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Intron 1 GTGGGTAAAT ... GTCCCAGCAG

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A102084021



>TRINITY_DN120203_c5_g1_i9 from sample A2 / Example spliced isoform
GGGAGGTTAGGTTCGAGTTGCCGCTGTAGGCGTGGCTTCATTTCTTTGTAAAGAAATCAATTCCCGTAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTGCCATTCACAGGCTGAAAAATCGAAAGAAAAATAAAATATTTTTTCCTGTAACCTCAGATCGAAACCCTAGGGATTCTTCACGCACCCTCTCTGGTTATGGCGAGGCCTCC
GGTGATGCCCCTGGTGCAGCCTACCTGAAACATTGTTTGCATTTGCAGTAGCATTCATCTCCGATTGATATTTTTCTGACCCAGGGTACAAAGCCAGGGGTTCGAACTGTTGACCTCTGTGTACCGAAGGGCTTCCGGACCTGCGTTGCGAAGAGCGAGGGCGAAAAGCTGCGGGAGGGCACGCGATTCACTTTCGGAAG
GGCGTAACAGGTACATATCTGTCTTTCTCGCTGAAACTTTAGTCAAGGAAAACGGGGGTAATAACGAGAAAGATTCATAGGGTTTGCCTGCAGTGGAGTGATTTTGCATGGTTTAGGATCCATCCTTTTGTCGGGGTAATGGTGTTGTATAAACGAGGTTACAGTGCCGTGTTCGTGGACTAGCCATTGGGGTTGGTTTC
ATGAAACCCTGGCCTAGTTAATGAGGCGGTCGTTTTGTTCCTTTTACAATAGGGCACAATGGTTTCGTAATTTTCGTCCTCGAGATTCTCTGTCAAGTGGCGGAAGATGATGATGGGTCGTGGAGCCGATGGTGGTTGTGTTGCCGAGGGGATCCAGAAGCTGGAAATCGACATATATTCACAGGCCCTCAAGGCATTGG
CATTGAATCATCCCTTCGATTTGGATGATGGCGTTGGTGCTGGCTCGGACGCTGCGGGGCCTTCGAACCCTTTAGCAAGGTATTCAGGAGCAGGCGATGGCAGGCGCAAGCACAAGAAGATTCAAGGAAGAGCACAGGACGGGGGGCTTTCTGCTGCTAAAGTTGGCAGTTCGACGAAAAGCAGGGATGGCAAATACTCT
AAACTCTGGGTGGAAGTGGAGGAGTACTTTCGGAGTGTTACAGCCGAGGATGTGATGGCTTTGGCTTCTGCCGCTAAAATTGATATTTTCAATTTTGCAGAAGTTTCCGATCCTTGCTTGTTAATTCCACCTCGTGGCATTTATGGCAGTGGGACTCAACAAGATAGTACTTTTGTTAAACAAAACTTGAGTTGTTCTAC
TAATCTCCAAGTGATGGACAAGAACGAAACTAAACATTGCGGTGCAGATGTTAAGGAAGACAGGAAACATCCTGCATCAGGCCAGGCCGTTGATGGATGTGTGAAGAAATATATCGAAGAAGGGGGGGACTGTGTCGGAGCAGATGGCGACAGAGCAGTGTCAGTGTCGGCATCTTCTAAGCAAGGAACAAACTCCGAGT
TAATTATTCCCATGGTAGGAATTTGCCAGAATGTTTCAACTTCAGTACTACCTAACCGGGAATCGGTGACTGGTCCTTACCTAACAGAGATATGGTCTATGAAGCCGGAATTGAACTCAGGCACTCCTAATCTGGGAATGAACTCTGACACAAATATGGCCGGAGTTTCTGTTCCTGCACACGAATTAAGCTCCTGCGCA
GAACTTGAAGGAGCAGTAGATTCTAACTGGGAGGCAATCTCCAGGCCAGAGCTTCTTCCAGTAGTATCATCTGAGCTTGGGTCGTGTTCTGGGGAAAAACCTGCAGCAGGAGCATTGTACCTTATGCAGGAACCCAGCTTTGGGATGAGATCTGTAACGGTAAGATCTAATCAACAGGAATCAAGTTCTATTGCAAAAAT
CTCCCTTGCATCATCTACCAAGCAGGAGCCAGGTTTTGGTGTAAAAAGGAAGCTCCTTGCTGCAAGTTTTCGATCTAAGAAGAGAAAGCTTTCAGACTCCACTGCTGAAGTCATAACTACAGTCATATCATGCCCAGAAAATGGCGGAAAAGAGCTGTGTCATGTGTGTTATGGTTCTGATAGTGAAAATTGGAATCAAA
TCCTTTTTTGTGATATATGTAATGTTCTGGTTCACCAGGAATGCTATGGTGTGCAGAAAATACCAGATGATAAATGGCTGTGCTCCTGGTGCTCATACAGGTCTCGATCAGAAGGTAAAATCTCTGGTAGAGCTGGAAATGACTCTGTAAATCATAAGCAAAGCAACAGTAAAGTGGGTGATGATGCACGGCCTTGTATA
TTGTGCCCAATAAATGGTGGTGCTTTGAAGCCAGTGGCAAGGGCAGGTTCAGAAATGGAAAATAGTGGATGCTTACAGTTTGCACATTTATTCTGTTTTCCGTGGTTTCCTGAGACACATATAGAAAACACAGAGACCATGGAACCAATAAAAAATATCGAAGGGATAAAAGAAGAGCGATGGAAATTAATATGTTCCTT
GTGCAAGGAGAAGCATGGAGCTTGCATTCAATGTAGCTACGGAATGTGTGCAACTGCGTTCCATCCCCTTTGTGCAAGGGACTCGAAACTCTGGATGGGGATATCGAGCAAGGAGGGAAGTGATGATGTTGGTCTGTGGGCCTTTTGCTCAAAGCATTCGTTGACTCGAGTTCGTAGAGCATCCTTGTTAACTTATGGTA
CAGTTGATGGTCTGTCTGAAGCAGAAGGAATGCCTTCTGGAGAAATTGTTCTCTCTCATACCCCAGATGAAGTTCCTTTGGAGCAGGAAAATGAGTCTTGTCGAACACCACGTGCAGGTCAGCCTACATGCATAGAAATCTCTTCAAAAGAGATTACAAATCAAACAATGCCAGATCAAGGAGATTTGTTGGAAAATTGC
AAAGGAGTAATCCCAGATCATGGAGATTTGTTGGGAAACTGTGAAGGGATCAAATTTAAGTTTTCTGAAGTGGATAATGCATTCCATTCCTGTTGCTCAGGTGTAGGGTTGTTATCTGGTAAGTCAGAGAAGATGCCTTGTGGGGATAGGCAGCACTTTAAAACAGGTGATTTGGAGGGTGTTAGCTCAGCTGTTGAATG
TTCTGCAATCCTTGAAATGGGTAACTCAGAGGATAGTGCATCTCTCCCGTCATCGAAAAGCAAACAAAATACTTTGGCTGTAGGAGTTGACGACGGCTTTGATTGCATTGAAAATTTTAGAAAGGCTGTTGATAAAAGACAGTTCATTCTGACAGATGTAGCAAATCAGATGGGCGTGTCATCAAATTTGCTAACATCTT
TGATTAAGGGAGATAAACACAGCATCCCTATCGATCTACAGAGAAATATTAATGGTTGGTTGTGCAGCCTCTTATCAAGTCAGAATAATACCTATCATCCTGCAACAGAACAGGACAACTTTTTCAGTGCAAAAGCATATCACCAGGATGATTTGGCCAGAGATTATGTTCATGCTGGAAGGCCCAGCAAAAGAACAAAA
AACAAGAAAAAGCTTCTAAAGACGGCAGGCTGTAGTAAAAGAGAGTGTATGCCATCTGAAACAGAATCTTCTGTTCATGGTGACAGGGCTGAAAATGATGTAGGGATGGGCGAAAAATGTTATCGTCACATCGAATGTTGTTATAATGAGGTACATCTAGGTTTACAGAATGTTAAAGGCAGTGATCAAAACAAATCTTT
CATGAAAGTTGATGATGCAGAGAGCACAGATGAGTATAAAGCAAGGCAAAGACATAACAATTGCAATTTAATATTGAAGGACTTTCATGAGGAGAGGCAACAGCAAGAAATGCAACAACTGGCAGTTCCTTTAGCAACAGAATCAAAGCATAATTTAGCAGGCTTTCCGACTGAAACTGAAGATGTTCCAGCCGGAATTG
GTGACTCTGCTGTTGAAAAGCACAGTAATTCAAAGCATGCTTCCTTCAAAATACAGGCTATGAAGGTGTCTGATTGTATGGAGCTTGCACAGTTCGGGAATACTGAAGCAGATTGTAGCAATGCTTCTTTGAAGGGATGCTCAATTAAGGAAGAGCTGGACGTGTTAATGGAAAGAGATATTGCTGGTTCAAGTTTGGTA
GGAGATCAAGCAAAAAATTGTAACAATAGGATACCAGAAGAGTCTAGTATGAAATGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATATAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAGGGGGGTTTGGTCCTTCCAAAAGGAGACCAAAGAACCTACTATAGTGATCATCCAGAAGGAGATGAAGTAACCAATGA
AAATTGCTTTCATGGAATGCTAGATACCAAGGAAAAAACGGATGCTTCTTTTATCTCGCCCAATATTGAAATGATCTCAAAAGATTCTCAATGGAAGCAGCTCTCTGAGGCAAGGGATACAGGGGTTTTGAATATGGCACCAGAAGATGAATTAGAAGGAGAAATTCTATTCTTGCAAAACAACCTGCTTGAAAATGCAA
GGGCAAATCGCTCCCGTTCTGGTTTGACCCTTGATATGCTTTTCTTTGTATATCAGTGAATTTTAAATTTATTATCTATTGCCCTATCTATTTTGGTAATGATATTAACTTGAATATCTTTGCAGAGAATTTAATTCTTAGGGTGATAATGAATTTGTCTGAAGAAAAGCAAGCATTGTGGAAGCAAAGATGTGATGCAT
TTCTAGTAAACGATAACCTAAATCAGGCAAGAGAAGCTAAGAAGCAGGGTAGAAAAGAGAGGAGGCATAAGGAGGCACAGGCTATCTTGGCTGCAGCTACTGCAGCAGCTGCAGCTTCTCCTAGGATTAGTTCTTCCAGGAAGGATGGAATTGGAGATGCAGTTGAAGAGCACAGTCTACGCCAAGTTAGCTTTCCTAGC
AAGCGTTCACATCCAGATGAATGGAATAATGTGAAACCTGCTTTTTCTGGCATATTTTCTACATCACAGCCAATGAAAGTATCACTGCAGAAACATCTAAAAGGTAACATTTTAGCTGGACGTCCAAGCTCTTCTTCTCACACAATGTTGCGGGCTAAAGAGACATTGTCCAGGCCCCTTGTTGCAAAAGTTCCATCAGA
AAGGCATTTTGATGCTTATCCGGTGCCATCCAGCTCACCAAAAGAAGAATCTCTTTTGTGTGATATTTGTAGACTGCATGAATCTACTCGCTCAAACAAGATTTATGTTTGTCGTCACTGCAGGGTAGCAGTTCACCAAGATTGCTATGGAATTTCAAGGAATAATTTTGGAGGATGGTATTGTCAGCCATGTGAAGCAT
TACATTGGCAATACCAAGGCATGAGGCTTCCAACTATAGTTAGCCATGGCAGGCATGGCTGTGGTGTTGAGTGTGCTTTATGTGGTGGTTTGAGTGGTGCTTTTAAGAGGACTACTGATGACCAGTGGGTTCATGCATTTTGTGCTGAGTGGATGTTGGAGAATACTTTCAGGCGGGGTCAATTGGAACTTGTTGAAGGG
CTGGAAATACTTTCCAGAGAAAGATATATGTTGCCATGCAGTATTTGTCATCGGCAAGGTGCCTGTTTGAAGTGCAATTTTGGCCACTGCCAAAGTTCTTTTCATCCCTTATGTGCTAGAGACTCTGGGTTTTATATGAGTGTGAGTACTCATGGTGGCAGGGTTCAACATAAAGCATATTGTGAAAAACATAGCCCAGA
GCAAAAGCTAAAGGCTGAAGCACGTCGATGTGGAGGAACTGAGGAGCTGAAGATAATAAAACAAATGCGGGTTGAGCTAGAGCGGCTCCGTCTGATATGTGAGCGCATTGTTAGAAGGGAAAAACTGAAGCGTGAGCTACTTCACTGCTCACATAATATGCTTGCCTCTAAAAGGGATTGTGTTGCTTTCTCTGCGGTTT
TCCATAGTTCTTTCCTGCCTCCAGATGTCAACTCCCATGTCGAGTTAGCCCCTGGTTCTGCTATTACTTTTGTACGTGGAAATGCTAATGAGTATAGAGGTCGAAAAGTTTATGGCGCAGAAAAACATGAGCGGTTAGTTGAATATGCTGTAGAGAGCACTGCATCAGGTCAGCTCAGAGACATTTTACCCAGCCAATCA
GAGGCAAGCCATCTGACATCTACCATGGATGATATTTTACATGGACGGTTTAATGTAGACAGTTCTGCAGTTGTGGGTGAGTCTGGACGTGCCAGGAAACCACTTGCATATTCGGCTAATTCTGGTGATGCTGATGATGGAGATGATGCACACAAAAGGCCCAGGAAGTCCAGGAAGCATGCCGAAACCCTTCAAAGAGA
AGTGGTGATGACACCAACAGAGGCCTCCATGCAAAATCAACGGTTACCAAAGGGATATGCATATGTCCCTGTTGTCTACCTCGCAAAAGGGAAGACGACCCATCAGGATGTCGGTCCACAAGATACCTGAGCTTTATCTAGGCCTTCATTGTATTATGATTACACTGAGATTCAGTTTCCCAGTCTCCTGAATCACTTTG
CCTGATTGTAATTTGTTTTGTCGACTCAATTTTTCATGTTAATGGTCGGCGCATTCATGGGTGTACAATTATAAGGATTGATGTATTACCATGCAGTGGATGAAAAAAATAAAGCAGTCCATCTCTCCTATTAGAGATGCTTTTGGGGTTAAGGAAGTTTTGACAAGGAAAGGAGTTGTATCTATATTGTGGACAAAAGT
TGTACAAATGATGAGTCTTTCCATCATTGTAATTAATACGCTAGGCTTTTGTCTGCCTAGTGGAAGTGCAGTGAGTAACCTGCATCTTCCATTATTGTAATTTTAACAGAATCAAATTAACAAGAATTACCGATGTATCAGTTCGTGTAAATCTGAGGAGTTGACAATTCTCTCATGATATTCCTCCATTTGCTGAGATG
CACATCGACAATAACTTTTCTGTGACATTCTCCAATAAGCTTCAATCAGTTGTTTTTCAGGCATATTGAACATTGTCACTAATATTCTGGAGACATTTCCATTTTCGTTTGAATACAAGAAATACCTTCAGAGAAAAACGGAAGTTGTTTCCAGGTCTCTAACAGAGATCTTCTCTGTAAATGATAGTTAAATCCACTGG
GCTGAAAGGCTAAGCGTCCTCCAAGCCAAACCAGACTGAATTTGCAGCTAGCACATATACGTGGTCTCTAATCTCCCCAGCATATGACTGATTTGGCAACCTATCCTCTAAACATCAAGCCTAAGTGACACAAACTTCAATTCCAGTATCAAAGGGTGATACCAGACAATTCAGTAAAGATTCAGGTAAAATGGGAGGTG
GAAAATGAAGAGAGATGAAGGCATTTGTCTGTAGATTAATATTCTCAAGAGAATCAGGTCATTGGTTACTCGATATATATTTGTACCAATGCAAAAGTATGTCCTTCCTTTCTCGATTAATTCCTAATGATCACACGTCAAATGATCCACTGCAATTTGTGGGGGAAACATCCTGACTACACATATTCACATCAAAGAGG
AACTAGAATTTTCAAAGAGGAAACACGTTAGCTGTAAAATTGTATACTGACTGGAAATTGTTGAAGTATAATGCACAGGTATTGACGTGTGTATAATAAACCGAGCTTAGCTTTGGCATGCTGAATTTAGAGTAGTTTTTTCCAAGTTGGCGTTTGCGATGAATATACACAGTGCGTTAAACTTGATTTATCAGTGTCTA
TATTCTAGTGGTGGGGGAAGTTGATTAACATGCAAAGCTCATGAAGGGAACATGGAATGCATGGACCATGCAATAGTCACAAAGGGGCCGGTTGTCTTCAATTCTGACTTTTAAAGAGGCTTCATTTTCTGTTGAGAATAATTTTCCATGTGGCATAGGTTTACAAAATGAAATACTATAGCCGCAAGTTTATCTTCACT
AAAATTGTGTCTATCGATCCCAAATATTTAC


>TRINITY_DN120203_c5_g1_i5 from sample A2 / Example unspliced isoform:
AAAGGCCCAGGAAGTCCAGGAAGgtgggtaaatatcattatctttgtcattttttgtagttgattttttggccagtacgctcatatttgttttatgtcccagcagCATGCCGAAACCCTTCAAAGAGAAGTGGTGATGACACCAACAGAGGCCTCCATGCAAAATCAACGGTTACCAAAGGGATATGCATATGTCCCTGT
TGTCTACCTCGCAAAAGGGAAGACGACCCATCAGGATGTCGGTCCACAAGATACCTGAGCTTTATCTAGGCCTTCATTGTATTATGATTACACTGAGATTCAGTTTCCCAGTCTCCTGAATCACTTTGCCTGATTGTAATTTGTTTTGTCGACTCAATTTTTCATGTTAATGGTCGGCGCATTCATGGGTGTACAATTAT
AAGGATTGATGTATTACCATGCAGTGGATGAAAAAAATAAAGCAGTCCATCTCTCCTATTAGAGATGCTTTTGGGGTTAAGGAAGTTTTGACAAGGAAAGGAGTTGTATCTATATTGTGGACAAAAGTTGTACAAATGATGAGTCTTTCCATCATTGTAATTAATACGCTAGGCTTTTGTCTGCCTAGTGGAAGTGCAGT
GAGTAACCTGCATCTTCCATTATTGTAATTTTAACAGAATCAAATTAACAAGAATTACCGATGTATCAGTTCGTGTAAATCTGAGGAGTTGACAATTCTCTCATGATATTCCTCCATTTGCTGAGATGCACATCGACAATAACTTTTCTGTGACATTCTCCAATAAGCTTCAATCAGTTGTTTTTCAGGCATATTGAACA
TTGTCACTAATATTCTGGAGACATTTCCATTTTCGTTTGAATACAAGAAATACCTTCAGAGAAAAACGGAAGTTGTTTCCAGGTCTCTAACAGAGATCTTCTCTGTAAATGATAGTTAAATCCACTGGGCTGAAAGGCTAAGCGTCCTCCAAGCCAAACCAGACTGAATTTGCAGCTAGCACATATACGTGGTCTCTAAT
CTCCCCAGCATATGACTGATTTGGCAACCTATCCTCTAAACATCAAGCCTAAGTGACACAAACTTCAATTCCAGTATCAAAGGGTGATACCAGACAATTCAGTAAAGATTCAGGTAAAATGGGAGGTGGAAAATGAAGAGAGATGAAGGCATTTGTCTGTAGATTAATATTCTCAAGAGAATCAGGTCATTGGTTACTCG
ATATATATTTGTACCAATGCAAAAGTATGTCCTTCCTTTCTCGATTAATTCCTAATGATCACACGTCAAATGATCCACTGCAATTTGTGGGGGAAACATCCTGACTACACATATTCACATCAAAGAGGAACTAGAATTTTCAAAGAGGAAACACGTTAGCTGTAAAATTGTATACTGACTGGAAATTGTTGAAGTATAAT
GCACAGGTATTGACGTGTGTATAATAAACCGAGCTTAGCTTTGGCATGCTGAATTTAGAGTAGTTTTTTCCAAGTTGGCGTTTGCGATGAATATACACAGTGCGTTAAACTTGATTTATCAGTGTCTATATTCTAGTGGTGGGGGAAGTTGATTAACATGCAAAGCTCATGAAGGGAACATGGAATGCATGGACCATGCA
ATAGTCACAAAGGGGCCGGTTGTCTTCAATTCTGACTTTTAAAGAGGCTTCATTTTCTGTTGAGAATAATTTTCCATGTGGCATAGGTTTACAAAATGAAATACTATAGCCGCAAGTTTATCTTCACTAAAATTGTGTCTATCGATCCCAAATATTTAC




Intron 2 GTTTGACCCT ... ATCTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN107045_c1_g1_i10 from sample A4 / Example spliced isoform
ATGAATGGAATAATGTGAAACCTACTTTTTCTAGCATATTAACTTCAAGCACAAAGGAAGAGCTTTGGATATGGAAAACGCACTCCAAAGAGTCAGTGTGCATCATTGGAGGATTTACTTGACCATTTCCTGGGCGCATTTACATCCCATTCCTAGAAGCCATCATGATGGCATTGATTCTGGAAGTTATGACACCAGAG
GAGTTACAAGGTCAGGACCTTGTCATTGCAAATGTTGGAGACTCTCGGGCTATTCTGGGAACAATGTCTGCTAATGGATGTTTGTCAGCCATTCAGTTGACAGTTGACTTGAAGCCAACCTTACCTAATTGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAGTG
GGGTTTGGTCCTTTCAAAAGGAGACCAAAGAACCTACTATAGTGATCATCCAGAAGGAGATGAAGTAACCAATGAAAATTGCTTTCATGGAATGCTAGATACCAAGGAAAAAACGGATGCTTCTTTTATCTCGCCCAATATTGAAATGATCTCAAAAGATTCTCAATGGAAGCAGCTCTCTGAGGCAAGCGATACAGAGG
TTTTGAATATGGCACCAGAAGATGAATTAGAAGGAGAAATTCTATTCTTGCAAAACAACCTGCTTGAAAATGCAAGGGCAAATCGCTCCCGTTCTGAGAATTTAATTCTTAGGGTGATAATGAATTTGTCTGAAGAACTTTTTCTAGCATATTAACTTCAAGCACAAAGGAAGAGCTTTGGATATGGAAAACGCACTCCA
AAGG


>TRINITY_DN107045_c1_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TGCGTATTGAACAGAGCCAAGTAAGTCAACCCAGGTGCCGGGATTGCTTCTTTCTTGGACTGTACTTCAACTACAACAGGAAATACTTCATAACCAGCATGATTCATTGCAAGTAGGGGTCGAGTTATTCCAGCAGGAGTCATTGCAAGAAGGGGTCGAGTTATTCCATATGAAAGGCGCAAGGGCCTGGCCAACTATGT
CTCTGTCCTAGGGAGTCGTGTTGAAGCTTGTGGCAAGGGAACAATACCTGTGGGCCGATATAGAGCAGATTCGCCATCGTATTCTCTAGTTAGTGGATTGTTATGGTAGTTAAGAAGTCGACTAGTGGTGGGCAAGTTCAAACTATATGCTACAGGAAGTGTGCATCCCCTTAGGGTCATGGTTACTCTTTGAAGTGTGG
CAGGAAGAGATGTGTTGTAAAGGAAAGGCCGTGTACCCTGTTTCCAAACATTCTCTCTATTGCTAGGCATTTACACTGAGAATCAAGGGTGTGAATATAATCGTGGGTACCTTTTGAAAACCCCAAACTGACTGTAACTTGTCGTTGGGTATTAATAATTCAGCTAGAGTATTATTGTCATTTGTGGAGAGATAAATACA
CTGAACTAAGGTCCATTTTGCTATTGCTGGTGGAGAGAAACATGTGTTCAACAAGTAATCTCTTGTCTTGGTGCTACTATTCTTGGTGTTGGTCATCGAAATACTTCTCCTCATTTACTGTGTGGCTGTTGGAGTGAACGTGGAACTGTTCTGAGGTGATTTCCTTGTGTGTTGGCCCGTGTAATCATGAATTAAGCAGC
TTATACCTCTCTGAGCAGCACCTTAAGGATTCCAGACAAGACTACCAGGAGTCAGTGTGCATCATTGGAGGATTTACTTGACCATTTCCTGGGCGCATTTACATCCCATTCCTAGAAGCCATCATGATGGCATTGATTCTGGAAGTTATGACACCAGAGGAGTTACAAGGTCAGGACCTTGTCATTGCAAATGTTGGAGA
CTCTCGGGCTATTCTGGGAACAATGTCTGCTAATGGATGTTTGTCAGCCATTCAGTTGACAGTTGACTTGAAGCCAACCTTACCTAATTGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAGTGGGGTTTGGTCCTTTCAAAAGGAGACCAAAGAACCTACTATA
GTGATCATCCAGAAGGAGATGAAGTAACCAATGAAAATTGCTTTCATGGAATGCTAGATACCAAGGAAAAAACGGATGCTTCTTTTATCTCGCCCAATATTGAAATGATCTCAAAAGATTCTCAATGGAAGCAGCTCTCTGAGGCAAGCGATACAGAGGTTTTGAATATGGCACCAGAAGATGAATTAGAAGGAGAAATT
CTATTCTTGCAAAACAACCTGCTTGAAAATGCAAGGGCAAATCGCTCCCGTTCTGgtttgacccttgatatgcttttctttgtatatcagtgaattttaaatttattatctattgccctatctattttggtaatgatattaacttgaatatctttgcagAGAATTTAATTCTTAGGGTGATAATGAATTTGTCTGAAGA




Intron 3 GCATGTGAAT ... AAATTACCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN48378_c0_g2_i5 from sample A7 / Example spliced isoform
TGCGTCAATGTAAAAAATACACTACTTAGCAGATCAAGACAAGGGAAAACTAAAATTTTAATTTATGGCAATATTCTGAAAGGGCTTGAATTTTGGGACTTTCCCCAATAGACAACTTCCCAAAGGCGACCTACAGCAACGACGGTTGTGAGGTGACCATTGATATGGGAGAAGCAGGGAAGAAGAGGAGGAAGGAAGCA
GATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAAGGAAGCAGATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAATATTGTTTCAACCCACTCGAGTTCGAATCCCATTAGTGGTTTCTTGATGAAGCGTTGTTGGCCAATGTGTTTCTCAAGGGTTTGGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGAGAACAGAGGAGA
AATACTCATTTTGCTTAGCAGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGGGAACATAGGAGAAATACCCATTTTGCTTAGCAGACGATCTTCTAGATTTGGGTCTGATGGGAAGCCAGTTCTTCGCCAGGAATCTATCAACAGAGATTGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATT
CTGCAGATCCAAAAGTGGGGTTTGGTCCTTTCAAAAGGAGACCAAAGAACCTACTATAGTGATCATCCAGAAGGAGATGAAGTAACCAATGAAAATTGCTTTCATGGAATGCTAGATACCAAGGAAAAAACGGATGCTTCTTTTATCTCGCCCAATATTGAAATGATCTCAAAAGATTCTCAATGGAAGCAGCTCTCTGA
GGCAAGCGATACAGAGGTTTTGAATATGGCACCAGAAGATGAATTAGAAGGAGAAATTCTATTCTTGCAAAACAACCTGCTTGAAAATGCAAGGGCAAATCGCTCCCGTTCTGAGAATTTAATTCTCAGGGTGATAATGAATTTGTCTGAAGAGCAGCAAGCATTGTGGAAGCAAAGATGTGATGCATTTCTAGTAAACG
ATTACCTAAATCAGGCAAGAGAAGCTAAGAAGCAGGGTAGAAAAGAGAGGAGGCATAAGCAGGCACAGGCTATCTTGGCTGCAGCTACTGCAGCAGCTGCAGCTTCTCCTAGGACTAGTTCTTCCAAGAAGGATGGAATTGGAGATGCAGTTGAAGAGCACAGTCTACGCCAAGTTAGCTTTCCTAGCAAGCGTTCACAT
CCAGATGAATGGAATAATGTGAAACCTGCTTTTTCTGGCATATTTTCTACATCACAGCCAATGAAAGTATCACTGCAGAAACATCTAAAAGGTAACATTTTAGCTGGACGTCCAAGCTCTTCTTCTCACACAATGTTGCGGGCTAAAGAGACATTGTCCAGGCCCCTTGTTGCAAAAGTTCCATCAGAAAGGCATTTTGA
TGCTTATCCGGTGCCATCCAGCTCACCAAAAGAAGAATCTCTTTTGTGTGATATTTGTAGACTGCATGAATCTACTCGCTCAAACAAGATTTATGTTTGTCGTCACTGCAGGGTAGCAGTTCACCAAGATTGCTATGGAATTTCAAGGAATAATTTTGGAGGATGGTATTGTCAGCCATGTGAAGCATTACATTGGCAAT
ACCAAGGCATGAGGCTTCCAACTATAGTTAGCCATGGCAGGCATGGCTGTGGTGTTGAGTGTGCTTTATGTGGTGGTTTGAGTGGTGCTTTTAAGAGGACTACTGATGACCAGTGGGTTCATGCATTTTGTGCTGAGTGGATGTTGGAGAATACTTTCAGGCGGGGTCAATTGGAACTTGTTGAAGGGCTGGAAATACTT
TCCAGAGAAAGATATATGTTGCCATGCAGTATTTGTCATCGGCAAGGTGCCTGTTTGAAGTGCAATTTTGGCCACTGCCAAAGTTCTTTTCATCCCTTATGTGCTAGAGACTCTGGGTTTTATATGAGTGTGAGTACTCATGGTGGCAGGGTTCAACATAAAGCATATTGTGAAAAACATAGCCCAGAGCAAAAGCTAAA
GGCTGAAGCACGTCGATGTGGAGGAACTGAGGAGCTGAAGATAATAAAACAAATGCGGGTTGAGCTAGAGCGGCTCCGTCTGATATGTGAGCGCATTGTTAGAAGGGAAAAACTGAAGCGTGAGCTACTTCACTGCTCACATAATATGCTTGCCTCTAAAAGGGATTGTGTTGCTTTCTCTGCGGTTTTCCATAGTTCTT
TCCTGCCTCCAGATGTCAACTCCCATGTCGAGTTAGCCCCTGGTTCTGCTATTACTTTTGTACGTGGAAATGCTAATGAGTATAGAGGTCGAAAAGTTTATGGCGCAGAAAAACATGAGCGGTTAGTTGAATATGCTGTAGAGAGCACTGCATCAGGTCAGCTCAGAGACATTTTACCCAGCCAATCAGAGGCAAGCCAT
CTGACATCTACCATGGATGATATTTTACATGGACGGTTTAATGTAGACAGTTCTGCAGTTGTGGGTGAGTCTGGACGTGCCAGGAAACCACTTGCATATTCGGCTAATTCTGGTGATGCTGATGATGGAGATGATGCACACAAAAGGCCCAGGAAGTCCAGGAAGCATGCCGAAACCCTTCAAAGAGAAGTGGTGATGAC
ACCAACAGAGGCCTCCATGCAAAATCAACGGTTACCAAAGGGATATGCATATGTCCCTGTTGTCTACCTCGCAAAAGGGAAGACGACCCATCAGGATGTCGGTCCACAAGATACCTGAGCTTTATCTAGGCCTTCATTGTATTATGATTACACTGAGATTCAGTTTCCCAGTCTCCTGAATCACTTTGCCTGATTGTAAT
TTGTTTTGTCGACTCAATTTTTCATGTTAATGGTCGGCGCATTCATGGGTGTACAATTATAAGGATTGATGTATTACCATGCAGTGGATGAAAAAAATAAAGCAGTCCATCTCTCCTATTAGAGATGCTTTTGGGGTTAAGGAAGTTTTGACAAGGAAAGGAGTTGTATCTATATTGTGGACAAAAGTTGTACAAATGAT
GAGTCTTTCCATCATTGTAATTAATACGCTAGGCTTTTGTCTGCCTAGTGGAAGTGCAGTGAGTAACCTGCATCTTCCATTATTGTAATTTTAACAGAATCAAATTAACAAGAATTACCGATGTATCAGTTCGTGTAAATCTGAGGAGTTGACAATTCTCTCATGATATTCCTCCATTTGCTGAGATGCACATCGACAAT
AACTTTTCTGTGACATTCTCCAATAAGCTTCAATCAGTTGTTTTTCAGGCATATTGAACATTGTCACTAATATTCTGGAGACATTTCCATTTTCGTTTGAATACAAGAAATACCTTCAGAGAAAAACGGAAGTTGTTTCCAGGTCTCTAACAGAGATCTTCTCTGTAAATGATAGTTAAATCCACTGGGCTGAAAGGCTA
AGCGTCCTCCAAGCCAAACCAGACTGAATTTGCAGCTAGCACATATACGTGGTCTCTAATCTCCCCAGCATATGACTGATTTGGCAACCTATCCTCTAAACATCAAGCCTAAGTGACACAAACTTCAATTCCAGTATCAAAGGGTGATACCAGACAATTCAGTAAAGATTCAGGTAAAATGGGAGGTGGAAAATGAAGAG
AGATGAAGGCATTTGTCTGTAGATTAATATTCTCAAGAGAATCAGGTCATTGGTTACTCGATATATATTTGTACCAATGCAAAAGTATGTCCTTCCTTTCTCGATTAATTCCTAATGATCACACGTCAAATGATCCACTGCAATTTGTGGGGGAAACATCCTGACTACACATATTCACATCAAAGAGGAACTAGAATTTT
CAAAGAGGAAACACGTTAGCTGTAAAATTGTATACTGACTGGAAATTGTTGAAGTATAATGCACAGGTATTGACGTGTGTATAATAAACCGAGCTTAGCTTTGGCATGCTGAATTTAGAGTAGTTTTTTCCAAGTTGGCGTTTGCGATGAATATACACAGTGCGTTAAACTTGATTTATCAGTGTCTATATTCTAGTGGT
GGGGGAAGTTGATTAACATGCAAAGCTCATGAAGGGAACATGGAATGCATGGACCATGCAATAGTCACAAAGGGGCCGGTTGTCTTCAATTCTGACTTTTAAAGAGGCTTCATTTTCTGTTGAGAATAATTTTCCATGTGGCATAGGTTTACAAAATGAAATACTATAGCCGCAAGTTTATCTTCACTAAAATTGTGTCT
ATCGATCCCAAATATTTACATATGCAATTACAACTATTGTTAATGAAGTAGTGAACCAGTTGACCAACTGATCAATAAATCAGTATTAGTTGTTGATACGGGGAGTTCATGTTCTTCTCTTATTTCCAG


>TRINITY_DN48378_c0_g2_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TGCGTCAATGTAAAAAATACACTACTTAGCAGATCAAGACAAGGGAAAACTAAAATTTTAATTTATGGCAATATTCTGAAAGGGCTTGAATTTTGGGACTTTCCCCAATAGACAACTTCCCAAAGGCGACCTACAGCAACGACGGTTGTGAGGTGACCATTGATATGGGAGAAGCAGGGAAGAAGAGGAGGAAGGAAGCA
GATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAAGGAAGCAGATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAATATTGTTTCAACCCACTCGAGTTCGAATCCCATTAGTGGTTTCTTGATGAAGCGTTGTTGGCCAATGTGTTTCTCAAGGGTTTGGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGAGAACAGAGGAGA
AATACTCATTTTGCTTAGCAGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGGGAACATAGGAGAAATACCCATTTTGCTTAGCAGACGATCTTCTAGATTTGGGTCTGATGGGAAGCCAGTTCTTCGCCAGGAATCTATCAACAGAGgcatgtgaattcaaattcaaatgcatttcatggataacagaaattggtgttttcta
aaatgaattacaaatgtgttttattagatatccatgtatactgtgttatatccactgtatattgtgagctatatctctgcgttcatcccaactcaaattgagttattgaatcgactcttagttactaaggagataaaactagatctagcattaagagcacacaaatgaattgtggtctatttcttttacagaccttgcac
tcaacattattatggttggagaggacagcgattttatgaaattaccag
ATTGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAG




Intron 4 GCATGTGAAT ... TCTTTTACAG

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>TRINITY_DN48378_c0_g2_i8 from sample A7 / Example spliced isoform
TGCGTCAATGTAAAAAATACACTACTTAGCAGATCAAGACAAGGGAAAACTAAAATTTTAATTTATGGCAATATTCTGAAAGGGCTTGAATTTTGGGACTTTCCCCAATAGACAACTTCCCAAAGGCGACCTACAGCAACGACGGTTGTGAGGTGACCATTGATATGGGAGAAGCAGGGAAGAAGAGGAGGAAGGAAGCA
GATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAAGGAAGCAGATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAATATTGTTTCAACCCACTCGAGTTCGAATCCCATTAGTGGTTTCTTGATGAAGCGTTGTTGGCCAATGTGTTTCTCAAGGGTTTGGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGAGAACAGAGGAGA
AATACTCATTTTGCTTAGCAGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGGGAACATAGGAGAAATACCCATTTTGCTTAGCAGACGATCTTCTAGATTTGGGTCTGATGGGAAGCCAGTTCTTCGCCAGGAATCTATCAACAGAGACCTTGCACTCAACATTATTATGGTTGGAGAGGACAGCGATTTTATGAAATTACCA
GATTGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAG


>TRINITY_DN48378_c0_g2_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TGCGTCAATGTAAAAAATACACTACTTAGCAGATCAAGACAAGGGAAAACTAAAATTTTAATTTATGGCAATATTCTGAAAGGGCTTGAATTTTGGGACTTTCCCCAATAGACAACTTCCCAAAGGCGACCTACAGCAACGACGGTTGTGAGGTGACCATTGATATGGGAGAAGCAGGGAAGAAGAGGAGGAAGGAAGCA
GATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAAGGAAGCAGATTAATGTTTAGAGTGGATCTATTCGATCCCAATATTGTTTCAACCCACTCGAGTTCGAATCCCATTAGTGGTTTCTTGATGAAGCGTTGTTGGCCAATGTGTTTCTCAAGGGTTTGGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGAGAACAGAGGAGA
AATACTCATTTTGCTTAGCAGACCCTCCGCCCTAGTTGTCTATCAATGGGAACATAGGAGAAATACCCATTTTGCTTAGCAGACGATCTTCTAGATTTGGGTCTGATGGGAAGCCAGTTCTTCGCCAGGAATCTATCAACAGAGgcatgtgaattcaaattcaaatgcatttcatggataacagaaattggtgttttcta
aaatgaattacaaatgtgttttattagatatccatgtatactgtgttatatccactgtatattgtgagctatatctctgcgttcatcccaactcaaattgagttattgaatcgactcttagttactaaggagataaaactagatctagcattaagagcacacaaatgaattgtggtctatttcttttacag
ACCTTGCAC
TCAACATTATTATGGTTGGAGAGGACAGCGATTTTATGAAATTACCAGATTGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAG




Intron 5 GCTGTTGATA ... TTTGATTAAG

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>TRINITY_DN48378_c0_g2_i7 from sample A7 / Example spliced isoform
GTCGGATTAGACGGAGGAGGGAAGTTAGGTTCGAGTTGCCGCTGTAGGCGTGGCTTCATTTCTTTGTAAAGAAATCAATTCCCGTAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTGCCATTCACAGGCTGAAAAATCGAAAGAAAAATAAAATATTTTTTCCTGTAACCTCAGATCGAAACCCTAGGGATTCTTCACGCACCCTCTCT
GGTTATGGCGAGGCCTCCGGTGATGCCCCTGGTGCAGCCTACCTGAAACATTGTTTGCATTTGCAGTAGCATTCATCTCCGATTGATATTTTTCTGACCCAGGGTACAAAGCCAGGGGTTCGAACTGTTGACCTCTGTGTACCGAAGGGCTTCCGGACCTGCGTTGCGAAGAGCGAGGGCGAAAAGCTGCGGGAGGGCAC
GCGATTCACTTTCGGAAGGGCGTAACAGGTACATATCTGTCTTTCTCGCTGAAACTTTAGTCAAGGAAAACGGGGGTAATAACGAGAAAGATTCATAGGGTTTGCCTGCAGTGGAGTGATTTTGCATGGTTTAGGATCCATCCTTTTGTCGGGGTAATGGTGTTGTATAAACGAGGTTACAGTGCCGTGTTCGTGGACTA
GCCATTGGGGTTGGTTTCATGAAACCCTGGCCTAGTTAATGAGGCGGTCGTTTTGTTCCTTTTACAATAGGGCACAATGGTTTCGTAATTTTCGTCCTCGAGATTCTCTGTCAAGTGGCGGAAGATGATGATGGGTCGTGGAGCCGATGGTGGTTGTGTTGCCGAGGGGATCCAGAAGCTGGAAATCGACATATATTCAC
AGGCCCTCAAGGCATTGGCATTGAATCATCCCTTCGATTTGGATGATGGCGTTGGTGCTGGCTCGGACGCTGCGGGGCCTTCGAACCCTTTAGCAAGGTATTCAGGAGCAGGCGATGGCAGGCGCAAGCACAAGAAGATTCAAGGAAGAGCACAGGACGGGGGGCTTTCTGCTGCTAAAGTTGGCAGTTCGACGAAAAGC
AGGGATGGCAAATACTCTAAACTCTGGGTGGAAGTGGAGGAGTACTTTCGGAGTGTTACAGCCGAGGATGTGATGGCTTTGGCTTCTGCCGCTAAAATTGATATTTTCAATTTTGCAGAAGTTTCCGATCCTTGCTTGTTAATTCCACCTCGTGGCATTTATGGCAGTGGGACTCAACAAGATAGTACTTTTGTTAAACA
AAACTTGAGTTGTTCTACTAATCTCCAAGTGATGGACAAGAACGAAACTAAACATTGCGGTGCAGATGTTAAGGAAGACAGGAAACATCCTGCATCAGGCCAGGCCGTTGATGGATGTGTGAAGAAATATATCGAAGAAGGGGGGGACTGTGTCGGAGCAGATGGCGACAGAGCAGTGTCAGTGTCGGCATCTTCTAAGC
AAGGAACAAACTCCGAGTTAATTATTCCCATGGTAGGAATTTGCCAGAATGTTTCAACTTCAGTACTACCTAACCGGGAATCGGTGACTGGTCCTTACCTAACAGAGATATGGTCTATGAAGCCGGAATTGAACTCAGGCACTCCTAATCTGGGAATGAACTCTGACACAAATATGGCCGGAGTTTCTGTTCCTGCACAC
GAATTAAGCTCCTGCGCAGAACTTGAAGGAGCAGTAGATTCTAACTGGGAGGCAATCTCCAGGCCAGAGCTTCTTCCAGTAGTATCATCTGAGCTTGGGTCGTGTTCTGGGGAAAAACCTGCAGCAGGAGCATTGTACCTTATGCAGGAACCCAGCTTTGGGATGAGATCTGTAACGGTAAGATCTAATCAACAGGAATC
AAGTTCTATTGCAAAAATCTCCCTTGCATCATCTACCAAGCAGGAGCCAGGTTTTGGTGTAAAAAGGAAGCTCCTTGCTGCAAGTTTTCGATCTAAGAAGAGAAAGCTTTCAGACTCCACTGCTGAAGTCATAACTACAGTCATATCATGCCCAGAAAATGGCGGAAAAGAGCTGTGTCATGTGTGTTATGGTTCTGATA
GTGAAAATTGGAATCAAATCCTTTTTTGTGATATATGTAATGTTCTGGTTCACCAGGAATGCTATGGTGTGCAGAAAATACCAGATGATAAATGGCTGTGCTCCTGGTGCTCATACAGGTCTCGATCAGAAGGTAAAATCTCTGGTAGAGCTGGAAATGACTCTGTAAATCATAAGCAAAGCAACAGTAAAGTGGGTGAT
GATGCACGGCCTTGTATATTGTGCCCAATAAATGGTGGTGCTTTGAAGCCAGTGGCAAGGGCAGGTTCAGAAATGGAAAATAGTGGATGCTTACAGTTTGCACATTTATTCTGTTTTCCGTGGTTTCCTGAGACACATATAGAAAACACAGAGACCATGGAACCAATAAAAAATATCGAAGGGATAAAAGAAGAGCGATG
GAAATTAATATGTTCCTTGTGCAAGGAGAAGCATGGAGCTTGCATTCAATGTAGCTACGGAATGTGTGCAACTGCGTTCCATCCCCTTTGTGCAAGGGACTCGAAACTCTGGATGGGGATATCGAGCAAGGAGGGAAGTGATGATGTTGGTCTGTGGGCCTTTTGCTCAAAGCATTCGTTGACTCGAGTTCGTAGAGCAT
CCTTGTTAACTTATGGTACAGTTGATGGTCTGTCTGAAGCAGAAGGAATGCCTTCTGGAGAAATTGTTCTCTCTCATACCCCAGATGAAGTTCCTTTGGAGCAGGAAAATGAGTCTTGTCGAACACCACGTGCAGGTCAGCCTACATGCATAGAAATCTCTTCAAAAGAGATTACAAATCAAACAATGCCAGATCAAGGA
GATTTGTTGGAAAATTGCAAAGGAGTAATCCCAGATCATGGAGATTTGTTGGGAAACTGTGAAGGGATCAAATTTAAGTTTTCTGAAGTGGATAATGCATTCCATTCCTGTTGCTCAGGTGTAGGGTTGTTATCTGGTAAGTCAGAGAAGATGCCTTGTGGGGATAGGCAGCACTTTAAAACAGGTGATTTGGAGGGTGT
TAGCTCAGCTGTTGAATGTTCTGCAATCCTTGAAATGGGTAACTCAGAGGATAGTGCATCTCTCCCGTCATCGAAAAGCAAACAAAATACTTTGGCTGTAGGAGTTGACGACGGCTTTGATTGCATTGAAAATTTTAGAAAGGGAGATAAACACAGCATCCCTATCGATCTACAGAGAAATATTAATGGTTGGTTGTGCA
GCCTCTTATCAAGTCAGAATAATACCTATCATCCTGCAACAGAACAGGACAACTTTTTCAGTGCAAAAGCATATCACCAGGATGATTTGGCCAGAGATTATGTTCATGCTGGAAGGCCCAGCAAAAGAACAAAAAACAAGAAAAAGCTTCTAAAGACGGCAGGCTGTAGTAAAAGAGAGTGTATGCCATCTGAAACAGAA
TCTTCTGTTCATGGTGACAGGGCTGAAAATGATGTAGGGATGGGCGAAAAATGTTATCGTCACATCGAATGTTGTTATAATGAGGTACATCTAGGTTTACAGAATGTTAAAGGCAGTGATCAAAACAAATCTTTCATGAAAGTTGATGATGCAGAGAGCACAGATGAGTATAAAGCAAGGCAAAGACATAACAATTGCAA
TTTAATATTGAAGGACTTTCATGAGGAGAGGCAACAGCAAGAAATGCAACAACTGGCAGTTCCTTTAGCAACAGAATCAAAGCATAATTTAGCAGGCTTTCCGACTGAAACTGAAGATGTTCCAGCCGGAATTGGTGACTCTGCTGTTGAAAAGCACAGTAATTCAAAGCATGCTTCCTTCAAAATACAGGCTATGAAGG
TGTCTGATTGTATGGAGCTTGCACAGTTCGGGAATACTGAAGCAGATTGTAGCAATGCTTCTTTGAAGGGATGCTCAATTAAGGAAGAGCTGGACGTGTTAATGGAAAGAGATATTGCTGGTTCAAGTTTGGTAGGAGATCAAGCAAAAAATTGTAACAATAGGATACCAGAAGAGTCTAGTATGAATTGTGGCAAGGAG
GCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAGGGGGGTTTGGTCCTTCCAAAAGGAGACCAAAGAACCTACTATAGTGATCATCCAGAAGGAGATGAAGTAACCAATGAAAATTGCTTTCATGGAATGCTAGATACCAAGGAAAAAACGGATGCTTCTTTTATCTCGCCCAATAT
TGAAATGATCTCAAAAGATTCTCAATGGAAGCAGCTCTCTGAGGCAAGGGATACAGGGGTTTTGAATATGGCACCAGAAGATGAATTAGAAGGAGAAATTCTATTCTTGCAAAACAACCTGCTTGAAAATGCAAGGGCAAATCGCTCCCGTTCTGAGAATTTAATTCTCAGGGTGATAATGAATTTGTCTGAAGAGCAGC
AAGCATTGTGGAAGCAAAGATGTGATGCATTTCTAGTAAACGATTACCTAAATCAGGCAAGAGAAGCTAAGAAGCAGGGTAGAAAAGAGAGGAGGCATAAGCAGGCACAGGCTATCTTGGCTGCAGCTACTGCAGCAGCTGCAGCTTCTCCTAGGACTAGTTCTTCCAAGAAGGATGGAATTGGAGATGCAGTTGAAGAG
CACAGTCTACGCCAAGTTAGCTTTCCTAGCAAGCGTTCACATCCAGATGAATGGAATAATGTGAAACCTGCTTTTTCTGGCATATTTTCTACATCACAGCCAATGAAAGTATCACTGCAGAAACATCTAAAAGGTAACATTTTAGCTGGACGTCCAAGCTCTTCTTCTCACACAATGTTGCGGGCTAAAGAGACATTGTC
CAGGCCCCTTGTTGCAAAAGTTCCATCAGAAAGGCATTTTGATGCTTATCCGGTGCCATCCAGCTCACCAAAAGAAGAATCTCTTTTGTGTGATATTTGTAGACTGCATGAATCTACTCGCTCAAACAAGATTTATGTTTGTCGTCACTGCAGGGTAGCAGTTCACCAAGATTGCTATGGAATTTCAAGGAATAATTTTG
GAGGATGGTATTGTCAGCCATGTGAAGCATTACATTGGCAATACCAAGGCATGAGGCTTCCAACTATAGTTAGCCATGGCAGGCATGGCTGTGGTGTTGAGTGTGCTTTATGTGGTGGTTTGAGTGGTGCTTTTAAGAGGACTACTGATGACCAGTGGGTTCATGCATTTTGTGCTGAGTGGATGTTGGAGAATACTTTC
AGGCGGGGTCAATTGGAACTTGTTGAAGGGCTGGAAATACTTTCCAGAGAAAGATATATGTTGCCATGCAGTATTTGTCATCGGCAAGGTGCCTGTTTGAAGTGCAATTTTGGCCACTGCCAAAGTTCTTTTCATCCCTTATGTGCTAGAGACTCTGGGTTTTATATGAGTGTGAGTACTCATGGTGGCAGGGTTCAACA
TAAAGCATATTGTGAAAAACATAGCCCAGAGCAAAAGCTAAAGGCTGAAGCACGTCGATGTGGAGGAACTGAGGAGCTGAAGATAATAAAACAAATGCGGGTTGAGCTAGAGCGGCTCCGTCTGATATGTGAGCGCATTGTTAGAAGGGAAAAACTGAAGCGTGAGCTACTTCACTGCTCACATAATATGCTTGCCTCTA
AAAGGGATTGTGTTGCTTTCTCTGCGGTTTTCCATAGTTCTTTCCTGCCTCCAGATGTCAACTCCCATGTCGAGTTAGCCCCTGGTTCTGCTATTACTTTTGTACGTGGAAATGCTAATGAGTATAGAGGTCGAAAAGTTTATGGCGCAGAAAAACATGAGCGGTTAGTTGAATATGCTGTAGAGAGCACTGCATCAGGT
CAGCTCAGAGACATTTTACCCAGCCAATCAGAGGCAAGCCATCTGACATCTACCATGGATGATATTTTACATGGACGGTTTAATGTAGACAGTTCTGCAGTTGTGGGTGAGTCTGGACGTGCCAGGAAACCACTTGCATATTCGGCTAATTCTGGTGATGCTGATGATGGAGATGATGCACACAAAAGGCCCAGGAAGTC
CAGGAAGCATGCCGAAACCCTTCAAAGAGAAGTGGTGATGACACCAACAGAGGCCTCCATGCAAAATCAACGGTTACCAAAGGGATATGCATATGTCCCTGTTGTCTACCTCGCAAAAGGGAAGACGACCCATCAGGATGTCGGTCCACAAGATACCTGAGCTTTATCTAGGCCTTCATTGTATTATGATTACACTGAGA
TTCAGTTTCCCAGTCTCCTGAATCACTTTGCCTGATTGTAATTTGTTTTGTCGACTCAATTTTTCATGTTAATGGTCGGCGCATTCATGGGTGTACAATTATAAGGATTGATGTATTACCATGCAGTGGATGAAAAAAATAAAGCAGTCCATCTCTCCTATTAGAGATGCTTTTGGGGTTAAGGAAGTTTTGACAAGGAA
AGGAGTTGTATCTATATTGTGGACAAAAGTTGTACAAATGATGAGTCTTTCCATCATTGTAATTAATACGCTAGGCTTTTGTCTGCCTAGTGGAAGTGCAGTGAGTAACCTGCATCTTCCATTATTGTAATTTTAACAGAATCAAATTAACAAGAATTACCGATGTATCAGTTCGTGTAAATCTGAGGAGTTGACAATTC
TCTCATGATATTCCTCCATTTGCTGAGATGCACATCGACAATAACTTTTCTGTGACATTCTCCAATAAGCTTCAATCAGTTGTTTTTCAGGCATATTGAACATTGTCACTAATATTCTGGAGACATTTCCATTTTCGTTTGAATACAAGAAATACCTTCAGAGAAAAACGGAAGTTGTTTCCAGGTCTCTAACAGAGATC
TTCTCTGTAAATGATAGTTAAATCCACTGGGCTGAAAGGCTAAGCGTCCTCCAAGCCAAACCAGACTGAATTTGCAGCTAGCACATATACGTGGTCTCTAATCTCCCCAGCATATGACTGATTTGGCAACCTATCCTCTAAACATCAAGCCTAAGTGACACAAACTTCAATTCCAGTATCAAAGGGTGATACCAGACAAT
TCAGTAAAGATTCAGGTAAAATGGGAGGTGGAAAATGAAGAGAGATGAAGGCATTTGTCTGTAGATTAATATTCTCAAGAGAATCAGGTCATTGGTTACTCGATATATATTTGTACCAATGCAAAAGTATGTCCTTCCTTTCTCGATTAATTCCTAATGATCACACGTCAAATGATCCACTGCAATTTGTGGGGGAAACA
TCCTGACTACACATATTCACATCAAAGAGGAACTAGAATTTTCAAAGAGGAAACACGTTAGCTGTAAAATTGTATACTGACTGGAAATTGTTGAAGTATAATGCACAGGTATTGACGTGTGTATAATAAACCGAGCTTAGCTTTGGCATGCTGAATTTAGAGTAGTTTTTTCCAAGTTGGCGTTTGCGATGAATATACAC
AGTGCGTTAAACTTGATTTATCAGTGTCTATATTCTAGTGGTGGGGGAAGTTGATTAACATGCAAAGCTCATGAAGGGAACATGGAATGCATGGACCATGCAATAGTCACAAAGGGGCCGGTTGTCTTCAATTCTGACTTTTAAAGAGGCTTCATTTTCTGTTGAGAATAATTTTCCATGTGGCATAGGTTTACAAAATG
AAATACTATAGCCGCAAGTTTATCTTCACTAAAATTGTGTCTATCGATCCCAAATATTTACATATGCAATTACAACTATTGTTAATGAAGTAGTGAACCAGTTGACCAACTGATCAATAAATCAGTATTAGTTGTTGATACGGGGAGTTCATGTTCTTCTCTTATTTCCAG


>TRINITY_DN48378_c0_g2_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GTCGGATTAGACGGAGGAGGGAAGTTAGGTTCGAGTTGCCGCTGTAGGCGTGGCTTCATTTCTTTGTAAAGAAATCAATTCCCGTAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTGCCATTCACAGGCTGAAAAATCGAAAGAAAAATAAAATATTTTTTCCTGTAACCTCAGATCGAAACCCTAGGGATTCTTCACGCACCCTCTCT
GGTTATGGCGAGGCCTCCGGTGATGCCCCTGGTGCAGCCTACCTGAAACATTGTTTGCATTTGCAGTAGCATTCATCTCCGATTGATATTTTTCTGACCCAGGGTACAAAGCCAGGGGTTCGAACTGTTGACCTCTGTGTACCGAAGGGCTTCCGGACCTGCGTTGCGAAGAGCGAGGGCGAAAAGCTGCGGGAGGGCAC
GCGATTCACTTTCGGAAGGGCGTAACAGGTACATATCTGTCTTTCTCGCTGAAACTTTAGTCAAGGAAAACGGGGGTAATAACGAGAAAGATTCATAGGGTTTGCCTGCAGTGGAGTGATTTTGCATGGTTTAGGATCCATCCTTTTGTCGGGGTAATGGTGTTGTATAAACGAGGTTACAGTGCCGTGTTCGTGGACTA
GCCATTGGGGTTGGTTTCATGAAACCCTGGCCTAGTTAATGAGGCGGTCGTTTTGTTCCTTTTACAATAGGGCACAATGGTTTCGTAATTTTCGTCCTCGAGATTCTCTGTCAAGTGGCGGAAGATGATGATGGGTCGTGGAGCCGATGGTGGTTGTGTTGCCGAGGGGATCCAGAAGCTGGAAATCGACATATATTCAC
AGGCCCTCAAGGCATTGGCATTGAATCATCCCTTCGATTTGGATGATGGCGTTGGTGCTGGCTCGGACGCTGCGGGGCCTTCGAACCCTTTAGCAAGGTATTCAGGAGCAGGCGATGGCAGGCGCAAGCACAAGAAGATTCAAGGAAGAGCACAGGACGGGGGGCTTTCTGCTGCTAAAGTTGGCAGTTCGACGAAAAGC
AGGGATGGCAAATACTCTAAACTCTGGGTGGAAGTGGAGGAGTACTTTCGGAGTGTTACAGCCGAGGATGTGATGGCTTTGGCTTCTGCCGCTAAAATTGATATTTTCAATTTTGCAGAAGTTTCCGATCCTTGCTTGTTAATTCCACCTCGTGGCATTTATGGCAGTGGGACTCAACAAGATAGTACTTTTGTTAAACA
AAACTTGAGTTGTTCTACTAATCTCCAAGTGATGGACAAGAACGAAACTAAACATTGCGGTGCAGATGTTAAGGAAGACAGGAAACATCCTGCATCAGGCCAGGCCGTTGATGGATGTGTGAAGAAATATATCGAAGAAGGGGGGGACTGTGTCGGAGCAGATGGCGACAGAGCAGTGTCAGTGTCGGCATCTTCTAAGC
AAGGAACAAACTCCGAGTTAATTATTCCCATGGTAGGAATTTGCCAGAATGTTTCAACTTCAGTACTACCTAACCGGGAATCGGTGACTGGTCCTTACCTAACAGAGATATGGTCTATGAAGCCGGAATTGAACTCAGGCACTCCTAATCTGGGAATGAACTCTGACACAAATATGGCCGGAGTTTCTGTTCCTGCACAC
GAATTAAGCTCCTGCGCAGAACTTGAAGGAGCAGTAGATTCTAACTGGGAGGCAATCTCCAGGCCAGAGCTTCTTCCAGTAGTATCATCTGAGCTTGGGTCGTGTTCTGGGGAAAAACCTGCAGCAGGAGCATTGTACCTTATGCAGGAACCCAGCTTTGGGATGAGATCTGTAACGGTAAGATCTAATCAACAGGAATC
AAGTTCTATTGCAAAAATCTCCCTTGCATCATCTACCAAGCAGGAGCCAGGTTTTGGTGTAAAAAGGAAGCTCCTTGCTGCAAGTTTTCGATCTAAGAAGAGAAAGCTTTCAGACTCCACTGCTGAAGTCATAACTACAGTCATATCATGCCCAGAAAATGGCGGAAAAGAGCTGTGTCATGTGTGTTATGGTTCTGATA
GTGAAAATTGGAATCAAATCCTTTTTTGTGATATATGTAATGTTCTGGTTCACCAGGAATGCTATGGTGTGCAGAAAATACCAGATGATAAATGGCTGTGCTCCTGGTGCTCATACAGGTCTCGATCAGAAGGTAAAATCTCTGGTAGAGCTGGAAATGACTCTGTAAATCATAAGCAAAGCAACAGTAAAGTGGGTGAT
GATGCACGGCCTTGTATATTGTGCCCAATAAATGGTGGTGCTTTGAAGCCAGTGGCAAGGGCAGGTTCAGAAATGGAAAATAGTGGATGCTTACAGTTTGCACATTTATTCTGTTTTCCGTGGTTTCCTGAGACACATATAGAAAACACAGAGACCATGGAACCAATAAAAAATATCGAAGGGATAAAAGAAGAGCGATG
GAAATTAATATGTTCCTTGTGCAAGGAGAAGCATGGAGCTTGCATTCAATGTAGCTACGGAATGTGTGCAACTGCGTTCCATCCCCTTTGTGCAAGGGACTCGAAACTCTGGATGGGGATATCGAGCAAGGAGGGAAGTGATGATGTTGGTCTGTGGGCCTTTTGCTCAAAGCATTCGTTGACTCGAGTTCGTAGAGCAT
CCTTGTTAACTTATGGTACAGTTGATGGTCTGTCTGAAGCAGAAGGAATGCCTTCTGGAGAAATTGTTCTCTCTCATACCCCAGATGAAGTTCCTTTGGAGCAGGAAAATGAGTCTTGTCGAACACCACGTGCAGGTCAGCCTACATGCATAGAAATCTCTTCAAAAGAGATTACAAATCAAACAATGCCAGATCAAGGA
GATTTGTTGGAAAATTGCAAAGGAGTAATCCCAGATCATGGAGATTTGTTGGGAAACTGTGAAGGGATCAAATTTAAGTTTTCTGAAGTGGATAATGCATTCCATTCCTGTTGCTCAGGTGTAGGGTTGTTATCTGGTAAGTCAGAGAAGATGCCTTGTGGGGATAGGCAGCACTTTAAAACAGGTGATTTGGAGGGTGT
TAGCTCAGCTGTTGAATGTTCTGCAATCCTTGAAATGGGTAACTCAGAGGATAGTGCATCTCTCCCGTCATCGAAAAGCAAACAAAATACTTTGGCTGTAGGAGTTGACGACGGCTTTGATTGCATTGAAAATTTTAGAAAGgctgttgataaaagacagttcattctgacagatgtagcaaatcagatgggcgtgtcat
caaatttgctaacatctttgattaag
GGAGATAAACACAGCATCCCTATCGATCTACAGAGAAATATTAATGGTTGGTTGTGCAGCCTCTTATCAAGTCAGAATAATACCTATCATCCTGCAACAGAACAGGACAACTTTTTCAGTGCAAAAGCATATCACCAGGATGATTTGGCCAGAGATTATGTTCATGCTGGAAGG
CCCAGCAAAAGAACAAAAAACAAGAAAAAGCTTCTAAAGACGGCAGGCTGTAGTAAAAGAGAGTGTATGCCATCTGAAACAGAATCTTCTGTTCATGGTGACAGGGCTGAAAATGATGTAGGGATGGGCGAAAAATGTTATCGTCACATCGAATGTTGTTATAATGAGGTACATCTAGGTTTACAGAATGTTAAAGGCAG
TGATCAAAACAAATCTTTCATGAAAGTTGATGATGCAGAGAGCACAGATGAGTATAAAGCAAGGCAAAGACATAACAATTGCAATTTAATATTGAAGGACTTTCATGAGGAGAGGCAACAGCAAGAAATGCAACAACTGGCAGTTCCTTTAGCAACAGAATCAAAGCATAATTTAGCAGGCTTTCCGACTGAAACTGAAG
ATGTTCCAGCCGGAATTGGTGACTCTGCTGTTGAAAAGCACAGTAATTCAAAGCATGCTTCCTTCAAAATACAGGCTATGAAGGTGTCTGATTGTATGGAGCTTGCACAGTTCGGGAATACTGAAGCAGATTGTAGCAATGCTTCTTTGAAGGGATGCTCAATTAAGGAAGAGCTGGACGTGTTAATGGAAAGAGATATT
GCTGGTTCAAGTTTGGTAGGAGATCAAGCAAAAAATTGTAACAATAGGATACCAGAAGAGTCTAGTATGAATTGTGGCAAGGAGGCACCCAAGTACTATGTGCATCCCTACATACAGCGGAAGATTCTGCAGATCCAAAAGGGGGGTTTGGTCCTTCCAAAAGGAGACCAAAGAACCTACTATAGTGATCATCCAGAAGG
AGATGAAGTAACCAATGAAAATTGCTTTCATGGAATGCTAGATACCAAGGAAAAAACGGATGCTTCTTTTATCTCGCCCAATATTGAAATGATCTCAAAAGATTCTCAATGGAAGCAGCTCTCTGAGGCAAGGGATACAGGGGTTTTGAATATGGCACCAGAAGATGAATTAGAAGGAGAAATTCTATTCTTGCAAAACA
ACCTGCTTGAAAATGCAAGGGCAAATCGCTCCCGTTCTGAGAATTTAATTCTCAGGGTGATAATGAATTTGTCTGAAGAGCAGCAAGCATTGTGGAAGCAAAGATGTGATGCATTTCTAGTAAACGATTACCTAAATCAGGCAAGAGAAGCTAAGAAGCAGGGTAGAAAAGAGAGGAGGCATAAGCAGGCACAGGCTATC
TTGGCTGCAGCTACTGCAGCAGCTGCAGCTTCTCCTAGGACTAGTTCTTCCAAGAAGGATGGAATTGGAGATGCAGTTGAAGAGCACAGTCTACGCCAAGTTAGCTTTCCTAGCAAGCGTTCACATCCAGATGAATGGAATAATGTGAAACCTGCTTTTTCTGGCATATTTTCTACATCACAGCCAATGAAAGTATCACT
GCAGAAACATCTAAAAGGTAACATTTTAGCTGGACGTCCAAGCTCTTCTTCTCACACAATGTTGCGGGCTAAAGAGACATTGTCCAGGCCCCTTGTTGCAAAAGTTCCATCAGAAAGGCATTTTGATGCTTATCCGGTGCCATCCAGCTCACCAAAAGAAGAATCTCTTTTGTGTGATATTTGTAGACTGCATGAATCTA
CTCGCTCAAACAAGATTTATGTTTGTCGTCACTGCAGGGTAGCAGTTCACCAAGATTGCTATGGAATTTCAAGGAATAATTTTGGAGGATGGTATTGTCAGCCATGTGAAGCATTACATTGGCAATACCAAGGCATGAGGCTTCCAACTATAGTTAGCCATGGCAGGCATGGCTGTGGTGTTGAGTGTGCTTTATGTGGT
GGTTTGAGTGGTGCTTTTAAGAGGACTACTGATGACCAGTGGGTTCATGCATTTTGTGCTGAGTGGATGTTGGAGAATACTTTCAGGCGGGGTCAATTGGAACTTGTTGAAGGGCTGGAAATACTTTCCAGAGAAAGATATATGTTGCCATGCAGTATTTGTCATCGGCAAGGTGCCTGTTTGAAGTGCAATTTTGGCCA
CTGCCAAAGTTCTTTTCATCCCTTATGTGCTAGAGACTCTGGGTTTTATATGAGTGTGAGTACTCATGGTGGCAGGGTTCAACATAAAGCATATTGTGAAAAACATAGCCCAGAGCAAAAGCTAAAGGCTGAAGCACGTCGATGTGGAGGAACTGAGGAGCTGAAGATAATAAAACAAATGCGGGTTGAGCTAGAGCGGC
TCCGTCTGATATGTGAGCGCATTGTTAGAAGGGAAAAACTGAAGCGTGAGCTACTTCACTGCTCACATAATATGCTTGCCTCTAAAAGGGATTGTGTTGCTTTCTCTGCGGTTTTCCATAGTTCTTTCCTGCCTCCAGATGTCAACTCCCATGTCGAGTTAGCCCCTGGTTCTGCTATTACTTTTGTACGTGGAAATGCT
AATGAGTATAGAGGTCGAAAAGTTTATGGCGCAGAAAAACATGAGCGGTTAGTTGAATATGCTGTAGAGAGCACTGCATCAGGTCAGCTCAGAGACATTTTACCCAGCCAATCAGAGGCAAGCCATCTGACATCTACCATGGATGATATTTTACATGGACGGTTTAATGTAGACAGTTCTGCAGTTGTGGGTGAGTCTGG
ACGTGCCAGGAAACCACTTGCATATTCGGCTAATTCTGGTGATGCTGATGATGGAGATGATGCACACAAAAGGCCCAGGAAGTCCAGGAAGCATGCCGAAACCCTTCAAAGAGAAGTGGTGATGACACCAACAGAGGCCTCCATGCAAAATCAACGGTTACCAAAGGGATATGCATATGTCCCTGTTGTCTACCTCGCAA
AAGGGAAGACGACCCATCAGGATGTCGGTCCACAAGATACCTGAGCTTTATCTAGGCCTTCATTGTATTATGATTACACTGAGATTCAGTTTCCCAGTCTCCTGAATCACTTTGCCTGATTGTAATTTGTTTTGTCGACTCAATTTTTCATGTTAATGGTCGGCGCATTCATGGGTGTACAATTATAAGGATTGATGTAT
TACCATGCAGTGGATGAAAAAAATAAAGCAGTCCATCTCTCCTATTAGAGATGCTTTTGGGGTTAAGGAAGTTTTGACAAGGAAAGGAGTTGTATCTATATTGTGGACAAAAGTTGTACAAATGATGAGTCTTTCCATCATTGTAATTAATACGCTAGGCTTTTGTCTGCCTAGTGGAAGTGCAGTGAGTAACCTGCATC
TTCCATTATTGTAATTTTAACAGAATCAAATTAACAAGAATTACCGATGTATCAGTTCGTGTAAATCTGAGGAGTTGACAATTCTCTCATGATATTCCTCCATTTGCTGAGATGCACATCGACAATAACTTTTCTGTGACATTCTCCAATAAGCTTCAATCAGTTGTTTTTCAGGCATATTGAACATTGTCACTAATATT
CTGGAGACATTTCCATTTTCGTTTGAATACAAGAAATACCTTCAGAGAAAAACGGAAGTTGTTTCCAGGTCTCTAACAGAGATCTTCTCTGTAAATGATAGTTAAATCCACTGGGCTGAAAGGCTAAGCGTCCTCCAAGCCAAACCAGACTGAATTTGCAGCTAGCACATATACGTGGTCTCTAATCTCCCCAGCATATG
ACTGATTTGGCAACCTATCCTCTAAACATCAAGCCTAAGTGACACAAACTTCAATTCCAGTATCAAAGGGTGATACCAGACAATTCAGTAAAGATTCAGGTAAAATGGGAGGTGGAAAATGAAGAGAGATGAAGGCATTTGTCTGTAGATTAATATTCTCAAGAGAATCAGGTCATTGGTTACTCGATATATATTTGTAC
CAATGCAAAAGTATGTCCTTCCTTTCTCGATTAATTCCTAATGATCACACGTCAAATGATCCACTGCAATTTGTGGGGGAAACATCCTGACTACACATATTCACATCAAAGAGGAACTAGAATTTTCAAAGAGGAAACACGTTAGCTGTAAAATTGTATACTGACTGGAAATTGTTGAAGTATAATGCACAGGTATTGAC
GTGTGTATAATAAACCGAGCTTAGCTTTGGCATGCTGAATTTAGAGTAGTTTTTTCCAAGTTGGCGTTTGCGATGAATATACACAGTGCGTTAAACTTGATTTATCAGTGTCTATATTCTAGTGGTGGGGGAAGTTGATTAACATGCAAAGCTCATGAAGGGAACATGGAATGCATGGACCATGCAATAGTCACAAAGGG
GCCGGTTGTCTTCAATTCTGACTTTTAAAGAGGCTTCATTTTCTGTTGAGAATAATTTTCCATGTGGCATAGGTTTACAAAATGAAATACTATAGCCGCAAGTTTATCTTCACTAAAATTGTGTCTATCGATCCCAAATATTTACATATGCAATTACAACTATTGTTAATGAAGTAGTGAACCAGTTGACCAACTGATCA
ATAAATCAGTATTAGTTGTTGATACGGGGAGTTCATGTTCTTCTCTTATTTCCAG




Intron 6 GTACATATCT ... TTTACAATAG

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>TRINITY_DN48378_c0_g2_i1 from sample A7 / Example spliced isoform
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>TRINITY_DN48378_c0_g2_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:
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AATGAGTATAGAGGTCGAAAAGTTTATGGCGCAGAAAAACATGAGCGGTTAGTTGAATATGCTGTAGAGAGCACTGCATCAGGTCAGCTCAGAGACATTTTACCCAGCCAATCAGAGGCAAGCCATCTGACATCTACCATGGATGATATTTTACATGGACGGTTTAATGTAGACAGTTCTGCAGTTGTGGGTGAGTCTGG
ACGTGCCAGGAAACCACTTGCATATTCGGCTAATTCTGGTGATGCTGATGATGGAGATGATGCACACAAAAGGCCCAGGAAGTCCAGGAAGCATGCCGAAACCCTTCAAAGAGAAGTGGTGATGACACCAACAGAGGCCTCCATGCAAAATCAACGGTTACCAAAGGGATATGCATATGTCCCTGTTGTCTACCTCGCAA
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TACCATGCAGTGGATGAAAAAAATAAAGCAGTCCATCTCTCCTATTAGAGATGCTTTTGGGGTTAAGGAAGTTTTGACAAGGAAAGGAGTTGTATCTATATTGTGGACAAAAGTTGTACAAATGATGAGTCTTTCCATCATTGTAATTAATACGCTAGGCTTTTGTCTGCCTAGTGGAAGTGCAGTGAGTAACCTGCATC
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CTGGAGACATTTCCATTTTCGTTTGAATACAAGAAATACCTTCAGAGAAAAACGGAAGTTGTTTCCAGGTCTCTAACAGAGATCTTCTCTGTAAATGATAGTTAAATCCACTGGGCTGAAAGGCTAAGCGTCCTCCAAGCCAAACCAGACTGAATTTGCAGCTAGCACATATACGTGGTCTCTAATCTCCCCAGCATATG
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