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Intron 1 GTATGGCGTT ... TGATGAACAG

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>TRINITY_DN118700_c3_g3_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
TCTATACATTTATTTCTGTTATTTGGAGTCATCTTGCTGGGAAAATCCTTATCATCGTAAGCTTACAACGGTAGAGTCCTCACGAATTCATGGCTTCAGACGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAA
CAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCAT
GATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTC
CAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCA
CGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCAC
TTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAA
AACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGC
AGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGCATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACT
GGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATT
TTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAA
GGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTT
TGGTCTGAATTTTGAGTTGGCCTTCCACAATAGAATCAACCACAAGTTTTGGAACCCTTGTTCAATCCAGAAATGGTGATCTTGGTGTATGAGCTCCCTCAACAAAAAGGGTTTGTCTTCCAAGATGGGCGACTAAGACGGTTGATGTTGTTAGAGTTGATGTAAGAGATATCAATGACTCAAGAAGAACTAGAAGTTAG
AAACAATATGGTAATGGCGTGTGCACTAGAAGAATGTGAGCTAAAGACATGTAGATGCACATGGTCGACCTGAATGGGAGAATTCTATAACTGATGAGTATCATTTTTTGATGAAGAATGACACATTAGATTTAGTTTTTTGACCCCAAGGAAAGAGTGCAGTGAAGTGTCGATGGGTTTACAAGACCAAATTCGTAGAT
AATGAAACTCCCTAGGATGAAGATGAGAGGTTGTGATAGATATCCAAGAGTGATTTGCCTCTACCAAAAGAGTGGGCATCTAGCCCATACATGAAACTTCTCAGTCCTCTGGAGGGGGAAATACAACAAGGGGCTCCAATATGAAGGCGCTATTGAAAGACATAAGGCTCATTTGGTAGTTAATGGTTTTTATCAACAAG
AAGACATTGACTACATTGAAACCTTTGCCCCAATCACAAAGATGAACTCTATTTGACGGATTCTTCAACTTGTTGCTCTCTTTGGATAGGAGGTACGTTAGATGGATGTCAAAAGTGCCTTTTTACATGATGATCTTAGTAAAGAGATTTATATGGAGCAACCCATCGATTTTGAAAAGGATGGCAGTGTTGTGTGTTGA
CTAAAGAAATCCTTATGTGGATTCAAACAATCCCCCATGGCATGGTATTAGAAGATTGATTGTTTTTTTTCTCAATCTCAGTTAAATGATGCGAATTTGATCACAATATCTACGTAATGCATGTAAATGGCGAACAAAGCAAAAATAAGAGATCTGTACTACAATACCAAATTTGCATTATGACAAGGCCAAAACAGGAG
ATATTGTCTACAGTGTCAAATTTGTATATTATCAACTGATTTTATCTGCAGTTGAATACCAAACAGGGCTTTGGTAGTTTGACATATTAACGTAATGTAAAATCATGTAAACTTTAGAGAATTGGTAAGACATTTTCAATTATATTATATAATCTGTTTGGCTTGTGAAATGATTAGTTTCTCATATTATCAAAAGGCCG
TCTCTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGGAAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTTGCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTT
AGGAAATGCTACTCTGGTGATTGTTTTCAAGTTTAGTTCCTAATCATTTCAATTTTTTTCTTCCATACAATGGATATCCCGGGGAAATCCACTGGGTACTTCTCTTCATTCCAAGGATGGTACCCACAGGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGAT
AACAATCATTTCTCCCAACCACCTAAGCTAGACCCATTTGAC


>TRINITY_DN118700_c3_g3_i15 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CGACGAAGAGGGTTTAAAAAACgtatggcgtttccaatcatttcttctcttctgataccatcctgcatttctgtaacgaaactaattttgtgatttcaggttatctacggattctgttattttcctcctgttttatgcattggactgatgtaaaattgatgaacagGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAG
TACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAACAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCC
CAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGC
GCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTCCAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCC
ATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCACGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTA
ACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCACTTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAA
TGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATA
TCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGCATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGAT
GGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACTGGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACT
TGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATTTTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTG
GATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAAGGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAA
GAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTTTGGTCTGAATTTTGAGGTAGTGTTGACATTTCGCTTTATGTTTGTGCTGCTTGTTGATCCATTGTTCTCTTTGTACATTCATTGGCCAAATATTATATCAACTAATTAGGTTATGGCTTATTTTGATTGTTTATTGCAATTGCAGTGGGTCATATT
TGTCCCGCCTCTCTCAATTTCCAATTTCAGTGCTGTTAACATATTGTTTAATAGAATGCAGTTGACAAAGCAAAAATAAGAGATCTGTACTACAATACCAAATTTGCATTATGACAAGGCCAAAACAGGAGATATTGTCTACAGTGTCAAATTTGTATATTATCAACTGATTTTATCTGCAGTTGAATACCAAACAGGGC
TTTGGTAGTTTGACATATTAACGTAATGTAAAATCATGTAAACTTTAGAGAATTGGTAAGACATTTTCAATTATATTATATAATCTGTTTGGCTTGTGAAATGATTAGTTTCTCATATTATCAAAAGGCCGTCTCTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGT
TTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGGAAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTTGCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTTAGGAAATGCTACTCTGGTGATTGTTTTCAAGTTTAGTTCCTAATCATTTCAATTTTTTTCTTCCATACA
ATGGATATCCCGGGGAAATCCACTGGGTACTTCTCTTCATTCCAAGGATGGTACCCACAGGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGATAACAATCATTTCTCCCAACCACCTAAGCTAGACCCATTTGAC



Intron 2 GTAGTGTTGA ... TAGAATGCAG

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>TRINITY_DN116468_c1_g3_i2 from sample A2 / Example spliced isoform
TGAAGAGTTGAGGCTTATTGATTCACTTACGCCGTTAAACTATATATATACATTTATTTCAGTTACTAGGAGTCGCTAAACTTTCTCTATACATTTATTTCTGTTATTTGGAGTCATCTTGCTGGGAAAATCCTTATCATCGTAAGCTTACAACGGTAGAGTCCTCACGAATTCATGGCTTCAGACGACGAAGAGGGTTT
AAAAAACGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAACAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAAC
AAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAAT
GAGGAAACAATAGGTCCTCCAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGC
TATTGACCACACAGGATCACGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTT
ATGACCGTGATGGCCTCACTTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTC
ATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGA
TGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGCATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATT
TCTATGACAGGCAAACACTGGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGG
AAAAAGTCCTTGGATGATTTTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGAC
ACAATACCTTCTCAAGGAAGGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATC
GTATCTATGAAAATTTTTTTGGTCTGAATTTTGAGTTGACAAAGCAAAAATAAGAGATCTGTACTACAATACCAAATTTGCATTATGACAAGGCCAAAACAGGAGATATTGTCTACAGTGTCAAATTTGTATATTATCAACTGATTTTATCTGCAGTTGAATACCAAACAGGGCTTTGGTAGTTTGACATATTAACGTAA
TGTAAAATCATGTAAACTTTAGAGAATTGGTAAGACATTTTCAATTATATTATATAATCTGTTTGGCTTGTGAAATGATTAGTTTCTCATATTATCAAAAGGCCGTCTCTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGG
AAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTTGCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTTAGGAAATGCTACTCTGGTGATTGTTTTCAAGTTTAGTTCCTAATCATTTCAATTTTTTTCTTCCATACAATGGATATCCCGGGGAAATCCACTGG
GTACTTCTCTTCATTCCAAGGATGGTACCCACAGGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGATAACAATCATTTCTCCCAACCACCTAAGCTAGACCCATTTGACTTCCTAATCATTCTATTTAAGTTATCATGCAAATTGAACTGAAATATTGGAGC
TTAGGTGGAACTTGCAACTTAGTAAGAAGCAATATGTAGAATGTCTGCAAGGTACCTGGATGCCACCTTATGAAACAAGGGTAATTGCTGATAACAACGAAGTATAGGACGTGATATTGGATTTCAAGGAGCCAACCAAACCAGAGGCACGTTCACAAATAACTCTGTGGGGGGCAAATTAAGTAATGTTGTTTGAGTTT
TGGATTCCTTTCAATGAAGCTTCGATTCTTCAAATGCATATTTGCCATGTAGTTGCAAACACTGATGAAAATGATGGGTTTTCTCTCGATCCATGGTCATATTGCTATAGTGTAGAATAAAATTCTTTCCAAATATGTATGGGAACTATATCTCGAGTCTTCTCCTAATTGTCGTCTGATGGTGAGGTTTTATTAAAAAT
CCTTGACTTATGTTCACAAGTGTTTTGTTATTTGGAGTTGAGGTTTGTGTTACAGATTTTTACCTTGTTTAGGTCTGATACAATGCCAGGGTGCACACTGCAAGCAGGTCTGCATATTTGTAGCAGAAAGGGTATATTCAAAGGTCCATACGATAGCAGTTATGGTAGCAGTTTGCCTAGGTTTTTGTGTACAGCAGAGT
GTGAGGGAGGTGCAGTTATGTAGGATAGGACGGGGCATGCATGCCTTCAGGGAGCATGCGTCAATCTTAGTATATTTCCAGTTTTGTTACCTTCAGACTTCGATTAAACTCAGTTCACGGTGGTTTCAGATTTCACAAGTTTTAGTTTGTAGTTCAGTTCAGTTCAGCTTTCAGTTTTGTTCTGTTTTTAGAATGTGTTC
TATTTCCTACTTAAAAAGCAAGGCTGTCAACATCTATGCA


>TRINITY_DN116468_c1_g3_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:
TAATTTTGTGATTTCAGGTTATCTACGGATTCTGTTATTTTCCTCCTGTTTTATGCATTGGACTGATGTAAAATTGATGAACAGGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAACAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTC
TGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACG
AGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTCCAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGAC
GATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCACGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCA
TCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCACTTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGC
AAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCA
GGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGC
ATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACTGGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAG
AAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATTTTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAG
TCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAAGGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATA
TGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTTTGGTCTGAATTTTGAGgtagtgttgacatttcgctttatgtttgtgctgcttgttgatccattgttctctttgtacattcattggccaaatattatatcaacta
attaggttatggcttattttgattgtttattgcaattgcagtgggtcatatttgtcccgcctctctcaatttccaatttcagtgctgttaacatattgtttaatagaatgcagTTGACAAAGCAAAAATAAGAGATCTGTACTACAATACCAAATTTGCATTATGACAAGGCCAAAACAGGAGATATTGTCTACAGTGTC
AAATTTGTATATTATCAACTGATTTTATCTGCAGTTGAATACCAAACAGGGCTTTGGTAGTTTGACATATTAACGTAATGTAAAATCATGTAAACTTTAGAGAATTGGTAAGACATTTTCAATTATATTATATAATCTGTTTGGCTTGTGAAATGATTAGTTTCTCATATTATCAAAAGGCCGTCTCTTTTTGTTAATAC
CGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGGAAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTTGCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTTAGGAAATGCTACTCTGG
TGATTGTTTTCAAGTTTAGTTCCTAATCATTTCAATTTTTTTCTTCCATACAATGGATATCCCGGGGAAATCCACTGGGTACTTCTCTTCATTCCAAGGATGGTACCCACAGGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGATAACAATCATTTCTCCCA
ACCACCTAAGCTAGACCCATTTGACTTCCTAATCATTCTATTTAAGTTATCATGCAAATTGAACTGAAATATTGGAGCTTAGGTGGAACTTGCAACTTAGTAAGAAGCAATATGTAGAATGTCTGCAAGGTACCTGGATGCCACCTTATGAAACAAGGGTAATTGCTGATAACAACGAAGTATAGGACGTGATATTGGAT
TTCAAGGAGCCAACCAAACCAGAGGCACGTTCACAAATAACTCTGTGGGGGGCAAATTAAGTAATGTTGTTTGAGTTTTGGATTCCTTTCAATGAAGCTTCGATTCTTCAAATGCATATTTGCCATGTAGTTGCAAACACTGATGAAAATGATGGGTTTTCTCTCGATCCATGGTCATATTGCTATAGTGTAGAATAAAA
TTCTTTCCAAATATGTATGGGAACTATATCTCGAGTCTTCTCCTAATTGTCGTCTGATGGTGAGGTTTTATTAAAAATCCTTGACTTATGTTCACAAGTGTTTTGTTATTTGGAGTTGAGGTTTGTGTTACAGATTTTTACCTTGTTTAGGTCTGATACAATGCCAGGGTGCACACTGCAAGCAGGTCTGCATATTTGTA
GCAGAAAGGGTATATTCAAAGGTCCATACGATAGCAGTTATGGTAGCAGTTTGCCTAGGTTTTTGTGTACAGCAGAGTGTGAGGGAGGTGCAGTTATGTAGGATAGGACGGGGCATGCATGCCTTCAGGGAGCATGCGTCAATCTTAGTATATTTCCAGTTTTGTTACCTTCAGACTTCGATTAAACTCAGTTCACGGTG
GTTTCAGATTTCACAAGTTTTAGTTTGTAGTTCAGTTCAGTTCAGCTTTCAGTTTTGTTCTGTTTTTAGAATGTGTTCTATTTCCTACTTAAAAAGCAAGGCTGTCAACATCTATGCA



Intron 3 GTAAGTGTTC ... GTTTATGAAG

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A817.61964196216
A918.51852217170
A1018.49736187147



>TRINITY_DN118700_c3_g3_i10 from sample A1 / Example spliced isoform
TCTATACATTTATTTCTGTTATTTGGAGTCATCTTGCTGGGAAAATCCTTATCATCGTAAGCTTACAACGGTAGAGTCCTCACGAATTCATGGCTTCAGACGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAA
CAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCAT
GATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTC
CAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCA
CGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCAC
TTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAA
AACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGC
AGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGCATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACT
GGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATT
TTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAA
GGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTT
TGGTCTGAATTTTGAGTTGGCCTTCCACAATAGAATCAACCACAAGTTTTGGAACCCTTGTTCAATCCAGAAATGGTGATCTTGGTGTATGAGCTCCCTCAACAAAAAGGGTTTGTCTTCCAAGATGGGCGACTAAGACGGTTGATGTTGTTAGAGTTGATGTAAGAGATATCAATGACTCAAGAAGAACTAGAAGTTAG
AAACAATATGGTAATGGCGTGTGCACTAGAAGAATGTGAGCTAAAGACATGTAGATGCACATGGTCGACCTGAATGGGAGAATTCTATAACTGATGAGTATCATTTTTTGATGAAGAATGACACATTAGATTTAGTTTTTTGACCCCAAGGAAAGAGTGCAGTGAAGTGTCGATGGGTTTACAAGACCAAATTCGTAGAT
AATGAAACTCCCTAGGATGAAGATGAGAGGTTGTGATAGATATCCAAGAGTGATTTGCCTCTACCAAAAGAGTGGGCATCTAGCCCATACATGAAACTTCTCAGTCCTCTGGAGGGGGAAATACAACAAGGGGCTCCAATATGAAGGCGCTATTGAAAGACATAAGGCTCATTTGGTAGTTAATGGTTTTTATCAACAAG
AAGACATTGACTACATTGAAACCTTTGCCCCAATCACAAAGATGAACTCTATTTGACGGATTCTTCAACTTGTTGCTCTCTTTGGATAGGAGGTACGTTAGATGGATGTCAAAAGTGCCTTTTTACATGATGATCTTAGTAAAGAGATTTATATGGAGCAACCCATCGATTTTGAAAAGGATGGCAGTGTTGTGTGTTGA
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TCTCTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGGAAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTTGCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTT
AGGAAATGCTACTCTGGTGATTGTTTTCAAGTTTAGTTCCTAATCATTTCAATTTTTTTCTTCCATACAATGGATATCCCGGGGAAATCCACTGGGTACTTCTCTTCATTCCAAGGATGGTACCCACAGGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGAT
AACAATCATTTCTCCCAACCACCTAAGCTAGACCCATTTGAC


>TRINITY_DN118700_c3_g3_i16 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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CAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCAT
GATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTC
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CGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCAC
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GGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGgtaagtgttcatgattttattctttcagtgtattaatgcattgctggacaccaaaatctagttttgtgctagcttaaagtgatgaataaatcctagcaaaatgttggtgctgtttattctgaac
aagtatatactggccatctagttttgtgctagcttaaagtgatgaataaatcttctgaacaagtatatactggccatcttttcctaatgcggtcctaaattgtcttttcctatcaccctagggcctaaaccactttcataacattgttgttcactacaaggacactctcaagtggtttcacaaaatgctggcatggtgtc
gatgccatggcccttaactaatcctaattcagttttaatctacatgcaattgctgttatttgtgaaagcactaatatagagggtgaactgacaatagcctctattgcataagaaaataagaacagaatagaggagtgaaggtctccatcctccattgtgttccctttttaatcctttaggatgagttcaataagtctcac
aataacttgttcccctatggttgatgcttctaaagacttgcggcagatctgcagaaaattgttcctagtgatctgctagagctttttgttaaacttacaggggaggcaatctatcctagggaactccatctctcatgtccttggttgccttaaacatctcctctaaatctagggtttgtatcttgattgtgagaggatat
tcttctttgattgagatagcatagcagggaccactcaccttttaggctttttgttccttgaaagttgacttctctcctatagttatgacaccctgtctaggagatttctggaagtgttatttgaaaattgcccaaatctggctttcatcctcaactgttctccttttatggagttcttaataacaataaatgcacctacc
aggtattctttgggaatgaaaatcactccatctttttgaatttgccagttgcacattcaggttcatatccttctgtgacttcgatattaaactggggagttaacttcaactaaggcttgccttttatcttggtaatctgttggtgggaaattgttcaagaattagcacagaagcattcttagtatgtgtaatcttcttgg
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ttttgtttcaaatttctcttactggtattattttgaagttaaatggtttaaatgtgctctactgtttatgaagGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATTTTG
AAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAAGGG
GGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTTTGG
TCTGAATTTTGAGTTGGCCTTCCACAATAGAATCAACCACAAGTTTTGGAACCCTTGTTCAATCCAGAAATGGTGATCTTGGTGTATGAGCTCCCTCAACAAAAAGGGTTTGTCTTCCAAGATGGGCGACTAAGACGGTTGATGTTGTTAGAGTTGATGTAAGAGATATCAATGACTCAAGAAGAACTAGAAGTTAGAAA
CAATATGGTAATGGCGTGTGCACTAGAAGAATGTGAGCTAAAGACATGTAGATGCACATGGTCGACCTGAATGGGAGAATTCTATAACTGATGAGTATCATTTTTTGATGAAGAATGACACATTAGATTTAGTTTTTTGACCCCAAGGAAAGAGTGCAGTGAAGTGTCGATGGGTTTACAAGACCAAATTCGTAGATAAT
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CTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGGAAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTTGCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTTAGG
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GGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATT
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GGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTT
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GGCGAACAAAGCAAAAATAAGAGATCTGTACTACAATACCAAATTTGCATTATGACAAGGCCAAAACAGGAGATATTGTCTACAGTGTCAAATTTGTATATTATCAACTGATTTTATCTGCAGTTGAATACCAAACAGGGCTTTGGTAGTTTGACATATTAACGTAATGTAAAATCATGTAAACTTTAGAGAATTGGTAA
GACATTTTCAATTATATTATATAATCTGTTTGGCTTGTGAAATGATTAGTTTCTCATATTATCAAAAGGCCGTCTCTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGGAAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTT
GCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTTAGGAAATGCTACTCTGGTGATTGTTTTCAAGTTTAGTTCCTAATCATTTCAATTTTTTTCTTCCATACAATGGATATCCCGGGGAAATCCACTGGGTACTTCTCTTCATTCCAAGGATGGTACCCACA
GGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGATAACAATCATTTCTCCCAACCACCTAAGCTAGACCCATTTGAC


>TRINITY_DN118700_c3_g3_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TCTATACATTTATTTCTGTTATTTGGAGTCATCTTGCTGGGAAAATCCTTATCATCGTAAGCTTACAACGGTAGAGTCCTCACGAATTCATGGCTTCAGACGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAA
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GATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTC
CAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCA
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AGGATGGTACCCACAGGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGATAACAATCATTTCTCCCAACCACCTAAGCTAGACCCATTTGAC



Intron 5 GTCCAAATGC ... TGGGTTTCAG

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AAGACATTGACTACATTGAAACCTTTGCCCCAATCACAAAGATGAACTCTATTTGACGGATTCTTCAACTTGTTGCTCTCTTTGGATAGGAGGTACGTTAGATGGATGTCAAAAGTGCCTTTTTACATGATGATCTTAGTAAAGAGATTTATATGGAGCAACCCATCGATTTTGAAAAGGATGGCAGTGTTGTGTGTTGA
CTAAAGAAATCCTTATGTGGATTCAAACAATCCCCCATGGCATGGTATTAGAAGATTGATTGTTTTTTTTCTCAATCTCAGTTAAATGATGCGAATTTGATCACAATATCTACGTAATGCATGTAAATGGCGAACAAAGCAAAAATAAGAGATCTGTACTACAATACCAAATTTGCATTATGACAAGGCCAAAACAGGAG
ATATTGTCTACAGTGTCAAATTTGTATATTATCAACTGATTTTATCTGCAGTTGAATACCAAACAGGGCTTTGGTAGTTTGACATATTAACGTAATGTAAAATCATGTAAACTTTAGAGAATTGGTAAGACATTTTCAATTATATTATATAATCTGTTTGGCTTGTGAAATGATTAGTTTCTCATATTATCAAAAGGCCG
TCTCTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCATTCACTAGTGTATTGTTTGGAAACTCTGTAGTGCGAAAAACACGTACTGCCTTGCACATTGTGATGGGATAATTTTCAATGTACTCAGATAGAATTCTTGTGCATTTCATGGTTAGGTTATGGTT
AGGAAATGCTACTCTGGTGATTGTTTTCAAGTTTAGTTCCTAATCATTTCAATTTTTTTCTTCCATACAATGGATATCCCGGGGAAATCCACTGGGTACTTCTCTTCATTCCAAGGATGGTACCCACAGGGTAAACAATATTCCACAGAAGATTGAGGCTTTGTCAACACAGGTGGGAACTAAAACTGGGTGGAGAGGAT
AACAATCATTTCTCCCAACCACCTAAGCTAGACCCATTTGAC


>TRINITY_DN118700_c3_g3_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:
TCTATACATTTATTTCTGTTATTTGGAGTCATCTTGCTGGGAAAATCCTTATCATCGTAAGCTTACAACGGTAGAGTCCTCACGAATTCATGGCTTCAGACGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAA
CAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCAT
GATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTC
CAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCA
CGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCAC
TTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGgtccaaatgcctttcactgtgc
agatttttgattttttcttgtttcctaagaaatctcattttaacttgtattcatttgctaattaagtattccttccatctgtcaacacatttcaaagcagaactattacgtattcgttttcttgattttaattgaattcccataaggcaaagctcaacatgtcctttaccttgtggaagtagctagagaacaatgtttaa
gttgattcatcaagaatgtccttaaattccaaattttaccaaagtaactgctagaggtagctagcttattttattttaatgatattatatgtagaacaaaccaatttgctgatttgagctttttaaaaaccttttgtacagatgaatgtcttttgatgtatagtaattttaacaaagccaatctcattctgggtttcagG
TCATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCT
GATGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTAATTGTTGTATTTATCATTTCTGTTTGTTTTATATTTGTTTTCCAGGTTTGTCTAGGTAGTGCTTACTTGCTGAGTGCTGTTCATTTTGTAGCTTGTCTTTATTTGTAGTTGTTTGTAGATATTAAATTCTATCTGTTTTCAGTTT



Intron 6 GTGTTTAATT ... ATTGTTGCAG

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>TRINITY_DN97925_c0_g1_i14 from sample A4 / Example spliced isoform
CTATACATTTATTTCTGTTATTTGGAGTCATCTTGCTGGGAAAATCCTTATCATCGTAAGCTTACAACGGTAGAGTCCTCACGAATTCATGGCTTCAGACGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAAC
AGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCATG
ATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTCCAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAG
CGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCACGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGC
TGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCACTTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCA
GGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGT
TGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCA
AGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGCATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACTGGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGC
CTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATTTTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAA
GAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAAGGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATG
TTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTTTGGTCTGAATTTTGAGAAGTTCATAATGGAAGACTATAAATCATGTGCTACACCTTATCAGTTGAGA
GTGAAGCTAACCAAGAAGTGTGATTCTCTGAAAGTTAATGCTACACTCTATCGACAACTTCTTGGTAGCCTTGTCTATTTAATTACAATTGACTTGATATCCTTTGTTGTAAGTGTTGCTTCTTAGATTATATAGGGTTTGTGAGAAAGTCACTTGAAGGCCGCAAAGAGAATGGTTTGTTATATCAAGGGAACTTACTA
GCTTGGTATAAAATATTGTAGTGATGAAGTAAACGAGTTCGTTGGTTATATTGACTCAGATTGCATTGGAGATGTCGATGATAGGAAGTCTATCTTTGGCTATGTGATTCGTCTTGGCTCCAAACCCATATTATGGTTTGGTTTTGTAAAAAACAGAAAATGGTCTCTCTTTTGATCGCAGAAGTAGAGTATCATGGTGC
AATGCACGTTGGCAAATAGGTGGTATGGATTTGGTACTATTGGGTAAACAAAGACCTTGATTGTGGTATATTATGGCAATAAAGGTGTGGTACAAGTTGCAAAGAATCTTGTTGAACACAACAAAATGAAGCATGTGGAGATTCATGCGCATTACTTGAGATAGTGAGTATAATATAATGTTGTGAATTTTAGTTGTTTA
TGATAGATGATAAGGTTGTTGATATCTTGTTGAAGCCTCTATTAGAAGATAAGTTTGTGAAGCTTTGAGATATGCTTGGGCTTCAAGAAGCTGAGATTGGGGGGTTGTACATCAATAGAGGG


>TRINITY_DN97925_c0_g1_i12 from sample A4 / Example unspliced isoform:
CTATACATTTATTTCTGTTATTTGGAGTCATCTTGCTGGGAAAATCCTTATCATCGTAAGCTTACAACGGTAGAGTCCTCACGAATTCATGGCTTCAGACGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAAC
AGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCATG
ATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTCCAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAG
CGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCACGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGC
TGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGgtgtttaattctgatattttttgtttctttacttcatagttcttttaatgaacatgagttttaacttttaaagggaaaggggcttatgtc
ttcttttacaactatcctctaaagccttatgtgcaggcgtttcaatgtgaaacttatgcagtttttgttttattgttgcagATTTATGACCGTGATGGCCTCACTTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAA
GGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATC
TTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACT
AATGTAGCATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACTGGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGA
TAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATTTTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATC
CTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAAGGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCA
CCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTTTGGTCTGAATTTTGAGTGGGTCATATTTGTCCCGCCTCTCTCAATTTCCAATTTCAGTGCTGTTAACATATTGTTTAATAGAATGCAGTTGACAAA
GCAAAAATAAGAGATCTGTACTACAATACCAAATTTGCATTATGACAAGGCCAAAACAGGAGATATTGTCTACAGTGTCAAATTTGTATATTATCAACTGATTTTATCTGCAGTTGAATACCAAACAGGGCTTTGGTAGTTTGACATATTAACGTAATGTAAAATCATGTAAACTTTAGAGAATTGGTAAGACATTTTCA
ATTATATTATATAATCTGTTTGGCTTGTGAAATGATTAGTTTCTCATATTATCAAAAGGCCGTCTCTTTTTGTTAATACCGGCAGTGCAATTCTTCCATGTTGAGCATATTATAATACAATTGAAAAATGTTTGCCT



Intron 7 GTAACGAAAC ... TGATGAACAG

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>TRINITY_DN109235_c9_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoform
CGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGTATGGCGTTTCCAATCATTTCTTCTCTTCTGATACCATCCTGCATTTCTGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAGTACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAACAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAG
GCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCCCAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATG
GCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTCCAAAGCCTCCGTATTTAGAAGAGGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGAT
TTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCACGGGTTCTTACAGGTAGCTACGACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAG
TTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCACTTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGTGACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGA
CATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGACTGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGC
AGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCAAGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGCATTTAGTCCAGA
TGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACTGGAATTGGTATTAAGAATTGGTGTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACAC
ATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATTTTGAAGCCAAACTTGTCATTCACAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCT
GATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAAGGGGGGATGATCAAGGAGACATGGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACA
GCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTTTGGTCTGAATTTTGAGTTGGCCTTCCACAATAGAATCAACCACAAGTTTTGGAACCCTTGTTCAATCCAGAAATGGTGATCTTGGTGTATGAGCTCCCTCAACAAAAAGGGTTTGT
CTTCCAAGATGGGCGACTAAGACGGTTGATGTTGTTAGAGTTGATGTAAGAGATATCAATGACTCAAGAAGAACTAGAAGTTAGAAACAATATGGTAATGGCGTGTGCACTAGAAGAATGTGAGCTAAAGACATGTAGATGCACATGGTCGACCTGAATGGGAGAATTCTATAACTGATGAGTATCATTTTTTGATGAAG
AATGACACATTAGATTTAGTTTTTTGACCCCAAGGAAAGAGTGCAGTGAAGTGTCGATGGGTTTACAAGACCAAATTCGTAGATAATGAAACTCCCTAGGATGAAGATGAGAGGTTGTGATAGATATCCAAGAGTGATTTGCCTCTACCAAAAGAGTGGGCATCTAGCCCATACATGAAACTTCTCAGTCCTCTGGAGGG
GGAAATACAACAAGGGGCTCCAATATGAAGGCGCTATTGAAAGACATAAGGCTCATTTGGTAGTTAATGGTTTTTATCAACAAGAAGACATTGACTACATTGAAACCTTTGCCCCAATCACAAAGATGAACTCTATTTGACGGATTCTTCAACTTGTTGCTCTCTTTGGATAGGAGGTACGTTAGATGGATGTCAAAAGT
GCCTTTTTACATGATGATCTTAGTAAAGAGATTTATATGGAGCAACCCATCGATTTTGAAAAGGATGGCAGTGTTGTGTGTTGACTAAAGAAATCCTTATGTGGATTCAAACAATCCCCCATGGCATGGTATTAGAAGATTGATTGTTTTTTTTCTCAATCTCAGTTAAATGATGCGAATTTGATCACAATATCTACGTA
ATGCATGTAAATGGCGAAACTTGAATTGTTGTGTTGTATGTTAGTGGCCTAGTCATTACTAGAAGTAATGTTCATTTAATTTTAGGCTTGAAAAAGCAATTAGCAAATACATTTGAGATCGTTGACATTAGTCTATTGCATTTCTTTTTGGGCATTTAAGTCTTAAAGATGGATTACTGCATTTTTATTCTATAACACAA
ATATGTGTTGAATCTTTTACAGAAGTTCATAATGGAAGACTATAAATCATGTGCTACACCTTATCAGTTGAGAGTGAAGCTAACCAAGAAGTGTGATTCTCTGAAAGTTAATGCTACACTCTATCGACAACTTCTTGGTAGCCTTGTCTATTTAATTACAATTGACTTGATATCCTTTGTTGTAAGTGTTGCTTCTTAGA
TTATATAGGGTTTGTGAGAAAGTCACTTGAAGGCCGCAAAGAGAATGGTTTGTTATATCAAGGGAACTTACTAGCTTGGTATAAAATATTGTAGTGATGAAGTAAACGAGTTCGTTGGTTATATTGACTCAGATTGCATTGGAGATGTCGATGATAGGAAGTCTATCTTTGGCTATGTGATTCGTCTTGGCTCCAAACCC
ATATTATGGTTTGGTTTTGTAAAAAACAGAAAATGGTCTCTCTTTTGATCGCAGAAGTAGAGTATCATGGTGCAATGCACGTTGGCAAATAGGTGGTATGGATTTGGTACTATTGGGTAAACAAAGACCTTGATTGTGGTATATTATGGCAATAAAGGTGTGGTACAAGTTGCAAAGAATCTTGTTGAACACAACAAAAT
GAAGCATGTGGAGATTCATGCGCATTACTTGAGATAGTGAGTATAATATAATGTTGTGAATTTTAGTTGTTTATGATAGATGATAAGGTTGTTGATATCTTGTTGAAGCCTCTATTAGAAGATAAGTTTGTGAAGCTTTGAGATATGCTTGGGCTTCAAGAAGCTGAGATTGGGGGGTTGTACATCAATA


>TRINITY_DN109235_c9_g1_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CGACGAAGAGGGTTTAAAAAACGTATGGCGTTTCCAATCATTTCTTCTCTTCTGATACCATCCTGCATTTCTgtaacgaaactaattttgtgatttcaggttatctacggattctgttattttcctcctgttttatgcattggactgatgtaaaattgatgaacagGAAGAGGGTCCGGGTGTTGTCGATGAAGCAGAAG
TACAGGATGGCCTGCGGGCCTGTTTCCCTCTGTCGTTTGGTAAACAGGAGAAGAAACAGGCCCCTTTGGAATCCATACACTCTGCCACCAAAAGGCCAGAGGAGCCACGGCCCAGACGTCAGTTTGGTCCTCCCAGGCCTCCCTCCAATTTGGTTGAACAAGAGGATTCTGATAGATTTGTAGGCCCTCCAAGGCCGCCC
CAATTCGTCAGAGGCGAGGATGGCAATGGGGAGGCAGAGATCATGATAGGACCTCCAAGACCACCCCAATTCGTTAGAGACGAGGATGGCGATGGCGAGGCGGAGATCATGATTGGACCTCCAAGACCGCCTGCGCAGTATAGCGATGACCATGATAATGAGGAAACAATAGGTCCTCCAAAGCCTCCGTATTTAGAAGA
GGGAGCGGGGAATGGCCAAATGGTAGGACCTTCCAAACGCAGAAGCGACGACGAAACCAGCGGTGATTCCGATGATGAAGACGATGCCGTCGATTTCAGGGTGCCTTTAAGTAATGAGATTGTGCTCAGGGGCCATACAAAGGTTGTTTCAGCCTTGGCTATTGACCACACAGGATCACGGGTTCTTACAGGTAGCTACG
ACTACTCTGTTCGTATGTATGATTTTCAAGGTATGACTTCTCAGCTGAAGTCATTCAGACAGCTAGAACCATCTGAAGGTCATCAAGTTCGTAGTTTAAGCTGGAGTCCAACTTCTGATCGATTTTTGTGTGTAACTGGATCAGCCCAGGCAAAGATTTATGACCGTGATGGCCTCACTTTAGGAGAGTTTGTTAAAGGT
GACATGTATTTGCGTGACCTTAAGAATACAAAGGGGCATATATCAGGTCTGACATGTGGAGAATGGCACCCTAAGGAGAAGCAAACAGTATTGACATCCTCAGAGGATGGTTCCCTTCGTATTTGGGATGTAAATGACTTTAATAGTCAGAAGCAGGTCATTAAGCCTAAACTTGCAAAACCTGGAAGAGTACCAGTGAC
TGCTTGTGCATGGGGTCGTGATGGGAAATGCATTGCAGGTGGTGTTGGTGATGGATCAATACAGGTGTGGAATCTTAAACCAGGATGGGGAAGCAGACCAGATTTATATGTTGCCAAGGGACACGACGATGATATCACAGGCCTCCAGTTTTCTGCTGATGGAAATACCCTTCTGAGCAGAAGTATTGATGAAACGCTCA
AGGTTTGGGATCTACGGAAGACTATAACTCCACTGCGAGTATTCAAGGATCTTCCAAACAACTATGCTCAAACTAATGTAGCATTTAGTCCAGATGAGAGGCTAATATATACAGGTACCTCTGTTGAAAGGGATGGTAAGTCTGGAGGCTTATTATATTTCTATGACAGGCAAACACTGGAATTGGTATTAAGAATTGGT
GTGTCCCCAGTGCACAGTGTTGTACGTTGTACTTGGCATCCGCGCCTTAATCAGGTCTTTGCTACAGTTGGTGATAAAAAAGAAGGTGGAACACATATATTATATGATCCAGCTTTGAGTGAGAGGGGGGCACTTGTTTGTGTTGCAAGAGCACCCAGGAAAAAGTCCTTGGATGATTTTGAAGCCAAACTTGTCATTCA
CAACCCACATGCCCTGCCCCTGTTTCGAGATGAACCTAGTCGTAAGAGGCAACGGGAAAAAGCACGGATGGATCCTATCAAGTCACAGAGGCCTGATTTGCCAGTCACAGGTCCTGGTTTTGGTGGGAGGGTTGGATCAACGAAGGGCAGCTTGTTGACACAATACCTTCTCAAGGAAGGGGGGATGATCAAGGAGACAT
GGATGGAGGAAGACCCAAGGGAGGCTATATTGAAATATGCTGATGTTGCTGCAAAAGATCCCAAGTTTATTGCACCTGCATATGCACAGACACAGCCGGAAACCGTCTTTGCTGAATCTGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAATGATATTCAACTGATGATCGTATCTATGAAAATTTTTTTGGTCTGAATTTTGAGTTGGCC
TTCCACAATAGAATCAACCACAAGTTTTGGAACCCTTGTTCAATCCAGAAATGGTGATCTTGGTGTATGAGCTCCCTCAACAAAAAGGGTTTGTCTTCCAAGATGGGCGACTAAGACGGTTGATGTTGTTAGAGTTGATGTAAGAGATATCAATGACTCAAGAAGAACTAGAAGTTAGAAACAATATGGTAATGGCGTGT
GCACTAGAAGAATGTGAGCTAAAGACATGTAGATGCACATGGTCGACCTGAATGGGAGAATTCTATAACTGATGAGTATCATTTTTTGATGAAGAATGACACATTAGATTTAGTTTTTTGACCCCAAGGAAAGAGTGCAGTGAAGTGTCGATGGGTTTACAAGACCAAATTCGTAGATAATGAAACTCCCTAGGATGAAG
ATGAGAGGTTGTGATAGATATCCAAGAGTGATTTGCCTCTACCAAAAGAGTGGGCATCTAGCCCATACATGAAACTTCTCAGTCCTCTGGAGGGGGAAATACAACAAGGGGCTCCAATATGAAGGCGCTATTGAAAGACATAAGGCTCATTTGGTAGTTAATGGTTTTTATCAACAAGAAGACATTGACTACATTGAAAC
CTTTGCCCCAATCACAAAGATGAACTCTATTTGACGGATTCTTCAACTTGTTGCTCTCTTTGGATAGGAGGTACGTTAGATGGATGTCAAAAGTGCCTTTTTACATGATGATCTTAGTAAAGAGATTTATATGGAGCAACCCATCGATTTTGAAAAGGATGGCAGTGTTGTGTGTTGACTAAAGAAATCCTTATGTGGAT
TCAAACAATCCCCCATGGCATGGTATTAGAAGATTGATTGTTTTTTTTCTCAATCTCAGTTAAATGATGCGAATTTGATCACAATATCTACGTAATGCATGTAAATGGCGAAACTTGAATTGTTGTGTTGTATGTTAGTGGCCTAGTCATTACTAGAAGTAATGTTCATTTAATTTTAGGCTTGAAAAAGCAATTAGCAA
ATACATTTGAGATCGTTGACATTAGTCTATTGCATTTCTTTTTGGGCATTTAAGTCTTAAAGATGGATTACTGCATTTTTATTCTATAACACAAATATGTGTTGAATCTTTTACAGAAGTTCATAATGGAAGACTATAAATCATGTGCTACACCTTATCAGTTGAGAGTGAAGCTAACCAAGAAGTGTGATTCTCTGAAA
GTTAATGCTACACTCTATCGACAACTTCTTGGTAGCCTTGTCTATTTAATTACAATTGACTTGATATCCTTTGTTGTAAGTGTTGCTTCTTAGATTATATAGGGTTTGTGAGAAAGTCACTTGAAGGCCGCAAAGAGAATGGTTTGTTATATCAAGGGAACTTACTAGCTTGGTATAAAATATTGTAGTGATGAAGTAAA
CGAGTTCGTTGGTTATATTGACTCAGATTGCATTGGAGATGTCGATGATAGGAAGTCTATCTTTGGCTATGTGATTCGTCTTGGCTCCAAACCCATATTATGGTTTGGTTTTGTAAAAAACAGAAAATGGTCTCTCTTTTGATCGCAGAAGTAGAGTATCATGGTGCAATGCACGTTGGCAAATAGGTGGTATGGATTTG
GTACTATTGGGTAAACAAAGACCTTGATTGTGGTATATTATGGCAATAAAGGTGTGGTACAAGTTGCAAAGAATCTTGTTGAACACAACAAAATGAAGCATGTGGAGATTCATGCGCATTACTTGAGATAGTGAGTATAATATAATGTTGTGAATTTTAGTTGTTTATGATAGATGATAAGGTTGTTGATATCTTGTTGA
AGCCTCTATTAGAAGATAAGTTTGTGAAGCTTTGAGATATGCTTGGGCTTCAAGAAGCTGAGATTGGGGGGTTGTACATCAATA