NA ----> NA


Intron 1 GTAAGCATCT ... ACAAGGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN39477_c0_g2_i7 from sample A9 / Example spliced isoform
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CCTTTGCAAACTATGGGCAAGGATAAACCCAATAAAATTATTTCGAGTAACCAATACACATACCATGATCCGCTCGCTGCGCCCATATTCAATTATTCATCTGCATTCAAAATTAAACCCACTCCAAGCTTAACCAGGAATACCAATATCAAATTCCAATTCGGATATATTAATCATATTTTCCCCAATGCCCTGCAAGC
TCTCGAGGGCGCCAAGGGCCTCACAGATGGATGGAAGAGCGTATCCAAATCCTTTATGCAGATACTGGGATTCGAACGCTGGCCAGTTGATTTCCAGATATCTAATTGGAAACCCACGAAGGGAGAGACTCTGTCCGTCATGGTCTCAGTTCCGCCTCCCAGCAATTTCATCGACAGATTGAATTTGGCTTTCAGGGAAA
CCTTTTTTAAGGGGCGATTAGTTGAGGTTACTTGTGAAGAGGAAACCTTCCCTGCTTATCCCACTTCAGGGCTCTCAAATATATGGAGAACCTTAATTCCACTTACGCCGCTTGACATAAGTGGGCACCGATCCCTCACTGTGGATGTTAATGATGGCAGGCACAAGTCGTTCCATGGAGTTATAGAGGTTGTTGAGAAG
GAATATCCTGTAGAGTCTATCTGGTTGAGCGAAACTAAGTCCACAATTCATGCAACAGAAAGTGAGTTACGTGCAGTCAAAAAATTGGTATCCAAGAAGTCAGCTCAACAATATTGGTGTGGTCCATTTAGATTGCCAACAGATGGTGAAGTAACAACAGAGTATGGTCTCAAAAGATACTACAATGGAGTTTTCGCATC
TGGGTATTATCATAAAGGTATTGACTATGGAGCTTCTCATGGAGCATATGTGGGGTCACCTGCAGCTGCTCGTGTATCTCTAGTGGGCAGGGAGGAAGAAGGTTTTGTGCTACATGGTAACTGTGTTGGCCTTGATCATGGACATGGTGTAACAAGCATTTTAATGCACCTTGACACTATTTTGGTGGAAGATGGGATGG
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CTGTCAACATACAGAACAGATAAAACATCATCTGCACAAACATTGCCAACAAATAGAACTTAAGTTTGCTATAGCCAAATTATCTACAATAAACTAGAAACTGTTTTATTGACCTCTGAGAACTTAGAAGGTTTGTGGGGAAGGACATTGGAATGTTCAATATATTCATGTGAAATGTTAAACATCCAGCAAATACATCG
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ATTTTTGGACCAAGTATTCAGATCATCACTATGCC


>TRINITY_DN39477_c0_g2_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:
CTGCGGTGTGTGCAGTTATTATCTTACAAAAAAACATGGCCATCATGTAAATATTTCTGCGTACTGCACCAACTTTCATCACACCATCACTCGGTAGTTTCTCTTTTTAATCATAGAATGGATTGCTGCTTGGTGAAATGGTAGACAAGAAAATAGGAAGATAGTAGGTATCCAATTTGAAGATCGTGCATCTGCATATG
CCTTTGCAAACTATGGGCAAGGATAAACCCAATAAAATTATTTCGAGTAACCAATACACATACCATGATCCGCTCGCTGCGCCCATATTCAATTATTCATCTGCATTCAAAATTAAACCCACTCCAAGCTTAACCAGGAATACCAATATCAAATTCCAATTCGGATATATTAATCATATTTTCCCCAATGCCCTGCAAGC
TCTCGAGGGCGCCAAGGGCCTCACAGATGGATGGAAGAGCGTATCCAAATCCTTTATGCAGATACTGGGATTCGAACGCTGGCCAGTTGATTTCCAGATATCTAATTGGAAACCCACGAAGGGAGAGACTCTGTCCGTCATGGTCTCAGTTCCGCCTCCCAGCAATTTCATCGACAGATTGAATTTGGCTTTCAGGGAAA
CCTTTTTTAAGGGGCGATTAGTTGAGGTTACTTGTGAAGAGGAAACCTTCCCTGCTTATCCCACTTCAGGGCTCTCAAATATATGGAGAACCTTAATTCCACTTACGCCGCTTGACATAAGTGGGCACCGATCCCTCACTGTGGATGTTAATGATGGCAGGCACAAGTCGTTCCATGGAGTTATAGAGGTTGTTGAGAAG
GAATATCCTGTAGAGTCTATCTGGTTGAGCGAAACTAAGTCCACAATTCATGCAACAGAAAGTGAGTTACGTGCAGTCAAAAAATTGGTATCCAAGAAGTCAGCTCAACAATATTGGTGTGGTCCATTTAGATTGCCAACAGATGGTGAAGTAACAACAGAGTATGGTCTCAAAAGATACTACAATGGAGTTTTCGCATC
TGGGTATTATCATAAAGGTATTGACTATGGAGCTTCTCATGGAGCATATGTGGGGTCACCTGCAGCTGCTCGTGTATCTCTAGTGGGCAGGGAGGAAGAAGGTTTTGTGCTACATGGTAACTGTGTTGGCCTTGATCATGGACATGGTGTAACAAGCATTTTAATGCACCTTGACACTATTTTGGTGGAAGATGGGATGG
TAGTTCAAGCTGGAGACCCATTGGGAACAGTGGGTGATACAGGTTTAGCTACAGGTCCGCATTTACATTGgtaagcatcttgtatttgttttaatttattgaaaatttgttgcttcatttttgtaagaacagacatcgttgctatttttaatttcttgtaaggaagctatttattgaggacaaattcaactgttccagta
taactaaaattaaaggagtaccctaaatagaagctttgtatatctctcaagtgcatatctacatgtacttatgtcattgattgcatcccagactagcatttgtgtaactgaatgcaatgcaaactagccctaggcggagaattttacaggggacatttaggctatgtattgtgttgtttgcagaaaatctttttctgggg
gtattgttcatatgggaataaatattcagtaattgatagtaaatactaaatagtaaataaactcaattcaggtacagccagcaatattcagttctgctgttattttttttcttttggagtttgttttatgaatatgattcattctgattaacaattggcaatcatcacaaggacag
CAGGTGAAGTCGAAGGGATCTGGA
AATGCCTGTTTTGTTGTTGAAGTTGAATTTCATGCCCTGGAATTTCTTCAGAGTTCTTGGTTATTAAACTTGTATTAAAATGTCTTCAAGTTTCCTTACTCTTCAACTGTCAACATACAGAACAGATAAAACATCATCTGCACAAACATTGCCAACAAATAGAACTTAAGTTTGCTATAGCCAAATTATCTACAATAAAC
TAGAAACTGTTTTATTGACCTCTGAGAACTTAGAAGGTTTGTGGGGAAGGACATTGGAATGTTCAATATATTCATGTGAAATGTTAAACATCCAGCAAATACATCGATCGTATATCGTCCTGCTCTCCAATTTCTTGAACAGTTTTTAGAATAGGATATGCTAGGCTTCTGGATGGCTTCAAAGATAAGGACATAATTGA
ACAGCATTGAGAATAGGACATGCTTGGCATGTGTCTGGCTTCAAAAGCTCAGGACATCAATTTTTCTTGTCCTATATCTGTTCTGGGATGATGATAATGACGTACAATTTTTGGACCAAGTATTCAGATCATCACTATGCC