sp|Q4QSN4|TPSBS_PSEMZ ----> (E)-gamma-bisabolene synthase
Intron 1 GTCAGTAATG ... TGATCTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68.92 | 23 | 28 | 51 |
| A2 | 68.75 | 10 | 20 | 22 |
| A3 | 70 | 12 | 24 | 28 |
| A4 | 69.05 | 13 | 28 | 29 |
| A5 | 75 | 3 | 19 | 9 |
| A6 | 74.44 | 23 | 24 | 67 |
| A7 | 86.17 | 39 | 63 | 243 |
| A8 | 83.04 | 38 | 52 | 186 |
| A9 | 94.07 | 14 | 22 | 222 |
| A10 | 91.82 | 18 | 42 | 202 |
>TRINITY_DN48806_c1_g2_i8 from sample A10 / Example spliced isoformGTGGAGTGTTTGTCCAATAACAAACACCAAATACAGTAGTATATATATTTTTTTATTTTGTAAAATCAATTTTATAGAATTTTAAGATTTTGAGTTAAATTTTGGAATTTCTGTAAATTTTGGAATTTCTATAGAGACTCATGTATGACATCTTCTTTGTGATCAGCTTCTTAAGATATGCACATATTTTGTGTATGTTT
TTATTTTGCTTTTTATTCATGTTTTTATTTTTAGTTATTTTTTAATATTAACATAGTTACATTTATTTTTATTTTAGAGTTTATTTTTCTTTATATAAGGTTTTATTTTATTTTTTAATACTATAATCATCATATAATAATCAATATTTTAATCATGTGGCATTTGTTTATTACGCCGTAAGGCGTTTTATTTCAACTTT
GGGGGTGGGGTGGCGGTGGCAGATTTTTCATTTTTAAAAGAATGAATGGCCAGATTTGAAACTTAACAGAATATTCTTCGTCTGGAGCATGATCGGAGTATTGAGATTTCAAGAAATAACTCCCGTGCATGTTTAATTCCAAAGGGATTGAACCGGAAGATGAACCGGAAGATGAAGAAACTCACTATGAAATTTGAGCA
ATGGGAGCTAGCGTGCATCTTCAGCAACGGAGAATAATCGGAGCAATGGGACGGAGAATAATCTGAGCAATGGGACGGAGGAGCTCCGGAGCTAGCGTGCATCTTCAGCAACAGCCACCAATAGAAATAGAGATCAAATTCTCTTTCTTGATTTCCTGATTATGGACAAGCCAAGTTCCTATCGCTGTCGTTTTCATACA
CACTGGAGACATGAAATGTCTGGAATTCTCGAACAGCATGCTCGCTAAGTTTGGCGATTTCGTTCCATGCATATATCATGTGGATCTGCTGGAACGCCTGTTGATAGTGGATACTATTGAACGCCTTGGAATTGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAACGAAAGAG
GAATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGATGGAAAATTCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGCTTCCGAG
TTTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGTTAAAGGCTTCACCACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGAGATTAAATACGCGGTGAAGACTTCTTGGCATTGCACTATCCCTAGAGTAGAAGCCAAGAGATTAAATACGCGGTG
AAGACTTCTTGGCATTGCAC
>TRINITY_DN48806_c1_g2_i5 from sample A10 / Example unspliced isoform:GTGGAGTGTTTGTCCAATAACAAACACCAAATACAGTAGTATATATATTTTTTTATTTTGTAAAATCAATTTTATAGAATTTTAAGATTTTGAGTTAAATTTTGGAATTTCTGTAAATTTTGGAATTTCTATAGAGACTCATGTATGACATCTTCTTTGTGATCAGCTTCTTAAGATATGCACATATTTTGTGTATGTTT
TTATTTTGCTTTTTATTCATGTTTTTATTTTTAGTTATTTTTTAATATTAACATAGTTACATTTATTTTTATTTTAGAGTTTATTTTTCTTTATATAAGGTTTTATTTTATTTTTTAATACTATAATCATCATATAATAATCAATATTTTAATCATGTGGCATTTGTTTATTACGCCGTAAGGCGTTTTATTTCAACTTT
GGGGGTGGGGTGGCGGTGGCAGATTTTTCATTTTTAAAAGAATGAATGGCCAGATTTGAAACTTAACAGAATATTCTTCGTCTGGAGCATGATCGGAGTATTGAGATTTCAAGAAATAACTCCCGTGCATGTTTAATTCCAAAGgtcagtaatgattttaaaaaaaaattaagttattacaagtgtcaaggccctcacgc
ttcttctgttattaaaaaaaaacaatgttattccaagtgtcgcttggctcatgttggctgaaacgtttcttggctcatgctcgctggaacgtttggctggaaaaccacgttccctctccattatcgatatagtggtatggaaagtgctgaagttaacagggattccaaatttatctgatgtttttcctttccttgagagg
tttgatctacagGGATTGAACCGGAAGATGAACCGGAAGATGAAGAAACTCACTATGAAATTTGAGCAATGGGAGCTAGCGTGCATCTTCAGCAACGGAGAATAATCGGAGCAATGGGACGGAGAATAATCTGAGCAATGGGACGGAGGAGCTCCGGAGCTAGCATGCATCTTCATCAACAGCCACCAACAGAAATAGAG
ATCAAATTCTCTTTCTTGATTTCCTGATTATGGACAAGCCAAGTTCCTATCGCTGTCGTTTTCATACACACTGGAGACATGAAATGTCTGGAATTCTCGAACAGCATGCTCGCTAAGTTTGGCGATTTCGTTCCATGCATATATCATGTGGATCTGCTGGAACGCCTGTTGATAGTGGATACTATTGAACGCCTTGGAAT
TGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAACGAAAGAGGAATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGATGGAAAAT
TCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGCTTCCGAGTTTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGCTAAAGGCTTCAATACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGAGATTAAG
TACGCAGTGAAGACTTCTTGGCATTGCACTATCCCTAGAGTGGAAGCAAAGAGATACTGTCAAGTATATCGCCCAGATTATGCACGCATAGCAAAAAGTGTTTACAAGTTGCACTACGTGAACAACGAAAAGATTTTGGAGCTGGAAAAATTGGACTTCAACATTATCCAGTCCATCCACCAAGAAGAGATGAAGGAGGT
CACCAGGAATCAACTCGGTTTTGGATGATGATACCTGAACGCGATCCCCAGATTTCAGAAATGCCATTTGTTATTTCAAAATAAGGTGGTCATACAACAAGGGTTTCCTTCGGCCAGAAATGCCATTTCTTATTTCAGAATAAGGTGCTCATACAACAAGGGTTTCCTTCGGTCAGAAATGCCATTTCTTATTTTAGAAT
AAGGTGCTCATACAACGAGGGTTTCCTTCTGCAAAGGATAACTGAGATTCCTAACGAATCAATTCTTGGAACAATTTCGGAACTAAAATAAATTTACACTTTGCTTAAATTTAAACTGTGTATATATTATGTTTACTGTTTAAATTTATATGTGTGGAATAAATTCTGAAAATTTTAAAAGCTTTGCAAAAAATGAATGG
CTGTAGGTCTTGATCTTATTTTACATCTTTACAGTGATAAAGTAAGTTGGATGAATGTGGAATGAGGTTAGTTAAGACAATAAATTCCCAACCAAATATGATAGCAAAACCATTAGAATTAATTAGGAATAAGTTTTGGTTATTATACAA
Intron 2 GTAACCGCAT ... GCCTTCCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 34.09 | 29 | 15 | 2 |
| A2 | 45.45 | 6 | 5 | 0 |
| A3 | 12.5 | 14 | 2 | 1 |
| A4 | 6.67 | 14 | 1 | 1 |
| A5 | 42.86 | 4 | 3 | 0 |
| A6 | 12.96 | 47 | 7 | 0 |
| A7 | 14.21 | 157 | 26 | 0 |
| A8 | 19.92 | 201 | 50 | 0 |
| A9 | 13.82 | 131 | 21 | 0 |
| A10 | 12.69 | 117 | 17 | 2 |
>TRINITY_DN44683_c2_g2_i9 from sample A9 / Example spliced isoformTTGGAATTGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAACGAAAGAGGAATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGAT
GGAAAATTCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGCTTCCGAGTTTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGTTAAAGGCTTCACCACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGA
GATTAAATACGCGGTGAAGACTTCTTGGCATTGCACTATCCCTAGAGTAGAAGCAAAGAGATACTGTCAAGTATATCGCCCAGATTATGCACGAATCAATTCTTGGAACAATTTCGGAACTAAAATAAATTTACACTTTGCTTAAATTTAAACTGTGTATATATTATGTTTACTGTTTAAATTTATATGTGTGGAATAAA
TTCTGAAAATCTTAAAAGCTTTGCAAAAAATGAATGGCTGTAGGTCTTGATCTTATTTTACATCTTTACAGTGATAAAGTAAGTTGGATGAATGTGGAATGAGGTTAGTTAAGACAATAAATTCCCAACCAAATATGATAGCAAAACCATTAGAATTAATTAGGAATAAGTTTTGGTTGTAAAGCACATGGTTTAGATTT
TAAGGAATAAGCCTTTGTTATTATATAAATTTGGTTGAGTTAAAGTCATTTGATCTTTATTTTCTTTTAGTTTTAGTTTTTAAAGAATTAGTCTTTGC
>TRINITY_DN44683_c2_g2_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:TTGGAATTGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAACGAAAGAGGAATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGAT
GGAAAATTCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGCTTCCGAGTTTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGTTAAAGGCTTCACCACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGA
Ggtaaccgcataaaacatacatataattgttgcttgtttgttcgcttgagacgagtgatcggatgaatttcttgtaatattccaggccgtgatttttttttttgtttaattctctacttagaactggaaaatggtataacagattttgtttgcatttaatgttatatacttatgatatatatttggtattaaattaaaaa
tatgactatttaatatagtagttttctaccaatttaatattttgtttttgtcattgccttcccagATTAAATACGCGGTGAAGACT
Intron 3 GTACGGATCG ... GATTATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 12.08 | 91 | 9 | 16 |
| A2 | 11.86 | 26 | 1 | 6 |
| A3 | 17.01 | 61 | 6 | 19 |
| A4 | 15.89 | 45 | 3 | 14 |
| A5 | 31.82 | 15 | 3 | 11 |
| A6 | 13.33 | 52 | 9 | 7 |
| A7 | 9.48 | 210 | 11 | 33 |
| A8 | 12.06 | 186 | 15 | 36 |
| A9 | 12.55 | 115 | 9 | 24 |
| A10 | 7.98 | 173 | 4 | 26 |
>TRINITY_DN121977_c5_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoformAACGTTTCTTGGCTCATGCTCGCTGGAACGTTTGGCTGGAAAACCACGTTCCCTCTCCATTATCGATATAGTGGTATGGAAAGTGCTGAAGTTAACAGGGATTCCAAATTTATCTGATGTTTTTCCTTTCCTTGAGAGGTTTGATCTACAGGGATTGAACCGGAAGATGAACCGGAAGATGAAGAAACTCACTATGAAAT
TTGAGCAATGGGAGCTAGCGTGCATCTTCAGCAACGGAGAATAATCGGAGCAATGGGACGGAGAATAATCTGAGCAATGGGACGGAGGAGCTCCGGAGCTAGCATGCATCTTCATCAACAGCCACCAACAGAAATAGAGATCAAATTCTCTTTCTTGATTTCCTGATTATGGACAAGCCAAGTTCCTCTCGCTGTCGTTT
TCATACACACTGGAGACATGAAATGTCTGGAATTCTTGAACAGCATGCTCGCTAAGTTTGGCGATTTCGTTCCATGCATATATCATGTGGATCTGCTGGAACGCCTGTTGATAGTGGATACTATTGAACGCCTTGGAATTGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAAC
GAAAGAGGAATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGATGGAAAATTCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGC
TTCCGAGTTTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGTTAAAGGCTTCACCACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGAGGTAACCGCATAAAACATACATATAATTGTTGCTTGTTTGTTCGCTTGAGACGAGTGATCGGATGAAT
TTCTTGTAATATTCCAGGCCGTGATTTTTTTTTGTTTAATTCTATACTTAGAACTGGAAAATGGTATAACAGATTCTTTTG
>TRINITY_DN121977_c5_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:AACGTTTCTTGGCTCATGCTCGCTGGAACGTTTGGCTGGAAAACCACGTTCCCTCTCCATTATCGATATAGTGGTATGGAAAGTGCTGAAGTTAACAGGGATTCCAAATTTATCTGATGTTTTTCCTTTCCTTGAGAGGTTTGATCTACAGGGATTGAACCGGAAGATGAACCGGAAGATGAAGAAACTCACTATGAAAT
TTGAGCAATGGGAGCTAGCGTGCATCTTCAGCAACGGAGAATAATCGGAGCAATGGGACGGAGAATAATCTGAGCAATGGGACGGAGGAGCTCCGGAGCTAGCATGCATCTTCATCAACAGCCACCAACAGAAATAGgtacggatcggaccgaaagactattggtttttgtaatcacagacctgtgtagaacgatttgta
cttgtgtggtcctgttccattgttttctttaaaaaaaaaggaattcactgctattaatagcgttgccggtgagggcgcagccctggactaaatgttgttgctttctttcttgatttctggattatgcagAGATCAAATTCTCTTTCTTGATTTCCTGATTATGGACAAGCCAAGTTCCTCTCGCTGTCGTTTTCATACAC
ACTGGAGACATGAAATGTCTGGAATTCTTGAACAGCATGCTCGCTAAGTTTGGCGATTTCGTTCCATGCATATATCATGTGGATCTGCTGGAACGCCTGTTGATAGTGGATACTATTGAACGCCTTGGAATTGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAACGAAAGAGG
AATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGATGGAAAATTCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGCTTCCGAGT
TTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGTTAAAGGCTTCACCACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGAGGTAACCGCATAAAACATACATATAATTGTTGCTTGTTTGTTCGCTTGAGACGAGTGATCGGATGAATTTCTTGTA
ATATTCCAGGCCGTGATTTTTTTTTGTTTAATTCTATACTTAGAACTGGAAAATGGTATAACAGATTCTTTTG
Intron 4 GTACGTATTT ... ATAATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A2 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A3 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A4 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A5 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A6 | 0 | 7.5 | 0 | 0 |
| A7 | 1.39 | 71.5 | 2 | 0 |
| A8 | 0.83 | 59.5 | 1 | 0 |
| A9 | 6.32 | 89 | 1 | 11 |
| A10 | 0 | 50.5 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN44683_c2_g2_i7 from sample A9 / Example spliced isoformTTGGAATTGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAACGAAAGAGGAATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGAT
GGAAAATTCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGCTTCCGAGTTTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGTTAAAGGCTTCACCACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGA
GATTAAGTACGCAGTGAAGACTTCTTGGCATTGCACTATCCCTAGAGTAGAAGCAAAGAGATACTGTCAAGTATATCGCCCAGATTATGCACGCATAGCAAAAAGTGTTTACAAGTTGCACTACGTGAACAACGAAAAGATTTTGGAGCTGGAAAAATTGGACTTCAACATTATCCAGTCCATCCACCAAGAAGAGATGA
AGGAGGTCACCAGGAATCAACTCGGTTTTGGATGATGATAACTGAACGCGATCCCCAGATTTCAGAAATGCCATTTGTTATTTCAAAATAAGGTGGTCATACAACAAGGGTTTCCTTCGGCCAGAAATGCCATTTCTTATTTCAGAATAAGGTGCTCATACAACAAGGGTTTCCTTCGGTCAGAAATGCCATTTCTTATT
TTAGAATAAGGTGCTCATACAACGAGGGTTTCCTTCTGCAAAGGATAACTGAGATTCCTAACGAATCAATTCTTGGAACAATTTCGGAACTAAAATAAATTTACACTTTGCTTAAATTTAAACTGTGTATATATTATGTTTACTGTTTAAATTTATATGTGTGGAATAAATTCTGAAAATCTTAAAAGCTTTGCAAAAAA
TGAATGGCTGTAGGTCTTGATCTTATTTTACATCTTTACAGTGATAAAGTAAGTTGGATGAATGTGGAATGAGGTTAGTTAAGACAATAAATTCCCAACCAAATATGATAGCAAAACCATTAGAATTAATTAGGAATAAGTTTTGGTTGTAAAGCACATGGTTTAGATTTTAAGGAATAAGCCTTTGTTATTATATAAAT
TTGGTTGAGTTAAAGTCATTTGATCTTTATTTTCTTTTAGTTTTAGTTTTTAAAGAATTAGTCTTTGC
>TRINITY_DN44683_c2_g2_i17 from sample A9 / Example unspliced isoform:GTGAAGACTTCTTGGCATTGCACTATCCCTAGAGTAGAAGCAAAGAGATACTGTCAAGTATATCGCCCAGATTATGCACGCATAGCAAAAAGTGTTTACAAgtacgtatttatatgattttcataaccttcagtttattttcttcttcgcaaacaatactgtgatagctgtgggattaaaaggattccgcttattataat
ttcagGTTGCACTACGTGAACAACGAAAAGATTTTGGAGCTGGAAAAATTGGACTTCAACATTATCCAGTCCATCCACCAAGAAGAGATGAAGGAGGTCACCAGAGACCTTTTCTTTCCACGAGGACGCAGTCCTTTAGCTTAAACACATGGCACAATCTTCTAATGGATGGGGCGTGGCCCTTGTGATGGAGTAGGATT
TGTTTATAAAATACTTATTGCTTGAAAAGCCAACTAGGATGCAATCAGTGGACTGAATGGTTTCTCATTGTGTCCATCTCCATTTGCAAGTTCAATATTCCACCCAACTTGCAGCACATAGTTCCATTGTATCCTATCAATCGATGGCATTCGAATCAATGGAATTCGACATCCCTCAATGCACAGTTAGGGTTTCTCTA
TCCATCTTTTTAAGCGTTGCGTTACTTAATTGGAGCGTTACTTCTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCAGTGTTACTTGTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCATCGTTACTTCTATCCTCTTTTTCAGCTGTGTGGGTATGATTGCAATGTTACTTCTATCCATCTCATCTTTTTCAGCATTACTTAATTGGAGCCT
TACTTCTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCAGCTGTGTGTGCATGATTCTCTTTTGTTGTGCTTATTTCAAATTTAGTATAATCCCTGATACACTCTCCCCATTCTTTTTATTTATACGCGCGGTTTCCATCAGCGAACCAGTTCTCAATTTTATCTTCGATTATCTTTCGATCGCCAAGGGATTATCTGAGTTGTGTG
CCTTCCTAGTCATGGTGGAAGAAGTATGCCGATTCCGGGATGGAATAAAGAAGGGGGTAATGAAGTGGGGGAGTGTCTTATCTTGTCATGTCTTCAGAGGTATGAGAATGTTCTTAAGGCTGCAAATCTTCTTCCAGAAGCCCTTTCAGTTGGTATGCGCCGAGCTGCAGTTGTTATGGCTGCTGTACCGGGTGGAAGAG
GTGCCTGTTCGGCTATTGTTTATGTTCGGAATTTACTAAAGAAATATGGTGGACTGTCAAGTGTGATTGCTTGGGAGAAAAATTTTAGAGTATCTTCTGAGCAGAGACTAGTTGCTGAATTAGAAGCTTATAAAACTAGTGAAAATGAATCAACATTTGGGTTGGTAGGGGTGTCTGGTACAGGTAGCAGTGAAGAATGT
GATGAACTCCTGCGGCAAAAGGTAAGTGGAAGGTTATCAAGAATATCTCCAAACTTGAAAGAGATAGTTCAGAGACATCTTAATAAAGCAGTGAACCAGATCTTCAGCAAAGAAAGAGAACATTTAATTTCTATGTCAAATCTCAGGACTGAGAAATGGGATGATGGGTATCAGACAGCCCAGCATACTATAGCTGATCT
GATTGAACTGATTCGGCAAAATAATCAAGGCGATGCATCTTTATTGGTGGCTGCTACTGTTGCAGCAGTTGTTGGTAATGTGGGGCCAGCTGTTGTGAGTATGCTTGATTCTGCTTCAAATAATACCTATACTGCATCCTCTTTTTCAAAGTTGTCTTCAATTAAATGTGCTCGTCGAGTTGTACAAATCCATATTTATT
GCCTTAGGTTACTAAAGGAGGCAATGGGTGAGTGCCAAAGCCGTATGTTGGAAATAACCCTTGCTACGGAAGCTTCATCCGTTATTGCTGCTGCCCTTGCTCCTGGAAAGGCACCTCGTAGTCAATTTCAGCTTTCGCCAGAGACACCGGATCCTAGTTCAACTATGGCAAATGAGATACTAAGCAACTCTAGTAAAGGT
TATTTGGGAAAGGCCACAAAAACTGCGGCAGCTGTTGCAGCATTCGTTGTGGGTGCTGTTGTTCATGGAATTACAAGTCTAGAAAGAATGGTGGCACTTTTGAGGATCAGGGAAGGTCTGGAAGTTTCACAGTTTTGGAAGAACAACCGTTCCATTTCCAATGGCCTTTCTCGGGTAGCGGGAGCAGGCAATTCTTTGAA
AGCTGATAGCTCAATTGAAGTATACTTGTATTGGTTTAGGGTTCTTATTAGCAACTGCAAAACAGTTTCTGATGGTCTAGTGGTCAATCTTCTTGGTGAATCAAGTGTTTTAGCACTTGCTCGAATGCAGCATATGCTGCCTCTGAACAGTATTTTCCCCCCAACTTATTCAATATTTTCCATGGTTGTGTGGATGCCTA
ATTTTTCATTTATAAACATGGGAAGTCGTGAAGATAGTCAACTTCACCAGGCATTGATATCATCTATAGTGGAAGCTATTAAGCATGAACCAATTCGCGATGTTTGCTTGCGAGATACTCATGCTTTGTACAACCACCTTGCTTGTGATGCAAATGTTTCTGGATTTGCAGCCACACTCGAAATGCAGGGGTTGGATATA
CATTCCAAATTGAAGGCCCTTTTACCCCTTCCTGGGCGATTATTTTTGCATGCTATTCTTGATTCTCAGCTGCCACCTTCTGTTTCTTCGCAGGATGAAGGAAATTGGCTTCATGGACCTGGGGATCTCAAGGGTCCTGCTGCAGATGGAAAATTGTTGGTGGAGCAACTTGTGCATGTTCTGGATAATCTACAGCCTGC
AAAATTTCACTGGCAGTGGGTTGTGCTCAGGCTGCTTCTAAATGAACAAGTTCTCATCGAGAAGATTGGGAACCAGCATGTTTCTGCAGTTGATGCATTGCAAGCTTTTACCCCGGGTGTTGATAATCCTCATCTTTCAGAATCTGAAAAGACATTTACAGAAATTGTTCTTACTAGATTACTTGTCCGGCCTGATGCTG
CTGCTCTGTACTCAGAAGTTGTGCATATGCTGGGGACATCACTAGAGGAGTATCTAATAAAGCATGTCAAGTGGGTACTTGATGGGGTTCTAGGACGAAAGTCTCTTAGGCAGTCACTTGATACCATGGCTCATCAAGGAGGTTTCTCTGTTAAAATTTGCTACATGAGTCCCTGGGGTTGGTCATCTTCACAGTATGTA
ACTGAAGCTGACAAGAAAAAGACTGAAGCAGCATCTCCAGAGGAAGGGGAAGTCGCAGAGGAAGGTTTAGACTATAAGAAGGATGGAAAACCATATAATAATTCACTCAATGATTCTGATGTGGAAGGTTCCTTTCAGAGTCAATATTTTGCAATAGAGAAAGGCCTTGCAGATTTGGTGTTGCCATGCCTAGCCAGAAG
CTCCGTCGAAATGCGCAGTACTTTTGCCATTGAGTTGGTTAAGCAAATGAATACTCTTGAACAAATTATAAATATGCCTATCCGGCATGCTGGGAAGTCAATACCTGGGGCTGCTGTCGGAGCTGAAGGCACTGGAATCAAAGGCCATGGTTCACGCAAGGGTCTTAGAGGTGGCAGCCCTGGGTTGGGACGGAGATTAA
CAGGAGTGGCTGATCCACCCTCTGCAGCAGCACTGCAAGCTTCCATGTGGTTGAGATTGCAATTTCTTTTGCCACTACTTCGAATCATTCTTTTGGACAGGGATTCGGTGGCACGCAACATGAGACAGTCACTTGACATGAGACAGTCACTTGCTCCAGTATTGCTCCGTCTTTTAGGAACAAGAGTTGTACAAGAGGCT
GTGGATCCGTTTAGTATTCATTTGCAGAAATATCTTCACAGTAAAAAGGAGTATGAATTGCATACTGAGATGTCTGCTGCAGCCGCAGCAGGTATGTCTGGGGAAGGTCTATTTGACAAAATTCTTAGTGTCCTTCATGCTTTACTTAGCAGTACCTGGGCAAGTTGGTTGAAGCCAAAGGCGACCACAAAATCTCCACG
AGAGGTCCTTGATCGGGATTTGGCAGAAAGAATGCAGGCTGAACTAGACCGAATGCAATTGCCTTCTGCGGTTCGTATACGACTGCAAGCAGCCATGCCTCTGCTTCCCCCTTCTTCCAGTCCTACAATTTCTTGTGTTCCTTCTAATGTAACTACAGCTGTCCCACTAGTACAATCAAGCTCTGTAAACACTGGTAGTT
TTTCTTCTGGTCTTGTAGGTATATCCCAAAAAGGTTCTGTCCGAATGGCTAATGCCATTGGAAAATGTAAGTCCACTATGCATCAGGATCCAGAAATAGAAATTGATCCCTGGACATTGCTGGAAGATGGGACAGGGTCAGGAGTGGGTGGAAGTAATGGTGGGGGTGGTGTTAGTGGAGATCATGCCAATTTAAAAGCG
TGCAATTGGCTTAAAGGGGCTGTAAGGGTAAGGAGGACAGATCTTACATATGTTGGTGCTGTAGATGACGATACTTGATTCATTGTTAGGCCTCAAGGCCGCCGTAGGCTTTAATAATACTTAGTTTGCTCCATTTTTTGCCGTTTTGGACTTTTTGTTGATTTTGATTACTTGCCTTTGACTGAATCATTTTACTTTTA
TGATGCTTGTATAGATGTATTATTATTTGTTTGCTAATGTGAACTAGGTGTTGAT
Intron 5 GTATATGTAA ... TTCACTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.26 | 111.3 | 30 | 19 |
| A2 | 19.76 | 85.3 | 21 | 11 |
| A3 | 23.18 | 83 | 25 | 12 |
| A4 | 35.08 | 70.3 | 38 | 9 |
| A5 | 31.21 | 37.7 | 17 | 11 |
| A6 | 23.14 | 93 | 28 | 1 |
| A7 | 15.63 | 167.3 | 31 | 9 |
| A8 | 16.06 | 83.7 | 16 | 1 |
| A9 | 19.42 | 128.7 | 31 | 0 |
| A10 | 11.97 | 184 | 25 | 12 |
>TRINITY_DN121977_c5_g1_i14 from sample A1 / Example spliced isoformGAGACCATGAAAAACAAAGAAAGACATCATCAAATTCATTAAGATCAAATTAATTAATTTCTTTTCAAGAAATACATAGGCGCGCTGATTCTATCCGTTGAAGAAAAGAGACGGAAGTGGGAGATCATGAAAGCAATAAAGAGAAGCTAGTTGGGAAGCTTTCGAAAACATTTTCCTCCTCGTCCTCCTGCTTAATCGAC
TGTCAGTTTCTGTTGTGCTATGTGGAAAGCTTCTTATCTGTGTCTGTCGTGAGCCTGGGCGTCGGCGTTTGCGTATTATTCCCGAGTCTTGGGTCTGGGCGTCTTTGTCTTCGTCTCTTGCTGAGGGTGGTGGCATGGAGGAGGAATTGATTTGGACATCTGCTCTGGAAGGACCTCCATAGGATCTTCAGCTGAATACC
GGAACAGAAGAACAAGAATGGATGAGAGTGACGGAAATGCAACGGAGAATGGATGAAGAAAGAAAATCAATGCTACTCCACTCCAGGTTTGTATCCATCTTGTCTCTGCTTTTTCATTTTCTGATTGTTCCTCTGCATATGTTGCTAAATCAAATCTAATCTAGGAATGAGTTTTTACCCACCTTTTTAATTTTAGCCAA
TTTTCATCCCACCTAAAGCTGCAGCTTCCATTATTAACCCTGCCCTTTCTAATTACCGATGTAATGACGGCATAATCAGATGGTCTCGTCTGTTTTTCGGCCTTTTCCTTCTCCATCGGAACTGATGCTTTTGGGAATAGACCTGTTGCTCGTGGGGGTTTCCGCCTGCAGTTTCCATTTTCTTGATTGGGCATTTATGG
GTTTTAGTTCGGTAAGGGCAAGAACTATTCTGGCTTCAAGACCCTTCCCCGTAAGGGCAAGCCGAATGTAGCGATATGCTTGTCTATAGGTAGGTTCAAATCTCTAGTTCGAAGTAGCCAGTTAGGATGCGTCCAATCAATGTATAGGTTGACCGATTTATGTTAGTGGTTTCTGGTTTAACAGATCCTGTTCATTCACT
TGCAACTATTCCCACCATAACCATTGCTCGCCCAATTGCTGTGCCGGCGAGAGATATTGTTCCAGATACATAACCCTAACCAGAAAACCTAGTTGATCACTTTTCGGTTCCGGATTCAATTCCATTCATTGAAGAGAGAGATCCCTTTCTTGGATATCCATTGAGGGACTGTTCCGCAAGCAGATGTGACCATAAGCTTT
GGTAGCGATGGCTCTAGCCGTTTCTCTAGTGAAGGAAGGAACCTCCAACCCGGCCGCAGTACAATGCACGCAGTAGGCATCTCGAGTAGATCTGTATTCCTCCGTTTCGTTGGAACAGACAAACTCGACTTCATATTCTTTGAGAAAGGAGCCGCCTCCAATGCATTTCTTCCAATGAACCCATCTAAGTGTTGTATGAC
TTTCTTGCACTTTTCTGTCCGTAGACTAGTGCTCATAGCAGTAACCCACAGCAGATTGGCTGGAAGATATTATGATCTCTTCATCCGAGGTAACATAAATCAGAGAGTTAAAAGTGAAGGTGGGAACACTGCAATCTGGTTCACATTCCCATAGTGAATGTGAACCAGGTCGCCCTCTCAGCATGTTTCATCTTATCAAT
GATATAGATTGAGATAAAAAAATCAGTCCGACATTTGTAAGAAATGCTTCTCCGACAGAGAGAATCTTTAGTAAACTATTCATGGTAATTGCATTTAACATATAGGAGAAACCTTGGGTAAATAAAGCCCATTGTTATAGCTTGATCACCATTATTTTATGGGACATTAAAGTAACCAATATCAAGTTCGGCTCAATTAA
GTTCTTATTACTTCTTTGTTTTAGGGTTAACGGTTACATTCACTAAGAATATGTATAGTCCCTCTCCATTACTAGGAAAACCAATGCGGATTTGTTGAAACCAGTGTGGAAGGGGATTTGTTTGAACTAGTGTACAAAAGAATTATTATGACACTAAGTCAACATAATATTGATAGTATTTTCATTAAAATTTAAGAGTT
ATTTAGAGATGATAAATATTTTCACATAGAATTTAATTGTAGATGTGTTTTTGTTGTTTATTATTTTATTGTAGATGTGGTATTGTTTTTTTATTAATGACTCTTGTAAGGATGCAATACACATATTTTTAATTGTTTTATACTATATGTTTTCTTCATTATATAGTTATATTATTGTGATTGTGCATATGAGAGAGGAG
GGCCACTTAGTATAGTGTGTCTTCTTTAATGTTTCGAAGTAATTTGATTTTATCTAATGTTTCCAAG
>TRINITY_DN121977_c5_g1_i13 from sample A1 / Example unspliced isoform:GAGACCATGAAAAACAAAGAAAGACATCATCAAATTCATTAAGATCAAATTAATTAATTTCTTTTCAAGAAATACATAGGCGCGCTGATTCTATCCGTTGAAGAAAAGAGACGGAAGTGGGAGATCATGAAAGCAATAAAGAGAAGCTAGTTGGGAAGCTTTCGAAAACATTTTCCTCCTCGTCCTCCTGCTTAATCGAC
TGTCAGTTTCTGTTGTGCTATGTGGAAAGCTTCTTATCTGTGTCTGTCGTGAGCCTGGGCGTCGGCGTTTGCGTATTATTCCCGAGTCTTGGGTCTGGGCGTCTTTGTCTTCGTCTCTTGCTGAGGGTGGTGGCATGGAGGAGGAATTGATTTGGACATCTGCTCTGGAAGGACCTCCATAGGATCTTCAGCTGAATACC
GgtatatgtaatttgatctgtttgtcattctaatttaatgtgtgtatctatgatctgaaatctcattagtgacctgtctatgacattcactgcagGAACAGAAGAACAAGAATGGATGAGAGTGACGGAAATGCAACGGAGAATGGATGAAGAAAGAAAATCAATGCTACTCCACTCCAGGTTTGTATCCATCTTGTCTC
TGCTTTTTCATTTTCTGATTGTTCCTCTGCATATGTTGCTAAATCAAATCTAATCTAGGAATGAGTTTTTACCCACCTTTTTAATTTTAGCCAATTTTCATCCCACCTAAAGCTGCAGCTTCCATTATTAACCCTGCCCTTTCTAATTACCGATGTAATGACGGCATAATCAGATGGTCTCGTCTGTTTTTCGGCCTTTT
CCTTCTCCATCGGAACTGATGCTTTTGGGAATAGACCTGTTGCTCGTGGGGGTTTCCGCCTGCAGTTTCCATTTTCTTGATTGGGCATTTATGGGTTTTAGTTCGGTAAGGGCAAGAACTATTCTGGCTTCAAGACCCTTCCCCGTAAGGGCAAGCCGAATGTAGCGATATGCTTGTCTATAGGTAGGTTCAAATCTCTA
GTTCGAAGTAGCCAGTTAGGATGCGTCCAATCAATGTATAGGTTGACCGATTTATGTTAGTGGTTTCTGGTTTAACAGATCCTGTTCATTCACTTGCAACTATTCCCACCATAACCATTGCTCGCCCAATTGCTGTGCCGGCGAGAGATATTGTTCCAGATACATAACCCTAACCAGAAAACCTAGTTGATCACTTTTCG
GTTCCGGATTCAATTCCATTCATTGAAGAGAGAGATCCCTTTCTTGGATATCCATTGAGGGACTGTTCCGCAAGCAGATGTGACCATAAGCTTTGGTAGCGATGGCTCTAGCCGTTTCTCTAGTGAAGGAAGGAACCTCCAACCCGGCCGCAGTACAATGCACGCAGTAGGCATCTCGAGTAGATCTGTATTCCTCCGTT
TCGTTGGAACAGACAAACTCGACTTCATATTCTTTGAGAAAGGAGCCGCCTCCAATGCATTTCTTCCAATGAACCCATCTAAGTGTTGTATGACTTTCTTGCACTTTTCTGTCCGTAGACTAGTGCTCATAGCAGATTAGCAGTAACCCACAGCAGATTGGCTGGAAGATATTATGATCTCTTCATCCGAGGTAACATAA
ATCAGAGAGTTAAAAGTGAAGGTGGGAACACTGCAATCTGGTTCACATTCCCAACCAGGTCGCGCTCTCTCCTAGCACCCTCTCGGCTGGTTTCATCTGATCAATGATATAGATTGAGATAAAAAAATCAGTCCGACATTTGTAAGAAATGCTTCTCCGACAGAGAGAATCTTTAGTAAACTATTCATGGTAATTGCATT
TAACATATAGGAGAAACCTTGGGTAAATAAAGCCCATTGTTATAGCTTGATCACCATTATTTTATGGGACATTAAAGTAACCAATATCAAGTTCGGCTCAATTAAGTTCTTATTACTTCTTTGTTTTAGGGTTAACGGTTACATTCACTAAGAATATGTATAGTCCCTCTCCATTACTAGGAAAACCAATGCGGATTTGT
TGAAACCAGTGTGGAAGGGGATTTGTTTGAACTAGTGTACAAAAGAATTATTATGACACTAAGTCAACATAATATTGATAGTATTTTCATTAAAATTTAAGAGTTATTTAGAGATGATAAATATTTTCACATAGAATTTAATTGTAGATGTGTTTTTGTTGTTTATTATTTTATTGTAGATGTGGTATTGTTTTTTTATT
AATGACTCTTGTAAGGATGCAATACACATATTTTTAATTGTTTTATACTATATGTTTTCTTCATTATATAGTTATATTATTGTGATTGTGCATATGAGAGAGGAGGGCCACTTAGTATAGTGTGTCTTCTTTAATGTTTCGAAGTAATTTGATTTTATCTAATGTTTCCAAG
Intron 6 GTGATTAGCT ... CTTTGTGCAG
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| A6 | 75 | 0.5 | 1 | 1 |
| A7 | 64.39 | 7 | 10 | 1 |
| A8 | 71.59 | 6 | 13 | 2 |
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>TRINITY_DN44683_c2_g2_i17 from sample A9 / Example spliced isoformGTGAAGACTTCTTGGCATTGCACTATCCCTAGAGTAGAAGCAAAGAGATACTGTCAAGTATATCGCCCAGATTATGCACGCATAGCAAAAAGTGTTTACAAGTACGTATTTATATGATTTTCATAACCTTCAGTTTATTTTCTTCTTCGCAAACAATACTGTGATAGCTGTGGGATTAAAAGGATTCCGCTTATTATAAT
TTCAGGTTGCACTACGTGAACAACGAAAAGATTTTGGAGCTGGAAAAATTGGACTTCAACATTATCCAGTCCATCCACCAAGAAGAGATGAAGGAGGTCACCAGAGACCTTTTCTTTCCACGAGGACGCAGTCCTTTAGCTTAAACACATGGCACAATCTTCTAATGGATGGGGCGTGGCCCTTGTGATGGAGTAGGATT
TGTTTATAAAATACTTATTGCTTGAAAAGCCAACTAGGATGCAATCAGTGGACTGAATGGTTTCTCATTGTGTCCATCTCCATTTGCAAGTTCAATATTCCACCCAACTTGCAGCACATAGTTCCATTGTATCCTATCAATCGATGGCATTCGAATCAATGGAATTCGACATCCCTCAATGCACAGTTAGGGTTTCTCTA
TCCATCTTTTTAAGCGTTGCGTTACTTAATTGGAGCGTTACTTCTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCAGTGTTACTTGTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCATCGTTACTTCTATCCTCTTTTTCAGCTGTGTGGGTATGATTGCAATGTTACTTCTATCCATCTCATCTTTTTCAGCATTACTTAATTGGAGCCT
TACTTCTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCAGCTGTGTGTGCATGATTCTCTTTTGTTGTGCTTATTTCAAATTTAGTATAATCCCTGATACACTCTCCCCATTCTTTTTATTTATACGCGCGGTTTCCATCAGCGAACCAGTTCTCAATTTTATCTTCGATTATCTTTCGATCGCCAAGGGATTATCTGAGTTGTGTG
CCTTCCTAGTCATGGTGGAAGAAGTATGCCGATTCCGGGATGGAATAAAGAAGGGGGTAATGAAGTGGGGGAGTGTCTTATCTTGTCATGTCTTCAGAGGTATGAGAATGTTCTTAAGGCTGCAAATCTTCTTCCAGAAGCCCTTTCAGTTGGTATGCGCCGAGCTGCAGTTGTTATGGCTGCTGTACCGGGTGGAAGAG
GTGCCTGTTCGGCTATTGTTTATGTTCGGAATTTACTAAAGAAATATGGTGGACTGTCAAGTGTGATTGCTTGGGAGAAAAATTTTAGAGTATCTTCTGAGCAGAGACTAGTTGCTGAATTAGAAGCTTATAAAACTAGTGAAAATGAATCAACATTTGGGTTGGTAGGGGTGTCTGGTACAGGTAGCAGTGAAGAATGT
GATGAACTCCTGCGGCAAAAGGTAAGTGGAAGGTTATCAAGAATATCTCCAAACTTGAAAGAGATAGTTCAGAGACATCTTAATAAAGCAGTGAACCAGATCTTCAGCAAAGAAAGAGAACATTTAATTTCTATGTCAAATCTCAGGACTGAGAAATGGGATGATGGGTATCAGACAGCCCAGCATACTATAGCTGATCT
GATTGAACTGATTCGGCAAAATAATCAAGGCGATGCATCTTTATTGGTGGCTGCTACTGTTGCAGCAGTTGTTGGTAATGTGGGGCCAGCTGTTGTGAGTATGCTTGATTCTGCTTCAAATAATACCTATACTGCATCCTCTTTTTCAAAGTTGTCTTCAATTAAATGTGCTCGTCGAGTTGTACAAATCCATATTTATT
GCCTTAGGTTACTAAAGGAGGCAATGGGTGAGTGCCAAAGCCGTATGTTGGAAATAACCCTTGCTACGGAAGCTTCATCCGTTATTGCTGCTGCCCTTGCTCCTGGAAAGGCACCTCGTAGTCAATTTCAGCTTTCGCCAGAGACACCGGATCCTAGTTCAACTATGGCAAATGAGATACTAAGCAACTCTAGTAAAGGT
TATTTGGGAAAGGCCACAAAAACTGCGGCAGCTGTTGCAGCATTCGTTGTGGGTGCTGTTGTTCATGGAATTACAAGTCTAGAAAGAATGGTGGCACTTTTGAGGATCAGGGAAGGTCTGGAAGTTTCACAGTTTTGGAAGAACAACCGTTCCATTTCCAATGGCCTTTCTCGGGTAGCGGGAGCAGGCAATTCTTTGAA
AGCTGATAGCTCAATTGAAGTATACTTGTATTGGTTTAGGGTTCTTATTAGCAACTGCAAAACAGTTTCTGATGGTCTAGTGGTCAATCTTCTTGGTGAATCAAGTGTTTTAGCACTTGCTCGAATGCAGCATATGCTGCCTCTGAACAGTATTTTCCCCCCAACTTATTCAATATTTTCCATGGTTGTGTGGATGCCTA
ATTTTTCATTTATAAACATGGGAAGTCGTGAAGATAGTCAACTTCACCAGGCATTGATATCATCTATAGTGGAAGCTATTAAGCATGAACCAATTCGCGATGTTTGCTTGCGAGATACTCATGCTTTGTACAACCACCTTGCTTGTGATGCAAATGTTTCTGGATTTGCAGCCACACTCGAAATGCAGGGGTTGGATATA
CATTCCAAATTGAAGGCCCTTTTACCCCTTCCTGGGCGATTATTTTTGCATGCTATTCTTGATTCTCAGCTGCCACCTTCTGTTTCTTCGCAGGATGAAGGAAATTGGCTTCATGGACCTGGGGATCTCAAGGGTCCTGCTGCAGATGGAAAATTGTTGGTGGAGCAACTTGTGCATGTTCTGGATAATCTACAGCCTGC
AAAATTTCACTGGCAGTGGGTTGTGCTCAGGCTGCTTCTAAATGAACAAGTTCTCATCGAGAAGATTGGGAACCAGCATGTTTCTGCAGTTGATGCATTGCAAGCTTTTACCCCGGGTGTTGATAATCCTCATCTTTCAGAATCTGAAAAGACATTTACAGAAATTGTTCTTACTAGATTACTTGTCCGGCCTGATGCTG
CTGCTCTGTACTCAGAAGTTGTGCATATGCTGGGGACATCACTAGAGGAGTATCTAATAAAGCATGTCAAGTGGGTACTTGATGGGGTTCTAGGACGAAAGTCTCTTAGGCAGTCACTTGATACCATGGCTCATCAAGGAGGTTTCTCTGTTAAAATTTGCTACATGAGTCCCTGGGGTTGGTCATCTTCACAGTATGTA
ACTGAAGCTGACAAGAAAAAGACTGAAGCAGCATCTCCAGAGGAAGGGGAAGTCGCAGAGGAAGGTTTAGACTATAAGAAGGATGGAAAACCATATAATAATTCACTCAATGATTCTGATGTGGAAGGTTCCTTTCAGAGTCAATATTTTGCAATAGAGAAAGGCCTTGCAGATTTGGTGTTGCCATGCCTAGCCAGAAG
CTCCGTCGAAATGCGCAGTACTTTTGCCATTGAGTTGGTTAAGCAAATGAATACTCTTGAACAAATTATAAATATGCCTATCCGGCATGCTGGGAAGTCAATACCTGGGGCTGCTGTCGGAGCTGAAGGCACTGGAATCAAAGGCCATGGTTCACGCAAGGGTCTTAGAGGTGGCAGCCCTGGGTTGGGACGGAGATTAA
CAGGAGTGGCTGATCCACCCTCTGCAGCAGCACTGCAAGCTTCCATGTGGTTGAGATTGCAATTTCTTTTGCCACTACTTCGAATCATTCTTTTGGACAGGGATTCGGTGGCACGCAACATGAGACAGTCACTTGACATGAGACAGTCACTTGCTCCAGTATTGCTCCGTCTTTTAGGAACAAGAGTTGTACAAGAGGCT
GTGGATCCGTTTAGTATTCATTTGCAGAAATATCTTCACAGTAAAAAGGAGTATGAATTGCATACTGAGATGTCTGCTGCAGCCGCAGCAGGTATGTCTGGGGAAGGTCTATTTGACAAAATTCTTAGTGTCCTTCATGCTTTACTTAGCAGTACCTGGGCAAGTTGGTTGAAGCCAAAGGCGACCACAAAATCTCCACG
AGAGGTCCTTGATCGGGATTTGGCAGAAAGAATGCAGGCTGAACTAGACCGAATGCAATTGCCTTCTGCGGTTCGTATACGACTGCAAGCAGCCATGCCTCTGCTTCCCCCTTCTTCCAGTCCTACAATTTCTTGTGTTCCTTCTAATGTAACTACAGCTGTCCCACTAGTACAATCAAGCTCTGTAAACACTGGTAGTT
TTTCTTCTGGTCTTGTAGGTATATCCCAAAAAGGTTCTGTCCGAATGGCTAATGCCATTGGAAAATGTAAGTCCACTATGCATCAGGATCCAGAAATAGAAATTGATCCCTGGACATTGCTGGAAGATGGGACAGGGTCAGGAGTGGGTGGAAGTAATGGTGGGGGTGGTGTTAGTGGAGATCATGCCAATTTAAAAGCG
TGCAATTGGCTTAAAGGGGCTGTAAGGGTAAGGAGGACAGATCTTACATATGTTGGTGCTGTAGATGACGATACTTGATTCATTGTTAGGCCTCAAGGCCGCCGTAGGCTTTAATAATACTTAGTTTGCTCCATTTTTTGCCGTTTTGGACTTTTTGTTGATTTTGATTACTTGCCTTTGACTGAATCATTTTACTTTTA
TGATGCTTGTATAGATGTATTATTATTTGTTTGCTAATGTGAACTAGGTGTTGAT
>TRINITY_DN44683_c2_g2_i8 from sample A9 / Example unspliced isoform:TTGGAATTGATACACACTTTGAAAAGGAAATCAACGAAGCTCTAGATTATGTTTACAGGTATTGGAACGAAAGAGGAATTGGGTGTGGCAGAATGAATGCCACTGCAGATCTTGAGACCACTGCTTTGGGATTTCGACTGCTTCGACTTCATCGGTACAATGTATCTCCAGTCGTATTTGAGAACTTCAAAGATGCGGAT
GGAAAATTCTTTACCTCGAGCGGTCAATTTAACAAAGATGTGGCAAGCATGCTGAACCTTTATAGAGCTTCCGAGTTTGCATTTCCTGGAGAAATTTTTTTGGATGAAGTTAAAGGCTTCACCACCAAATATTTGAAAGAAGCTCTGGAGAAAAGTGAGACTTTCAGCTCATGGAACAACAAACAAAACCTGAGCCAAGA
GATTAAGTACGCAGTGAAGACTTCTTGGCATTGCACTATCCCTAGAGTAGAAGCAAAGAGATACTGTCAAGTATATCGCCCAGATTATGCACGCATAGCAAAAAGTGTTTACAAGTTGCACTACGTGAACAACGAAAAGATTTTGGAGCTGGAAAAATTGGACTTCAACATTATCCAGTCCATCCACCAAGAAGAGATGA
AGGAGGTCACCAGgtgattagctaactgacagtttctcgtgaccttgtctatatatatattattgtctattaattttattaaaactcttgactggctattcactaggaaatcacactttgtgcagAGACCTTTTCTTTCCACGAGGACGCAGTCCTTTAGCTTAAACACATGGCACAATCTTCTAATGGATGGGGCGTGG
CCCTTGTGATGGAGTAGGATTTGTTTATAAAATACTTATTGCTTGAAAAGCCAACTAGGATGCAATCAGTGGACTGAATGGTTTCTCATTGTGTCCATCTCCATTTGCAAGTTCAATATTCCACCCAACTTGCAGCACATAGTTCCATTGTATCCTATCAATCGATGGCATTCGAATCAATGGAATTCGACATCCCTCAA
TGCACAGTTAGGGTTTCTCTATCCATCTTTTTAAGCGTTGCGTTACTTAATTGGAGCGTTACTTCTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCAGTGTTACTTGTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCATCGTTACTTCTATCCTCTTTTTCAGCTGTGTGGGTATGATTGCAATGTTACTTCTATCCATCTCATCTTTTTC
AGCATTACTTAATTGGAGCCTTACTTCTATCCATCTTTTTCTGATTAATTGCAGCTGTGTGTGCATGATTCTCTTTTGTTGTGCTTATTTCAAATTTAGTATAATCCCTGATACACTCTCCCCATTCTTTTTATTTATACGCGCGGTTTCCATCAGCGAACCAGTTCTCAATTTTATCTTCGATTATCTTTCGATCGCCA
AGGGATTATCTGAGTTGTGTGCCTTCCTAGTCATGGTGGAAGAAGTATGCCGATTCCGGGATGGAATAAAGAAGGGGGTAATGAAGTGGGGGAGTGTCTTATCTTGTCATGTCTTCAGAGGTATGAGAATGTTCTTAAGGCTGCAAATCTTCTTCCAGAAGCCCTTTCAGTTGGTATGCGCCGAGCTGCAGTTGTTATGG
CTGCTGTACCGGGTGGAAGAGGTGCCTGTTCGGCTATTGTTTATGTTCGGAATTTACTAAAGAAATATGGTGGACTGTCAAGTGTGATTGCTTGGGAGAAAAATTTTAGAGTATCTTCTGAGCAGAGACTAGTTGCTGAATTAGAAGCTTATAAAACTAGTGAAAATGAATCAACATTTGGGTTGGTAGGGGTGTCTGGT
ACAGGTAGCAGTGAAGAATGTGATGAACTCCTGCGGCAAAAGGTAAGTGGAAGGTTATCAAGAATATCTCCAAACTTGAAAGAGATAGTTCAGAGACATCTTAATAAAGCAGTGAACCAGATCTTCAGCAAAGAAAGAGAACATTTAATTTCTATGTCAAATCTCAGGACTGAGAAATGGGATGATGGGTATCAGACAGC
CCAGCATACTATAGCTGATCTGATTGAACTGATTCGGCAAAATAATCAAGGCGATGCATCTTTATTGGTGGCTGCTACTGTTGCAGCAGTTGTTGGTAATGTGGGGCCAGCTGTTGTGAGTATGCTTGATTCTGCTTCAAATAATACCTATACTGCATCCTCTTTTTCAAAGTTGTCTTCAATTAAATGTGCTCGTCGAG
TTGTACAAATCCATATTTATTGCCTTAGGTTACTAAAGGAGGCAATGGGTGAGTGCCAAAGCCGTATGTTGGAAATAACCCTTGCTACGGAAGCTTCATCCGTTATTGCTGCTGCCCTTGCTCCTGGAAAGGCACCTCGTAGTCAATTTCAGCTTTCGCCAGAGACACCGGATCCTAGTTCAACTATGGCAAATGAGATA
CTAAGCAACTCTAGTAAAGGTTATTTGGGAAAGGCCACAAAAACTGCGGCAGCTGTTGCAGCATTCGTTGTGGGTGCTGTTGTTCATGGAATTACAAGTCTAGAAAGAATGGTGGCACTTTTGAGGATCAGGGAAGGTCTGGAAGTTTCACAGTTTTGGAAGAACAACCGTTCCATTTCCAATGGCCTTTCTCGGGTAGC
GGGAGCAGGCAATTCTTTGAAAGCTGATAGCTCAATTGAAGTATACTTGTATTGGTTTAGGGTTCTTATTAGCAACTGCAAAACAGTTTCTGATGGTCTAGTGGTCAATCTTCTTGGTGAATCAAGTGTTTTAGCACTTGCTCGAATGCAGCATATGCTGCCTCTGAACAGTATTTTCCCCCCAACTTATTCAATATTTT
CCATGGTTGTGTGGATGCCTAATTTTTCATTTATAAACATGGGAAGTCGTGAAGATAGTCAACTTCACCAGGCATTGATATCATCTATAGTGGAAGCTATTAAGCATGAACCAATTCGCGATGTTTGCTTGCGAGATACTCATGCTTTGTACAACCACCTTGCTTGTGATGCAAATGTTTCTGGATTTGCAGCCACACTC
GAAATGCAGGGGTTGGATATACATTCCAAATTGAAGGCCCTTTTACCCCTTCCTGGGCGATTATTTTTGCATGCTATTCTTGATTCTCAGCTGCCACCTTCTGTTTCTTCGCAGGATGAAGGAAATTGGCTTCATGGACCTGGGGATCTCAAGGGTCCTGCTGCAGATGGAAAATTGTTGGTGGAGCAACTTGTGCATGT
TCTGGATAATCTACAGCCTGCAAAATTTCACTGGCAGTGGGTTGTGCTCAGGCTGCTTCTAAATGAACAAGTTCTCATCGAGAAGATTGGGAACCAGCATGTTTCTGCAGTTGATGCATTGCAAGCTTTTACCCCGGGTGTTGATAATCCTCATCTTTCAGAATCTGAAAAGACATTTACAGAAATTGTTCTTACTAGAT
TACTTGTCCGGCCTGATGCTGCTGCTCTGTACTCAGAAGTTGTGCATATGCTGGGGACATCACTAGAGGAGTATCTAATAAAGCATGTCAAGTGGGTACTTGATGGGGTTCTAGGACGAAAGTCTCTTAGGCAGTCACTTGATACCATGGCTCATCAAGGAGGTTTCTCTGTTAAAATTTGCTACATGAGTCCCTGGGGT
TGGTCATCTTCACAGTATGTAACTGAAGCTGACAAGAAAAAGACTGAAGCAGCATCTCCAGAGGAAGGGGAAGTCGCAGAGGAAGGTTTAGACTATAAGAAGGATGGAAAACCATATAATAATTCACTCAATGATTCTGATGTGGAAGGTTCCTTTCAGAGTCAATATTTTGCAATAGAGAAAGGCCTTGCAGATTTGGT
GTTGCCATGCCTAGCCAGAAGCTCCGTCGAAATGCGCAGTACTTTTGCCATTGAGTTGGTTAAGCAAATGAATACTCTTGAACAAATTATAAATATGCCTATCCGGCATGCTGGGAAGTCAATACCTGGGGCTGCTGTCGGAGCTGAAGGCACTGGAATCAAAGGCCATGGTTCACGCAAGGGTCTTAGAGGTGGCAGCC
CTGGGTTGGGACGGAGATTAACAGGAGTGGCTGATCCACCCTCTGCAGCAGCACTGCAAGCTTCCATGTGGTTGAGATTGCAATTTCTTTTGCCACTACTTCGAATCATTCTTTTGGACAGGGATTCGGTGGCACGCAACATGAGACAGTCACTTGACATGAGACAGTCACTTGCTCCAGTATTGCTCCGTCTTTTAGGA
ACAAGAGTTGTACAAGAGGCTGTGGATCCGTTTAGTATTCATTTGCAGAAATATCTTCACAGTAAAAAGGAGTATGAATTGCATACTGAGATGTCTGCTGCAGCCGCAGCAGGTATGTCTGGGGAAGGTCTATTTGACAAAATTCTTAGTGTCCTTCATGCTTTACTTAGCAGTACCTGGGCAAGTTGGTTGAAGCCAAA
GGCGACCACAAAATCTCCACGAGAGGTCCTTGATCGGGATTTGGCAGAAAGAATGCAGGCTGAACTAGACCGAATGCAATTGCCTTCTGCGGTTCGTATACGACTGCAAGCAGCCATGCCTCTGCTTCCCCCTTCTTCCAGTCCTACAATTTCTTGTGTTCCTTCTAATGTAACTACAGCTGTCCCACTAGTACAATCAA
GCTCTGTAAACACTGGTAGTTTTTCTTCTGGTCTTGTAGGTATATCCCAAAAAGGTTCTGTCCGAATGGCTAATGCCATTGGAAAATGTAAGTCCACTATGCATCAGGATCCAGAAATAGAAATTGATCCCTGGACATTGCTGGAAGATGGGACAGGGTCAGGAGTGGGTGGAAGTAATGGTGGGGGTGGTGTTAGTGGA
GATCATGCCAATTTAAAAGCGTGCAATTGGCTTAAAGGGGCTGTAAGGGTAAGGAGGACAGATCTTACATATGTTGGTGCTGTAGATGACGATACTTGATTCATTGTTAGGCCTCAAGGCCGCCGTAGGCTTTAATAATACTTAGTTTGCTCCATTTTTTGCCGTTTTGGACTTTTTGTTGATTTTGATTACTTGCCTTT
GACTGAATCATTTTACTTTTATGATGCTTGTATAGATGTATTATTATTTGTTTGCTAATGTGAACTAGGTGTTGAT