NA ----> NA
Intron 1 GTAAGCATCT ... ACAAGGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 52.46 | 29 | 32 | 6 |
| A2 | 50 | 16 | 16 | 1 |
| A3 | 52.54 | 28 | 31 | 1 |
| A4 | 50 | 24 | 24 | 2 |
| A5 | 56.25 | 7 | 9 | 3 |
| A6 | 51.61 | 120 | 128 | 1 |
| A7 | 50.5 | 149 | 152 | 3 |
| A8 | 50.97 | 177 | 184 | 5 |
| A9 | 50.79 | 155 | 160 | 1 |
| A10 | 50.21 | 117 | 118 | 1 |
>TRINITY_DN39477_c0_g2_i7 from sample A9 / Example spliced isoformCTGCGGTGTGTGCAGTTATTATCTTACAAAAAAACATGGCCATCATGTAAATATTTCTGCGTACTGCACCAACTTTCATCACACCATCACTCGGTAGTTTCTCTTTTTAATCATAGAATGGATTGCTGCTTGGTGAAATGGTAGACAAGAAAATAGGAAGATAGTAGGTATCCAATTTGAAGATCGTGCATCTGCATATG
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CTGTCAACATACAGAACAGATAAAACATCATCTGCACAAACATTGCCAACAAATAGAACTTAAGTTTGCTATAGCCAAATTATCTACAATAAACTAGAAACTGTTTTATTGACCTCTGAGAACTTAGAAGGTTTGTGGGGAAGGACATTGGAATGTTCAATATATTCATGTGAAATGTTAAACATCCAGCAAATACATCG
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ATTTTTGGACCAAGTATTCAGATCATCACTATGCC
>TRINITY_DN39477_c0_g2_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:CTGCGGTGTGTGCAGTTATTATCTTACAAAAAAACATGGCCATCATGTAAATATTTCTGCGTACTGCACCAACTTTCATCACACCATCACTCGGTAGTTTCTCTTTTTAATCATAGAATGGATTGCTGCTTGGTGAAATGGTAGACAAGAAAATAGGAAGATAGTAGGTATCCAATTTGAAGATCGTGCATCTGCATATG
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taactaaaattaaaggagtaccctaaatagaagctttgtatatctctcaagtgcatatctacatgtacttatgtcattgattgcatcccagactagcatttgtgtaactgaatgcaatgcaaactagccctaggcggagaattttacaggggacatttaggctatgtattgtgttgtttgcagaaaatctttttctgggg
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TAGAAACTGTTTTATTGACCTCTGAGAACTTAGAAGGTTTGTGGGGAAGGACATTGGAATGTTCAATATATTCATGTGAAATGTTAAACATCCAGCAAATACATCGATCGTATATCGTCCTGCTCTCCAATTTCTTGAACAGTTTTTAGAATAGGATATGCTAGGCTTCTGGATGGCTTCAAAGATAAGGACATAATTGA
ACAGCATTGAGAATAGGACATGCTTGGCATGTGTCTGGCTTCAAAAGCTCAGGACATCAATTTTTCTTGTCCTATATCTGTTCTGGGATGATGATAATGACGTACAATTTTTGGACCAAGTATTCAGATCATCACTATGCC