sp|Q9LIR4|ILVD_ARATH ----> Dihydroxy-acid dehydratase, chloroplastic
Intron 1 GTAAGAGCCT ... TGCATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 75.45 | 27 | 15 | 83 |
| A2 | 76.54 | 19 | 11 | 62 |
| A3 | 82.14 | 20 | 21 | 92 |
| A4 | 75.64 | 19 | 15 | 59 |
| A5 | 93.48 | 3 | 13 | 43 |
| A6 | 90.12 | 8 | 8 | 73 |
| A7 | 81.86 | 41 | 39 | 185 |
| A8 | 83.87 | 10 | 8 | 52 |
| A9 | 84.69 | 32 | 42 | 177 |
| A10 | 81.25 | 48 | 57 | 208 |
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoformCGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTACAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGTCTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTC
CGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTG
TCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTT
GCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAA
TATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAG
CTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCA
GAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGG
GTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAG
GGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGC
TTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTA
TGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAA
GAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTCATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAA
AATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCTGTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCT
TTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGAT
TAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGCG
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAgtaagagcctcgttgcatttcgctctcccctctccgatccatttcaactttcctctaaacttctaaaatctttctgcatttcagCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGT
CTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAAT
CGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGA
AGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAA
TGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACA
GCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGC
TCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGT
TGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGC
CTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTT
AACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGACCAGTGGGTTGGCTCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTCTGTGGTTCTGGTCTGTCTGAGTTCCACTGGGTTACCAGCCACTATTGTGGTTGGCAGTTGAGCTGCCCTCC
TTCTGGATATTCTGGGGAAGAGATCCAGTCAAGTTTTACTTGGAAAAAAAGATCAAACATTTTTATCCTAATCATATTCAAAGTTATTATTGAAAGGCCTTCCTGTCCTAGTCATCTACAAGTGAAATTGCTAAAACATAGAATGAAATTCCTCATGAGTCTTCTGCCAATTGATGTATTTAGTATTATTGCAGTGTGTT
TTTAGACAATAGAGCAACGTG
Intron 2 GTAATGTCTT ... CCTTTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 83.15 | 30 | 148 | 27 |
| A2 | 83.89 | 24 | 125 | 14 |
| A3 | 77.78 | 36 | 126 | 22 |
| A4 | 74 | 26 | 74 | 19 |
| A5 | 80 | 9 | 36 | 4 |
| A6 | 86.18 | 131 | 817 | 181 |
| A7 | 83.49 | 170.7 | 863.3 | 213 |
| A8 | 84.99 | 258 | 1461 | 450 |
| A9 | 87.17 | 140 | 951 | 292 |
| A10 | 81.14 | 109.7 | 471.7 | 163 |
>TRINITY_DN114755_c0_g4_i5 from sample A3 / Example spliced isoformCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGTCTATTGGA
AACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGCT
GAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGGAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCA
TGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGC
CTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATAC
CATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCGTTGAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTG
GCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTC
ATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCGGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTT
TTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATG
GAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAAT
AAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAATGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGAC
ATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGA
GCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGTACATACATTTCCCTTATTTCCATTGTAAGAGTTTGTTCAGTAAGAAATAGAGA
TGTTCTGT
>TRINITY_DN114755_c0_g4_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:GCCATGTATGCCCTGAGGCACAGACCAGTGGGTTGGCTCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGT
CTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAATGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTT
GGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGgtaatgtcttccccttatcaattttgcacctttctgaaaaccatgtatatcccattactttaaagagcaagagc
aatacaaagcactttctagtagattatcaaatagtgaattctataatgctttttacggtgaagtatttggaagagccaattttaacttgtgacgaggaaaatgatgcaatactagttattttgccttcttccatacatctttcattctccacaagttttaggaaatttgtatacagggattcatagttgtgcataataaa
catattgatgcatctgtaaatcgaaattagtttcagtaggttccaccagttggagctggagtgatctaagcatcaagggaattctgtttccttttgcctttgatcaagcagggtagatagaatcttcatgcaaaagcacagcagcgattggatccctctttgaacattttcttggtaatattcctgagttatggccttgc
ctttgacagGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAG
AATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGTACATACATTTCCCTTATTTCCATTGTAAGAGTTTGTTCAGTAAGAAATAGAGATGTTCTGT
Intron 3 GTGAGACACG ... GCTGATACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 11.54 | 333 | 48.9 | 43.5 |
| A2 | 14.13 | 322.9 | 41.9 | 53.2 |
| A3 | 12.85 | 288 | 44.9 | 42.5 |
| A4 | 12.81 | 258 | 41.2 | 37.9 |
| A5 | 6.87 | 74 | 9.7 | 5.5 |
| A6 | 8.14 | 468 | 67.3 | 41.5 |
| A7 | 10.11 | 770 | 109.3 | 86.6 |
| A8 | 10.51 | 525 | 62.5 | 61.7 |
| A9 | 7.71 | 645 | 82.9 | 53.9 |
| A10 | 6.8 | 596 | 77 | 43.5 |
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGT
CTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAAT
CGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGA
AGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAA
TGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACA
GCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGC
TCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGT
TGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGC
CTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTT
AACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACA
AAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATT
GTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTCATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTT
CTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCT
GTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTG
AACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAAT
AAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGCG
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CATAGATGGCGATTGTATAACTGGTGAGACTTCTCTTCTTTAACATTGGATGAGGCTGAGATCAGCTTTATACTGCTTGCTTAGAAACACACTTGCAATGATTGCAGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGgtgagacacgttataagtgaaagtatgattttgt
tgttcaattttggatgaatcaaaatttcaaatttcaatctattacgtgggtgctgatacagAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGT
TCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCA
CATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTA
TATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTG
CATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTCATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTA
TAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCTGTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTC
CACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGC
ATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTA
GTTAAGTAGCG
Intron 4 GTATGCATTT ... TTTTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 47.76 | 70 | 64 | 9 |
| A2 | 51.52 | 48 | 51 | 5 |
| A3 | 48.28 | 60 | 56 | 8 |
| A4 | 50 | 66 | 66 | 6 |
| A5 | 47.83 | 24 | 22 | 1 |
| A6 | 48.4 | 129 | 121 | 14 |
| A7 | 46.75 | 205 | 180 | 11 |
| A8 | 47.58 | 184 | 167 | 9 |
| A9 | 49.09 | 168 | 162 | 6 |
| A10 | 46.86 | 144 | 127 | 4 |
>TRINITY_DN47431_c0_g1_i8 from sample A7 / Example spliced isoformAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTT
TCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAG
AGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTC
AAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCCGAGGCACAGACCAGTGGGTTGGC
TCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTCTGTGGTTCTGGTCTGTCTGAGTTCCACTGGGTTACCAGCCACTATTGTGGTTGGCAGTTGAGCTGCCCTCCTTCTGGATATTCTGGGGAAGAGATCCAGTCAAGTTTTACTTGGAAAAAAAGATCAAACATTTTTATCCTAATCATATTCAA
AGTTATTATTGAAAGGCCTTCCTGTCCTAGTCATCTACAAGTGAAATTGCTAAAACATAGAATGAAATTCCTCATGAGTCTTCTGCCAATTGATGTATTTAGTATTATTGCAGTGTGTTTTTAGACAATAGAGCAACGTGACAAGCATTCTGGTGGTTGATGGTATTTATATTTAGTATTTATCAGAAAGAAATTTCTAT
TCCTCAACTACAGATTTTGAAGAGGGTACTTTCTTTGGCTGGGCACAAAGATGACTGATTTAAGGAACTATAAGCATCAATAGGAGTTTCAGATACACATTAGATTGTGCATGTATGTGTTTGAGCCTTTACAAGGTGACACATGCCAAAACTCCGGGCCATTCTAAAGATTATTTTGCCATATCTGATGAATATATGCT
AAATTTGAACTACCAATAGTTCATTGTATGTTTCAGAATTGCCATATTTGGACCCTACAGTGTAAATTGTTTTTTATTTTTATTTTTTGTATAATGGAATGGATACACAAACACACAAGCACATGGAGTACATTCGTTTCCATACCAGCAAAATTGAAAGGAAGATAGGGTACCCTATTTTTGGGGGTCCATACTGGGTA
CTGTATGATACAAGTATATGGGGGGTTGAATTAAGATAGGGTGTACTTGTTTTACTACTGATCTCTGATATCTGTGTTACCTTGCTTTAAATTTGTGTACATTTTGTCAAGCCTTACAAGTCCAATGAATTATTAAGGTTGGTCCTAATAGTTTTTTTTCATCATCTGTCCTTGCAACTTTAGGTTGGAGGTCCAATTGC
TTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAGGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTA
TGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAA
GAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTAATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAA
AATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCTGTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCT
TTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGAT
TAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGTACATACATTTCCCTTATTTCCATTGTAAGAGTTTGTTCAGTAAGAA
ATAGAGATGTTCTGTTCTGAAAGATGAATCTAATGTTATGCAAATCTTCTGTGCCAACGTTTGATTTTTATAAGTTGAAACTTGAGGTTATG
>TRINITY_DN47431_c0_g1_i7 from sample A7 / Example unspliced isoform:GCCAGGCTAATTAAATATTTGACCAACGCCATATTAATGAAAATGGCTCGTCGATTTTCCGAAAAGTCGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTC
AACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGTCTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTC
TTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGT
ATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCA
CAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGA
TGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAAC
TGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGG
AAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACA
CATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGA
TGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCCGAGGCACAGgtatgcatttgggtgttttgtcataaaaaatatctttcaacttgtaaaaaatgagctttatgtttt
tttttgaccaatctgtaacgtttatgcagtgttgcatgtatacacagtactgtatgggtaccgtactgggcatgcccatgtgttggtgacccaattgtgcacttgaacatcacttgatatctatctatgtatctatctatataagatattttttttttcagACCAGTGGGTTGGCTCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTC
AAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTCTGTGGTTCTGGTCTGTCTGAGTTCCACTGGGTTACCAGCCACTATTGTGGTTGGCAGTTGAGCTGCCCTCCTTCTGGATATTCTGGGGAAGAGATCCAGTCAAGTTTTACTTGGAAAAAAAGATCAAACATTTTTATCCTAATCATATTCAAAGTTATTATTGAAAGGCCTTCCTGT
CCTAGTCATCTACAAGTGAAATTGCTAAAACATAGAATGAAATTCCTCATGAGTCTTCTGCCAATTGATGTATTTAGTATTATTGCAGTGTGTTTTTAGACAATAGAGCAACGTGACAAGCATTCTGGTGGTTGATGGTATTTATATTTAGTATTTATCAGAAAGAAATTTCTATTCCTCAACTACAGATTTTGAAGAGG
GTACTTTCTTTGGCTGGGCACAAAGATGACTGATTTAAGGAACTATAAGCATCAATAGGAGTTTCAGATACACATTAGATTGTGCATGTATGTGTTTGAGCCTTTACAAGGTGACACATGCCAAAACTCCGGGCCATTCTAAAGATTATTTTGCCATATCTGATGAATATATGCTAAATTTGAACTACCAATAGTTCATT
GTATGTTTCAGAATTGCCATATTTGGACCCTACAGTGTAAATTGTTTTTTATTTTTATTTTTTGTATAATGGAATGGATACACAAACACACAAGCACATGGAGTACATTCGTTTCCATACCAGCAAAATTGAAAGGAAGATAGGGTACCCTATTTTTGGGGGTCCATACTGGGTACTGTATGATACAAGTATATGGGGGG
TTGAATTAAGATAGGGTGTACTTGTTTTAC
Intron 5 GTAATTCAGA ... TATGGAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.22 | 210.2 | 66 | 1 |
| A2 | 19.83 | 176.6 | 43 | 2 |
| A3 | 14.17 | 180.8 | 29 | 2 |
| A4 | 20.37 | 169.8 | 43 | 0 |
| A5 | 19.79 | 57.6 | 14 | 0 |
| A6 | 16.7 | 356 | 69 | 0 |
| A7 | 17.48 | 583.2 | 120 | 0 |
| A8 | 18.92 | 536.2 | 122 | 0 |
| A9 | 18.78 | 562.4 | 127 | 2 |
| A10 | 15.5 | 481.4 | 86 | 0 |
>TRINITY_DN47431_c0_g1_i5 from sample A7 / Example spliced isoformAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTT
TCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAG
AGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTC
AAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCCGAGGCACAGTGTTGCATGTATAC
ACAGTACTGTATGGGTACCGTACTGGGCATGCCCATGTGTTGGTGACCCAATTGTGCACTTGAACATCACTTGATATCTATCTATGTATCTATCTATATAAGATATTTTTTTTTTCAGACCAGTGGGTTGGCTCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTCTGTGGTTCTGGTCTGTCTGA
GTTCCACTGGGTTACCAGCCACTATTGTGGTTGGCAGTTGAGCTGCCCTCCTTCTGGATATTCTGGGGAAGAGATCCAGTCAAGTTTTACTTGGAAAAAAAGATCAAACATTTTTATCCTAATCATATTCAAAGTTATTATTGAAAGGCCTTCCTGTCCTAGTCATCTACAAGTGAAATTGCTAAAACATAGAATGAAAT
TCCTCATGAGTCTTCTGCCAATTGATGTATTTAGTATTATTGCAGTGTGTTTTTAGACAATAGAGCAACGTGACAAGCATTCTGGTGGTTGATGGTATTTATATTTAGTATTTATCAGAAAGAAATTTCTATTCCTCAACTACAGATTTTGAAGAGGGTACTTTCTTTGGCTGGGCACAAAGATGACTGATTTAAGGAAC
TATAAGCATCAATAGGAGTTTCAGATACACATTAGATTGTGCATGTATGTGTTTGAGCCTTTACAAGGTGACACATGCCAAAACTCCGGGCCATTCTAAAGATTATTTTGCCATATCTGATGAATATATGCTAAATTTGAACTACCAATAGTTCATTGTATGTTTCAGAATTGCCATATTTGGACCCTACAGTGTAAATT
GTTTTTTATTTTTATTTTTTGTATAATGGAATGGATACACAAACACACAAGCACATGGAGTACATTCGTTTCCATACCAGCAAAATTGAAAGGAAGATAGGGTACCCTATTTTTGGGGGTCCATACTGGGTACTGTATGATACAAGTATATGGGGGGTTGAATTAAGATAGGGTGTACTTGTTTTACCACCGATCTCTGA
TATCTGTGTTACCTTGCTTTAAATTTGTGTACATTTTGTCAAGCCTTACAAGTCCAATGAATTATTAAGGTTGGTCCTAATAGTTTTTTTT
>TRINITY_DN47431_c0_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:GCCAGGCTAATTAAATATTTGACCAACGCCATATTAATGAAAATGGCTCGTCGATTTTCCGAAAAGTCGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTC
AACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGTCTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTC
TTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGT
ATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCA
CAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGA
TGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAAC
TGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGG
AAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACA
CATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGA
TGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGgtaattcagagtgccattactgttgattgtctatttagcaatagtgaatggtattgagttcttgtattggagttttgagttcttgaatttatctttgtgtggctcaagcatatgttgggtcttatactcacatgattgcttagtgga
tgcttgtttcaattgatgctcctgtattcttgggtatgagttggctgctaacatgtctatttatggaacagGAAGTTGCTTTGTTAACAGAT
Intron 6 GTATGCATTT ... GTTTATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 50.53 | 46 | 48.8 | 7 |
| A2 | 46.22 | 43.8 | 39.3 | 9.5 |
| A3 | 50.78 | 35.5 | 42 | 2 |
| A4 | 51.3 | 40.8 | 49.5 | 7 |
| A5 | 51.83 | 14.3 | 16.5 | 2.8 |
| A6 | 47.02 | 95.8 | 91 | 6.5 |
| A7 | 48.08 | 135.8 | 135 | 8 |
| A8 | 48.63 | 123.8 | 125.5 | 6.8 |
| A9 | 49.23 | 119.8 | 121.8 | 6 |
| A10 | 49.45 | 93.5 | 95.3 | 0 |
>TRINITY_DN45152_c1_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoformCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTATGGGGATATCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAATAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAAGAGCCATGCATACATCGTCTATTGGAAACCTGG
TTGATTTGAAAACCCCCGTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGCTGAACAAG
TACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGGAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCATGGTGGG
CTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGCCTTAATC
GACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATACCATGGCA
AGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCGTTGAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCAC
TAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATG
GCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGT
CCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTT
TTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCCGAGGCACAGTGTTGCATGTATACACAGTACTGTATGGGTACCGTACTGGGCATGCCCATGTGTTGGTGACCCAATTGTGCACTTGAACATCACTTGATATCTATCTATGTATCTATCTATATAAGATATTTTTTTTTTCAGACCAGTGGGTTGGCTC
AATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTCTGTGGTTCTGGTCTGTCTGAGTTCCACTGGGTTACCAGCCACTATTGTGGTTGGCAGTTGAGCTGCCCTCCTTCTGGATATTCTGGGGAAGAGATCCAGTCAAGTTTTACTTGGAAAAAAAGATCAAACATTTTTATCCTAATCATATTCAAAG
TTATTATTGAAAGGCCTTCCTGTCCTAGTCATCTACAAGTGAAATTGCTAAAACATAGAATGAAATTCCTCATGAGTCTTCTGCCAATTGATGTATTTAGTATTATTGCAGTGTGTTTTTAGACAATAGAGCAACGTGACAAGCATTCTGGTGGTTGATGGTATTTATATTTAGTATTTATCAGAAAGAAATTTCTATTC
CTCAACTACAGATTTTGAAGAGGGTACTTTCTTTGGCTGGGCACAAAGATGACTGATTTAAGGAACTATAAGCATCAATAGGAGTTTCAGATACACATTAGATTGTGCATGTATGTGTTTGAGCCTTTACAAGGTGACACATGCCAAAACTCCGGGCCATTCTAAAGATTATTTTGCCATATCTGATGAATATATGCTAA
ATTTGAACTACCAATAGTTCATTGTATGTTTCAGAATTGCCATATTTGGACCCTACAGTGTAAATTGTTTTTTATTTTTATTTTTTGTATAATGGAATGGATACACAAACACACAAGCACATGGAGTACATTCGTTTCCATACCAGCAAAATTGAAAGGAAGATAGGGTACCCTATTTTTGGGGGTCCATACTGGGTACT
GTATGATACAAGTATATGGGGGGTTGAATTAAGATAGGGTGTACTTGTTTTACTACTGATCTCTGATATCTGTGTTACCTTGCTTTAAATTTGTGTACATTTTGTCAAGCCTTACAAGTCCAATGAATTATTAAGGTTGGTCCTAATAGTTTTTTTTTCA
>TRINITY_DN45152_c1_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:CCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTATGGGGATATCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAATAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAAGAGCCATGCATACATCGTCTATTGGAAACCTGG
TTGATTTGAAAACCCCCGTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGCTGAACAAG
TACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGGAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCATGGTGGG
CTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGCCTTAATC
GACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATACCATGGCA
AGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCGTTGAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCAC
TAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATG
GCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGT
CCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTT
TTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCCGAGGCACAGgtatgcatttgggtgttttgtcataaaaaatatctttcaacttgtaaaaaatgagctttatgtttttttttgaccaatctgtaacgtttatgcagTGTTGCATGTATACACAGTACTGTATGGGTACCGTACTGGGCATGCCCATGTG
TTGGTGACCCAATTGTGCACTTGAACATCACTTGATATCTATCTATGTATCTATCTATATAAGATATTTTTTTTTTCAGACCAGTGGGTTGGCTCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTCTGTGGTTCTGGTCTGTCTGAGTTCCACTGGGTTACCAGCCACTATTGTGGTTGGCAGTT
GAGCTGCCCTCCTTCTGGATATTCTGGGGAAGAGATCCAGTCAAGTTTTACTTGGAAAAAAAGATCAAACATTTTTATCCTAATCATATTCAAAGTTATTATTGAAAGGCCTTCCTGTCCTAGTCATCTACAAGTGAAATTGCTAAAACATAGAATGAAATTCCTCATGAGTCTTCTGCCAATTGATGTATTTAGTATTA
TTGCAGTGTGTTTTTAGACAATAGAGCAACGTGACAAGCATTCTGGTGGTTGATGGTATTTATATTTAGTATTTATCAGAAAGAAATTTCTATTCCTCAACTACAGATTTTGAAGAGGGTACTTTCTTTGGCTGGGCACAAAGATGACTGATTTAAGGAACTATAAGCATCAATAGGAGTTTCAGATACACATTAGATTG
TGCATGTATGTGTTTGAGCCTTTACAAGGTGACACATGCCAAAACTCCGGGCCATTCTAAAGATTATTTTGCCATATCTGATGAATATATGCTAAATTTGAACTACCAATAGTTCATTGTATGTTTCAGAATTGCCATATTTGGACCCTACAGTGTAAATTGTTTTTTATTTTTATTTTTTGTATAATGGAATGGATACA
CAAACACACAAGCACATGGAGTACATTCGTTTCCATACCAGCAAAATTGAAAGGAAGATAGGGTACCCTATTTTTGGGGGTCCATACTGGGTACTGTATGATACAAGTATATGGGGGGTTGAATTAAGATAGGGTGTACTTGTTTTACTACTGATCTCTGATATCTGTGTTACCTTGCTTTAAATTTGTGTACATTTTGT
CAAGCCTTACAAGTCCAATGAATTATTAAGGTTGGTCCTAATAGTTTTTTTTTCA
Intron 7 GTGAGACTTC ... ATGATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0.76 | 328 | 2 | 3 |
| A2 | 0.8 | 247 | 1 | 3 |
| A3 | 0.21 | 243 | 0 | 1 |
| A4 | 0.21 | 234 | 0 | 1 |
| A5 | 0 | 87 | 0 | 0 |
| A6 | 0.24 | 421 | 1 | 1 |
| A7 | 0 | 708 | 0 | 0 |
| A8 | 0.1 | 477 | 0 | 1 |
| A9 | 0 | 562 | 0 | 0 |
| A10 | 0 | 575 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGT
CTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAAT
CGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGA
AGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAA
TGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACA
GCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGC
TCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGT
TGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGC
CTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTT
AACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACA
AAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATT
GTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTCATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTT
CTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCT
GTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTG
AACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAAT
AAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGCG
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:CATAGATGGCGATTGTATAACTGgtgagacttctcttctttaacattggatgaggctgagatcagctttatactgcttgcttagaaacacacttgcaatgattgcagTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGGTGAGACACGTTATAAGTGAAAGTATGATTTTGT
TGTTCAATTTTGGATGAATCAAAATTTCAAATTTCAATCTATTACGTGGGTGCTGATACAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGT
TCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCA
CATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTA
TATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTG
CATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTCATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTA
TAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCTGTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTC
CACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGC
ATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTA
GTTAAGTAGCG
Intron 8 GTCTGTGGTT ... GCAACTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 51.82 | 53 | 16 | 57 |
| A2 | 49.63 | 68 | 10 | 67 |
| A3 | 46.77 | 66 | 12 | 58 |
| A4 | 47.62 | 33 | 6 | 30 |
| A5 | 50 | 4 | 5 | 4 |
| A6 | 50.72 | 103 | 16 | 106 |
| A7 | 47.94 | 227 | 14 | 209 |
| A8 | 50.25 | 201 | 33 | 203 |
| A9 | 48.56 | 215 | 10 | 203 |
| A10 | 49.06 | 135 | 8 | 130 |
>TRINITY_DN42753_c0_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoformGTTTTGAGTTCTTGAATTTATCTTTGTGTGGCTCAAGCATATGTTGGGTCTTATACTCACATGATTGCTTAGTGGATGCTTGTTTCAATTGATGCTCCTGTATTCTTGGGTATGAGTTGGCTGCTAACATGTCTATTTATGGAACAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGT
TGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGACCAGTGGGTTGGCTCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAA
GTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGC
CTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGG
>TRINITY_DN42753_c0_g1_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:CATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAAGAGCCATGCATACATCGTCTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACC
CCCGTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGT
CACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGGAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACA
CTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATG
GTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGAC
CATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCGTTGAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGC
ATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACT
GTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCGGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTT
CGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCAC
ATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCCGAGGCACAGGTATGCATTTGGGTGTTTTGTCATAAAAAATATCTTTCAACTTGTAAAAAATGAGCTTTATGTTTTTTTTTGACCAATCTGTAACGTTTATGCAGTGTTGCATGTATACACAGTACTGTATGGGTACCGTACTGGGCATGCCCATGTGTTGGTGACCCAATT
GTGCACTTGAACATCACTTGATATCTATCTATGTATCTATCTATATAAGATATTTTTTTTTTCAGACCAGTGGGTTGGCTCAATTGGTTCAAATGGACTGTTTCAAGGTGGAGGTCGCTGTAAGgtctgtggttctggtctgtctgagttccactgggttaccagccactattgtggttggcagttgagctgccctcctt
ctggatattctggggaagagatccagtcaagttttacttggaaaaaaagatcaaacatttttatcctaatcatattcaaagttattattgaaaggccttcctgtcctagtcatctacaagtgaaattgctaaaacatagaatgaaattcctcatgagtcttctgccaattgatgtatttagtattattgcagtgtgtttt
tagacaatagagcaacgtgacaagcattctggtggttgatggtatttatatttagtatttatcagaaagaaatttctattcctcaactacagattttgaagagggtactttctttggctgggcacaaagatgactgatttaaggaactataagcatcaataggagtttcagatacacattagattgtgcatgtatgtgtt
tgagcctttacaaggtgacacatgccaaaactccgggccattctaaagattattttgccatatctgatgaatatatgctaaatttgaactaccaatagttcattgtatgtttcagaattgccatatttggaccctacagtgtaaattgttttttatttttattttttgtataatggaatggatacacaaacacacaagca
catggagtacattcgtttccataccagcaaaattgaaaggaagatagggtaccctatttttgggggtccatactgggtactgtatgatacaagtatatggggggttgaattaagatagggtgtacttgttttactactgatctctgatatctgtgttaccttgctttaaatttgtgtacattttgtcaagccttacaagt
ccaatgaattattaaggttggtcctaatagtttttttttcatcatctgtccttgcaactttagGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGT
TAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTA
AGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTAATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAG
TAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCTGTAA
ATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACC
AGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAATAAAT
GCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGTACATACATTTCCCTTATTTCCATTGTAAGAGTTTGTTCAGTAAGAAATAGAGATGTTCTGTTCTGAAAGATGAATCTAATGTTATGCAAATCTTCTGTGCCAACGTTTGATTTTTATAAGTTGAAACTTGAGGTTATGCAACTATGACC
Intron 9 GTGCAGTTTT ... AGGCTTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.53 | 251.7 | 33 | 97 |
| A2 | 21.83 | 191 | 40.7 | 66 |
| A3 | 20.52 | 153 | 28 | 51 |
| A4 | 20.76 | 215 | 34.7 | 78 |
| A5 | 21.05 | 75 | 23 | 17 |
| A6 | 20.36 | 277 | 40.7 | 101 |
| A7 | 20.04 | 479.7 | 85.3 | 155 |
| A8 | 18.3 | 425 | 66.3 | 124 |
| A9 | 20.49 | 458 | 84 | 152 |
| A10 | 19.84 | 410 | 54 | 149 |
>TRINITY_DN120535_c5_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAAGAGCCATGCATACATCGTCTATTGG
AAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCGTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGC
TGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGC
ATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCG
CCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATA
CCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGT
GGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCT
CATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCGGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATT
TTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGAT
GGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCCGAGGCACAGGTTGGAGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAA
TAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGA
CATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTAATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAGTAG
ATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCTGTAAATC
GAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACCAGG
GCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCG
TAACCTCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGTACATACATTTCCCTTATTTCCATTG
>TRINITY_DN120535_c5_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:CCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAAGAGCCATGCATACATCGTCTATTGG
AAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCGTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGC
TGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGC
ATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCG
CCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATA
CCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGT
GGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCT
CATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGGTGAGACACGTTATAAGTGAAAGTATGATTTTGTTGTTCAATTTTGGATGAATCAAAATTTCAAATTTCAATCTATTACGTGGGTGCTGATACAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAA
TCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCGGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGgtgcagtttttggatggatttgttatgttaatttctagagagtatatgtattgagacgtgataatgtagattccatttgtagtgaggttcctggatttt
attattagtattttctcaaatatatgaggcttccagGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGT
CTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGC
AAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAA
GGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTAATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGA
GCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGC
ATAATAAACATATTGATGCATCTGTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTAT
GGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGT
GATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCTCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGTACATACATTTCCCTTATTTCCATTG
Intron 10 GTTAAGGACC ... TCAATGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 18.39 | 213 | 48 | 0 |
| A2 | 20.14 | 115 | 29 | 0 |
| A3 | 20.33 | 145 | 37 | 0 |
| A4 | 20.67 | 165 | 43 | 0 |
| A5 | 19.44 | 58 | 14 | 0 |
| A6 | 17.14 | 145 | 30 | 0 |
| A7 | 16.72 | 239 | 48 | 0 |
| A8 | 19.69 | 155 | 38 | 0 |
| A9 | 21.73 | 245 | 68 | 0 |
| A10 | 21.35 | 210 | 57 | 0 |
>TRINITY_DN120535_c5_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoformCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAAGAGCCATGCATACATCGTCTATTGG
AAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCGTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAATCGCAAGC
TGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGC
ATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCG
CCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATA
CCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGT
GGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGTTGGGGCT
CATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGGTGAGACACGTTATAAGTGAAAGTATGATTTTGTTGTTCAATTTTGGATGAATCAAAATTTCAAATTTCAATCTATTACGTGGGTGCTGATACAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAA
TCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCGGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGCCTTTATTTTTCAGGTGCAGTTTTTGGATGGATTTGTTATGTTAATTTCTAGAGAGTATATGTATTGAGACGTGATAATGTAGATTCCATTTGTAGTGAGGTTCCTGGATTTT
ATTATTAGTATTTTCTCAAATATATGAGGCTTCCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGT
CTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTTAACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGC
AAAGTGGTCTCCTCCACCATACAAAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAA
GGCCTTTTGGAGATGTCATTATTGTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTAATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGA
GCAAGAGCAATACAAAGCACTTTCTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGC
ATAATAAACATATTGATGCATCTGTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTAT
GGCCTTGCCTTTGACAGGATTTGAACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGT
GATACTAGAATAGGAGCAATAATAAATGCGTAACCTCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGTACATACATTTCCCTTATTTCCATTG
>TRINITY_DN120535_c5_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGAAGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAAT
GTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAATGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGT
GGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACAGCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGG
ATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGCTCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGgttaaggacccttgtacttaaattaaaagtacagcattcaatttctgtatggtggaagctgtccagaattcattaatgctcttttccctggagtttattctga
ttattttacgttggttgttcaatggcagATCGGTTGGTTTAGAGTTGA
Intron 11 GTATGCCATA ... TCTTAATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.76 | 283 | 57 | 3 |
| A2 | 8.72 | 157 | 15 | 0 |
| A3 | 13 | 194 | 29 | 0 |
| A4 | 14.53 | 200 | 34 | 0 |
| A5 | 14.74 | 81 | 14 | 0 |
| A6 | 10.42 | 318 | 37 | 0 |
| A7 | 10.58 | 575 | 68 | 0 |
| A8 | 7.83 | 353 | 30 | 0 |
| A9 | 12.64 | 477 | 69 | 0 |
| A10 | 8.21 | 436 | 39 | 0 |
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGT
CTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAAT
CGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGA
AGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAA
TGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACA
GCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGC
TCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGGTTGGAGGAACACCAGCAGTAATTCGATACCTATTAGAGT
TGGGGCTCATAGATGGCGATTGTATAACTGTTACAGGAAAGACGCTTGGAGAAAATGTAAAGTATTGTCCTCCTTTAACAGAGGGTCAGAAAGTAATAAGGCCCTTAGAAAATCCAATCAAATCAACTGGACACATTCAGATATTGTATGGCAACTTAGCACCAGAGGGTTCTGTTGCAAAGATTACAGGGAAGGAGGGC
CTTTATTTTTCAGGTCCTGCTCTTGTGTTCGAAGGAGAAGAGTCCATGTTGGCAGCTATTTCAGAGAATCCACAAAGCTTCAAGGGTTCAGTTGTTGTTATAAGGGGAGAGGGCCCAATGGGTGGGCCTGGGATGCCAGAGATGCTAACTCCTACTAGTGCCATTATGGGTGCCGGTCTTGGCAAGGAAGTTGCTTTGTT
AACAGATGGAAGGTTTTCAGGTGGTTCACATGGATTCGTTGTTGGCCATGTATGCCCTGAGGCACAGGTTGGGGGTCCAATTGCTTTGGTCCAAAATGGAGATATGATCACTATTGATGTGAGTAAACGGAGAATAGACGTGGCCTTGACAGAAAAAGAATTTGCAGAGAGGAAGGCAAAGTGGTCTCCTCCACCATACA
AAGTTAATAAAGGAACATTGTACAAGTATATCAAGAATGTAAAATCAGCCTCTGAGGGCTGCGTGACAGATGAATAAAACGTTATGCGAATAAATGCTTTACAAGTTTCAGGTATTAAGGTGTGTCTGATGTGTAATGCACTTCGACTTTTATGGCTACTTAAGTTTCTCCAGTGAAGGCCTTTTGGAGATGTCATTATT
GTTAAGACATTGGTTGAGGTCTACAGTGCATAAGGGGATTGTTCTGAATATTTAATTCAACATCAGTGCATATAATGCAACGAAGAAGTTGCTGAGCTTTTCTTGTCAAGGGTCATGTCTTCCCCTTATCAATTTTGCACCTTTCTGAAAACCATGTATATCCCATTACTTTAAAGAGCAAGAGCAATACAAAGCACTTT
CTAGTAGATTATCAAATAGTGAATTCTATAATGCTTTTTACGGTGAAGTATTTGGAAGAGCCAATTTTAACTTGTGACGAGGAAAATGATGCAATACTAGTTATTTTGCCTTCTTCCATACATCTTTCATTCTCCACAAGTTTTAGGAAATTTGTATACAGGGATTCATAGTTGTGCATAATAAACATATTGATGCATCT
GTAAATCGAAATTAGTTTCAGTAGGTTCCACCAGTTGGAGCTGGAGTGATCTAAGCATCAAGGGAATTCTGTTTCCTTTTGCCTTTGATCAAGCAGGGTAGATAGAATCTTCATGCAAAAGCACAGCAGCGATTGGATCCCTCTTTGAACATTTTCTTGGTAATATTCCTGAGTTATGGCCTTGCCTTTGACAGGATTTG
AACCAGGGCATTATCTGTGTCTAAGAGCATTGATTCAACAAGCAATGGTACTAATTAGTTAAGGTTCACCTCAGGTGATATGATTAGTTGAGCAGCCATATTGCATGTTTCTGCTTTGTTATGTATTGCTTCAAGGGTGGTTCTCTTTATAGCTGTATAGTAATAGCTCATCTATGTGATACTAGAATAGGAGCAATAAT
AAATGCGTAACCCCTTTGAAGATCTTTAGTTAAGTAGCG
>TRINITY_DN128765_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CGTTTACCCTATGCGCCCTCCTCGTGTGCCATAAACCCTTTCTGGGGATAGCGCTGGCGGACTGAAATCCTAAAACCCATTCAATCTAGTAAGAGCCTCGTTGCATTTCGCTCTCCCCTCTCCGATCCATTTCAACTTTCCTCTAAACTTCTAAAATCTTTCTGCATTTCAGCAAAATAAAATAGCCATGCATACATCGT
CTATTGGAAACCTGGTTGATTTGAAAACCCCCTTGCATTATCAAGGCCGACGAGATATACTCCTCGCCAGACTGAGACCCAGTCCGAATAAAACTACATGGAACCGCCACCGCAGCTTCAGATGCGCTGCTTCTTCTCCCACATCATCTGTTGCTCAGCCGGAGGCGCCTCCAGCCACTGTGGAGGATGCGGATTCGAAT
CGCAAGCTGAACAAGTACAGCAGCAGAGTCACCCAGCCCAAGTCCCAGGGAGGATCGCAGGCTGTCCTCTATGGCGTGGGTCTGTCCGAGAAAGATATGAGCAAGCCCCAGGTGGGTATATCTTCCGTTTGGTATGAGGGGAATACATGCAATATGCATTTGCTCAAGCTGGCGGAGGCCGTCAAGGAGGGCGTTACAGA
AGCAGGCATGGTGGGCTTCCGTTTCAACACTGTGGGTGTGAGTGATGCCATCTCCATGGGCACTAGAGGCATGAGCTACAGCTTGCAGTCGAGAGACCTCATTGCTGATAGCATTGAGACCGTCATGGGCGCACAGTGGTACGATGCCAATGTCTCCCTACCTGGTTGTGACAAAAATATGCCTGGTACCATTATGGCAA
TGGGGCGCCTTAATCGACCTAGCATTATGGTTTATGGAGGGACCATCAAGCCTGGTCATTTCCAAGGTCACACCTATGACATAATATCAGCCTTTCAGTGCTATGGGGAATATGTCAATGGGTCAATCACCGATGAGCAGCGTATGGATGTGGTGCGCAATTCTTGTCCCGGTGCAGGAGCATGTGGTGGCATGTATACA
GCCAATACCATGGCAAGTGCAATTGAGACCATGGGCATGAGCCTTCCTTACAGTTCTTCAACACCTGCAGAGGACCCATTAAAGCTGGATGAATGCCGTTTGGCAGGCAAATATCTTATGGAACTGATAAAACTGGATTTGAAACCAAGGGATATCATCACCATGAAGTCCCTACAAAATGCAATGGTTATTACAATGGC
TCTAGGTGGCTCCACTAATGCCGTCTTGCATTTGATTGCCATTGCCAGATCGGTTGGTTTAGAGTTGACACTGGATGATTTTCAGAGGATCAGTGATCAGGTGCCTTTTCTTGCAGATCTCAAGCCCAGTGGGAAATATGTAATGGAAGACCTTCATAAGgtatgccatacttttccatatttttgtggcatttctcttt
tgcattacatatctaatttcttcctccatcagaggaggttatatgatacattgcattactaccagtgaacaattcatatttcattccttgtaactggttagagcttcattcttaatcagGTTGGAGGAACACCAGCAGTA