sp|Q8VWI1|ERD2B_ARATH ----> ER lumen protein-retaining receptor B

Intron 1 GTAAGATTCT ... GGTTTTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	15.94	58	15.2	11
A2	6.67	56	11	4
A3	9.38	87	20.4	9
A4	13.16	66	16.4	10
A5	12.73	48	7.4	7
A6	9.57	359	72.4	38
A7	6.13	251	51.2	16.4
A8	11.33	227	44.6	29
A9	4.82	237	49.4	12
A10	11.66	197	50.2	26

>TRINITY_DN112571_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGTGAAGCAATATTGTACCAAGATCTCTATAACGTGTACGCATTTAAGACCTCGATTGATCAAGTATTTTATTCACTCTCCAGCAGAAATGTATTTTGCTTCTGAATCCCTTCTCTGCTGCTAGGTGCCTTTCTACATCTCGTATATTTCGCGAGCTCGCCATGTGTGCCAAGCAAATTCCTCTACATTGTTCTGGAAT
CTCGGATCCCTGCTATTCTCACTGCCTGGCACCTTGAGGTTGTCGGTTCGAATCCATTCCGCACCATTGATTCCGAAATCGCAAGGGTTTGTTTTGGTTTCGGAACGGTTCCATCGCACTGTTCTGACCCCAGTTCCTGGATCCGGGGATTTCCAAGGAGCGGCAGGCTGTGTAACGAGCGAAAATGAATATCTTCAGGT
TAGCAGGGGACATGACGCATTTAATGAGCGTCCTGGTCCTGCTGCTGAAGATCCACACCATTAAATCCTGCGCAGGGATTTCGTTGAAGACTCAGGAGCTTTACGCTCTTGTGTTTGTTACCCGTTACTTGGATTTATTCTCCGACTATATATCGTTCTACAATACCGTAATGAAGATGATCTTTATAGCGAGTTCAATT
TCCATTGTGTGGTACATGAGGAGCCACAAAATCGTGAGGAGATCATATGACAAGGAGCAAGACACTTTCAGGCATTATCTCCTCGTCATACCCTGCTTCATCTTGGCTCTCCTCTTACACGACAAGTTTACATTCAGAGAGGTTCTCTGGGCATTCTCTATTTACCTGGAAGCAGTCGCTATTCTTCCGCAGTTAGTTTT
ATTACAGAGGAGCAGGAACATAGACAACTTGACAGGGCAATATGTTTTCTTTCTTGGGGCTTACAGGGGGTTCTACATCCTAAATTGGATTTATCGCTATTTCACTGAAAGACATTACTTCCGATTGATACCTTGGGTATCTGGGCTCGTGCAGACAGCACTTTATGCAGATTTCTTTTACTACTATTTCAAAAGCTGGA
AAAACAATGAGAAGCTGCAGCTACCAGCTTAGTTTTCACTTTGGAATTGATTCTCCATGCAAGGAGTTTTGATTTGAGCAAATCCATTCTTGCTACAATGCTATGTAAATCTTCTCGTTGAAGGTTAGGTTGTTTATGATAACAAACCCCCTTTTCAAATTGTTTTACCTAGCTAATGTAACCACTTATTCAGTATGTCA
TCAGATTCTGATAAAATATAGAGCTATCAGAATCTTGTGAACTTAATTAACTCTACAAGCCAATTCTTTTATCAGTACTCCAGAAGTTTCATCTTCAAGATAATAGGCATGCGTTAGAAATTTTCTTTGGGAGTCTTACTAAGCTAGTCCATTGATTTATACTAGAATGTTTAAGATATTAAGAATCAAGATGATTCGAG
ATTATGGTGATGCAGAAAACTATTAGGATATACTCTTCCTGCTGCGAAATCAGACTATTATTCTGGCTTCTTACCTGCCACCACATTTACAGATGTGAGTGTTGCAGATTTTGAATGTAATTATTTGGTGACTGTAGATTTCCTTTCAGTCAAGAGACTGTGCCTAGAATTTTTCAGGCCTTGCAGGTTATTTAATAATG
CAACACATAAATTTGTTATTATTTTGTCTGAAAGGATCTATCAACAAACAGGATTGTAATTTTTAAATTGACAATTATAAATAAGATTTTCTCATTCCTGAA

>TRINITY_DN112571_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTCTTTTACTACTATTTCAAAAGgtaagattctttaatctgcagcaaccgattgccttaaaacttttatgtatatttttcatttatttagtcaaggcttacatagggttggccatttatcactgaactactccatggttttacagCTGGAAAAACAATGAGAAGCTGCAGCTACCAGCTTAGTTTTCACTTTGGAATTGA
TTCTCCATGCAAGGAGTTTTGATTTGAGCAAATCCATTCTTGCTACAATGCTATGTAAATCTTCTCGTTGAAGGTTAGGTTGTTTATGATAACAAACCCCCTTTTCAAATTGTTTTACCTAGCTAATGTAACCACTTATTCAGTATGTCATCAGATTCTGATAAAATATAGAGCTATCAGAATCTTGTGAACTTAATTAA
CTCTACAAGCCAATTCTTTTATCAGTACTCCAGAAGTTTCATCTTCAAGATAATAGGCATGCGTTAGAAATTTTCTTTGGGAGTCTTACTAAGCTAGTCCATTGATTTATACTAGAATGTTTAAGATATTAAGAATCAAGATGATTCGAGATTATGGTGATGCAGAAAACTATTAGGATATACTCTTCCTGCTGCGAAAT
CAGACTATTATTCTGGCTTCTTACCTGCCACCACATTTACAGATGTGAGTGTTGCAGATTTTGAATGTAATTATTTGGTGACTGTAGATTTCCTTTCAGTCAAGAGACTGTGCCTAGAATTTTTCAGGCCTTGCAGGTTATTTAATAATGCAACACATAAATTTGTTATTATTTTGTCTGAAAGGATCTATCAACAAACA
GGATTGTAATTTTTAAATTGACAATTATAAATAAGATTTTCTCATTCCTGAA

Intron 2 GTACGTGAAT ... GGTGGAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.01	50	11	26
A2	21.57	40	7	15
A3	24.66	55	15	21
A4	25.12	79	12	41
A5	22.58	36	5	16
A6	17.95	224	40	58
A7	19.26	174	33	50
A8	18.52	154	26	44
A9	16.79	228	39	53
A10	18.24	130	34	24

>TRINITY_DN112571_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGTGAAGCAATATTGTACCAAGATCTCTATAACGTGTACGCATTTAAGACCTCGATTGATCAAGTATTTTATTCACTCTCCAGCAGAAATGTATTTTGCTTCTGAATCCCTTCTCTGCTGCTAGGTGCCTTTCTACATCTCGTATATTTCGCGAGCTCGCCATGTGTGCCAAGCAAATTCCTCTACATTGTTCTGGAAT
CTCGGATCCCTGCTATTCTCACTGCCTGGCACCTTGAGGTTGTCGGTTCGAATCCATTCCGCACCATTGATTCCGAAATCGCAAGGGTTTGTTTTGGTTTCGGAACGGTTCCATCGCACTGTTCTGACCCCAGTTCCTGGATCCGGGGATTTCCAAGGAGCGGCAGGCTGTGTAACGAGCGAAAATGAATATCTTCAGGT
TAGCAGGGGACATGACGCATTTAATGAGCGTCCTGGTCCTGCTGCTGAAGATCCACACCATTAAATCCTGCGCAGGGATTTCGTTGAAGACTCAGGAGCTTTACGCTCTTGTGTTTGTTACCCGTTACTTGGATTTATTCTCCGACTATATATCGTTCTACAATACCGTAATGAAGATGATCTTTATAGCGAGTTCAATT
TCCATTGTGTGGTACATGAGGAGCCACAAAATCGTGAGGAGATCATATGACAAGGAGCAAGACACTTTCAGGCATTATCTCCTCGTCATACCCTGCTTCATCTTGGCTCTCCTCTTACACGACAAGTTTACATTCAGAGAGGTTCTCTGGGCATTCTCTATTTACCTGGAAGCAGTCGCTATTCTTCCGCAGTTAGTTTT
ATTACAGAGGAGCAGGAACATAGACAACTTGACAGGGCAATATGTTTTCTTTCTTGGGGCTTACAGGGGGTTCTACATCCTAAATTGGATTTATCGCTATTTCACTGAAAGACATTACTTCCGATTGATACCTTGGGTATCTGGGCTCGTGCAGACAGCACTTTATGCAGATTTCTTTTACTACTATTTCAAAAGCTGGA
AAAACAATGAGAAGCTGCAGCTACCAGCTTAGTTTTCACTTTGGAATTGATTCTCCATGCAAGGAGTTTTGATTTGAGCAAATCCATTCTTGCTACAATGCTATGTAAATCTTCTCGTTGAAGGTTAGGTTGTTTATGATAACAAACCCCCTTTTCAAATTGTTTTACCTAGCTAATGTAACCACTTATTCAGTATGTCA
TCAGATTCTGATAAAATATAGAGCTATCAGAATCTTGTGAACTTAATTAACTCTACAAGCCAATTCTTTTATCAGTACTCCAGAAGTTTCATCTTCAAGATAATAGGCATGCGTTAGAAATTTTCTTTGGGAGTCTTACTAAGCTAGTCCATTGATTTATACTAGAATGTTTAAGATATTAAGAATCAAGATGATTCGAG
ATTATGGTGATGCAGAAAACTATTAGGATATACTCTTCCTGCTGCGAAATCAGACTATTATTCTGGCTTCTTACCTGCCACCACATTTACAGATGTGAGTGTTGCAGATTTTGAATGTAATTATTTGGTGACTGTAGATTTCCTTTCAGTCAAGAGACTGTGCCTAGAATTTTTCAGGCCTTGCAGGTTATTTAATAATG
CAACACATAAATTTGTTATTATTTTGTCTGAAAGGATCTATCAACAAACAGGATTGTAATTTTTAAATTGACAATTATAAATAAGATTTTCTCATTCCTGAA

>TRINITY_DN112571_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTGTGAAGCAATATTGTACCAAGATCTCTATAACGTGTACGCATTTAAGACCTCGATTGATCAAGTATTTTATTCACTCTCCAGCAGAAATGTATTTTGCTTCTGAATCCCTTCTCTGCTGCTAGGTGCCTTTCTACATCTCGTATATTTCGCGAGCTCGCCATGTGTGCCAAGCAAATTCCTCTACATTGTTCTGGAAT
CTCGGATCCCTGCTATTCTCACTGCCTGGCACCTTGAGGTTGTCGGTTCGAATCCATTCCGCACCATTGATTCCGAAATCGCAAGGGTTTGTTTTGGTTTCGGAACGGTTCCATCGCACTGTTCTGACCCCAGTTCCTGGATCCGGGGATTTCCAAGGAGCGGCAGGCTGTGTAACGAGCGAAAATGAATATCTTCAGGT
TAGCAGGGGACATGACGCATTTAATGAGCGTCCTGGTCCTGCTGCTGAAGATCCACACCATTAAATCCTGCGCAGgtacgtgaatataagggttaccaggccctagtttgtctggaacaatatttaaatgtcttaaatttgagttgaattattcttctctttggtggagcagGGATTTCGTTGAAGACTCAGGAGCTTTA
CGCTCTTGTGTTTGTTACCCGTTACTTGGATTTATTCTCCGACTATATATCGTTCTACAATACCGTAATGAAGATGATCTTTATAGCGAGTTCAATTTCCATTGTGTGGTACATGAGGAGCCACAAAATCGTGAGGAGATCATATGACAAGGAGCAAGACACTTTCAGGCATTATCTCCTCGTCATACCCTGCTTCATCT
TGGCTCTCCTCTTACACGACAAGTTTACATTCAGAGAGGTATGTTTGGATTCTATGATGCTAGGTCATTTATAATTCTTTGATTAAATCCCGATCAAATTCGTTGTCAATATAAATTTGATTTGGGGATAAAGATCCTATTGATCAAGTAGGTCTTAAAGGACATTCATTGTTAAAAA

Intron 3 GTAAGAAGGT ... TGTTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	22.71	59	17	8
A2	25.02	85.3	28	13.5
A3	23.31	100.3	30	14.5
A4	18.04	73.8	16	4.8
A5	14.67	41	7	8.5
A6	20.22	416.8	104	43.5
A7	20.31	306.3	77	43.5
A8	19.14	232	54	32.3
A9	21.53	280.8	75	35.3
A10	19.4	215.8	51	15.8

>TRINITY_DN106222_c0_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoform

ATTTTATTCACTCTCCAGCAGAAATGTATTTTGCTTCTGAATCCCTTCTCTGCTGCTAGGTGCCTTTCTACATCTCGTATATTTCGCGAGCTCGCCATGTGTGCCAAGCAAATTCCTCTACATTGTTCTGGAATCTCGGATCCCTGCTATTCTCACTGCCTGGCACCTTGAGGTTGTCGGTTCGAATCCATTCCGCACCA
TTGATTCCGAAATCGCAAGGGTTTGTTTTGGTTTCGGAACGGTTCCATCGCACTGTTCTGACCCCAGTTCCTGGATCCGGGGATTTCCAAGGAGCGGCAGGCTGTGTAACGAGCGAAAATGAATATCTTCAGGTTAGCAGGGGACATGACGCATTTAATGAGCGTCCTGGTCCTGCTGCTGAAGATCCACACCATTAAAT
CCTGCGCAGGGATTTCGTTGAAGACTCAGGAGCTTTACGCTCTTGTGTTTGTTACCCGTTACTTGGATTTATTCTCCGACTATATATCGTTCTACAATACCGTAATGAAGATGATCTTTATAGCGAGTTCAATTTCCATTGTGTGGTACATGAGGAGCCACAAAATCGTGAGGAGATCATATGACAAGGAGCAAGACACT
TTCAGGCATTATCTCCTCGTCATACCCTGCTTCATCTTGGCTCTCCTCTTACACGACAAGTTTACATTCAGAGAGGTTCTCTGGGCATTCTCTATTTACCTGGAAGCAGTCGCTATTCTTCCGCAGTTAGTTTTATTACAGAGGAGCAGGAACATAGACAACTTGACAGGGCAATATGTTTTCTTTCTTGGGGCTTACAG
GGGGTTCTACATCCTAAATTGGATTTATCGCTATTTCACTGAAAGACATTACTTCCGATTGATACCTTGGGTATCTGGGCTCGTGCAGACAGCACTTTATGCAGATTTCTTTTACTACTATTTCAAAAGCTGGAAAAACAATGAGAAGCTGCAGCTACCAGCTTAGTTTTCACTTTGGAATTGATTCTCCATGCAAGGAG
TTTTGATTTGAGCAAATCCATTCTTGCTACAATGCTATGTAAATCTTCTCGTTGAAGGTTAGGTTGTTTATGATAACAAACCCCCTTTTCAAATTGTTTTACCTAGCTAATGTAACCACTTATTCAGTATGTCATCAGATTCTGATAAAATATAGAGCTATCAGAATCTTGTGAACTTAATTAACTCTACAAGCCAATTC
TTTTATCAGTACTCCAGAAGTTTCATCTTCAAGATAATAGGCATGCGTTAGAAATTTTCTTTGGGAGTCTTACTAAGCTAGTCCATTGATTTATACTAGAATGTTTAAGATATTAAGAATCAAGATGATTCGAGATTATGGTGATGCAGTAAACTATTAGGATATACTCTTCCTGCTGCGAAATCAGACTATTATTCTGG
CTTCTTACCTGCCACCACATTTACAGATGTGAGTGTTGCAGATTTTGAATGTAATTATTTGGTGACTGTAGATTTCCTTTCAGTCAAGAGACTGTGCCTAGAATTTTTCAGGCCTTGCAGGTTATTTAATAATGCAACACATAAATTTGTTATTATTTTGTCTGAAAGGATCTATCAACAAACAGGATTGTAATTTTTAA
ATTGACAATTATAAATAAG

>TRINITY_DN106222_c0_g2_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:

ATTTTATTCACTCTCCAGCAGAAATGTATTTTGCTTCTGAATCCCTTCTCTGCTGCTAGGTGCCTTTCTACATCTCGTATATTTCGCGAGCTCGCCATGTGTGCCAAGCAAATTCCTCTACATTGTTCTGGAATCTCGGATCCCTGCTATTCTCACTGCCTGGCACCTTGAGGTTGTCGGTTCGAATCCATTCCGCACCA
TTGATTCCGAAATCGCAAGGGTTTGTTTTGGTTTCGGAACGGTTCCATCGCACTGTTCTGACCCCAGTTCCTGGATCCGGGGATTTCCAAGGAGCGGCAGGCTGTGTAACGAGCGAAAATGAATATCTTCAGGTTAGCAGGGGACATGACGCATTTAATGAGCGTCCTGGTCCTGCTGCTGAAGATCCACACCATTAAAT
CCTGCGCAGGGATTTCGTTGAAGACTCAGGAGCTTTACGCTCTTGTGTTTGTTACCCGTTACTTGGATTTATTCTCCGACTATATATCGTTCTACAATACCGTAATGAAGATGATCTTTATAGCGAGTTCAATTTCCATTGTGTGGTACATGAGGAGCCACAAAATCGTGAGGAGATCATATGACAAGGAGCAAGACACT
TTCAGGCATTATCTCCTCGTCATACCCTGCTTCATCTTGGCTCTCCTCTTACACGACAAGTTTACATTCAGAGAGGTTCTCTGGGCATTCTCTATTTACCTGGAAGCAGTCGCTATTCTTCCGCAGTTAGTTTTATTACAGAGGAGCAGGAACATAGACAACTTGACAGGGCAATATGTTTTCTTTCTTGGGGCTTACAG
GGGGTTCTACATCCTAAATTGGATTTATCGCTATTTCACTGAAAGACATTACTTCCGATTGATACgtaagaaggtttctatccattgttttttcaatttgaaacaaacattttttgagattgtctgatgctttcttgtttgtttctcagCTTGGGTATCTGGGCTCGTGCAGACAGCACTTTATGCAGATTTCTTTTACT
ACTATTTCAAAAGGTAAGATTCTTTAATCTGCAGCAACCGATTGCCTTAAAACTTTTATGTATATTTTTCATTTATTTAGTCAAGGCTTACATAGGGTTGGCCATTTATCACTGAACTACTCCATGGTTTTACAGCTGGAAAAACAATGAGAAGCTGCAGCTACCAGCTTAGTTTTCACTTTGGAATTGATTCTCCATGC
AAGGAGTTTTGATTTGAGCAAATCCATTCTTGCTACAATGCTATGTAAATCTTCTCGTTGAAGGTTAGGTTGTTTATGATAACAAACCCCCTTTTCAAATTGTTTTACCTAGCTAATGTAACCACTTATTCAGTATGTCATCAGATTCTGATAAAATATAGAGCTATCAGAATCTTGTGAACTTAATTAACTCTACAAGC
CAATTCTTTTATCAGTACTCCAGAAGTTTCATCTTCAAGATAATAGGCATGCGTTAGAAATTTTCTTTGGGAGTCTTACTAAGCTAGTCCATTGATTTATACTAGAATGTTTAAGATATTAAGAATCAAGATGATTCGAGATTATGGTGATGCAGTAAACTATTAGGATATACTCTTCCTGCTGCGAAATCAGACTATTA
TTCTGGCTTCTTACCTGCCACCACATTTACAGATGTGAGTGTTGCAGATTTTGAATGTAATTATTTGGTGACTGTAGATTTCCTTTCAGTCAAGAGACTGTGCCTAGAATTTTTCAGGCCTTGCAGGTTATTTAATAATGCAACACATAAATTTGTTATTATTTTGTCTGAAAGGATCTATCAACAAACAGGATTGTAAT
TTTTAAATTGACAATTATAAATAAG