATTGAGGATTGTGAATGCGTTTAAGGCCAT
AAAAAATAAAAAAATCGATACGATCAACTTAATTAATTTTGACCTTTGTAATTAGATTTATGTTGTAAGTTTGGACATTTGAGATATAAGGTGTTTGAAAACATTAATTTCATTTCTCAATTTCTATTC
>TRINITY_DN112650_c0_g1_i11 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGGTTACTTGCCGGACTGGAGTTTTGGAAAGGATTAGGGTTTCAGTGTTCGAAAGTCCCCCGAATCTAGGCCTCTCGCTGCCGGTCACATAGCAATCCGCTCGCAACACTTTTACCTTAGTGCGCATGCAATCCATTGATTTATATCAGCCAGTTGGAGAAACCACAGCTGGTGCTGAGATTAATTAGGAGGCATTTGCA
TTGCCCAAATGGAGTCACACGAACTTCTTGAAGATCATGGGCATTCTGGAACACTGTTAAAGTTAGAAGTGCATGAATGCAATGATACTGAGAAAATGTCAAAGCAAGATGCAGATGTAGATTTTGATCCTAATGCACCATACTCTTCTTCAATGGATAACGTACCGTTAAAGGTTCTTTTTGGAGTACCCAATGTAAAG
ATGCGCCAATCTCCAACACATGAGAAGAAGACAGTACAGATAGATTTATCTTCCCCCAAGGGTCATGTTGATTCATCTGATTCTGTCAGAGCCAAACTGAGAGACTCCTTGGCATCTGCTTTGGCTATGGTAGGGGATGAACAACCTAAAAAGGATGTAAAAACAGAAAACAATTTCCAGATTGAGTCAACAGTCTTGAG
CATGCATGCAAGTGAGGATTATAAAGTTGTTAAATTGGAAGACACTGAGTTCAGCACCATTACTGACAAATATTGTCAAGAGGAATCAACTAAAACTTTGAAACGGGAAGGGGGAGACTTTGAACAAAATGAGGTTTTGCCTGAAACAACTGTTTTTTCAGGTTTCTTAAGACAAGGTTCACACCAGGCACAAAATGAAC
TTAAGTTGAGCTCTGAGTTAAATGCACCATATAATGGTGAGGAGGGTCAAAGTGAAGGGCATGAACAGAATATGCAGAGTTCTGAGCTAGCACAGATTGTATCGGTTAAAGTTGAAGCTGAACTTTTCAGAATATACGGCAGTGTTAACAAGAAATACAAGGAAAAGGCAAGGTCTCTTCTATTTAATCTTAAAGATAGA
AACAACCCTGAGTTAAGGGCACGTGTTGTCTCAGGTGAAATCACCCCTGAGCGTCTCTGTTGCATGACTGCAGAGCAATTAGCATCCAAGGAATTGTCACAATGGAGGATTGCAAAAGCAGAGGAGCTTGCTTATATGATAGTTCTACCTGACTCAGATGTTGACTATAGAAGGCTAGTTAAGAAAACACACAAAGGAGA
ATTTCAAGTGGAAGTTGAAGAGGATGATGTAGCTCCAGAAGTAGCTGCTGGTGGAGGACGCCAACTCCAAGTTAACGAGGACCCTACTCAAATCAATGAAATCCCAAATGTGGATGAATTTGCTGGTGCAGTTGACAGTCTTGACCATAATGAAATTGCCAGTGGTGCAGATTCCCCTGGTGCTTTTCCACCATGTACAT
CATCTGGTCAAGTAGTTGAGgtaaatgcatcagacatgagtgcagctgaaattgttattgaagaggtaatgagggaacaaaaggaacttcctgaaataatgtctcttgatgaatatatagGTTCAAGGGGAGATCAATCTAATGAAGATGCAGAAGTTGTTAATACAATTCAGAATGGAGAATCTACAGAATGGGCAAAC
ACCCTTCAAGGTAATTTGGAGGAAGGCAAAGCTGGTTTATTAGATGATCTTTCCGTCTCCCGGAAGAGAATGTTCAATGGAGAAGGGAAAAGTGAAAGCCTTAGAAGGAAAATGAAATATTCTGATGGCCTGAATGATTGGAAATCAGGAAGTGCAGCTCAATCGTCATCTTATGAAACACTTTGGGAGGGAACTGTACA
ATTAAATCCCTTTGTCGTTGAAACAGTTTTTGCTGTTTTCAAAAGTGGTGAGAAAACCTCAGCAAAAGATTGGTCCAATTATGTTGAAGTTAAGGGAAGAGTACGGCTAGATGCATTTGAAAAGTTTCTTCAGGAGTTACCTCTTTCTCGAAGCCGTACAGTCATGGTTTGCATCACGGAGAGATTGCTATCGAACAATG
TAGTTGTGATGCTTTATTGCGAACCAACTGCATATACAAATGCAACTGCAGCATTACTACCAATTTTCGGATTGTTCTGATAAAAGCCGTGTTTCTTGATGTCAATGTAGTGAATTCTTTTTTCAGCGTTGGAGAAACTAAATAGAAAAGGAGTGCCATGACTTTATAATGTAAAAGAATGGCCGATGAACTGAGAATTT
GTCAGTATTACAAATGCAATATTCGGCATACAACTTGGATTCATGGTTGTGACTTGTAATCGGCTTTATGAGGATCACTGAAAAATAAAAAATATGGTTGACACTCGTTATTTGAAAAGACAAATATGAACAAAGAGGCATGTTAATGAAATTACGGCATTTTCTGTGTCATCATATATTCTTTGCTTAAGATTTTCAAA
ACGGGAA