sp|Q8W1K8|MUT11_CHLRE ----> Protein Mut11

Intron 1 GTATGTTTCT ... CTTCTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	37.04	34	5	20
A2	28.57	40	2.5	16
A3	14.81	23	3	4
A4	13.79	25	2.5	4
A5	7.69	12	0	1
A6	16.67	305	30.5	61
A7	14.73	220	26	38
A8	15.23	334	32.5	60
A9	14.33	257	34.5	43
A10	12.99	154	18.5	23

>TRINITY_DN113241_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

TTGGAAAGTAGTACCCTTCTAAGGTTTATGATTTATCGTCCACTTGTAGTATAGTATATCACGGCAATAGCATTCAAAGTTTGCCATATCCCCACGGTGGAGAGGCGCAGACAGGTATCCGCGCGTGGGCATTCCATTTTCCGGCCAACACAACCATTTCGGCATTCATATATGGTATACCCAATTGGTTTAGGGCATAT
GTACTAATGATTTAATCCATCGAGAACATTTCCCATTTATGCATTCGGGACATACATTAGACGGCTCTTTCAGGAAAAAGCCAGTGAACAGTGGCGGCTCGGCTCAGCTCAGCTCTTACATGATCTATACTCTTTGATATTCGGCGAATTTAGACGAATTTTAATCGTCTGTCTTCAGATTCCTCGGTTTTAATCCTTCA
AATCCGCCGGCTTCCTCTTGCCTCTACTACCATGCCCGATGAACATCAGACTAGCGAGGACGAGAATGAATCAATTTTAATCGACGATGACGATGTGATCGATGAGATTTCCATCGACGAAGAAGATCTTCCTGACGCTGACGAGGAAAGCGAAGATGCGCAAGAAGACAACGGAGAAAGCGAGCCAGATGACACCTTAA
GTAGTTTGGATGATGCTATACACACTTTCGAAGGTCATGAAGATACTTTGTTTGCTGTAGCTTGTAGTCCAGTAGATGCAACATGGGTTGCATCAGGTGGTGGAGATGACAAAGCTTTTATGTGGAGGATAGGCCATGCAGCACCATTTTTTGAGCTGAAAGGACATACCGATTCTGTTGTAGCCTTGTCTTTCAGCAAT
GATGGGCTCTTACTTGCATCTGGTAGTTTGGATGGAGTAGTTCGCATCTGGGATGCCTCTTCTGGAAATCTCATACATGTACTAGATGGCCCGGGAGGGGGTATTGAGTGGGTCAGATGGCATCCAAAAGGGCATTTAGTCTTGGCAGGATCAGAGGATTACACAACTTGGATGTGGAATGCTGATCTTGGAAAGTGCCT
TTCAGTATATACTGGTCATAGTGAATCTGTAACATGTGGCGATTTTACACCTGATGGAAAGACTATTTGTACTGGATCTGCAGATGCTTCTTTGCGGGTATGGAATCCACAGACACAAGAAAGTAAACTCACCGTAAAAGGGCATCCATACCACACAGAGGGACTTACATGCTTAAACATTAGTTCAGATTCCACGTTGG
TTGTTAGTGGCTCCACAGATGGCAGTGTTCATGTGGTTAACATAAAAACTGGAAAGGTGGTTGTTTCCTTAGTCGGCCATTCTGGATCAATAGAATGTGTTGGGTTTTCACCCAGCTTGAATTGGGTTGCAACAGGTGGTATGGATAAAAAACTAATGATTTGGGAATTGCAAAGCTCATCGCTGCGATGCACTTTTCAG
CATGAGGAAGGCGTGATGAGGTTATCATGGTCATCTTCATCCGAGCACATCATAAGCGCTTCCCTTGATGGAATTGTCTACCTTTGGGATAGTCGGTCAGGGGCTTGTAAAAGAGTTTTCCAGGGTCACAATGATTCAATTCAGGATATGGCGGTCACAGTGGATCAACGGTTTATCCTTACAGGATCAGATGACAAGAC
TGCTAAAGTTTTTGAAATTGGGGCATTTTGATTTTATATACTGTTTCATACAAAATAATATGTTGATTGTAAGTTATTGTCATGTTTGAATGTAAGTCACAGCAGAAGATTGGAAGGGCTGAGACCGAGGGTAGCAATTGCTTTCCACATGATAATATAGGTAACTATTTACTGAAGTGAACTGGGGGACAGAAGCTAAC
CTGTTGGTTTCTTTTTCTGTATGGTTCGTTCAACAATAATATTGTTGTAACTACATTTTTTGTAAATTTTCTTTTAGTGGTTAAAAAAAA

>TRINITY_DN113241_c0_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTCAGGATATGGCGGTCACAGTgtatgtttctgaggctattgacattagcattgatggcatttaattatgctttctgaattcaagctgtagctttgaataaatgcaacttgtttttggcatttaacatttaatatttacttatgcgattatctttttagattattgtggattgaatatctgctaattcttcttgcagGGA
TCAACGGTTTATCCTTACAGGATCAGATGACAAGACTGCTAAAGTTTTTGAAATTGGGGCATTTTGATTTTATATACTGTTTCATACAAAATAATATGTTGATTGTAAGTTATTGTCATGTTTGAATGTAAGTCACAGCAGAAGATTGGAAGGGCTGAGACCGAGGGTAGCAATTGCTTTCCACATGATAATATAGGTAA
CTATTTACTGAAGTGAACTGGGGGACAGAAGCTAACCTGTTGGTTTCTTTTTCTGTATGGTTCGTTCAACAATAATATTGTTGTAACTACATTTTTTGTAAATTTTCTTTTAGTGGTTAAAAAAAA

Intron 2 GTATACCCAA ... GCTCTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	58.97	8	4	19
A2	80.95	2	7	10
A3	55.56	6	7	8
A4	71.43	6	10	20
A5	76.92	3	9	11
A6	59.24	32	38	55
A7	62.04	26	31	54
A8	67.57	12	13	37
A9	60.54	29	30	59
A10	56.76	32	36	48

>TRINITY_DN38417_c1_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

GATTTATCGTCCACTTGTAGTATAGTATATCACGGCAATAGCATTCAAAGTTTGCCATATCCCCACGGTGGAGAGGCGCAGACAGGTATCCGCGCGTGGGCATTCCATTTTCCGGCCAACACAACCATTTCGGCATTCATATATGGAAAAAGCCAGTGAACAGTGGCGGCTCGGCTCAGCTCAGCTCTTACATGATCTAT
ACTCTTTGATATTCGGCGAATTTAGACGAATTTTAATCGTCTGTCTTCAGATTCCTCGGTTTTAATCCTTCAAATCCGCCGGCTTCCTCTTGCCTCTACTACCATGCCCGATGAACATCAGACTAGCGAGGACGAGAATGAATCAATTTTAATCGACGATGACGATGTGATCGATGAGATTTCCATCGACGAAGAAGATC
TTCCTGACGCTGACGAGGAAAGCGAAGATGCGCAAGAAGACAACGGAGAAAGCGAGCCAGATGACACCTTAAGTAGTTTGGATGATGCTATACACACTTTCGAAGGTCATGAAGATACTTTGTTTGCTGTAGCTTGTAGTCCAGTAGATGCAACATGGGTTGCATCAGGTGGTGGAGATGACAAAGCTTTTATGTGGAGG
ATAGGCCATGCAGCACCATTTTTTGAGCTGAAAGGACATACCGATTCTGTTGTAGCCTTGTCTTTCAGCAATGATGGGCTCTTACTTGCATCTGGTAGTTTGGATGGAGTAGTTCGCATCTGGGATGCCTCTTCTGGAAATCTCATACATGTACTAGATGGCCCGGGAGGGGGTATTGAGTGGGTCAGATGGCATCCAAA
AGGGCATTTAGTCTTGGCAGGATCAGAGGATTACACAACTTGGATGTGGAATGCTGATCTTGGAAAGTGCCTTTCAGTATATACTGGTCATAGTGAATCTGTAACATGTGGCGATTTTACACCTGATGGAAAGACTATTTGTACTGGATCTGCAGATGCTTCTTTGCGGGTATGGAATCCACAGACACAAGAAAGTAAAC
TCACCGTAAAAGGGCATCCATACCACACAGAGGGACTTACATGCTTAAACATTAGTTCAGATTCCACGTTGGTTGTTAGTGGCTCCACAGATGGCAGTGTTCATGTGGTTAACATAAAAACTGGAAAGGTGGTTGTTTCCTTAGTCGGCCATTCTGGATCAATAGAATGTGTTGGGTTTTCACCCAGCTTGAATTGGGTT
GCAACAGGTGGTATGGATAAAAAACTAATGATTTGGGAATTGCAAAGCTCATCGCTGCGATGCACTTTTCAGCATGAGGAAGGCGTGATGAGGTTATCATGGTCATCTTCATCCGAGCACATCATAAGCGCTTCCCTTGATGGAATTGTCTACCTTTGGGATAGTCGGTCAGGGGCTTGTAAAAGAGTTTTCCAGGGTCA
CAATGATTCAATTCAGGATATGGCGGTCACAGTGGATCAACGGTTTATCCTTACAGGATCAGATGACAAGACTGCTAAAGTTTTTGAAATTGGGGCATTTTGATTTTATATACTGTTTCATACAAAATAATATGTTGATTGTAAGTTATTGTCATGTTTGAATGTAAGTCACAGCAGAAGATTGGAAGGGCTGAGACCGA
GGGTAGCAATTGCTTTCCACATGATAATATAGGTAACTATTTACTGAAGTGAACTGGGGGACAGAAGCTAACCTGTTGGTTTCTTTTTCTGTATGGTTCGTTCAACAATAATATTGTTGTAACTACATTTTTTGTAAATTTTCTTTTAGTGGTTAACATTATTAAGTGAATTTTATTCAATTAGTTTGTAAAGTTCATGT
TCCCATATTAAACTGATTAAACTGATGTTCTCATAAAACTGATGAATGGGAATTATGAAATGTTGGTGTG

>TRINITY_DN38417_c1_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GATTTATCGTCCACTTGTAGTATAGTATATCACGGCAATAGCATTCAAAGTTTGCCATATCCCCACGGTGGAGAGGCGCAGACAGGTATCCGCGCGTGGGCATTCCATTTTCCGGCCAACACAACCATTTCGGCATTCATATATGgtatacccaattggtttagggcatatgtactaatgatttaatccatcgagaacat
ttcccatttatgcattcgggacatacattagacggctctttcagGAAAAAGCCAGTGAACAGTGGCGGCTCGGCTCAGCTCAGCTCTTACATGATCTATACTCTTTGATATTCGGCGAATTTAGACGAATTTTAATCGTCTGTCTTCAGATTCCTCGGTTTTAATCCTTCAAATCCGCCGGCTTCCTCTTGCCTCTACTA
CCATGCCCGATGAACATCAGACTAGCGAGGACGAGAATGAATCAATTTTAATCGACGATGACGATGTGATCGATGAGATTTCCATCGACGAAGAAGATCTTCCTGACGCTGACGAGGAAAGCGAAGATGCGCAAGAAGACAACGGAGAAAGCGAGCCAGATGACACCTTAAGTAGTTTGGATGATGCTATACACACTTTC
GAAGGTCATGAAGATACTTTGTTTGCTGTAGCTTGTAGTCCAGTAGATGCAACATGGGTTGCATCAGGTGGTGGAGATGACAAAGCTTTTATGTGGAGGATAGGCCATGCAGCACCATTTTTTGAGCTGAAAGGACATACCGATTCTGTTGTAGCCTTGTCTTTCAGCAATGATGGGCTCTTACTTGCATCTGGTAGTTT
GGATGGAGTAGTTCGCATCTGGGATGCCTCTTCTGGAAATCTCATACATGTACTAGATGGCCCGGGAGGGGGTATTGAGTGGGTCAGATGGCATCCAAAAGGGCATTTAGTCTTGGCAGGATCAGAGGATTACACAACTTGGATGTGGAATGCTGATCTTGGAAAGTGCCTTTCAGTATATACTGGTCATAGTGAATCTG
TAACATGTGGCGATTTTACACCTGATGGAAAGACTATTTGTACTGGATCTGCAGATGCTTCTTTGCGGGTATGGAATCCACAGACACAAGAAAGTAAACTCACCGTAAAAGGGCATCCATACCACACAGAGGGACTTACATGCTTAAACATTAGTTCAGATTCCACGTTGGTTGTTAGTGGCTCCACAGATGGCAGTGTT
CATGTGGTTAACATAAAAACTGGAAAGGTGGTTGTTTCCTTAGTCGGCCATTCTGGATCAATAGAATGTGTTGGGTTTTCACCCAGCTTGAATTGGGTTGCAACAGGTGGTATGGATAAAAAACTAATGATTTGGGAATTGCAAAGCTCATCGCTGCGATGCACTTTTCAGCATGAGGAAGGCGTGATGAGGTTATCATG
GTCATCTTCATCCGAGCACATCATAAGCGCTTCCCTTGATGGAATTGTCTACCTTTGGGATAGTCGGTCAGGGGCTTGTAAAAGAGTTTTCCAGGGTCACAATGATTCAATTCAGGATATGGCGGTCACAGTGGATCAACGGTTTATCCTTACAGGATCAGATGACAAGACTGCTAAAGTTTTTGAAATTGGGGCATTTT
GATTTTATATACTGTTTCATACAAAATAATATGTTGATTGTAAGTTATTGTCATGTTTGAATGTAAGTCACAGCAGAAGATTGGAAGGGCTGAGACCGAGGGTAGCAATTGCTTTCCACATGATAATATAGGTAACTATTTACTGAAGTGAACTGGGGGACAGAAGCTAACCTGTTGGTTTCTTTTTCTGTATGGTTCGT
TCAACAATAATATTGTTGTAACTACATTTTTTGTAAATTTTCTTTTAGTGGTTAACATTATTAAGTGAATTTTATTCAATTAGTTTGTAAAGTTCATGTTCCCATATTAAACTGATTAAACTGATGTTCTCATAAAACTGATGAATGGGAATTATGAAATGTTGGTGTG

Intron 3 GTATACCCAA ... CTGTCTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	93.94	1	4	27
A2	92.86	1	7	19
A3	83.33	4	7	33
A4	100	0	10	19
A5	100	0	9	12
A6	85.4	10	38	79
A7	96.19	2	31	70
A8	92	2	13	33
A9	91.3	6	30	96
A10	95.97	3	36	107

>TRINITY_DN35764_c0_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoform

AAAGTAGTACCCTTCTAAGGTTTATGATTTATCGTCCACTTGTAGTATAGTATATCACGGCAATAGCATTCAAAGTTTGCCATATCCCCACGGTGGAGAGGCGCAGACAGGTATCCGCGCGTGGGCATTCCATTTTCCGGCCAACACAACCATTTCGGCATTCATATATGATTCCTCGGTTTTAATCCTTCAAATCCGCC
GGCTTCCTCTTGCCTCTACTACCATGCCCGATGAACATCAGACTAGCGAGGACGAGAATGAATCAATTTTAATCGACGATGACGATGTGATCGATGAGATTTCCATCGACGAAGAAGATCTTCCTGACGCTGACGAGGAAAGCGAAGATGCGCAAGAAGACAACGGAGAAAGCGAGCCAGATGACACCTTAAGTAGTTTG
GATGATGCTATACACACTTTCGAAGGTCATGAAGATACTTTGTTTGCTGTAGCTTGTAGTCCAGTAGATGCAACATGGGTTGCATCAGGTGGTGGAGATGACAAAGCTTTTATGTGGAGGATAGGCCATGCAGCACCATTTTTTGAGCTGAAAGGACATACCGATTCTGTTGTAGCCTTGTCTTTCAGCAATGATGGGCT
CTTACTTGCATCTGGTAGTTTGGATGGAGTAGTTCGCATCTGGGATGCCTCTTCTGGAAATCTCATACATGTACTAGATGGCCCGGGAGGGGGTATTGAGTGGGTCAGATGGCATCCAAAAGGGCATTTAGTCTTGGCAGGATCAGAGGATTACACAACTTGGATGTGGAATGCTGATCTTGGAAAGTGCCTTTCAGTAT
ATACTGGTCATAGTGAATCTGTAACATGTGGCGATTTTACACCTGATGGAAAGACTATTTGTACTGGATCTGCAGATGCTTCTTTGCGGGTATGGAATCCACAGACACAAGAAAGTAAACTCACCGTAAAAGGGCATCCATACCACACAGAGGGACTTACATGCTTAAACATTAGTTCAGATTCCACGTTGGTTGTTAGT
GGCTCCACAGATGGCAGTGTTCATGTGGTTAACATAAAAACTGGAAAGGTGGTTGTTTCCTTAGTCGGCCATTCTGGATCAATAGAATGTGTTGGGTTTTCACCCAGCTTGAATTGGGTTGCAACAGGTGGTATGGATAAAAAACTAATGATTTGGGAATTGCAAAGCTCATCGCTGCGATGCACTTTTCAGCATGAGGA
AGGCGTGATGAGGTTATCATGGTCATCTTCATCCGAGCACATCATAAGCGCTTCCCTTGATGGAATTGTCTACCTTTGGGATAGTCGGTCAGGGGCTTGTAAAAGAGTTTTCCAGGGTCACAATGATTCAATTCAGGATATGGCGGTCACAGTGGATCAACGGTTTATCCTTACAGGATCAGATGACAAGACTGCTAAAG
TTTTTGAAATTGGGGCATTTTGATTTTATATACTGTTTCATACAAAATAATATGTTGATTGTAAGTTATTGTCATGTTTGAATGTAAGTCACAGCAGAAGATTGGAAGGGCTGAGACCGAGGGTAGCAATTGCTTTCCACATGATAATATAGGTAACTATTTACTGAAGTGAACTGGGGGACAGAAGTTAACCTGTTGGT
TTCTTTTTCTGTATGGTTCGTTCAACAATAATATTGTTGTAACTACATTTTTTGTAAATTTTCTTTTAGTGGTTAACATTATTAAGTGAATTTTATTCAATTAGTTTGTAAAGTTCATGTTCCCATATTAAACTGATTAAACTGATGTTCTCA

>TRINITY_DN35764_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

AAAGTAGTACCCTTCTAAGGTTTATGATTTATCGTCCACTTGTAGTATAGTATATCACGGCAATAGCATTCAAAGTTTGCCATATCCCCACGGTGGAGAGGCGCAGACAGGTATCCGCGCGTGGGCATTCCATTTTCCGGCCAACACAACCATTTCGGCATTCATATATGgtatacccaattggtttagggcatatgtac
taatgatttaatccatcgagaacatttcccatttatgcattcgggacatacattagacggctctttcaggaaaaagccagtgaacagtggcggctcggctcagctcagctcttacatgatctatactctttgatattcggcgaatttagacgaattttaatcgtctgtcttcagATTCCTCGGTTTTAATCCTTCAAATC
CGCCGGCTTCCTCTTGCCTCTACTACCATGCCCGATGAACATCAGACTAGCGAGGACGAGAATGAATCAATTTTAATCGACGATGACGATGTGATCGATGAGATTTCCATCGACGAAGAAGATCTTCCTGACGCTGACGAGGAAAGCGAAGATGCGCAAGAAGACAACGGAGAAAGCGAGCCAGATGACACCTTAAGTAG
TTTGGATGATGCTATACACACTTTCGAAGGTCATGAAGATACTTTGTTTGCTGTAGCTTGTAGTCCAGTAGATGCAACATGGGTTGCATCAGGTGGTGGAGATGACAAAGCTTTTATGTGGAGGATAGGCCATGCAGCACCATTTTTTGAGCTGAAAGGACATACCGATTCTGTTGTAGCCTTGTCTTTCAGCAATGATG
GGCTCTTACTTGCATCTGGTAGTTTGGATGGAGTAGTTCGCATCTGGGATGCCTCTTCTGGAAATCTCATACATGTACTAGATGGCCCGGGAGGGGGTATTGAGTGGGTCAGATGGCATCCAAAAGGGCATTTAGTCTTGGCAGGATCAGAGGATTACACAACTTGGATGTGGAATGCTGATCTTGGAAAGTGCCTTTCA
GTATATACTGGTCATAGTGAATCTGTAACATGTGGCGATTTTACACCTGATGGAAAGACTATTTGTACTGGATCTGCAGATGCTTCTTTGCGGGTATGGAATCCACAGACACAAGAAAGTAAACTCACCGTAAAAGGGCATCCATACCACACAGAGGGACTTACATGCTTAAACATTAGTTCAGATTCCACGTTGGTTGT
TAGTGGCTCCACAGATGGCAGTGTTCATGTGGTTAACATAAAAACTGGAAAGGTGGTTGTTTCCTTAGTCGGCCATTCTGGATCAATAGAATGTGTTGGGTTTTCACCCAGCTTGAATTGGGTTGCAACAGGTGGTATGGATAAAAAACTAATGATTTGGGAATTGCAAAGCTCATCGCTGCGATGCACTTTTCAGCATG
AGGAAGGCGTGATGAGGTTATCATGGTCATCTTCATCCGAGCACATCATAAGCGCTTCCCTTGATGGAATTGTCTACCTTTGGGATAGTCGGTCAGGGGCTTGTAAAAGAGTTTTCCAGGGTCACAATGATTCAATTCAGGATATGGCGGTCACAGTGGATCAACGGTTTATCCTTACAGGATCAGATGACAAGACTGCT
AAAGTTTTTGAAATTGGGGCATTTTGATTTTATATACTGTTTCATACAAAATAATATGTTGATTGTAAGTTATTGTCATGTTTGAATGTAAGTCACAGCAGAAGATTGGAAGGGCTGAGACCGAGGGTAGCAATTGCTTTCCACATGATAATATAGGTAACTATTTACTGAAGTGAACTGGGGGACAGAAGTTAACCTGT
TGGTTTCTTTTTCTGTATGGTTCGTTCAACAATAATATTGTTGTAACTACATTTTTTGTAAATTTTCTTTTAGTGGTTAACATTATTAAGTGAATTTTATTCAATTAGTTTGTAAAGTTCATGTTCCCATATTAAACTGATTAAACTGATGTTCTCA