sp|Q6NM26|DI196_ARATH ----> Protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 6

Intron 1 GTATCCTACA ... CAATTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.33	67	37	30
A2	36.32	64	35	38
A3	38.38	57	31	40
A4	41.57	26	25	12
A5	48.39	16	18	12
A6	33.95	674	218	475
A7	34.14	569	278	312
A8	35.49	759	284	551
A9	34.18	599	201	421
A10	32.94	340	132	202

>TRINITY_DN44235_c0_g5_i1 from sample A8 / Example spliced isoform

GGCTGCATTCTTCTGTTGGAGGAGGTTCCTCGCGTTTGGGTGGATGTTCCTCTAATGATGCACCAGATCCTCTACTTTCATCTCTCAGTTATGGGTTGCCAATTATTGAATCCCATGAACAAGAGAAAACATGTTCCTCTACAAATGATACTTCAGCAAAGAATTCTTCAGATTCACAGGATGTAATTAGGTAAGCTATG
ATAATGGAGAAAGTTGGCACAACCGGTGCATTTCATGGCTCAACTGTTGGAATGTTCAAAATGAAAACTTGTAATTGGGTGGATTGGTACTTGTTGGGATTTCCACCATTTATTGTAGAGCTGGACATCTATAAATATGCACATTTGCAGATATTTTGAATACAAATGCTCATTTTCTTTTCCACTGAAAAAGTCATATT
TTCAATTCCAGTATGAAATGGAAAACACATTCATCGTATGCACTTACCACTTTACAGAACAGGGTGTACTTTGCATCCTTCATCTTCTAGCACAGAGTCTAGATACAATCCCAGATTCTCCAAAAATACGACATATTCAAGCATCCTTCTAAAAGCATACTGCCCTTAATTGGGCCACCCTTCAAAAATTTTGGTCTCAT
ATGAAAATATGAAAAACATTCTCCAAAAATACGACATATT

>TRINITY_DN44235_c0_g5_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GGCTGCATTCTTCTGTTGGAGGAGGTTCCTCGCGTTTGGGTGGATGTTCCTCTAATGATGCACCAGATCCTCTACTTTCATCTCTCAGTTATGGGTTGCCAATTATTGAATCCCATGAACAAGAGAAAACATGTTCCTCTACAAATGATACTTCAGCAAAGAATTCTTCAGATTCACAGGATGTAATTAGgtatcctaca
cttctttttctttaatattgtaagaaattatgggactctactgatgtcttttattagtcctatttttttggttttgctcatcgtttattcacataagatcttcagtcctcttctttgttccctatattgtttattcattattgctgtaaaacagggattttttcatggcaatagattattgcacattgtcaatcttatcc
tgcacatggaaaactaaggagtttctcagcctcttctttgcttcctaattttttttattgctttaacaaagagattttcatggcaatatataatttcacattgtcaaccttatcctgcgcatgccaaactaaggagttcctcatcctctgttcacaaaatggcattgaatgtgctttctcaaatgcaaccccaccaagga
tttcgaatgtctccaattactacatggtataatcatcttaaatatctaatatgcttcctaaggggagcacaccaatttatcatctggaaatagtattggtcaactaatgtatgatgttatgttccttgcctcaaaatatttcttttttcaattgttgttacttaatatattactttgcttaagaaagtgcttatatatct
acccaggatgtgttataattaaataaatgaaatgcctagactagagctaaggatgaatgtggaggatttagtttgtaagtatcaaatacttgagactgttcttgctaagatttgatccagacttgccactttctagttgtctttgcctatttgataatgaaattaaggaagaatatgaatcattcctatttcagattagt
gaaatgttgtcgtcttcctagagctagtctatagtagcaattctctttagagatctttattatttttatcaggcagctttatggaaaactagaaatcctatcaaaatgttcaatattatccctacatactgaatgattgttgatttttttccatttccggggtcctgtaaatgcattcatatatagtttgatatgccatt
ttggcagcaagattcatgccagtataatctgtatggcttctctggttatagagccttgtttgtgtggttcagcaatttttttttaaagatcattataattttgtatcaggcatctttatggaaaaactagaaatcctatcaaaatgttcaatgttatccctgcactttactgaatgcttgttgattatttccccatttcc
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cattttttctagtggttatggttgatgcttacttatgatatagtattgtatgaagtttcattaaataaacaatatggtttgagaagtttttactccaagttcaaacaatactttgttgtaaattttacttttccaaggaaaactttcattatttttagtaagcttgcaatattgtttaatattatagtctttggcatgtt
gatttctggtttgcctgaaagcattgttatgaccaatttattgagaaactttctcagagttagcataaatttataaaatgtatataattctgcaacgtgtttctttaattggtttttgaaagtggatttaaaaactacaaatagaaggctgaagtggatttggtgatatccataatagacccataattttcatgaaagtg
atttgatagatgcaactgacatgcttgatttctatatgcttttaatatttattgcaacagagaaatggtgtctctcaatatatctagtatttaggaagatggatgtgatatttttactgtctttctttgtttcttgtcacaattatttgggctagattttatgctacatgtctttgtgcatatgaaccttgaaggtatct
attattttttattgcatctacttacaatcagatttcaccaaagttgcttccctcggtggcaaaaaatctacactgttgggaggaaacccgatcatgctattgaaggataggaatggcaatagggccattgtatctgtaccgttgcaaatttgcatctttaaattatggaaaggaaaaagaacatagacaaagtcaaattt
gtgaaaatgtatttgtgcttagtatttggcatttttcttgacctttcctttaattttatgaatgctttacaatttttagttgttgaatattcgactctgtttttcactaccagcattctgactgcaacactatctgggtgagcttgacactttttattatgtttatcacaatttgcagGTAAGCTATGATAATGGAGAAA
GTTGGCACAACCGGTGCATTTCATGGCTCAACTGTTGGAATGTTCAAAATGAAAACTTGTAATTGGGTGGATTGGTACTTGTTGGGATTTCCACCATTTATTGTGGAGCTGGACATGTATAAATATGCACATTTGCAGATATTTTGAATACAAATGCTCATTTTCTTTTCCACTGAAAAAGTCATATTTTCAATTCCAGT
ATGAAATGGAAAACACATTCATCGTATGCACTTACCACTTTACAGAACAGGGTGTACTTTGCATCCTTCATCTTCTAGCACAGAGTCTAGATACAATCCCAGATTCTCCAAAAATACGACATATTCAAGCATCCTTCTAAAAGCATACTGCCCTTAATTGGGCCACCCTTCAAAAATTTTGGTCTCATATGAAAATATGA
AAAACATTCTCCAAAAATACGACATATT

Intron 2 GTATCCTACA ... TGTAAAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	100	0	37	3
A2	94.59	2	35	7
A3	96.88	1	31	6
A4	100	0	25	4
A5	100	0	18	1
A6	99.54	1	218	7
A7	99.29	2	278	24
A8	97.59	7	284	33
A9	98.05	4	201	16
A10	99.25	1	132	5

>TRINITY_DN44235_c0_g5_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

CAGATTCACAGGATGTAATTAGGGATTTTTTCATGGCAATAGATTATTGCACATTGTCAATCTTATCCTGCACATGGAAAACTAAGGAGTTTCTCAGCCTCTTCTTTGCTTCCTAAGTTTCTTTATTGCTTTAACAAAGAGATTTTCATGGCAATATATAATTTCACATTGTCAACCTTATCCTGCGCATGCCAAACTAA
GGAGTTCCTCATCCTCTGTTCACAAAATGGCATTGAATGTGCTTTCTCAAATGCAACCCCACCAAGGATTTCGAATGTCTCCAATTACTACATGGTATAATCATCTTAAATATCTAATATGCTTCCTAAGGGGAGCACACCAATTTATCATCTGGAAATAGTATTGGTCAACTAATGTATGATGTTATGTTCCTTGCCTC
AAAATATTTCTTTTTTCAATTGTTGTTACTTAATATATTACTTTGCTTAAGAAAGTGCTTATATATCTACCCAGGATGTGTTATAATTAAATAAATGAAATGCCTAGACTAGAGCTAAGGATGAATGTGGAGGATTTAGTTTGTAAGTATCAAATACTTGAGACTGTTCTTGCTAAGATTTGATCCAGACTTGCCACTTT
CTAGTTGTCTTTGCCTATTTGATAATGAAATTAAGGAAGAATATGAATCATTCCTATTTCAGATTAGTGAAATGTTGTCGTCTTCCTAGAGCTAGTCTATAGTAGCAATTCTCTTTAGAGATCTTTATTATTTTTATCAGGCAGCTTTATGGAAAACTAGAAATCCTATCAAAATGTTCAATATTATCCCTACATACTGA
ATGATTGTTGATTTTTTTCCATTTCCGGGGTCCTGTAAATGCATTCATATATAGTTTGATATGCCATTTTGGCAGCAAGATTCATGCCAGTATAATCTGTATGGCTTCTCTGGTTATAGAGCCTTGTTTGTGTGGTTCAGCAATTTTTTTTTAAAGATCATTATAATTTTGTATCAGGCATCTTTATGGAAAAACTAGAA
ATCCTATCAAAATGTTCAATGTTATCCCTGCACTTTACTGAATGCTTGTTGATTATTTCCCCATTTCCAAGGTCCTGAAAATGCATTCATTGATAATTTGATATGTCATTTTGGAAGCAATATTCATGCTGGTATAATCTGTATGTCTTCTCTGGTTATAGAGCCTTGTTTGTGTGTTTCATTTCCTTTCATTATTGTAG
GAAGGAAGAACAGATTTAGCAAAAGTAAATTTAAAAGATTTCTATGCACATAGCTGTTTATAAAAGTTCATTTTTTCTAGTGGTTATGGTTGATGCTTACTTATGATATAGTATTGTATGAAGTTTCATTAAATAAACAATATGGTTTGAGAAGTTTTTACTCCAAGTTCAAACAATACTTTGTTGTAAATTTTACTTTT
CCAAGGAAAACTTTCATTATTTTTAGTAAGCTTGCAATATTGTTTAATATTATAGTCTTTGGCATGTTGATTTCTGGTTTGCCTGAAAGCATTGTTATGACCAATTTATTGAGAAACTTTCTCAGAGTTAGCATAAATTTATAAAATGTATATAATTCTGCAACGTGTTTCTTTAATTGGTTTTTGAAAGTGGATTTAAA
AACTACAAATAGAAGGCTGAAGTGGATTTGGTGATATCCATAATAGACCCATAATTTTCATGAAAGTGATTTGATAGATGCAACTGACATGCTTGATTTCTATATGCTTTTAATATTTATTGCAACAGAGAAATGGTGTCTCTCAATATATCTAGTATTTAGGAAGATGGATGTGATATTTTTACTGTCTTTCTTTGTTT
CTTGTCACAATTATTTGGGCTAGATTTTATGCTACATGTCTTTGTGCATATGAACCTTGAAGGTATCTATTATTTTTTATTGCATCTACTTACAATCAGATTTCACCAAAGTTGCTTCCCTCGGTGGCAAAAAATCTACACTGTTGGGAGGAAACCCGATCATGCTATTGAAGGATAGGAATGGCAATAGGGCCATTGTA
TCTGTACCGTTGCAAATTTGCATCTTTAAATTATGGAAAGGAAAAAGAACATAGACAAAGTCAAATTTGTGAAAATGTATTTGTGCTTAGTATTTGGCATTTTTCTTGACCTTTCCTTTAATTTTATGAATGCTTTACAATTTTTAGTTGTTGAATATTCGACTCTGTTTTTCACTACCAGCATTCTGACTGCAACACTA
TCTGGGTGAGCTTGACACTTTTTATTATGTTTATCACAATTTGCAGGTAAGCTATGATAATGGAGAAAGTTGGCACAACCGGTGCATTTCATGGCTCAACTGTTGGAATGTTCAAAATGAAAACTTGTAATTGGGTGGATTGGTACTTGTTGGGATTTCCACCATTTATTGTGGAGCTGGACATGTATAAATATGCACAT
TTGCAGATATTTTGAATACAAATGCTCATTTTCTTTTCCACTGAAAAAGTCATATTTTCAATTCCAGTATGAAATGGAAAACACATTCATCGTATGCACTTACCACTTTACAGAACAGGGTGTACTTTGCATCCTTCATCTTCTAGCACAGAGTCTAGATACAATCCCAGATTCTCCAAAAATACGACATATTCAAGCAT
CCTTCTAAAAGCATACTGCCCTTAATTGGGCCACCCTTCAAAAATTTTGGTCTCATATGAAAATATGAAAAACATTCTCCAAAAATACGACATATT

>TRINITY_DN44235_c0_g5_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GGCTGCATTCTTCTGTTGGAGGAGGTTCCTCGCGTTTGGGTGGATGTTCCTCTAATGATGCACCAGATCCTCTACTTTCATCTCTCAGTTATGGGTTGCCAATTATTGAATCCCATGAACAAGAGAAAACATGTTCCTCTACAAATGATACTTCAGCAAAGAATTCTTCAGATTCACAGGATGTAATTAGgtatcctaca
cttctttttctttaatattgtaagaaattatgggactctactgatgtcttttattagtcctatttttttggttttgctcatcgtttattcacataagatcttcagtcctcttctttgttccctatattgtttattcattattgctgtaaaacagGGATTTTTTCATGGCAATAGATTATTGCACATTGTCAATCTTATCC
TGCACATGGAAAACTAAGGAGTTTCTCAGCCTCTTCTTTGCTTCCTAATTTTTTTTATTGCTTTAACAAAGAGATTTTCATGGCAATATATAATTTCACATTGTCAACCTTATCCTGCGCATGCCAAACTAAGGAGTTCCTCATCCTCTGTTCACAAAATGGCATTGAATGTGCTTTCTCAAATGCAACCCCACCAAGGA
TTTCGAATGTCTCCAATTACTACATGGTATAATCATCTTAAATATCTAATATGCTTCCTAAGGGGAGCACACCAATTTATCATCTGGAAATAGTATTGGTCAACTAATGTATGATGTTATGTTCCTTGCCTCAAAATATTTCTTTTTTCAATTGTTGTTACTTAATATATTACTTTGCTTAAGAAAGTGCTTATATATCT
ACCCAGGATGTGTTATAATTAAATAAATGAAATGCCTAGACTAGAGCTAAGGATGAATGTGGAGGATTTAGTTTGTAAGTATCAAATACTTGAGACTGTTCTTGCTAAGATTTGATCCAGACTTGCCACTTTCTAGTTGTCTTTGCCTATTTGATAATGAAATTAAGGAAGAATATGAATCATTCCTATTTCAGATTAGT
GAAATGTTGTCGTCTTCCTAGAGCTAGTCTATAGTAGCAATTCTCTTTAGAGATCTTTATTATTTTTATCAGGCAGCTTTATGGAAAACTAGAAATCCTATCAAAATGTTCAATATTATCCCTACATACTGAATGATTGTTGATTTTTTTCCATTTCCGGGGTCCTGTAAATGCATTCATATATAGTTTGATATGCCATT
TTGGCAGCAAGATTCATGCCAGTATAATCTGTATGGCTTCTCTGGTTATAGAGCCTTGTTTGTGTGGTTCAGCAATTTTTTTTTAAAGATCATTATAATTTTGTATCAGGCATCTTTATGGAAAAACTAGAAATCCTATCAAAATGTTCAATGTTATCCCTGCACTTTACTGAATGCTTGTTGATTATTTCCCCATTTCC
AAGGTCCTGAAAATGCATTCATTGATAATTTGATATGTCATTTTGGAAGCAATATTCATGCTGGTATAATCTGTATGTCTTCTCTGGTTATAGAGCCTTGTTTGTGTGTTTCATTTCCTTTCATTATTGTAGGAAGGAAGAACAGATTTAGCAAAAGTAAATTTAAAAGATTTCTATGCACATAGCTGTTTATAAAAGTT
CATTTTTTCTAGTGGTTATGGTTGATGCTTACTTATGATATAGTATTGTATGAAGTTTCATTAAATAAACAATATGGTTTGAGAAGTTTTTACTCCAAGTTCAAACAATACTTTGTTGTAAATTTTACTTTTCCAAGGAAAACTTTCATTATTTTTAGTAAGCTTGCAATATTGTTTAATATTATAGTCTTTGGCATGTT
GATTTCTGGTTTGCCTGAAAGCATTGTTATGACCAATTTATTGAGAAACTTTCTCAGAGTTAGCATAAATTTATAAAATGTATATAATTCTGCAACGTGTTTCTTTAATTGGTTTTTGAAAGTGGATTTAAAAACTACAAATAGAAGGCTGAAGTGGATTTGGTGATATCCATAATAGACCCATAATTTTCATGAAAGTG
ATTTGATAGATGCAACTGACATGCTTGATTTCTATATGCTTTTAATATTTATTGCAACAGAGAAATGGTGTCTCTCAATATATCTAGTATTTAGGAAGATGGATGTGATATTTTTACTGTCTTTCTTTGTTTCTTGTCACAATTATTTGGGCTAGATTTTATGCTACATGTCTTTGTGCATATGAACCTTGAAGGTATCT
ATTATTTTTTATTGCATCTACTTACAATCAGATTTCACCAAAGTTGCTTCCCTCGGTGGCAAAAAATCTACACTGTTGGGAGGAAACCCGATCATGCTATTGAAGGATAGGAATGGCAATAGGGCCATTGTATCTGTACCGTTGCAAATTTGCATCTTTAAATTATGGAAAGGAAAAAGAACATAGACAAAGTCAAATTT
GTGAAAATGTATTTGTGCTTAGTATTTGGCATTTTTCTTGACCTTTCCTTTAATTTTATGAATGCTTTACAATTTTTAGTTGTTGAATATTCGACTCTGTTTTTCACTACCAGCATTCTGACTGCAACACTATCTGGGTGAGCTTGACACTTTTTATTATGTTTATCACAATTTGCAGGTAAGCTATGATAATGGAGAAA
GTTGGCACAACCGGTGCATTTCATGGCTCAACTGTTGGAATGTTCAAAATGAAAACTTGTAATTGGGTGGATTGGTACTTGTTGGGATTTCCACCATTTATTGTGGAGCTGGACATGTATAAATATGCACATTTGCAGATATTTTGAATACAAATGCTCATTTTCTTTTCCACTGAAAAAGTCATATTTTCAATTCCAGT
ATGAAATGGAAAACACATTCATCGTATGCACTTACCACTTTACAGAACAGGGTGTACTTTGCATCCTTCATCTTCTAGCACAGAGTCTAGATACAATCCCAGATTCTCCAAAAATACGACATATTCAAGCATCCTTCTAAAAGCATACTGCCCTTAATTGGGCCACCCTTCAAAAATTTTGGTCTCATATGAAAATATGA
AAAACATTCTCCAAAAATACGACATATT