sp|Q9M2J5|MCC16_ARATH ----> MATH domain and coiled-coil domain-containing protein At3g58210
Intron 1 GTATGATTGA ... GTTGTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 18.47 | 64 | 22 | 7 |
| A2 | 14.29 | 42 | 8 | 6 |
| A3 | 17.57 | 61 | 16 | 10 |
| A4 | 22.98 | 62 | 21 | 16 |
| A5 | 24.24 | 25 | 13 | 3 |
| A6 | 12 | 11 | 1 | 2 |
| A7 | 12.94 | 37 | 7 | 4 |
| A8 | 21.74 | 9 | 3 | 2 |
| A9 | 18.64 | 24 | 8 | 3 |
| A10 | 13.04 | 20 | 3 | 3 |
>TRINITY_DN121356_c4_g3_i1 from sample A2 / Example spliced isoformAACATGTTACTACTGTTTGTTAGTAGTGTGCTCCCTAATGGGATCATTTTAATCTTTCTGTAGGTAATGGTTTCAGATGATGAGCAAGATGCACTGTCAACGGATCCAGATGAGCTTATTGATTCTGATGACAGCGAAGGAATCAGCGGGGATGAAGAAGATATTTTCAGAAGCCTTCTTGCCAGGGCAGGTTTTCATCT
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TCTCTTACTGCTGTTATAAGTACTATTTTCAAGGCTGCATCTGGGTGTCAACAAGTACCTCAAGCGGCAGGAGCAGTCCGTGGTAGACTGAAGAAGTTAGGAGCTGGTGTGTCTCCTCAGATTCTAGATTGTCTAAGAAACATAGTTGCTAGTCAGGCAGATGTCGCTGAAGCTCTACTGAGAGACATTGATTCTGATAG
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AAGATGTTTGCATTGATGTATGCAAAATTCAACAACATTAGAATTTGGGGTTTGATATATTCATCCAGTCCATACGTCCACTGTAACAGGTTTTCCGTTCAATGCCTTTTGAAGCAGTAATGTAGGTATTCTTTTCTACATCTTTGCTGAAGAACACTTGGAGATGCAATAGACAAAATTGTCTCGATGGTCTCCCGAAA
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TACTAGATGCAAAGAACCTGGATTGTGTTTTAATAGATCTTATATTATGATCTATTAAGTGCTGAGACGGATAAAAAACACCAGATACAAACTTAAATTTGTTTCTATACCCTTCTCAACCGCTTAATAGATCCTGATTTAAGATCTTTTATAGTGTATTTATAGTTGTAAAAAATGAGGTAAGATAAATAACATGTCTT
TTCTTCGAAATTATGGTAATTAAGAGAAAGAATACATTGCACTTTTTTTCATTTTTCTGAAGTCTTACACGTATACGCACACAGTTAGAAATATCTCCACCGACGCGCTGTAGAGCATTGCGCTTCCCTTGGTCCAGTGACTAAATTTGAGTTGCG
>TRINITY_DN121356_c4_g3_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:TCCACATTTAGGGTTTAAATTATCTGATACTCAAAAATAATATTAAAGATTTTTGGAATCCAATAAAATGTAAAATATAAAATCCCACGTCTGTCCTTGAATACAAATACTCTCCCATATTGGGCCTCCAGGACACCACTCTCCAGTGGAAAGAAGTTAACAGGAGGAGCAGCAGCAGTGCTCAGCAGTAATTAGAGGAA
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ATACAGCGTGATTCCTGGCATCGGTTTTCCACCAAGAAGAAGTCCCATGGCTGGTGTGACTTTACACCCAGCTCGACAGTCCTGGATCCCAAGGCTGGTTTCCTTCTGAATGACACGATCGTTGTCTTGGCGGAGATTCTTGTCCTACATGAGTCTGTGACGTTCTCCAGGGAGAATGAATTGCAGCCGATTGCCGGCCC
CATGCCAGAGGTCCTGAGTGGGAAGTTCTTGTGGAAGGTGCACAATTTGTCTCTGTTTAAGGAGATGATCAAGACGCAGAAGATCATGAGCCCTGTGTTTCCGGCCGGGGAATGCAATCTGCGGCTCAGTGTGTACCAATCGTCTGTTAATGGCATCGATTATCTGTCGATGTGCTTGGAGAGCAAGGATACCGATAAGT
CTGTTGTTACAGAGCGGAGCTGTTGGTGTCTCTTTCGCATGTCCGTTCTGAATCAGCGAGCTGGGATGAACCATATGCATCGGGATTCCTATGGCCGATTCGCAGGGGACAATAAGAGTGGTGACAATACGAGCCTTGGATGGAACGATTACATGCTAATGACAGATTTTGTATCTCCAGAGATGGGTTATTTGGTGGAT
GACACTGCTGTTTTCAGCGCTTCATTTCATGTCATCAAGGAGTCCAGTGGCTTTACTAGAAACCTTGGAACCGTAGGTGGAAGAAGCAATGTCAGAAAATCAGATGGTCATCAAGGGAAATTTACATGGAGAATTGAGAATTTCACAAGGTTAAAAGACATCCTTAAGAAAAGGAAAATAACGGGCCTATGTGTCAAGAG
TAGGCGATTTCAGGTTGGCAACCGCGACTGCCGTCTTATTGTGTACCCTAGAGGGCAATCACAACCCCCTTGTCACCTTTCAATGTTTCTCGAAGTTACAGATCCTCGTAACAATTCTGCTGATTGGAGTTGTTTTGTCAGTCACCGTTTATCAGTTGTGAATCAAAGATCTGAAGAAAAATCGGTTACAAAGGAGTCTC
AAAACCGTTATTCAAAGGCTGCTAAAGATTGGGGTTGGCGTGAATTTATTACCTTGACTAGTCTCTTTGACCAAGATTCAGGGTACTTGGTGCAAGACACAGTGGTCTTTTCTGCAGAGGTTCTCATTTTAAAGGAGACCTCTATAATGCAGGAGTGCTCAGATCATGAAGTAGATTCCAATGTCTCTAGAAGTGAAGCT
GGAAGAACTGTAAACAAAGGCACCTTCACATGGAAGGTTGAGAACTTTTTAGCTTTTAAAGAGATCATGGAGACAAGGAAAATCTTCAGCAAATTCTTTCAGGCTGGTGGTTGTGAGCTACGCATAGGTGTCTACGAGTCGTTTGATACTCTATGCATATACTTGGAAAGTGACCAATCTGTTGGAACTGATCCTGATAA
GAATTTCTGGGTGAGATATCGGATGGCAGTAGTGAATCAAAAACACTCTGATAAAACTGTCTGGAAGGAGTCATCCATATGTACAAAGACTTGGAATAATTCAGTTCTACAATTCATGAAAGTCTCTGACATGCTGGATCCAGATGCAGGGTTCCTTACACGTGATACAGTTGTGTTTGTATGCGAGATTCTGGATTGTT
GTCCTTGGTTCGAGTTTTCTGATCTTGAGGTAATGGTTTCAGATGATGAGCAAGATGCACTGTCAACGGATCCAGATGAGCTTATTGATTCTGATGACAGCGAAGGAATCAGCGGGGATGAAGAAGATATTTTCAGAAGCCTTCTTGCCAGGGCAGGTTTTCATCTTACATATGGTGATAATCCAACTCTTCTACTAGAC
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CCGGAGCAGTCTGATGAGCTGTTAAGACTGATTGTCAACTCCCTGAGGGCACTGGATGGTGCTGTGCCACAAGGCTGTTTAGAACCTCGGCGGCGACCAGAATCGGCACAGAAGATTGCTTTTGTTCTGGAGAGGTCTCCTAAACATTTGCAGCCAGATTTGATTTCGCTGGTGCCAAAACTTGTGGATGCATCTGAGCA
TTCGCTGGCTGCATATGCATTGTTAAACCAACTTCGCAAAACAGATGCAGAACCAGCTTTATGGCTACCTgtatgattgatccatcgatttatgtagttttctattaaatttgtatttcgtacaatccactgcttgaaaatatgtccttccttgaatgtgaagataaatcaaccactttaccttttcttatttgacagtt
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TAGACTGAAGAAGTTAGGAGCTGGTGTGTCTCCTCAGATTCTAGATTGTCTAAGAAACATAGTTGCTAGTCAGGCAGATGTCGCTGAAGCTCTACTGAGAGACATTGATTCTGATAGTGAAAAAGGTGAAAACGATTTCACAGAACCCACATCCATTGATGTGGTTGCTGATAACGAGAGTAGAGGTGCCGCAGGAAAAT
TACAGTTGACAGCAGAGCATGTGGCAAATGCATGTTGGCGTCTTGCAGATGTGTACATTCTTGTAGAGTTATTATTGGTACCTTCTCTTAGAGAAAAAGCACAGCATGTGTTTGAGAGAGCTATTGCTCGTGGGGCATTTGGGGAAAGGTCAATAGCAATGTTCATAGAAAGACGACATTCACAGAGGCCAATTATAGAT
TTCAGATGTAATGTTTCAGATAATCAGAGTTCACAGGCCTTTAGTACAGATTCTTCCGTTCAGCCCTTGCCTGAAGAGGATGAGGACTTCCCTGCTGTGCTTGGACTTGCTGAAGTGTTGATGCTCAGTAGGGACACTCGAGTGAGAGAATTTGTGAGTACTTTGTATGCAGTAATGTTTAAAGTATATCAAAATGAGGG
TTATCGGGATCGGATGTTGAGGGGACTAGTTGAGTGTGCAAGCAGAAACACAAATGGTCATCATGAAATGGACCTTGGCATGGATATTCTGGCATTTCTTTTACGAGAAGAGGAAGGAACTGCAAGACCTGTATTAAGCATGATGCACGAGGCAGCTCAACTCGCCAATGTTGATCGAGCTGCTATGTGGCAGCGGTTGT
GCGTGAGTGAAGAAGAATTAATTCGGGTTCGTGAAGATAGACAAGATGAAATTGCTAATATCAGTAAAGAAAATGTGCTTCTATCCCAAAGATTAGCTGATGCTGCAATGGCACAAGCACATCTCAAGGCTGAAATGAAGGCTGAACTGGAAAAATTTTCACGGGAGAAAAGGGATCTTTCAGAACGCTTGCAAGAAGCA
GAAAATCAACTAGAGTGGGTTCGATCAGAGCGAGCTGAAGAAATTGCTAAGTTAGCTGCTGATAGGAAGGTCCTTCAGGACAATTTGCGTGATGCAGAAACACAGCTTACACAACTGAAGACTCGTAAACGTGACGAATTAAAGAGGGTTGTCAAAGAGAAAAATGCACTTGCCGAGAGGCTAAAAAGTGCAGAGTCTGC
AAGGAAAAGATTTGATGAAGAGCTGAAACGATTTGCAACAGAAACTGTAACCCGAGAAGAAGTGCGACAATCATTGGAAAATGAGGTAAAACGTCTTAGACAAACAGTTGGACAGACTGAAGGAGGCCTAAGAGAGAAAGAAGATCAGATTATGCGATGCGAAAATTATATTGATGGGTTGGAGTCAAAATTAAATGCAT
GCCAGG