sp|P38385|SC61G_ORYSJ ----> Protein transport protein Sec61 subunit gamma
Intron 1 GCAATTCTCT ... TAATTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 10.62 | 220 | 27.3 | 25 |
| A2 | 12.82 | 406.7 | 57.6 | 62 |
| A3 | 10.43 | 430 | 44.1 | 56 |
| A4 | 13.38 | 363.7 | 71.4 | 41 |
| A5 | 11.66 | 302 | 49.7 | 30 |
| A6 | 10 | 5994.1 | 562.1 | 770 |
| A7 | 10.14 | 3276.3 | 337.3 | 403 |
| A8 | 10.87 | 2223 | 221.6 | 321 |
| A9 | 10.97 | 3555.4 | 404.4 | 472 |
| A10 | 10.39 | 2579 | 250.4 | 348 |
>TRINITY_DN121159_c2_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformCGCAAAGTCTAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTCGGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAG
TGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATATTTTTGT
ATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTTTGTTAGTGAATTATATGGATTACAAATACTAAATTTTAACTACTACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATGTTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAAATCTTA
TCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTCTCCATTGGAAATTTTTAATATTCATGCTTTTAGGTAGCATTTGCTAGATTAATTGCGTGGAGTGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCTTTCATGATGTTATTTCTTTTATTTTCTAAATTTCC
CAGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCTACATTTCTTTTTAAAATGAACTCTTTGGGGTATATGATTGATTGTTTTAAACAATCGAAGATTGTTTATATTCTTATGTTATAATGTCCTGGTAATGGAGAAACGCATCTTCCTTAGTAGTAAAAGGGAATATTTTTGAAGTCACA
>TRINITY_DN121159_c2_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:CGCAAAGTCTAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGTTTAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTCGGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGgcaattctctgtctctttagttttgtttggtctattttgtgacgattttgctgaataaat
tgtgaaatattccgagttcattttgttgtcgagagcgtgttatcctgccgtatttggtacagattcctctcttttctgtattttcaaggttatatgtgtgcagatctggcattaattgtactaaagaatgatattgagggatggatttatgttgtaggccgataaaagaggttttattgcaaaatcctgtataaatttat
gtttattatgtctacaaggaggagtctgaacggtcctgattaaatttctgttcggttttgaaagatagggttttagaaaatttctggttttaaagcacatttatctccttgtttctgttgtttggaccttgatttggtagagtaattgcgcagtccgtctttgcgaggaaattggaattctatttattgtttaaaaaaaa
aatcaaactgtggcatagattgacgttttcaactggttaaatggaggtgatagtttgaaatcggcatggatatgatttagtttgagctgtggttaaattggagatctcttagaaactctagggtttggtgacattttaaaaccttttttatgtaatgtaatacagcaggctttctttttaattcggaccggtgaggggat
taaggggttttgttgtgaattccataaggattaccttcgagtgatctgatctctgaggatttaatgtataattggcagAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAA
CGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGG
Intron 2 GTACAGATTC ... TAATTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 55.98 | 19.7 | 3 | 25 |
| A2 | 53.45 | 54 | 11 | 62 |
| A3 | 50.92 | 54 | 18 | 56 |
| A4 | 52.56 | 37 | 9 | 41 |
| A5 | 50.88 | 29 | 9 | 30 |
| A6 | 49.85 | 774.7 | 10 | 770 |
| A7 | 49.71 | 407.7 | 6 | 403 |
| A8 | 49.92 | 322 | 5 | 321 |
| A9 | 49.63 | 479 | 11 | 472 |
| A10 | 50.22 | 345 | 2 | 348 |
>TRINITY_DN41384_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformTGCGGGGAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTCGGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGGCAATTCTCTGTCTCTTTAGTTTTGTTTGGTCTATTTTGTGACGATTTTGCCGAATAAAT
TGTGAAATATTCCGAGTTCATTTTGTTGTCGAGAGCGTGTTATCCTGCCGTATTTGAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCAT
GGGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATATTTTTGTATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTTTGTTAGTGAATTATATGGATTACAAAT
ACTAAATTTTAACTACTACAAGTCTACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATGTTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAAATCTTATCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTCTCCATTGGAAATTTTAATATTC
ATGCTTTTAGGTAGCATTTGCTAGATTAATTGCGTGGAGGGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCATTCATGATGCTATTTCTTTTATTTTCTAAATTTCCCAGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCTACATTTCTTTT
>TRINITY_DN41384_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:TGCGGGGAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTCGGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGGCAATTCTCTGTCTCTTTAGTTTTGTTTGGTCTATTTTGTGACGATTTTGCCGAATAAAT
TGTGAAATATTCCGAGTTCATTTTGTTGTCGAGAGCGTGTTATCCTGCCGTATTTGgtacagattcctctcttttctgtattttcaaggttatatgtgtgcagatctggcattaattgtactaaagaatgatattgagggatggatttatgttgtaggccgataaaagaggttttattgcaaaatcctgtataaatttat
gtttattatgtctacaaggaggagtctgaacggtcctgattaaatttctgttcggttttgaaagatagggttttagaaaatttctggttttaaagcacatttatctccttgtttctgttgtttggaccttgatttggtagagtaattgcgcagtccgtctttgcgaggaaattggaattctatttattgtttaaaaaaaa
aatcaaactgtggcatagattgacgttttcaactggttaaatggaggtgatagtttgaaatcggcatggatatgatttagtttgatctgttgttaaattggagatctcttagaaactctagggtttggtgacattttaaaaccttttttatgtaatgtaatacagcaggctttctttttaattcggaccggtgaggggat
taaggggttttgttgtgaattccataaggattaccttcgagtgatctgatctctgaggatttaatgtataattggcagAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAA
CGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATATTTTTGTATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTTTGTTA
GTGAATTATATGGATTACAAATACTAAATTTTAACTACTACAAGTCTACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATGTTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAAATCTTATCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTC
TCCATTGGAAATTTTAATATTCATGCTTTTAGGTAGCATTTGCTAGATTAATTGCGTGGAGGGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCATTCATGATGCTATTTCTTTTATTTTCTAAATTTCCCAGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCTACATTTCTTTT
Intron 3 GCAATTCTCT ... AATACAGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 55.32 | 21 | 26 | 11 |
| A2 | 52.59 | 55 | 61 | 9 |
| A3 | 52.87 | 41 | 46 | 25 |
| A4 | 57.36 | 55 | 74 | 12 |
| A5 | 52.53 | 47 | 52 | 5 |
| A6 | 52.13 | 562 | 612 | 8 |
| A7 | 51.6 | 349 | 372 | 8 |
| A8 | 51.9 | 228 | 246 | 10 |
| A9 | 52.22 | 399 | 436 | 10 |
| A10 | 52.45 | 252 | 278 | 12 |
>TRINITY_DN37501_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoformCTCGCAAAGTCTAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTCGGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGGCTTTCTTTTTAATTCGGACCGGTGAGGGGATTAAGGGGTTTTGTTGTGAATTCC
ATAAGGATTACCTTCGAGTGATCTGATCTCTGAGGATTTAATGTATAATTGGCAGAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCATG
GGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATATTTTTGTATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTTTGTTAGTGAATTATATGGATTACAAATA
CTAAATTTTAACTACTACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATATTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAAATCTTATCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTCTCCATTGGAAATTTTAATATTCATGCTTTTA
GGTAGCATTTGCTAGATTAATTGCGTGGAGGGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCATTCATGATGCTATTTCTTTTATTTTCTAAATTTCCCAGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCTACATTTCTTTTTAAAATGAACTCTTTGGGGTATATGATTGATTGTTTTA
AACAATCGAAGATTGTTTATATTCTTATGTTATAATGTCCTGATAATGGAGAAACGCATCTTCCTTAGTAGTAAAAGGGAATATTTTTGAAGTCACGAGATTAAAAGTTTTCAAAGTCTATTGATAGGATTTTCTCATGCCAGTTTCTGGCAATCTTGAATGCATTGAATGATATTTTTTTAATGCCCATCAAACTACCC
TATGTGCTCGAGCA
>TRINITY_DN37501_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:CTCGCAAAGTCTAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTCGGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGgcaattctctgtctctttagttttgtttggtctattttgtgacgattttgccgaa
taaattgtgaaatattccgagttcattttgttgtcgagagcgtgttatcctgccgtatttggtacagattcctctcttttctgtattttcaaggttatatgtgtgcagatctggcattaattgtactaaagaatgatattgagggatggatttatgttgtaggccgataaaagaggttttattgcaaaatcctgtataaa
tttatgtttattatgtctacaaggaggagtctgaacggtcctgattaaatttctgttcggttttgaaagatagggttttagaaaatttctggttttaaagcacatttatctccttgtttctgttgtttggaccttgatttggtagagtaattgcgcagtccgtctttgcgaggaaattggaattctatttattgtttaaa
aaaaaaatcaaactgtggcatagattgacgttttcaactggttaaatggaggtgatagtttgaaatcggcatggatatgatttagtttgatctgttgttaaattggagatctcttagaaactctagggtttggtgacattttaaaaccttttttatgtaatgtaatacagcagGCTTTCTTTTTAATTCGGACCGGTGAG
GGGATTAAGGGGTTTTGTTGTGAATTCCATAAGGATTACCTTCGAGTGATCTGATCTCTGAGGATTTAATGTATAATTGGCAGAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATT
CAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATATTTTTGTATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTT
TGTTAGTGAATTATATGGATTACAAATACTAAATTTTAACTACTACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATATTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAAATCTTATCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTCTCC
ATTGGAAATTTTAATATTCATGCTTTTAGGTAGCATTTGCTAGATTAATTGCGTGGAGGGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCATTCATGATGCTATTTCTTTTATTTTCTAAATTTCCCAGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCTACATTTCTTTTTAAAATGAAC
TCTTTGGGGTATATGATTGATTGTTTTAAACAATCGAAGATTGTTTATATTCTTATGTTATAATGTCCTGATAATGGAGAAACGCATCTTCCTTAGTAGTAAAAGGGAATATTTTTGAAGTCACGAGATTAAAAGTTTTCAAAGTCTATTGATAGGATTTTCTCATGCCAGTTTCTGGCAATCTTGAATGCATTGAATGA
TATTTTTTTAATGCCCATCAAACTACCCTATGTGCTCGAGCA
Intron 4 GCTTTCTTTT ... TAATTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 9.47 | 220 | 21 | 25 |
| A2 | 12.38 | 407 | 55 | 60 |
| A3 | 10.14 | 430 | 41 | 56 |
| A4 | 11.47 | 364 | 53.3 | 41 |
| A5 | 11.31 | 302 | 47 | 30 |
| A6 | 10 | 5994.7 | 561.3 | 770 |
| A7 | 10.27 | 3277 | 347.3 | 403 |
| A8 | 10.98 | 2223 | 227.7 | 321 |
| A9 | 10.89 | 3556 | 397.3 | 472 |
| A10 | 10.41 | 2579 | 251.7 | 348 |
>TRINITY_DN36210_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformGGCAAAGTGAACCCAATCCGGACTTTAATGTTAATTAAATTTTACTAATTAAACAAAATAAATGAGGAAATCCCACTTTATATAGCCCGCCTGCCTCGCAAAGTCTAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTC
GGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCT
TTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATATTTTTGTATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTTTGTTAGTGAATTATATGGATTACAAATACTAAATTTTAACTACT
ACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATATTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAAATCTTATCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTCTCCATTGGAAATTTTTAATATTCATGCTTTTAGGTAGCATTTGCTAG
ATTAATTGCGTGGAGGGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCATTCATGATGCTATTTCTTTTATTTTCTAAATTTCCCAGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCT
>TRINITY_DN36210_c0_g1_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:GGCAAAGTGAACCCAATCCGGACTTTAATGTTAATTAAATTTTACTAATTAAACAAAATAAATGAGGAAATCCCACTTTATATAGCCCGCCTGCCTCGCAAAGTCTAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTC
GGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGgctttctttttaattcggaccggtgaggggattaaggggttttgttgtgaattccataaggattaccttcgagtgatctgatctctgaggatttaatgtataattggcagAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAA
AGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATAT
TTTTGTATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTTTGTTAGTGAATTATATGGATTACAAATACTAAATTTTAACTACTACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATATTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAA
ATCTTATCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTCTCCATTGGAAATTTTTAATATTCATGCTTTTAGGTAGCATTTGCTAGATTAATTGCGTGGAGGGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCATTCATGATGCTATTTCTTTTATTTTCTAA
ATTTCCCAGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCT
Intron 5 GTAAGAAGCA ... TATTGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 36.12 | 212 | 16.7 | 120 |
| A2 | 22.97 | 248 | 19 | 74 |
| A3 | 24.03 | 262.3 | 15.3 | 83 |
| A4 | 25.93 | 232.3 | 20 | 81.3 |
| A5 | 26.82 | 175.3 | 11.3 | 64.3 |
| A6 | 23.55 | 3676 | 275 | 1133 |
| A7 | 22.17 | 1856.7 | 130.3 | 529 |
| A8 | 26.18 | 1614.7 | 118.3 | 572.7 |
| A9 | 22.52 | 2051.7 | 139.7 | 596.3 |
| A10 | 21.11 | 1457 | 98 | 390.3 |
>TRINITY_DN114758_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoformCGCAAAGTCTAGAGAGCCTGTGTTGTGTTTTAAGAGGTTTCCATTTTTGATATTGTTGGAGATTAGAAGGAATTTCAGCACGCTGAAGAGCAATCGCGCACCTCGGAAAACACGTAAACGTCGCGTAGGGTTTGAATCTGCAGAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAG
TGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTCATAAGCCAGACCGGAAAGAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCTTTGTTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGAATTTATGTGGGTCATGGTCGACAAGACTTGCATATTTTTGT
ATGTTAGACATTGTCAAATGATGTTGAAGTTTTACGTGAAATTACAGGTTTCTTTTGTTTTGTTAGTGAATTATATGGATTACAAATACTAAATTTTAACTACTACAATAGCAAATGCTTTTTGGTAGAGCGTTCAATGCGGATTAGTGACTTGTTATGAATATTGAAAATCTCTATTGATGTAGCAAGGTAAAATCTTA
TCTTGTATTTCTTGTTTTAACGGTTTAGCAGAGGCAAATTACAAGTCTCTTCATCTCTCCATTGGAAATTTTAATATTCATGCTTTTAGGTAGCATTTGCTAGATTAATTGCGTGGAGGGTTGGTCATGTTTCGAGTATTTGATGGCTATTTTTTCCAAATTCATTCATGATGCTATTTCTTTTATTTTCTAAATTTCCC
AGCATTTTAATACTTATTAAAGATTATGCAATTTTTCCTACATTTCTTTTTAAAATGAACTCTTTG
>TRINITY_DN114758_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:AATACAGCAGGCTTTCTTTTTAATTCTGACCGGTGAGGGGATTAAGGGGTTTTGTTGTGAATTCCATAAGGATTACCTTCGAGTGATCTGATCTCTGAGGATTTAATGTATAATTGGCAGAGTTATGGATGCTGTAGACACTGTTGTGAGGCCGTTGAAGGACTTTGCCAAAGATAGTGTCAGGCTTGTGAAGAGATGTC
ATAAGCCAGACCGGAAAGgtaagaagcatattctctattctagtgtacaatttttgtcatttatatctgcatatctatatttctggtgcttttagttttttaaatggttggtttggaatatgtttattgtgcagAATTCAGCAAAGTTGCATTCAGAACGGCGATTGGTTTTGTCGTCATGGGCTTTGTTGGGTTCTTTG
TTAAGTTGATTTTCATTCCAATCAACAACATCATCGTCGGATCTGGATAGGTAATTCTATCTATGGCTAAGACCATCTATGATTCCGTTGTATTTAACCTCTTATCCTGTATTATTCAGGTCAATTCCATAAGATAAAATGTTTTTCAAGAAATAAAACCTATATGCATTAAATTAACATGGATCCAGTCTGTAATTGAC
ACTGTATTTTGACCCCCAGAATTTCAGTTTCATTTTACAAATTGCAAAAAAGCATCATGTAAACAGTTCAGAGATGTTGCTCCCTCTTGCAACCCAGGTCAGAAGCACGTACATATCAGACTGAGTGCCATAATGAAATCCCCCAATTTACCACCTAAGATCATGACCTTTAACAACTTTTTCCTCTTGAAAAGCTGAGT
TTCAGTTACCACATCACAATTTTTTTCCCAAGGAAAACCTTGTGGGGAATCTTTGAGGCACTTCCCTGCAATTTGT