NA ----> NA
Intron 1 GTATGTTATG ... TTTGCTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.45 | 164 | 1 | 56 |
| A2 | 17.52 | 113 | 8 | 24 |
| A3 | 21.78 | 176 | 0 | 49 |
| A4 | 20.48 | 132 | 3 | 34 |
| A5 | 20.37 | 86 | 1 | 22 |
| A6 | 16.39 | 199 | 0 | 39 |
| A7 | 21.19 | 383 | 0 | 103 |
| A8 | 17.87 | 216 | 0 | 47 |
| A9 | 17.21 | 409 | 0 | 85 |
| A10 | 21.01 | 391 | 0 | 104 |
>TRINITY_DN105127_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformAGGCACCATCCCTCACAGCTAGTGTTGCATTCGATTTTTTGTCCAGACAGCTATTCTTGCGTAGATCATTTATGCCCCTTGAATTCCATCCGAGTATCTTTAAAATCCATCAGGGTGCCTGCCAAATCTCAGAAGAACGGTCCCAGAATCATCAGAAAGAGGTTGCGGATTCCCTAATTACGCTTTTGAAGGGCTTTTTA
ATTATAAACAATGGTGCTGGGATGCGCTGGAATGGTGCCCTTGGAGACAGATCCCCGATCCACCTGTGACAGCCAGGCGGAATCAGCTCCGCCCAAGACAGGGTTAGGGACTCCCAAGGATTCTTCCAAGAAGAAAAAGGTAAACAGACAAGCCAAGTTGAAGCAATGCAAGCTGGATGCCCGACGGGAGCAATGGTTGT
CACAAGGCAAGAATAAGATAATTGGGCAGCAGCAGCAAAATGGAATCAATGGGGATCAAGTTAATTCCAGGGAAGATATTGCTAATAATAATAATAACAACGGTAATAATACACAAATGGAAATGCCGAGAAGAAGTTTTTCGGATATGGATTCCAGAAGCTCGAAAGCCTCAGTTGAAGAAGAAGATAATGATGGGTGT
AGCTCGGAAGAGGTTAATAGTAAAGCCCAAGCACCCGATAGCAGTCAAGAAGAAGAACACGAGAGTCTCTCAGATGTTGAAGATGATTGGGAGGCTGCAGCTGATGCCCTCATTATAGAAGACTCTTCTTTCAAAGCTACAAAAGAAGAAATTTCATCCATTTCCGATCATGTATCCCCTGAAAATAATAAATCTTCCTT
CTCCATTGAGGATGGGATTCTCAAACCAGAGTATAAAATCAAGTCGACAAACTTGGCAAACAGGTCTCTTCGTGGTGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGGGCTTGGAGACCTGATGATGTATCCCGTCCAAACACCTTGCCAAAGCTCACAAAACTCCACAGTTTTCCATCACAGTCCTGTCGGCCTTCATCTTGGAGTG
CCTGGAATAATCCCTCTTCTTCATCGACTTCGGTACCATCGTCTTGCCCTATTTGCTATGAAGATTTGGATGTTACTGATTCTAATTTTCTCCCGTGTGCCTGTGGATTCCGTCTGTGCTTGTTCTGCCACAAGAGGATACTTGAGCACGATGGGCGATGTCCGGGTTGCAGAAACCGATATAATGTTACAGACACAGGT
GGAAAAGCGACAATTGTGAGGTTGCCCCGTTCCTGTAGTATGAGGTTGAAAGCTTAGAAAAGGACAAAGTCATTTATCTCTCTTATGCTGTGCTACTGCTCATCATAGTTTTGTATAGATTCTAGAACTTTAGCGTATATACATATGTAGGAAGTGATGAAAACAGTTAGCTATATGATTCTTTCCTACTTGTGAATATA
TAGGATTTGGGTCAGTGACGTAAGAATGTTACCTTTACTGACTTATCGATTTAGGCAAAATGTGGGTTGGGTTTGCTCAATAATAATGAATAGTGATTTGAGCGAGTCGGATTGGTTTTATGCTATATGTTTGCATGTTCTACACTTTCTATCATAACTGGGCTTAAGAGCTCCTGGGTTGGGTCTTAATGGCTTTCACT
TTCAGTAGTTATTCAGATGAAAAATGACATTGCAAGTGTCACTATACAGTACATTTACTTTTTGGAAGTTGCTGAAGGACTATACAGTTGCTAAATTTTAGAACTGAGTGCATTGAGTTTCTTACCTCAGAGTAAGTATTTATTGTGAACATTACATATAGTGTCCCAAGTGTCGCTATTCAGTGCATTTACACTTTGGA
AGTTGCTGAAGGACTATACAGTTGAAACAGACTCAGTTATTGCAGCACATCATAGTGTGTAGAATTACCATTATTTTTCCAAGTTTTGACCTAAGATACTTTATCAACAATTTTTTGGTTATCTTGGAAATTTCAGAACTATACAGTTGAAAGTTTGAAACAGACTCAGTTATTGCAGCACATCATTGTATGTAGATTTA
CCAATAATTTTCCAAGTTTCGACCTAGTATACTTTATCAACATTTTTTTTTGGTTATCTTGGAAATTTCAGAACTATACAGTTGAAAGTTTGAAACAGACTCAGTTATTGCAGCACATCATTGTATGTAGATTTACCAATAATTTTCCAAGTTTCGACCTAGTATACTTTATCAACATTTTTTTTTGGTTATCTTGGAAA
TTTCAGAACTATACAGTTGAAACAGACTTGCAGCACATCATTGTATGTAGATTTACCAATAATTTTCCAAGTTTCGACCTAGTATACTTTATCAACATTTTTTTTTGGTTATCTTGGAAATTT
>TRINITY_DN105127_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:ATTGTTATTTATATTTACCCATAAAGCAATTATCTTTTGTTTTTGATAACATAAGATAATTATTTGTTGAGCAGGGTACATTTTCAGCAAATGATGGAATTGCTCGGTTGTTTTCAGGTAAACAGACAAGCCAAGTTGAAGCAATGCAAGCTGGATGCCCGACGGGAGCAATGGTTGTCACAAGgtatgttatgcgattg
ggatttcatttatttagtagttaaaatggtgataattgatatcagaagcagggaataaggctaggaattcagtattcttgtttgaatcacaaaggatgggagttaaaatatattttttgatttgctttagGCAAGAATAAGATAATTGGGCAGCAGCAGCAAAATGGAATCAATGGGGATCAAGTTAATTCCAGGGAAGA
TATTGCTAATAATAATAATAACAACGGTAATAATACACAAATGGAAATGCCGAGAAGAAGTTTTTCGGATATGGATTCCAGAAGCTCGAAAGCCTCAGTTGAAGAAGAAGATAATGATGGGTGTAGCTCGGAAGAGGTTAATAGTAAAGCCCAAGCACCCGATAGCAGTCAAGAAGAAGAACACGAGAGTCTCTCAGATG
TTGAAGATGATTGGGAGGCTGCAGCTGATGCCCTCATTATAGAAGACTCTTCTTTCAAAGCTACAAAAGAAGAAATTTCATCCATTTCCGATCATGTATCCCCTGAAAATAATAAATCTTCCTTCTCCATTGAGGATGGGATTCTCAAACCAGAGTATAAAATCAAGTCGACAAACTTGGCAAACAGGTCTCTTCGTGGT
GGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGGGCTTGGAGACCTGATGATGTATCCCGTCCAAACACCTTGCCAAAGCTCACAAAACTCCACAGTTTTCCATCACAGTCCTGTCGGCCTTCATCTTGGAGTGCCTGGAATAATCCCTCTTCTTCATCGACTTCGGTACCATCGTCTTGCCCTATTTGCTATGAAGATTTGGATGTTAC
TGATTCTAATTTTCTCCCGTGTGCCTGTGGATTCCGTCTGTGCTTGTTCTGCCACAAGAGGATACTTGAGCACGATGGGCGATGTCCGGGTTGCAGAAACCGATATAATGTTACAGACACAGGTGGAAAAGCGACAATTGTGAGGTTGCCCCGTTCCTGTAGTATGAGGTTGAAAGCTTAGAAAAGGACAAAGTCATTTA
TCTCTCTTATGCTGTGCTACTGCTCATCATAGTTTTGTATAGATTCTAGAACTTTAGCGTATATACATATGTAGGAAGTGATGAAAACAGTTAGCTATATGATTCTTTCCTACTTGTGAATATATAGGATTTGGGTCAGTGACGTAAGAATGTTACCTTTACTGACTTATCGATTTAGGCAAAATGTGGGTTGGGTTTGC
TCAATAATAATGAATAGTGATTTGAGCGAGTCGGATTGGTTTTATGCTATATGTTTGCATGTTCTACACTTTCTATCATAACTGGGCTTAAGAGCTCCTGGGTTGGGTCTTAATGGCTTTCACTTTCAGTAGTTATTCAGATGAAAAATGACATTGCAAGTGTCACTATACAGTACATTTACTTTTTGGAAGTTGCTGAA
GGACTATACAGTTGCTAAATTTTAGAACTGAGTGCATTGAGTTTCTTACCTCAGAGTAAGTATTTATTGTGAACATTACATATAGTGTCCCAAGTGTCGCTATTCAGTGCATTTACACTTTGGAAGTTGCTGAAGGACTATACAGTTGAAACAGACTCAGTTATTGCAGCACATCATAGTGTGTAGAATTACCATTATTT
TTCCAAGTTTTGACCTAAGATACTTTATCAACAATTTTTTGGTTATCTTGGAAATTTCAGAACTATACAGTTGAAAGTTTGAAACAGACTCAGTTATTGCAGCACATCATTGTATGTAGATTTACCAATAATTTTCCAAGTTTCGACCTAGTATACTTTATCAACATTTTTTTTTGGTTATCTTGGAAATTTCAGAACTA
TACAGTTGAAAGTTTGAAACAGACTCAGTTATTGCAGCACATCATTGTATGTAGATTTACCAATAATTTTCCAAGTTTCGACCTAGTATACTTTATCAACATTTTTTTTTGGTTATCTTGGAAATTTCAGAACTATACAGTTGAAACAGACTTGCAGCACATCATTGTATGTAGATTTACCAATAATTTTCCAAGTTTCG
ACCTAGTATACTTTATCAACATTTTTTTTTGGTTATCTTGGAAATTT