sp|Q9FHK9|MD26B_ARATH ----> Probable mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26b


Intron 1 GTATTGGAAG ... TGTGCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A147.6211128
A213.511623
A34.761001
A414.29903
A59.681412
A660121
A70300
A80700
A941210
A1011.11410



>TRINITY_DN115142_c2_g5_i3 from sample A2 / Example spliced isoform
CCAAGTACCAGCAAAGTGGCTTATATACATCAATGAAGCAAGTCCTAGTATACAGTGAAACTGCAGAATATAATAAGGCTGGAAAAGGAGGCCGGCATGAGTTACGGGCAGCCAGAGTAGCTCACTAGAGCTACTTAAAAAAGCAGTACTGTTATTTCTGTCTGTCATTGCAGTTTCCAAATAGGGCTGCATGCATGTTT
ATTTGACCGTTTGGAATTGTGTGTCTGCACAAATGCAAAAGCAAAGCAGAGCTGGTACTCCCAACTCCCGAACCCCACAGTTCTATTTTTTCCTTGATAGGCATGTGTTTTGTTGCCATGTTTGTCCAGACAGGCTTTAGGATAGATGAATGAATGGCTTTGATGGTGCTATACTTCTTCTGTATATAGCGTCATTTTAA
GCTGTCAATGCCTATGTATATATTACCCTGTAAATGAATGGTTGGGACAAATTTTGAGCTACAGTATCAGTTATTCGCACCCATCATCATCATTTACAATCCAATCCTAATATCCATAGCTTGGTATCAAAGCGTGCTTTTAAAGATTTTTCAATTCTCATAAGCAGGAGAGGGTCAACAACAACACTACACCTTTTACT
GTGTTATATGGGTAAATTTAGGGGAATTCAAGGCACATTTTTGGGTTTTCTATAGATTTTGGGTTTTGGGAAAACGTCAAATTCGGTGGTTTGAGCAGCTTCATTTGATCATGAAAGAAAGACTCCATCCAGTCATGTTCATGGGCTGACTTAATACGTAATGTTTGTGGTGGATTTTAAGTTTCTTGATCGATGAAGGG
CTTGTGAAATATGATTAGGGTTTAAGGGAGGCTAAAAATGGAGTCTGTGGAAAAATGGAGAAAGTTTTTCAAAGCTGCAGGGACTGATATCTGTAGTCTGATTGAATATGCAATCCTGGTTGCAGCCTTTGATTGCCCAAATGAATTCAGGAGGAGGAGAGATAGGATTGCACAGAGATTGTATGCATCTAGGTTTCTCA
GGTGCTGTGAGTGTGATGTTGTTACTTCGGCTGAACCCCATGATGACATTGCTGATGATGAGGATGAACAGGAGTGTATCAATGACTGCCATGATAAATACAATGAAAATGTAAACAACGACACTGGTGAGGCAGATGAAAATAGGGTTAGCAATTACAGTTATGATGAAGCCGAAGCCCTCACCATAGAGATTGAGGAA
GAATCCCAGGCTCTTAAGGAGGTATCCAGGATCAAAGACATTCTTGCAAACCCATATGAGTCTGATAGTCAGGTGTACGAATGCTTGAGAAGATTGGAACTGATGGAACTCACAGTGGAAACCTTAAAGACAACTGAGATTGGGAAACAAGTTAATCGGTTGCGGAAGCACATTTCAAAGGAAATTCGGTCTATGGTGAA
AAGGCTTATAAGTAGCTGGAAGGAACTTGAAGATGAATGGGTGAAGACTGCTGGAAATGTCTCTGTAGCAGCAATTGCAGGTACCTTGCCAGATTCTGCTTCACCTGCAACTGCAGATGATGAAAATGGACTCGCCTTGCCCCCACTTGATGAGGGTGCCTTTCTGGCAACCCAGATGACTTTGATAGAAATATCTCAGG
TATTCTTCAAATATGTGTGTTTAGTATGGTCTCTTCC


>TRINITY_DN115142_c2_g5_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CCAAGTACCAGCAAAGTGGCTTATATACATCAATGAAGCAAGTCCTAGTATACAGTGAAACTGCAGAATATAATAAGGCTGGAAAAGGAGGCCGGCATGAGTTACGGGCAGCCAGAGTAGCTCACTAGAGCTACTTAAAAAAGCAGTACTGTTATTTCTGTCTGTCATTGCAGTTTCCAAATAGGGCTGCATGCATGTTT
ATTTGACCGTTTGGAATTGTGTGTCTGCACAAATGCAAAAGCAAAGCAGAGCTGGTACTCCCAACTCCCGAACCCCACAGTTCTATTTTTTCCTTGATAGGCATGTGTTTTGTTGCCATGTTTGTCCAGACAGGCTTTAGGATAGATGAATGAATGGCTTTGATGGTGCTATACTTCTTCTGTATATAGCGTCATTTTAA
GCTGTCAATGCCTATGTATATATTACCCTGTAAATGAATGGTTGGGACAAATTTTGAGCTACAGTATCAGTTATTCGCACCCATCATCATCATTTACAATCCAATCCTAATATCCATAGCTTGGTATCAAAGCGTGCTTTTAAAGATTTTTCAATTCTCATAAGCAGGAGAGGGTCAACAACAACACTACACCTTTTACT
GTGTTATATGGGTAAATTTAGGGGAATTCAAGGCACATTTTTGGGTTTTCTATAGATTTTGGGTTTTGGGAAAACGTCAAATTCGGTGGTTTGAGCAGCTTCATTTGATCATGAAAGAAAGACTCCATCCAGTCATGTTCATGGGCTGACTTAATACGTAATGTTTGTGGTGGATTTTAAGTTTCTTGATCGATGAAGGG
CTTGTGAAATATGATTAGGGTTTAAGGGAGGCTAAAAATGGAGTCTGTGGAAAAATGGAGAAAGTTTTTCAAAGCTGCAGGGACTGATATCTGTAGTCTGATTGAATATGCAATCCTGGTTGCAGCCTTTGATTGCCCAAATGAATTCAGGAGGAGGAGAGATAGGATTGCACAGAGATTGTATGCATCTAGGTTTCTCA
GGTGCTGTGAGTGTGATGTTGTTACTTCGGCTGAACCCCATGATGACATTGCTGATGATGAGGATGAACAGGAGTGTATCAATGACTGCCATGATAAATACAATGAAAATGTAAACAACGACACTGGTGAGGCAGATGAAAATAGGGTTAGCAATTACAGTTATGATGAAGCCGAAGCCCTCACCATAGAGATTGAGGAA
GAATCCCAGGCTCTTAAGGAGGTATCCAGGATCAAAGACATTCTTGCAAACCCATATGAGTCTGATAGTCAGGTGTACGAATGCTTGAGAAGATTGGAACTGATGGAACTCACAGTGGAAACCTTAAAGGTATGCTTTTTATAGGGTTTGGAGTTCTTTTGCATGTGATGTAACGTCAAACACGCTTTTTCCAACTTGTT
CAATATCCAACATGTTGTGCAATGGGTTATTAACTTATTCTATCCAGACAACTGAGATTGGGAAACAAGTTAATCGGTTGCGGAAGCACATTTCAAAGGAAATTCGGTCTATGGTGAAAAGGCTTATAAGgtattggaagccaaaacctcctagttcaaggttgaaagcatggataatctaatgcttaattccaacattg
gttatggagaaatgtagtttagtcacagcagcagtttcttattttcacttgcattatgggaacttatcccaacacaagtggaataacaaattttatggctttaagctgacttggacctacgtacatgaacactaaaaggcttaaatgtgcttattgcttctgtttgttgtgctgcag
TAGCTGGAAGGAACTTGAAGATG
AATGGGTGAAGACTGCTGGAAATGTCTCTGTAGCAGCAATTGCAGGTATTGTAATGTGCTGAAGTTACTAAAGTTTGTCCTATGTTTTACTACAAGCCTGATTTTGTTCTTCAAAATACTTTTTGCTTTATATGCATCATTTTGCATGTTGCAGGTACCTTGCCAGATTCTGCTTCACCTGCAACTGCAGATGATGAAAA
TGGACTCGCCTTGCCCCCACTTGATGAGGGTGCCTTTCTGGCAACCCAGATGACTTTGATAGAAATATCTCAGGTATTCTTCAAATATGTGTGTTTAGTATGGTCTCTTCC




Intron 2 GTATGCTTTT ... TTCTATCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A131.7415410
A222.538.714
A342.86424
A457.411.722.3
A550.95564
A650.951.302.7
A7100010
A801.700
A925.847.741.3
A1025311



>TRINITY_DN121148_c5_g7_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
AATTAACCAAGTACCAGCAAAGTGGCTTATATACATCAATGAAGCAAGTCCTAGTATACAGTGAAACTGCAGAATATAATAAGGCTGGAAAAGGAGGCCGGCATGAGTTACGGGCAGCCAGAGTAGCTCACTAGAGCTACTTAAAAAAGCAGTACTGTTATTTCTGTCTGTCATTGCAGTTTCCAAATAGGGCTGCATGC
ATGTTTATTTGACCGTTTGGAATTGTGTGTCTGCACAAATGCAAAAGCAAAGCAGAGCTGGTACTCCCAACTCCCGAACCCCACAGTTCTATTTTTTCCTTGATAGGCATGTGTTTTGTTGCCATGTTTGTCCAGACAGGCTTTAGGATAGATGAATGAATGGCTTTGATGGTGCTATACTTCTTCTGTATATAGCGTCA
TTTTAAGCTGTCAATGCCTATGTATATATTACCCTGTAAATGAATGGTTGGGACAAATTTTGAGCTACAGTATCAGTTATTCGCACCCATCATCATCATTTACAATCCAATCCTAATATCCATAGCTTGGTATCAAAGCGTGCTTTTAAAGATTTTTCAATTCTCATAAGCAGGAGAGGGTCAACAACAACACTACACCT
TTTACTGTGTTATATGGGTAAATTTAGGGGAATTCAAGGCACATTTTTGGGTTTTCTATAGATTTTGGGTTTTGGGAAAACGTCAAATTCGGTGGTTTGAGCAGCTTCATTTGATCATGAAAGAAAGACTCCATCCAGTCATGTTCATGGGCTGACTTAATACGTAATGTTTGTGGTGGATTTTAAGTTTCTTGATCGAT
GAAGGGCTTGTGAAATATGATTAGGGTTTAAGGGAGGCTAAAAATGGAGTCTGTGGAAAAATGGAGAAAGTTTTTCAAAGCTGCAGGGACTGATATCTGTAGTCTGATTGAATATGCAATCCTGGTTGCAGCCTTTGATTGCCCAAATGAATTCAGGAGGAGGAGAGATAGGATTGCACAGAGATTGTATGCATCTAGGT
TTCTCAGGTGCTGTGAGTGTGATGTTGTTACTTCGGCTGAACCCCATGATGACATTGCTGATGATGAGGATGAACAGGAGTGTATCAATGACTGCCATGATAAATACAATGAAAATGTAAACAACGACACTGGTGAGGCAGATGAAAATAGGGTTAGCAATTACAGTTATGATGAAGCCGAAGCCCTCACCATAGAGATT
GAGGAAGAATCCCAGGCTCTTAAGGAGGTATCCAGGATCAAAGACATTCTTGCAAACCCATATGAGTCTGATAGTCAGGTGTACGAATGCTTGAGAAGATTGGAACTGATGGAACTCACAGTGGAAACCTTAAAGACAACTGAGATTGGGAAACAAGTTAATCGGTTGCGGAAGCACATTTCAAAGGAAATTCGGTCTAT
GGTGAAAAGGCTTATAAGGTATTGGAAGCCAAAACCTCCTAGTTCAAGGTTGAAAGCATGGATAATCTAATGCTTAATTCCAACATTGGTTATGGAGAAATGTAGTTTAGTCACAGCAGCAGTTTCTT


>TRINITY_DN121148_c5_g7_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AATTAACCAAGTACCAGCAAAGTGGCTTATATACATCAATGAAGCAAGTCCTAGTATACAGTGAAACTGCAGAATATAATAAGGCTGGAAAAGGAGGCCGGCATGAGTTACGGGCAGCCAGAGTAGCTCACTAGAGCTACTTAAAAAAGCAGTACTGTTATTTCTGTCTGTCATTGCAGTTTCCAAATAGGGCTGCATGC
ATGTTTATTTGACCGTTTGGAATTGTGTGTCTGCACAAATGCAAAAGCAAAGCAGAGCTGGTACTCCCAACTCCCGAACCCCACAGTTCTATTTTTTCCTTGATAGGCATGTGTTTTGTTGCCATGTTTGTCCAGACAGGCTTTAGGATAGATGAATGAATGGCTTTGATGGTGCTATACTTCTTCTGTATATAGCGTCA
TTTTAAGCTGTCAATGCCTATGTATATATTACCCTGTAAATGAATGGTTGGGACAAATTTTGAGCTACAGTATCAGTTATTCGCACCCATCATCATCATTTACAATCCAATCCTAATATCCATAGCTTGGTATCAAAGCGTGCTTTTAAAGATTTTTCAATTCTCATAAGCAGGAGAGGGTCAACAACAACACTACACCT
TTTACTGTGTTATATGGGTAAATTTAGGGGAATTCAAGGCACATTTTTGGGTTTTCTATAGATTTTGGGTTTTGGGAAAACGTCAAATTCGGTGGTTTGAGCAGCTTCATTTGATCATGAAAGAAAGACTCCATCCAGTCATGTTCATGGGCTGACTTAATACGTAATGTTTGTGGTGGATTTTAAGTTTCTTGATCGAT
GAAGGGCTTGTGAAATATGATTAGGGTTTAAGGGAGGCTAAAAATGGAGTCTGTGGAAAAATGGAGAAAGTTTTTCAAAGCTGCAGGGACTGATATCTGTAGTCTGATTGAATATGCAATCCTGGTTGCAGCCTTTGATTGCCCAAATGAATTCAGGAGGAGGAGAGATAGGATTGCACAGAGATTGTATGCATCTAGGT
TTCTCAGGTGCTGTGAGTGTGATGTTGTTACTTCGGCTGAACCCCATGATGACATTGCTGATGATGAGGATGAACAGGAGTGTATCAATGACTGCCATGATAAATACAATGAAAATGTAAACAACGACACTGGTGAGGCAGATGAAAATAGGGTTAGCAATTACAGTTATGATGAAGCCGAAGCCCTCACCATAGAGATT
GAGGAAGAATCCCAGGCTCTTAAGGAGGTATCCAGGATCAAAGACATTCTTGCAAACCCATATGAGTCTGATAGTCAGGTGTACGAATGCTTGAGAAGATTGGAACTGATGGAACTCACAGTGGAAACCTTAAAGgtatgctttttatagggtttggagttcttttgcatgcgatgtaacgtcaaacacgctttttccaa
cttgttcaatatccaacatgttgtgcaatgggttattaacttattctatccag
ACAACTGAGATTGGGAAACAAGTTAATCGGTTGCGGAAGCACATTTCAAAGGAAATTCGGTCTATGGTGAAAAGGCTTATAAGGTATTGGAAGCCAAAACCTCCTAGTTCAAGGTTGAAAGCATGGATAATCTAATGCTTAATTCCA
ACATTGGTTATGGAGAAATGTAGTTTAGTCACAGCAGCAGTTTCTT




Intron 3 GTATTGTAAT ... CATGTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A12030411
A243.33171115
A341210
A413.641933
A512.52115
A60500
A7201005
A89.091503
A901300
A100600



>TRINITY_DN115142_c2_g5_i3 from sample A2 / Example spliced isoform
CCAAGTACCAGCAAAGTGGCTTATATACATCAATGAAGCAAGTCCTAGTATACAGTGAAACTGCAGAATATAATAAGGCTGGAAAAGGAGGCCGGCATGAGTTACGGGCAGCCAGAGTAGCTCACTAGAGCTACTTAAAAAAGCAGTACTGTTATTTCTGTCTGTCATTGCAGTTTCCAAATAGGGCTGCATGCATGTTT
ATTTGACCGTTTGGAATTGTGTGTCTGCACAAATGCAAAAGCAAAGCAGAGCTGGTACTCCCAACTCCCGAACCCCACAGTTCTATTTTTTCCTTGATAGGCATGTGTTTTGTTGCCATGTTTGTCCAGACAGGCTTTAGGATAGATGAATGAATGGCTTTGATGGTGCTATACTTCTTCTGTATATAGCGTCATTTTAA
GCTGTCAATGCCTATGTATATATTACCCTGTAAATGAATGGTTGGGACAAATTTTGAGCTACAGTATCAGTTATTCGCACCCATCATCATCATTTACAATCCAATCCTAATATCCATAGCTTGGTATCAAAGCGTGCTTTTAAAGATTTTTCAATTCTCATAAGCAGGAGAGGGTCAACAACAACACTACACCTTTTACT
GTGTTATATGGGTAAATTTAGGGGAATTCAAGGCACATTTTTGGGTTTTCTATAGATTTTGGGTTTTGGGAAAACGTCAAATTCGGTGGTTTGAGCAGCTTCATTTGATCATGAAAGAAAGACTCCATCCAGTCATGTTCATGGGCTGACTTAATACGTAATGTTTGTGGTGGATTTTAAGTTTCTTGATCGATGAAGGG
CTTGTGAAATATGATTAGGGTTTAAGGGAGGCTAAAAATGGAGTCTGTGGAAAAATGGAGAAAGTTTTTCAAAGCTGCAGGGACTGATATCTGTAGTCTGATTGAATATGCAATCCTGGTTGCAGCCTTTGATTGCCCAAATGAATTCAGGAGGAGGAGAGATAGGATTGCACAGAGATTGTATGCATCTAGGTTTCTCA
GGTGCTGTGAGTGTGATGTTGTTACTTCGGCTGAACCCCATGATGACATTGCTGATGATGAGGATGAACAGGAGTGTATCAATGACTGCCATGATAAATACAATGAAAATGTAAACAACGACACTGGTGAGGCAGATGAAAATAGGGTTAGCAATTACAGTTATGATGAAGCCGAAGCCCTCACCATAGAGATTGAGGAA
GAATCCCAGGCTCTTAAGGAGGTATCCAGGATCAAAGACATTCTTGCAAACCCATATGAGTCTGATAGTCAGGTGTACGAATGCTTGAGAAGATTGGAACTGATGGAACTCACAGTGGAAACCTTAAAGACAACTGAGATTGGGAAACAAGTTAATCGGTTGCGGAAGCACATTTCAAAGGAAATTCGGTCTATGGTGAA
AAGGCTTATAAGTAGCTGGAAGGAACTTGAAGATGAATGGGTGAAGACTGCTGGAAATGTCTCTGTAGCAGCAATTGCAGGTACCTTGCCAGATTCTGCTTCACCTGCAACTGCAGATGATGAAAATGGACTCGCCTTGCCCCCACTTGATGAGGGTGCCTTTCTGGCAACCCAGATGACTTTGATAGAAATATCTCAGG
TATTCTTCAAATATGTGTGTTTAGTATGGTCTCTTCC


>TRINITY_DN115142_c2_g5_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CCAAGTACCAGCAAAGTGGCTTATATACATCAATGAAGCAAGTCCTAGTATACAGTGAAACTGCAGAATATAATAAGGCTGGAAAAGGAGGCCGGCATGAGTTACGGGCAGCCAGAGTAGCTCACTAGAGCTACTTAAAAAAGCAGTACTGTTATTTCTGTCTGTCATTGCAGTTTCCAAATAGGGCTGCATGCATGTTT
ATTTGACCGTTTGGAATTGTGTGTCTGCACAAATGCAAAAGCAAAGCAGAGCTGGTACTCCCAACTCCCGAACCCCACAGTTCTATTTTTTCCTTGATAGGCATGTGTTTTGTTGCCATGTTTGTCCAGACAGGCTTTAGGATAGATGAATGAATGGCTTTGATGGTGCTATACTTCTTCTGTATATAGCGTCATTTTAA
GCTGTCAATGCCTATGTATATATTACCCTGTAAATGAATGGTTGGGACAAATTTTGAGCTACAGTATCAGTTATTCGCACCCATCATCATCATTTACAATCCAATCCTAATATCCATAGCTTGGTATCAAAGCGTGCTTTTAAAGATTTTTCAATTCTCATAAGCAGGAGAGGGTCAACAACAACACTACACCTTTTACT
GTGTTATATGGGTAAATTTAGGGGAATTCAAGGCACATTTTTGGGTTTTCTATAGATTTTGGGTTTTGGGAAAACGTCAAATTCGGTGGTTTGAGCAGCTTCATTTGATCATGAAAGAAAGACTCCATCCAGTCATGTTCATGGGCTGACTTAATACGTAATGTTTGTGGTGGATTTTAAGTTTCTTGATCGATGAAGGG
CTTGTGAAATATGATTAGGGTTTAAGGGAGGCTAAAAATGGAGTCTGTGGAAAAATGGAGAAAGTTTTTCAAAGCTGCAGGGACTGATATCTGTAGTCTGATTGAATATGCAATCCTGGTTGCAGCCTTTGATTGCCCAAATGAATTCAGGAGGAGGAGAGATAGGATTGCACAGAGATTGTATGCATCTAGGTTTCTCA
GGTGCTGTGAGTGTGATGTTGTTACTTCGGCTGAACCCCATGATGACATTGCTGATGATGAGGATGAACAGGAGTGTATCAATGACTGCCATGATAAATACAATGAAAATGTAAACAACGACACTGGTGAGGCAGATGAAAATAGGGTTAGCAATTACAGTTATGATGAAGCCGAAGCCCTCACCATAGAGATTGAGGAA
GAATCCCAGGCTCTTAAGGAGGTATCCAGGATCAAAGACATTCTTGCAAACCCATATGAGTCTGATAGTCAGGTGTACGAATGCTTGAGAAGATTGGAACTGATGGAACTCACAGTGGAAACCTTAAAGGTATGCTTTTTATAGGGTTTGGAGTTCTTTTGCATGTGATGTAACGTCAAACACGCTTTTTCCAACTTGTT
CAATATCCAACATGTTGTGCAATGGGTTATTAACTTATTCTATCCAGACAACTGAGATTGGGAAACAAGTTAATCGGTTGCGGAAGCACATTTCAAAGGAAATTCGGTCTATGGTGAAAAGGCTTATAAGGTATTGGAAGCCAAAACCTCCTAGTTCAAGGTTGAAAGCATGGATAATCTAATGCTTAATTCCAACATTG
GTTATGGAGAAATGTAGTTTAGTCACAGCAGCAGTTTCTTATTTTCACTTGCATTATGGGAACTTATCCCAACACAAGTGGAATAACAAATTTTATGGCTTTAAGCTGACTTGGACCTACGTACATGAACACTAAAAGGCTTAAATGTGCTTATTGCTTCTGTTTGTTGTGCTGCAGTAGCTGGAAGGAACTTGAAGATG
AATGGGTGAAGACTGCTGGAAATGTCTCTGTAGCAGCAATTGCAGgtattgtaatgtgctgaagttactaaagtttgtcctatgttttactacaagcctgattttgttcttcaaaatactttttgctttatatgcatcattttgcatgttgcagGTACCTTGCCAGATTCTGCTTCACCTGCAACTGCAGATGATGAAAA
TGGACTCGCCTTGCCCCCACTTGATGAGGGTGCCTTTCTGGCAACCCAGATGACTTTGATAGAAATATCTCAGGTATTCTTCAAATATGTGTGTTTAGTATGGTCTCTTCC