sp|Q949N0|NAC53_ARATH ----> NAC domain-containing protein 53


Intron 1 GTTGGACTTC ... CACTGAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A1763613
A257.89483
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A4100072
A5100019
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A791.2143647
A882.8662533
A992.3133141
A1082.6141424



>TRINITY_DN44934_c0_g2_i3 from sample A7 / Example spliced isoform
GGGGCACTGTATCTGTAGCGAGGTTTCCGATAGCTTCACGACGACGACATATTACTAAATATATTGATTCCAATTGTAATTACATTTGACTCTGCAGTTGTTGGACGAGAGAAGGCAACACCAACGAAAGCGGCGTTGAATGGACTGGGGTCGAACACGAACTCAAAACCCTCGAGCCTTCAACAAAGAAATCTCTGCAT
TCAATCCACAGCACATCTCAAGTCTGAGCGTTCATGGGCGACTTGAACTGCTTACCTCCAGGCTTTCGATTTCATCCCACGGACGAAGAGCTGGTCTGCTATTATCTCAGAGGAAAGGTCTCTGAATCCACATCGAAATCGAAGTCGAAGTCGAAGTCGACAACCGTTTACTTGAATGCAATTACAGACATTGATCTTTA
CAAGTATGACCCATCCGACTTACCAGCGATGTCATACTTGCAGGGCGGGGATCGACAGTGGTTTTTCTTTACGGAGGGGAATAGGAAGAAATACTCCAATGGATCGCGGAAGAACCGGGCTACAGAAGGAGGGCACTGGAAAACCACCTGTAAAGACCGCCCGGTTTTGTCGGAAAGGTCGCTTGTTGGGATGAAGAAGA
CCCTAGTGTTCCACAGAGGGCGGTCCCCTCACTCGGTGCGTACGAACTGGATGATGTACGAATACAGGCTTGTCAATGACGAGGATGGAGAGTCTTCTCGCTCGGAAAAGGACCGTTTTGTTCTTTGTCGAGTATTCCTGAAAAGTGGCTCTGGTGCAAAAACTGGAGAACAGCATGGAGCTTTATATTCAAGGGAAGAT
TCAAGATCAACAGATAATCAGTCTGCACTTGTGATGGAAGACAGACAATATGGTGATATTATGCTCTCACCTGCAGGGGAGGCTGAGGCAGAGGAGAGAAATTCACCTCTGGGACCCCTTACTGCTGTTCCAGAGGAAAACATCATTCTTTCGGATGAAGATATTTCCAACTTCTTGCTGGAATGTCTTAATGAAACAGA
TAATGAACAGACTGCTCGTGATTTGCTGCAAATTCCAGTTGGTGTCGATGAATGGTCCAGTTTAATTGATGAGCCTTTTGCTGAAATGCAGGGCATTGGCCCTTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGATGTTCACAGGGTTG
AGTCTATGCATGGAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTTTGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCGCACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAGTGATAAGTATTCC
TGGTTGCCGTTGACAAAATCAATATGCATCAACGGTAATTAAAAACAAATCCCAGAACATATACATTTGCAAGGATTATTTCAAGAGTTGGCTCCATGTCGAGCGTACGTTGGCTGTAATGATCAGTTGAAGATAATTCAGAGAAGCAATAGGTAACATTATTGGGTTCCATCAAAGGCAGTACATAATTTTTTGAAATC
ACAAAATAACTCCTCAATGACGGTATTTGACATGATTGACAAAACGAGGTTTACTGGACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACT


>TRINITY_DN44934_c0_g2_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GGGGCACTGTATCTGTAGCGAGGTTTCCGATAGCTTCACGACGACGACATATTACTAAATATATTGATTCCAATTGTAATTACATTTGACTCTGCAGTTGTTGGACGAGAGAAGGCAACACCAACGAAAGCGGCGTTGAATGGACTGGGGTCGAACACGAACTCAAAACCCTCGAGCCTTCAACAAAGAAATCTCTGCAT
TCAATCCACAGCACATCTCAAGTCTGAGCGTTCATGGGCGACTTGAACTGCTTACCTCCAGGCTTTCGATTTCATCCCACGGACGAAGAGCTGGTCTGCTATTATCTCAGAGGAAAGGTCTCTGAATCCACATCGAAATCGAAGTCGAAGTCGAAGTCGACAACCGTTTACTTGAATGCAATTACAGACATTGATCTTTA
CAAGTATGACCCATCCGACTTACCAGCGATGTCATACTTGCAGGGCGGGGATCGACAGTGGTTTTTCTTTACGGAGGGGAATAGGAAGAAATACTCCAATGGATCGCGGAAGAACCGGGCTACAGAAGGAGGGCACTGGAAAACCACCTGTAAAGACCGCCCGGTTTTGTCGGAAAGGTCGCTTGTTGGGATGAAGAAGA
CCCTAGTGTTCCACAGAGGGCGGTCCCCTCACTCGGTGCGTACGAACTGGATGATGTACGAATACAGGCTTGTCAATGACGAGGATGGAGAGTCTTCTCGCTCGGAAAAGGACCGTTTTGTTCTTTGTCGAGTATTCCTGAAAAGTGGCTCTGGTGCAAAAACTGGAGAACAGCATGGAGCTTTATATTCAAGGGAAGAT
TCAAGATCAACAGATAATCAGTCTGCACTTGTGATGGAAGACAGACAATATGGTGATATTATGCTCTCACCTGCAGGGGAGGCTGAGGCAGAGGAGAGAAATTCACCTCTGGGACCCCTTACTGCTGTTCCAGAGGAAAACATCATTCTTTCGGATGAAGATATTTCCAACTTCTTGCTGGAATGTCTTAATGAAACAGA
TAATGAACAGGGCATTGGCCCTTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGATGTTCACAGGGTTGAGTCTATGCATGGAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTT
TGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCGCACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAGTGATAAGTATTCCTGGTTGCCGTTGACAAAATCAATATGCATCAACGGTAATTAAAAACAAATCCCAGAACATATACATTTGCAAGGATTATTT
CAAGAGTTGGCTCCATGTCGAGCGTACGTTGGCTGTAATGATCAGTTGAAGATAATTCAGAGAAGCAATAGGTAACATTATTGGGTTCCATCAAAGGCAGTACATAATTTTTTGAAATCACAAAATAACTCCTCAATGACGGTATTTGACATGATTGACAAAACGAGgttggacttcgttgtgtcatttgagacacttgc
acctttggctagtgtcagttagttcttgaagataggcttttggctatattattatttttgcaatgacttttgcagacattgatggtaaacatacactgaacag
GTTTACTGGACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACTACTCAATACTTTGAATGCAGGTGCAGTCAATGACTAATAGTGTTAGCATGGTTTTCTAG
GACATCCCTACATTGGGATGTTCTCGATCTGTTGCAGGTAATAAAGGGGAGGCAGCACTGTTTATGTTTTTTATAAATCGATAGAACATTTTGTCTGGGATAATGGAAAGAAGGCAGTTGTGGAACTTTAAGGGATCTGGTGCAGTGAGCCCACTTGATAAGGCACCCGAAACTGATATGTAACTCCATGTTTCTTTACA
GGCACCTTTGTTCGAGATTCAACTTATTTGCTGTTCGAAGCTAACTAGATAGAGGAGACACAATGCATTGCTCATTCATCCTGAAATGCAGTTCTCCATCTAGTTTCTTATTCTGAAGAAATTAAGGTAGAATTTTAAGTTTGTAAGGTAGGTGGATGCTATTGTCAATATGGGTTTGATTTAGTTGTTTGCTTGCTCCC
TATCAATATAGTCTGTCTTGGATTGAGCCTTGAAATGCTCCAGACTGTTTGGGATATCTGTAGTATTACTCACTAAGTTTGCCCTTTCACTCTGATATTTTGACGTCATTTGTTTTTCTAATTTGTGCTGCTTGCCAAGCATACTGTGATTGTATATTTTCTTCTCTGCTTGTTAGTTCTAGTTGGTTCTTTAACGTGTA
TTTTTTAATTTTATTGCATTTTATTTTGGCCATATCCATAACTATATTTGAAACAGTGGGCTTTTTCCCAAGTGTTTGCACAAATGGTTCCTTCCTACATCTAAAATGTTTTAAAAAAACCAATACTAGCTTTACTTACTTTTTAAATGGTTTCATTAGATTTTCGTACTTG




Intron 2 GTAACATTAT ... ACTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A163.64477
A2509171
A347.37581
A440.74856
A566.67375
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A849.45232718
A952.07293528
A1050151713



>TRINITY_DN101796_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform
TGATTCTTGGTGGGGCACTGTGTATCTGTAGCGAGGTTTCCGATAGCTTCACGACGACGACATATTACTAAATATATTGATTCCAATTGTAATTACATTTGACTCTGCAGTTGTTGGACGAGAGAAGGCAACACCAACGAAAGCGGCGTTGAATGGACTGGGGTCGAACACGAACTCAAAACCCTCGAGCCTTCAACAAA
GAAATCTCTGCATTCAATCCACAGCACATCTCAAGTCTGAGCGTTCATGGGCGACTTGAACTGCTTACCTCCAGGCTTTCGATTTCATCCCACGGACGAAGAGCTGGTCTGCTATTATCTCAGAGGAAAGGTCTCTGAATCCACATCGAAATCGAAGTCGAAGTCGAAGTCGACAACCGTTTACTTGAATGCAATTACAG
ACATTGATCTTTACAAGTATGACCCATCCGACTTACCAGCGATGTCATACTTGCAGGGCGGGGATCGACAGTGGTTTTTCTTTACGGAGGGGAATAGGAAGAAATACTCCAATGGATCGCGGAAGAACCGGGCTACAGAAGGAGGGCACTGGAAAACCACCTGTAAAGACCGCCCGGTTTTGTCGGAAAGGTCGCTTGTT
GGGATGAAGAAGACCCTAGTGTTCCACAGAGGGCGGTCCCCTCACTCGGTGCGTACGAACTGGATGATGTACGAATACAGGCTTGTCAATGACGAGGATGGAGAGTCTTCTCGCTCGGAAAAGGACCGTTTTGTTCTTTGTCGAGTATTCCTGAAAAGTGGCTCTGGTGCAAAAACTGGAGAACAGCATGGAGCTTTATA
TTCAAGGGAAGATTCAAGATCAACAGATAATCAGTCTGCACTTGTGATGGAAGACAGACAATATGGTGATATTATGCTCTCACCTGCAGGGGAGGCTGAGGCAGAGGAGAGAAATTCACCTCTGGGACCCCTTACTGCTGCTCCAGAGGAAAACATCATTCTTTCGGATGAAGATATTTCCAACTTCTTGCTGGAATGTC
TTAATGAAACAGATAATGAACAGACTGCTCGTGATTTGCTGCAAATTCCAGTTGGTGTCGATGAATGGCCCAGTTTAATTGATGAGCCTTTTGCTGAAATGCAGGGCATTGGCCCTTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGAT
GTTCACAGGGTTGAGTCTATGCATGGAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTTTGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCACACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAG
TGATAAGTATTCCTGGTTGCCGTTGACAAAATCAATATGCATCAACGGTAATTAAAAACAAATCCCAGAACATATACATTTGCAAGGATTATTTCAAGAGTTGGCTCCATGTCGAGCGTACGTTGGCTGTAATGATCAGTTGAAGATAATTCAGAGAAGCAATAGACATTGATGGTAAACATACACTGAACAGGTTTACT
GGACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACTACTCAATACTTTGAATGCAGGTGCAGTCAATGACTAATAGTGTTAGCATGGTTTTCTAGGACATCCCTACATTGGGATGTTCTCGATCTGTTGCAGGTAATAAAGGGGAGGCAGCACTGTTTATGTTTTTTATAAATCGATAGAACATTTTGTCTGGGATAATGGAAAG
AAGGCAGTTGTGGAACTTTAAGGGATCTGGTGCAGTGAGCCCACTTGATAAGGCACCCGAAACTGATATGTAACTCCATGTTTCTTTACAGGCACCTTTGTTCGAGATTCAACTTATTTGCTGTTCGAAGCTAACTAGATAGAGGAGACACAATGCATTGCTCATTCATCCTGAAATGCAGTTCTCCATCTAGTTTCTTA
TTCTGAAGAAATTAAGGTAGAATTTTAAGTTTGTAAGGTAGGTGGATGCTATTGTCAATATGGGTTTGATTTAGTTGTTTGCTTGCTCCCTATCAATATAGTCTGTCTTGGATTGAGCCTTGAAATGCTCCAGACTGTTTGGGATATCTGTAGTATTACTCACTAAGTTTGCCCTTTCACTCTGATATTTTGACG


>TRINITY_DN101796_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TGATTCTTGGTGGGGCACTGTGTATCTGTAGCGAGGTTTCCGATAGCTTCACGACGACGACATATTACTAAATATATTGATTCCAATTGTAATTACATTTGACTCTGCAGTTGTTGGACGAGAGAAGGCAACACCAACGAAAGCGGCGTTGAATGGACTGGGGTCGAACACGAACTCAAAACCCTCGAGCCTTCAACAAA
GAAATCTCTGCATTCAATCCACAGCACATCTCAAGTCTGAGCGTTCATGGGCGACTTGAACTGCTTACCTCCAGGCTTTCGATTTCATCCCACGGACGAAGAGCTGGTCTGCTATTATCTCAGAGGAAAGGTCTCTGAATCCACATCGAAATCGAAGTCGAAGTCGAAGTCGACAACCGTTTACTTGAATGCAATTACAG
ACATTGATCTTTACAAGTATGACCCATCCGACTTACCAGCGATGTCATACTTGCAGGGCGGGGATCGACAGTGGTTTTTCTTTACGGAGGGGAATAGGAAGAAATACTCCAATGGATCGCGGAAGAACCGGGCTACAGAAGGAGGGCACTGGAAAACCACCTGTAAAGACCGCCCGGTTTTGTCGGAAAGGTCGCTTGTT
GGGATGAAGAAGACCCTAGTGTTCCACAGAGGGCGGTCCCCTCACTCGGTGCGTACGAACTGGATGATGTACGAATACAGGCTTGTCAATGACGAGGATGGAGAGTCTTCTCGCTCGGAAAAGGACCGTTTTGTTCTTTGTCGAGTATTCCTGAAAAGTGGCTCTGGTGCAAAAACTGGAGAACAGCATGGAGCTTTATA
TTCAAGGGAAGATTCAAGATCAACAGATAATCAGTCTGCACTTGTGATGGAAGACAGACAATATGGTGATATTATGCTCTCACCTGCAGGGGAGGCTGAGGCAGAGGAGAGAAATTCACCTCTGGGACCCCTTACTGCTGCTCCAGAGGAAAACATCATTCTTTCGGATGAAGATATTTCCAACTTCTTGCTGGAATGTC
TTAATGAAACAGATAATGAACAGACTGCTCGTGATTTGCTGCAAATTCCAGTTGGTGTCGATGAATGGCCCAGTTTAATTGATGAGCCTTTTGCTGAAATGCAGGGCATTGGCCCTTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGAT
GTTCACAGGGTTGAGTCTATGCATGGAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTTTGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCACACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAG
TGATAAGTATTCCTGGTTGCCGTTGACAAAATCAATATGCATCAACGGTAATTAAAAACAAATCCCAGAACATATACATTTGCAAGGATTATTTCAAGAGTTGGCTCCATGTCGAGCGTACGTTGGCTGTAATGATCAGTTGAAGATAATTCAGAGAAGCAATAGgtaacattattgggttccatcaaaggcagtacata
attttttgaaatcacaaaataactcctcaatgacggtatttgacatgattgacaaaacgaggttggacttcgttgcgtcatttgagacacttgcacctttggctagtgtcagttagttcttgaagataggcttttggctatattattatttttgcaatgacttttgcag
ACATTGATGGTAAACATACACTGAACAGGTT
TACTGGACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACTACTCAATACTTTGAATGCAGGTGCAGTCAATGACTAATAGTGTTAGCATGGTTTTCTAGGACATCCCTACATTGGGATGTTCTCGATCTGTTGCAGGTAATAAAGGGGAGGCAGCACTGTTTATGTTTTTTATAAATCGATAGAACATTTTGTCTGGGATAATGG
AAAGAAGGCAGTTGTGGAACTTTAAGGGATCTGGTGCAGTGAGCCCACTTGATAAGGCACCCGAAACTGATATGTAACTCCATGTTTCTTTACAGGCACCTTTGTTCGAGATTCAACTTATTTGCTGTTCGAAGCTAACTAGATAGAGGAGACACAATGCATTGCTCATTCATCCTGAAATGCAGTTCTCCATCTAGTTT
CTTATTCTGAAGAAATTAAGGTAGAATTTTAAGTTTGTAAGGTAGGTGGATGCTATTGTCAATATGGGTTTGATTTAGTTGTTTGCTTGCTCCCTATCAATATAGTCTGTCTTGGATTGAGCCTTGAAATGCTCCAGACTGTTTGGGATATCTGTAGTATTACTCACTAAGTTTGCCCTTTCACTCTGATATTTTGACG




Intron 3 GTAATAAAGG ... TTCTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A152.6421.12126
A230.72205.712
A357.4510918
A461.54102012
A552.94445
A646.3763.742.268
A745.9755.545.449
A848.426034.678
A938.4283.930.774
A1041.8713963



>TRINITY_DN118488_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
CTGTAGCGAGGTTTCCGATAGCTTCACGACGACGACATATTGCTAAATATATTGATTCCAATTGTAATTACATTTGACTCTGCAGTTGTTGGACGAGAGAAGGCAACACCAACGAAAGCGGCGTTGAATGGACTGGGGTCGAACACGAACTCAAAACCCTCGAGCCTTCAACAAAGAAATCTCTGCATTCAATCCACAGC
ACATCTCAAGTCTGAGCGTTCATGGGCGACTTGAACTGCTTACCTCCAGGCTTTCGATTTCATCCCACGGACGAAGAGCTGGTCTGCTATTATCTCAGAGGAAAGGTCTCTGAATCCACATCGAAATCGAAGTCGAAGTCGAAGTCGACAACCGTTTACTTGAATGCAATTACAGACATTGATCTTTACAAGTATGACCC
ATCCGACTTACCAGCGATGTCATACTTGCAGGGCGGGGATCGACAGTGGTTTTTCTTTACGGAGGGGAATAGGAAGAAATACTCCAATGGATCGCGGAAGAACCGGGCTACAGAAGGAGGGCACTGGAAAACCACCTGTAAAGACCGCCCGGTTTTGTCGGAAAGTTCGCTTGTTGGGATGAAGAAGACCCTAGTGTTCC
ACAGAGGGCGGTCCCCTCACGCGGTGCGTACGAACTGGATGATGTACGAGTACAGGCTTGTCAATGACGAGGATGGAGAGTCTTCTCGCTCGGAAAAGGACCGTTTTGTTCTTTGTCGAGTATTCCTGAAAAGTGGCTCTGGTGCAAAAACTGGAGAACAGCATGGAGCTTTATATTCAAGGGAAGATTCAAGATCAACA
GATAATCAGTCTGCACTTGTGATGGAAGACAGACAATATGGTGATATTATGCTCTCACCTGCAGGGGAGGCTGAGGCAGAGGAGAGAAATTCACCTCTGGGACCCCTTACTGCTGTTCCAGAGGAAAACATCATTCTTTCGGATGAAGATATTTCCAACTTCTTGCTGGAATGTCTTAATGAAACAGATAATGAACAGAC
TGCTCGTGATTTGCTGCAAATTCCAGTTGGTGTCGATGAATGGTCCAGTTTAATTGATGAGCCTTTTGCTGAAATGCAGGGCATTGGCCCCTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGATGTTCACAGGGTTGAGTCTATGCATG
GAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTTTGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCACACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAGTGATAAGTATTCCTGGTTGCCGTTG
ACAAAATCAATATGCATCAACGGTAATTAAAAACAAATCCCAGAACATATACATTTGCAAGGATTATTTCAAGAGTTGGCTCCATGTCGAGCGTACGTTGGCTGTAATGATCAGTTGAAGATAATTCAGAGAAGCAATAGGTTTACTGGACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACTGCTCAATACTTTTAATGCAGGT
GCAGTCAATGACTAATAGTGTTAGCATGGTTTTCTAGGACATCCCTACATTGGGATGTTCTCGATCTGTTGCAGGCACCTTTGTTCGAGATTCAACTTATTTGCTGTTCGAAGCTAACTAGATAGAGGAGACACAATGCATTGCTCATTCATCCTGAAATGCAGTTCTCCATCTAGTTTCTTATTCTGAAGAAATTAAGG
TAGAATTTTAAGTTTGTAAGGTAGGTGGATGCTATTGTCAATATGGGTTTGATTTAGTTGTTTGCTTGCTCCCTATCAATATAGTCTGTCTTGGATTGAGCCTTGAAATGCTCCAGACTATTTAGGATATCTGTAGTATTACTCACTAAGTTTGCCCTTTCACTCTGATATTTTGACGTCATTTGTTTTTCTAATTTGTG
CTGCTTGCCAAGCATACTGTGATTGTATATTTTCTTCTCTGCTTGTTAGTTCTAGTTGGTTCTTTAACGTGTATTTTTTAATTTTATTGCATTTTATTTTGGCCATATCCATAACTATATTTGAAACAGTGGGCTTTTTCCCAAGTGTTTGCACAAATGGTTCCTTCCTACATCTAAAATGTTTTAAAAAAACCAATACT
AGCTTTACTTGCTTTTAAAATGGTTTCATTAGATTTTCGTACTTGCTAATTGTTGCATATCAAATGTTGAAGAACAAAATAGTTGATATTCTTTTCATTTTGTTTTTTTAAGTAATTTTGCGGAGTCAATGAGATACTCGGC


>TRINITY_DN118488_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
ACCGTTTTGTTCTTTGTCGAGTATTCCTGAAAAGTGGCTCTGGTGCAAAAACTGGAGAACAGCATGGAGCTTTATATTCAAGGGAAGATTCAAGATCAACAGATAATCAGTCTGCACTTGTGATGGAAGACAGACAATATGGTGATATTATGCTCTCACCTGCAGGGGAGGCTGAGGCAGAGGAGAGAAATTCACCTCTG
GGACCCCTTACTGCTGTTCCAGAGGAAAACATCATTCTTTCGGATGAAGATATTTCCAACTTCTTGCTGGAATGTCTTAATGAAACAGATAATGAACAGGGCATTGGCCCCTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGATGTTCA
CAGGGTTGAGTCTATGCATGGAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTTTGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCACACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAGTGATA
AGTATTCCTGGTTGCCGTTGACAAAATCAATATGCATCAACGGTAATTAAAAACAAATCCCAGAACATATACATTTGCAAGGATTATTTCAAGAGTTGGCTCCATGTCGAGCGTACGTTGGCTGTAATGATCAGTTGAAGATAATTCAGAGAAGCAATAGGTAACATTATTGGGTTCCATCAAAGGCAGTACATAATTTT
TTGAAATCACAAAATAACTCCTCAATGACGGTATTTGACATGATTGACAAAACGAGGTTGGACTTCGTTGCGTCATTTGAGACACTTGCACCTTTGGCTAGTGTCAGTTAGTTCTTGAAGATAGGCTTTTGGCTATATTATTATTTTTGCAATGACTTTTGCAGACATTGATGGTAAACATACACTGAACAGGTTTACTG
GACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACTACTCAATACTTTGAATGCAGGTGCAGTCAATGACTAATAGTGTTAGCATGGTTTTCTAGGACATCCCTACATTGGGATGTTCTCGATCTGTTGCAGgtaataaaggggaggcagcactgtttatgttttttataaatcgatagaacattttgtctgggataatggaaaga
aggcagttgtggaactttaagggatctggtgcagtgagcccacttgataaggcacccgaaactgatatgtaactccatgtttctttacag
GCACCTTTGTTCGAGATTCAACTTATTTGCTGTTCGAAGCTAACTAGATAGAGGAGACACAATGCATTGCTCATTCATCCTGAAATGCAGTTCTCCATCTAGTTTCTTAT
TCTGAAGAAATTAAGGTAGAATTTTAAGTTTGTAAGGTAGGTGGATGCTATTGTCAATATGGGTTTGATTTAGTTGTTTGCTTGCTCCCTATCAATATAGTCTGTCTTGGATTGAGCCTTGAAATGCTCCAGACTGTTTGGGATATCTGTAGTATTACTCACTAAGTTTGCCCTTTCACTCTGATATTTTGACGTCATTT
GTTTTTCTAATTTGTGCTGCTTGCCAAGCATACTGTGATTGTATATTTTCTTCTCTGCTTGTTAGTTCTAGTTGGTTCTTTAACGTGTATTTTTTAATTTTATTGCATTTTATTTTGGCCATATCCATAACTATATTTGAAACAGTGGGCTTTTTCCCAAGTGTTTGCACAAATGGTTCCTTCCTACATCTAAAATGTTT
TAAAAAAACCAATACTAGCTTTACTTGCTTTTAAAATGGTTTCATTAGATTTTCGTACTTGCTAATTGTTGCATATCAAATGTTGAAGAACAAAATAGTTGATATTCTTTTCATTTTGTTTTTTTAAGTAATTTTGCGGAGTCAATGAGATACTCGGC




Intron 4 GTAACATTAT ... CACTGAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A14015713
A237.0417173
A343.157.984
A430.228.152
A547.06979
A634.9765.13733
A739.71633647
A832.26632733
A935.6768.93541.4
A1035.3537.716.724.4



>TRINITY_DN118488_c0_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoform
CTGTAGCGAGGTTTCCGATAGCTTCACGACGACGACATATTGCTAAATATATTGATTCCAATTGTAATTACATTTGACTCTGCAGTTGTTGGACGAGAGAAGGCAACACCAACGAAAGCGGCGTTGAATGGACTGGGGTCGAACACGAACTCAAAACCCTCGAGCCTTCAACAAAGAAATCTCTGCATTCAATCCACAGC
ACATCTCAAGTCTGAGCGTTCATGGGCGACTTGAACTGCTTACCTCCAGGCTTTCGATTTCATCCCACGGACGAAGAGCTGGTCTGCTATTATCTCAGAGGAAAGGTCTCTGAATCCACATCGAAATCGAAGTCGAAGTCGAAGTCGACAACCGTTTACTTGAATGCAATTACAGACATTGATCTTTACAAGTATGACCC
ATCCGACTTACCAGCGATGTCATACTTGCAGGGCGGGGATCGACAGTGGTTTTTCTTTACGGAGGGGAATAGGAAGAAATACTCCAATGGATCGCGGAAGAACCGGGCTACAGAAGGAGGGCACTGGAAAACCACCTGTAAAGACCGCCCGGTTTTGTCGGAAAGTTCGCTTGTTGGGATGAAGAAGACCCTAGTGTTCC
ACAGAGGGCGGTCCCCTCACGCGGTGCGTACGAACTGGATGATGTACGAGTACAGGCTTGTCAATGACGAGGATGGAGAGTCTTCTCGCTCGGAAAAGGACCGTTTTGTTCTTTGTCGAGTATTCCTGAAAAGTGGCTCTGGTGCAAAAACTGGAGAACAGCATGGAGCTTTATATTCAAGGGAAGATTCAAGATCAACA
GATAATCAGTCTGCACTTGTGATGGAAGACAGACAATATGGTGATATTATGCTCTCACCTGCAGGGGAGGCTGAGGCAGAGGAGAGAAATTCACCTCTGGGACCCCTTACTGCTGTTCCAGAGGAAAACATCATTCTTTCGGATGAAGATATTTCCAACTTCTTGCTGGAATGTCTTAATGAAACAGATAATGAACAGAC
TGCTCGTGATTTGCTGCAAATTCCAGTTGGTGTCGATGAATGGTCCAGTTTAATTGATGAGCCTTTTGCTGAAATGCAGGGCATTGGCCCCTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGATGTTCACAGGGTTGAGTCTATGCATG
GAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTTTGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCACACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAGTGATAAGTATTCCTGGTTGCCGTTG
ACAAAATCAATATGCATCAACGGTAATTAAAAACAAATCCCAGAACATATACATTTGCAAGGATTATTTCAAGAGTTGGCTCCATGTCGAGCGTACGTTGGCTGTAATGATCAGTTGAAGATAATTCAGAGAAGCAATAGGTTTACTGGACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACTGCTCAATACTTTTAATGCAGGT
GCAGTCAATGACTAATAGTGTTAGCATGGTTTTCTAGGACATCCCTACATTGGGATGTTCTCGATCTGTTGCAGGTAATAAAGGGGAGGCAGCACTGTTTATGTTTTTTATAAATCGATAGAACATTTTGTCTGGGATAATGGAAAGAAGGCAGTTGTGGAACTTTAAGGGATCTGGTGCAGTGAGCCCACTTGATAAGG
CACCCGAAACTGATATGTAACTCCATGTTTCTTTACAGGCACCTTTGTTCGAGATTCAACTTATTTGCTGTTCGAAGCTAACTAGATAGAGGAGACACAATGCATTGCTCATTCATCCTGAAATGCAGTTCTCCATCTAGTTTCTTATTCTGAAGAAATTAAGGTAGAATTTTAAGTTTGTAAGGTAGGTGGATGCTATT
GTCAATATGGGTTTGATTTAGTTGTTTGCTTGCTCCCTATCAATATAGTCTGTCTTGGATTGAGCCTTGAAATGCTCCAGACTATTTAGGATATCTGTAGTATTACTCACTAAGTTTGCCCTTTCACTCTGATATTTTGACGTCATTTGTTTTTCTAATTTGTGCTGCTTGCCAAGCATACTGTGATTGTATATTTTCTT
CTCTGCTTGTTAGTTCTAGTTGGTTCTTTAACGTGTATTTTTTAATTTTATTGCATTTTATTTTGGCCATATCCATAACTATATTTGAAACAGTGGGCTTTTTCCCAAGTGTTTGCACAAATGGTTCCTTCCTACATCTAAAATGTTTTAAAAAAACCAATACTAGCTTTACTTGCTTTTAAAATGGTTTCATTAGATTT
TCGTACTTGCTAATTGTTGCATATCAAATGTTGAAGAACAAAATAGTTGATATTCTTTTCATTTTGTTTTTTTAAGTAATTTTGCGGAGTCAATGAGATACTCGGC


>TRINITY_DN118488_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTGTAGCGAGGTTTCCGATAGCTTCACGACGACGACATATTGCTAAATATATTGATTCCAATTGTAATTACATTTGACTCTGCAGTTGTTGGACGAGAGAAGGCAACACCAACGAAAGCGGCGTTGAATGGACTGGGGTCGAACACGAACTCAAAACCCTCGAGCCTTCAACAAAGAAATCTCTGCATTCAATCCACAGC
ACATCTCAAGTCTGAGCGTTCATGGGCGACTTGAACTGCTTACCTCCAGGCTTTCGATTTCATCCCACGGACGAAGAGCTGGTCTGCTATTATCTCAGAGGAAAGGTCTCTGAATCCACATCGAAATCGAAGTCGAAGTCGAAGTCGACAACCGTTTACTTGAATGCAATTACAGACATTGATCTTTACAAGTATGACCC
ATCCGACTTACCAGCGATGTCATACTTGCAGGGCGGGGATCGACAGTGGTTTTTCTTTACGGAGGGGAATAGGAAGAAATACTCCAATGGATCGCGGAAGAACCGGGCTACAGAAGGAGGGCACTGGAAAACCACCTGTAAAGACCGCCCGGTTTTGTCGGAAAGTTCGCTTGTTGGGATGAAGAAGACCCTAGTGTTCC
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GAGCAGACACTGTTGAACAGTCAAATTTTGAGGCATTACTGTCTCCAGCTTATTTAGGTGGAGACTTTTTGGAGTTGAATGATCTAATTTCACCACTCGACTCAGATTACTTTCTCTAGGTTGATATCTATGATATACAGGGCTACCACACTAGTAGCCTAAATATGGTTGGAAGTGATAAGTATTCCTGGTTGCCGTTG
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GTTTACTGGACGACAAGCTTGACTCAGA
TGAGAAAACTACTCAATACTTTGAATGCAGGTGCAGTCAATGACTAATAGTGTTAGCATGGTTTTCTAGGACATCCCTACATTGGGATGTTCTCGATCTGTTGCAGGTAATAAAGGGGAGGCAGCACTGTTTATGTTTTTTATAAATCGATAGAACATTTTGTCTGGGATAATGGAAAGAAGGCAGTTGTGGAACTTTAA
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Intron 5 GTAACATTAT ... ACAAAACGAG

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>TRINITY_DN44934_c0_g2_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:
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TAATGAACAGACTGCTCGTGATTTGCTGCAAATTCCAGTTGGTGTCGATGAATGGTCCAGTTTAATTGATGAGCCTTTTGCTGAAATGCAGGGCATTGGCCCTTTTAATGATGAAGCAGGCAATTTGATCAGAAATGATACACAGCAACAAAATATTGCTGATAAGAATTTACATACAGAAAGGGATGTTCACAGGGTTG
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acaaaataactcctcaatgacggtatttgacatgattgacaaaacgag
GTTTACTGGACGACAAGCTTGACTCAGATGAGAAAACT